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当前共找到 813 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-03-02 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2025-Sep, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00952-9
PMID:40897908
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术，揭示了神经相关巨噬细胞在脂肪组织稳态和年龄相关炎症中的关键作用 | 首次定义了神经相关巨噬细胞作为脂肪组织巨噬细胞的一个特殊亚群，并发现其随年龄减少会加剧炎症和脂解功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证 | 探究脂肪组织巨噬细胞在年龄相关炎症中的作用机制 | 小鼠脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 年龄相关炎症 | 单细胞测序，多参数流式细胞术，血管内标记 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | 小鼠脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-02-27 |
Computational Drug Repurposing for Alzheimer's Disease via Sheaf Theoretic Population-Scale Analysis of snRNA-seq Data
2025-Sep-29, ArXiv
PMID:41256885
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研究论文 | 本文提出了一种基于鞘理论的计算药物重定位模型，用于阿尔茨海默病的治疗，通过分析大规模单核RNA测序数据来识别药物靶点 | 首次将持久鞘拉普拉斯算子应用于阿尔茨海默病的药物重定位，结合群体水平的单核RNA测序数据进行蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 研究依赖于公共数据集，可能未涵盖所有阿尔茨海默病亚型或细胞类型，且药物预测模型需进一步实验验证 | 开发一种计算药物重定位方法，以针对阿尔茨海默病的分子靶点筛选现有药物 | 阿尔茨海默病相关的微胶质细胞和脑血管组织中的多种细胞类型，涉及数十万个细胞核 | 计算生物学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | 机器学习模型 | 单核RNA测序数据 | 涉及多患者、多区域研究的数十万个细胞核 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-02-27 |
The urokinase receptor/uPAR is a major effector of p53 gain-of-function mutations in gemcitabine-treated pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110561
PMID:40759369
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研究论文 | 本文研究了在胰腺导管腺癌中，TP53功能获得性突变通过上调uPAR表达，促进吉西他滨治疗后癌细胞侵袭和转移的机制 | 揭示了TP53功能获得性突变通过上调PLAUR/uPAR表达，驱动吉西他滨治疗后胰腺癌细胞的侵袭性增强和化疗耐药，并利用单细胞RNA测序技术验证了PLAUR在特定恶性上皮细胞簇中的表达增加 | 研究主要基于细胞系和TCGA数据，缺乏体内实验验证，且EGFR沉默对uPAR介导的ERK1/2激活无影响的机制未完全阐明 | 探究TP53功能获得性突变在胰腺导管腺癌化疗耐药和侵袭转移中的作用机制 | 胰腺导管腺癌细胞系（PANC1和MIA PaCa-2）及TCGA数据库中的患者数据 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、基因沉默、细胞迁移和侵袭实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | TCGA数据库中的胰腺导管腺癌样本及PANC1、MIA PaCa-2细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-02-27 |
SMAD1/5-mediated recruitment of the histone demethylase KDM1A controls cell fate programs in embryonic stem cells
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110591
PMID:40812426
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研究论文 | 本研究揭示了SMAD1/5通过招募组蛋白去甲基化酶KDM1A来调控小鼠胚胎干细胞中细胞命运程序的转录抑制机制 | 发现了SMAD1/5通过招募KDM1A去除增强子相关的H3K4me1/2标记，从而调控细胞类型特异性基因表达程序的新机制 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型，在人类细胞或其他生物系统中的普适性尚需验证 | 探究SMAD1/5在小鼠胚胎干细胞中调控细胞命运的具体分子机制 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs） | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq） | NA | 基因表达数据，染色质修饰数据 | Smad1/5双敲除（S1/5 dKO）和野生型（WT）小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA测序，染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-02-26 |
Leveraging RNA-seq deconvolution to improve complex in vitro model characterization
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110510
PMID:40701251
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研究论文 | 本文评估了利用RNA-seq反卷积技术，结合公开单细胞RNA-seq数据集，从复杂体外模型的bulk RNA-seq数据预测细胞比例，以改进这些模型的表征 | 首次将RNA-seq反卷积技术应用于复杂体外模型（如肠道类器官和睾丸模型）的细胞组成分析，并评估了单细胞数据插补方法对反卷积准确性的提升效果 | 反卷积方法的准确性在不同分析中差异显著，且依赖于公开单细胞数据集的可用性和质量 | 开发新方法以表征复杂体外模型，用于毒理学和药物开发 | 基于干细胞的人肠道类器官CIVM和新生啮齿动物睾丸CIVM | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 反卷积模型 | bulk RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2026-02-15 |
The impact of asymmetrical gene expression on the development of spike morphology in Triticum aestivum
2025-Sep, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.70047
PMID:41674570
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组图谱探索了小麦穗发育过程中不对称基因三重表达对产量性状调控的影响 | 首次在小麦穗双棱期构建了单细胞转录组图谱，揭示了10种不同细胞类型及1410个基因的表达模式，并发现不对称基因三重表达是细胞分化的关键因素 | 研究仅基于一个普通小麦品种（济麦22）的5989个细胞，样本代表性有限，且分子调控机制仍需进一步验证 | 探究小麦穗发育的分子调控机制及其对产量性状的影响 | 普通小麦品种济麦22的双棱期穗细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 5989个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-02-15 |
Microbiota humanization drives human-like metabolic and immune transcriptomic shifts in pigs
2025-Sep, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.70034
PMID:41674575
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研究论文 | 本研究通过将人类粪便微生物群移植到抗生素处理的猪体内，建立了肠道微生物群人源化猪模型，并系统评估了其微生物组成、血清代谢物和免疫细胞谱的变化 | 首次在猪模型中通过人类粪便微生物群移植，实现了肠道微生物群、血清代谢谱和免疫细胞转录组向人类特征的系统性转变，为研究宿主-微生物群相互作用提供了一个强大的大型动物平台 | 研究未详细探讨微生物群人源化对猪器官移植排斥反应的具体影响，也未评估长期移植效果的稳定性 | 研究人类微生物群移植对猪的肠道微生物组成、代谢表型和免疫系统的影响，以推动异种移植和微生物组疗法的发展 | 肠道微生物群人源化猪模型 | 微生物组学 | NA | 宏基因组学、准靶向代谢组学、单细胞转录组测序 | NA | 宏基因组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-02-13 |
Crosstalk between the microbiota and intestinal dendritic cells in IBD
2025-Sep-30, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-025-01062-9
PMID:41028655
|
综述 | 本文综述了肠道常规树突状细胞（cDCs）在炎症性肠病（IBD）中的功能，以及微生物群对cDC生物学的影响 | 总结了单细胞测序技术如何帮助定义cDCs及其亚群，并探讨了微生物群在IBD背景下对cDC功能的影响 | cDCs在IBD中的确切作用仍不明确，特别是微生物群如何影响其功能 | 理解cDCs在肠道和IBD中的功能，以及微生物群在cDC生物学中的作用，以开发新的IBD治疗策略 | 肠道常规树突状细胞（cDCs）和肠道微生物群 | 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-02-12 |
Variational inference of single cell time series
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610389
PMID:39257806
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNOW的深度学习算法，用于解卷积单细胞时间序列数据，以分离时间依赖和独立成分 | 提出SNOW算法，能够构建有生物学意义的潜在空间、去除批次效应并生成真实的单细胞时间序列 | NA | 解决单细胞RNA测序时间序列数据分析中的挑战，如时间与细胞类型贡献的解卷积、区分真实动态与批次效应 | 单细胞RNA测序时间序列数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-02-11 |
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.673801
PMID:41000836
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研究论文 | 本研究探讨了脂氧素B4（LXB4）在眼压升高期间如何调节TRPV4通道激活的Müller胶质细胞反应性，并揭示了Müller胶质细胞自身是视网膜中LXB4的重要来源 | 首次证实Müller胶质细胞是视网膜中抗炎和神经保护性脂质介质LXB4的内源性来源，并揭示了TRPV4机械应力激活同时触发胶质增生和保护性脂质信号传导的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床样本中得到验证 | 探究LXB4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞激活和炎症，以及Müller胶质细胞自身是否参与视网膜脂氧素通路 | 小鼠Müller胶质细胞（原代和永生化细胞系）、小鼠视网膜组织 | 神经科学 | 青光眼 | RNA bulk-sequencing, qPCR, LC-MS/MS脂质组学, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 免疫染色, 免疫印迹 | NA | 转录组数据, 脂质组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-02-08 |
Single-Cell transcriptomic profiles of peripheral blood immune cells reveal early monocyte and platelet activation in the transition from high-risk states to clinical sepsis
2025-Sep-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17078-y
PMID:40998960
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了外周血免疫细胞在脓毒症高风险状态向临床脓毒症转变过程中，单核细胞和血小板早期激活的转录组重编程特征 | 首次在单细胞水平上系统描绘了脓毒症进展过程中单核细胞和血小板的动态转录组变化，并发现了一个在多种高风险人群中一致、早期且持续上调的核心基因特征（S100A8, S100A9, IFITM2, IFITM3） | 研究样本量相对有限，且主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证 | 阐明从脓毒症高风险状态向临床脓毒症转变过程中的免疫细胞转录组变化特征 | 健康对照、脓毒症高风险个体、临床脓毒症患者的外周血免疫细胞，以及独立队列中的极早产脓毒症婴儿和老年糖尿病患者 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照、高风险个体、临床脓毒症患者，以及独立队列的极早产婴儿和老年糖尿病患者（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-02-07 |
Hypertension-Induced Neurovascular and Cognitive Dysfunction at Single-Cell Resolution
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.14.648770
PMID:41000655
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在高血压小鼠模型中揭示了高血压诱导神经血管和认知功能障碍的早期分子机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示了高血压诱导的早期内皮细胞、中间神经元和少突胶质细胞脆弱性，为神经血管功能障碍和认知障碍提供了分子基础 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；样本时间点有限，未涵盖更长期的动态变化 | 探究高血压如何通过影响脑细胞导致神经血管和认知功能障碍的分子机制 | 高血压小鼠模型（由血管紧张素II诱导）中的新皮质细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 高血压小鼠模型在不同时间点（3天和42天）的新皮质样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-02-07 |
Recent Advances in Deciphering Normal and Diseased Aortic Valve Biology Using Transcriptomic Technologies
2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70835
PMID:40903834
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综述 | 本文综述了转录组学技术在揭示正常与病变主动脉瓣生物学机制方面的最新进展 | 强调了利用单细胞测序等转录组学技术解析主动脉瓣细胞可塑性、异质性及细胞间相互作用的新视角，并首次系统性地提出将健康基线特征作为疾病解读的参照标准 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，依赖已有研究的整合分析 | 通过整合转录组学发现，识别关键分子靶点以推动钙化性主动脉瓣疾病的有效疗法开发 | 主动脉瓣的正常与病变生物学机制，重点关注瓣膜内皮细胞与单核细胞的相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序（RNAseq），单细胞测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-02-03 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
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研究论文 | 本文报道了乳腺癌中肿瘤细胞通过去分化程序表达白细胞表面受体蛋白，称为“免疫拟态”，并探讨其与肿瘤进展和治疗抵抗的关系 | 首次提出乳腺癌细胞通过“免疫拟态”表达白细胞表面受体蛋白，并证明这赋予肿瘤细胞增殖优势，促进早期肿瘤生长 | 需要更多乳腺癌队列验证其预后价值，并评估与远端转移、生存期和治疗反应的相关性 | 研究乳腺癌细胞去分化程序中的免疫拟态现象及其对肿瘤进展的影响 | 人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织病理学标本、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺癌症模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据、图像、细胞系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-02-03 |
Single-cell and clonal analysis of AL amyloidosis plasma cells and their bone marrow microenvironment
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024719
PMID:40493887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和克隆分析，揭示了AL淀粉样变性患者浆细胞及其骨髓微环境的转录特征和功能改变 | 首次在治疗初治的AL淀粉样变性患者中，结合单细胞RNA测序和定量蛋白质组学，系统描绘了克隆性浆细胞及其骨髓微环境的转录景观，并识别出与蛋白质稳态相关的关键基因表达变化 | 研究样本量有限，且为横断面研究，未能追踪疾病进展或治疗后的动态变化 | 阐明AL淀粉样变性中克隆性浆细胞的功能特性及其与骨髓微环境的相互作用 | 新诊断、未经治疗的AL淀粉样变性患者和健康对照者的骨髓样本 | 单细胞组学 | AL淀粉样变性 | 5' 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 新诊断、未经治疗的AL淀粉样变性患者和健康对照者（具体人数未在摘要中明确给出） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5' 单细胞RNA测序 |
| 56 | 2026-02-02 |
Primary cilia in growth plates orchestrate long bone development
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2025.04.014
PMID:41613437
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研究论文 | 本研究揭示了初级纤毛在生长板中通过调控关键信号通路和干细胞命运，对长骨发育起关键作用 | 首次系统性地报告了初级纤毛存在于生长板的所有区域，并阐明了其通过介导Wnt等信号通路、调控骨骼干细胞不对称分裂来协调长骨发育的具体机制 | 研究主要基于条件性基因敲除小鼠模型，在人类骨骼疾病中的直接相关性仍需进一步验证 | 探究初级纤毛在长骨发育和修复中的作用机制 | 生长板软骨细胞、成骨细胞及骨骼干细胞 | 发育生物学 | 骨骼发育障碍 | 空间转录组学、条件性基因敲除、延时成像 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 空间转录组数据、显微成像数据 | 条件性敲除小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 57 | 2026-01-28 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2025-Sep-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96713
PMID:40982369
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习工具DEGAS，通过单细胞RNA-seq数据识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 应用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据，首次识别出与2型糖尿病和肥胖相关的独特β细胞亚群，并验证了CDKN1C和DLK1基因的表达差异 | 研究仅基于现有单细胞RNA-seq数据，未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集以揭示复杂的多细胞相互作用 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群，以更好地理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗的相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据 | 来自健康和非糖尿病捐赠者的人类胰腺切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-01-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651101
PMID:40475445
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研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序协议，以提升胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 通过优化5'文库制备协议和靶向耗竭胰岛素转录本，提高了单细胞长读长测序的读长和转录本检测效率 | 单细胞长读长测序存在技术挑战，如读长不足和错误率较高 | 优化单细胞长读长测序协议，以增强胰腺胰岛中异构体的检测 | 胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-01-28 |
Investigating Gene Expression Noise Reduction by MicroRNAs and MiRISC Reinforcement by Self-Feedback Regulation of mRNA Degradation
2025-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637731
PMID:39990448
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研究论文 | 本研究通过数学建模和单细胞RNA-seq数据分析，探讨了microRNA通过负自反馈调控mRNA降解来降低基因表达噪声的机制 | 首次同时分析mRNA降解动力学和表达噪声，并证明通过mRNA降解的自反馈调控可以降低噪声 | NA | 研究microRNA介导的基因表达噪声减少机制 | microRNA诱导的沉默复合体（miRISC）及其靶向的mRNAs | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学建模 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-01-25 |
Spatially resolved transcriptomics of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf016
PMID:39847441
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术分析良性和恶性外周神经鞘瘤，揭示其空间和生物学异质性 | 首次将空间转录组学应用于外周神经鞘瘤，构建了空间细胞分化图谱，并整合了组织学特征和单细胞数据 | 作为一项试点研究，样本量有限，未来需要更大规模验证 | 确定外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性，以改善其分类和诊断 | 福尔马林固定石蜡包埋的患病外周神经组织样本 | 数字病理学 | 外周神经鞘瘤 | 空间转录组学 | 空间聚类和加权相关网络分析 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |