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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-10-05 |
Long Noncoding RNAs as Emerging Regulators of Seed Development, Germination, and Senescence
2025-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178702
PMID:40943616
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综述 | 本文综述了长链非编码RNA在种子发育、萌发和衰老过程中的调控作用 | 整合了lncRNAs在种子发育关键阶段的多重调控机制,包括染色质重塑、RNA指导的DNA甲基化等新兴功能 | NA | 探讨lncRNAs在种子发育生理过程中的调控功能 | 种子发育过程(胚胎发生、成熟、休眠、萌发和衰老) | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、直接RNA测序、RNA-染色质相互作用图谱 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 562 | 2025-10-05 |
Application of Single-Cell Sequencing and Machine Learning in Prognosis and Immune Profiling of Lung Adenocarcinoma: Exploring Disease Mechanisms and Treatment Strategies Based on Circadian Rhythm Gene Signatures
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172911
PMID:40941008
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习方法,基于昼夜节律基因构建肺腺癌预后模型并探索其免疫特征 | 首次结合单细胞测序和机器学习分析昼夜节律基因在肺腺癌中的作用,发现ARNTL2基因的关键促癌功能 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分相对有限 | 探索昼夜节律基因在肺腺癌预后和免疫特征中的作用机制 | 肺腺癌患者组织和细胞系 | 机器学习, 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 转录组测序 | Stepwise Cox回归, SuperPC | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 563 | 2025-10-05 |
An Update on Single-Cell RNA Sequencing in Illuminating Disease Mechanisms of Cutaneous T-Cell Lymphoma
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172921
PMID:40941016
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在皮肤T细胞淋巴瘤疾病机制研究中的最新应用进展 | 系统总结了单细胞RNA测序在揭示CTCL肿瘤微环境异质性和相互作用网络中的最新发现 | CTCL疾病本身具有高度异质性,现有研究仍存在样本量有限等局限 | 更新单细胞RNA测序在皮肤T细胞淋巴瘤研究中的应用现状和发现 | 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL) | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 564 | 2025-10-05 |
PIAS1 Shapes a Tumor-Suppressive Microenvironment by Suppressing Immune Evasion in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Sep-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172905
PMID:40941002
|
研究论文 | 本研究通过免疫组化和单细胞RNA测序分析,揭示了PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境中抑制免疫逃逸并塑造肿瘤抑制性微环境的作用机制 | 首次系统阐明PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境非恶性基质和免疫细胞中的表达特征和功能,发现PIAS1阳性细胞具有肿瘤抑制特性而阴性细胞富集免疫抑制信号 | 研究主要基于观察性数据分析,需要进一步的功能实验验证PIAS1的具体作用机制 | 探究PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境中的表达特征和功能相关性 | 口腔鳞癌组织样本和正常组织样本 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组织化学,单细胞RNA测序,差异基因表达分析,通路分析,细胞间通讯推断 | NA | 组织图像,单细胞RNA测序数据 | 口腔鳞癌组织微阵列和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 565 | 2025-10-05 |
Unraveling the developmental heterogeneity of human retinal ganglion cells within the developing retina to study to the continuity of maturation
2025-Sep-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.08.025
PMID:40912448
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析人类视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的连续成熟轨迹 | 首次构建了人类胎儿视网膜从第8周到第27周的单细胞图谱,并应用伪时间分析揭示了视网膜神经节细胞成熟的连续性过程 | 研究仅涵盖胎儿发育阶段,缺乏成年期视网膜发育数据 | 解析人类视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的成熟异质性和连续性 | 人类胎儿视网膜组织中的视网膜神经节细胞 | 单细胞基因组学 | 视网膜发育疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 人类胎儿视网膜样本(孕周8-27周) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 566 | 2025-10-05 |
Machine Learning Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data Reveals Cathepsin B as a Central PANoptosis Regulator in Influenza
2025-Sep-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178533
PMID:40943452
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法,揭示了组织蛋白酶B在流感病毒感染中作为PANoptosis核心调控因子的作用 | 首次将bulk和单细胞RNA测序数据整合分析,采用多种机器学习算法识别PANoptosis关键调控基因,发现组织蛋白酶B在流感相关肺损伤中的核心调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人体中的验证尚需进一步研究 | 探究流感病毒感染中PANoptosis的分子调控机制 | 流感A病毒感染的肺组织 | 机器学习 | 流感 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SVM, Random Forest, LASSO回归 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 567 | 2025-10-05 |
BMP5 signalling in beta cells and the impact on insulin secretion in the context of type 2 diabetes
2025-Sep, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06457-9
PMID:40471239
|
研究论文 | 本研究探讨BMP5信号在胰岛β细胞中的表达及其对胰岛素分泌的影响 | 首次揭示BMP5是β细胞中主要表达的BMP配体,并发现其在2型糖尿病中上调会损害β细胞功能 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探究BMP5信号在胰岛β细胞功能维持中的作用机制 | 人胰岛细胞和EndoC-βH1细胞系 | 细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,基因敲低,线粒体呼吸测量,葡萄糖刺激胰岛素分泌测试 | NA | 基因表达数据,生理功能数据 | 来自有无2型糖尿病供体的人胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 568 | 2025-10-05 |
CXCL6 Is a Novel Biliary Marker and a Downstream Target of MMP7 in Biliary Atresia
2025-Sep, Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/hepr.14217
PMID:40515742
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CXCL6是MMP7的下游靶点,并验证其作为胆道闭锁新型胆道标志物的潜力 | 首次发现CXCL6是MMP7在胆道闭锁中的下游靶点,并证实其在肝纤维化过程中的病理作用 | 未阐明MMP7-CXCL6信号通路在胆道闭锁发病机制中的完整分子机制 | 探究MMP7在胆道闭锁发病机制中的下游信号通路 | 胆道闭锁患者肝脏组织和血清样本,胆管上皮细胞 | 单细胞组学 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化,Western blot,ELISA,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据,蛋白表达数据 | 胆道闭锁患者、非胆道闭锁胆汁淤积患者和正常对照的肝脏及血清样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 569 | 2025-10-05 |
Heterogeneity in Osteosarcoma Revealed by scRNA Sequencing: CLU+ Endothelial Cells as Key Players in Tumor Progression
2025-Sep, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70138
PMID:40623412
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤的空间异质性,发现外周区域CLU+内皮细胞在肿瘤进展中的关键作用 | 首次在骨肉瘤中系统比较中心区域和外周区域的单细胞转录组差异,鉴定出CLU+内皮细胞亚群通过ITGB1介导的胶原蛋白家族成员促进肿瘤转移,并通过Nectin2-TIGIT通路诱导CD8+ T细胞耗竭 | 样本量较小(仅6例患者),需要更大规模研究验证发现 | 探索骨肉瘤瘤内异质性在肿瘤进展中的作用机制 | 骨肉瘤患者的配对肿瘤组织样本(中心区域和外周区域) | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例骨肉瘤患者的配对肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2025-10-05 |
Investigating cytotoxic and inflammatory human IL-7 receptor low effector memory CD8+ T cells in lupus
2025-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105898
PMID:40857939
|
研究论文 | 本研究通过分析狼疮患者外周血和肾脏组织中的CD8+ T细胞异质性,揭示了IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的关键作用 | 首次发现IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞在狼疮患者中积累,并证明其通过TNF-α和IFN-γ依赖性方式诱导中性粒细胞胞外诱捕网形成 | 研究主要基于转录组数据和体外实验,需要进一步的功能验证和机制研究 | 探讨CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的作用及其异质性意义 | 狼疮患者的外周血和肾脏组织样本 | 免疫学 | 狼疮 | 单细胞RNA测序,微阵列,成像质谱流式细胞术 | NA | RNA测序数据,微阵列数据,图像数据 | 狼疮患者和正常人的外周血及肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 571 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal Proliferative Heterogeneity of Intraorgan Endothelial Cells
2025-Sep-12, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326748
PMID:40814781
|
研究论文 | 本研究揭示了心脏、肝脏和肺脏中内皮细胞增殖的时空异质性及其调控机制 | 首次开发内皮细胞特异性增殖追踪系统,发现同一器官内不同区域内皮细胞存在显著增殖异质性 | 研究主要聚焦于三种器官,其他器官的内皮细胞增殖异质性仍需进一步探索 | 探究同一器官内内皮细胞增殖的时空异质性及其分子机制 | 小鼠心脏、肝脏和肺脏的内皮细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | RNA测序,空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | 多个器官的内皮细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 572 | 2025-10-05 |
Customized Design and Preparation of Bionic Drug Delivery System Leveraging Single-Cell RNA Sequencing for Precisely Targeted Therapy
2025-Sep-12, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501497
PMID:40936355
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术开发了一种针对急性肾损伤关键细胞亚型的仿生药物递送系统 | 首次结合单细胞RNA测序技术识别急性肾损伤的关键细胞亚型,并基于此定制设计仿生药物递送系统 | 研究仅针对急性肾损伤模型,在其他疾病中的应用效果尚待验证 | 开发精准靶向治疗的仿生药物递送系统 | 急性肾损伤的关键细胞亚型(PTIs) | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 573 | 2025-10-05 |
Retinoic Acid Inhibition Alters Intestinal Composition in Zebrafish: A Non-genetic Model to Study Hirschsprung Disease?
2025-Sep-12, Neurogastroenterology and motility
IF:3.5Q2
DOI:10.1111/nmo.70155
PMID:40937495
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研究论文 | 本研究通过抑制斑马鱼体内视黄酸合成,探究其对肠道细胞组成的广泛影响及其作为先天性巨结肠疾病模型的潜力 | 首次在斑马鱼模型中系统揭示视黄酸抑制对神经元和非神经元肠道细胞组成的全面影响,并比较其与遗传性HSCR模型的差异 | 两种模型(DEAB处理和ret突变)在非神经元细胞变化方面存在显著差异,提示模型间的生物学机制不完全一致 | 研究视黄酸在肠道发育中的作用及其与先天性巨结肠疾病的关联 | 斑马鱼幼虫 | 发育生物学 | 先天性巨结肠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | DEAB处理组、野生型和ret突变HSCR模型斑马鱼 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 574 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals developmental trajectories and environmental regulation of callus formation in Arabidopsis
2025-Sep-12, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00255-4
PMID:40938467
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了拟南芥愈伤组织形成的发育轨迹和环境调控机制 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了愈伤组织发育过程中的转录组动态和转录因子调控网络 | 研究仅聚焦于拟南芥模型,未在其他植物物种中验证 | 探索植物愈伤组织发育的调控网络和细胞命运决定机制 | 拟南芥愈伤组织细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP聚类,伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 拟南芥愈伤组织在起始、增殖和绿化三个关键阶段的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 575 | 2025-10-05 |
AP2X-1 is a negative regulator of Toxoplasma gondii sexual commitment
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00052-25
PMID:40823841
|
研究论文 | 本研究鉴定AP2X-1作为弓形虫有性发育的关键负调控因子 | 首次发现AP2X-1通过调控HDAC3/MORC复合物功能抑制缓殖子和有性阶段特异性基因表达 | 未明确AP2X-1与HDAC3/MORC复合物相互作用的分子机制细节 | 探究弓形虫生活周期转换的调控机制 | 弓形虫AP2X-1转录因子及其调控网络 | 分子生物学 | 寄生虫感染 | 单细胞测序,CUT&Tag,ATAC-seq | 基因敲除模型 | 基因组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,染色质可及性分析 | NA | NA |
| 576 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing reveals the immune microenvironment in osteoarthritis: from heterogeneity to therapeutic targets
2025-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115521
PMID:40934543
|
综述 | 系统总结单细胞RNA测序技术在解析骨关节炎免疫微环境中的关键进展 | 从传统机械磨损理论转向免疫炎症驱动新范式,首次系统绘制免疫细胞动态轨迹和细胞间配体-受体网络 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究进行理论总结 | 解析骨关节炎免疫微环境特征并寻找治疗靶点 | 骨关节炎患者关节组织中的免疫细胞和关节常驻细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 577 | 2025-10-05 |
Endothelin B receptor inhibition rescues aging-dependent neuronal regenerative decline
2025-Sep-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100217
PMID:40924015
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研究论文 | 本研究揭示通过抑制内皮素B受体可改善衰老导致的神经元再生能力下降 | 首次发现卫星胶质细胞表达内皮素B受体,并证明其抑制可逆转衰老相关的轴突再生能力下降 | 机制研究尚未完全阐明,临床转化需要进一步验证 | 探索衰老导致神经元再生能力下降的机制及治疗策略 | 背根神经节中的感觉神经元和卫星胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,电子显微镜 | NA | 基因表达数据,显微图像 | 成年和老年小鼠的背根神经节 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 578 | 2025-10-05 |
Computational pathology annotation enhances the resolution and interpretation of breast cancer spatial transcriptomics data
2025-Sep-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01104-3
PMID:40925915
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研究论文 | 本研究开发了一种计算病理学图像分析流程,用于增强乳腺癌空间转录组数据的解析和解释 | 提出计算组织注释(CTA)流程,利用机器学习算法在Visium平台数据中精确映射肿瘤、基质和免疫区室,提高数据分析分辨率 | 研究样本量较小(仅4名患者的23个肿瘤切片),且空间转录组技术尚未达到单细胞分辨率 | 开发计算病理学方法以增强乳腺癌空间转录组数据的解析能力 | 乳腺癌肿瘤组织切片 | 计算病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,机器学习 | 机器学习算法 | 图像,空间转录组数据 | 4名患者的23个乳腺癌肿瘤切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台 |
| 579 | 2025-10-05 |
Dynamic interaction of oligodendrocyte precursor cells with other cell types in the central nervous system
2025-Sep-08, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106050
PMID:40930164
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综述 | 系统梳理少突胶质前体细胞与中枢神经系统其他细胞类型的动态相互作用及其功能多样性 | 突破传统仅关注髓鞘形成功能的认知,通过单细胞测序和活体成像技术揭示OPCs在神经发育、稳态维持和病理重塑中的多模态功能 | NA | 整合OPCs非髓鞘形成功能的现有证据,探讨神经再生医学的治疗靶点 | 少突胶质前体细胞与神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、血管内皮细胞的相互作用 | 神经科学 | 多发性硬化症, 脑缺血 | 单细胞测序, 活体成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 580 | 2025-10-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify dihydrolipoic acid succinyltransferase as a promoter of tumor invasion via vascular pathways in cutaneous melanoma
2025-Sep-07, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147504
PMID:40925436
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了二氢硫辛酸琥珀酰转移酶通过血管途径促进皮肤黑色素瘤侵袭的新机制 | 首次发现DLST通过调控组蛋白去甲基化酶KDM4C活性,影响H3K9和H3K27去甲基化,从而促进黑色素瘤进展 | DLST与KDM4C相互作用的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究DLST在黑色素瘤进展中的作用机制及其临床意义 | 皮肤黑色素瘤患者样本和黑色素瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,生物信息学分析,siRNA沉默,免疫共沉淀,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |