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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-05 | FemXpress: Systematic Analysis of X Chromosome Inactivation Heterogeneity in Female Single-Cell RNA-Seq Samples 
          2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202504754
          PMID:40583143
         | 研究论文 | 介绍了一种名为FemXpress的计算工具,用于分析女性单细胞RNA测序数据中的X染色体失活异质性 | 开发了首个不依赖亲本基因组信息即可基于X连锁SNPs对单细胞进行X染色体失活起源分类的计算工具 | NA | 开发分析女性单细胞RNA测序数据中X染色体失活异质性的计算方法 | 女性单细胞RNA测序样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织的食蟹猴单细胞RNA测序数据,以及胚胎和结肠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 302 | 2025-10-05 | Tracing and Capturing the Epiblast Pluripotency of Sheep Preimplantation Embryos 
          2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202417764
          PMID:40586282
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了绵羊植入前胚胎中上胚层多能性的变化,并成功建立了绵羊形成性和定型多能干细胞 | 首次在绵羊中建立了能够长期传代的形成性和定型多能干细胞,并揭示了物种间早期胚胎发育的保守性和差异性 | 研究主要聚焦于绵羊模型,跨物种比较的深度和广度有待进一步扩展 | 研究绵羊植入前胚胎上胚层多能性的变化规律及其调控机制 | 绵羊植入前胚胎(E1-E14天)及衍生的多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 绵羊胚胎E1至E14天发育时间点的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 303 | 2025-10-05 | Integrated Transcriptome and Metabolomics Analyses Show MYC as a Potential Therapeutic Target for Behçet's Uveitis 
          2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202417843
          PMID:40586758
         | 研究论文 | 本研究通过整合转录组和代谢组学分析,揭示MYC作为贝赫切特葡萄膜炎潜在治疗靶点 | 首次结合非靶向代谢组学和单细胞RNA测序技术,发现MYC通过调控糖酵解促进效应T细胞异常反应的新机制 | 研究样本量有限,主要基于实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型,需要更多临床验证 | 探索贝赫切特葡萄膜炎的疾病特异性代谢改变及其治疗靶点 | 贝赫切特葡萄膜炎患者、健康对照者和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 非靶向代谢组学,单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据,单细胞转录组数据 | 贝赫切特葡萄膜炎患者和健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学 | NA | NA | 
| 304 | 2025-10-05 | Choroid Plexus Fibroblast-ILC2 Niche Promotes Adult Hippocampal Neurogenesis after Traumatic Brain Injury 
          2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202415984
          PMID:40605604
         | 研究论文 | 本研究揭示创伤性脑损伤后脉络丛中ILC2细胞的积累及其通过调节免疫微环境和促进海马神经发生改善神经功能的机制 | 首次发现脉络丛成纤维细胞与ILC2形成的生态位在创伤性脑损伤后促进海马神经发生的作用机制 | NA | 探究创伤性脑损伤后脉络丛结构变化和免疫细胞浸润特征及其对神经修复的影响 | 创伤性脑损伤小鼠模型中的脉络丛组织和海马组织 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,组织学分析 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA | 
| 305 | 2025-10-05 | Roadmap for spatial transcriptomics of HIV in tissues 
          2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
          
          IF:4.5Q1
          
         
          DOI:10.1097/COH.0000000000000961
          PMID:40626838
         | 综述 | 本文概述了空间转录组学在HIV组织研究中的应用路线图,包括平台选择、工作流程和生物信息学分析 | 提出了HIV组织持久性研究的空间转录组学路线图,整合了多种空间分析技术 | 目标RNA捕获中目标数量增加会降低灵敏度,分析需要确保严谨性并验证发现 | 探索HIV在组织中的持久性机制并为治疗策略提供信息 | HIV感染细胞及其周围组织微环境 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学, ATAC-seq, T细胞受体测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA | 
| 306 | 2025-10-05 | The Evolutionary Trajectory and Prognostic Value of GITR+ Tregs Reprogramed by Tumor-Intrinsic PD-1/c-MET Signaling in Pancreatic Cancer 
          2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202500806
          PMID:40673866
         | 研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中肿瘤内在PD-1/c-MET信号通路通过驱动GITR⁺ Tregs的积累促进免疫逃逸的机制 | 首次发现MET信号通路选择性驱动具有强免疫抑制功能的GITR⁺ Tregs亚群积累,并阐明MET-IL-23-STAT4轴在其中的关键作用 | 研究主要基于胰腺导管腺癌模型,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤内在PD-1/c-MET信号通路的免疫调节作用及其在胰腺癌免疫逃逸中的机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的免疫细胞,特别是GITR⁺调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,原位肿瘤模型 | NA | 基因表达数据,免疫组化数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 307 | 2025-10-05 | Enhanced Media Optimize Bovine Myogenesis in 2D and 3D Models for Cultivated Meat Applications 
          2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202413998
          PMID:40720723
         | 研究论文 | 本研究通过多组学分析开发了增强牛肌源性祖细胞分化的培养基,优化了培养肉的2D和3D肌肉模型 | 首次通过多组学方法系统表征牛肌源性祖细胞分化分子图谱,并开发出能同时促进肌细胞分化和维持祖细胞特性的增强培养基 | 研究主要聚焦于体外模型,需要进一步验证在规模化培养肉生产中的适用性 | 优化培养肉生产技术,提高肌肉细胞分化效率 | 牛肌源性祖细胞(MPCs) | 组织工程 | NA | 多组学分析、单细胞转录组学、蛋白质组学 | 2D培养模型、3D骨骼肌构建体 | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq、蛋白质组学 | NA | NA | 
| 308 | 2025-10-05 | Neuro-immuno-stromal context in colorectal cancer: An enteric glial cell-driven prognostic model via machine learning predicts survival, recurrence, and therapy response 
          2025-Sep-01, Experimental cell research
          
          IF:3.3Q2
          
         
          DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114733
          PMID:40914542
         | 研究论文 | 基于肠胶质细胞相关基因构建机器学习预后模型,用于预测结直肠癌患者的生存、复发和治疗反应 | 首次整合肠胶质细胞和结直肠癌相关基因表达,通过机器学习构建预后模型,揭示神经-免疫-基质微环境在结直肠癌中的作用 | 需要进一步验证模型的临床适用性 | 开发并验证结直肠癌预后预测模型 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA测序 | RSF随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA | 
| 309 | 2025-10-05 | Role of Tunneling Nanotubes in Arachidonic Acid Transfer and Macrophage Function Reprogramming in Intrahepatic Cholangiocarcinoma 
          2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202500148
          PMID:40552574
         | 研究论文 | 本研究揭示隧道纳米管通过转移花生四烯酸重编程肿瘤相关巨噬细胞功能促进肝内胆管癌进展的机制 | 首次发现隧道纳米管是肿瘤源性脂肪酸转移的主要途径,并阐明花生四烯酸通过PI3K-AKT通路驱动巨噬细胞表型重编程 | 研究主要基于异种移植模型,需要在人类原代样本中进一步验证 | 探究隧道纳米管在肿瘤微环境中巨噬细胞功能重编程中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和肝内胆管癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 脂质组学, 代谢组学, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 脂质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 310 | 2025-10-05 | Maximizing Efficacy of Cancer Nanovaccines and Immune Cells Landscape in Responders and Non-Responders to Immunotherapy 
          2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202416756
          PMID:40574416
         | 研究论文 | 本研究通过优化癌症纳米疫苗尺寸并分析免疫细胞图谱,开发出能治愈大多数荷瘤小鼠的癌症疫苗 | 确定了纳米/微米疫苗的最佳尺寸(≤400 nm和2.5 µm),并首次系统描绘了免疫治疗应答者与非应答者的免疫细胞图谱 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果需进一步验证 | 最大化癌症疫苗疗效并揭示免疫治疗应答机制 | 荷瘤小鼠(黑色素瘤、肺癌、胰腺癌、黑色素瘤肺转移模型)及癌症患者 | 免疫治疗 | 黑色素瘤、肺癌、胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 21个样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA | 
| 311 | 2025-10-05 | Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Reveals Immune Microenvironment Remodelling in Lymph Node Metastasis of Lung Adenocarcinoma 
          2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
          
          IF:4.3Q2
          
         
          DOI:10.1111/jcmm.70859
          PMID:40988131
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习分析揭示了肺腺癌淋巴结转移中的免疫微环境重塑 | 整合单细胞测序与多组学特征开发了LNRScore风险预测模型,并鉴定HMGA1作为核心基因在转移进展中的作用 | 研究样本量有限,需要更大规模验证 | 探究肺腺癌淋巴结转移对肿瘤微环境的影响并开发风险预测模型 | 转移性和非转移性淋巴结组织 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | 集成机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据,多组学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 312 | 2025-10-05 | Integrative Multi-Omics Features Stratify Metabolic and Immune Subtypes in Glioma 
          2025-Sep, JCO precision oncology
          
          IF:5.3Q1
          
         
          DOI:10.1200/PO-24-00928
          PMID:41004701
         | 研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和MRI影像组学特征,对胶质瘤的代谢和免疫亚型进行分层分类 | 首次开发了基于代谢-免疫特征的胶质瘤分类器,并结合单细胞RNA测序和空间转录组验证亚型特征 | 样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的泛化能力 | 改进胶质瘤分类方法,实现更精准的个性化治疗策略 | 胶质瘤患者 | 数字病理 | 胶质瘤 | 转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组测序,MRI影像组学 | 机器学习算法 | 基因组数据,影像数据,转录组数据 | 1,720例胶质瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,转录组测序 | NA | NA | 
| 313 | 2025-10-05 | Immunoregulatory Roles of Tumor-Originated Pericytes Identified by Single-Cell Analysis in Glioblastoma 
          2025-Sep-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202511856
          PMID:41001759
         | 研究论文 | 通过单细胞分析鉴定胶质母细胞瘤中肿瘤源性周细胞的免疫调节作用 | 首次在胶质母细胞瘤中区分肿瘤源性周细胞和正常源性周细胞,并发现CD44+周细胞亚群通过促进肿瘤相关巨噬细胞M2极化调控肿瘤生长 | 样本来源仅限于人类原发胶质母细胞瘤,需要进一步验证在其他肿瘤类型中的普适性 | 探究胶质母细胞瘤中周细胞的起源和功能异质性及其免疫调节作用 | 人类原发胶质母细胞瘤中的CD146+周细胞 | 单细胞分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据 | 人类原发胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 314 | 2025-10-05 | Time-Series Transcriptomics Identifies Xanthine Dehydrogenase in Injured Neurons Correlated With Orthodontic Pain 
          2025-Sep-26, Orthodontics & craniofacial research
          
          IF:2.4Q2
          
         
          DOI:10.1111/ocr.70036
          PMID:41002069
         | 研究论文 | 本研究通过时间序列转录组学分析发现黄嘌呤脱氢酶(Xdh)在正畸疼痛损伤神经元中高表达 | 首次将时间序列转录组学与单细胞RNA-seq数据整合,识别出Atf3+损伤神经元中Xdh的上调与疼痛峰值相关 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索正畸牙齿移动疼痛的分子和细胞机制 | 小鼠三叉神经节组织和神经元 | 转录组学 | 疼痛疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | 小鼠三叉神经节组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 315 | 2025-10-05 | Increased AIF-1-mediated p38 MAPK phosphorylation in the mid-secretory endometrium impairs endometrial receptivity in women with recurrent implantation failure 
          2025-Sep-26, Human reproduction (Oxford, England)
          
         
          DOI:10.1093/humrep/deaf174
          PMID:41003697
         | 研究论文 | 本研究探讨了同种异体移植炎症因子-1(AIF-1)通过p38 MAPK磷酸化途径损害复发性种植失败患者子宫内膜容受性的机制 | 首次揭示AIF-1在子宫内膜基质细胞中通过p38 MAPK磷酸化途径抑制细胞增殖和蜕膜化,从而降低子宫内膜容受性的具体分子机制 | AIF-1在子宫内膜巨噬细胞中对胚胎植入的作用尚不明确 | 探究AIF-1对复发性种植失败患者子宫内膜容受性的影响机制 | 复发性种植失败患者和生育能力正常女性的子宫内膜组织、人子宫内膜基质细胞、子宫内膜基质细胞系、CD-1小鼠 | 生殖医学 | 复发性种植失败 | 单细胞RNA测序,定量PCR,蛋白质印迹,免疫组织化学,免疫荧光,RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 | 18例RIF患者,18例对照组患者,30例不同月经周期阶段的额外对照组患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 316 | 2025-10-05 | Change in brain molecular landscapes following electrical stimulation of the nucleus accumbens 
          2025-Sep-25, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
          
          IF:6.6Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41386-025-02241-w
          PMID:40999234
         | 研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究伏隔核深部脑刺激对小鼠大脑分子景观的影响 | 首次使用高分辨率空间转录组学技术(Stereo-seq)在全脑范围内系统分析NAc DBS诱导的基因表达变化 | 研究仅在小鼠模型中进行,需要进一步在人类中验证;刺激参数固定,未探索不同参数的影响 | 阐明伏隔核深部脑刺激治疗神经精神疾病的分子机制 | 接受伏隔核电刺激的小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 神经精神疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 随机分配接受电刺激或假处理的小鼠 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | 高分辨率空间转录组学技术 | 
| 317 | 2025-10-05 | MAN1A1 promotes colorectal cancer liver metastasis by maintaining TGFBR2 protein stability 
          2025-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
          
          IF:3.3Q1
          
         
          DOI:10.3724/abbs.2025164
          PMID:40999906
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现MAN1A1通过维持TGFBR2蛋白稳定性促进结直肠癌肝转移 | 首次揭示MAN1A1通过延长TGFBR2蛋白半衰期促进结直肠癌肝转移的分子机制 | 未详细说明MAN1A1调控TGFBR2蛋白稳定性的具体分子通路 | 探究结直肠癌肝转移的分子机制及潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞及肝转移组织 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, Transwell实验, 基因操作 | NA | 基因表达数据, 蛋白质稳定性数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 318 | 2025-10-05 | Single-cell transcriptomics reveals apolipoprotein A4-mediated metabolic-immune reprogramming in lymphocytes during early obesity-related chronic kidney disease 
          2025-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
          
          IF:3.3Q1
          
         
          DOI:10.3724/abbs.2025171
          PMID:40999903
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了载脂蛋白A4在肥胖相关慢性肾病早期淋巴细胞代谢-免疫重编程中的关键调控作用 | 首次发现Apoa4通过调节淋巴细胞代谢和免疫功能在肥胖相关慢性肾病早期发挥保护作用,揭示了肾脏免疫代谢景观的重塑机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;机制研究仍需进一步深入 | 探究Apoa4在肥胖诱导的慢性肾病早期免疫细胞代谢和功能调控中的作用 | 野生型和Apoa4敲除小鼠的肾脏淋巴细胞 | 单细胞生物学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光染色,qPCR | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,基因表达数据 | 野生型和Apoa4敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 319 | 2025-10-05 | Single-cell RNA sequencing across diverse cell types to identify PFOA-induced ovarian cellular senescence 
          2025-Sep-24, Ecotoxicology and environmental safety
          
          IF:6.2Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119089
          PMID:40997563
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究PFOA暴露诱导卵巢细胞衰老的机制 | 首次从细胞衰老角度揭示PFOA卵巢毒性的单细胞水平机制,发现卵丘细胞对PFOA诱导的耗竭特别敏感 | 研究仅使用小鼠模型,样本量相对有限 | 探究PFOA暴露导致卵巢功能障碍的细胞机制 | 雌性ICR小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29,000+个细胞,8个不同细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 320 | 2025-10-05 | TRIB3 promotes endometrial cancer progression through interacting with E2F1 and enhancing PKM2-mediated tumor glycolysis 
          2025-Sep-24, Gynecologic oncology
          
          IF:4.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.ygyno.2025.09.008
          PMID:40997650
         | 研究论文 | 本研究探讨了TRIB3通过稳定E2F1和增强PKM2转录促进子宫内膜癌进展的机制 | 首次揭示TRIB3通过E2F1-PKM2轴促进子宫内膜癌糖酵解的新机制,并发现吲达帕胺可作为TRIB3抑制剂 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索TRIB3在子宫内膜癌中的作用机制 | 子宫内膜癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,qRT-PCR,Western blot,共免疫沉淀,双荧光素酶报告基因,免疫荧光双染色,泛素化分析,染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,临床数据 | 人类子宫内膜癌组织及癌旁组织,异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |