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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-06 |
Monitoring the Biological Impact and Therapeutic Potential of Intermittent Fasting in Oncology: Assessing Strategies and Clinical Translational Challenges
2025-Sep-18, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15182369
PMID:41008741
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综述 | 本文评估间歇性禁食在肿瘤学中的生物学影响监测策略及临床转化挑战 | 提出整合机制性监测与临床反应监测的双层框架,强调将现代诊断技术(如单细胞RNA测序、ctDNA检测)与临床实践相结合 | 当前先进监测工具因成本与复杂性主要限于临床前研究,需要大规模随机试验验证标准化方案 | 评估间歇性禁食在肿瘤治疗中的生物学效应监测方法及临床转化路径 | 肿瘤患者及间歇性禁食干预的生物学机制 | 肿瘤学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学、循环肿瘤DNA检测、免疫表型分析 | NA | 文献数据、生物标志物数据、影像学数据 | NA(文献综述未涉及具体样本量) | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,代谢组学 | NA | NA |
| 262 | 2025-10-06 |
Diversity, Functional Complexity, and Translational Potential of Glial Cells in the Central Nervous System
2025-Sep-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26189080
PMID:41009644
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综述 | 系统综述中枢神经系统中胶质细胞的功能多样性、分子机制及转化医学潜力 | 重新定义胶质细胞在神经系统中的动态调节作用,整合高分辨率成像和单细胞转录组学等前沿技术 | NA | 弥合基础神经科学与临床应用之间的鸿沟,为下一代中枢神经系统疗法提供框架 | 中枢神经系统中的各类胶质细胞(星形胶质细胞、NG2胶质细胞、小胶质细胞) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 高分辨率活体成像、单细胞转录组学、基因编辑平台 | NA | 分子机制数据、成像数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2025-10-06 |
Investigating Germ Cell Transition Genes in Breast Cancer: Exploring the Genesis of Cancer Testis-Associated Markers
2025-Sep-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26188958
PMID:41009526
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研究论文 | 本研究探讨乳腺癌中与男性生殖细胞发育相关基因的表达特征及其在肿瘤发生中的作用 | 首次系统识别乳腺癌中与胎儿原始生殖细胞相关的过度表达基因,并通过单细胞RNA测序揭示肿瘤异质性 | 样本量较小(28个肿瘤样本),且主要依赖已发表数据集进行重新分析 | 探索乳腺癌中生殖细胞转化相关的分子机制和通路 | 乳腺癌组织样本和相关的基因表达数据 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 定量RT-PCR, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 28个乳腺癌组织样本,基于已发表数据集的重新分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 264 | 2025-10-06 |
Rat Glioma 101.8 Tissue Strain: Molecular and Morphological Features
2025-Sep-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26188992
PMID:41009560
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研究论文 | 本研究通过多组学方法表征了大鼠胶质瘤101.8组织移植株的分子和形态特征 | 首次系统表征了具有人类中枢神经系统肿瘤关键遗传畸变的大鼠胶质瘤模型,为精准治疗研究提供新工具 | 研究基于动物模型,与人类肿瘤仍存在物种差异 | 开发适用于差异诊断和个性化治疗的中枢神经系统肿瘤代表性模型 | 大鼠胶质瘤101.8组织移植株及其微环境 | 实验神经肿瘤学 | 胶质瘤 | MRI, IHC, scRNA-seq, qPCR-RT | 动物肿瘤模型 | 分子数据、影像数据 | 来自神经系统实验肿瘤收藏库的化学诱导可移植肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 265 | 2025-10-06 |
Development and Validation of a Centrosome Amplification-Related Prognostic Model in Pancreatic Cancer: Multi-Omics Guided Risk Stratification and Tumor Microenvironment
2025-Sep-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17182983
PMID:41008826
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个胰腺癌中心体扩增相关预后模型,通过多组学分析揭示其在肿瘤微环境中的作用机制 | 首次系统整合多组学数据构建胰腺癌中心体扩增预后模型,结合单细胞测序和空间转录组学揭示其时空动态特征 | 研究样本量有限,需要更大规模的前瞻性验证 | 探索中心体扩增在胰腺癌中的预后价值及其在肿瘤微环境重塑中的作用机制 | 胰腺腺癌患者组织样本和基因表达数据 | 数字病理 | 胰腺癌 | 多组学分析、单细胞测序、空间转录组学、PCR验证 | Cox回归模型、LASSO回归 | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | TCGA和GEO数据库的胰腺癌样本,患者来源的组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 266 | 2025-10-06 |
Identification of Key Genes Related to Both Lipid Metabolism Disorders and Inflammation in MAFLD
2025-Sep-09, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13092211
PMID:41007773
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研究论文 | 本研究通过整合分析识别了与MAFLD脂质代谢紊乱和炎症相关的关键基因 | 首次通过机器学习方法整合脂质代谢和炎症相关基因,识别出FADS1、FADS2、GLB1和PNPLA3四个关键基因,并验证了它们在MAFLD中的重要作用 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证这些基因的具体功能机制 | 识别与代谢相关脂肪肝病中脂质代谢紊乱和炎症相关的关键基因 | MAFLD患者和MAFLD小鼠模型 | 生物信息学 | 代谢相关脂肪肝病 | 机器学习、单细胞RNA测序、实时PCR | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 使用GSE135251和GSE89632数据集,以及GSE186328单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 267 | 2025-10-06 |
Heterogeneity of Tertiary Lymphoid Structures and Plasma Cells in PDAC with and Without Lymph Node Metastasis
2025-Sep-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17182949
PMID:41008793
|
研究论文 | 本研究通过多色免疫荧光和AI病理图像分析探讨PDAC中三级淋巴结构与浆细胞的异质性及其与淋巴结转移的关系 | 发现N0 PDAC中存在IgG浆细胞相关免疫热点,并首次提出IgG浆细胞与最近IgG肿瘤细胞间的距离可作为新的预后生物标志物 | 三级淋巴结构形成机制及其对抗肿瘤体液免疫应答的具体贡献仍需进一步研究 | 探究PDAC中三级淋巴结构和浆细胞的异质性及其在淋巴结转移中的作用 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者组织样本,包括无淋巴结转移(N0)和有淋巴结转移(N1/2)两组 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多色免疫荧光(mIF)染色、AI病理图像分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、TCGA数据库分析 | AI图像分析软件 | 病理图像、单细胞测序数据、基因组数据 | 利用三个scRNA-seq数据集和TCGA-PAAD数据库,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 268 | 2025-10-06 |
Single cell transcription revealing key transcription factors in embryonic kidney development
2025-Sep, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05307-x
PMID:40392427
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示胚胎肾脏发育中关键转录因子的作用 | 首次在单细胞分辨率下识别出肾脏祖细胞中的关键转录因子及其在分化为肾小管上皮细胞和足细胞中的作用 | 需要进一步研究验证这些发现及其治疗潜力 | 探索肾脏发育过程中肾脏祖细胞分化的分子机制 | 胚胎肾脏发育过程中的肾脏祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 269 | 2025-10-06 |
Immune mechanisms and signatures in lethal and non-lethal sepsis revealed by single-cell transcriptomics
2025-Sep-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf140
PMID:40580488
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示致死性和非致死性脓毒症的免疫机制和特征 | 利用遗传同质性小鼠模型首次系统比较致死性和非致死性脓毒症的单细胞转录组动态变化,发现Mono2单核细胞亚群的关键作用及其与疾病预后的关联 | 研究基于小鼠模型,需在人类患者中进一步验证;样本量相对有限 | 揭示脓毒症的免疫机制并鉴定诊断和预后相关的生物标志物 | 近交系小鼠的外周血单核细胞和公开的人类患者数据 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型和公开人类患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 270 | 2025-10-05 |
Intervention of Rutin and Ochnaflavone in the Attenuation of Neuroinflammation and Neuronal Apoptosis in Spinal Cord Injury
2025-Sep-26, Global spine journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1177/21925682251383489
PMID:41001708
|
研究论文 | 本研究探讨芦丁和奥那黄酮通过调节PI3K/AKT和NF-κB信号通路减轻脊髓损伤后神经炎症和神经元凋亡的机制 | 首次揭示芦丁和奥那黄酮协同作用通过调控小胶质细胞活化和PI3K/AKT/NF-κB信号通路发挥神经保护作用的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;机制研究尚未完全阐明所有下游效应分子 | 阐明芦丁和奥那黄酮在脊髓损伤中的神经保护机制 | 脊髓损伤小鼠模型、BV2小胶质细胞系、小胶质细胞-神经元共培养系统 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 蛋白质印迹, 免疫荧光, ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞培养数据 | 小鼠脊髓损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2025-10-05 |
Integrated multi-omics analysis reveals PTM networks as key regulators of colorectal cancer progression and immune evasion
2025-Sep-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03445-8
PMID:41003898
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示翻译后修饰网络作为结直肠癌进展和免疫逃逸的关键调控因子 | 首次全面揭示PTM网络在结直肠癌中的调控作用,发现GALNT6介导的糖基化通过稳定PD-L1和排除CD8+T细胞驱动免疫逃逸 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索翻译后修饰在结直肠癌进展和免疫逃逸中的综合作用 | 结直肠癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学整合分析,孟德尔随机化,空间转录组学 | LASSO,SVM,随机森林 | 转录组数据,单细胞数据 | 1,783例批量RNA-seq样本,41,143个单细胞 | NA | 单细胞转录组学,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 272 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis reveals the prognostic value and immunomodulatory role of CTSW in breast cancer
2025-Sep-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03550-8
PMID:41003895
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示CTSW在乳腺癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次采用多组学框架系统研究CTSW在乳腺癌中的预后意义和免疫调节功能,并通过单细胞RNA测序发现CTSW在活化CD8+T细胞中的表达与预后相关 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索乳腺癌中新的生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌患者和肿瘤免疫微环境 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组学、甲基化组学、数量性状位点分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序 | Cox回归、Kaplan-Meier生存分析、孟德尔随机化 | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-05 |
Data-driven inference of Boolean networks from transcriptomes to predict cellular differentiation and reprogramming
2025-Sep-26, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00569-z
PMID:41006334
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研究论文 | 提出一种从转录组数据自动推断布尔网络的方法,用于预测细胞分化和重编程 | 开发了整合转录组数据和先验知识自动生成布尔网络集合的通用方法,能够处理模型不确定性并预测稳健的重编程靶点 | 方法依赖于转录组数据的质量和对基础基因调控网络的先验知识 | 构建能够再现细胞定性行为的布尔网络模型,用于预测细胞分化和重编程 | 造血系统细胞分化和骨髓基质细胞向脂肪细胞/成骨细胞分化 | 计算生物学 | NA | RNA-seq | 布尔网络 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of molecular mechanisms in prostate cancer via single-cell RNA sequencing and weighted gene co-expression network analysis
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15682-6
PMID:41006377
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析研究前列腺癌的分子机制 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq与hdWGCNA方法,在更高分辨率下分析前列腺癌肿瘤微环境,识别出6个关键基因 | 需要进一步的临床验证 | 探索前列腺癌进展的分子机制,发现潜在治疗靶点 | 前列腺癌组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | Cox回归, LASSO回归, 预后预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 9,809个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 275 | 2025-10-05 |
Hypersonic levitation and spinning: paving the way for enhanced single-cell analysis via contactless tissue dissociation
2025-Sep-26, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-025-00497-0
PMID:41006575
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研究论文 | 本文介绍了一种新型非接触式组织解离技术——高超声悬浮旋转技术,用于改进单细胞分析 | 开发了基于三声谐振器探针的高超声悬浮旋转技术,实现非接触式组织解离,通过微尺度'液体射流'施加精确流体动力 | NA | 开发高效、温和的组织解离方法以改进单细胞分析 | 人类肾癌组织 | 单细胞分析 | 肾癌 | 高超声悬浮旋转技术 | NA | 流式细胞术、原代细胞培养、免疫荧光、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2025-10-05 |
Comprehensive characterization of lysosome-dependent cell death reveals prognostic significance and immune landscape in colon adenocarcinoma
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-18267-5
PMID:41006689
|
研究论文 | 本研究全面表征了溶酶体依赖性细胞死亡在结肠腺癌中的预后意义和免疫景观 | 首次系统分析LDCD相关基因在结肠腺癌中的表达特征,建立五基因预后标志物,并揭示其与肿瘤免疫微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要更多前瞻性研究验证 | 探索溶酶体依赖性细胞死亡相关基因在结肠腺癌中的预后价值和免疫学意义 | 结肠腺癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,LASSO回归,Cox回归分析 | 预后预测模型 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 277 | 2025-10-05 |
Integrated Multiomics Analysis Identifies CDO1 as a Novel Therapeutic Target for Osteoarthritis
2025-Sep-25, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 通过整合多组学分析识别CDO1作为骨关节炎的新型治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和WGCNA分析识别CDO1作为骨关节炎的因果风险基因,并通过体内实验验证其治疗潜力 | 研究仅在大鼠模型中进行功能验证,尚未在人类临床试验中得到证实 | 识别骨关节炎进展中的关键基因和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,WGCNA,孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据 | 7个公共OA数据集和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal profiling reveals the impact of caloric restriction in the aging mammalian brain
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116165
PMID:40833855
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和空间转录组学技术,揭示了热量限制对衰老小鼠大脑的细胞和分子影响 | 首次结合单细胞转录组和空间转录组技术,在时空维度上系统解析热量限制对哺乳动物大脑衰老的影响机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究热量限制延缓大脑衰老的细胞种群和分子通路机制 | 小鼠大脑细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单核转录组测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 36只小鼠大脑的超过50万个细胞,12个大脑切片 | EasySci, IRISeq | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | EasySci单核转录组, IRISeq空间转录组 | 无成像IRISeq空间转录组技术 |
| 279 | 2025-10-05 |
gwSPADE: gene frequency-weighted reference-free deconvolution in spatial transcriptomics
2025-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf966
PMID:41002029
|
研究论文 | 提出一种名为gwSPADE的基因频率加权无参考空间转录组解卷积方法 | 开发了无需外部单细胞参考数据的空间转录组解卷积方法,采用基因频率加权方案和主题模型 | NA | 解决空间转录组数据中细胞类型组成的准确解卷积问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 主题模型 | 基因计数矩阵 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 280 | 2025-10-05 |
Single-cell-scale spatial transcriptome of the developing and adult mouse ovary
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.16.676655
PMID:41000831
|
研究论文 | 本研究使用空间转录组技术构建了小鼠卵巢发育和成年期的单细胞尺度空间转录组图谱 | 首次在保持卵巢原生细胞结构的前提下,通过10X Genomics Visium HD空间转录组技术实现了近单细胞分辨率的空间基因表达分析 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及其他物种验证 | 探究卵巢发育过程中的空间模式调控机制 | 发育中和成年小鼠卵巢 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 8个关键胎儿期和出生后时间点的小鼠卵巢样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10X Genomics Visium HD空间转录组学平台 |