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当前共找到 803 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-01 |
Rigor and Reproducibility of Spatial Transcriptomics Performed on Clinically Sourced Human Tissues
2025-Sep, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104190
PMID:40311874
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研究论文 | 通过临床来源的人体组织评估空间转录组学技术的严格性和可重复性 | 首次系统性地评估了数字空间剖析技术在真实世界临床条件下的技术可重复性、数据归一化方法及检测灵敏度，并与单分子成像平台进行了性能比较 | 主要聚焦于数字空间剖析技术，对空间转录组学的其他方法覆盖有限；样本仅来自人体肾脏组织，可能无法代表其他组织类型 | 评估空间转录组学技术在临床研究中的实际性能，为将其整合到临床工作流程奠定基础 | 临床来源的人类肾脏组织及活检样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 临床来源的人类肾脏组织和活检样本（具体数量未述） | Nanostring, 单分子成像平台供应商 | 空间转录组学 | 数字空间剖析仪, 单分子成像仪 | 数字空间剖析技术（Digital Spatial Profiling），单分子成像平台（Single Molecular Imager） |
| 22 | 2026-04-30 |
Single-cell RNA-sequencing of BCG naïve and recurrent non-muscle invasive bladder cancer reveals a CD6/ALCAM-mediated immune-suppressive pathway
2025-Sep-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01093-3
PMID:41006678
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析BCG初治和复发性非肌层浸润性膀胱癌，揭示CD6/ALCAM介导的免疫抑制通路 | 首次发现CD6/ALCAM信号通路与BCG耐药性之间的关联，并指出该通路可作为增强BCG疗效的潜在治疗靶点 | 未明确说明局限性，样本量可能有限，且需进一步验证CD6/ALCAM信号在其他队列中的普适性 | 探究BCG治疗抵抗背后的免疫机制，以改善复发非肌层浸润性膀胱癌的治疗效果 | BCG初治和复发性非肌层浸润性膀胱癌患者的肿瘤组织 | 单细胞组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、全外显子测序 | NA | 基因表达数据、外显子变异数据 | 多个NMIBC患者样本（具体数量未提供），包括BCG治疗前后 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于scRNA-seq |
| 23 | 2026-04-29 |
scTWAS: A powerful statistical framework for single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Sep-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6531106/v1
PMID:41256005
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研究论文 | 提出scTWAS统计方法，利用单细胞数据进行细胞类型特异性转录组关联研究 | 创新采用潜变量模型和矩估计方法，解决单细胞数据的高噪声、高稀疏性和技术变异，实现细胞类型特异性TWAS分析 | 未在正文中明确说明，推测可能依赖于基因型数据的可用性和单细胞数据的质量 | 开发一种能够利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型特异性转录组关联研究的统计方法 | 血液和脑组织中的细胞类型，以及29种血液性状、3种免疫相关疾病和阿尔茨海默病 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 潜变量模型 | 基因表达数据 | 未在标题和摘要中明确提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-04-29 |
CD1d+ Goblet Cells Expand Colon-Resident Immature, Intermediate and Differentiated iNKT Cells to Limit Colitis
2025-Sep-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7603392/v1
PMID:41041542
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现，结肠中存在类似胸腺未成熟和中间前体状态的iNKT细胞群，并且CD1d+杯状细胞通过形成抗原通道扩增这些细胞以限制结肠炎 | 颠覆了结肠iNKT细胞在断奶后固定不变的经典观点，首次证明成年结肠中存在具有可塑性的iNKT细胞亚群，并揭示杯状细胞作为非传统抗原呈递细胞调控iNKT细胞扩增的新机制 | 未明确说明 | 探究结肠iNKT细胞的异质性及其在结肠炎中的调控机制 | 人类和小鼠结肠中的iNKT细胞及CD1d+杯状细胞 | 单细胞转录组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠结肠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 25 | 2026-04-29 |
Protocol for predicting single- and multiple-dose-dependent gene expression using deep generative learning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103932
PMID:40650899
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协议 | 提出了一种使用深度生成学习预测单剂量和多剂量依赖性基因表达的协议 | 利用变分自编码器建模单细胞RNA测序数据中的剂量依赖性化学扰动效应，实现基因表达预测 | NA | 开发并验证一种预测化学扰动后基因表达的计算协议 | 单细胞基因表达数据及剂量响应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-04-27 |
NNMT inhibition in cancer-associated fibroblasts restores antitumour immunity
2025-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09303-5
PMID:40702186
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示癌症相关成纤维细胞中NNMT抑制可恢复抗肿瘤免疫 | 首次发现并验证NNMT在CAF中通过H3K27me3低甲基化驱动补体分泌，进而招募免疫抑制性MDSC，并开发出特异性NNMT抑制剂 | 未提及 | 研究NNMT在高级别浆液性卵巢癌CAF中的免疫抑制机制及靶向治疗潜力 | 癌症相关成纤维细胞中的NNMT | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序， 空间转录组学， 高通量筛选 | NA | 基因表达数据， 空间转录组数据 | 多个小鼠癌症模型（卵巢、乳腺、结肠） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学 |
| 27 | 2026-04-25 |
Insights into tissue- and cell type-specific effects of Grb10 on pig skeletal muscle growth by multi-omics analysis
2025-09, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2910-7
PMID:40545505
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研究论文 | 通过多组学分析揭示GRB10在猪骨骼肌生长中的组织和细胞类型特异性影响 | 首次结合基因组学、转录组学、表观组学和单细胞转录组学，定位肥胖型和瘦肉型猪中GRB10在肌肉组织和细胞中的特异性，并发现其肌肉特异性启动子及转录因子KLF15的结合 | 尚未详细说明该机制的完整调控网络及其在人类中的直接验证 | 探究猪肌肉组织发育的关键基因和调控机制，特别关注GRB10的组织和细胞类型特异性作用 | 肥胖型和瘦肉型猪的肌肉组织和细胞 | 机器学习 | NA | 基因组学、转录组学、表观组学、单核RNA测序、双荧光素酶和染色质免疫沉淀(ChIP)实验 | NA | 多组学数据（基因组、转录组、表观组、单细胞转录组） | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 28 | 2026-04-24 |
Single-cell atlas of human liver and blood immune cells across fatty liver disease stages reveals distinct signatures linked to liver dysfunction and fibrogenesis
2025-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02255-y
PMID:40883571
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类肝脏和血液免疫细胞在脂肪肝病不同阶段的图谱，揭示与肝功能障碍和纤维化相关的独特免疫特征 | 首次提供涵盖MASLD/MASH全谱系的配对外周血和肝脏细针穿刺样本的单细胞RNA测序图谱，揭示了疾病进展中免疫调节程序的变化 | 研究未提及具体限制 | 揭示代谢功能障碍相关脂肪肝病和脂肪性肝炎（MASLD/MASH）各阶段的免疫细胞特征，寻找阶段特异性免疫靶点 | 人类外周血和肝脏免疫细胞 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖MASLD/MASH全谱系的人类队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 29 | 2026-04-23 |
Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322100
PMID:40371469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的新机制 | 首次在收集淋巴管中表征了TRPV4的表达，并发现其通过表达TRPV4的髓系细胞与淋巴肌细胞或淋巴内皮细胞之间的相互作用介导收缩失调 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本仅限于乳腺癌相关淋巴水肿患者，机制细节如其他血管舒张前列腺素的作用需进一步验证 | 探究TRPV4通道在淋巴系统疾病中的表达和功能作用 | 小鼠收集淋巴管及周围组织，以及乳腺癌相关淋巴水肿患者的活检样本 | 单细胞转录组学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，细胞内钙活性测量 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据，功能实验数据 | 小鼠收集淋巴管样本及患者活检样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-04-20 |
Integrative genomics elucidates the evolutionary, temporal, and developmental origins of a hydrocephalus risk gene
2025-Sep-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.09.01.25334358
PMID:40950474
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研究论文 | 本研究通过整合基因组学方法，阐明了脑积水风险基因MAEL的进化起源、时间表达模式及在新生儿大脑发育过程中的细胞谱系特异性表达 | 首次系统描绘了MAEL基因在人类大脑发育过程中的时空表达谱，并直接验证了其在人类脑积水组织中的表达下调，为理解该基因在疾病中的作用机制提供了进化与发育背景 | 研究主要基于观察性数据，MAEL表达下调与脑积水之间的直接因果关系仍需进一步的体外和体内功能实验验证 | 阐明MAEL基因的进化起源及其在人类大脑发育和脑积水中的表达模式 | MAEL基因、人类大脑组织（包括正常发育大脑和脑积水手术获取的皮质组织） | 基因组学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、系统进化分析、基因表达定量 | NA | 基因序列数据、单细胞转录组数据 | 来自艾伦研究所发育中人类大脑图谱的49个脑区scRNA-seq数据，以及手术获取的原代脑积水皮质组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-04-17 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq identifies transcriptional and epigenetic blueprint guiding osteoclastogenic trajectory
2025-Sep-28, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf084
PMID:40577680
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq、ATAC-seq、批量RNA-seq和ChIP-seq技术，揭示了破骨细胞生成过程中转录和表观遗传调控的蓝图 | 首次在单细胞分辨率下结合多组学分析，系统描绘了破骨细胞生成的分化轨迹，并鉴定出IRF8作为破骨细胞生成的关键负调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证和临床转化仍需进一步探索 | 阐明破骨细胞生成过程中的转录和表观遗传调控机制 | 野生型和IRF8条件性敲除小鼠的造血干细胞、祖细胞、单核细胞及破骨细胞前体 | 单细胞多组学 | 骨溶解性疾病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA-seq, ChIP-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据, 批量转录组数据, 染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-04-17 |
Anti-tumor effects on tumor-infiltrating natural killer cells by localized ablative immunotherapy and immune checkpoint inhibitors: An integrated and comparative study using scRNAseq analysis
2025-Sep-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217825
PMID:40436260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，比较了局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤浸润自然杀伤细胞的调控作用及其临床意义 | 首次整合单细胞测序和TCGA数据库，系统比较了LAIT和ICI对NK细胞的转录调控，并构建了基于NK细胞基因特征的预后模型 | 研究基于小鼠乳腺癌模型，临床转化需进一步验证；单细胞测序样本量有限 | 阐明局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤微环境中NK细胞的调控机制 | 肿瘤浸润自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠乳腺癌模型，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-04-13 |
Single-cell dissection of the genotype-immunophenotype relationship in glioblastoma
2025-Sep-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf129
PMID:40215269
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，系统性地解析了胶质母细胞瘤三种分子亚型中基因型与免疫表型之间的关系 | 首次在单细胞水平上，利用基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型，系统地建立了人类相关驱动突变（EGFRvIII、PDGFB、NF1）与肿瘤微环境中免疫表型之间的关联分析平台 | 研究基于小鼠模型，虽然能有效模拟人类肿瘤的异质性，但仍需在人类临床样本中进行进一步验证 | 解析胶质母细胞瘤中基因驱动突变与肿瘤微环境免疫表型之间的因果关系，为个性化治疗提供新靶点 | 携带EGFRvIII、PDGFB和NF1驱动突变的基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-04-12 |
Lung NR3C1+ and CXCR6high T cells distinguish immunopathogenesis of human emphysema
2025-Sep-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08698-1
PMID:40993192
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肺气肿中T细胞的免疫病理机制，特别是NR3C1+和CXCR6high CD4 T细胞亚群的作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合临床数据，识别出肺气肿中特定的T细胞亚群（NR3C1+和CXCR6high CD4 T细胞），并揭示了它们与肺功能保留的关联，为肺气肿的免疫治疗提供了新靶点 | 研究基于两个独立的单细胞RNA测序数据集，样本量可能有限，且机制验证需要进一步的实验研究 | 探究T细胞在吸烟者慢性阻塞性肺疾病（COPD）肺气肿中的免疫病理作用 | 人类肺组织样本，包括肺气肿性COPD、非肺气肿性COPD和对照组的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺气肿 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个独立的人类肺组织单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-04-12 |
Post-Liver Transplantation Management and Specimen Collection in Daurian Ground Squirrels for Single-Cell RNA Sequencing
2025-09-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68443
PMID:41052099
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研究论文 | 本文详细介绍了针对达乌尔黄鼠肝移植后的动物护理、生理监测以及用于单细胞RNA测序的高质量肝移植物样本制备标准化流程 | 利用冷适应性达乌尔黄鼠作为新型肝移植模型，以研究低温诱导的移植物损伤机制，填补了传统啮齿动物模型的局限 | 协议主要针对达乌尔黄鼠这一特殊物种，可能在其他生物中的普适性有限，且未涉及大规模临床验证 | 开发并标准化肝移植后管理及样本收集方法，以促进对移植功能恢复和免疫兼容性机制的研究 | 达乌尔黄鼠的肝移植物样本 | 数字病理学 | 肝移植相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组分析、组织病理学检查 | NA | RNA序列数据、组织样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-04-12 |
Mining Spatial Transcriptomics Datasets using DeepSpaceDB
2025-09-05, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68892
PMID:40982393
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研究论文 | 本文介绍了DeepSpaceDB数据库，一个用于空间转录组学数据探索的综合动态数据库，并通过示例展示了其工作流程和应用 | 开发了DeepSpaceDB数据库，提供高级工具和交互功能，促进空间转录组学数据的访问和深入分析 | 空间转录组学仍是一种高度专业化的实验技术，存在显著的技术和财务限制 | 促进空间转录组学数据的访问和分析，以探索组织结构和疾病生物学 | 小鼠脑样本和鼠肝中的结直肠癌转移区域与健康组织区域 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2026-04-10 |
Autophagy Upregulation in Mutant Isocitrate Dehydrogenase 1 (IDH1) Glioma Uncovers a Novel Therapeutic Target
2025-Sep-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7483444/v1
PMID:40964044
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研究论文 | 本研究揭示了突变型异柠檬酸脱氢酶1（mIDH1）胶质瘤中自噬上调作为关键生存途径，并探索了通过自噬抑制增强放射敏感性的新治疗策略 | 首次发现mIDH1胶质瘤中自噬上调作为能量来源，并利用合成蛋白纳米颗粒递送siRNA靶向Atg7抑制自噬，从而增强放射敏感性并诱导肿瘤消退 | 研究主要基于人类和小鼠细胞模型及小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索mIDH1胶质瘤的生存机制并开发新的治疗靶点 | 人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞及小鼠模型 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-04-10 |
Single-cell analysis of human fibrous dysplasia bone reveals a fibrotic transcriptome and GNAS variants in endothelial, perivascular, and stromal cells
2025-Sep-04, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.07.018
PMID:40848713
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和GNAS基因分型策略，分析了人类纤维性发育不良骨中的非造血细胞，揭示了GNAS变异在多种非成骨细胞谱系中的存在以及FD特有的纤维化转录组特征 | 首次在纤维性发育不良骨的内皮细胞、血管周围细胞和基质细胞中检测到GNAS c.602G>A和c.601C>T变异，并识别了跨FD细胞谱系的共同纤维化转录组特征 | 研究样本量有限，可能无法完全代表FD的异质性；单细胞测序技术本身存在技术偏差 | 探究GNAS体细胞镶嵌变异在纤维性发育不良中的细胞和分子机制 | 人类纤维性发育不良骨和非FD骨中的非造血细胞 | 数字病理学 | 纤维性发育不良 | 单细胞RNA测序, GNAS基因分型, BaseScope原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | FD和非FD人类骨样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-04-09 |
Gene context drift identifies drug targets to mitigate cancer treatment resistance
2025-Sep-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.06.005
PMID:40578362
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RECODR的计算流程，通过结合单细胞RNA测序谱的共表达图网络和图嵌入方法，测量癌症治疗期间基因共表达上下文的变化，以识别耐药机制并设计有效联合治疗方案 | RECODR首次将基因共表达上下文变化（而非仅表达水平）作为核心指标，结合图网络和图嵌入技术，揭示了传统计算方法无法检测的耐药机制 | 方法主要基于单细胞RNA测序数据，可能未涵盖其他分子层面的耐药机制，且临床验证仍需进一步扩展 | 开发计算工具以预测和缓解癌症治疗耐药性，通过分析基因共表达上下文变化来设计有效联合治疗方案 | 癌症治疗耐药机制，聚焦于脉络丛癌、髓母细胞瘤和三阴性乳腺癌的肿瘤样本 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 图网络和图嵌入方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-04-04 |
Identifying spatially variable genes by projecting to morphologically relevant curves
2025-Sep-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.21.624653
PMID:39605709
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研究论文 | 本文提出了一种基于谱图理论的方法，用于在空间转录组学数据中识别空间可变基因，通过将二维空间坐标投影到一维曲线上来反映组织形态 | 引入谱图理论来近似样本空间坐标的一维曲线，并开发广义加性模型直接建模基因计数，无需标准化或正态假设，同时能准确估计基因表达模式和空间位点 | NA | 识别空间转录组学数据中的空间可变基因 | 空间转录组学数据，包括小鼠黏膜和多样本数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 广义加性模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | Slide-seq, MERFISH | NA |