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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-10-05 |
Assessing the impact of perfluoroalkyl substances on liver health: a comprehensive study using multi-donor human liver spheroids
2025-Sep, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109763
PMID:40914107
|
研究论文 | 本研究使用多供体人类肝脏球体模型评估全氟烷基物质对肝脏健康的影响 | 首次在多细胞类型人类肝脏球体模型中系统比较不同PFAS化合物的性别特异性肝毒性机制 | 研究仅采用体外模型,浓度固定为20μM,暴露时间较短 | 阐明不同PFAS导致人类肝脏功能障碍的具体细胞和分子机制 | 多供体人类肝脏球体模型(包含多种细胞类型) | 毒理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序,脂质染色 | 肝脏球体模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | 多供体人类肝脏球体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2025-10-05 |
Zebrafish optic nerve injury results in systemic retinal ganglion cell dedifferentiation
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011879
PMID:40971959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼视网膜神经节细胞在视神经损伤后的去分化现象 | 首次发现斑马鱼所有RGC亚型均对损伤具有抵抗力,并揭示其通过去分化为未成熟状态的独特生存机制 | 研究结果基于斑马鱼模型,与哺乳动物存在物种差异,临床应用前景需进一步验证 | 探索视网膜神经节细胞在视神经损伤后的分子响应机制和神经保护途径 | 斑马鱼视网膜神经节细胞 | 单细胞转录组学 | 视神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2025-10-05 |
Expression and Clinical Implications of LAG-3 in Small Cell Lung Cancer
2025-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502183R
PMID:40960909
|
研究论文 | 本研究评估了LAG-3在小细胞肺癌中的表达及其临床意义 | 首次系统评估28种免疫检查点分子在小细胞肺癌中的表达,发现LAG-3表达高于其他肺癌亚型和黑色素瘤,并验证其作为免疫治疗疗效预测标志物的潜力 | 研究基于多个数据集,可能存在样本异质性;需要进一步实验验证LAG-3作为生物标志物的临床实用性 | 探索PD-L1之外可用于免疫检查点抑制剂的分子标志物 | 小细胞肺癌细胞系和肿瘤组织 | 癌症免疫学 | 小细胞肺癌 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | 多个公共数据集和内部数据集(包括CCLE数据库、IMpower133数据集等) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 444 | 2025-10-05 |
Rolling circle amplification for next-generation molecular diagnostics, genome analysis, and spatial transcriptome profiling
2025-Sep-25, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr03032c
PMID:40917009
|
综述 | 本综述全面探讨滚环扩增技术的基本原理、设计改进及其在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用 | 将RCA与CRISPR检测、生物传感器和纳米颗粒辅助信号放大技术整合,显著提升了诊断潜力,实现核酸、蛋白质、细胞外囊泡和单细胞的超灵敏检测 | 面临反应特异性、自动化和成本效益等关键挑战 | 探索RCA技术在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用及未来发展 | 核酸、蛋白质、细胞外囊泡、单细胞和组织结构中的基因表达 | 分子诊断 | 癌症 | 滚环扩增、CRISPR检测、生物传感器、纳米颗粒辅助信号放大 | NA | DNA序列、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 445 | 2025-10-05 |
Novel radiation-derived gene blueprint stratifying patients with breast cancer
2025-Sep-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03549-1
PMID:40983794
|
研究论文 | 开发基于辐射相关基因的乳腺癌预后风险模型 | 首次利用辐射相关基因构建乳腺癌预后预测模型,并揭示其与免疫浸润和免疫治疗反应的关系 | 需要更多独立队列验证模型的临床适用性 | 开发乳腺癌预后预测生物标志物和个性化治疗策略 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多组学分析 | 随机森林, LASSO Cox回归, stepAIC | 基因表达数据 | TCGA-BRCA队列和METABRIC数据集患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 446 | 2025-10-05 |
Engineering Spatial and Molecular Features from Cellular Niches to Inform Predictions of Inflammatory Bowel Disease
2025-Sep-12, ArXiv
PMID:40964085
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用空间转录组学构建可解释机器学习模型来区分炎症性肠病亚型的新计算框架 | 首次将空间转录组学与可解释机器学习相结合,从细胞生态位中系统提取空间和分子特征用于IBD分类 | 样本量相对有限,需要更大规模验证 | 开发基于空间转录组学的IBD亚型分类和诊断方法 | 健康对照、溃疡性结肠炎和克罗恩病患者的结肠黏膜组织 | 空间转录组学 | 炎症性肠病 | 空间转录组学,非负矩阵分解,多层感知器 | MLP | 空间转录组数据 | 健康对照、UC和CD患者的结肠黏膜样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 447 | 2025-10-05 |
Genome-wide association study identifies FUT2 rs601338 polymorphism linking intra-pancreatic fat deposition to chronic pancreatitis
2025-Sep, Pancreatology : official journal of the International Association of Pancreatology (IAP) ... [et al.]
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.pan.2025.07.407
PMID:40744837
|
研究论文 | 通过全基因组关联研究揭示FUT2基因rs601338多态性通过影响胰腺脂肪沉积与慢性胰腺炎风险的关联机制 | 首次通过大规模GWAS发现胰腺脂肪沉积的遗传基础,结合单细胞转录组学确认FUT2基因在胰腺外分泌部的特异性表达 | 研究人群主要为欧洲裔,样本代表性有限;未深入探讨FUT2影响胰腺脂肪沉积的具体分子机制 | 探索胰腺脂肪沉积的遗传基础及其对胰腺疾病风险的影响 | 20,040名欧洲裔个体(排除急/慢性胰腺炎和胰腺癌患者) | 基因组学 | 慢性胰腺炎 | 全基因组关联研究(GWAS), 共定位分析, 转录组关联研究(TWAS), 单细胞转录组学 | 回归模型, 交互作用分析 | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 20,040人 | UK Biobank | 基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 448 | 2025-10-05 |
ALKBH5 demethylates the m6A modification of SOCS3 in microglia/macrophages and alleviates neuroinflammation after brain injury
2025-Sep-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504697122
PMID:40986354
|
研究论文 | 本研究揭示了ALKBH5通过去甲基化SOCS3的m6A修饰缓解脑损伤后神经炎症的分子机制 | 首次发现ALKBH5-m6A-SOCS3调控轴在脑损伤后小胶质细胞/巨噬细胞驱动的神经炎症中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在人体中验证 | 探究m6A RNA修饰在创伤性脑损伤后神经炎症中的作用机制 | 小胶质细胞/巨噬细胞 | 分子生物学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, m6A RNA免疫沉淀测序, MeRIP-qPCR, RNA pull-down | NA | RNA测序数据 | 多个时间点的脑损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序, m6A测序 | NA | NA |
| 449 | 2025-10-05 |
Prolonged immune activation in post-acute sequelae of SARS-CoV-2: neutrophil dynamics and therapeutic insights
2025-Sep-24, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01539-5
PMID:40987794
|
研究论文 | 本研究通过仓鼠模型揭示了SARS-CoV-2感染后长期症状中中性粒细胞持续激活的机制,并验证了靶向中性粒细胞炎症的治疗策略 | 首次在小仓鼠模型中系统揭示PASC的免疫机制,发现中性粒细胞持续激活是驱动长期炎症的关键因素,并验证了Sivelestat等小分子抑制剂的治疗效果 | 研究基于动物模型,结果需要进一步在人类临床试验中验证;样本量相对有限 | 探究SARS-CoV-2感染后长期症状的免疫机制并寻找有效治疗策略 | 小仓鼠模型及感染后30天的组织样本 | 免疫学 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,组织病理图像 | SARS-CoV-2感染组46.25-47.50%存活率,其中13.75%发展为PASC表型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 450 | 2025-10-05 |
Leveraging single-cell transcriptomics of developing rat ocular outflow tissues to prioritize congenital glaucoma candidate genes
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672439
PMID:40909638
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析发育期大鼠眼房水流出通路的基因表达,为先天性青光眼候选基因的优先排序提供资源 | 首次生成了发育期房水流出通路的单细胞RNA测序数据集,揭示了395个在发育TM/SC亚型中特异性上调的基因 | 研究基于大鼠模型,与人类疾病存在物种差异;仅分析了三个关键发育阶段 | 识别先天性青光眼的候选致病基因并理解房水流出通路的发育机制 | 发育期大鼠眼房水流出通路组织,特别是小梁网和Schlemm管 | 单细胞转录组学 | 先天性青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 86,653个细胞,包含超过10,000个TM/SC相关细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 451 | 2025-10-05 |
Sorting nexin 3 promotes ischemic retinopathy through RIP1- and RIP3-mediated myeloid cell necroptosis and mitochondrial fission
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426578122
PMID:40924459
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现分选连接蛋白3(SNX3)在缺血性视网膜病变中通过RIP1/RIP3介导的髓系细胞坏死性凋亡和线粒体分裂促进病理性血管生成 | 首次揭示SNX3通过调控RIP1/RIP3信号通路促进髓系细胞坏死性凋亡和线粒体分裂,进而驱动缺血性视网膜病变的新机制 | 研究主要基于小鼠氧诱导视网膜病变模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究SNX3在缺血性视网膜病变中的作用机制 | 小鼠视网膜髓系细胞(小胶质细胞/巨噬细胞) | 单细胞生物学 | 缺血性视网膜病变 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, GST pull-down, 免疫共沉淀, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 452 | 2025-10-05 |
Revealing the core immunotoxicity of di-n-pentyl phthalate exposure in murine models using single-cell RNA sequencing
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118754
PMID:40753775
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示邻苯二甲酸二正戊酯在小鼠模型中的核心免疫毒性作用 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统评估DNPP对免疫系统的全面影响,揭示了其对多种免疫细胞功能的具体损害机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证;剂量反应关系需要更深入分析 | 系统评估DNPP暴露引起的免疫系统改变 | 小鼠脾脏组织和外周血白细胞 | 单细胞组学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | DNPP暴露小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 453 | 2025-10-05 |
The food-derived metabolite trimethylamine and trimethylamine-N-oxide promote colorectal cancer progression via SREBF1
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118996
PMID:40912095
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研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物TMA和TMAO通过SREBF1介导的PI3K/AKT信号通路促进结直肠癌进展的机制 | 首次证明TMA和TMAO通过激活PI3K/AKT信号通路促进结直肠癌细胞增殖,并确定SREBF1是TMA和TMAO诱导CRC增殖的关键介质 | NA | 研究TMA和TMAO对结直肠癌进展的影响及其分子机制 | 结直肠癌细胞系和小鼠肿瘤模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 实时PCR、Western blotting、细胞活力和迁移实验、凋亡分析、单细胞RNA测序、肿瘤异种移植模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据、测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 454 | 2025-10-05 |
Decoding coal-induced pulmonary endothelial injury using single-cell omics
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118989
PMID:40914082
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析煤尘暴露引起的肺内皮细胞损伤机制 | 首次在煤工尘肺小鼠模型中应用单细胞RNA测序技术,系统识别了四种内皮细胞亚群并揭示了煤尘通过内外在机制共同导致内皮细胞损伤 | 研究仅基于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 探究煤尘暴露引起肺内皮细胞损伤的分子机制 | 煤工尘肺小鼠模型的肺组织内皮细胞 | 单细胞组学 | 尘肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 煤尘暴露组和对照组小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 455 | 2025-10-05 |
Integration of network toxicology, machine learning and single-cell sequencing reveals the effects of soil pollutants on prostate cancer
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119010
PMID:40925179
|
研究论文 | 整合网络毒理学、机器学习和单细胞测序技术研究土壤污染物对前列腺癌的影响机制 | 首次将网络毒理学、101种机器学习算法和单细胞测序技术相结合,系统揭示土壤污染物通过DNMT1和mTOR关键分子靶点影响前列腺癌的新机制 | 研究主要基于计算预测和数据库分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能实验确认机制 | 探究土壤污染物影响前列腺癌发展的分子机制 | 前列腺癌相关分子靶点和10种土壤污染物(DBP、DOP、DMP、PFOA、PFOS、MEK、TOL、ZEN、OTA、DON) | 生物信息学 | 前列腺癌 | 网络毒理学、机器学习、单细胞测序、分子对接 | 101种机器学习算法、Cox回归模型、Kaplan-Meier分析 | 基因组数据、蛋白质互作数据、单细胞表达数据 | 242个潜在靶点,26个风险靶分子 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 456 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics meets diabetic kidney disease: Illuminating the path to precision medicine
2025-Sep-15, World journal of diabetes
IF:4.2Q1
DOI:10.4239/wjd.v16.i9.107663
PMID:40980298
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综述 | 本文探讨空间转录组学技术在糖尿病肾病研究中的应用及其对精准医疗的推动作用 | 将空间转录组学技术引入糖尿病肾病研究,实现基因表达与空间定位的整合分析,揭示肾脏微环境中细胞互作和局部分子改变 | 空间分辨率有限、数据复杂度高、计算需求大 | 探索空间转录组学在糖尿病肾病精准医疗中的应用价值 | 糖尿病肾病肾脏组织 | 空间转录组学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 机器学习,网络分析 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | Slide-seqV2 | NA |
| 457 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics unravels the interactive network of aflatoxin B1-driven gastric cancer: Multi-omics integration of transcriptome and mendelian randomization
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118919
PMID:40850114
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研究论文 | 通过空间转录组学和多组学整合揭示黄曲霉毒素B1驱动胃癌的分子网络机制 | 首次构建AFB1诱导胃癌的多层次分子调控图谱,建立了环境致癌物毒理机制研究的多组学整合新范式 | AFB1诱导胃癌的具体分子机制仍有待进一步明确 | 阐明黄曲霉毒素B1驱动胃癌恶性进展的分子网络机制 | 人类胃癌组织及黄曲霉毒素B1核心靶基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接模拟,多组学整合 | 分子对接模拟 | 转录组数据,空间转录组数据 | 人类胃癌组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 458 | 2025-10-05 |
Polyethylene terephthalate microplastics promote pulmonary fibrosis via AKT1, PIK3CD, and PIM1: A network toxicology and multi-omics analysis
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118954
PMID:40876188
|
研究论文 | 通过网络毒理学和多组学分析揭示聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料通过AKT1、PIK3CD和PIM1蛋白加剧特发性肺纤维化的分子机制 | 首次结合网络毒理学、分子对接、孟德尔随机化和单细胞测序分析系统揭示PET-MPs通过特定信号通路和细胞类型加剧IPF的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和数据库挖掘,缺乏实验验证 | 确定PET-MPs在加剧特发性肺纤维化中的作用机制 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯微塑料及其与肺纤维化的关联 | 网络毒理学 | 特发性肺纤维化 | 网络毒理学、分子对接、孟德尔随机化、单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 从多个数据库识别120个潜在靶点和81个交叉靶点 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 459 | 2025-10-05 |
Major PM2.5 components promote intracranial aneurysm via TP53: Insights from a comprehensive network analysis
2025-Sep-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118953
PMID:40886600
|
研究论文 | 通过整合网络毒理学和双样本孟德尔随机化分析,揭示PM2.5主要成分通过TP53基因促进颅内动脉瘤形成的机制 | 首次将网络毒理学与孟德尔随机化相结合,系统阐明PM2.5成分通过TP53介导颅内动脉瘤形成的因果机制 | 研究主要基于数据库分析和计算模拟,需要更多实验验证 | 探究PM2.5主要成分影响颅内动脉瘤发展的潜在机制 | PM2.5六种代表性成分(铅、镉、砷、苯并[a]芘、甲醛、苯)及其与TP53基因的相互作用 | 生物信息学 | 颅内动脉瘤 | 网络毒理学, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | NA | 基因组数据, 蛋白质结构数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 460 | 2025-10-05 |
Pathogenic Mechanism of the Lactylation-Related Gene DCBLD1 in Ulcerative Colitis: A Multi-Omics and Machine Learning Analysis
2025-09-11, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 通过多组学和机器学习方法探究乳酰化相关基因DCBLD1在溃疡性结肠炎中的致病机制 | 首次将乳酰化修饰与溃疡性结肠炎发病机制联系起来,并采用多组学整合分析和机器学习方法构建诊断模型 | 需要进一步实验验证DCBLD1通过乳酰化调控免疫代谢的具体分子机制 | 探究乳酰化相关基因DCBLD1在溃疡性结肠炎发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者和健康对照的肠道组织 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序,RNA测序,定量PCR,SMR分析 | CATboost,XGBoost,NGboost | 基因表达数据,单细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |