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当前共找到 959 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-05 |
Engineered vasculature induces functional maturation of pluripotent stem cell-derived islet organoids
2025-Sep-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.024
PMID:40412386
|
研究论文 | 本研究通过工程化血管系统成功诱导人多能干细胞来源的胰岛类器官实现功能成熟 | 首次构建了包含血管系统的三维胰岛类器官模型，揭示了血管通过形成胰岛样基底膜和BMP信号通路促进β细胞功能成熟的机制 | 研究中使用的血管系统模型仍需进一步优化以更精确模拟体内生理环境 | 开发具有血管系统的功能性胰岛类器官用于糖尿病研究和治疗 | 人多能干细胞来源的胰岛细胞、人原代内皮细胞和成纤维细胞 | 组织工程 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、微流体技术、三维细胞培养 | NA | 基因表达数据、钙离子成像数据、胰岛素分泌数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2025-10-05 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2025-Sep-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96713
PMID:40982369
|
研究论文 | 本研究利用深度迁移学习工具DEGAS识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 首次应用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据中，识别出特定的疾病相关β细胞亚群 | 研究样本量有限，未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群以更好理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫染色 | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据，批量表达数据，图像数据 | 来自健康和2型糖尿病捐赠者的人类胰腺切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 363 | 2025-10-05 |
Novel radiation-derived gene blueprint stratifying patients with breast cancer
2025-Sep-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03549-1
PMID:40983794
|
研究论文 | 开发基于辐射相关基因的乳腺癌预后风险模型 | 首次利用辐射相关基因构建乳腺癌预后预测模型，并揭示其与免疫浸润和免疫治疗反应的关系 | 需要更多独立队列验证模型的临床适用性 | 开发乳腺癌预后预测生物标志物和个性化治疗策略 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多组学分析 | 随机森林, LASSO Cox回归, stepAIC | 基因表达数据 | TCGA-BRCA队列和METABRIC数据集患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 364 | 2025-10-05 |
SIGEL: a context-aware genomic representation learning framework for spatial genomics analysis
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03748-7
PMID:40983914
|
研究论文 | 提出一种用于空间基因组学分析的情境感知基因组表示学习框架SIGEL | 开发了能够从空间转录组数据中利用空间基因组情境生成基因表示的创新框架 | NA | 解决空间转录组学中生成空间感知基因表示方法的局限性 | 空间转录组数据中的基因表示 | 空间基因组学 | NA | 空间转录组学 | 表示学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 365 | 2025-10-05 |
KEGNI: knowledge graph enhanced framework for gene regulatory network inference
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03780-7
PMID:40983951
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研究论文 | 提出一种知识图谱增强的基因调控网络推断框架KEGNI，利用图自编码器从单细胞RNA测序数据中推断细胞类型特异性基因调控网络 | 首次将知识图谱与图自编码器相结合，通过知识引导增强基因调控网络推断的准确性 | NA | 开发更准确的细胞类型特异性基因调控网络推断方法 | 基因调控网络和驱动基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 图自编码器 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 366 | 2025-10-05 |
The Single Cell Landscape of the Human Vein After Arteriovenous Fistula Creation and Implications for Maturation Failure
2025-Sep-22, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.024
PMID:40992573
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类静脉在动静脉瘘建立后的细胞景观，阐明了瘘管成熟失败的机制 | 首次构建了人类静脉在动静脉瘘建立前后的单细胞转录组图谱，发现了成熟失败瘘管中持续的炎症反应和异常修复反应特征 | 样本量相对有限（20例单细胞测序患者），且为观察性研究 | 探究动静脉瘘成熟的生物学机制，特别是成熟失败的分子基础 | 接受血液透析患者的静脉组织和动静脉瘘样本 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学图像 | 23例患者（组织学分析），20例患者（单细胞测序，共70,281个细胞） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 367 | 2025-10-05 |
Single-cell and bulk transcriptomic analyses reveal ITGA5-driven epithelial-mesenchymal transition and metabolic adaptation in thyroid cancer
2025-Sep-21, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152678
PMID:40992268
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示ITGA5驱动的上皮-间质转化和代谢适应在甲状腺癌中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据系统分析ITGA5在甲状腺癌中的功能机制，发现其通过调控上皮-间质转化和肿瘤微环境重塑促进癌症进展 | 研究主要基于细胞系实验，缺乏体内动物模型验证；临床样本分析依赖于公共数据库 | 探究ITGA5在甲状腺癌进展中的分子机制和功能作用 | 甲状腺癌组织样本、BCPAP和8505C甲状腺癌细胞系 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, 功能富集分析, 细胞功能实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA甲状腺癌数据集, 两种甲状腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 368 | 2025-10-05 |
YWHAG mediated epithelial-mesenchymal transition facilitates tumor progression and metastatic spread in non-small cell lung cancer
2025-Sep-15, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112139
PMID:40962000
|
研究论文 | 本研究揭示YWHAG通过LRRK2/PI3K/AKT轴促进非小细胞肺癌的上皮-间质转化和转移进程 | 首次阐明YWHAG在非小细胞肺癌中通过调控LRRK2/PI3K/AKT信号轴驱动上皮-间质转化的分子机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证相对有限 | 阐明YWHAG在非小细胞肺癌进展中的功能和机制作用 | 非小细胞肺癌细胞系(NCI-H292, A549)、TCGA泛癌数据集、单细胞RNA测序数据、肺癌特异性YWHAG敲除小鼠模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 过表达, 免疫共沉淀, 免疫荧光, 通路活性分析, 生物发光成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | TCGA泛癌数据集(29种癌症类型)、2个NSCLC单细胞RNA测序数据集(GSE117570 & GSE148071)、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2025-10-05 |
Engineering Spatial and Molecular Features from Cellular Niches to Inform Predictions of Inflammatory Bowel Disease
2025-Sep-12, ArXiv
PMID:40964085
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用空间转录组学构建可解释机器学习模型来区分炎症性肠病亚型的新计算框架 | 首次将空间转录组学与可解释机器学习相结合，从细胞生态位中系统提取空间和分子特征用于IBD分类 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 开发基于空间转录组学的IBD亚型分类和诊断方法 | 健康对照、溃疡性结肠炎和克罗恩病患者的结肠黏膜组织 | 空间转录组学 | 炎症性肠病 | 空间转录组学，非负矩阵分解，多层感知器 | MLP | 空间转录组数据 | 健康对照、UC和CD患者的结肠黏膜样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 370 | 2025-10-05 |
NNMT inhibition in cancer-associated fibroblasts restores antitumour immunity
2025-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09303-5
PMID:40702186
|
研究论文 | 本研究通过抑制癌症相关成纤维细胞中的NNMT酶活性，恢复抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示NNMT通过诱导H3K27me3低甲基化驱动CAF分泌补体，招募免疫抑制性MDSC的机制，并开发了特异性NNMT抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果需进一步验证 | 探索NNMT在肿瘤微环境免疫抑制中的作用及治疗潜力 | 高级别浆液性卵巢癌、乳腺癌和结肠癌模型 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、高通量筛选 | 基因敲除小鼠模型、同系肿瘤模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | 多个小鼠癌症模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 371 | 2025-10-05 |
Genome-wide association study identifies FUT2 rs601338 polymorphism linking intra-pancreatic fat deposition to chronic pancreatitis
2025-Sep, Pancreatology : official journal of the International Association of Pancreatology (IAP) ... [et al.]
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.pan.2025.07.407
PMID:40744837
|
研究论文 | 通过全基因组关联研究揭示FUT2基因rs601338多态性通过影响胰腺脂肪沉积与慢性胰腺炎风险的关联机制 | 首次通过大规模GWAS发现胰腺脂肪沉积的遗传基础，结合单细胞转录组学确认FUT2基因在胰腺外分泌部的特异性表达 | 研究人群主要为欧洲裔，样本代表性有限；未深入探讨FUT2影响胰腺脂肪沉积的具体分子机制 | 探索胰腺脂肪沉积的遗传基础及其对胰腺疾病风险的影响 | 20,040名欧洲裔个体（排除急/慢性胰腺炎和胰腺癌患者） | 基因组学 | 慢性胰腺炎 | 全基因组关联研究(GWAS), 共定位分析, 转录组关联研究(TWAS), 单细胞转录组学 | 回归模型, 交互作用分析 | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 20,040人 | UK Biobank | 基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 372 | 2025-10-05 |
Biomarkers of immune dysregulation and posttreatment inflammation in spinal muscular atrophy
2025-Sep-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2506976122
PMID:40986347
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序分析脊髓性肌萎缩症(SMA)患者的免疫失调特征 | 首次在SMA中识别出6-7个月免疫激活转变点，发现基因治疗后NF-κB相关炎症基因显著上调，并揭示CD4+ T细胞早期功能障碍和G1期阻滞 | 样本量较小(共17名婴儿)，仅包含25个月以下患者 | 阐明脊髓性肌萎缩症中的免疫失调机制及其对治疗反应的影响 | 脊髓性肌萎缩症婴儿患者和健康对照婴儿的外周血样本 | 生物信息学 | 脊髓性肌萎缩症 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | SMA患者11例(7例bulk RNA-seq, 4例scRNA-seq)，健康对照10例(4例bulk RNA-seq, 6例scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2025-10-05 |
ALKBH5 demethylates the m6A modification of SOCS3 in microglia/macrophages and alleviates neuroinflammation after brain injury
2025-Sep-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504697122
PMID:40986354
|
研究论文 | 本研究揭示了ALKBH5通过去甲基化SOCS3的m6A修饰缓解脑损伤后神经炎症的分子机制 | 首次发现ALKBH5-m6A-SOCS3调控轴在脑损伤后小胶质细胞/巨噬细胞驱动的神经炎症中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中验证 | 探究m6A RNA修饰在创伤性脑损伤后神经炎症中的作用机制 | 小胶质细胞/巨噬细胞 | 分子生物学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, m6A RNA免疫沉淀测序, MeRIP-qPCR, RNA pull-down | NA | RNA测序数据 | 多个时间点的脑损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序, m6A测序 | NA | NA |
| 374 | 2025-10-05 |
Prolonged immune activation in post-acute sequelae of SARS-CoV-2: neutrophil dynamics and therapeutic insights
2025-Sep-24, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01539-5
PMID:40987794
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研究论文 | 本研究通过仓鼠模型揭示了SARS-CoV-2感染后长期症状中中性粒细胞持续激活的机制，并验证了靶向中性粒细胞炎症的治疗策略 | 首次在小仓鼠模型中系统揭示PASC的免疫机制，发现中性粒细胞持续激活是驱动长期炎症的关键因素，并验证了Sivelestat等小分子抑制剂的治疗效果 | 研究基于动物模型，结果需要进一步在人类临床试验中验证；样本量相对有限 | 探究SARS-CoV-2感染后长期症状的免疫机制并寻找有效治疗策略 | 小仓鼠模型及感染后30天的组织样本 | 免疫学 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | 动物疾病模型 | 基因表达数据，组织病理图像 | SARS-CoV-2感染组46.25-47.50%存活率，其中13.75%发展为PASC表型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 375 | 2025-10-05 |
Homocysteine Exacerbates Pulmonary Fibrosis via Orchestrating Syntaxin 17 Homocysteinylation of Alveolar Type II Cells
2025-Sep-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507803
PMID:40990430
|
研究论文 | 本研究揭示了高同型半胱氨酸血症通过诱导STX17同型半胱氨酸化修饰加剧肺纤维化的分子机制 | 首次发现同型半胱氨酸通过STX17同型半胱氨酸化-泛素化级联反应破坏自噬流的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步开展 | 探究同型半胱氨酸在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 特发性肺纤维化患者和小鼠模型的肺泡II型上皮细胞 | 分子病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | 小鼠遗传扰动模型 | 基因表达数据,蛋白质修饰数据 | 特发性肺纤维化患者与健康对照的样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 376 | 2025-10-05 |
DisConST: Distribution-aware Contrastive Learning for Spatial Domain Identification
2025-Sep-24, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf085
PMID:40990806
|
研究论文 | 提出一种基于分布感知对比学习的空间转录组学空间域识别新方法 | 首次将零膨胀负二项分布与图对比学习结合，有效整合空间位置、转录组谱和细胞类型比例信息 | NA | 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性 | 来自不同测序平台的组织、器官和胚胎空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | 对比学习, 图神经网络 | 空间基因表达数据 | 多种组织和胚胎样本（具体数量未明确说明） | 多种测序平台（具体公司未明确说明） | 空间转录组学 | NA | NA |
| 377 | 2025-10-05 |
Airway Epithelial Heterogeneity and Mucus Plugging in Asthmatic Bronchioles
2025-Sep-23, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202409-1849OC
PMID:40986379
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研究论文 | 本研究通过分析哮喘患者外周肺组织，揭示了细支气管上皮异质性与MUC5AC主导的黏液栓形成机制 | 首次发现哮喘细支气管中存在MUC5AC高表达杯状细胞生态位，并证明其与免疫细胞定位无关的异质性分布特征 | 样本来源为切除组织，无法动态观察疾病进程；免疫细胞分布与黏液栓形成相关性未明确 | 探究哮喘细支气管上皮生物学紊乱与黏液栓形成的分子病理机制 | 重度哮喘患者、致命性哮喘患者和对照者的外周肺组织 | 空间转录组学 | 哮喘 | 组织学分析、RNA原位杂交、免疫组织化学、空间转录组学、多重免疫表型分析 | NA | 组织切片图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 | 重度哮喘患者、致命性哮喘患者和对照组的外周肺组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 378 | 2025-10-05 |
PASSpedia: A Polyadenylation Site Database Across Different Species at Single Cell Resolution
2025-Sep-23, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf089
PMID:40986375
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研究论文 | 开发了一个跨物种单细胞分辨率的多聚腺苷酸化位点数据库PASSpedia | 升级了深度学习分析流程SCAPTURE v2，首次在单细胞水平构建了跨七个物种的全面PAS图谱 | NA | 研究多聚腺苷酸化位点在不同物种中的使用模式和特征 | 七个物种的1330个已发表的3'标签scRNA-seq数据集 | 生物信息学 | NA | 3'标签测序, 单细胞RNA测序, 长读长测序 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据 | 1330个scRNA-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | 3'标签scRNA-seq |
| 379 | 2025-10-05 |
Shear stress-induced endothelial HEG1 signalling regulates vascular tone and blood pressure
2025-Sep-23, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf742
PMID:40986512
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞HEG1蛋白通过剪切应力信号通路调控血管张力和血压的新机制 | 首次发现HEG1通过促进CUL3介导的PHACTR1降解来调节eNOS转录和NO产生，从而调控血压 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩大 | 阐明内皮HEG1在血压调控中的作用及分子机制 | 内皮细胞、小鼠模型、人类动脉和血浆样本 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、计算流体动力学分析、蛋白质组学、转录组学、泛素化分析 | 内皮特异性Heg1敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、血流动力学数据 | 多个独立队列的动脉和血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 380 | 2025-10-05 |
A Systematic Review on the Role of the Stria Vascularis in Menière's Disease Pathogenesis
2025-Sep-23, Journal of the Association for Research in Otolaryngology : JARO
DOI:10.1007/s10162-025-01006-y
PMID:40987969
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系统综述 | 本文系统综述了血管纹在梅尼埃病发病机制中的作用，识别了血管纹细胞类型中表达的基因及其与梅尼埃病的病理生理联系 | 首次系统性地识别了血管纹三种细胞类型中与梅尼埃病相关的特定基因，并揭示了免疫相关基因在散发性梅尼埃病中的重要作用 | 纳入研究数量有限（130项），且人类研究相对较少（26项），可能影响结果的普适性 | 评估血管纹基因在梅尼埃病发病机制中的病理生理作用 | 血管纹细胞类型（边缘细胞、中间细胞、基底细胞）和缝隙连接蛋白 | 系统综述 | 梅尼埃病 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 多组学研究 | NA | 文献数据, 基因表达数据 | 1293篇文章经筛选后纳入130项研究（26项人类研究，101项动物研究，3项人-动物研究） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |