单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 792 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-05 |
shinyUMAP: an online tool for promoting understanding of single cell omics data visualization
2025-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.27.672621
PMID:40949989
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研究论文 | 开发了一个在线交互式工具，帮助用户理解单细胞组学数据可视化中UMAP参数对细胞簇分布的影响 | 首个允许用户上传单细胞数据并交互式调整UMAP超参数以观察细胞簇分布变化的在线服务器 | 仅支持2D UMAP可视化，未涉及其他降维方法或更高维度的可视化 | 促进单细胞组学数据可视化的正确理解和应用 | 单细胞组学数据（如scRNA-seq表达数据） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP | 单细胞表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 542 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Analysis Reveals Reduced Frequency and Activity of CXCR5+ Atypical Memory B Cells in Islet Xenotransplantation Treated With Clinically Applicable Immunosuppressants Including Belimumab
2025 Sep-Oct, Xenotransplantation
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/xen.70076
PMID:40964768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Belimumab在猪到非人灵长类胰岛异种移植中对B细胞亚群的影响 | 首次在异种移植模型中揭示Belimumab不仅减少CXCR5+非典型记忆B细胞比例，还引起所有B细胞亚群功能受损 | 研究仅限于非人灵长类动物模型，未在人类受试者中验证 | 研究Belimumab在胰岛异种移植中的免疫抑制机制 | 恒河猴的B细胞亚群 | 单细胞测序分析 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 恒河猴治疗前后血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 543 | 2025-10-05 |
Differentially expressed fusogens specify myocyte states to drive myogenesis
2025-Sep-17, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204771
PMID:40959964
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现小鼠肌细胞中存在两种不同的肌细胞群体，分别表达不同的融合蛋白，挑战了脊椎动物肌肉前体细胞同质性的传统观点 | 首次识别出表达Myomaker和Myomixer的Mc1细胞群和仅表达Myomaker的Mc2细胞群，并揭示了它们之间的谱系关系和调控机制 | 研究仅限于小鼠胚胎发育的特定时期(E9.5-11.5)，需要进一步验证在其他物种和发育阶段的普适性 | 探究肌细胞融合过程中肌细胞状态的异质性及其调控机制 | 小鼠胚胎体节中的肌细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，荧光原位杂交，谱系追踪，荧光素酶报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | E9.5-11.5小鼠胚胎体节 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 544 | 2025-10-05 |
Biomarker Analysis and Treatment Dynamics Following Preoperative Ipilimumab plus Nivolumab in Locally Advanced Urothelial Cancer from the Phase IB NABUCCO Study
2025-Sep-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0419
PMID:40489082
|
研究论文 | 本研究通过分析NABUCCO IB期临床试验数据，探索了局部晚期尿路上皮癌患者术前使用伊匹单抗联合纳武利尤单抗治疗的生物标志物和肿瘤微环境动态变化 | 首次在局部晚期尿路上皮癌中系统分析伊匹单抗联合纳武利尤单抗治疗的生物标志物，并通过单细胞RNA测序发现TCF7+CD8+ T细胞在治疗应答者肿瘤微环境中的积累 | 样本量有限（特别是单细胞RNA测序仅分析了两名应答者），需要更大规模研究验证发现 | 探索伊匹单抗联合纳武利尤单抗在局部晚期尿路上皮癌中的应答生物标志物和肿瘤微环境治疗动态 | III期尿路上皮癌患者 | 癌症免疫治疗 | 尿路上皮癌 | PD-L1免疫组化, 全外显子测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | PD-L1 IHC分析51例, 测序分析53例, CD8+ T细胞分析51例基线样本和42例膀胱切除样本, scRNA-seq分析2例应答者 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 545 | 2025-10-05 |
Comparison of single-cell RNA-seq methods to enable transcriptome profiling of neutrophils in clinical samples
2025-Sep-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101173
PMID:40957400
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研究论文 | 比较三种单细胞RNA测序方法在临床样本中性粒细胞转录组分析中的性能 | 首次系统评估10× Genomics、PARSE Biosciences和HIVE三种平台在临床样本中性粒细胞scRNA-seq分析中的表现 | 仅评估了三种特定平台，可能不适用于其他单细胞测序技术 | 建立临床样本中性粒细胞可靠的scRNA-seq工作流程 | 人血液来源的中性粒细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics, Parse Biosciences, Honeycomb Biotechnologies | 单细胞RNA-seq | NA | 10× Genomics、PARSE Biosciences和HIVE单细胞RNA测序平台 |
| 546 | 2025-10-05 |
Restoring mitochondrial quantity and quality to reverse the Warburg effect and drive neuroblastoma differentiation
2025-Sep-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2502483122
PMID:40911595
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研究论文 | 本研究通过恢复线粒体功能来逆转Warburg效应并驱动神经母细胞瘤分化 | 首次联合使用视黄酸和线粒体解偶联剂协同恢复线粒体功能，建立以线粒体为中心的治疗策略诱导肿瘤分化 | 研究主要基于神经母细胞瘤模型，在其他肿瘤类型中的适用性需进一步验证 | 探索恢复肿瘤中线粒体数量和质量是否能驱动肿瘤分化 | 神经母细胞瘤 | 癌症研究 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, U-C-葡萄糖/谷氨酰胺同位素示踪 | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | 原位神经母细胞瘤异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 547 | 2025-10-05 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Solid Tumors and Sarcomas: Heterogeneity, Function, and Therapeutic Implications
2025-Sep-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14171398
PMID:40940809
|
综述 | 本文系统探讨了实体瘤和肉瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性、功能及治疗意义 | 首次系统比较了上皮性肿瘤与肉瘤中CAF的异同，提出了CAF分型在肉瘤中的身份界定难题 | 肉瘤中CAF研究相对不足，恶性与非恶性成纤维细胞界限模糊 | 探索CAF在不同肿瘤类型中的异质性、可塑性及其治疗靶向策略 | 癌症相关成纤维细胞(CAF)及其在实体瘤和肉瘤中的亚型 | 肿瘤微环境研究 | 实体瘤和肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 548 | 2025-10-05 |
Analysis of Microarray and Single-Cell RNA-Seq Finds Gene Co-Expression and Tumor Environment Associated with Extracellular Matrix in Epithelial-Mesenchymal Transition in Prostate Cancer
2025-Sep-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178575
PMID:40943497
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研究论文 | 通过分析微阵列和单细胞RNA测序数据，研究前列腺癌上皮-间质转化中基因共表达和肿瘤微环境与细胞外基质的关系 | 首次结合微阵列和单细胞RNA测序数据重建前列腺癌EMT相关差异表达基因网络 | NA | 阐明前列腺癌EMT中差异表达基因的分子特征和通路，识别潜在生物标志物 | 前列腺癌上皮-间质转化相关基因 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 549 | 2025-10-05 |
Inflammatory Milieu by Crosstalk between Glomerulus and Proximal Tubular Cells in Type 2 Diabetes Mellitus Kidney Disease
2025-Sep, Diabetes & metabolism journal
IF:6.8Q1
DOI:10.4093/dmj.2024.0535
PMID:40160027
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析诱导型2型糖尿病肾病模型，揭示了肾小球与近端肾小管细胞间相互作用导致CXCL12介导的T细胞浸润机制 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于诱导型而非基因修饰的2型糖尿病肾病模型，并发现CXCL12在介导T细胞招募中的关键作用 | 研究基于动物模型，人类样本验证有限，需要进一步临床研究确认 | 探索2型糖尿病肾病中肾小球与近端肾小管细胞间的相互作用机制 | 诱导型2型糖尿病肾病小鼠模型和人类肾脏活检组织 | 单细胞测序分析 | 2型糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、组织学分析、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织学图像、流式细胞数据 | 诱导型T2DKD小鼠模型和对照小鼠，人类肾脏活检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 550 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell transcriptomics, molecular docking, and dynamics simulations to characterize protein kinase X-linked mechanisms in osteosarcoma
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147335
PMID:40907924
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、分子对接和动力学模拟，揭示了PRKX-CDC37相互作用在骨肉瘤中的机制，并发现麦角胺可作为潜在抑制剂 | 首次结合单细胞RNA测序与分子动力学模拟揭示PRKX-CDC37在骨肉瘤中的变构调控机制，并发现麦角胺作为新型抑制剂 | 研究主要基于计算模拟和体外实验，缺乏体内实验验证 | 解码PRKX的激活机制并评估其作为骨肉瘤生物标志物和治疗靶点的临床潜力 | 骨肉瘤细胞、PRKX激酶、CDC37分子 | 计算生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、siRNA敲低 | AlphaFold预测模型、分子动力学模型 | 基因表达数据、蛋白质结构数据 | GSE152048数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 551 | 2025-10-05 |
From Pathophysiology to Innovative Therapies in Eye Diseases: A Brief Overview
2025-Sep-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178496
PMID:40943417
|
综述 | 本文概述了眼科疾病从病理生理学到创新疗法的进展，重点介绍分子影像技术和精准治疗方法 | 整合分子影像技术与人工智能分析，探索基因治疗、干细胞再生和靶向分子疗法在眼科疾病中的应用 | 这些技术需要进一步验证、监管批准和长期安全性评估才能应用于常规临床护理 | 探讨分子影像和精准疗法在眼科疾病诊断和治疗中的转化应用 | 年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、青光眼和葡萄膜炎等致盲性眼病 | 数字病理 | 眼科疾病 | 光学相干断层扫描、OCT血管成像、MALDI-MSI、空间转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、机器学习 | 机器学习 | 影像数据、分子数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 552 | 2025-10-05 |
Staphylococcus aureus transcriptomics and single-cell sequencing approaches
2025-Sep-15, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00411-25
PMID:40952388
|
综述 | 本文综述了用于研究金黄色葡萄球菌的基因组学和转录组学方法，特别关注转录组学和单细胞测序技术的应用与发展 | 特别强调转录组学和单细胞测序技术在金黄色葡萄球菌研究中的最新应用和未来发展前景 | NA | 回顾用于研究金黄色葡萄球菌的基因组学和转录组学方法，特别关注转录组学和单细胞测序技术 | 金黄色葡萄球菌 | NA | 细菌感染 | 基因组学, 转录组学, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 553 | 2025-10-05 |
Chronic kidney disease facilitates TNF-α + neutrophils dysfunction and progression in oral squamous cell carcinoma
2025-Sep-23, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115184
PMID:40644859
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研究论文 | 本研究探讨慢性肾脏病通过TNF-α+中性粒细胞功能障碍促进口腔鳞状细胞癌进展的机制 | 首次揭示慢性肾脏病通过改变TNF-α+中性粒细胞功能并调控Tregs和CTLs促进口腔鳞癌进展的免疫机制 | 样本量有限（52例患者），动物模型与人类疾病存在差异 | 探究慢性肾脏病在口腔鳞状细胞癌进展中的作用机制 | 口腔鳞状细胞癌患者（含慢性肾脏病与非慢性肾脏病组）和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，多色免疫荧光，体外细胞实验 | 小鼠皮下肿瘤模型 | RNA测序数据，免疫荧光图像，临床数据 | 52例口腔鳞癌患者（23例伴慢性肾脏病），小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 554 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics of neuroinflammation and cerebrovascular endothelial cells in the aged rat hippocampus
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113332
PMID:40933643
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析老年大鼠海马体神经炎症的细胞景观，重点关注脑血管内皮细胞的作用 | 首次在老年大鼠模型中揭示神经炎症期间脑血管内皮细胞的转录组变化特征，并发现REDD1基因在氧化应激中的关键作用 | 研究仅关注LPS注射后第3天的时间点，缺乏动态观察；样本量有限 | 阐明围手术期神经认知障碍中神经炎症的细胞分子机制 | 老年大鼠海马体细胞 | 单细胞生物学 | 神经认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年大鼠海马体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2025-10-05 |
Potential modulation of microglial ferroptosis by Linggui Zhugan decoction in Alzheimer's disease through IL-17 and TNF pathways
2025-Sep-12, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115489
PMID:40945030
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研究论文 | 探讨苓桂术甘汤通过IL-17和TNF通路调节阿尔茨海默病中小胶质细胞铁死亡的潜在作用 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学研究传统中药复方对阿尔茨海默病铁死亡的调节作用 | 研究结果仅显示相关性，需要进一步机制验证以确定因果关系 | 探究苓桂术甘汤对阿尔茨海默病中小胶质细胞铁死亡的调节作用 | AD模型小鼠和Aβ1-42处理的小胶质细胞 | 生物医学研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 体外实验 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 行为学数据 | AD模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 556 | 2025-10-05 |
