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当前共找到 792 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-12-17 |
Targeting Atf4 for enhanced neuroprotection: Role of quercetin-loaded EVs in ischemic stroke
2025-Sep, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2025.101312
PMID:41079784
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研究论文 | 本研究探讨了负载槲皮素-3-β-d-葡萄糖醛酸的细胞外囊泡在脑缺血再灌注损伤中的神经保护作用及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术，明确了神经元细胞在脑缺血再灌注损伤中的关键作用，并揭示了Atf4在介导负载槲皮素的细胞外囊泡神经保护效应中的核心调控功能 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人体中的适用性有待进一步验证；Atf4的具体下游作用通路尚未完全阐明 | 探究负载槲皮素的细胞外囊泡对脑缺血再灌注损伤的神经保护作用及其分子机制 | 脑缺血再灌注损伤小鼠模型、神经元细胞、细胞外囊泡 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、蛋白质分析数据、行为学评估数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 242 | 2025-12-15 |
Single-cell multiomics identifies Tcf1 and Lef1 as key initiators of early thymic progenitor fate
2025-Sep-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adq8970
PMID:40938954
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术揭示了Tcf1和Lef1作为早期胸腺祖细胞命运的关键启动因子 | 首次结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序解析小鼠早期胸腺祖细胞的异质性，并发现Tcf1和Lef1在Notch通路上游调控ETP形成 | 研究主要基于小鼠模型，人类ETP形成机制可能有所不同 | 探究调控早期胸腺祖细胞形成的分子机制 | 小鼠早期胸腺祖细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 243 | 2025-12-12 |
Streamlining single-cell spatial transcriptomics for human kidney tissue
2025 Sep-Oct, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.1080/07366205.2025.2591484
PMID:41324332
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研究论文 | 本文介绍了一种新的细胞区域归一化方法和流程，用于从NanoString CosMx单细胞空间转录组平台数据中注释15种肾脏细胞类型，并比较健康与疾病样本 | 开发了一种新颖的细胞区域归一化方法，提高了空间转录组数据分析的敏感性，并将流程集成到BioTuring SpatialX平台，使无生物信息学背景的用户也能进行空间数据分析 | 未明确说明样本量是否足够大以代表更广泛的疾病群体，且可能依赖于特定平台（CosMx）的数据 | 简化单细胞空间转录组学分析流程，以促进人类肾脏组织的研究和疾病比较 | 人类肾脏组织样本，包括两个健康肾脏活检和两个疾病样本（糖尿病肾病） | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 4个样本（2个健康肾脏活检，2个疾病样本） | NanoString | 单细胞空间转录组学 | CosMx | NanoString CosMx单细胞分辨率空间转录组平台 |
| 244 | 2025-12-11 |
Identification of conserved gene expression changes across common glomerular diseases by spatial transcriptomics
2025-Sep, Journal of nephrology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s40620-025-02233-5
PMID:40067649
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，分析了多种肾小球疾病中肾小球特异性基因表达谱，以识别共同的基因表达变化 | 首次利用空间转录组学技术系统比较多种肾小球疾病中的基因表达变化，识别出35个一致下调的差异表达基因，并揭示了与DNA结合转录因子活性相关的分子功能 | 研究样本量有限，仅包括五种肾小球疾病类型，且未涵盖所有可能的疾病亚型，可能影响结果的普遍性 | 探索肾小球疾病中共同的基因表达通路，以揭示潜在的分子机制 | 肾小球疾病患者和健康肾脏捐赠者的肾活检标本 | 数字病理学 | 肾小球疾病 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | 包括肾小球疾病患者和健康捐赠者，具体样本数未明确说明，但涉及五种疾病类型 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler用于空间转录组分析，配置了疾病代表性肾小球区域兴趣点 |
| 245 | 2025-12-07 |
Linear Dimensionality Reduction Methods for Analyzing Structured Biomedical Data: Existing Research and Future Opportunities
2025-Sep, Wiley interdisciplinary reviews. Computational statistics
DOI:10.1002/wics.70045
PMID:41341259
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综述 | 本文综述了用于分析结构化生物医学数据的线性降维方法，包括监督和无监督分析，并基于低秩加噪声模型进行理论和数值比较 | 提出了一个基于低秩加噪声模型的统一框架，对现有结构化降维方法进行理论和数值比较，并指出未来研究方向 | 主要关注线性方法，可能未全面覆盖非线性降维技术，且为综述性文章，缺乏新的实证应用 | 综述现有线性降维方法，以帮助研究人员选择适合结构化生物医学数据分析的方法，并推动该领域未来发展 | 结构化生物医学数据，如单细胞RNA-seq数据、微生物组数据和空间转录组数据 | 机器学习 | NA | NA | 线性降维方法 | 结构化生物医学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 246 | 2025-12-07 |
Modeling gut inflammation using intestinal organoids: Advances, challenges, and future perspectives
2025-Sep, Best practice & research. Clinical gastroenterology
DOI:10.1016/j.bpg.2025.102048
PMID:41350087
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综述 | 本文综述了利用肠道类器官模拟肠道炎症的进展、挑战与未来展望 | 整合了基因编辑、单细胞与空间转录组学以及类器官芯片等微工程平台，以推进类器官在炎症建模中的应用 | 在实现长期免疫共培养、培养基兼容性以及标准化检测方面仍面临挑战 | 利用肠道类器官模拟肠道炎症，以指导转化研究 | 肠道类器官 | NA | 炎症性肠病 | 基因编辑技术、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 247 | 2025-12-04 |
Identification of novel biomarkers and drug targets for frailty-related skeletal muscle aging: a multi-omics study
2025-Sep-01, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcaf108
PMID:40343466
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别了与衰弱相关骨骼肌衰老的新型生物标志物和药物靶点 | 首次发现24个生物标志物基因，并利用单细胞RNA测序数据集揭示内皮细胞在肌肉退化中的关键作用 | NA | 早期检测和治疗干预衰弱相关骨骼肌衰老 | 人类骨骼肌 | 机器学习 | 老年疾病 | 转录组学，单细胞RNA测序 | 机器学习预测模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 248 | 2025-12-01 |
Glioblastoma shift from bulk to infiltrative growth is guided by plexin-B2-mediated microglia alignment in invasive niches
2025-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00985-4
PMID:40442367
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤从团块生长向浸润性生长转变的机制，发现小胶质细胞通过plexin-B2介导的排列形成'癌流'引导肿瘤细胞集体迁移 | 首次发现小胶质细胞在肿瘤浸润前沿形成特定结构'癌流'引导集体迁移，并鉴定plexin-B2在解决细胞碰撞和细胞外基质重构中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探索胶质母细胞瘤浸润性生长的细胞机制和微环境调控 | 胶质母细胞瘤细胞、肿瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞(TAMs) | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、形态学数据 | 免疫活性小鼠模型和人类胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-11-30 |
Coxsackievirus B infection invokes unique cell-type-specific responses in primary human pancreatic islets
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116211
PMID:40892543
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示柯萨奇病毒B3感染在人胰岛中引发独特的细胞类型特异性反应 | 挑战了关于胰岛特异性病毒靶向的长期假设，发现导管细胞而非β细胞表现出最强的干扰素和HLA相关反应，并鉴定长非编码RNA MIR7-3HG在调节病毒感染中的作用 | 使用人尸体胰岛可能无法完全反映活体状态，干细胞衍生的胰岛模型可能与原代胰岛存在差异 | 探究柯萨奇病毒B感染对不同类型人胰岛细胞的特异性影响及其与1型糖尿病的关联 | 原代人胰岛细胞和干细胞衍生的胰岛 | 单细胞生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人尸体胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-11-28 |
Comparative Single-Cell Transcriptome Analysis of c-Met Receptor Expressing and Non-Expressing Projection Neurons in the Developing Frontal and Visual Cortices
2025-Sep-25, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000548617
PMID:40996948
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较发育中前额叶和视觉皮层c-Met受体表达与非表达投射神经元的转录组差异 | 首次在发育阶段系统比较同一投射神经元亚类中Met+和Met-群体的转录组差异，揭示MET信号通路在皮层回路异步成熟中的作用 | 研究仅关注小鼠发育早期阶段，未涵盖其他发育时期或物种 | 探究发育中皮层投射神经元亚类内转录组异质性的分子机制 | 小鼠视觉和前额叶皮层的投射神经元 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, smFISH | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 小鼠皮层神经元（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2025-11-26 |
Treg activation during allograft tolerance induction requires mitochondrion-induced TGF-β1 in type 1 conventional dendritic cells
2025-Sep-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178960
PMID:40644411
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研究论文 | 本研究揭示了1型常规树突状细胞通过线粒体代谢诱导TGF-β1表达，进而促进抗原特异性调节性T细胞生成和心脏移植物耐受的机制 | 首次发现cDC1细胞在移植物耐受诱导中的关键作用，并阐明线粒体代谢-TGF-β1信号轴调控抗原特异性Treg生成的新机制 | 研究基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；cDC1特异性基因敲除模型可能存在脱靶效应 | 探究1型常规树突状细胞在实体器官移植物耐受诱导中的作用机制 | 小鼠心脏移植模型、1型常规树突状细胞、CD4+CD25+FoxP3+调节性T细胞 | 免疫学 | 器官移植排斥 | 单细胞RNA测序、代谢分析、基因敲除 | NA | 基因表达数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 252 | 2025-11-24 |
Reduced intestinal GLP-1 + cell numbers are associated with an inflammation-related epithelial metabolic signature
2025-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.05.641577
PMID:41040310
|
研究论文 | 本研究探讨肠道炎症中GLP-1+细胞数量减少与炎症相关上皮代谢特征的关系 | 首次系统证明GLP-1+细胞在肠道炎症中普遍减少，并揭示其与线粒体功能障碍和代谢重编程的因果关系 | 主要依赖动物模型，人类数据来自公共数据库，需要进一步临床验证 | 阐明肠内分泌细胞在肠道炎症中的作用机制 | 小鼠模型、克罗恩病患者黏膜活检、肠道类器官 | 分子生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，转录组分析，器官培养 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 4种小鼠炎症模型和克罗恩病患者活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2025-11-20 |
CDK4 or CDK6 upregulation induces DNA replication stress and genomic instability to cause EGFR targeted therapy resistance in lung cancer
2025-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.12.584638
PMID:41256559
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研究论文 | 本研究揭示了CDK4或CDK6上调通过诱导DNA复制应激和基因组不稳定性导致EGFR突变肺癌对靶向治疗产生耐药性的机制 | 首次阐明CDK4/6上调通过复制应激和基因组不稳定性驱动EGFR靶向治疗耐药的具体分子机制 | 机制研究主要基于临床前模型，需要进一步临床验证 | 探究CDK4/6上调导致EGFR突变肺癌靶向治疗耐药的分子机制 | EGFR突变肺腺癌患者样本和临床前模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,拷贝数分析 | NA | 基因表达数据,拷贝数变异数据,单细胞测序数据 | EGFR突变肺腺癌患者活检样本和临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-11-20 |
Spatiomolecular mapping reveals anatomical organization of heterogeneous cell types in the human nucleus accumbens
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.10.675374
PMID:40964296
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，构建了人类伏隔核细胞类型和空间域的空间分子图谱 | 首次在人类大脑中发现连续的基因表达空间梯度，揭示了DRD1和DRD2中型多棘神经元更复杂的空间组织模式 | 研究基于10名神经典型成年捐赠者的死后组织样本，样本量相对有限 | 解析人类伏隔核细胞类型和空间组织的分子特征及其与神经精神疾病的关联 | 人类伏隔核组织样本 | 空间转录组学 | 神经精神疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 10名神经典型成年捐赠者的伏隔核组织 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 255 | 2025-11-19 |
Distinct roles for NF-κB in hematopoietic stem cells and the bone marrow milieu in promoting hematopoietic aging
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116193
PMID:40875292
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研究论文 | 本研究通过实验模型解析NF-κB在造血衰老中的不同作用机制 | 首次揭示NF-κB在造血干细胞自主功能和骨髓微环境中分别调控造血衰老不同表型的独立机制 | 研究基于特定基因缺陷模型，可能无法完全反映自然衰老过程 | 阐明炎症信号通路NF-κB在造血衰老过程中的具体作用机制 | 造血干细胞和骨髓微环境 | 单细胞生物学 | 造血系统衰老 | 单细胞RNA测序 | IκB缺陷小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及人类HSC数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 256 | 2025-11-19 |
Development of an electroconductive Heart-on-a-chip model to investigate cellular and molecular response of human cardiac tissue to gold nanomaterials
2025-Sep, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 开发了一种导电性心脏芯片模型，用于研究人类心脏组织对金纳米材料的细胞和分子响应 | 首次将导电性水凝胶支架与微流控芯片系统结合，构建具有改善电生理特性的3D心脏芯片模型 | 模型仍需进一步验证其在长期培养和疾病建模中的稳定性 | 开发更仿生的体外心脏组织模型以研究心脏发育和药物反应 | 人类诱导多能干细胞来源的心肌细胞和心脏成纤维细胞 | 组织工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 心脏芯片模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 257 | 2025-11-18 |
Single-vessel transcriptome map pathological landscapes and reveal NR2F2-mediated smooth muscle cell phenotype acquisition in capillary malformations
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.02.673874
PMID:40950147
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了毛细血管畸形中血管病理景观及NR2F2介导的平滑肌细胞表型获得机制 | 首次在单血管水平构建毛细血管畸形的空间转录组图谱，发现NR2F2在调控平滑肌细胞表型获得中的核心作用 | 研究样本量有限，主要基于体外iPSC模型验证，需要更多临床样本验证 | 探究毛细血管畸形的血管发病机制及病理重塑过程 | 毛细血管畸形病变组织及iPSC分化的血管细胞 | 空间转录组学 | 血管畸形 | 空间全转录组分析,单细胞RNA测序,磷酸化蛋白质组学,免疫荧光染色 | iPSC分化模型,Tet-on系统基因调控 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,磷酸化蛋白质组数据,免疫荧光图像 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序,磷酸化蛋白质组学 | GeoMx | 空间全转录组分析平台 |
| 258 | 2025-11-15 |
KEGNI: knowledge graph enhanced framework for gene regulatory network inference
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03780-7
PMID:40983951
|
研究论文 | 提出一种知识图谱增强的基因调控网络推断框架KEGNI，利用图自编码器从单细胞RNA测序数据中推断细胞类型特异性基因调控网络 | 首次将知识图谱与图自编码器相结合用于基因调控网络推断，能够识别驱动基因并阐明不同细胞背景下的调控机制 | NA | 开发更准确的细胞类型特异性基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 图自编码器 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 259 | 2025-11-11 |
Single-cell sequencing analysis and multiple machine learning methods identified immune-associated SERPINB1 and CPEB4 as novel biomarkers for COVID-19-induced ARDS
2025-Sep-02, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-025-02016-9
PMID:40892227
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研究论文 | 通过单细胞测序分析和多种机器学习方法鉴定SERPINB1和CPEB4作为COVID-19诱发ARDS的新型免疫相关生物标志物 | 首次通过整合单细胞RNA测序和三种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)识别出COVID-19诱发ARDS的新型免疫相关生物标志物 | 研究基于公共数据集，需要进一步实验验证 | 识别COVID-19诱发急性呼吸窘迫综合征的有效分子生物标志物 | COVID-19诱发的急性呼吸窘迫综合征患者 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 加权基因共表达网络分析 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | RNA测序数据 | 来自三个公共数据集(GSE172114、GSE149878、GSE213313)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2025-11-03 |
Somatic TEK Mutation Identified in a Patient with Calvarial Venous Malformations
2025-Sep-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16101123
PMID:41153341
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研究论文 | 首次报道一例儿童颅骨静脉畸形患者携带体细胞TEK L914F突变及其分子机制 | 首次在儿童颅骨静脉畸形中发现体细胞TEK L914F致病突变 | 单一样本病例，需要进一步研究确定治疗靶点 | 探索颅骨静脉畸形的遗传基础 | 16岁女性颅骨静脉畸形患者 | 数字病理 | 血管畸形 | 外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA,RNA测序数据 | 1例患者（病变组织和血液DNA） | NA | 单细胞RNA测序,外显子组测序 | NA | NA |