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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-10-05 | Loss of RPL22 Expression Identifies a Transcriptional Subset of MLH1 Deficient Endometrial Cancers with Lower Numbers of Tumor-Associated Lymphocytes 
          2025-Sep-24, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
          
          IF:7.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.modpat.2025.100899
          PMID:41005533
         | 研究论文 | 本研究通过免疫组化和空间转录组学技术,发现RPL22表达缺失可识别MLH1缺陷型子宫内膜癌中免疫活性较低的亚型 | 首次证明RPL22缺失可作为MLH1缺陷型子宫内膜癌中免疫低活性亚型的生物标志物 | 未发现RPL22表达与肿瘤突变负荷或PD-L1表达相关 | 探索RPL22突变在MSI-high子宫内膜癌中的临床意义 | 子宫内膜癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 免疫组化, 数字空间转录组学, 基因敲低 | NA | 图像, 转录组数据 | 子宫内膜癌队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 282 | 2025-10-05 | Lipid-laden macrophages in atherosclerosis and cancer 
          2025-Sep-24, Seminars in cancer biology
          
          IF:12.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.semcancer.2025.09.007
          PMID:41005549
         | 综述 | 探讨脂质负载巨噬细胞在动脉粥样硬化和癌症中的双重作用及其分子机制 | 系统比较了脂质负载巨噬细胞在不同疾病环境中的共同和独特功能特征 | NA | 阐明脂质负载巨噬细胞在炎症、动脉粥样硬化和癌症中的生物学作用 | 脂质负载巨噬细胞 | NA | 动脉粥样硬化,癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 283 | 2025-10-05 | Integrating multi-omic Mendelian randomization, microarray, single-cell RNA sequencing, and spatial RNA sequencing to identify potential therapeutic targets for vitiligo 
          2025-Sep-24, The Journal of investigative dermatology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.jid.2025.09.015
          PMID:41005615
         | 研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化分析结合单细胞和空间转录组测序,鉴定CTSS作为白癜风潜在治疗靶点 | 首次整合多组学孟德尔随机化、微阵列、单细胞RNA测序和空间RNA测序技术系统研究白癜风发病机制 | NA | 鉴定白癜风潜在治疗靶点 | 白癜风患者黑色素细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 白癜风 | 多组学孟德尔随机化, 微阵列, 单细胞RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 4,479个可药物化基因的QTL数据结合GWAS数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA | 
| 284 | 2025-10-05 | MMP13- and COL11A1-expressing cancer-associated fibroblasts: key drivers of esophageal squamous cell carcinoma progression and prognostic indicators 
          2025-Sep-24, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
          
         
          DOI:10.1016/j.labinv.2025.104247
          PMID:41005711
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了食管鳞状细胞癌中三种癌症相关成纤维细胞亚型,并发现其中MMP13和COL11A1两种亚型是疾病进展的关键驱动因素和预后指标 | 首次报道了癌症相关成纤维细胞与食管鳞状细胞癌病理分期进展的关联,并识别了三种具有不同特性的癌症相关成纤维细胞亚型 | 研究主要关注晚期食管鳞状细胞癌患者,未涵盖早期阶段;样本量相对有限 | 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其预后价值 | 食管鳞状细胞癌患者的手术切除标本 | 单细胞测序分析 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, RNA原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织标本 | 晚期食管鳞状细胞癌患者手术切除标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 285 | 2025-10-05 | Human brain cell types shape host-rabies virus transcriptional interactions revealing a preexisting pro-viral astrocyte subpopulation 
          2025-Sep-23, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.celrep.2025.116159
          PMID:40864551
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究狂犬病毒与人类脑细胞共培养中的宿主-病毒转录相互作用 | 发现存在预先存在的促病毒星形胶质细胞亚群,且解除天然免疫抑制反而增强狂犬病毒转录 | 使用体外共培养模型,可能与体内真实情况存在差异 | 研究病毒-宿主细胞相互作用和天然免疫拮抗如何影响神经嗜性病毒感染动态 | 人类脑细胞共培养体系 | 单细胞基因组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类脑细胞共培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 286 | 2025-10-05 | Next-gen tools in cancer neuroscience 
          2025-Sep-23, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.celrep.2025.116258
          PMID:40934086
         | 综述 | 本文综述了推动癌症神经科学领域发展的新一代技术工具 | 整合了单细胞转录组学、空间转录组学、光遗传学、化学遗传学等多种前沿技术来研究神经系统与癌症的相互作用 | NA | 探讨连接肿瘤学与神经科学的关键技术 | 神经系统与癌症相互作用的组成部分 | 癌症神经科学 | 癌症 | 单细胞转录组学,空间转录组学,光遗传学,化学遗传学,工程病毒,神经元活动可视化 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA | 
| 287 | 2025-10-05 | Innate Immune-Cloaked Microgel-Coated Mesenchymal Stromal Cells Reverse Persistent Pulmonary Fibrosis via Reparative Macrophages 
          2025-Sep-23, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
          
         
          DOI:10.1002/adma.202504590
          PMID:40984773
         | 研究论文 | 本研究开发了一种先天免疫伪装微凝胶包被的间充质基质细胞,通过修复性巨噬细胞逆转持续性肺纤维化 | 首次将先天免疫检查点材料策略与微凝胶包被技术结合,使治疗细胞能逃逸组织驻留巨噬细胞的清除 | NA | 开发治疗复杂慢性疾病(如纤维化)的新型细胞治疗策略 | 间充质基质细胞、组织驻留巨噬细胞、肺纤维化模型 | 细胞治疗 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 288 | 2025-10-05 | Tertiary lymphoid structures in Merkel cell carcinoma facilitate naïve and central memory T-cell infiltration linked to immunotherapy response 
          2025-Sep-23, Journal for immunotherapy of cancer
          
          IF:10.3Q1
          
         
          DOI:10.1136/jitc-2025-012224
          PMID:40992783
         | 研究论文 | 本研究探讨默克尔细胞癌中三级淋巴结构对T细胞浸润和免疫治疗反应的影响机制 | 首次系统揭示三级淋巴结构通过高内皮小静脉促进初始和中央记忆T细胞浸润的详细机制,并发现TCR克隆多样性与病毒抗原反应性的关联 | 样本量较小(27例患者),部分分析仅在选定病例中进行空间转录组学 | 阐明三级淋巴结构在默克尔细胞癌免疫微环境中的作用机制 | 27例默克尔细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 默克尔细胞癌 | 转录组分析、多重免疫可视化分析、T细胞受体克隆分型、空间转录组学 | 加权基因共表达网络分析 | RNA测序数据、免疫组织化学数据、空间转录组数据 | 27例默克尔细胞癌患者 | NA | 空间转录组学、RNA测序、V(D)J测序 | NA | NA | 
| 289 | 2025-10-05 | Spatial regulation of CD8+ T cells at the HLA-E-NKG2A axis drives HIV persistence in lymph node B cell follicles 
          2025-Sep-23, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.celrep.2025.116181
          PMID:40849901
         | 研究论文 | 本研究通过空间转录组学和高维组织细胞计量技术揭示了HIV在淋巴结B细胞滤泡中持续存在的免疫调控机制 | 首次发现HLA-E-NKG2A轴在调节滤泡CD8+T细胞功能中的关键作用,揭示了HIV免疫逃避的新机制 | 研究样本仅限于HIV感染者,缺乏健康对照组比较 | 探究淋巴结B细胞滤泡中HIV持续存在的免疫调控机制 | HIV感染者的淋巴结组织样本 | 数字病理学 | HIV感染 | 空间转录组学,高维组织细胞计量,荧光激活细胞分选 | NA | 空间转录组数据,组织图像,流式细胞数据 | 不同抗逆转录病毒治疗阶段的HIV感染者淋巴结样本 | NA | 空间转录组学,单细胞分析 | NA | NA | 
| 290 | 2025-10-05 | Distinct roles for NF-κB in hematopoietic stem cells and the bone marrow milieu in promoting hematopoietic aging 
          2025-Sep-23, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.celrep.2025.116193
          PMID:40875292
         | 研究论文 | 本研究通过构建NF-κB活性升高实验模型,解析其在造血衰老表型中的特异性作用机制 | 首次明确区分NF-κB在造血干细胞自主功能与骨髓微环境中的不同作用,并建立单细胞RNA测序标记框架进行跨物种验证 | 实验模型为人工构建的NF-κB活性升高模型,可能与自然衰老过程存在差异 | 阐明炎症信号通路NF-κB在造血衰老过程中的具体作用机制 | 造血干细胞和骨髓微环境 | 单细胞生物学 | 造血系统衰老 | 单细胞RNA测序 | IκB缺陷小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类HSC数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 291 | 2025-10-05 | Junctional adhesion molecule C limits glioblastoma stem-like cell invasion by regulating integrin adhesion at the endothelial interface 
          2025-Sep-23, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.celrep.2025.116194
          PMID:40875295
         | 研究论文 | 本研究揭示了连接粘附分子C(JAMC)通过调节整合素粘附在限制胶质母细胞瘤干细胞样细胞侵袭中的关键作用 | 首次发现JAMC通过调节整合素粘附在胶质母细胞瘤干细胞样细胞与内皮细胞界面相互作用中的关键调控功能 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索胶质母细胞瘤干细胞样细胞与血管内皮界面相互作用的分子机制 | 胶质母细胞瘤干细胞样细胞(GSCs) | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学,定量蛋白质组学,脱细胞基质,共培养,器官型脑切片 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,细胞行为数据 | 人类样本和小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 292 | 2025-10-05 | Single-cell transcriptomic reconstruction of the human hair cycle: Capturing the temporal dynamics of skin tissue remodeling 
          2025-Sep-23, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.celrep.2025.116196
          PMID:40884793
         | 研究论文 | 通过单细胞转录组测序重建人类毛发周期的时间动态,揭示皮肤组织重塑的分子机制 | 首次在人类皮肤组织中构建了毛发周期的伪时间序列,揭示了16种不同细胞群体在毛发周期中的连续基因表达变化 | 样本数量有限(19个皮肤组织),且为计算重建的伪时间序列而非真实时间序列 | 研究人类皮肤组织在毛发周期中的动态重塑过程 | 人类皮肤组织中的毛囊及相关细胞群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间序列分析 | 单细胞转录组数据 | 19个人类皮肤组织样本,每个样本包含单个毛囊 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 293 | 2025-10-05 | Advances in artificial intelligence for spatial transcriptomics in cancer: Special focus on Yin Yang 1 (YY1) and Raf kinase inhibitor protein (RKIP) 
          2025-Sep-22, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
          
         
          DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189456
          PMID:40992707
         | 综述 | 探讨人工智能在癌症空间转录组学中的应用,特别关注YY1和RKIP基因 | 聚焦于整合机器学习、人工智能和统计方法来解析空间转录组数据,并以YY1和RKIP基因为例展示应用 | NA | 推进空间转录组学在癌症研究和个性化医疗中的应用 | 癌症微环境中的基因表达模式,特别是YY1和RKIP基因 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学,机器学习,人工智能 | 支持向量机(SVM),随机森林(RF),主成分分析(PCA),t-SNE,UMAP | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 294 | 2025-10-05 | Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy 
          2025-Sep-19, Journal of advanced research
          
          IF:11.4Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.jare.2025.09.031
          PMID:40976555
         | 研究论文 | 本研究通过基因敲除Epac1探索其在缺血性视网膜病变中对Müller胶质细胞病理激活和视网膜神经变性的作用机制 | 首次揭示Epac1通过调节Müller细胞中VEGF信号通路促进视网膜神经变性的新机制 | 研究仅使用小鼠OIR模型,尚未在人类疾病中验证 | 探究Epac1在缺血性视网膜病变中的作用及其分子机制 | 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型和原代Müller细胞 | 眼科疾病研究 | 缺血性视网膜病变 | 单细胞RNA测序,免疫染色,qPCR,Western blot,邻近连接分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,组织形态数据 | 未明确样本数量的小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 295 | 2025-10-05 | Immune microenvironment and fibroblast subpopulation in diabetic wound healing 
          2025-Sep-19, iScience
          
          IF:4.6Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.isci.2025.113440
          PMID:40995117
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析糖尿病足溃疡肉芽组织,揭示免疫微环境和成纤维细胞亚群在伤口愈合中的作用 | 首次在单细胞水平系统描绘糖尿病伤口修复微环境中免疫细胞和成纤维细胞亚群的特定改变 | NA | 探究糖尿病足溃疡愈合障碍的细胞分子机制 | 糖尿病足溃疡患者的肉芽组织 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序,荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 296 | 2025-10-05 | Single-cell analysis of heterogeneity and molecular changes in cultured corneal epithelial stem cells during serial passage 
          2025-Sep-17, Stem cells (Dayton, Ohio)
          
         
          DOI:10.1093/stmcls/sxaf041
          PMID:40574692
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析长期传代培养的角膜缘干细胞群体动态和基因表达变化 | 首次在单细胞水平识别出三种不同的角膜缘祖细胞亚群,并发现RepSox小分子处理可部分维持长期培养中的干细胞特性 | 研究主要基于体外培养模型,体内验证仍需进一步研究 | 探索长期传代培养中角膜缘干细胞异质性和分子变化机制 | 培养的角膜上皮干细胞 | 单细胞生物学 | 角膜疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 22708个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 297 | 2025-10-05 | Consistent self-organized emergence of hyaline cartilage in human induced pluripotent stem cell-derived multi-tissue organoids 
          2025-Sep-17, Stem cells (Dayton, Ohio)
          
         
          DOI:10.1093/stmcls/sxaf043
          PMID:40577622
         | 研究论文 | 开发了一种利用人多能干细胞生成透明软骨的简化多组织类器官方案 | 建立了无需异源成分和饲养层的简单培养方案,实现了透明软骨在类器官中的稳定形成 | 未提及临床转化应用的具体验证数据 | 开发稳定生成透明软骨的hiPSC培养方案 | 人诱导多能干细胞衍生的多组织类器官 | 组织工程 | 软骨相关疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 组织学, 免疫组织化学 | 多组织类器官模型 | 基因表达数据, 组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 298 | 2025-10-05 | A TLR4-dependent fibroblast-monocyte axis in tumor-draining lymph nodes contributes to metastasis in triple-negative breast cancer 
          2025-Sep-15, Immunity
          
          IF:25.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.015
          PMID:40957419
         | 研究论文 | 本研究揭示了三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结内TLR4依赖的成纤维细胞-单核细胞轴促进转移的机制 | 首次发现肿瘤引流淋巴结中成纤维网状细胞通过TLR4信号促进单核细胞招募并形成免疫抑制微环境 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究三阴性乳腺癌转移过程中肿瘤引流淋巴结的免疫微环境重塑机制 | 三阴性乳腺癌小鼠模型和人类肿瘤引流淋巴结样本 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学,体外抑制实验 | NA | 基因表达数据,空间分布数据 | 小鼠肿瘤模型和人类TNBC样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 299 | 2025-10-05 | Human-mouse cross-species comparison identifies common and unique aspects of intestinal mesenchyme development 
          2025-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2025.09.03.674033
          PMID:40950081
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序和组织学方法比较小鼠和人类肠道间充质发育的异同 | 首次进行跨物种比较揭示肠道间充质细胞类型的高度保守性及物种特异性基因表达差异 | 研究仅关注发育阶段,未涉及成熟或病理状态下的间充质细胞 | 探究小鼠和人类肠道间充质细胞发育的保守性和差异性 | 发育中小鼠和人类肠道的间充质(成纤维细胞)群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 300 | 2025-10-05 | Development of an electroconductive Heart-on-a-chip model to investigate cellular and molecular response of human cardiac tissue to gold nanomaterials 
          2025-Sep, Biomaterials
          
          IF:12.8Q1
          
         | 研究论文 | 开发了一种导电性心脏芯片模型,用于研究人类心脏组织对金纳米材料的细胞和分子响应 | 首次将导电水凝胶支架与微流控芯片系统结合,构建具有原生心肌电导特性的3D心脏芯片模型 | 未明确说明样本规模和实验重复次数 | 研究人类心脏组织对金纳米材料的细胞和分子响应机制 | 人类诱导多能干细胞来源的心肌细胞和心脏成纤维细胞 | 组织工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 微流控技术 | 3D心脏芯片模型 | 基因表达数据, 功能测试数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |