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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-05 |
Tabersonine inhibits inflammation and apoptosis through the JAK1/STAT3 signaling pathway to alleviate LPS-induced acute lung injury
2025-Sep-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17885-3
PMID:40998926
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研究论文 | 本研究探讨了塔博赛宁通过JAK1/STAT3信号通路抑制炎症和细胞凋亡,缓解LPS诱导的急性肺损伤的作用机制 | 首次通过网络药理学预测结合实验验证,发现塔博赛宁通过靶向JAK1/STAT3通路发挥治疗急性肺损伤的作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未进行临床验证 | 探究塔博赛宁治疗急性肺损伤的分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型和RAW264.7巨噬细胞系 | 分子生物学 | 急性肺损伤 | 网络药理学分析、单细胞转录组分析、分子对接、Western blot、流式细胞术、TUNEL染色 | 动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量,使用小鼠模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE225664单细胞转录组数据集 |
| 262 | 2025-10-05 |
Evaluation of cell type annotation reliability using a large language model-based identifier
2025-Sep-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08745-x
PMID:40998963
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研究论文 | 开发了一种基于大语言模型的细胞类型注释可靠性评估工具LICT | 利用多模型集成和“人机对话”方法,提供客观的细胞类型注释可靠性评估框架 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 263 | 2025-10-05 |
MitoDelta: identifying mitochondrial DNA deletions at cell-type resolution from single-cell RNA sequencing data
2025-Sep-25, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11931-0
PMID:40999372
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研究论文 | 开发了一种从单细胞RNA测序数据中识别细胞类型特异性线粒体DNA缺失的计算方法 | 首个专门从单细胞RNA测序数据中检测细胞类型特异性mtDNA缺失的计算流程,无需额外DNA测序数据 | 依赖单细胞RNA测序数据的质量和覆盖度,可能受转录组噪音影响 | 开发检测细胞类型特异性线粒体DNA缺失的计算方法 | 线粒体DNA缺失变异 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,计算分析 | beta-二项分布模型 | 单细胞RNA测序数据 | 已发表的帕金森病单核RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 264 | 2025-10-05 |
EMB is essential for enteric nervous system development mediated by PI3K signaling
2025-Sep-25, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01538-1
PMID:40999499
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研究论文 | 本研究揭示了EMB通过调控PI3K信号通路在肠道神经系统发育中的关键作用 | 首次发现EMB通过招募PP2A磷酸酶复合物至细胞膜促进PI3K-AKT通路激活,调控肠道神经嵴细胞发育的新机制 | EMB罕见变异与HSCR疾病的因果关系需要进一步验证 | 探究EMB在肠道神经系统发育中的功能机制 | 斑马鱼、小鼠模型及人类HSCR患者队列 | 发育生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、基因敲除、迁移实验、类器官培养 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、表型数据、临床变异数据 | 斑马鱼和小鼠模型,以及HSCR患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2025-10-05 |
Mechanically activated snai1b coordinates the initiation of myocardial delamination for trabeculation
2025-Sep-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62285-w
PMID:40993149
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研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼心脏发育过程中机械力激活的snai1b阳性心肌细胞通过启动分层过程参与小梁形成的新机制 | 首次发现snai1b阳性心肌细胞在机械力激活下启动心肌分层,且这些细胞不表现典型的上皮-间质转化特征 | 研究主要基于斑马鱼模型,需要在哺乳动物中进一步验证 | 探究心肌小梁形成过程中机械力激活的snai1b在心肌分层启动中的作用机制 | 斑马鱼胚胎心脏发育过程中的心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | CRISPR激活/抑制, 4-D应变分析, 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | 斑马鱼发育模型 | 基因表达数据, 影像数据, 转录组数据 | 4天受精后斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 266 | 2025-10-05 |
Amyloid-β-driven Alzheimer's disease reshapes the colonic immune system in mice
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116109
PMID:40885186
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示阿尔茨海默病如何重塑小鼠结肠免疫系统 | 首次在淀粉样蛋白β驱动的小鼠模型中系统揭示肠道免疫系统变化与大脑免疫细胞迁移的关联 | 研究基于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证 | 探索阿尔茨海默病中肠道-大脑轴的免疫学特征 | 5XFAD淀粉样蛋白β小鼠模型的结肠免疫细胞 | 单细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 光谱调谐流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 5XFAD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 267 | 2025-10-05 |
A multi-omic analysis to investigate the causal associations between circulating proteins and risk of spontaneous abortion and their potential implications
2025-Sep-22, JBRA assisted reproduction
DOI:10.5935/1518-0557.20250031
PMID:40674570
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析研究循环蛋白与自然流产风险的因果关系 | 首次结合顺式和反式pQTLs作为工具变量,并整合单细胞转录组分析识别子宫内易感细胞类型 | 排除了性别间差异表达的蛋白质,可能遗漏部分相关蛋白 | 探索循环蛋白与自然流产风险的因果关系及其分子机制 | 自然流产风险相关的遗传变异和循环蛋白 | 生物信息学 | 自然流产 | 孟德尔随机化, pQTL分析, KEGG通路富集, 单细胞转录组分析 | 孟德尔随机化模型 | 遗传变异数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 268 | 2025-10-05 |
Orlistat Confers Neuroprotection in Traumatic Brain Injury by Modulating Microglial Lipid Metabolism
2025-Sep-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181469
PMID:41002434
|
研究论文 | 研究奥利司他通过调节小胶质细胞脂质代谢在创伤性脑损伤中发挥神经保护作用 | 首次发现奥利司他通过直接抑制小胶质细胞中脂蛋白脂肪酶(LPL)介导的神经炎症发挥神经保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探讨奥利司他在创伤性脑损伤中的神经保护潜力及作用机制 | 小鼠创伤性脑损伤模型及小胶质细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 转录组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 行为学数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2025-10-05 |
Astrocytes in Fear Memory Processing: Molecular Mechanisms Across the Amygdala-Hippocampus-Prefrontal Cortex Network
2025-Sep-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181444
PMID:41002409
|
综述 | 本文综述了星形胶质细胞在恐惧记忆处理中的分子机制及其在杏仁核-海马体-前额叶皮层网络中的作用 | 挑战了传统的以神经元为中心的恐惧记忆观点,揭示了星形胶质细胞在不同脑区特异性功能和与神经元的动态相互作用 | NA | 探讨星形胶质细胞在恐惧记忆获取、巩固、消退和提取过程中的分子机制 | 星形胶质细胞在杏仁核-海马体-前额叶皮层网络中的功能 | 神经科学 | 创伤后应激障碍(PTSD)和焦虑症 | 空间转录组学, 光遗传学, 化学遗传学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 270 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Cell Heterogeneity and Altered Signaling Pathways in Jellyfish Sting Patients
2025-Sep-15, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23090358
PMID:41003327
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示水母蜇伤患者免疫细胞异质性和信号通路改变 | 首次在单细胞分辨率下揭示水母蜇伤后的免疫失调图谱,发现MMP9+单核细胞和S100A12+中性粒细胞的关键作用 | 仅分析一名严重患者样本,样本量较小 | 探究水母蜇伤后的免疫机制和信号通路变化 | 水母蜇伤患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 中毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 一名严重患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2025-10-05 |
Morphological and Transcriptomic Analyses of the Adrenal Gland in Acomys cahirinus: A Novel Model for Murine Adrenal Physiology
2025-Sep-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181431
PMID:41002397
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研究论文 | 本研究通过形态学和转录组学分析比较了Acomys cahirinus与小鼠的肾上腺结构与基因表达差异 | 首次在Acomys cahirinus中发现明确的网状带结构,其肾上腺基因表达谱与人类肾上腺皮质高度相似 | 需要进一步进行单细胞转录组学和功能验证实验来充分评估其转化潜力 | 评估Acomys cahirinus作为人类肾上腺疾病模型的适用性 | Acomys cahirinus和小鼠的肾上腺组织 | 转录组学 | 肾上腺疾病 | RNA-seq, qRT-PCR, CAGE-seq, 通路分析 | NA | 转录组数据, 形态学数据 | NA | NA | 转录组测序 | NA | NA |
| 272 | 2025-10-05 |
Comprehensive Characterization of Long Non-Coding RNAs in Porcine Tissues: Expression Patterns and Functional Insights During Oocyte Development
2025-Sep-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181409
PMID:41002376
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研究论文 | 本研究系统表征了猪组织中长链非编码RNA的表达模式及其在卵母细胞发育中的功能 | 首次系统分析14种猪组织的lncRNA表达谱,并鉴定卵母细胞发育过程中的关键lncRNA | 研究主要基于表达谱分析,功能验证实验相对有限 | 阐明猪组织中lncRNA的表达特征及其在生殖生物学中的功能 | 猪多种组织样本及卵母细胞发育不同阶段的单细胞数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 607个组织RNA-seq数据集,63个单细胞RNA-seq数据集,以及37个人鼠比较数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 273 | 2025-10-05 |
Piezo1 promotes M1 macrophage polarization and impairs osteogenic differentiation in bone infection
2025-Sep-07, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.168042
PMID:40925468
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研究论文 | 本研究探讨Piezo1在骨感染中促进巨噬细胞M1极化并损害成骨分化的机制 | 首次揭示Piezo1在骨感染微环境中调控巨噬细胞极化并通过PANoptosis影响成骨分化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 探究Piezo1在骨感染过程中对巨噬细胞极化和成骨分化的调控作用 | 大鼠骨感染模型、人类感染骨组织、小鼠单核巨噬细胞和骨髓间充质干细胞 | 骨生物学 | 骨感染 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 细胞共培养 | NA | RNA测序数据, 细胞实验数据 | 大鼠模型和人类组织样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 274 | 2025-10-05 |
Dissecting microbial communities with single-cell transcriptome analysis
2025-Sep-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp6252
PMID:40906858
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综述 | 本文综述了单细胞转录组分析技术在微生物群落研究中的应用进展与挑战 | 将单细胞基因表达分析技术从人类生物学领域拓展应用于微生物群落功能解析 | 在微生物群落应用中仍面临技术挑战 | 探讨单细胞转录组技术在微生物群落功能研究中的应用 | 微生物群落及其亚群 | 单细胞组学 | 肠道微生物相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 275 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of human fibrous dysplasia bone reveals a fibrotic transcriptome and GNAS variants in endothelial, perivascular, and stromal cells
2025-Sep-04, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.07.018
PMID:40848713
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类纤维性发育不良骨组织,揭示纤维化转录组特征和GNAS变异在多种细胞类型中的表达 | 首次在骨骼基质谱系外的内皮细胞和周细胞中发现GNAS c.602G>A和c.601C>T变异,并识别出跨FD细胞谱系的共同纤维化转录组特征 | 样本量有限,仅分析了非造血细胞 | 研究体细胞嵌合对纤维性发育不良疾病机制的细胞和分子影响 | 人类纤维性发育不良和非纤维性发育不良骨组织中的非造血细胞 | 单细胞组学 | 纤维性发育不良 | 单细胞RNA测序,GNAS基因分型,BaseScope检测 | NA | 单细胞RNA测序数据 | FD和非FD人类骨组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2025-10-05 |
A Human Immuno-Lung Organoid Model to Study Macrophage-Mediated Lung Cell Senescence Upon SARS-CoV-2 Infection
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503932
PMID:40712141
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研究论文 | 本研究开发了免疫-肺类器官模型,研究SARS-CoV-2感染后巨噬细胞介导的肺细胞衰老机制 | 建立了包含hPSC来源肺泡和气道类器官与巨噬细胞共培养的免疫-肺类器官模型,并首次发现THBS1-(ITGA3+ITGB1)信号轴在驱动肺细胞衰老中的作用 | NA | 研究SARS-CoV-2感染后巨噬细胞介导的肺损伤机制 | 非COVID和COVID-19肺组织外植体和尸检样本,免疫-肺类器官模型 | 数字病理 | COVID-19 | 空间转录组测序 | 类器官模型 | 空间转录组数据 | 非COVID和COVID-19肺组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | CosMx | NanoString CosMx空间分子成像平台 |
| 277 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptional analysis of murine mesenteric lymph nodes following oral lyso-phosphatidylserine nanoparticle administration reveals cellular heterogeneity in tolerance features
2025-Sep, Journal of pharmaceutical sciences
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.xphs.2025.103919
PMID:40712826
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析口服含溶血磷脂酰丝氨酸纳米颗粒后小鼠肠系膜淋巴结的免疫细胞反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示LysoPS纳米颗粒通过TGF-β反应诱导B细胞、T细胞和NK细胞耐受性特征的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,人体内的生物过程和细胞通讯机制仍不明确 | 阐明LysoPS介导的口服耐受性中的免疫细胞相互作用和潜在耐受机制 | 小鼠肠系膜淋巴结中的免疫细胞(B细胞、T细胞、NK细胞) | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-10-05 |
Glioblastoma exploits ATP from leading-edge astrocytes to fuel its infiltrative growth revealed by spatially resolved chimeric analysis
2025-Sep-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv5673
PMID:40991701
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研究论文 | 本研究开发了空间解析嵌合分析工具SCAR,揭示胶质母细胞瘤通过利用前导星形胶质细胞提供的ATP促进浸润性生长的代谢机制 | 开发了SCAR计算工具用于解析人鼠嵌合癌症模型中肿瘤与微环境的空间转录组互作,首次发现浸润性胶质母细胞瘤通过CKB介导的代谢重编程利用星形胶质细胞ATP的机制 | 研究基于人鼠嵌合模型,与人类真实肿瘤环境存在差异;空间转录组技术分辨率有限 | 探究胶质母细胞瘤浸润性生长的分子特征及其与脑微环境的相互作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞、星形胶质细胞、肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、计算分析 | SCAR(空间解析嵌合分析工具) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 279 | 2025-10-05 |
Integrating 3D imaging, GWAS and single-cell transcriptome approaches to elucidate root system architecture in Populus
2025-Sep-26, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf432
PMID:41004703
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研究论文 | 本研究通过整合3D成像、GWAS和单细胞转录组方法,揭示了毛白杨根系构型的遗传调控机制 | 开发了先进的图像识别方法量化杨树根系性状,建立了综合多组学框架解析根系构型的遗传基础 | 研究仅针对毛白杨特定种质资源,结果在其他树种中的普适性有待验证 | 阐明杨树根系构型的遗传结构和调控网络 | 毛白杨(Populus simonii)种质资源和84k杨树(Populus alba × Populus glandulosa)转基因材料 | 植物遗传学 | NA | 3D空间成像、全基因组关联分析(GWAS)、转录组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、遗传转化 | NA | 图像数据、基因组数据、转录组数据 | 303份毛白杨种质资源和转基因植株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2025-10-05 |
Mechanism of Piezo1 regulating chondrocyte mitochondrial function and promoting fracture healing through β-catenin/LARS2 signaling pathway
2025-Sep-24, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00459-4
PMID:40993116
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研究论文 | 本研究揭示了Piezo1通过β-catenin/LARS2信号通路调控软骨细胞线粒体功能并促进骨折愈合的分子机制 | 首次发现Piezo1通过β-catenin/LARS2轴调控软骨细胞线粒体生物能量学,并证实软骨细胞向成骨细胞转分化在骨折愈合中的作用 | 研究主要聚焦于分子机制,临床转化潜力仍需进一步验证 | 探究Piezo1在内软骨骨化过程中对软骨细胞的调控机制 | 软骨细胞及其线粒体功能 | 分子生物学 | 骨折 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,蛋白互作分析 | 基因敲除模型 | 基因表达数据,蛋白互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |