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当前共找到 792 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-05 |
Inferring Personalized Cell-Cell Communication Networks in Colorectal Cancer with Individualized Causal Discovery
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.20.677543
PMID:41040408
|
研究论文 | 开发了一个整合计算框架，用于推断结直肠癌中个性化的细胞间通讯网络 | 结合嵌套层次狄利克雷过程模型和实例特异性贪婪快速因果推断方法，首次实现了患者特异性的细胞间通讯网络推断 | 方法依赖于单细胞RNA测序数据的质量和完整性，因果推断结果需要进一步实验验证 | 解决肿瘤异质性背景下个性化细胞间通讯网络推断的计算挑战 | 结直肠癌患者的单细胞和批量RNA测序数据 | 计算生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 嵌套层次狄利克雷过程模型，贪婪快速因果推断 | 基因表达数据，生存数据 | 超过625,000个细胞的大规模单细胞RNA测序数据，TCGA批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2025-10-05 |
Network dynamics underlying activity-timescale differences between cortical regions
2025-Sep-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.19.677442
PMID:41000864
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研究论文 | 本研究通过整合功能成像和空间转录组学数据，揭示了小鼠大脑皮层不同区域活动时间尺度的网络动力学差异 | 首次将功能成像与空间转录组学数据共同配准，并利用双光子成像和光遗传学技术比较了不同时间尺度皮层区域的网络响应特性 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果是否适用于其他物种尚需验证 | 探究大脑皮层不同区域网络动力学的差异及其机制 | 小鼠大脑皮层，特别是短时间尺度的视觉区域VISp和长时间尺度的前额叶区域MOs | 神经科学 | NA | 双光子成像，光遗传学，空间转录组学 | NA | 图像，转录组数据 | 小鼠大脑皮层样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 323 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic analyses provide insights into SPP1+ TAM-mediated immune suppression and CD8+ T cell dysfunction in lung cancer
2025-Sep-29, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04180-3
PMID:41021043
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过A2AR信号通路介导CD8+ T细胞功能失调的免疫抑制机制 | 首次系统比较原发性和脑转移性肺癌中SPP1+ TAM与CD8+ T细胞的相互作用，并证实抗SPP1治疗可逆转T细胞耗竭 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究SPP1+肿瘤相关巨噬细胞在肺癌免疫抑制中的作用机制 | 肺癌原发灶和脑转移灶中的免疫细胞，特别是SPP1+ TAM和CD8+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光，qPCR，Western blot，共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，免疫荧光图像 | 肺癌原发和脑转移组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 324 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of ILF2 reveals its prognostic value and functional roles across pan-cancer
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03609-6
PMID:41021104
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研究论文 | 通过多组学分析揭示ILF2在泛癌中的预后价值和功能作用 | 首次对ILF2进行系统性泛癌分析，涵盖表达模式、预后意义、遗传变异、免疫浸润和治疗反应等多个维度 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证功能机制 | 阐明ILF2在泛癌中的生物学功能和临床意义 | 多种癌症类型和ILF2基因 | 生物信息学 | 泛癌分析（特别关注肝细胞癌） | 多组学分析，单细胞RNA测序 | 生物信息学分析模型 | 基因组数据，转录组数据，临床数据 | 多种癌症类型的多组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 325 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals NFATc1-mediated regulatory mechanisms of vascular smooth muscle cell osteogenic transformation in the osteosarcoma microenvironment
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03606-9
PMID:41021149
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化的NFATc1介导的调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示NFATc1在骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化中的分布特征和共表达网络 | 需要功能扰动实验来建立因果关系 | 研究骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化的调控机制 | 新鲜骨肉瘤组织中的血管平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | k-近邻/Louvain聚类 | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, NovaSeq 6000 | 10x Chromium Single Cell 3' v3试剂 |
| 326 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing data establishes a cuproptosis-related gene predictive signature in breast cancer
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03525-9
PMID:41021161
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，建立了乳腺癌中铜死亡相关基因的预测特征 | 首次系统评估铜死亡相关基因在乳腺癌中的预后意义，并构建了基于四个关键基因的预后特征模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 建立乳腺癌铜死亡相关基因的预后预测模型 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 预后特征模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO队列的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 327 | 2025-10-05 |
Identification of prognostic biomarkers associated with T and melanoma cell subpopulations in melanoma through integrating machine learning and multiomics
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03701-x
PMID:41021162
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和多组学数据，识别了与黑色素瘤预后相关的T细胞和黑色素瘤细胞亚群，并构建了新型预后风险评分模型 | 首次鉴定出MITF+T细胞和M2细胞亚群与黑色素瘤预后的关联，并采用72种机器学习算法组合开发共识预后模型 | NA | 识别黑色素瘤预后相关的细胞亚群并构建预后预测模型 | 黑色素瘤患者和相关的细胞亚群 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | 预后风险评分模型, 机器学习算法组合 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的多个数据集(GSE200218, GSE215121, GSE65904)和TCGA-SKCM数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因表达分析 | NA | NA |
| 328 | 2025-10-05 |
Cell division cycle 25 C (CDC25C) mediates cell-cycle progression and immune evasion in glioma
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03596-8
PMID:41021167
|
研究论文 | 本研究探讨CDC25C在胶质瘤细胞周期进展和免疫逃逸中的关键作用 | 首次系统揭示CDC25C通过调控CDK1-Cyclin B1轴促进胶质瘤细胞增殖并与免疫抑制微环境形成关联 | 研究主要基于细胞系实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 阐明CDC25C在胶质瘤进展和免疫逃逸中的分子机制 | 胶质瘤患者样本和U87MG胶质瘤细胞系 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | RNA测序, siRNA干扰, EdU染色, 流式细胞术, Western blot | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 多个公共数据库(TCGA, CGGA, GEO)的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 329 | 2025-10-05 |
Deciphering key chemotherapeutic drug targets within tyrosine metabolism for breast cancer and advancing a wide-ranging diagnostic strategy
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03577-x
PMID:41021173
|
研究论文 | 本研究通过整合分析乳腺癌转录组数据，探索酪氨酸代谢在乳腺癌中的作用及其与化疗反应的关系 | 开发了酪氨酸代谢共表达预后模型，其性能优于传统临床指标，并识别出MAOA和MAOB两个关键基因作为连接免疫治疗和化疗的重要潜在生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索酪氨酸代谢在乳腺癌早期诊断和治疗中的作用机制 | 乳腺癌患者转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组分析，单细胞RNA测序，分子对接 | 机器学习算法Extra Trees (BO) | 转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 330 | 2025-10-05 |
FGL1-mediated lymph node metastasis in stage T1 non-small cell lung cancer: therapeutic targeting
2025-Sep-29, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00709-5
PMID:41024301
|
研究论文 | 本研究揭示了FGL1在T1期非小细胞肺癌纵隔淋巴结转移中的关键作用机制 | 首次发现FGL1+细胞亚群介导T1期NSCLC的N2淋巴结转移，并验证了靶向FGL1的新型基因治疗方法 | 研究机制尚未完全阐明，临床转化需要进一步验证 | 探究T1期非小细胞肺癌纵隔淋巴结转移的分子机制并开发靶向治疗策略 | T1期非小细胞肺癌患者样本和细胞模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞测序,转录组测序,代谢组测序,质谱分析 | NA | 单细胞数据,转录组数据,代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 331 | 2025-10-05 |
High Treg and PMN-MDSC densities are a hallmark of tertiary lymphoid structures in fatal cases of cervical cancer
2025-Sep-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012613
PMID:40998518
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研究论文 | 本研究通过分析三级淋巴结构在宫颈癌和头颈鳞癌中的密度、组成及预后影响，揭示其在HPV相关癌症中的免疫调节作用差异 | 首次发现宫颈癌中三级淋巴结构的高Treg和PMN-MDSC浸润与患者不良预后相关，不同于头颈鳞癌中三级淋巴结构密度与良好预后的正相关 | 样本来源限于HPV相关癌症，未涵盖其他癌症类型；空间转录组学分析范围有限 | 探究三级淋巴结构在HPV诱导的宫颈癌和头颈鳞癌中对抗肿瘤免疫的塑造作用及预后影响 | 宫颈癌和头颈鳞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 多重免疫荧光、免疫组织化学、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 组织切片图像、空间转录组数据、流式细胞数据 | 宫颈癌和头颈鳞癌患者组织样本（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 332 | 2025-10-05 |
Decoding the Tumor Microenvironment: Insights and New Targets from Single-Cell Sequencing and Spatial Transcriptomics
2025-Sep-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090730
PMID:41020852
|
综述 | 本文探讨单细胞测序和空间转录组学技术在解析肿瘤微环境中的应用与进展 | 整合单细胞测序与空间转录组学技术，在单细胞分辨率下揭示肿瘤微环境的异质性和空间动态 | NA | 探索肿瘤微环境的分子机制并发现新的治疗靶点 | 肿瘤微环境中的细胞组成和空间结构 | 数字病理 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 333 | 2025-10-05 |
After the bite: cellular responses to mosquito blood feeding
2025-Sep, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2025.07.018
PMID:40803965
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析埃及伊蚊吸血后中肠和脂肪体组织的细胞反应 | 首次在单细胞水平系统表征蚊子吸血后不同组织的转录组和代谢组响应，揭示了新型细胞类型和昆虫特异性病毒感染动态 | NA | 研究蚊子吸血后的细胞响应机制 | 埃及伊蚊的中肠和脂肪体组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 334 | 2025-10-05 |
Plant metabolism: Zoom in to the single-cell level
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf375
PMID:40889291
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在植物代谢研究中的应用进展 | 整合单细胞转录组学与多组学技术揭示植物代谢产物的细胞类型特异性积累模式 | NA | 探索植物代谢产物在细胞水平上的积累规律及其调控机制 | 模式植物和药用植物 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像, 单细胞转录组学, 多组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 335 | 2025-10-05 |
PD-L1(+) tumor-associated macrophages induce CD8(+) T Cell exhaustion in hepatocellular carcinoma
2025-Sep-29, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101234
PMID:41027276
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、空间分析和功能实验，揭示了PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌中诱导CD8阳性T细胞耗竭的关键作用 | 首次系统阐明PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞通过GM-CSF诱导途径促进CD8阳性T细胞耗竭的具体机制，并证明抗GM-CSF与抗PD-L1联合治疗的协同效应 | 研究样本量相对有限，主要基于手术标本，缺乏更大规模的前瞻性验证 | 阐明PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌免疫抑制微环境中的具体功能和机制 | 肝细胞癌患者肿瘤样本、体外培养的巨噬细胞和CD8阳性T细胞、小鼠原位肝癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光染色、体外功能实验、体内治疗模型 | 小鼠原位肝癌模型 | 单细胞转录组数据、空间分布数据、免疫荧光图像 | 113例肝细胞癌患者手术标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 336 | 2025-10-05 |
SPP1-mediated crosstalk between macrophage and fibroblasts promotes benign airway stenosis
2025-Sep-26, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110627
PMID:41015147
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研究论文 | 本研究通过大鼠模型和体外共培养系统揭示了M2巨噬细胞通过SPP1介导的信号通路促进良性气道狭窄的纤维化机制 | 首次系统阐明M2巨噬细胞通过SPP1-PI3K/AKT/mTOR信号轴驱动成纤维细胞活化在良性气道狭窄中的作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 阐明M2巨噬细胞在良性气道狭窄发病机制中的作用 | SD大鼠模型、人肉芽组织来源的成纤维细胞、正常气道组织成纤维细胞 | 病理生物学 | 良性气道狭窄 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、体外共培养 | 动物疾病模型、细胞共培养系统 | 基因表达数据、组织病理数据 | SD大鼠分为5个实验组（正常对照和建模后第1、4、7、14天） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 337 | 2025-10-05 |
Comprehensive Immune Subtyping and Multi-Omics Profiling of the Tumor Microenvironment in Colorectal Cancer: Implications for Prognosis and Personalized Immunotherapy
2025-Sep-26, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
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研究论文 | 通过多组学分析对结直肠癌肿瘤微环境进行免疫分型，并开发预后模型和探索微生物多样性作用 | 首次整合TME免疫分型、风险建模、单细胞分析和微生物组分析，揭示微生物多样性对免疫治疗反应的影响 | 需要外部数据集验证，样本量有限 | 识别结直肠癌免疫亚型，开发预后模型，探索微生物多样性在肿瘤进展中的作用 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，微生物组分析，免疫组织化学，qPCR | 非负矩阵分解，Cox回归，LASSO回归 | 多组学数据，单细胞RNA测序数据，微生物组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序，微生物组分析 | NA | NA |
| 338 | 2025-10-05 |
Integrated spatial transcriptomic profiling to dissect the cellular characteristics of tumor-associated tertiary lymphoid structures
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116250
PMID:40934085
|
研究论文 | 通过整合23种癌症的空间转录组数据构建泛癌TA-TLS图谱，解析肿瘤相关三级淋巴结构的细胞特征 | 首次构建泛癌TA-TLS图谱，发现成熟TLS中IgG+浆细胞优先富集，鉴定CCL19+血管周细胞作为淋巴组织组织细胞，揭示动脉内皮细胞通过Notch信号抑制获得高内皮静脉样表型 | 研究主要基于空间转录组数据分析，需要进一步实验验证机制 | 解析肿瘤相关三级淋巴结构的细胞特征和形成机制 | 23种癌症的肿瘤相关三级淋巴结构 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 23种癌症 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 339 | 2025-10-05 |
SPACE: Spatially variable gene clustering adjusting for cell type effect for improved spatial domain detection
2025-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf936
PMID:40985765
|
研究论文 | 提出SPACE框架，通过调整细胞类型混杂效应来基于空间模式对空间可变基因进行聚类，以改进空间域检测 | 无需基因簇数量、空间模式或细胞类型信息的先验知识，通过分组SVG并获取每组低维嵌入来保留特定模式、减少信号混合 | 未在摘要中明确说明 | 改进空间转录组分析中的空间域检测 | 空间可变基因(SVGs) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 340 | 2025-10-05 |
Constructing Gene Regulatory Network using Chatterjee's Rank Correlation with Single-cell Transcriptomic Data
2025-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.676530
PMID:41000795
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研究论文 | 提出基于Chatterjee秩相关系数的单细胞转录组基因调控网络构建方法 | 使用非参数依赖度量Chatterjee秩相关系数，开发了数据驱动的检验阈值估计算法，并提出定向调控的新检验方法 | 未明确说明方法在特定生物场景下的适用性限制 | 从单细胞RNA测序数据中发现基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数统计模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |