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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-05 |
Consistent self-organized emergence of hyaline cartilage in human induced pluripotent stem cell-derived multi-tissue organoids
2025-Sep-17, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf043
PMID:40577622
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研究论文 | 开发了一种利用人多能干细胞生成透明软骨的简化多组织类器官方案 | 建立了无需异源成分和饲养层的简单培养方案,实现了透明软骨在类器官中的稳定形成 | 未提及临床转化应用的具体验证数据 | 开发稳定生成透明软骨的hiPSC培养方案 | 人诱导多能干细胞衍生的多组织类器官 | 组织工程 | 软骨相关疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 组织学, 免疫组织化学 | 多组织类器官模型 | 基因表达数据, 组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-10-05 |
FemXpress: Systematic Analysis of X Chromosome Inactivation Heterogeneity in Female Single-Cell RNA-Seq Samples
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504754
PMID:40583143
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研究论文 | 介绍了一种名为FemXpress的计算工具,用于分析女性单细胞RNA测序数据中的X染色体失活异质性 | 开发了首个不依赖亲本基因组信息即可基于X连锁SNPs对单细胞进行X染色体失活起源分类的计算工具 | NA | 开发分析女性单细胞RNA测序数据中X染色体失活异质性的计算方法 | 女性单细胞RNA测序样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织的食蟹猴单细胞RNA测序数据,以及胚胎和结肠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 423 | 2025-10-05 |
Tracing and Capturing the Epiblast Pluripotency of Sheep Preimplantation Embryos
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417764
PMID:40586282
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了绵羊植入前胚胎中上胚层多能性的变化,并成功建立了绵羊形成性和定型多能干细胞 | 首次在绵羊中建立了能够长期传代的形成性和定型多能干细胞,并揭示了物种间早期胚胎发育的保守性和差异性 | 研究主要聚焦于绵羊模型,跨物种比较的深度和广度有待进一步扩展 | 研究绵羊植入前胚胎上胚层多能性的变化规律及其调控机制 | 绵羊植入前胚胎(E1-E14天)及衍生的多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 绵羊胚胎E1至E14天发育时间点的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2025-10-05 |
Integrated Transcriptome and Metabolomics Analyses Show MYC as a Potential Therapeutic Target for Behçet's Uveitis
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417843
PMID:40586758
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和代谢组学分析,揭示MYC作为贝赫切特葡萄膜炎潜在治疗靶点 | 首次结合非靶向代谢组学和单细胞RNA测序技术,发现MYC通过调控糖酵解促进效应T细胞异常反应的新机制 | 研究样本量有限,主要基于实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型,需要更多临床验证 | 探索贝赫切特葡萄膜炎的疾病特异性代谢改变及其治疗靶点 | 贝赫切特葡萄膜炎患者、健康对照者和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 非靶向代谢组学,单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据,单细胞转录组数据 | 贝赫切特葡萄膜炎患者和健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学 | NA | NA |
| 425 | 2025-10-05 |
Choroid Plexus Fibroblast-ILC2 Niche Promotes Adult Hippocampal Neurogenesis after Traumatic Brain Injury
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415984
PMID:40605604
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研究论文 | 本研究揭示创伤性脑损伤后脉络丛中ILC2细胞的积累及其通过调节免疫微环境和促进海马神经发生改善神经功能的机制 | 首次发现脉络丛成纤维细胞与ILC2形成的生态位在创伤性脑损伤后促进海马神经发生的作用机制 | NA | 探究创伤性脑损伤后脉络丛结构变化和免疫细胞浸润特征及其对神经修复的影响 | 创伤性脑损伤小鼠模型中的脉络丛组织和海马组织 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,组织学分析 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 426 | 2025-10-05 |
The Evolutionary Trajectory and Prognostic Value of GITR+ Tregs Reprogramed by Tumor-Intrinsic PD-1/c-MET Signaling in Pancreatic Cancer
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500806
PMID:40673866
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中肿瘤内在PD-1/c-MET信号通路通过驱动GITR⁺ Tregs的积累促进免疫逃逸的机制 | 首次发现MET信号通路选择性驱动具有强免疫抑制功能的GITR⁺ Tregs亚群积累,并阐明MET-IL-23-STAT4轴在其中的关键作用 | 研究主要基于胰腺导管腺癌模型,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤内在PD-1/c-MET信号通路的免疫调节作用及其在胰腺癌免疫逃逸中的机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的免疫细胞,特别是GITR⁺调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,原位肿瘤模型 | NA | 基因表达数据,免疫组化数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-05 |
Enhanced Media Optimize Bovine Myogenesis in 2D and 3D Models for Cultivated Meat Applications
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413998
PMID:40720723
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研究论文 | 本研究通过多组学分析开发了增强牛肌源性祖细胞分化的培养基,优化了培养肉的2D和3D肌肉模型 | 首次通过多组学方法系统表征牛肌源性祖细胞分化分子图谱,并开发出能同时促进肌细胞分化和维持祖细胞特性的增强培养基 | 研究主要聚焦于体外模型,需要进一步验证在规模化培养肉生产中的适用性 | 优化培养肉生产技术,提高肌肉细胞分化效率 | 牛肌源性祖细胞(MPCs) | 组织工程 | NA | 多组学分析、单细胞转录组学、蛋白质组学 | 2D培养模型、3D骨骼肌构建体 | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq、蛋白质组学 | NA | NA |
| 428 | 2025-10-05 |
Neuro-immuno-stromal context in colorectal cancer: An enteric glial cell-driven prognostic model via machine learning predicts survival, recurrence, and therapy response
2025-Sep-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114733
PMID:40914542
|
研究论文 | 基于肠胶质细胞相关基因构建机器学习预后模型,用于预测结直肠癌患者的生存、复发和治疗反应 | 首次整合肠胶质细胞和结直肠癌相关基因表达,通过机器学习构建预后模型,揭示神经-免疫-基质微环境在结直肠癌中的作用 | 需要进一步验证模型的临床适用性 | 开发并验证结直肠癌预后预测模型 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA测序 | RSF随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-05 |
Role of Tunneling Nanotubes in Arachidonic Acid Transfer and Macrophage Function Reprogramming in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500148
PMID:40552574
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研究论文 | 本研究揭示隧道纳米管通过转移花生四烯酸重编程肿瘤相关巨噬细胞功能促进肝内胆管癌进展的机制 | 首次发现隧道纳米管是肿瘤源性脂肪酸转移的主要途径,并阐明花生四烯酸通过PI3K-AKT通路驱动巨噬细胞表型重编程 | 研究主要基于异种移植模型,需要在人类原代样本中进一步验证 | 探究隧道纳米管在肿瘤微环境中巨噬细胞功能重编程中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和肝内胆管癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 脂质组学, 代谢组学, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 脂质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-10-05 |
Maximizing Efficacy of Cancer Nanovaccines and Immune Cells Landscape in Responders and Non-Responders to Immunotherapy
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416756
PMID:40574416
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研究论文 | 本研究通过优化癌症纳米疫苗尺寸并分析免疫细胞图谱,开发出能治愈大多数荷瘤小鼠的癌症疫苗 | 确定了纳米/微米疫苗的最佳尺寸(≤400 nm和2.5 µm),并首次系统描绘了免疫治疗应答者与非应答者的免疫细胞图谱 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果需进一步验证 | 最大化癌症疫苗疗效并揭示免疫治疗应答机制 | 荷瘤小鼠(黑色素瘤、肺癌、胰腺癌、黑色素瘤肺转移模型)及癌症患者 | 免疫治疗 | 黑色素瘤、肺癌、胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 21个样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 431 | 2025-10-05 |
Integrative Multi-Omics Features Stratify Metabolic and Immune Subtypes in Glioma
2025-Sep, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-24-00928
PMID:41004701
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和MRI影像组学特征,对胶质瘤的代谢和免疫亚型进行分层分类 | 首次开发了基于代谢-免疫特征的胶质瘤分类器,并结合单细胞RNA测序和空间转录组验证亚型特征 | 样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的泛化能力 | 改进胶质瘤分类方法,实现更精准的个性化治疗策略 | 胶质瘤患者 | 数字病理 | 胶质瘤 | 转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组测序,MRI影像组学 | 机器学习算法 | 基因组数据,影像数据,转录组数据 | 1,720例胶质瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,转录组测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing across diverse cell types to identify PFOA-induced ovarian cellular senescence
2025-Sep-24, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119089
PMID:40997563
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究PFOA暴露诱导卵巢细胞衰老的机制 | 首次从细胞衰老角度揭示PFOA卵巢毒性的单细胞水平机制,发现卵丘细胞对PFOA诱导的耗竭特别敏感 | 研究仅使用小鼠模型,样本量相对有限 | 探究PFOA暴露导致卵巢功能障碍的细胞机制 | 雌性ICR小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29,000+个细胞,8个不同细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 433 | 2025-10-05 |
Comprehensive characterization of the molecular feature of acetylation in colorectal cancer using integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Sep-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21081-8
PMID:40987803
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序技术,全面表征结直肠癌中乙酰化的分子特征 | 首次结合单细胞RNA测序和WGCNA分析结直肠癌乙酰化特征,开发了乙酰化相关预后标志物 | 研究基于公共数据库的样本,需要进一步实验验证 | 探索结直肠癌中乙酰化特征与预后和免疫微环境的关系 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, ssGSEA | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 两个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 434 | 2025-10-05 |
Comparative single-cell and spatial profiling of anti-SSA-positive and anti-centromere-positive Sjögren's disease reveals common and distinct immune activation and fibroblast-mediated inflammation
2025-Sep-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63935-9
PMID:40983612
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间技术比较抗SSA阳性和抗着丝粒阳性干燥综合征的免疫特征 | 首次结合单细胞RNA测序、T/B细胞受体测序和空间转录组学揭示不同自身抗体谱的细胞特征差异 | 样本量有限,需要更大队列验证发现 | 阐明干燥综合征中不同自身抗体谱相关的细胞和转录特征 | 干燥综合征患者的唾液腺病变组织 | 单细胞组学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, B细胞受体测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-05 |
Per- and Polyfluoroalkyl Substances Induces Salt-Sensitive Hypertension by Upregulating Epithelial Sodium Channel - The First Experimental Evidence Supporting Causality
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.19.677469
PMID:41000895
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研究论文 | 本研究首次通过实验证明全氟和多氟烷基物质通过上调上皮钠通道诱导盐敏感性高血压 | 首次提供PFAS暴露与高血压因果关系的实验证据,发现PFAS通过降低Nedd4-2磷酸化增加αENaC表达的机制 | 研究仅使用雄性129S6小鼠,未在雌性小鼠中观察到血压效应,剂量反应关系仍需进一步验证 | 探究PFAS暴露对血压、盐敏感性和肾损伤的影响及其分子机制 | 129S6小鼠 | 毒理学 | 高血压 | 单细胞RNA测序,蛋白质印迹 | 小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,生理参数 | 129S6小鼠群体(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2025-10-05 |
A Human Glomerular Disease Atlas defines the APOL1-JAK-STAT feed forward loop in focal segmental glomerulosclerosis
2025-Sep-19, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.09.12.25335572
PMID:41001468
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研究论文 | 通过整合肾脏活检和参考组织的单细胞测序数据构建人类肾小球疾病图谱,揭示APOL1-JAK-STAT信号通路在局灶节段性肾小球硬化中的调控机制 | 首次构建综合性肾小球疾病图谱OCEAN,发现APOL1与JAK-STAT通路形成正反馈循环的新机制 | 样本量相对有限,主要基于观察性数据,需要进一步功能验证 | 解析罕见肾小球疾病的转录调控程序 | 人类肾脏组织样本和患者来源的足细胞模型 | 单细胞基因组学 | 局灶节段性肾小球硬化 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | 无监督分析 | 单细胞转录组数据 | 170个样本(120个肾脏活检+50个参考组织) | NA | 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2025-10-05 |
VEGFR2 blockade overcomes acquired KRAS G12D inhibitor resistance driven by PI3Kγ activation
2025-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.16.676456
PMID:41000780
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研究论文 | 本研究揭示了KRAS G12D抑制剂获得性耐药的新机制,并提出通过阻断VEGFR2来克服耐药性的治疗策略 | 首次发现PI3Kγ激活通过形成KRAS-p110γ-p101复合物驱动VEGFA-VEGFR2信号通路,导致KRAS G12D抑制剂获得性耐药 | 研究主要基于体外模型和动物实验,尚未进行临床试验验证 | 探索KRAS G12D抑制剂获得性耐药的机制并开发克服策略 | 胃肠道癌症模型和患者来源类器官 | 癌症生物学 | 胰腺癌、胃癌、结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9个人类胃肠道癌症模型,包括3个患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2025-10-05 |
ZipAEr: A compressive convolutional autoencoder for high-dimensional spatial omics data at subcellular resolution
2025-Sep-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7541289/v1
PMID:41001552
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研究论文 | 提出一种名为ZipAEr的压缩卷积自编码器,用于处理高维空间组学数据并提取有意义的潜在特征 | 在转录水平而非细胞水平处理数据,保留亚细胞和细胞外空间背景;通过卷积层同时减少空间维度和通道数;在损失函数中引入通道加权以平衡低表达基因的表示 | NA | 解决空间转录组学数据分析复杂性的挑战,开发高效的数据压缩和特征提取方法 | 高维空间组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 卷积自编码器 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 439 | 2025-10-05 |
Human Cytomegalovirus Infection of Primary Human Oral Keratinocytes Induces Intermediate Keratinocyte Differentiation and an Altered Innate Immune Response
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.16.676604
PMID:41000686
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研究论文 | 本研究利用原代人类口腔角质形成细胞模型,探究人巨细胞病毒在口腔黏膜感染过程中如何调控宿主细胞分化和先天免疫反应 | 首次在原发性人类口腔角质形成细胞中通过单细胞RNA测序揭示HCMV感染诱导中间角质形成细胞分化表型并改变先天免疫反应 | 研究仅限于体外细胞培养模型,未涉及完整的口腔黏膜组织环境 | 探究人巨细胞病毒在口腔黏膜中的初始感染机制及对宿主细胞的影响 | 原代人类口腔角质形成细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 440 | 2025-10-05 |
Impact of Data Quality on Deep Learning Prediction of Spatial Transcriptomics from Histology Images
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.04.674228
PMID:40964396
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研究论文 | 研究数据质量对从组织学图像预测空间转录组学的深度学习模型性能的影响 | 首次系统评估分子数据和图像数据质量对空间转录组学预测模型的影响,而非仅关注模型架构改进 | 插补方法提供的改进有限且无法泛化到测试集之外 | 探索数据质量对基于深度学习的空间基因表达预测性能的影响 | 空间转录组学数据和H&E染色组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学,深度学习 | 深度学习模型 | 图像,基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium, Visium | 成像技术(Xenium)与测序技术(Visium)的空间转录组学平台 |