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当前共找到 803 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-05 |
Peripheral nerve-targeting and pain-promoting transcriptomic signatures in early Guillain-Barré syndrome
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.24.678413
PMID:41040175
|
研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序揭示早期吉兰-巴雷综合征中免疫细胞与周围神经系统相互作用的分子机制 | 首次在AIDP变异型GBS患者中结合单细胞和bulk RNA测序分析，发现特定白细胞亚群与周围神经细胞相互作用的分子机制 | 研究样本量有限，仅针对早期未治疗的AIDP变异型患者，需要进一步功能验证 | 阐明吉兰-巴雷综合征早期自身免疫损伤的驱动机制 | 早期未治疗的AIDP变异型GBS患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 吉兰-巴雷综合征 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 早期未治疗AIDP变异型GBS患者和健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-05 |
Dual-patterned pluripotent stem cells self-organize into a human embryo model with extended anterior-posterior patterning
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.25.678678
PMID:41040184
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研究论文 | 本研究通过双模式预分化人类多能干细胞，开发出具有前后轴模式化特征的人类胚胎模型 | 首次通过混合前后轴预分化干细胞实现自组织形成具有完整前后轴特征的人类胚胎模型 | 缺乏脊索结构和完整的背腹极性 | 建立更完善的人类胚胎发育模型以研究体轴形成机制 | 人类多能干细胞(hPSCs) | 发育生物学 | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 人类胚胎模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 223 | 2025-10-05 |
Mapping disease critical spatially variable gene programs by integrating spatial transcriptomics with human genetics
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.24.678397
PMID:41040309
|
研究论文 | 开发了一种名为Spacelink的统一框架，通过整合空间转录组学与人类遗传学数据来识别与疾病相关的空间可变基因程序 | 提出自适应混合数据驱动空间核模型，在整体组织和细胞类型分辨率下建模基因空间变异性，并引入有效空间变异性(ESV)指标 | NA | 解码连接组织架构与疾病遗传学的空间可变基因程序 | 人类健康组织(大脑皮层、淋巴结、肝脏)、小鼠器官发生图谱、阿尔茨海默病患者样本 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病,自闭症谱系障碍,复杂疾病 | 空间转录组学,遗传学分析 | 自适应混合空间核模型 | 空间基因表达数据,遗传数据 | 3个健康人类组织,32个阿尔茨海默病样本,8个小鼠发育阶段 | 10x Genomics,Nanostring | 空间转录组学 | 10x Visium,CosMx,Stereo-seq | Visium空间基因表达平台,CosMx空间分子成像仪,Stereo-seq空间转录组技术 |
| 224 | 2025-10-05 |
Regional Signaling Controls Stem Cell-Mediated Regeneration in an Invertebrate Chordate
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.25.678506
PMID:41040342
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研究论文 | 本研究通过比较海鞘再生与非再生片段，揭示了区域特异性信号如何调控干细胞介导的再生过程 | 首次在海鞘模型中系统比较再生与非再生环境的转录动态和信号差异，发现再生能力不仅取决于干细胞数量，更关键的是区域特异性信号调控 | 研究局限于单一无脊椎脊索动物模型，结论在其他系统中的普适性有待验证 | 探究局部信号如何调控干细胞在损伤后的激活和再生过程 | 海鞘（无脊椎脊索动物）的再生与非再生身体片段 | 发育生物学 | 组织损伤与再生 | 流式细胞术, scRNA-seq, 移植实验, 命运图谱 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 海鞘再生与非再生片段对比样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 225 | 2025-10-05 |
Maintenance of chronic neuroinflammation in multiple sclerosis via interferon signaling and CD8 T-cell-mediated cytotoxicity
2025-Sep-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7633686/v1
PMID:41041547
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研究论文 | 通过单细胞技术研究多发性硬化中慢性神经炎症的维持机制 | 首次结合单细胞转录组和T细胞受体测序揭示PRL相关干扰素信号和CD8+ T细胞毒性作用 | 样本量有限（34例MS患者），需要更大队列验证 | 探索多发性硬化慢性神经炎症的分子机制和潜在治疗靶点 | 多发性硬化患者和健康对照者的脑脊液和血液免疫细胞 | 单细胞组学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列, 蛋白质组数据 | 34例多发性硬化患者（17例未治疗，6例B细胞清除治疗）和5例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-05 |
Single cell-scale spatial transcriptome profiling of the adult cycling mouse uterus
2025-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677812
PMID:41040313
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研究论文 | 本研究使用空间转录组技术对成年小鼠子宫在生殖周期中的细胞类型和空间分布进行了高分辨率分析 | 首次在单细胞尺度上对成年小鼠子宫在四个不同动情周期阶段进行空间转录组分析，揭示了子宫细胞类型的空间分布特征 | 研究仅针对未生育的成年小鼠子宫，未涉及其他生理状态或疾病模型 | 揭示子宫在生殖周期中细胞重塑和再生的时空分子调控机制 | 成年未生育小鼠的子宫组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 覆盖四个动情周期阶段的成年小鼠子宫样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间转录组技术，提供8x8微米分辨率的空间转录信息 |
| 227 | 2025-10-05 |
Longitudinal single-cell analysis of glucagon-like peptide-2 treatment in patients with short bowel syndrome
2025-Sep-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.194497
PMID:40773292
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞分析探讨了GLP-2类似物治疗对短肠综合征患者肠道上皮细胞和免疫细胞动态变化的影响 | 首次在短肠综合征患者中进行为期一年的纵向单细胞RNA测序分析，并结合微生物组组成分析 | 样本量较小（仅5名男性患者），缺乏对照组 | 阐明GLP-2类似物在短肠综合征患者中的治疗机制 | 短肠综合征患者 | 单细胞组学 | 短肠综合征 | 单细胞RNA测序，微生物组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，微生物组数据 | 5名男性短肠综合征患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 228 | 2025-10-05 |
Defining the vascular niche of human adipose tissue across metabolic states
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.22.610444
PMID:41040169
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱揭示人类皮下脂肪组织中血管生态位的细胞异质性和在代谢疾病中的作用 | 首次构建了包含近70,000个血管细胞的人类皮下脂肪组织单细胞转录组图谱，鉴定出一种新型异质性内皮细胞亚群（sub-AdECs）并证实其通过内皮-间质转化形成 | 研究主要关注皮下脂肪组织，其他脂肪库的血管生态位特征可能不同 | 阐明人类脂肪组织血管生态位在代谢状态下的细胞组成和功能特征 | 65名个体的皮下脂肪组织血管细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖和糖尿病 | 单细胞RNA测序，全组织成像 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 65名个体，近70,000个血管细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 229 | 2025-10-05 |
Establishing a continuum of cell types in the visual cortex
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677893
PMID:41040235
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术揭示了小鼠视觉皮层L2/3层神经元连续体的发育机制及其在皮层连接中的作用 | 首次揭示视觉皮层神经元连续体通过遗传程序和视觉经验两阶段发育形成，并证明不同位置神经元优先投射到不同高级视觉区域 | 研究仅聚焦于小鼠视觉皮层L2/3层兴奋性神经元，未涉及其他皮层区域或神经元类型 | 理解视觉皮层神经元连续体的发育机制及其对皮层连接特异性的贡献 | 小鼠视觉皮层第2/3层兴奋性神经元 | 神经科学 | NA | 单核多组学测序(RNA-seq和ATAC-seq)、空间转录组学 | NA | 基因组学数据、表观基因组学数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 单核多组学测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 230 | 2025-10-05 |
Constitutive Interferon Epsilon Expression Shapes Antiviral Epithelial States in the Female Reproductive Tract and Intestine
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.15.623843
PMID:41040269
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研究论文 | 本研究揭示了干扰素ε(IFNε)在女性生殖道和肠道黏膜中作为组成性表达的抗病毒防御调节剂的作用机制 | 首次系统阐明IFNε在生殖道外组织(特别是肠道)中的功能，发现其在肠道绒毛尖端肠细胞中的特异性表达模式及其对III型干扰素表达的维持作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类组织验证有限；IFNε在其他黏膜组织的功能仍需进一步探索 | 阐明IFNε在不同黏膜表面(女性生殖道和肠道)的抗病毒防御功能 | 小鼠模型和原代人类女性生殖道来源细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 231 | 2025-10-05 |
Inferring Personalized Cell-Cell Communication Networks in Colorectal Cancer with Individualized Causal Discovery
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.20.677543
PMID:41040408
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研究论文 | 开发了一个整合计算框架，用于推断结直肠癌中个性化的细胞间通讯网络 | 结合嵌套层次狄利克雷过程模型和实例特异性贪婪快速因果推断方法，首次实现了患者特异性的细胞间通讯网络推断 | 方法依赖于单细胞RNA测序数据的质量和完整性，因果推断结果需要进一步实验验证 | 解决肿瘤异质性背景下个性化细胞间通讯网络推断的计算挑战 | 结直肠癌患者的单细胞和批量RNA测序数据 | 计算生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 嵌套层次狄利克雷过程模型，贪婪快速因果推断 | 基因表达数据，生存数据 | 超过625,000个细胞的大规模单细胞RNA测序数据，TCGA批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 232 | 2025-10-05 |
Network dynamics underlying activity-timescale differences between cortical regions
2025-Sep-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.19.677442
PMID:41000864
|
研究论文 | 本研究通过整合功能成像和空间转录组学数据，揭示了小鼠大脑皮层不同区域活动时间尺度的网络动力学差异 | 首次将功能成像与空间转录组学数据共同配准，并利用双光子成像和光遗传学技术比较了不同时间尺度皮层区域的网络响应特性 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果是否适用于其他物种尚需验证 | 探究大脑皮层不同区域网络动力学的差异及其机制 | 小鼠大脑皮层，特别是短时间尺度的视觉区域VISp和长时间尺度的前额叶区域MOs | 神经科学 | NA | 双光子成像，光遗传学，空间转录组学 | NA | 图像，转录组数据 | 小鼠大脑皮层样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 233 | 2025-10-05 |
Spatial omics enters the microscopic realm: opportunities and challenges
2025-Sep, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.05.002
PMID:40461389
|
综述 | 本文综述了微观分辨率空间转录组学(μST)的技术进展、当前挑战及未来发展方向 | 系统总结了微观分辨率空间转录组学的最新突破，强调了从组织水平到细胞和亚细胞水平的技术演进 | 面临每个微米级空间单元转录本发现稀疏、数据跨平台碎片化、缺乏可扩展且通用的分析方法等挑战 | 探讨微观分辨率空间转录组学领域的发展机遇和技术挑战 | 空间转录组学技术及其在微观尺度的应用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，测序和成像技术 | 人工智能(AI) | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | 微观分辨率空间转录组学(μST) |
| 234 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic analyses provide insights into SPP1+ TAM-mediated immune suppression and CD8+ T cell dysfunction in lung cancer
2025-Sep-29, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04180-3
PMID:41021043
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过A2AR信号通路介导CD8+ T细胞功能失调的免疫抑制机制 | 首次系统比较原发性和脑转移性肺癌中SPP1+ TAM与CD8+ T细胞的相互作用，并证实抗SPP1治疗可逆转T细胞耗竭 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究SPP1+肿瘤相关巨噬细胞在肺癌免疫抑制中的作用机制 | 肺癌原发灶和脑转移灶中的免疫细胞，特别是SPP1+ TAM和CD8+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光，qPCR，Western blot，共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，免疫荧光图像 | 肺癌原发和脑转移组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 235 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of ILF2 reveals its prognostic value and functional roles across pan-cancer
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03609-6
PMID:41021104
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示ILF2在泛癌中的预后价值和功能作用 | 首次对ILF2进行系统性泛癌分析，涵盖表达模式、预后意义、遗传变异、免疫浸润和治疗反应等多个维度 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证功能机制 | 阐明ILF2在泛癌中的生物学功能和临床意义 | 多种癌症类型和ILF2基因 | 生物信息学 | 泛癌分析（特别关注肝细胞癌） | 多组学分析，单细胞RNA测序 | 生物信息学分析模型 | 基因组数据，转录组数据，临床数据 | 多种癌症类型的多组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 236 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals NFATc1-mediated regulatory mechanisms of vascular smooth muscle cell osteogenic transformation in the osteosarcoma microenvironment
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03606-9
PMID:41021149
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化的NFATc1介导的调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示NFATc1在骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化中的分布特征和共表达网络 | 需要功能扰动实验来建立因果关系 | 研究骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化的调控机制 | 新鲜骨肉瘤组织中的血管平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | k-近邻/Louvain聚类 | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, NovaSeq 6000 | 10x Chromium Single Cell 3' v3试剂 |
| 237 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing data establishes a cuproptosis-related gene predictive signature in breast cancer
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03525-9
PMID:41021161
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，建立了乳腺癌中铜死亡相关基因的预测特征 | 首次系统评估铜死亡相关基因在乳腺癌中的预后意义，并构建了基于四个关键基因的预后特征模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 建立乳腺癌铜死亡相关基因的预后预测模型 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 预后特征模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO队列的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 238 | 2025-10-05 |
Identification of prognostic biomarkers associated with T and melanoma cell subpopulations in melanoma through integrating machine learning and multiomics
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03701-x
PMID:41021162
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和多组学数据，识别了与黑色素瘤预后相关的T细胞和黑色素瘤细胞亚群，并构建了新型预后风险评分模型 | 首次鉴定出MITF+T细胞和M2细胞亚群与黑色素瘤预后的关联，并采用72种机器学习算法组合开发共识预后模型 | NA | 识别黑色素瘤预后相关的细胞亚群并构建预后预测模型 | 黑色素瘤患者和相关的细胞亚群 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | 预后风险评分模型, 机器学习算法组合 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的多个数据集(GSE200218, GSE215121, GSE65904)和TCGA-SKCM数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因表达分析 | NA | NA |
| 239 | 2025-10-05 |
Cell division cycle 25 C (CDC25C) mediates cell-cycle progression and immune evasion in glioma
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03596-8
PMID:41021167
|
研究论文 | 本研究探讨CDC25C在胶质瘤细胞周期进展和免疫逃逸中的关键作用 | 首次系统揭示CDC25C通过调控CDK1-Cyclin B1轴促进胶质瘤细胞增殖并与免疫抑制微环境形成关联 | 研究主要基于细胞系实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 阐明CDC25C在胶质瘤进展和免疫逃逸中的分子机制 | 胶质瘤患者样本和U87MG胶质瘤细胞系 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | RNA测序, siRNA干扰, EdU染色, 流式细胞术, Western blot | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 多个公共数据库(TCGA, CGGA, GEO)的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 240 | 2025-10-05 |
Deciphering key chemotherapeutic drug targets within tyrosine metabolism for breast cancer and advancing a wide-ranging diagnostic strategy
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03577-x
PMID:41021173
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研究论文 | 本研究通过整合分析乳腺癌转录组数据，探索酪氨酸代谢在乳腺癌中的作用及其与化疗反应的关系 | 开发了酪氨酸代谢共表达预后模型，其性能优于传统临床指标，并识别出MAOA和MAOB两个关键基因作为连接免疫治疗和化疗的重要潜在生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索酪氨酸代谢在乳腺癌早期诊断和治疗中的作用机制 | 乳腺癌患者转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组分析，单细胞RNA测序，分子对接 | 机器学习算法Extra Trees (BO) | 转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |