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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-05 |
After the bite: cellular responses to mosquito blood feeding
2025-Sep, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2025.07.018
PMID:40803965
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析埃及伊蚊吸血后中肠和脂肪体组织的细胞反应 | 首次在单细胞水平系统表征蚊子吸血后不同组织的转录组和代谢组响应,揭示了新型细胞类型和昆虫特异性病毒感染动态 | NA | 研究蚊子吸血后的细胞响应机制 | 埃及伊蚊的中肠和脂肪体组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 222 | 2025-10-05 |
Plant metabolism: Zoom in to the single-cell level
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf375
PMID:40889291
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在植物代谢研究中的应用进展 | 整合单细胞转录组学与多组学技术揭示植物代谢产物的细胞类型特异性积累模式 | NA | 探索植物代谢产物在细胞水平上的积累规律及其调控机制 | 模式植物和药用植物 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像, 单细胞转录组学, 多组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 223 | 2025-10-05 |
Thymic Stromal Lymphopoietin Promotes Ozone-induced Inflammation in the Airway
2025-Sep-30, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0281OC
PMID:41025995
|
研究论文 | 本研究探讨了胸腺基质淋巴细胞生成素在臭氧诱导的气道炎症中的作用机制 | 首次揭示了cDC1来源的XCR1通过TSLP通路介导臭氧诱导的中性粒细胞气道炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证;部分基因表达机制仍需进一步阐明 | 阐明TSLP在臭氧诱导的气道炎症中的分子机制 | BALB/c小鼠、TSLP受体缺陷小鼠、C57BL/6J小鼠 | 免疫学 | 气道炎症 | 单细胞RNA测序, 细胞因子分析 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | 多种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 224 | 2025-10-05 |
The loss of microRNA-26b promotes aortic calcification through the regulation of cell-specific target genes
2025-Sep-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf117
PMID:40737220
|
研究论文 | 本研究首次揭示microRNA-26b缺失通过调控细胞特异性靶基因促进主动脉钙化的机制 | 首次发现miR-26b在主动脉钙化中的关键作用,结合单细胞转录组学和网络分析揭示细胞特异性靶点 | NA | 探索miR-26b在血管钙化中的潜在作用机制 | miR-26b基因敲除小鼠和主动脉瘤或瓣膜相关主动脉病变患者的主动脉组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | micro-PET/CT成像, 18F-氟化钠标记, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 网络分析 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | miR-26bKO小鼠和人类主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 225 | 2025-10-05 |
PD-L1(+) tumor-associated macrophages induce CD8(+) T Cell exhaustion in hepatocellular carcinoma
2025-Sep-29, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101234
PMID:41027276
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、空间分析和功能实验,揭示了PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌中诱导CD8阳性T细胞耗竭的关键作用 | 首次系统阐明PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞通过GM-CSF诱导途径促进CD8阳性T细胞耗竭的具体机制,并证明抗GM-CSF与抗PD-L1联合治疗的协同效应 | 研究样本量相对有限,主要基于手术标本,缺乏更大规模的前瞻性验证 | 阐明PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌免疫抑制微环境中的具体功能和机制 | 肝细胞癌患者肿瘤样本、体外培养的巨噬细胞和CD8阳性T细胞、小鼠原位肝癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光染色、体外功能实验、体内治疗模型 | 小鼠原位肝癌模型 | 单细胞转录组数据、空间分布数据、免疫荧光图像 | 113例肝细胞癌患者手术标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-05 |
SPP1-mediated crosstalk between macrophage and fibroblasts promotes benign airway stenosis
2025-Sep-26, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110627
PMID:41015147
|
研究论文 | 本研究通过大鼠模型和体外共培养系统揭示了M2巨噬细胞通过SPP1介导的信号通路促进良性气道狭窄的纤维化机制 | 首次系统阐明M2巨噬细胞通过SPP1-PI3K/AKT/mTOR信号轴驱动成纤维细胞活化在良性气道狭窄中的作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 阐明M2巨噬细胞在良性气道狭窄发病机制中的作用 | SD大鼠模型、人肉芽组织来源的成纤维细胞、正常气道组织成纤维细胞 | 病理生物学 | 良性气道狭窄 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、体外共培养 | 动物疾病模型、细胞共培养系统 | 基因表达数据、组织病理数据 | SD大鼠分为5个实验组(正常对照和建模后第1、4、7、14天) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2025-10-05 |
Comprehensive Immune Subtyping and Multi-Omics Profiling of the Tumor Microenvironment in Colorectal Cancer: Implications for Prognosis and Personalized Immunotherapy
2025-Sep-26, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
|
研究论文 | 通过多组学分析对结直肠癌肿瘤微环境进行免疫分型,并开发预后模型和探索微生物多样性作用 | 首次整合TME免疫分型、风险建模、单细胞分析和微生物组分析,揭示微生物多样性对免疫治疗反应的影响 | 需要外部数据集验证,样本量有限 | 识别结直肠癌免疫亚型,开发预后模型,探索微生物多样性在肿瘤进展中的作用 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,微生物组分析,免疫组织化学,qPCR | 非负矩阵分解,Cox回归,LASSO回归 | 多组学数据,单细胞RNA测序数据,微生物组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,微生物组分析 | NA | NA |
| 228 | 2025-10-05 |
A specific gene expression program underlies antigen archiving by lymphatic endothelial cells in mammalian lymph nodes
2025-Sep-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63543-7
PMID:40998762
|
研究论文 | 本研究揭示了淋巴结中淋巴内皮细胞通过特定基因表达程序实现抗原长期存档的机制 | 首次定义了淋巴内皮细胞抗原存档的特异性转录程序,并证明该程序能跨物种预测抗原存档能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仍需进一步扩展 | 探究淋巴内皮细胞实现持久抗原存档的分子机制及其调控特性 | 小鼠和人类淋巴结中的淋巴内皮细胞及树突状细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染 | 单细胞测序, 空间转录组学, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 多个时间点的免疫后淋巴结组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 229 | 2025-10-05 |
Integrated spatial transcriptomic profiling to dissect the cellular characteristics of tumor-associated tertiary lymphoid structures
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116250
PMID:40934085
|
研究论文 | 通过整合23种癌症的空间转录组数据构建泛癌TA-TLS图谱,解析肿瘤相关三级淋巴结构的细胞特征 | 首次构建泛癌TA-TLS图谱,发现成熟TLS中IgG+浆细胞优先富集,鉴定CCL19+血管周细胞作为淋巴组织组织细胞,揭示动脉内皮细胞通过Notch信号抑制获得高内皮静脉样表型 | 研究主要基于空间转录组数据分析,需要进一步实验验证机制 | 解析肿瘤相关三级淋巴结构的细胞特征和形成机制 | 23种癌症的肿瘤相关三级淋巴结构 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 23种癌症 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 230 | 2025-10-05 |
SPACE: Spatially variable gene clustering adjusting for cell type effect for improved spatial domain detection
2025-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf936
PMID:40985765
|
研究论文 | 提出SPACE框架,通过调整细胞类型混杂效应来基于空间模式对空间可变基因进行聚类,以改进空间域检测 | 无需基因簇数量、空间模式或细胞类型信息的先验知识,通过分组SVG并获取每组低维嵌入来保留特定模式、减少信号混合 | 未在摘要中明确说明 | 改进空间转录组分析中的空间域检测 | 空间可变基因(SVGs) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 231 | 2025-10-05 |
Constructing Gene Regulatory Network using Chatterjee's Rank Correlation with Single-cell Transcriptomic Data
2025-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.676530
PMID:41000795
|
研究论文 | 提出基于Chatterjee秩相关系数的单细胞转录组基因调控网络构建方法 | 使用非参数依赖度量Chatterjee秩相关系数,开发了数据驱动的检验阈值估计算法,并提出定向调控的新检验方法 | 未明确说明方法在特定生物场景下的适用性限制 | 从单细胞RNA测序数据中发现基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数统计模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 232 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomics in Inherited Retinal Dystrophies: Current Findings and Emerging Perspectives
2025-Sep-16, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16091088
PMID:41010033
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在遗传性视网膜营养不良研究中的应用现状与前景 | 系统总结了单细胞转录组技术如何揭示传统批量RNA测序无法检测的视网膜特定细胞群在疾病进展中的分子变化 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 探讨单细胞转录组学如何增进对遗传性视网膜营养不良疾病机制的理解并促进新治疗靶点识别 | 遗传性视网膜营养不良疾病模型和视网膜细胞 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2025-10-05 |
Dual Therapeutic Impact of AXL Inhibitor AB-329: Chemotherapy Sensitization and Immune Microenvironment Reprogramming in TNBC
2025-Sep-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26188896
PMID:41009462
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研究论文 | 本研究评估AXL抑制剂AB-329在三阴性乳腺癌中的双重治疗作用:化疗增敏和免疫微环境重编程 | 首次揭示AXL抑制剂AB-329不仅增强化疗疗效,还能通过增加NK细胞浸润重塑肿瘤免疫微环境 | 研究基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 评估AXL抑制剂AB-329在三阴性乳腺癌中的抗肿瘤疗效和免疫调节潜力 | 三阴性乳腺癌临床前模型,包括小鼠同种移植模型和人源化小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 234 | 2025-10-05 |
Innate and adaptive immune features associated with immune-related adverse events
2025-Sep-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012414
PMID:40930749
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研究论文 | 本研究通过多维度方法分析接受免疫检查点抑制剂治疗患者的免疫特征,揭示免疫相关不良事件的生物学机制 | 首次系统揭示irAE患者基线存在的自身免疫样促炎状态特征,并识别出驱动irAE发生的三个关键轴 | 样本量相对有限,研究主要关注外周免疫特征,未深入探讨组织特异性机制 | 探索免疫检查点抑制剂治疗中免疫相关不良事件的生物学基础 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,多重细胞因子检测,抗核抗体分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,细胞因子数据,抗体数据 | 162名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2025-10-05 |
Cancer Growth and Invasion Are Increased in the Tight Skin (TSK) Mouse
2025-Sep-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17182943
PMID:41008788
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研究论文 | 本研究通过使用紧皮(TSK)小鼠模型探究系统性硬化症微环境对癌症进展的影响 | 首次发现TSK小鼠可作为研究系统性硬化症与癌症关联的模型,并揭示了微环境中中性粒细胞-淋巴细胞比率升高和促纤维化细胞群富集的关键变化 | 研究仅使用了三种癌症细胞系,且机制研究仍需深入 | 探究系统性硬化症相关微环境对癌症进展的促进作用 | TSK小鼠和野生型小鼠,以及乳腺癌、黑色素瘤和卵巢癌细胞系 | 癌症生物学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TSK小鼠和野生型小鼠的多组肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2025-10-05 |
Predictors of response to CD19 chimeric antigen receptor T-cell therapy in large B-cell lymphoma: a consolidated review
2025-Sep-04, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000001188
PMID:41029962
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综述 | 本文系统回顾了CD19 CAR-T细胞疗法在弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效预测因素 | 整合了患者特异性、肿瘤内在性和治疗相关因素对CAR-T疗效影响的综合视角,并引入免疫分析、影像组学和单细胞转录组学等新型预测工具 | 基于现有文献的回顾性分析,缺乏前瞻性验证数据 | 探讨CD19 CAR-T疗法在弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效预测因素 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | 医学研究 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 免疫分析、影像组学、单细胞转录组学 | NA | 临床数据、基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 237 | 2025-10-05 |
Identification of ATG4B and NLRP1 as M1 Macrophage-Activating-Related Plasma Proteins in Systemic Lupus Erythematosus via Multi-Omics Approaches
2025-Sep-02, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000548167
PMID:40892678
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研究论文 | 通过多组学方法鉴定系统性红斑狼疮中与M1巨噬细胞活化相关的血浆蛋白ATG4B和NLRP1 | 整合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、贝叶斯共定位分析和体外M1巨噬细胞实验,首次系统鉴定与SLE相关的M1巨噬细胞活化血浆蛋白 | 研究样本来源有限,主要基于现有数据库和体外实验,需要进一步临床验证 | 鉴定系统性红斑狼疮相关的血浆蛋白,特别是与M1巨噬细胞活化相关的蛋白质 | 系统性红斑狼疮患者、原代人外周血单核细胞、THP-1细胞系 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,贝叶斯共定位分析,分子动力学模拟,分子对接 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 基于GWAS数据库和FinnGen数据库的SLE患者数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 238 | 2025-10-05 |
NAT10 regulates tumor progression and immune microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma via the N4-acetylated LAMB3-mediated FAK/ERK pathway
2025-Sep, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70045
PMID:40540648
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研究论文 | 本研究揭示了NAT10通过N4-乙酰化修饰LAMB3增强其mRNA稳定性,进而激活FAK/ERK通路促进胰腺导管腺癌进展和免疫抑制微环境的机制 | 首次发现NAT10在PDAC中通过乙酰化修饰LAMB3调控FAK/ERK通路和免疫微环境的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限 | 阐明NAT10在PDAC肿瘤恶性进展和肿瘤微环境中的作用机制 | 胰腺导管腺癌组织和细胞系,小鼠皮下肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 生物信息学分析,乙酰化RNA免疫沉淀,定量PCR,RNA免疫沉淀,Western blotting,单细胞RNA测序,多重免疫荧光,流式细胞术 | 动物肿瘤模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞测序数据 | PDAC组织和细胞系,小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 239 | 2025-10-05 |
Single-dose cathepsin L CRISPR nanotherapy mitigates PASC-like lung damage in hamsters
2025-Sep, Nano research
IF:9.5Q1
DOI:10.26599/NR.2025.94907695
PMID:41019839
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研究论文 | 开发针对组织蛋白酶L的单剂量CRISPR纳米疗法,可减轻仓鼠COVID-19急性后遗症相关的肺损伤 | 首次利用CRISPR-CasRx纳米疗法靶向宿主酶组织蛋白酶L,兼具抗病毒和促进肺泡修复的双重机制 | 研究仅在叙利亚仓鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发针对COVID-19急性后遗症肺损伤的新型治疗方法 | 叙利亚仓鼠 | 基因治疗 | COVID-19后遗症 | CRISPR-CasRx基因编辑,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 240 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing reveals no evidence for meiotic sex chromosome inactivation in the threespine stickleback fish
2025-Sep-29, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011875
PMID:41021609
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究三刺棘鱼减数分裂过程中性染色体基因表达模式 | 首次在三刺棘鱼中发现缺乏减数分裂性染色体失活现象,挑战了该过程在硬骨鱼类中的保守性假设 | 研究仅针对单一物种,需要更多硬骨鱼类研究验证结论的普适性 | 探究三刺棘鱼减数分裂过程中性染色体失活现象的存在与否 | 三刺棘鱼(Gasterosteus aculeatus)的性染色体(X和Y染色体) | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |