单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 792 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-10-05 |
Analysis of immune cell infiltration landscape and identification of diagnostic biomarkers in ankylosing spondylitis
2025-Sep, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0252297
PMID:40936943
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证鉴定强直性脊柱炎中免疫细胞相关诊断生物标志物 | 首次结合多种生物信息学方法和实验验证鉴定出CX3CR1等三个免疫细胞相关生物标志物在强直性脊柱炎中的诊断价值 | 研究样本量有限，主要依赖公共数据库数据，需要更大规模临床样本验证 | 筛选和验证强直性脊柱炎中免疫细胞相关的诊断生物标志物 | 强直性脊柱炎患者和对照样本的基因表达数据 | 生物信息学 | 强直性脊柱炎 | 差异表达分析,免疫细胞浸润分析,WGCNA,ROC分析,RT-qPCR,免疫荧光染色,单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE25101,GSE41038,GSE73754,GSE194315) | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 562 | 2025-10-05 |
Plasma proteomic signature for preoperative prediction of microvascular invasion in HCC
2025-Sep, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101481
PMID:40823177
|
研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析开发了用于术前预测肝细胞癌微血管侵犯风险的血液检测工具 | 首次发现TALDO1、PDIA3和PGK1三个血浆蛋白生物标志物，并建立了基于机器学习的PRIM预测模型 | 样本量相对有限（160例患者），需要更大规模的前瞻性研究验证 | 开发术前非侵入性预测肝细胞癌微血管侵犯的方法 | 肝细胞癌患者 | 生物医学 | 肝细胞癌 | 数据非依赖性采集质谱，单细胞RNA测序，ELISA | 机器学习模型 | 蛋白质组数据，RNA测序数据 | 160例HCC患者（80例MVI阳性，80例MVI阴性），来自四个医疗中心 | NA | 质谱分析，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 563 | 2025-10-05 |
Deciphering tryptophan metabolism in colorectal cancer through multi-omics analysis
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102157
PMID:40836965
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示色氨酸代谢在结直肠癌中的关键作用及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 整合非靶向代谢组学、靶向代谢组学和单细胞RNA测序数据，首次系统阐明色氨酸代谢在结直肠癌中的调控机制及其与M2巨噬细胞极化的直接因果关系 | 研究主要基于回顾性队列分析，需要进一步的前瞻性研究验证临床适用性 | 探究色氨酸代谢在结直肠癌发生发展中的作用机制 | 结直肠癌组织及配对癌旁组织 | 多组学分析 | 结直肠癌 | 非靶向代谢组学, 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 多种机器学习算法 | 代谢组数据, 转录组数据 | 多个独立队列的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 564 | 2025-10-05 |
Ginsenoside Rb1 attenuates coronary microvascular inflammatory injury via NDUFS4-SIRT5-DUSP1-mediated mitochondrial quality control in a murine ischemia-reperfusion model
2025-Sep, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2025.04.006
PMID:40843019
|
研究论文 | 本研究探讨人参皂苷Rb1通过NDUFS4-SIRT5-DUSP1轴调控线粒体质量控制网络，减轻小鼠缺血再灌注模型中冠状动脉微血管炎性损伤的分子机制 | 首次揭示人参皂苷Rb1通过NDUFS4-SIRT5-DUSP1信号轴调控线粒体质量控制网络在冠状动脉疾病中的保护作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，临床转化价值需进一步验证 | 探究人参皂苷Rb1在缺血再灌注损伤中对内皮细胞的保护作用机制 | 小鼠模型（SIRT5CKO/TG和NDUFS4CKO/TG）、细胞模型（Si-DUSP-1/ad-DUSP-1和si-SIRT5/ad-SIRT5） | 分子生物学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞转录组测序、基因修饰技术、荧光检测、线粒体膜电位测定、RT-PCR、Western blotting | 基因敲除/过表达小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 565 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal Dynamics of Central Nervous System Diseases: Advancing Translational Neuropathology via Single-Cell and Spatial Multiomics
2025-Sep, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70328
PMID:40843131
|
综述 | 本文探讨了通过单细胞和空间多组学技术解析中枢神经系统疾病的时空动态特征 | 提出整合单细胞RNA测序与空间转录组学的多组学融合策略，揭示疾病进展中的空间协调分子网络 | 面临数据标准化、亚细胞空间分辨率和计算可扩展性等挑战 | 推动转化神经病理学发展，实现精准临床干预 | 中枢神经系统疾病（如中风、阿尔茨海默病、帕金森病等） | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 566 | 2025-10-05 |
Bioinformatics and experimental approach identify DNMT3A as a diagnostic marker associated with regulated cell death patterns in psoriasis
2025-Sep, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1016/j.jgeb.2025.100526
PMID:40854645
|
研究论文 | 通过生物信息学和实验方法鉴定DNMT3A作为与银屑病调控性细胞死亡模式相关的诊断标志物 | 首次系统评估调控性细胞死亡在银屑病中的作用，建立RCD评分系统并鉴定出五个特征基因 | 研究基于10个转录组数据集，样本来源和规模可能存在限制 | 探索调控性细胞死亡模式在银屑病诊断中的价值 | 银屑病患者转录组数据和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 银屑病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 机器学习, 孟德尔随机化分析 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 10个银屑病转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 567 | 2025-10-05 |
CD2-CD58 axis orchestrates cytotoxic T lymphocyte function and metabolic crosstalk in breast cancer brain metastasis
2025-Sep, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.70040
PMID:40859981
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨CD2-CD58信号轴在乳腺癌脑转移中对效应T细胞功能和肿瘤代谢互作的影响 | 首次揭示CD2-CD58信号轴在乳腺癌脑转移微环境中调控细胞毒性T淋巴细胞功能和代谢重编程的关键作用 | 研究主要基于实验模型，需要进一步临床验证 | 探究CD2-CD58信号轴在乳腺癌脑转移中对免疫细胞功能和代谢调控的机制 | 乳腺癌脑转移模型中的CD8 T细胞和肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 568 | 2025-10-05 |
Activity and Heterogeneity of Astrocytes in Neurological Diseases: Molecular Mechanisms and Therapeutic Targets
2025-Sep, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70329
PMID:40859959
|
综述 | 本文综述了星形胶质细胞在神经系统疾病中的活动特性和异质性，探讨其分子机制及作为治疗靶点的潜力 | 通过单细胞测序技术揭示星形胶质细胞的显著异质性及其不同亚群在疾病进展中的特异性作用 | NA | 阐明星形胶质细胞在神经系统疾病中的双重作用及其分子机制，推动精准医疗发展 | 中枢神经系统中的星形胶质细胞及其在多种神经系统疾病中的表现 | 神经科学 | 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、肌萎缩侧索硬化、缺血性卒中、脑出血、多发性硬化等神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 569 | 2025-10-05 |
Penthorum chinense Pursh extract ameliorates lupus nephritis disease in MRL/lpr mice via the PPARγ/NFκB signaling axis
2025-Sep-25, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120379
PMID:40780476
|
研究论文 | 本研究探讨了Penthorum chinense Pursh提取物通过PPARγ/NFκB信号轴改善狼疮性肾炎的机制 | 首次揭示PGF通过调节巨噬细胞PPARγ/NFκB信号轴改善狼疮性肾炎的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未进行人体临床试验 | 评估Penthorum chinense Pursh提取物对狼疮性肾炎的治疗作用及机制 | MRL/lpr小鼠模型、Raw264.7巨噬细胞和HK2细胞 | 生物医学研究 | 狼疮性肾炎 | UPLC-Q-TOF/MS, 转录组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹, 双荧光素酶报告基因检测, RT-qPCR | 动物疾病模型 | 分子生物学数据, 组学数据, 病理学数据 | MRL/lpr小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 570 | 2025-10-05 |
Transcriptomic bioinformatics analysis proposes a novel BCL2-MAPK14-TXN oxidative stress diagnostic model of sepsis and identifies TXN as an oxidative stress-related signature gene in sepsis
2025-Sep-23, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115016
PMID:40540896
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析提出了一个新型的BCL2-MAPK14-TXN氧化应激诊断模型用于脓毒症诊断，并确定TXN为脓毒症中氧化应激相关特征基因 | 首次提出BCL2-MAPK14-TXN诊断模型，并通过实验初步验证TXN在脓毒症氧化应激中的作用 | 需要进一步实验验证以促进临床应用 | 筛选脓毒症氧化应激相关基因并验证其诊断价值 | 脓毒症患者基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 微阵列分析，单细胞RNA测序，机器学习算法 | 机器学习算法，诊断列线图 | 基因表达数据 | 来自四个GEO数据集(GSE65682, GSE95233, GSE131761, GSE33118)和单细胞RNA测序数据集(GSE175453) | NCBI | 微阵列，单细胞RNA测序 | GEO数据库 | NCBI基因表达综合数据库 |
| 571 | 2025-10-05 |
Pharming: Joint Clonal Tree Reconstruction of Single-Nucleotide Variant and Copy Number Aberration Evolution from Single-Cell DNA Sequencing of Tumors
2025-Sep-15, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666251374694
PMID:40944534
|
研究论文 | 提出一种名为Pharming的新方法，用于从单细胞DNA测序数据中联合重建单核苷酸变异和拷贝数畸变的克隆进化树 | 首次实现SNV和CNA的联合进化历史推断，利用拷贝数推断的高准确性和SNV与CNA区域的共现性来提高系统发育重建精度 | 方法依赖于低覆盖度单细胞测序技术，SNV检测可靠性存在挑战 | 重建肿瘤进化历史，理解突变获取顺序和不同类型改变之间的动态相互作用 | 肿瘤细胞中的单核苷酸变异和拷贝数畸变 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞DNA测序，全基因组测序 | 肿瘤系统发育推断方法 | DNA测序数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | 高通量低覆盖度单细胞DNA测序技术 |
| 572 | 2025-10-05 |
High-plex imaging of hepatoblastoma and adjacent liver in pediatric patients reveals a predominant myeloid infiltrate expressing immune-checkpoints
2025-Sep-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04164-3
PMID:40944713
|
研究论文 | 通过高维度成像技术分析儿童肝母细胞瘤的免疫景观特征 | 首次系统描绘肝母细胞瘤的免疫微环境特征，发现髓系细胞浸润为主并表达免疫检查点 | 样本量有限，主要基于观察性研究 | 表征肝母细胞瘤免疫景观以探索免疫治疗策略 | 儿童肝母细胞瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 成像质谱流式技术，免疫荧光，单细胞RNA测序 | NA | 组织图像，基因表达数据 | 未治疗和化疗后肝母细胞瘤组织及配对正常肝组织 | NA | 成像质谱流式，单细胞RNA测序，免疫荧光 | NA | NA |
| 573 | 2025-10-05 |
Draft de novo genome construction of Scytonema sp. PRP1: identified from single-cell sequencing library preparation
2025-Sep-11, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/mra.00029-25
PMID:40744872
|
研究论文 | 通过单细胞测序文库制备鉴定并构建了Scytonema sp. PRP1蓝藻菌的基因组草图 | 首次从人类脑组织单细胞测序文库中鉴定出蓝藻菌并完成其基因组从头组装 | NA | 构建蓝藻菌Scytonema sp. PRP1的基因组序列 | Scytonema sp. PRP1蓝藻菌 | 基因组学 | NA | 单细胞测序，基因组从头组装 | NA | 基因组序列数据 | 1个蓝藻菌株 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 574 | 2025-10-05 |
Upfront whole blood transcriptional patterns in patients receiving immune checkpoint inhibitors associate with clinical outcome
2025-Sep-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04155-4
PMID:40931197
|
研究论文 | 本研究通过全血转录组分析识别与免疫检查点抑制剂临床疗效相关的转录模式 | 首次在14,085个全血转录组中应用共识独立成分分析识别转录成分，并验证其与免疫治疗临床结局的关联 | 样本量相对有限（145例患者），需要更大规模研究验证 | 开发基于全血转录组学的无创生物标志物以改善免疫治疗患者分层 | 晚期癌症患者接受免疫检查点抑制剂治疗 | 生物信息学 | 晚期癌症 | RNA测序，共识独立成分分析，基因集富集分析，单细胞转录组分析 | 多变量分析，置换检验框架 | 全血RNA测序数据，单细胞转录组数据 | 145例患者预处理全血样本，14,085个公共全血转录组 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2025-10-05 |
Xcr1+ type 1 conventional dendritic cells are essential mediators for atherosclerosis progression
2025-Sep-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107742
PMID:40934103
|
研究论文 | 本研究揭示了Xcr1+ cDC1细胞通过Xcl1信号通路促进动脉粥样硬化进展的关键机制 | 首次证实cDC1细胞在动脉粥样硬化斑块中的存在，建立了新型cDC1条件性敲除小鼠模型，并发现通过Xcl1靶向cDC1可抑制动脉粥样硬化发展 | 未详细阐明cDC1细胞异质性的具体功能差异，血清脂质水平和巨噬细胞变化未观察到显著差异 | 探究cDC1细胞在动脉粥样硬化发展中的作用机制 | 人类动脉粥样硬化斑块、小鼠模型、Xcr1+ cDC1细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、遗传工程小鼠模型 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、病理学数据 | 人类动脉粥样硬化斑块样本、高脂血症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 576 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell atlas of human atherosclerotic plaques
2025-Sep-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63202-x
PMID:40931012
|
研究论文 | 构建人类动脉粥样硬化斑块整合单细胞图谱，揭示斑块进展的细胞机制 | 首次创建全面整合的人类动脉粥样硬化斑块单细胞图谱，通过专家共识和表面蛋白测量验证细胞类型注释，识别斑块中性粒细胞特异性标志物、促血管生成内皮细胞簇和特殊巨噬细胞亚群 | NA | 阐明动脉粥样硬化斑块进展的免疫机制和结构细胞转化 | 人类动脉粥样硬化斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 约25万个高质量注释细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 577 | 2025-10-05 |
Comparative efficacy and safety of PSCA CAR-engineered Vδ1 γδ T cells for immunotherapy of pancreatic cancer
2025-Sep-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011890
PMID:40930745
|
研究论文 | 本研究比较了PSCA CAR工程化Vδ1 γδ T细胞在胰腺癌免疫治疗中的疗效和安全性 | 首次直接比较CAR工程化Vδ1 γδ T细胞、Vδ2 γδ T细胞和传统αβ T细胞在胰腺癌治疗中的安全性和有效性 | Vδ1 γδ T细胞在外周血中丰度较低且体外扩增困难 | 评估CAR工程化Vδ1 γδ T细胞对胰腺癌的免疫治疗效果和安全性 | 前列腺干细胞抗原(PSCA)表达的胰腺肿瘤细胞 | 免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞疗法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 578 | 2025-10-05 |
The RNA-Binding Protein RBMX Mediates the Immunosuppressive Microenvironment of Osteosarcoma by Regulating CD8+T Cells
2025-Sep-06, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172928
PMID:40941025
|
研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白RBMX通过调控CD8+T细胞介导骨肉瘤免疫抑制微环境的机制 | 首次发现RBMX在骨肉瘤中高表达并通过调控H2-K1和THBS1影响CD8+T细胞浸润 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究RBMX在骨肉瘤免疫微环境中的调控机制 | 骨肉瘤细胞、CD8+T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、多重免疫荧光、PCR | 小鼠皮下移植瘤模型 | 转录组测序数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 | 人类骨肉瘤数据库和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 579 | 2025-10-05 |
Long Noncoding RNAs as Emerging Regulators of Seed Development, Germination, and Senescence
2025-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178702
PMID:40943616
|
综述 | 本文综述了长链非编码RNA在种子发育、萌发和衰老过程中的调控作用 | 整合了lncRNAs在种子发育关键阶段的多重调控机制，包括染色质重塑、RNA指导的DNA甲基化等新兴功能 | NA | 探讨lncRNAs在种子发育生理过程中的调控功能 | 种子发育过程（胚胎发生、成熟、休眠、萌发和衰老） | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、直接RNA测序、RNA-染色质相互作用图谱 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 580 | 2025-10-05 |
Application of Single-Cell Sequencing and Machine Learning in Prognosis and Immune Profiling of Lung Adenocarcinoma: Exploring Disease Mechanisms and Treatment Strategies Based on Circadian Rhythm Gene Signatures
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172911
PMID:40941008
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习方法，基于昼夜节律基因构建肺腺癌预后模型并探索其免疫特征 | 首次结合单细胞测序和机器学习分析昼夜节律基因在肺腺癌中的作用，发现ARNTL2基因的关键促癌功能 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证部分相对有限 | 探索昼夜节律基因在肺腺癌预后和免疫特征中的作用机制 | 肺腺癌患者组织和细胞系 | 机器学习, 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 转录组测序 | Stepwise Cox回归, SuperPC | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |