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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-16 |
Loss of BAP1 defines a unique subtype of TP53-mutated de novo AML and confers sensitivity to BCL-xL inhibitors
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026417
PMID:40540751
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研究论文 | 本文发现BAP1缺失与TP53突变在急性髓系白血病中共存,定义了独特的亚型,并揭示了其对BCL-xL抑制剂的敏感性 | 首次揭示BAP1缺失与TP53突变在AML中的协同作用,定义了新的白血病亚型,并发现其依赖BCL2L1表达,对BCL-xL抑制剂敏感 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,人类疾病异质性可能未被完全捕捉 | 探究与TP53缺陷协同促进红细胞白血病转化的遗传改变 | TP53突变的急性髓系白血病患者及小鼠模型 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-03-14 |
Multi-step genomics on single cells and live cultures in sub-nanoliter capsules
2025-Sep-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.642839
PMID:40166192
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研究论文 | 本文开发了一种名为CAGEs的胶囊技术,用于在单细胞水平上进行高通量多步基因组学分析,包括活细胞培养与全基因组读出的结合 | CAGEs胶囊技术首次实现了在单细胞水平上结合活细胞培养与高通量多步基因组学分析,突破了传统方法在活细胞分析中的限制 | 未明确提及技术局限性,但可能涉及胶囊制备的复杂性或特定应用场景的适应性 | 开发一种新型单细胞分析平台,以支持活细胞的高通量多步基因组学测量 | 单细胞和活细胞培养 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞测序、基因组学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 数万个扩展克隆的转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | CAGEs胶囊技术 |
| 23 | 2026-03-10 |
Single-cell transcriptome combined with genetic tracing reveals a roadmap of fibrosis formation during proliferative vitreoretinopathy
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424487122
PMID:40920930
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪技术,揭示了增殖性玻璃体视网膜病变(PVR)中纤维化形成的细胞起源和机制,并识别了TSP-1作为关键驱动基因 | 首次结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪,系统绘制了PVR纤维化形成的细胞路线图,并发现TSP-1作为治疗靶点 | NA | 解析增殖性玻璃体视网膜病变(PVR)中纤维化形成的细胞机制,以开发治疗策略 | 视网膜色素上皮细胞、免疫细胞和Müller细胞在PVR病变中的贡献 | 数字病理学 | 增殖性玻璃体视网膜病变 | 单细胞转录组学,遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-03-10 |
Dynamic and precise electromagnetic levitation of single cells
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2512246122
PMID:40920932
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Electro-LEV的创新平台,它结合电磁和磁悬浮原理,实现了在3-D微流体环境中对单细胞位置进行动态精确控制 | 该平台通过周期性调制和跟踪细胞在z轴的位置,能够区分单细胞与细胞簇的悬浮行为,并显著提高了悬浮分选的纯度和效率 | NA | 开发一种用于动态3-D控制细胞位置的新平台,以研究细胞异质性、区分细胞大小和类型,并提高细胞分选效率 | 单细胞和细胞簇 | 数字病理学 | NA | 电磁悬浮和磁悬浮 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2026-03-10 |
Single-cell analysis of human fibrous dysplasia bone reveals a fibrotic transcriptome and GNAS variants in endothelial, perivascular, and stromal cells
2025-Sep-04, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.07.018
PMID:40848713
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和GNAS基因分型策略,分析了人类纤维性结构不良骨中的非造血细胞,揭示了GNAS变异在多种细胞谱系中的存在以及共同的纤维化转录组特征 | 首次在纤维性结构不良骨中,除了骨骼基质谱系外,还在内皮细胞和血管周围细胞中检测到GNAS c.602G>A和c.601C>T变异,并识别出跨细胞谱系的共同纤维化转录组特征 | 样本来源有限,仅分析了非造血细胞,可能未全面覆盖所有相关细胞类型 | 探究体细胞嵌合体在纤维性结构不良疾病中的细胞和分子机制 | 人类纤维性结构不良骨和非纤维性结构不良骨中的非造血细胞 | 数字病理学 | 纤维性结构不良 | 单细胞RNA测序, GNAS基因分型, BaseScope | NA | RNA测序数据 | 来自FD和非FD人类骨组织的非造血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-03-06 |
The pericardium forms as a distinct structure during heart formation
2025-Sep-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63599-5
PMID:41022776
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研究论文 | 本研究揭示了心包在心脏形成过程中作为一个独立结构起源于侧板中胚层中的特定间皮祖细胞 | 发现心包起源于侧板中胚层中与经典心区不同的特定间皮祖细胞,并证明其形成过程独立于心脏形成 | NA | 探究心包的发育起源及其在心脏形态发生中的作用 | 斑马鱼、哺乳动物和新生大鼠的心包发育过程 | 发育生物学 | 小儿扩张型心肌病 | 单细胞转录组学、光片成像、机器学习支持的细胞追踪 | 机器学习 | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-03-06 |
A Novel Proteoglycan-4 Isoform Drives Skeletal Regeneration
2025-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.15.676417
PMID:41001003
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研究论文 | 本文通过小鼠胫骨骨折模型,揭示了PRG4蛋白在骨骼再生中的新作用,特别是其独特剪接异构体在骨形成中的关键功能 | 发现了PRG4的一个新型剪接异构体(缺失三个编码外显子),并首次证明其在骨骼再生中具有成骨作用,突破了PRG4仅作为关节软骨润滑蛋白的传统认知 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证;局部siRNA递送可能影响其他细胞过程 | 探究PRG4在骨骼再生过程中的功能及其剪接异构体的作用 | 小鼠胫骨骨折模型及骨折骨痂组织 | 数字病理学 | 骨骼疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲低 | NA | RNA序列数据 | 多个骨折后时间点的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-03-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of C. elegans Q neuroblast lineage during migration and differentiation
2025-Sep-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.09.675151
PMID:40964368
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,对秀丽隐杆线虫Q神经母细胞谱系在迁移和分化过程中的基因表达进行了高分辨率分析 | 首次构建了Q神经母细胞谱系的稳健转录组分化图谱,揭示了新的基因表达模式,包括左右不对称的Wnt相关机制以及上皮-间质转化过程 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,功能验证可能有限,且样本来自特定发育阶段,可能无法完全代表整个发育过程 | 探究神经母细胞迁移和分化的分子机制,特别是在单细胞分辨率下解析Q谱系的发育过程 | 秀丽隐杆线虫的Q神经母细胞谱系细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同发育阶段的Q谱系细胞,通过FACS分离 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-03-06 |
Human-mouse cross-species comparison identifies common and unique aspects of intestinal mesenchyme development
2025-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.03.674033
PMID:40950081
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组织学方法,比较了小鼠和人类肠道间充质细胞在发育过程中的细胞身份、多样性和组织结构的异同 | 首次在小鼠和人类之间进行跨物种比较,揭示了肠道间充质细胞类型/状态的高度保守性,同时识别了物种间谱系定义基因的差异 | NA | 探究小鼠和人类肠道间充质细胞在发育过程中的保守性和独特性 | 小鼠和人类发育中的肠道间充质(成纤维细胞)群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荧光原位杂交(FISH)、免疫荧光(IF) | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-03-06 |
Isotope-encoded spatial biology identifies plaque-age-dependent maturation and synaptic loss in an Alzheimer's disease mouse model
2025-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63328-y
PMID:40890115
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研究论文 | 本研究结合质谱成像与稳定同位素标记技术,在阿尔茨海默病小鼠模型中时间标记Aβ斑块,并整合空间转录组学分析,揭示了斑块年龄依赖性成熟与突触丢失的关系 | 首次将稳定同位素标记与质谱成像结合,实现对Aβ斑块从初始沉积开始的时空老化追踪,并独立于小鼠年龄或疾病阶段关联斑块年龄与基因表达变化 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类阿尔茨海默病;技术整合的复杂性可能限制广泛应用 | 探究Aβ斑块随时间演变如何影响周围组织,特别是斑块成熟与神经毒性之间的关系 | App敲入Aβ小鼠模型中的淀粉样蛋白斑块及其周围脑组织 | 空间生物学 | 阿尔茨海默病 | 质谱成像、稳定同位素标记、空间转录组学 | NA | 质谱成像数据、空间转录组数据、结构特异性染料图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 31 | 2026-03-05 |
p53 maintains lineage fidelity during lung capillary injury-repair in neonatal hyperoxia
2025-Sep-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182880
PMID:40763040
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研究论文 | 本研究揭示了p53在新生儿高氧损伤后肺毛细血管修复过程中维持内皮细胞谱系保真性的关键作用 | 首次发现Cap2细胞在高氧损伤中被Cap1细胞替代,并证实EC特异性p53缺失可通过诱导过渡性内皮细胞状态改善血管表型和肺泡简化 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;过渡性EC状态的具体调控机制仍需进一步探索 | 探究p53在新生儿高氧诱导肺损伤修复过程中对内皮细胞谱系保真性的调控作用 | 新生小鼠肺组织内皮细胞亚群(Cap1/Cap2)及人类支气管肺发育不良(BPD)伴肺动脉高压样本 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良(BPD) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量(含小鼠模型和人类BPD样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-03-04 |
Tumor-expressed GPNMB orchestrates Siglec-9+ TAM polarization and EMT to promote metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Sep-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503081122
PMID:40892920
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤表达的GPNMB如何通过调控Siglec-9+ TAM极化和EMT来促进三阴性乳腺癌的转移 | 揭示了GPNMB通过诱导单核细胞中次级GPNMB表达,形成前馈放大环路,促进免疫抑制性TAM极化,并首次阐明了GPNMB不同唾液酸化修饰(α2,3 vs α2,6)导致Siglec-9差异识别的机制 | 研究主要基于体外共培养和体内小鼠模型,人类临床样本验证相对有限,且Siglec-9在人体中的功能需进一步验证 | 阐明GPNMB在三阴性乳腺癌转移中的分子机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞、单核细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq)、去卷积分析、体外共培养、体内小鼠模型 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | 基于公开可用的TNBC scRNA-seq数据集和TNBC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-03-03 |
Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy
2025-Sep-19, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.031
PMID:40976555
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研究论文 | 本研究探讨了Epac1在缺血诱导的视网膜病变(OIR)小鼠模型中的作用,发现Epac1缺失可减轻Müller胶质细胞的病理性激活,并缓解视网膜神经变性 | 揭示了Epac1通过调节Müller细胞中的VEGF信号通路促进视网膜神经变性的新作用机制 | 研究基于小鼠OIR模型,其发现向人类疾病的转化仍需进一步验证 | 探究Epac1在缺血诱导视网膜病变中的作用及其分子机制 | 小鼠氧诱导视网膜病变(OIR)模型中的视网膜组织,特别是Müller胶质细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫染色、qPCR、Western blot、邻近连接分析 | 小鼠遗传缺失模型(Epac1敲除) | 单细胞转录组数据、组织图像、蛋白质印迹数据 | 未明确说明具体数量的小鼠OIR模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-03-03 |
Single-cell transcriptome and surfaceome profiling of the adult human retinal pigment epithelium
2025-Sep-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102611
PMID:40882639
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研究论文 | 本研究利用CITE-seq技术对成人视网膜色素上皮细胞进行单细胞转录组和表面组分析,揭示了其亚群的多样性、空间分布和功能差异 | 首次结合单细胞转录组和表面蛋白标记(CITE-seq)对成人RPE进行综合分析,发现了具有独特空间模式和功能的新亚群,并验证了培养过程中亚群的保留情况 | 研究主要基于成人样本,未涵盖发育或疾病状态下的RPE变化;样本量相对有限 | 探索成人视网膜色素上皮细胞的亚群多样性及其对视网膜生物学和细胞治疗的意义 | 成人视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 年龄相关性黄斑变性 | CITE-seq(转录组和表面蛋白标记测序),免疫组织化学分析 | NA | 单细胞转录组数据,表面蛋白数据,图像数据 | 成人RPE细胞样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,表面蛋白检测 | NA | NA |
| 35 | 2026-03-03 |
High-resolution spatial transcriptomics in fixed tissue using a cost-effective PCL-seq workflow
2025-Sep-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279906.124
PMID:40764053
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PCL-seq的高分辨率空间转录组学方法,适用于固定组织,具有成本效益 | 采用光控DNA标记策略和光裂解寡核苷酸,实现亚细胞分辨率,并兼容FFPE组织 | NA | 开发一种高分辨率、成本效益高的空间转录组学工作流程 | 小鼠胚胎的冷冻和FFPE组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎组织(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学 | PCL-seq工作流程 | 使用光裂解寡核苷酸和连接适配器,通过显微镜控制的光照指定感兴趣区域 |
| 36 | 2026-03-03 |
Innate immunity and the NF-κB pathway control prostate stem cell plasticity, reprogramming and tumor initiation
2025-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00994-3
PMID:40550901
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研究论文 | 本研究探讨了Pten缺失如何通过先天免疫和NF-κB通路调控前列腺基底细胞的可塑性、重编程和肿瘤起始 | 揭示了Pten缺失导致基底细胞以区域化方式重编程为hillock样状态,并进展为近端样管腔状态,最终形成侵袭性肿瘤,且这一过程与先天免疫激活相关 | NA | 研究前列腺基底细胞可塑性和肿瘤起始的分子机制 | 前列腺基底细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 原位表征 | NA | RNA测序数据, 染色质可及性数据, 原位图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-03-03 |
Single-Cell Sequencing-Based Exploration of the Role of Tip Cells on Astrocytes and Macrophages After Spinal Cord Injury
2025-09, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70088
PMID:40891625
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序和体外实验,探讨了尖端细胞在脊髓损伤后对星形胶质细胞和巨噬细胞的作用 | 揭示了尖端细胞通过Angptl4-Sdc4配体-受体通路调控星形胶质细胞迁移和巨噬细胞极化,并首次报道其在脊髓损伤中的核糖体蛋白表达特征 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,体内验证和临床转化潜力尚需进一步探索 | 探索脊髓损伤后尖端细胞对炎症微环境中星形胶质细胞和巨噬细胞的影响 | 尖端细胞、星形胶质细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-03-02 |
Deconvoluting single-cell transcriptomics reveals cellular programs regulated by cell-cell communication in colorectal cancer
2025-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.09.648030
PMID:40321215
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荟萃分析 | 本研究通过整合八个单细胞队列数据,开发了一种新颖的分析框架,以揭示结直肠癌中细胞间通讯网络及其调控的细胞程序 | 采用分层主题建模识别反映单细胞信号状态的基因表达模块,并结合因果发现方法系统揭示可能受配体-受体信号和跨细胞类型通讯调控的模块,通过空间转录组学验证了这些模块在空间域中的共定位 | NA | 深入理解结直肠癌中细胞间通讯网络的复杂性及其在肿瘤微环境中的作用 | 结直肠癌患者样本中的单细胞转录组数据 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 分层主题建模,因果发现方法 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 153名患者,279个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-03-02 |
Interferon Epsilon Loss Is Elusive 9p21 Link to Immune-Cold Tumors, Resistant to Immune Checkpoint Therapy, and Endogenous CXCL9/10 Induction
2025-Sep, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2024.12.020
PMID:39725169
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研究论文 | 本研究揭示了9号染色体短臂(9p)缺失通过干扰素ε(IFNϵ)信号通路导致免疫冷肿瘤及免疫检查点疗法(ICT)耐药性的机制 | 首次将9p缺失与IFNϵ信号联系起来,并证明IFNϵ是调控CXCL9/10表达和免疫细胞浸润的关键因子 | IFNϵ在肿瘤免疫微环境中的作用具有显著的组织特异性,且部分肿瘤类型中相关性较弱 | 探究9p缺失导致免疫冷肿瘤和ICT耐药的分子机制 | 人类肿瘤样本、细胞系及小鼠模型,涵盖头颈鳞癌、非鳞非小细胞肺癌、黑色素瘤等多种癌症类型 | 肿瘤免疫学 | 多种癌症(头颈鳞癌、非鳞非小细胞肺癌、黑色素瘤等) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、拷贝数变异分析、介导分析 | 小鼠基因工程模型(ΔS与ΔL缺失模型) | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 13项研究报告、36个ICT队列数据,涵盖多种肿瘤类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-03-02 |
Roadmap for spatial transcriptomics of HIV in tissues
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000961
PMID:40626838
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综述 | 本文概述了空间转录组学平台及其在HIV组织持久性研究中的应用,包括工作流程和质量控制 | 提出了空间转录组学在HIV组织研究中的路线图,强调高分辨率(<1 μm)和全基因组覆盖(约20,000基因)的创新应用 | 目标捕获中目标数量增加常降低灵敏度,且分析需确保严谨性以避免报告无生物学意义的特征 | 探索HIV在组织中的持久性机制,并为治疗策略提供信息 | HIV感染细胞、周围微环境及组织样本 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学、ATAC-seq、蛋白质捕获、T细胞受体测序 | NA | RNA分子、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞多组学 | NA | NA |