Targeting CD161 inhibitory receptors enhances NK cell-mediated changes in synovial fibroblast function in rheumatoid arthritis
2025-Sep-12, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115528
PMID:40945032
|
研究论文 | 本研究探讨CD161抑制性受体在类风湿关节炎中的作用机制及其治疗潜力 | 首次系统揭示CD161在RA滑膜NK细胞中的特异性过表达及其通过IFN-γ和PI3K-AKT通路调控FLS功能的机制 | 研究样本量有限，机制研究主要基于体外实验，需要更多临床验证 | 探究CD161在类风湿关节炎发病机制中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 类风湿关节炎患者样本、胶原诱导关节炎模型、NK细胞系、成纤维样滑膜细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | RNA测序,单细胞RNA测序,全基因组测序,细胞共培养 | NA | 基因表达数据,临床数据,细胞功能数据 | 未明确具体样本数量，包含RA患者样本和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 557 | 2025-10-05 |
Lead binds HIF-1α contributing to depression-like behaviour through modulating mitochondria-associated astrocyte ferroptosis
2025-Sep-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08824-z
PMID:40935814
|
研究论文 | 本研究揭示了铅通过结合HIF-1α诱导星形胶质细胞铁死亡，导致抑郁样行为的分子机制 | 首次发现铅离子直接结合HIF-1α蛋白的脯氨酸羟基化位点，稳定其结构并促进核转位，进而通过VDAC1调控线粒体功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究铅暴露导致抑郁样行为的分子机制 | 小鼠脑组织星形胶质细胞 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序，计算模型，实验验证 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 558 | 2025-10-05 |
Identification of CD159A as a prognostic and immune biomarker in kidney renal clear cell carcinoma
2025-Sep-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-18515-8
PMID:40935873
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定CD159A作为肾透明细胞癌的预后和免疫生物标志物 | 首次系统揭示CD159A在KIRC中的免疫检查点功能及其与NK/CD8 T细胞浸润的关联 | 研究样本主要基于TCGA数据库和单一验证队列，需要更多独立队列验证 | 探讨CD159A在肾透明细胞癌中的预后价值和免疫调节作用 | 肾透明细胞癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学分析,qRT-PCR,免疫组化,单细胞RNA测序,流式细胞术 | 机器学习分析 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,单细胞测序数据 | TCGA数据库样本和湘雅KIRC验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 559 | 2025-10-05 |
METTL3 promotes ovarian cancer progression through YTHDF2-dependent degradation of GATA4
2025-Sep-09, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156224
PMID:40945198
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研究论文 | 本研究揭示了METTL3通过YTHDF2介导的GATA4降解促进卵巢癌进展的分子机制 | 首次发现METTL3-YTHDF2调控轴通过m6A修饰促进肿瘤抑制因子GATA4 mRNA降解的新机制 | 未明确METTL3在其他类型细胞中的具体作用机制 | 阐明m6A修饰在卵巢癌进展中的分子调控机制 | 卵巢癌细胞及肿瘤微环境中的颗粒细胞、成纤维细胞和内皮细胞 | 分子生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 药理学抑制 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 560 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals distinct tumor microenvironments in HPV-associated penile squamous cell carcinoma
2025-Sep, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbaf013
PMID:40936798
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示HPV相关阴茎鳞状细胞癌中独特的肿瘤微环境特征 | 首次在单细胞水平系统描绘阴茎鳞状细胞癌的肿瘤微环境，并揭示HPV阳性与阴性肿瘤在免疫细胞组成和功能状态上的显著差异 | 样本量相对较小（11例患者），且仅分析了初治患者 | 阐明HPV状态对阴茎鳞状细胞癌肿瘤微环境的影响机制 | 11例初治阴茎鳞状细胞癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 11例患者，共52,980个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |