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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-05 | Efficacious suppression of primary and metastasized liver tumors by polyIC-loaded lipid nanoparticles 
          2025-Sep-10, Hepatology (Baltimore, Md.)
          
         
          DOI:10.1097/HEP.0000000000001514
          PMID:40928035
         | 研究论文 | 本研究开发了装载polyIC的脂质纳米颗粒,可有效抑制原发性和转移性肝肿瘤 | 意外发现polyIC-LNPs可作为肝肿瘤的有效单药疗法,无需联合免疫检查点抑制剂 | 目前仅在动物模型中进行验证,尚未进行临床试验 | 开发肝靶向策略以降低polyIC的全身毒性并提高治疗效果 | 小鼠肝肿瘤模型 | 免疫治疗 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 多个小鼠肝肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 342 | 2025-10-05 | Impact of Data Quality on Deep Learning Prediction of Spatial Transcriptomics from Histology Images 
          2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2025.09.04.674228
          PMID:40964396
         | 研究论文 | 研究数据质量对从组织学图像预测空间转录组学的深度学习模型性能的影响 | 首次系统评估分子数据和图像数据质量对空间转录组学预测模型的影响,而非仅关注模型架构改进 | 插补方法提供的改进有限且无法泛化到测试集之外 | 探索数据质量对基于深度学习的空间基因表达预测性能的影响 | 空间转录组学数据和H&E染色组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学,深度学习 | 深度学习模型 | 图像,基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium, Visium | 成像技术(Xenium)与测序技术(Visium)的空间转录组学平台 | 
| 343 | 2025-10-05 | Spatial Transcriptomics to Study Virus-Host Interactions 
          2025-Sep, Annual review of virology
          
          IF:8.1Q1
          
         | 综述 | 探讨空间转录组学在研究病毒-宿主相互作用及其在病毒致病机制研究中的变革潜力 | 强调空间转录组技术对病毒致病机制研究的变革性潜力,解析相关技术细节与实施方法 | NA | 开发新型抗病毒疗法和诱导保护性免疫的策略 | 植物、动物和人类中的病毒性疾病 | 空间转录组学 | 病毒性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 344 | 2025-10-05 | SWIFT-seq enables comprehensive single-cell transcriptomic profiling of circulating tumor cells in multiple myeloma and its precursors 
          2025-Sep, Nature cancer
          
          IF:23.5Q1
          
         
          DOI:10.1038/s43018-025-01006-0
          PMID:40781193
         | 研究论文 | 开发了一种名为SWIFT-seq的单细胞测序工作流程,用于全面分析多发性骨髓瘤及其前体病变中循环肿瘤细胞的转录组特征 | 首次建立了基于测序的CTC计数策略和CTC分类器,能够推断细胞遗传学异常,并提出了循环动力学模型 | 样本量相对有限(101例患者和健康供者),BM活检技术限制可能导致部分结果不明确 | 开发非侵入性方法用于多发性骨髓瘤的诊断、监测和预后评估 | 多发性骨髓瘤患者和健康供者的骨髓和循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,B细胞受体测序 | CTC分类器,循环动力学模型 | 单细胞转录组数据 | 101例患者和健康供者 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | NA | SWIFT-seq工作流程 | 
| 345 | 2025-10-05 | Innate immunity and the NF-κB pathway control prostate stem cell plasticity, reprogramming and tumor initiation 
          2025-Sep, Nature cancer
          
          IF:23.5Q1
          
         
          DOI:10.1038/s43018-025-00994-3
          PMID:40550901
         | 研究论文 | 本研究揭示先天免疫和NF-κB通路通过调控前列腺干细胞可塑性影响肿瘤起始机制 | 发现Pten缺失通过激活先天免疫通路诱导基底细胞重编程为hillock样状态,并首次证明NF-κB通路在此过程中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类前列腺癌中的适用性需进一步验证 | 探索前列腺基底细胞可塑性和肿瘤起始的分子调控机制 | 前列腺基底细胞及其在Pten缺失后的命运变化 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 原位表征 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 组织学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA | 
| 346 | 2025-10-05 | Assessing the impact of perfluoroalkyl substances on liver health: a comprehensive study using multi-donor human liver spheroids 
          2025-Sep, Environment international
          
          IF:10.3Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.envint.2025.109763
          PMID:40914107
         | 研究论文 | 本研究使用多供体人类肝脏球体模型评估全氟烷基物质对肝脏健康的影响 | 首次在多细胞类型人类肝脏球体模型中系统比较不同PFAS化合物的性别特异性肝毒性机制 | 研究仅采用体外模型,浓度固定为20μM,暴露时间较短 | 阐明不同PFAS导致人类肝脏功能障碍的具体细胞和分子机制 | 多供体人类肝脏球体模型(包含多种细胞类型) | 毒理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序,脂质染色 | 肝脏球体模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | 多供体人类肝脏球体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 347 | 2025-10-05 | Zebrafish optic nerve injury results in systemic retinal ganglion cell dedifferentiation 
          2025-Sep, PLoS genetics
          
          IF:4.0Q1
          
         
          DOI:10.1371/journal.pgen.1011879
          PMID:40971959
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼视网膜神经节细胞在视神经损伤后的去分化现象 | 首次发现斑马鱼所有RGC亚型均对损伤具有抵抗力,并揭示其通过去分化为未成熟状态的独特生存机制 | 研究结果基于斑马鱼模型,与哺乳动物存在物种差异,临床应用前景需进一步验证 | 探索视网膜神经节细胞在视神经损伤后的分子响应机制和神经保护途径 | 斑马鱼视网膜神经节细胞 | 单细胞转录组学 | 视神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 348 | 2025-10-05 | Stereo-cell: Advancing spatial single-cell biology towards clinical translation 
          2025-Sep, Clinical and translational medicine
          
          IF:7.9Q1
          
         
          DOI:10.1002/ctm2.70480
          PMID:40984816
         | 研究论文 | 介绍新开发的空间单细胞测序平台Stereo-cell的技术创新及其在精准医学中的应用潜力 | 开发了整合形态学、转录组学和蛋白质组学的高分辨率空间单细胞测序平台,弥合先进组学与传统病理学之间的鸿沟 | 数据整合、监管合规性和数字建模方面存在重要挑战 | 推动空间单细胞生物学向临床转化发展 | 空间单细胞生物学平台 | 空间组学 | NA | 空间单细胞测序 | NA | 形态学、转录组学、蛋白质组学数据 | NA | NA | 空间单细胞测序 | Stereo-cell | 整合形态学、转录组学和蛋白质组学的高分辨率空间单细胞测序平台 | 
| 349 | 2025-10-05 | CD103+CD8+ tissue-resident memory T lymphocytes of melanoma boost anti-tumour immunity and predict immunotherapy outcomes 
          2025-Sep, Clinical and translational medicine
          
          IF:7.9Q1
          
         
          DOI:10.1002/ctm2.70464
          PMID:40985995
         | 研究论文 | 本研究揭示了CD103+CD8+组织驻留记忆T细胞在黑色素瘤中的抗肿瘤作用及其作为免疫治疗疗效预测标志物的价值 | 首次系统阐明CD103作为黑色素瘤中CD8+组织驻留记忆T细胞的标志物,并揭示其通过整合素依赖的PI3K/AKT信号通路增强抗肿瘤免疫的机制 | NA | 探究CD103+CD8+组织驻留记忆T细胞在黑色素瘤抗肿瘤免疫中的作用及其作为免疫治疗预测标志物的潜力 | 黑色素瘤患者样本、CD8+组织驻留记忆T细胞、小鼠模型 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 多重免疫组织化学、单细胞RNA测序、空间转录组学、体内/体外实验 | NA | 基因表达数据、空间分布数据、临床数据 | 多个独立队列的黑色素瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | 
| 350 | 2025-10-05 | Multi-Omics Integrated Analysis of the Protective Effect of Tertiary Lymphoid Structures and Associated Key Regulatory Genes in Human Gallbladder Cancer 
          2025-Sep, The journal of gene medicine
          
          IF:3.2Q2
          
         
          DOI:10.1002/jgm.70037
          PMID:40997892
         | 研究论文 | 本研究通过多组学整合分析探讨三级淋巴结构及其关键调控基因在人类胆囊癌中的保护作用 | 首次在胆囊癌中系统研究三级淋巴结构的预后价值,并通过单细胞RNA测序、批量RNA测序和深度学习筛选出6个TLS相关关键基因 | 样本量相对较小(85例患者),需要更大规模研究验证 | 探究三级淋巴结构在胆囊癌中的预后关联及其相关基因的调控机制 | 85例胆囊癌患者组织样本 | 生物信息学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 深度学习, 细胞实验验证 | 深度学习 | 基因表达数据, 临床数据 | 85例胆囊癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 351 | 2025-10-05 | Expression and Clinical Implications of LAG-3 in Small Cell Lung Cancer 
          2025-Sep-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
          
          IF:4.4Q2
          
         
          DOI:10.1096/fj.202502183R
          PMID:40960909
         | 研究论文 | 本研究评估了LAG-3在小细胞肺癌中的表达及其临床意义 | 首次系统评估28种免疫检查点分子在小细胞肺癌中的表达,发现LAG-3表达高于其他肺癌亚型和黑色素瘤,并验证其作为免疫治疗疗效预测标志物的潜力 | 研究基于多个数据集,可能存在样本异质性;需要进一步实验验证LAG-3作为生物标志物的临床实用性 | 探索PD-L1之外可用于免疫检查点抑制剂的分子标志物 | 小细胞肺癌细胞系和肿瘤组织 | 癌症免疫学 | 小细胞肺癌 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | 多个公共数据集和内部数据集(包括CCLE数据库、IMpower133数据集等) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA | 
| 352 | 2025-10-05 | Cyclic Heptapeptide FZ1 Acts as an Integrin αvβ3 Agonist to Facilitate Diabetic Skin Wound Healing by Enhancing Angiogenesis 
          2025-Sep-25, Journal of medicinal chemistry
          
          IF:6.8Q1
          
         
          DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c01734
          PMID:40910702
         | 研究论文 | 本研究揭示了环状七肽FZ1作为整合素αvβ3激动剂通过增强血管生成促进糖尿病皮肤伤口愈合的机制 | 首次发现靶向整合素αvβ3的肽类激动剂FZ1,并证明其在糖尿病伤口中的促愈合作用 | NA | 开发有效的糖尿病伤口治疗药物并阐明其调控机制 | 环状七肽FZ1及其在糖尿病伤口愈合中的作用机制 | 生物医学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序,RNA干扰,表面等离子共振,分子对接 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 353 | 2025-10-05 | Rolling circle amplification for next-generation molecular diagnostics, genome analysis, and spatial transcriptome profiling 
          2025-Sep-25, Nanoscale
          
          IF:5.8Q1
          
         
          DOI:10.1039/d5nr03032c
          PMID:40917009
         | 综述 | 本综述全面探讨滚环扩增技术的基本原理、设计改进及其在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用 | 将RCA与CRISPR检测、生物传感器和纳米颗粒辅助信号放大技术整合,显著提升了诊断潜力,实现核酸、蛋白质、细胞外囊泡和单细胞的超灵敏检测 | 面临反应特异性、自动化和成本效益等关键挑战 | 探索RCA技术在分子诊断、基因组分析和空间转录组分析中的应用及未来发展 | 核酸、蛋白质、细胞外囊泡、单细胞和组织结构中的基因表达 | 分子诊断 | 癌症 | 滚环扩增、CRISPR检测、生物传感器、纳米颗粒辅助信号放大 | NA | DNA序列、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA | 
| 354 | 2025-10-05 | Nonalcoholic Fatty Liver Disease Exacerbates the Advancement of Renal Fibrosis by Modulating Renal CCR2+PIRB+ Macrophages Through the ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP Axis 
          2025-Sep-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202509351
          PMID:40995682
         | 研究论文 | 本研究揭示了非酒精性脂肪肝病通过ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP轴调控肾脏CCR2+PIRB+巨噬细胞加剧肾纤维化的机制 | 首次发现NAFLD通过肝脏分泌的ANGPTL8激活肾脏特异性CCR2+PIRB+巨噬细胞,通过破坏亚油酸代谢促进肾纤维化的肝-肾轴信号通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探讨NAFLD在肾纤维化进展中的具体作用和分子机制 | 小鼠模型、原代肾巨噬细胞、共培养模型 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 流式细胞术, 免疫荧光 | 动物模型, 细胞培养模型 | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 流式数据, 图像数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA | 
| 355 | 2025-10-05 | Single-Cell Immune Profiling Reveals Neutrophils Promote Myasthenia Gravis Exacerbation Through BAFF Secretion 
          2025-Sep-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202509260
          PMID:40995750
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示中性粒细胞通过分泌BAFF促进重症肌无力恶化的机制 | 首次发现中性粒细胞-BAFF-浆细胞轴在重症肌无力急性加重中的作用机制 | 样本量有限,需要更大规模临床验证 | 探究中性粒细胞在重症肌无力急性加重中的具体作用机制 | 重症肌无力患者骨髓和外周血样本、实验性自身免疫性重症肌无力小鼠模型 | 单细胞生物学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据 | 重症肌无力患者和EAMG小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 356 | 2025-10-05 | RNA Sequencing at Single Vesicle Resolution via 3D Printed Embedded Droplet Arrays 
          2025-Sep-24, ACS applied materials & interfaces
          
          IF:8.3Q1
          
         
          DOI:10.1021/acsami.5c09959
          PMID:40938793
         | 研究论文 | 开发了一种通过3D打印嵌入式液滴阵列实现单细胞外囊泡RNA测序的平台 | 利用3D打印技术创建嵌入式液滴阵列,首次实现单细胞外囊泡水平的多聚腺苷酸RNA测序 | NA | 解决细胞外囊泡RNA载物的异质性问题 | 单个细胞外囊泡 | 单细胞测序技术 | NA | RNA测序, 3D打印, PCR | NA | RNA测序数据 | 3689个独特条形码对应的细胞外囊泡 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D打印嵌入式液滴阵列 | 基于有机凝胶支持介质的3D打印液滴阵列平台 | 
| 357 | 2025-10-05 | Next-generation translational genomics for developing future crops 
          2025-Sep-24, Functional & integrative genomics
          
          IF:3.9Q1
          
         
          DOI:10.1007/s10142-025-01704-z
          PMID:40987990
         | 综述 | 本文探讨现代转化基因组学在作物育种中的最新进展与创新策略 | 从单一基因组转向泛基因组分析,从批量转录组转向单细胞转录组技术,结合人工智能实现高通量表型分析 | NA | 通过整合基因组学、转录组学和表型数据加速作物改良 | 作物育种与遗传改良 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、高通量基因分型、表型分析 | AI和机器学习模型 | 基因组数据、转录组数据、表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA | 
| 358 | 2025-10-05 | Spatial profiling of human pancreatic ductal adenocarcinoma reveals molecular alterations associated with venous invasion 
          2025-Sep-24, Science translational medicine
          
          IF:15.8Q1
          
         
          DOI:10.1126/scitranslmed.ady7524
          PMID:40991729
         | 研究论文 | 通过空间转录组学分析揭示胰腺导管腺癌静脉侵犯的分子特征 | 首次系统描绘PDAC静脉侵犯的空间分子图谱,发现静脉侵犯区域表现出与更好预后相关的分子特征 | 样本量相对有限(8例患者95个样本),需在更大队列中验证 | 探究胰腺导管腺癌静脉侵犯的分子特征及其临床意义 | 人类胰腺导管腺癌组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, RNA-seq | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 公共RNA-seq数据 | 95个PDAC组织样本(来自8例初治患者),独立验证队列19例患者 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 359 | 2025-10-05 | Transforming histologic assessment: artificial intelligence in cancer diagnosis and personalized treatment 
          2025-Sep-24, British journal of cancer
          
          IF:6.4Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41416-025-03206-y
          PMID:40993310
         | 综述 | 本文综述了人工智能在组织学评估中的变革作用,特别是在癌症诊断和个性化治疗中的应用 | AI从诊断辅助工具发展为临床决策的组成部分,通过深度学习技术复制和增强病理学家决策,并整合组织学、基因组和临床数据 | AI预测验证存在挑战,特别是在预后应用方面,资源有限环境中的可及性仍需解决 | 探索人工智能在组织病理学评估中的临床应用和发展前景 | 组织学图像、基因组数据和临床数据的整合分析 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习、空间转录组学、多模态方法 | 深度学习模型 | 全切片图像(WSIs)、基因组数据、临床数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 360 | 2025-10-05 | HEBP2-governed glutamine competition between tumor and macrophages dictates immunotherapy efficacy in triple-negative breast cancer 
          2025-Sep-23, Cell metabolism
          
          IF:27.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.cmet.2025.08.009
          PMID:40992373
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了HEBP2调控的肿瘤细胞与巨噬细胞间谷氨酰胺竞争决定三阴性乳腺癌免疫治疗疗效的机制 | 首次发现HEBP2/GSTP1轴调控的肿瘤-巨噬细胞代谢检查点,开创了单细胞水平免疫代谢评估免疫治疗脆弱性的新范式 | 样本量相对有限(scRNA-seq队列N=27,空间转录组学队列N=88),需要在更大队列中验证 | 阐明三阴性乳腺癌免疫治疗疗效受限的代谢机制 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤微环境中的肿瘤细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | scRNA-seq队列27例患者,空间转录组学队列88例患者 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |