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当前共找到 857 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-05 |
Multi-modal characterization of metabolic and immune gene clusters in adrenocortical carcinoma treatment
2025-Sep-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01092-4
PMID:40968257
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研究论文 | 通过多模态分析开发肾上腺皮质癌的类固醇相关免疫评分系统，并验证其预测免疫治疗和激素抑制治疗反应的能力 | 开发了基于多模态分析的SIS评分系统，揭示了代谢和免疫基因簇的协同调控机制，发现ACC与精神分裂症的代谢特征相似性 | 样本量相对有限，需要进一步大样本验证 | 提高肾上腺皮质癌的精准医疗水平并改善患者预后 | 肾上腺皮质癌患者 | 数字病理学 | 肾上腺皮质癌 | 单细胞RNA测序, 多模态分析, 体外功能实验 | ResNet50, Vision Transformer-B16, CAMs | 基因组数据, 数字病理图像, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-10-05 |
Spatially resolved transcriptomics of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf016
PMID:39847441
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学分析良性和恶性外周神经鞘瘤的空间异质性 | 首次构建MPNST的空间细胞分化图谱，定位施万细胞前体、神经嵴样细胞和间充质转化细胞的空间分布 | 样本量有限，属于初步研究 | 确定外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性 | 福尔马林固定石蜡包埋的病变外周神经组织 | 空间转录组学 | 外周神经鞘瘤 | 空间转录组学，免疫组织化学 | 空间聚类，加权相关网络分析 | 空间转录组数据，单细胞测序数据，组织学特征 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 423 | 2025-10-05 |
DAESC+: High-performance, integrated software for single-cell allele-specific expression data
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.03.674100
PMID:40964337
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研究论文 | 开发了用于单细胞等位基因特异性表达数据处理和分析的高性能集成软件DAESC+ | 提供了首个端到端的单细胞ASE专用计算工具，预处理模块DAESC-P比现有SALSA流程更准确，分析模块DAESC-GPU比前代方法DAESC快数十倍且可扩展至百万级细胞 | NA | 开发高性能的单细胞等位基因特异性表达数据分析工具 | 单细胞等位基因特异性表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GPU加速计算 | 单细胞RNA测序数据 | OneK1K队列子集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal analysis of Crohn's disease reveals PECAM2 signaling at the basis of the inflammation-to-fibrosis transition
2025-Sep-07, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf130
PMID:40680170
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研究论文 | 通过时空转录组学分析克罗恩病，揭示PECAM2信号在炎症向纤维化转变中的关键作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，系统解析克罗恩病中炎症向纤维化转变的细胞分子机制，并发现PECAM2-CD38信号轴的关键驱动作用 | 样本量相对有限（13个手术标本），研究结果需要在更大队列中进一步验证 | 阐明克罗恩病从慢性炎症向纤维化发展的分子机制 | 克罗恩病患者手术标本、TNBS诱导的慢性结肠炎小鼠模型 | 空间转录组学 | 克罗恩病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫染色, 配体-受体相互作用分析, 伪时间分析 | 计算分析流程, TNBS诱导的小鼠结肠炎模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 免疫染色图像 | 13个手术标本（包括炎症组织、纤维化组织和健康对照） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2025-10-05 |
Differential Localization of β-Catenin Protein in CTNNB1 Mutant Endometrial Cancers Results in Distinct Transcriptional Profiles
2025-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100791
PMID:40348058
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析CTNNB1突变子宫内膜癌中β-连环蛋白不同亚细胞定位导致的转录谱差异 | 首次发现β-连环蛋白在CTNNB1突变子宫内膜癌中的亚细胞定位差异导致瘤内转录异质性，并鉴定出TROP2作为Wnt/β-连环蛋白信号通路的新治疗靶点 | 研究样本量有限，未明确说明具体病例数量；空间转录组学分析仅针对选定区域 | 确定β-连环蛋白不同亚细胞定位对子宫内膜癌下游基因表达的影响 | CTNNB1外显子3突变的子宫内膜样子宫内膜癌组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学，差异表达分析，层次聚类分析 | NA | 空间转录组数据，蛋白质定位数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 426 | 2025-10-05 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2025-Sep, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00952-9
PMID:40897908
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研究论文 | 本研究揭示了神经相关巨噬细胞在调控脂肪组织稳态和抑制年龄相关炎症中的关键作用 | 首次发现并定义了神经相关巨噬细胞这一特殊脂肪组织巨噬细胞亚群，揭示了其在控制脂肪组织稳态和抑制年龄相关炎症中的新机制 | 研究仅在鼠类模型中进行，尚未在人类中验证；具体分子机制仍需进一步研究 | 探究脂肪组织巨噬细胞在年龄相关炎症中的作用机制 | 小鼠脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 免疫学 | 老年疾病 | 单细胞测序，多参数流式细胞术，血管内标记 | NA | 单细胞测序数据，流式细胞数据 | 不同年龄段的小鼠脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-05 |
MIG-21 interacts with Wnt and Netrin signaling in gonad migration in C. elegans
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011866
PMID:40953068
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现mig-21基因在线虫生殖腺迁移中的新调控作用 | 首次在线虫生殖腺迁移研究中应用单细胞RNA测序技术，发现mig-21与Wnt和Netrin信号通路协同调控远端尖端细胞的迁移 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据集，实验验证仍依赖传统遗传学方法 | 探究线虫生殖腺迁移过程中新的遗传调控机制 | 秀丽隐杆线虫的生殖腺远端尖端细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，RNAi敲低，活细胞成像，经典遗传学技术 | NA | 单细胞RNA测序数据，显微成像数据 | 已发表的成年秀丽隐杆线虫单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 428 | 2025-10-05 |
Spatial gene expression at single-cell resolution from histology using deep learning with GHIST
2025-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02795-z
PMID:40954301
|
研究论文 | 开发了一种基于深度学习的框架GHIST，能够从组织学图像预测单细胞分辨率空间基因表达 | 利用亚细胞空间转录组学和多层生物信息协同关系，实现单细胞分辨率的空间基因表达预测 | 未明确说明具体的技术限制 | 开发从常规组织学图像预测空间基因表达的方法 | 公共数据集和癌症基因组图谱数据 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | 深度学习框架 | 组织学图像、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-05 |
Single-cell consequences of X-linked meiotic drive in stalk-eyed flies
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011816
PMID:40966227
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究马来西亚突眼蝇X连锁减数分裂驱动对睾丸转录组景观和性染色体调控的影响 | 首次在非模式生物突眼蝇中构建睾丸单细胞图谱，揭示减数分裂驱动系统对性染色体调控的独特影响 | 研究局限于单一物种，缺乏与其他驱动系统的比较分析 | 探究性连锁减数分裂驱动的分子机制及其对配子发生和性染色体调控的影响 | 马来西亚突眼蝇(Teleopsis dalmanni)的睾丸组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 驱动型和标准型睾丸样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-10-05 |
Mitoepigenetic Targeting of Age-Related Dysfunction: Mechanisms, Therapeutic Avenues, and Transgenerational Implications
2025-Sep, Aging advances
|
综述 | 探讨线粒体表观遗传学在衰老及相关疾病中的作用机制与治疗前景 | 系统整合线粒体表观遗传调控机制，提出跨代表观遗传记忆和精准医疗新策略 | 线粒体DNA甲基化检测技术存在标准化难题，临床转化面临挑战 | 阐明线粒体表观遗传在年龄相关功能障碍中的调控机制与治疗潜力 | 线粒体DNA、核小体动力学、非编码RNA、代谢产物修饰 | 表观遗传学 | 衰老相关疾病 | 单细胞测序、CRISPR技术、表观遗传分析 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptomic landscape and potential targets for large/giant congenital melanocytic nevi
2025-Sep-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf360
PMID:40974031
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了大/巨型先天性黑色素细胞痣的转录组景观和潜在治疗靶点 | 首次在L/GCMN研究中应用单细胞技术，发现TBX2作为黑色素细胞亚群的核心转录因子，并鉴定PTN-PTPRZ1和IGF1-IGF1R信号通路的异常激活 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 阐明L/GCMN皮肤微环境中细胞的转录组特征，探索黑色素细胞病理变化的关键分子机制 | L/GCMN患者的病变和非病变皮肤样本，健康皮肤样本，原代痣黑色素细胞 | 单细胞转录组学 | 先天性黑色素细胞痣 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质印迹, qRT-PCR, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质表达数据 | L/GCMN患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-05 |
Single-cell profiling of peripheral and local immune compartments reveal unique genotype-independent prognostic immune signatures across IDH-stratified glioma
2025-Sep-20, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf206
PMID:40974256
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析IDH突变型和野生型胶质瘤的局部与外周免疫环境，揭示基因型独立的预后免疫特征 | 首次系统比较胶质瘤局部与外周免疫 compartments，发现独特的GZMH+ CD8+ T细胞群和具有补体交互特征的微胶质样细胞 | 样本量较小（18例患者），需要更大规模验证 | 表征IDH分层胶质瘤的免疫微环境特征及其预后价值 | IDH突变型和野生型胶质瘤患者 | 单细胞基因组学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例胶质瘤患者（6例IDH突变型，12例IDH野生型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2025-10-05 |
The tumor-associated fibroblasts regulate urothelial carcinoma progression
2025-Sep-19, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaf032
PMID:40973873
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研究论文 | 通过单细胞测序和空间转录组技术构建上尿路尿路上皮癌微环境图谱，揭示肿瘤相关成纤维细胞在癌症进展中的作用 | 首次构建UTUC的全面微环境图谱，发现myCAFs亚群与不同恶性程度上皮细胞的相互作用机制 | CAFs在UTUC发展中的具体调控机制仍需进一步验证 | 研究肿瘤相关成纤维细胞对上尿路尿路上皮癌进展的调控作用 | 上尿路尿路上皮癌组织和细胞 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组测序,免疫荧光芯片 | 风险模型,层次聚类 | 基因表达数据,空间转录组数据,免疫荧光数据 | UTUC患者队列 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | Stereo-seq空间增强分辨率组学测序技术 |
| 434 | 2025-10-05 |
Bone marrow B lymphopoiesis accelerates early cerebral amyloid pathology
2025-Sep-18, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02419-0
PMID:40962797
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓B淋巴细胞生成通过IL-6信号通路加速早期脑淀粉样蛋白病理的机制 | 首次发现Aβ在AD患者颅骨骨髓中积累，并证实骨髓来源的年龄相关B细胞通过增强小胶质细胞反应性加剧AD神经病理 | 研究主要基于小鼠AD模型，人类样本验证有限 | 探究骨髓造血系统改变在阿尔茨海默病神经炎症和脑Aβ病理中的作用 | AD患者骨髓样本、5×FAD和APP/PS1小鼠模型、IL-6敲除小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 流式细胞术、细胞追踪分析、单细胞测序、体外小胶质细胞培养 | NA | 细胞计数数据、基因表达数据、行为学数据 | 两种经典AD小鼠模型（5×FAD和APP/PS1）及IL-6敲除小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-05 |
SPP1+ macrophages polarized by lactate confer the progression of hypoxic adaptive tumor cells in brain
2025-Sep-18, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf208
PMID:40973181
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研究论文 | 本研究揭示了脑肿瘤中缺氧适应性肿瘤细胞通过乳酸诱导SPP1+巨噬细胞极化促进肿瘤进展的机制 | 首次发现乳酸介导的组蛋白乳酸化诱导SPP1+巨噬细胞极化，并阐明SPP1直接激活MAPK信号通路促进肿瘤生长的机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 探究脑肿瘤微环境中缺氧适应性肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用机制 | 脑肿瘤微环境中的肿瘤细胞和巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组,CRISPR/Cas9基因编辑,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组 | NA | NA |
| 436 | 2025-10-05 |
Conformal Inference for Reliable Single Cell RNA-seq Annotation
2025-Sep-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf521
PMID:40973204
|
研究论文 | 提出基于共形预测框架的单细胞RNA测序注释方法，提供可靠的细胞类型注释和不确定性量化 | 首次将共形预测框架应用于单细胞RNA测序注释，无需数据分布假设即可提供统计保证 | NA | 解决单细胞RNA测序注释中的不确定性量化和异常细胞类型检测问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共形预测 | 基因表达数据 | 十个批次实验，来自多种组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 437 | 2025-10-05 |
RNA velocity and beyond: Current advances in modeling single-cell transcriptional dynamics
2025-Sep-18, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2025.08.005
PMID:40973591
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综述 | 本文综述了RNA Velocity及其扩展方法在单细胞转录动力学建模中的最新进展 | 系统梳理了RNA Velocity从基础原理到第二代计算工具的发展历程，并重点介绍了在过敏和免疫学研究中的创新应用 | 讨论了RNA Velocity分析当前面临的挑战和剩余限制 | 探索单细胞转录动力学的建模方法及其在生物学研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据及其在细胞分化、重编程和疾病进展等动态过程中的应用 | 生物信息学 | 过敏性和免疫介导疾病 | 单细胞RNA测序 | Velocyto, scVelo, dynamo, CellRank, 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 438 | 2025-10-05 |
TissueMosaic: Self-supervised learning of tissue representations enables differential spatial transcriptomics across samples
2025-Sep-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101394
PMID:40925368
|
研究论文 | 提出了一种自监督卷积神经网络TissueMosaic，用于从空间转录组数据中学习组织架构表示并比较不同样本间的差异 | 开发了首个基于组织架构基序的自监督学习方法，能够将组织结构与基因表达联系起来，提高空间差异表达分析的信噪比 | 未提及具体的技术限制或数据集局限性 | 开发计算方法以连接细胞状态与其微环境，并比较不同样本和条件下的空间转录组关系 | 多样本空间转录组数据集中的组织架构基序 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 自监督卷积神经网络(CNN) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 439 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomic analysis reveals lack of response to PD-1 blockade in recurrent glioblastoma
2025-Sep-17, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-025-02937-9
PMID:40960500
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析发现复发性胶质母细胞瘤对PD-1阻断治疗缺乏响应 | 首次使用空间转录组学技术分析PD-1阻断后胶质母细胞瘤中肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞的转录组变化 | 样本量相对较小(26例患者)，仅检测了空间转录组水平的变化 | 研究PD-1阻断治疗在复发性胶质母细胞瘤中对肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞的影响 | 26例匹配的原发性和复发性IDH野生型胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学，Digital Spatial Profiling | NA | 空间转录组数据 | 26例患者(16例接受纳武利尤单抗治疗) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | Digital Spatial Profiling平台，使用FFPE肿瘤样本，针对SOX2⁺肿瘤细胞和IBA1⁺肿瘤相关巨噬细胞区域进行分析 |
| 440 | 2025-10-05 |
Learning antibody sequence constraints from allelic inclusion
2025-Sep-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101368
PMID:40812311
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研究论文 | 开发机器学习框架利用等位基因包含数据识别抗体序列约束 | 首次利用等位基因包含这一罕见事件作为数据源训练机器学习模型预测抗体序列约束 | NA | 识别违反表达要求和脱靶反应性限制的抗体序列 | 人类B细胞抗体轻链和重链序列 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |