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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
581 2025-10-05
Investigating cytotoxic and inflammatory human IL-7 receptor low effector memory CD8+ T cells in lupus
2025-Sep, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过分析狼疮患者外周血和肾脏组织中的CD8+ T细胞异质性,揭示了IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的关键作用 首次发现IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞在狼疮患者中积累,并证明其通过TNF-α和IFN-γ依赖性方式诱导中性粒细胞胞外诱捕网形成 研究主要基于转录组数据和体外实验,需要进一步的功能验证和机制研究 探讨CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的作用及其异质性意义 狼疮患者的外周血和肾脏组织样本 免疫学 狼疮 单细胞RNA测序,微阵列,成像质谱流式细胞术 NA RNA测序数据,微阵列数据,图像数据 狼疮患者和正常人的外周血及肾脏组织样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
582 2025-10-05
Spatiotemporal Proliferative Heterogeneity of Intraorgan Endothelial Cells
2025-Sep-12, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究揭示了心脏、肝脏和肺脏中内皮细胞增殖的时空异质性及其调控机制 首次开发内皮细胞特异性增殖追踪系统,发现同一器官内不同区域内皮细胞存在显著增殖异质性 研究主要聚焦于三种器官,其他器官的内皮细胞增殖异质性仍需进一步探索 探究同一器官内内皮细胞增殖的时空异质性及其分子机制 小鼠心脏、肝脏和肺脏的内皮细胞 空间转录组学 心血管疾病 RNA测序,空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,空间定位数据 多个器官的内皮细胞样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
583 2025-10-05
Retinoic Acid Inhibition Alters Intestinal Composition in Zebrafish: A Non-genetic Model to Study Hirschsprung Disease?
2025-Sep-12, Neurogastroenterology and motility IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过抑制斑马鱼体内视黄酸合成,探究其对肠道细胞组成的广泛影响及其作为先天性巨结肠疾病模型的潜力 首次在斑马鱼模型中系统揭示视黄酸抑制对神经元和非神经元肠道细胞组成的全面影响,并比较其与遗传性HSCR模型的差异 两种模型(DEAB处理和ret突变)在非神经元细胞变化方面存在显著差异,提示模型间的生物学机制不完全一致 研究视黄酸在肠道发育中的作用及其与先天性巨结肠疾病的关联 斑马鱼幼虫 发育生物学 先天性巨结肠疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 DEAB处理组、野生型和ret突变HSCR模型斑马鱼 NA 单细胞RNA测序 NA NA
584 2025-10-05
Single-cell RNA sequencing reveals developmental trajectories and environmental regulation of callus formation in Arabidopsis
2025-Sep-12, Stress biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了拟南芥愈伤组织形成的发育轨迹和环境调控机制 首次在单细胞分辨率下系统描绘了愈伤组织发育过程中的转录组动态和转录因子调控网络 研究仅聚焦于拟南芥模型,未在其他植物物种中验证 探索植物愈伤组织发育的调控网络和细胞命运决定机制 拟南芥愈伤组织细胞 植物发育生物学 NA 单细胞RNA测序 UMAP聚类,伪时间分析 单细胞转录组数据 拟南芥愈伤组织在起始、增殖和绿化三个关键阶段的细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
585 2025-10-05
Single-cell sequencing reveals the immune microenvironment in osteoarthritis: from heterogeneity to therapeutic targets
2025-Sep-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1
综述 系统总结单细胞RNA测序技术在解析骨关节炎免疫微环境中的关键进展 从传统机械磨损理论转向免疫炎症驱动新范式,首次系统绘制免疫细胞动态轨迹和细胞间配体-受体网络 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究进行理论总结 解析骨关节炎免疫微环境特征并寻找治疗靶点 骨关节炎患者关节组织中的免疫细胞和关节常驻细胞 单细胞组学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
586 2025-10-05
Endothelin B receptor inhibition rescues aging-dependent neuronal regenerative decline
2025-Sep-09, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示通过抑制内皮素B受体可改善衰老导致的神经元再生能力下降 首次发现卫星胶质细胞表达内皮素B受体,并证明其抑制可逆转衰老相关的轴突再生能力下降 机制研究尚未完全阐明,临床转化需要进一步验证 探索衰老导致神经元再生能力下降的机制及治疗策略 背根神经节中的感觉神经元和卫星胶质细胞 神经科学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序,单核RNA测序,电子显微镜 NA 基因表达数据,显微图像 成年和老年小鼠的背根神经节 NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA NA
587 2025-10-05
Computational pathology annotation enhances the resolution and interpretation of breast cancer spatial transcriptomics data
2025-Sep-09, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究开发了一种计算病理学图像分析流程,用于增强乳腺癌空间转录组数据的解析和解释 提出计算组织注释(CTA)流程,利用机器学习算法在Visium平台数据中精确映射肿瘤、基质和免疫区室,提高数据分析分辨率 研究样本量较小(仅4名患者的23个肿瘤切片),且空间转录组技术尚未达到单细胞分辨率 开发计算病理学方法以增强乳腺癌空间转录组数据的解析能力 乳腺癌肿瘤组织切片 计算病理学 乳腺癌 空间转录组学,机器学习 机器学习算法 图像,空间转录组数据 4名患者的23个乳腺癌肿瘤切片 10x Genomics 空间转录组学 Visium Visium空间转录组平台
588 2025-10-05
Single-cell and spatial transcriptomics identify dihydrolipoic acid succinyltransferase as a promoter of tumor invasion via vascular pathways in cutaneous melanoma
2025-Sep-07, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了二氢硫辛酸琥珀酰转移酶通过血管途径促进皮肤黑色素瘤侵袭的新机制 首次发现DLST通过调控组蛋白去甲基化酶KDM4C活性,影响H3K9和H3K27去甲基化,从而促进黑色素瘤进展 DLST与KDM4C相互作用的具体分子机制仍需进一步验证 探究DLST在黑色素瘤进展中的作用机制及其临床意义 皮肤黑色素瘤患者样本和黑色素瘤细胞 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学,生物信息学分析,siRNA沉默,免疫共沉淀,免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质相互作用数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
589 2025-10-05
DNA methylation subtypes dictate metastatic heterogeneity of osteosarcoma via distinct tumor-stromal interactions: Multi-omics profiling and decitabine validation
2025-Sep-05, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 通过整合DNA甲基化分析和单细胞RNA测序,揭示骨肉瘤转移异质性的表观遗传机制 首次发现DNA甲基化亚型通过不同的肿瘤-基质相互作用决定骨肉瘤转移异质性,并验证了地西他滨的治疗潜力 NA 阐明骨肉瘤转移异质性的表观遗传驱动机制 骨肉瘤细胞和肿瘤微环境中的基质细胞 表观遗传学 骨肉瘤 DNA甲基化分析, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 假时间轨迹分析 NA 甲基化数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量DNA甲基化分析 NA NA
590 2025-10-05
FmH2ST: foundation model-based spatial transcriptomics generation from histological images
2025-Sep-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 提出基于基础模型的FmH2ST方法,从组织学图像预测空间基因表达 采用预训练基础模型和双分支框架,结合多级特征提取和双图策略解决切片间异质性和切片内复杂性 NA 从组织学图像预测空间转录组数据 组织学图像和空间转录组数据 空间转录组学 癌症 空间转录组学 基础模型, Transformer, 图神经网络, 多尺度卷积 图像, 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
591 2025-10-05
Persistent and progressive acute lung allograft dysfunction is linked to cell compositional and transcriptional changes in small airways
2025-Sep, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析急性肺移植物功能障碍患者小气道的细胞组成和转录变化 首次将急性肺移植物功能障碍的临床进展与单细胞水平的细胞组成和转录变化相关联 样本量较小(总样本20例),属于初步研究 识别急性肺移植物功能障碍进展为慢性肺移植物功能障碍的分子标志物 肺移植受者的小气道细胞 单细胞测序分析 肺移植相关并发症 单细胞RNA测序 PERMANOVA统计模型 单细胞转录组数据 20例肺移植受者(8例对照组,4例恢复组,5例持续组,3例进展组) NA 单细胞RNA测序 NA NA
592 2025-10-05
Pericytes change function depending on glioblastoma vicinity: emphasis on immune regulation
2025-Sep, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胶质母细胞瘤微环境中壁细胞的空间异质性及其免疫调节功能 首次发现壁细胞在肿瘤内部和边界区域具有不同的转录组特征和免疫调节功能 研究样本量有限,需要进一步验证功能机制 探究胶质母细胞瘤微环境中壁细胞的空间异质性及其免疫调节作用 小鼠和人类胶质母细胞瘤样本中的壁细胞(包括周细胞和平滑肌细胞) 单细胞测序分析 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠和人类胶质母细胞瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
593 2025-10-05
Correction to 'Immunopipe: a comprehensive and flexible scRNA-seq and scTCR-seq data analysis pipeline'
2025-Sep, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
更正 对先前发表的Immunopipe单细胞数据分析流程文章进行更正 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
594 2025-10-05
Single-cell Raman and mass spectrometry analysis to probe cellular heterogeneity in tamoxifen uptake and metabolism
2025-Sep, Analytical and bioanalytical chemistry IF:3.8Q1
研究论文 本研究结合单细胞拉曼光谱和质谱技术探究他莫昔芬在肝癌细胞中的摄取、代谢异质性 首次将单细胞拉曼光谱与质谱技术整合,实现细胞状态与药物代谢的同时评估,并采用三种药物浓度进行系统性分析 样本量较小且仅使用单一细胞系,缺乏更广泛的生物学验证 探究药物在单细胞水平的摄取、代谢异质性及其对细胞的影响 HepG2肝癌细胞系 单细胞分析 肝癌 单细胞拉曼光谱, 单细胞质谱 NA 光谱数据, 质谱数据 HepG2肝癌细胞系(具体数量未明确) NA 单细胞拉曼光谱, 单细胞质谱 NA 拉曼-质谱联合分析平台
595 2025-10-05
Role of immune cell subsets in liver fibrosis through single-cell RNA sequencing and array
2025-Sep, Cancer biomarkers : section A of Disease markers IF:2.2Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序和数据分析揭示免疫细胞亚群在肝纤维化中的作用 首次建立肝纤维化免疫细胞图谱,识别24个不同免疫细胞亚群,发现与不良预后相关的特征基因和细胞间相互作用 数据主要来源于公共数据库,缺乏实验验证 研究免疫细胞亚群在肝纤维化发病机制中的作用 肝纤维化患者 生物信息学 肝纤维化 单细胞RNA测序, ssGSEA, Kaplan-Meier分析 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
596 2025-10-05
The PAR-score based on PANoptosis genes predicts the progression of ulcerative colitis and the response to anti-TNF-α treatment
2025-Sep-11, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 基于PANoptosis基因开发PAR-score预测溃疡性结肠炎进展及抗TNF-α治疗反应 首次将PANoptosis(整合焦亡、凋亡和坏死性凋亡的协调细胞死亡机制)特征应用于溃疡性结肠炎进展和结肠炎相关结直肠癌风险的预测模型构建 研究主要基于公共数据库的转录组数据,需要进一步实验验证 阐明PANoptosis在溃疡性结肠炎进展中的作用并开发预测模型 溃疡性结肠炎患者、结肠炎相关结直肠癌病例和对照样本 生物信息学 溃疡性结肠炎 转录组分析、单细胞测序、孟德尔随机化、分子对接 风险评分模型 基因表达数据 来自GEO数据库的UC患者、CAC病例和对照样本 NA 单细胞RNA-seq, 转录组测序 NA NA
597 2025-10-05
Interferon-induced senescent CD8+ T cells reduce anti-PD1 immunotherapy efficacy in early triple-negative breast cancer
2025-Sep-10, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序发现干扰素诱导的衰老CD8+ T细胞是早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的关键因素 首次发现干扰素诱导的CD8+ T细胞衰老是早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的驱动因素,并提出了烟酰胺单核苷酸治疗策略 样本量相对有限(171例患者),需要在更大队列中验证 探索早期三阴性乳腺癌免疫治疗无效的机制并寻找解决方案 早期三阴性乳腺癌患者样本、患者来源类器官和小鼠模型 数字病理学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 病理学检测 NA 基因表达数据, 病理图像 171例早期三阴性乳腺癌患者 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
598 2025-10-05
CRISPR-based genetic tools for the study of host-microbe interactions
2025-Sep-09, Infection and immunity IF:2.9Q2
综述 本文综述了基于CRISPR的遗传工具在研究宿主-微生物相互作用中的应用与进展 系统总结了CRISPR工具在宿主-微生物互作研究中的创新应用,包括筛选、基因组编辑和记录系统,以及与单细胞RNA测序等新兴技术的结合 当前工具仍存在一定局限性,需要进一步发展更先进的遗传工具包 研究宿主-微生物相互作用的遗传基础及其在健康和疾病中的作用 宿主细胞、微生物细胞和动物模型 基因编辑技术 与宿主-微生物相互作用相关的疾病 CRISPR基因编辑, 单细胞RNA测序 NA 遗传数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
599 2025-10-05
Targeting annexin A2 enhances anti-PD-1 immunotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma by remodeling the tumor immune microenvironment
2025-Sep-09, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨膜联蛋白A2在胰腺导管腺癌中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 首次通过单细胞RNA测序发现ANXA2表达与PDAC患者预后不良相关,并证实ANXA2抑制可增强抗PD-1免疫疗法效果 研究主要基于小鼠模型,需要进一步临床验证 探索ANXA2在PDAC免疫治疗中的作用机制 胰腺导管腺癌组织和细胞 癌症免疫学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 共培养系统, 流式细胞术, 蛋白质印迹法 小鼠PDAC模型 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
600 2025-10-05
Single-cell MultiOmics and spatial transcriptomics demonstrate neuroblastoma developmental plasticity
2025-Sep-08, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学和空间转录组学技术揭示了神经母细胞瘤的发育可塑性机制 首次结合小鼠自发肿瘤模型的单细胞多组学和人类患者样本的空间转录组学,揭示了神经母细胞瘤发育中间状态及其恶性转化的表观遗传调控机制 研究样本数量有限,主要依赖小鼠模型和部分人类样本 解析神经母细胞瘤发育可塑性的调控机制 神经母细胞瘤小鼠模型和人类患者样本 数字病理学 神经母细胞瘤 单细胞多组学, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间基因表达数据 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
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