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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomics in Inherited Retinal Dystrophies: Current Findings and Emerging Perspectives
2025-Sep-16, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16091088
PMID:41010033
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在遗传性视网膜营养不良研究中的应用现状与前景 | 系统总结了单细胞转录组技术如何揭示传统批量RNA测序无法检测的视网膜特定细胞群在疾病进展中的分子变化 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 探讨单细胞转录组学如何增进对遗传性视网膜营养不良疾病机制的理解并促进新治疗靶点识别 | 遗传性视网膜营养不良疾病模型和视网膜细胞 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 342 | 2025-10-05 |
Dual Therapeutic Impact of AXL Inhibitor AB-329: Chemotherapy Sensitization and Immune Microenvironment Reprogramming in TNBC
2025-Sep-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26188896
PMID:41009462
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研究论文 | 本研究评估AXL抑制剂AB-329在三阴性乳腺癌中的双重治疗作用:化疗增敏和免疫微环境重编程 | 首次揭示AXL抑制剂AB-329不仅增强化疗疗效,还能通过增加NK细胞浸润重塑肿瘤免疫微环境 | 研究基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 评估AXL抑制剂AB-329在三阴性乳腺癌中的抗肿瘤疗效和免疫调节潜力 | 三阴性乳腺癌临床前模型,包括小鼠同种移植模型和人源化小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 343 | 2025-10-05 |
Cancer Growth and Invasion Are Increased in the Tight Skin (TSK) Mouse
2025-Sep-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17182943
PMID:41008788
|
研究论文 | 本研究通过使用紧皮(TSK)小鼠模型探究系统性硬化症微环境对癌症进展的影响 | 首次发现TSK小鼠可作为研究系统性硬化症与癌症关联的模型,并揭示了微环境中中性粒细胞-淋巴细胞比率升高和促纤维化细胞群富集的关键变化 | 研究仅使用了三种癌症细胞系,且机制研究仍需深入 | 探究系统性硬化症相关微环境对癌症进展的促进作用 | TSK小鼠和野生型小鼠,以及乳腺癌、黑色素瘤和卵巢癌细胞系 | 癌症生物学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TSK小鼠和野生型小鼠的多组肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 344 | 2025-10-05 |
Predictors of response to CD19 chimeric antigen receptor T-cell therapy in large B-cell lymphoma: a consolidated review
2025-Sep-04, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000001188
PMID:41029962
|
综述 | 本文系统回顾了CD19 CAR-T细胞疗法在弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效预测因素 | 整合了患者特异性、肿瘤内在性和治疗相关因素对CAR-T疗效影响的综合视角,并引入免疫分析、影像组学和单细胞转录组学等新型预测工具 | 基于现有文献的回顾性分析,缺乏前瞻性验证数据 | 探讨CD19 CAR-T疗法在弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效预测因素 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | 医学研究 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 免疫分析、影像组学、单细胞转录组学 | NA | 临床数据、基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2025-10-05 |
Identification of ATG4B and NLRP1 as M1 Macrophage-Activating-Related Plasma Proteins in Systemic Lupus Erythematosus via Multi-Omics Approaches
2025-Sep-02, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000548167
PMID:40892678
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研究论文 | 通过多组学方法鉴定系统性红斑狼疮中与M1巨噬细胞活化相关的血浆蛋白ATG4B和NLRP1 | 整合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、贝叶斯共定位分析和体外M1巨噬细胞实验,首次系统鉴定与SLE相关的M1巨噬细胞活化血浆蛋白 | 研究样本来源有限,主要基于现有数据库和体外实验,需要进一步临床验证 | 鉴定系统性红斑狼疮相关的血浆蛋白,特别是与M1巨噬细胞活化相关的蛋白质 | 系统性红斑狼疮患者、原代人外周血单核细胞、THP-1细胞系 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,贝叶斯共定位分析,分子动力学模拟,分子对接 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 基于GWAS数据库和FinnGen数据库的SLE患者数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 346 | 2025-10-05 |
NAT10 regulates tumor progression and immune microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma via the N4-acetylated LAMB3-mediated FAK/ERK pathway
2025-Sep, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70045
PMID:40540648
|
研究论文 | 本研究揭示了NAT10通过N4-乙酰化修饰LAMB3增强其mRNA稳定性,进而激活FAK/ERK通路促进胰腺导管腺癌进展和免疫抑制微环境的机制 | 首次发现NAT10在PDAC中通过乙酰化修饰LAMB3调控FAK/ERK通路和免疫微环境的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限 | 阐明NAT10在PDAC肿瘤恶性进展和肿瘤微环境中的作用机制 | 胰腺导管腺癌组织和细胞系,小鼠皮下肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 生物信息学分析,乙酰化RNA免疫沉淀,定量PCR,RNA免疫沉淀,Western blotting,单细胞RNA测序,多重免疫荧光,流式细胞术 | 动物肿瘤模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞测序数据 | PDAC组织和细胞系,小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2025-10-05 |
Single-dose cathepsin L CRISPR nanotherapy mitigates PASC-like lung damage in hamsters
2025-Sep, Nano research
IF:9.5Q1
DOI:10.26599/NR.2025.94907695
PMID:41019839
|
研究论文 | 开发针对组织蛋白酶L的单剂量CRISPR纳米疗法,可减轻仓鼠COVID-19急性后遗症相关的肺损伤 | 首次利用CRISPR-CasRx纳米疗法靶向宿主酶组织蛋白酶L,兼具抗病毒和促进肺泡修复的双重机制 | 研究仅在叙利亚仓鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发针对COVID-19急性后遗症肺损伤的新型治疗方法 | 叙利亚仓鼠 | 基因治疗 | COVID-19后遗症 | CRISPR-CasRx基因编辑,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 348 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing reveals no evidence for meiotic sex chromosome inactivation in the threespine stickleback fish
2025-Sep-29, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011875
PMID:41021609
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究三刺棘鱼减数分裂过程中性染色体基因表达模式 | 首次在三刺棘鱼中发现缺乏减数分裂性染色体失活现象,挑战了该过程在硬骨鱼类中的保守性假设 | 研究仅针对单一物种,需要更多硬骨鱼类研究验证结论的普适性 | 探究三刺棘鱼减数分裂过程中性染色体失活现象的存在与否 | 三刺棘鱼(Gasterosteus aculeatus)的性染色体(X和Y染色体) | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 349 | 2025-10-06 |
Hypothesis-generating evaluation of multi-armoured oncolytic HSV-1 (VG161) in intrahepatic cholangiocarcinoma: pooled insights from multicentre studies
2025-Sep-29, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335904
PMID:41022576
|
研究论文 | 评估多效溶瘤病毒VG161在肝内胆管癌中的安全性和疗效,并探索其免疫机制 | 首次报道表达IL-12、IL-15和PD-L1拮抗剂的多效溶瘤HSV-1病毒VG161在ICC中的临床数据,通过多组学分析揭示免疫微环境重塑机制 | 样本量较小(24例患者),需要更大规模试验验证结果 | 探索VG161溶瘤病毒在晚期肝内胆管癌患者中的安全性、疗效和免疫机制 | 晚期肝内胆管癌患者 | 肿瘤免疫治疗 | 肝内胆管癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、多组学分析 | NA | 临床数据、肿瘤活检样本、转录组数据 | 24例晚期ICC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 350 | 2025-10-06 |
Distinct cell state ecosystems for nodular lymphocyte-predominant Hodgkin lymphoma
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63339-9
PMID:41006203
|
研究论文 | 本研究开发了NLPHL特异性淋巴细胞优势生态型模型,识别出34种不同细胞状态并建立临床相关生物学分类 | 首次建立NLPHL特异性淋巴细胞优势生态型模型,识别出3种不同的免疫微环境生态型及其临床预后意义 | NLPHL为罕见癌症,样本量相对有限(总171例) | 深入研究结节性淋巴细胞为主型霍奇金淋巴瘤的免疫微环境和罕见淋巴细胞优势细胞 | 171例NLPHL患者样本中的淋巴细胞优势细胞和免疫微环境细胞 | 数字病理学 | 霍奇金淋巴瘤 | 空间转录组学 | LPE生态型模型 | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 训练队列109例(65% LPE1/2),验证队列62例(61% LPE1/2),总计171例NLPHL样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 351 | 2025-10-06 |
Spatially-restricted inflammation-induced senescent-like glia in multiple sclerosis and patient-derived organoids
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63371-9
PMID:41006208
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研究论文 | 本研究探讨多发性硬化症中慢性炎症与细胞衰老的关系,发现病变区域存在衰老样胶质细胞积累 | 首次通过单细胞转录组和空间转录组技术揭示MS病变中衰老样胶质细胞的空间分布特征,并利用患者来源的类器官模型验证小胶质细胞对炎症诱导衰老的特殊敏感性 | 样本数量有限,类器官模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究多发性硬化症中慢性炎症与细胞衰老的关联及其对疾病进展的影响 | 多发性硬化症患者脑组织样本和hiPSC来源的神经类器官 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组分析、空间转录组学、hiPSC衍生神经类器官、3T MRI | NA | 转录组数据、影像数据 | 466名患者脑组织样本及hiPSC衍生神经类器官 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-06 |
Comparison of imaging based single-cell resolution spatial transcriptomics profiling platforms using formalin-fixed paraffin-embedded tumor samples
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63414-1
PMID:41006245
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研究论文 | 使用福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本比较三种成像空间转录组学平台的性能 | 首次系统评估商业空间转录组学平台在肿瘤样本中的表现,并揭示探针设计等参数对数据质量的重要性 | 研究仅使用肺癌和胸膜间皮瘤样本,样本类型相对有限 | 评估不同空间转录组学平台在肿瘤生物学研究中的性能差异 | 肺腺癌和胸膜间皮瘤的福尔马林固定石蜡包埋手术切除样本 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学(CosMx、MERFISH、Xenium)、批量RNA测序、多重免疫荧光、GeoMx、HE染色 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | 使用组织微阵列中的肺腺癌和胸膜间皮瘤样本 | CosMx, MERFISH, Xenium | 空间转录组学,单细胞分辨率成像 | CosMx, MERFISH, Xenium | 单模态和多模态Xenium平台 |
| 353 | 2025-10-06 |
Aging in mice alters regionally enriched striatal astrocytes
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63429-8
PMID:41006292
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠纹状体中星形胶质细胞随年龄增长的分子变化和区域异质性 | 首次在单细胞分辨率下识别了纹状体中分子特征不同的星形胶质细胞亚型,并发现背侧纹状体星形胶质细胞表现出更大的年龄相关分子变化 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本;样本数量未明确说明 | 探究衰老对纹状体星形胶质细胞分子特征和区域分布的影响 | 年轻和老年小鼠的纹状体星形胶质细胞 | 神经科学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 354 | 2025-10-06 |
Mechanism of sepsis regulation by ELANE via macrophage polarization
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-18848-4
PMID:41006720
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了ELANE基因通过促进巨噬细胞M1极化加剧脓毒症的机制 | 首次系统性地将ELANE鉴定为脓毒症核心免疫调控基因,并通过单细胞测序和体外实验证实其在巨噬细胞极化中的关键作用 | 样本量较小(20例患者),且主要基于体外实验,需要更大规模的临床验证 | 鉴定脓毒症核心免疫调控基因ELANE并探索其通过巨噬细胞极化调控脓毒症的机制 | 脓毒症患者和健康对照者的外周血样本,以及LPS刺激的巨噬细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | RNA测序、生物信息学分析、单细胞测序、流式细胞术、ELISA | NA | RNA测序数据、单细胞测序数据、蛋白质相互作用数据 | 20例脓毒症患者和10例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 355 | 2025-10-06 |
BiAEImpute: a robust bidirectional autoencoder framework for High-fidelity dropout imputation in single-cell transcriptomics
2025-Sep-26, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11988-x
PMID:41013245
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研究论文 | 提出一种基于双向自编码器的单细胞转录组数据缺失值插补方法BiAEImpute | 采用行向和列向自编码器协同学习细胞和基因特征,增强插补过程的鲁棒性和准确性 | NA | 开发有效的单细胞RNA测序数据缺失值插补方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 双向自编码器(Bidirectional Autoencoder) | 基因表达数据 | 四个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 356 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of endometrium uncovers dynamic characteristics and dysregulation of perivascular CD9+SUSD2+ cells in thin endometrium
2025-Sep-26, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04658-y
PMID:41013639
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示薄型子宫内膜中血管周围CD9+SUSD2+细胞的动态特征和功能失调 | 首次在单细胞水平鉴定薄型子宫内膜中血管周围CD9+SUSD2+细胞作为祖干细胞,并揭示其功能异常机制 | 样本量较小(正常组n=3,薄型子宫内膜组n=3) | 探究薄型子宫内膜中CD9+SUSD2+细胞的分子特征和功能机制 | 人类子宫内膜组织,特别是血管周围CD9+SUSD2+细胞 | 单细胞生物学 | 薄型子宫内膜 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术,Western blotting,多重免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,组织学图像 | 6例子宫内膜样本(3例正常,3例薄型子宫内膜),共59,770个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2025-10-06 |
Adenine base editing rescues disrupted BCKDH function and reduces BCAAs toxic accumulation in maple syrup urine disease patient iPSC-hepatic organoids
2025-Sep-26, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04630-w
PMID:41013826
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研究论文 | 本研究利用腺嘌呤碱基编辑器ABE8e成功修复MSUD患者iPSC来源肝类器官中的BCKDHB基因突变,恢复BCKDH酶功能并降低支链氨基酸毒性积累 | 首次在MSUD患者特异性iPSC肝类器官中应用ABE8e碱基编辑技术精准纠正致病突变,并系统评估其功能恢复效果和安全性 | 研究仅限于体外类器官模型,尚未进行体内动物实验验证 | 开发基于碱基编辑技术的MSUD基因治疗方法 | MSUD患者诱导多能干细胞来源的肝类器官 | 基因编辑与干细胞研究 | 枫糖尿症(MSUD) | 腺嘌呤碱基编辑(ABE8e)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、全基因组测序(WGS)、qRT-PCR、Western blot | iPSC-derived hepatic organoids | 基因组数据、转录组数据、蛋白质表达数据 | MSUD患者iPSC来源肝类器官及对照样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 358 | 2025-10-06 |
Metabolic heterogeneity and survival outcomes in papillary renal cell carcinoma: insights from multi-datasets and machine learning analyses
2025-Sep-26, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00571-9
PMID:41013841
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研究论文 | 本研究通过多数据集和机器学习分析揭示了乳头状肾细胞癌的代谢异质性并建立了预后预测模型 | 整合90种机器学习算法构建代谢相关特征,并在单细胞水平验证关键基因 | 研究基于回顾性数据集,需要进一步前瞻性验证 | 研究肾乳头状细胞癌中代谢相关分子的特征并识别潜在预后生物标志物 | 肾乳头状细胞癌(KIRP)患者 | 机器学习 | 肾癌 | 加权基因共表达网络分析、差异表达分析、单细胞RNA测序、定量PCR、免疫组化染色 | 随机生存森林(RSF)、Cox回归 | 基因表达数据 | TCGA-KIRP和GSE2748队列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 359 | 2025-10-06 |
Nodal Spread Prediction in Human Oral Tongue Squamous Cell Carcinoma Using a Cancer-Testis Antigen Genes Signature
2025-Sep-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26189258
PMID:41009820
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于癌-睾丸抗原基因特征的诊断工具,用于预测口腔舌鳞状细胞癌的淋巴结转移 | 首次整合多组学数据识别与口腔舌癌淋巴结转移相关的癌-睾丸抗原基因特征,并验证其预测价值 | 样本量较小(16例患者),需要更大规模研究验证 | 开发能够准确预测口腔舌鳞状细胞癌淋巴结转移的基因诊断工具 | 口腔舌鳞状细胞癌患者 | 数字病理 | 口腔癌 | 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、NanoString nCounter RNA分析 | 决策树、t-SNE、CNN | 基因表达数据 | 16例接受舌切除术和选择性颈清扫术的患者 | NanoString | 基因表达分析 | nCounter | NanoString nCounter RNA分析系统 |
| 360 | 2025-10-06 |
Investigating the Development of Colorectal Cancer Based on Spatial Transcriptomics
2025-Sep-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26189256
PMID:41009818
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探索结直肠癌发展的时空动态特征 | 首次结合小鼠模型和人类TCGA数据,通过空间转录组学解析结直肠癌发展的时空异质性,发现新的潜在生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证相对有限 | 探究结直肠癌发展的时空动态特征和分子机制 | 小鼠肠道肿瘤组织和人类结直肠癌患者数据 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学(ST)、TCGA数据库分析 | 整合降维分析、伪时间轨迹分析 | 空间转录组数据、基因表达数据 | 小鼠多时间点肿瘤样本和TCGA人类结直肠癌队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |