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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
181 2025-10-06
Protocol for single-cell spatial transcriptomic profiling of cultured cells and engineered tissues without embedding or sectioning
2025-Sep-19, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文提出了一种无需包埋或切片即可对培养细胞和工程组织进行单细胞空间转录组分析的新方案 开发了适用于标准包埋切片不兼容的2D工程组织和细胞培养物的空间转录组分析新方法 NA 建立适用于特殊样本类型的空间转录组分析技术方案 2D工程组织和细胞培养物 空间转录组学 NA 空间转录组分析 NA 空间转录组数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 Visium HD Visium HD空间技术
182 2025-10-06
Multi-omics analysis reveals the attenuation of the interferon pathway as a driver of chemo-refractory ovarian cancer
2025-Sep-16, Cell reports. Medicine
研究论文 通过多组学分析揭示干扰素通路减弱是卵巢癌化疗耐药的关键驱动因素 首次发现化疗耐药卵巢癌中I型干扰素通路活性降低与缺氧通路增强的分子特征,并证实干扰素活性可独立预测化疗反应 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 探索卵巢高级别浆液性癌化疗耐药的分子机制 DECIDER观察性试验中化疗耐药卵巢癌患者的治疗前活检样本 多组学分析 卵巢癌 单细胞RNA测序,空间蛋白质分析,体外实验 NA 基因组学数据,转录组学数据,蛋白质组学数据 DECIDER临床试验注册患者(NCT04846933) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 NA NA
183 2025-10-06
Appendiceal B lymphocytes contribute to the pathogenesis of experimental colitis through fueling colonic CD4+ T polarization
2025-Sep-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示阑尾B淋巴细胞通过CCL20-CCR6轴迁移至结肠并促进CD4+ T细胞介导的Th1/Th17免疫反应,从而加剧实验性结肠炎 首次阐明阑尾B淋巴细胞通过特定迁移机制加剧结肠炎的具体病理机制,并提出阑尾口炎症可能代表溃疡性结肠炎的特殊亚型 研究主要基于动物模型,人类数据验证仍需进一步扩展 探究阑尾B淋巴细胞在实验性结肠炎发病机制中的作用 小鼠模型和溃疡性结肠炎患者的结肠组织 免疫学 溃疡性结肠炎 单细胞测序,免疫荧光共染色 NA 基因表达数据,组织图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
184 2025-10-06
Single-cell RNA sequencing: enhancing the predictive accuracy of tumor immunotherapy efficacy
2025-Sep-08, Essays in biochemistry IF:5.6Q1
综述 本文综述单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫治疗疗效预测中的应用现状与前景 系统阐述scRNA-seq技术如何提升免疫治疗疗效预测准确性,并探讨生物材料整合带来的新研究方向 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究进行理论分析 探讨单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫治疗领域的应用价值与发展方向 肿瘤微环境中的免疫细胞 生物信息学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
185 2025-10-06
Folliculin Deletion in the Mouse Kidney Results in Cystogenesis of the Loops of Henle via Aberrant TFEB Activation
2025-Sep, The American journal of pathology
研究论文 本研究通过构建肾单位特异性Folliculin基因敲除小鼠模型,揭示了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的关键作用 首次证明Folliculin基因缺失通过异常激活TFEB导致亨利氏袢囊肿形成,并阐明了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的特异性作用 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 探究Folliculin基因在整个肾单位中的具体功能及其在囊肿形成中的作用机制 肾单位特异性Folliculin基因敲除小鼠模型 分子生物学 肾脏疾病 单细胞RNA测序,基因敲除技术 基因敲除小鼠模型 基因表达数据,组织形态学数据 基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
186 2025-10-05
DUSP6 is upregulated in metastasis and influences migration and metabolism in pancreatic cancer cells
2025-Sep-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨DUSP6在胰腺癌转移中的作用及其对细胞迁移和代谢的影响 首次揭示DUSP6在胰腺癌转移中独立调控细胞迁移和代谢的双重功能 未阐明DUSP6调控迁移和代谢的具体分子机制 研究DUSP6在胰腺导管腺癌进展中的作用机制 胰腺导管腺癌细胞 癌症生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序,转录组分析,基因集富集分析,代谢分析 NA 基因表达数据,代谢数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
187 2025-10-05
Single-nucleus transcriptomics reveal the morphogenesis and artemisinin biosynthesis in Artemisia annua glandular trichomes
2025-Sep-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单核转录组和空间转录组技术构建了青蒿腺毛发育的高分辨率细胞图谱,揭示了青蒿素生物合成的空间机制 首次在单细胞分辨率上系统阐明青蒿腺毛发育的三个阶段及其代谢动态,并精确定位青蒿素主要在10细胞腺毛中的6个特定分泌细胞中产生 NA 阐明青蒿腺毛的形态发生和青蒿素生物合成机制 青蒿腺毛分泌毛状体 空间转录组学 疟疾 单核RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA NA
188 2025-10-05
Fatty acid metabolism in ischemic stroke: multi-omics biomarker discovery and therapeutic potential of GPR84
2025-Sep-30, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过多组学分析探索脂肪酸代谢在缺血性脑卒中中的作用,并鉴定出VIM、G0S2和GPR84作为新型诊断生物标志物 首次系统整合外周血转录组数据识别脂肪酸代谢相关差异基因,发现GPR84可作为治疗靶点,并通过分子对接预测潜在药物 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证生物标志物的临床适用性 探索脂肪酸代谢在缺血性脑卒中中的生物标志物和治疗靶点 缺血性脑卒中患者的外周血样本 生物信息学 缺血性脑卒中 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 广义线性模型, LASSO, 支持向量机, 随机森林 基因表达数据 多个公共数据集(GSE22255, GSE58294, GSE16561, GSE174574)的外周血样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
189 2025-10-05
MOADE: a multimodal autoencoder for dissociating bulk multi-omics data
2025-Sep-30, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出一种多模态自编码器MOADE,用于从批量多组学数据中解析细胞组成 通过多模态自编码器将多维特征关联,联合预测个性化多组学谱和细胞组成,利用内部非转录组参考和外部scRNA-seq数据构建伪批量数据 NA 开发能够解离批量多组学数据的计算方法 多组织类型的多组学数据 机器学习 NA 多组学分析,单细胞RNA测序 自编码器 多组学数据,转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,多组学 NA NA
190 2025-10-05
Urine proteomic signatures of kidney function decline after hospitalization
2025-Sep-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过尿液蛋白质组学分析识别与住院后肾功能下降相关的蛋白质标志物 首次在多个独立队列中系统鉴定与肾功能下降相关的尿液蛋白质标志物,并结合单细胞和空间转录组学确定其在肾脏细胞中的表达定位 样本量相对有限(174例患者),随访时间中位数为5.1年 探索尿液蛋白质组学在预测住院后肾功能下降中的机制和应用价值 急性肾损伤患者和非急性肾损伤患者 生物医学信息学 肾脏疾病 尿液蛋白质组学分析,单细胞转录组学,空间转录组学 加权相关网络分析 蛋白质组数据,转录组数据,临床数据 174例患者(来自ASSESS-AKI队列),4个独立验证队列包括肾脏精准医学项目 Olink 蛋白质组学,单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA Olink蛋白质组分析平台,检测2783种尿液蛋白质
191 2025-10-05
Th17 cells with regulatory phenotype are the main IL-17F and IL-26 producers in palmoplantar pustulosis
2025-Sep-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间分析揭示掌跖脓疱病中具有调节表型的Th17细胞是IL-17F和IL-26的主要生产者 首次在PPP中发现共表达调节标记(FOXP3, CTLA4, TIGIT)和IL17F/IL26的混合型regTh17细胞群,并揭示其与IL-36G+角质形成细胞的相互作用机制 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究主要基于转录组数据,需要功能实验进一步证实 解析掌跖脓疱病的细胞和空间结构特征,深入了解IL-17通路在该疾病中的作用机制 掌跖脓疱病患者和健康人的肢端皮肤组织(包括病变、非病变和健康皮肤) 单细胞生物学 皮肤炎症性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),空间转录组分析 NA 单细胞转录组数据,空间定位数据 未明确具体样本数量,包括病变、非病变和健康肢端皮肤 NA 单细胞RNA测序 NA NA
192 2025-10-06
A cross model spatial and single-cell atlas reveals the conserved involvement of osteopontin in polycystic kidney disease
2025-Sep-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过构建跨模型空间和单细胞图谱,揭示骨桥蛋白在多囊肾病中的保守作用机制 首次整合多个PKD小鼠模型的单细胞和空间转录组数据,系统揭示SPP1信号通路在疾病进展中的保守作用 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 阐明多囊肾病进展的细胞和分子机制 多囊肾病小鼠模型 数字病理学 多囊肾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 多个PKD小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
193 2025-10-05
Integrative Spatial Omics for Systems-Level Mapping of Pathological Niches
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种整合空间组学的多模态分析流程,用于系统级绘制病理微环境 首次整合MALDI成像质谱脂质组学、空间转录组学、多重免疫荧光显微镜和组织病理学染色,实现跨分子类别的空间分子分析 NA 开发空间组学整合方法以揭示疾病微环境中的空间分子特征 阿尔茨海默病的人脑组织和2型糖尿病的人胰腺组织 空间组学 阿尔茨海默病, 2型糖尿病 MALDI成像质谱, 空间转录组学, 多重免疫荧光显微镜, 组织病理学染色 NA 质谱数据, 转录组数据, 图像数据 NA NA 空间转录组学, 成像质谱, 多重免疫荧光 NA NA
194 2025-10-06
Reference-Informed Spatial Domain Detection Using Weak Supervision for Spatial Transcriptomics
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种参考信息引导的弱监督对比学习模型GraphScrDom,用于空间转录组数据的组织区域分割 首次将专家标注的空间网格/组织学图像涂鸦与参考单细胞RNA-seq数据中的细胞类型特异性基因表达谱相结合进行组织分割 仅使用有限的涂鸦标注,可能在某些复杂组织结构中存在分割精度限制 开发空间转录组数据的组织区域检测方法 空间转录组数据中的组织区域 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq 对比学习模型 空间基因表达数据,组织学图像 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
195 2025-10-05
Exhausted-like effector CD8 T cells mediate immune-stromal interactions at mucosal Chronic Graft-versus-Host Disease onset
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了耗竭样效应CD8 T细胞在口腔黏膜慢性移植物抗宿主病发病机制中的关键作用 首次在口腔黏膜cGVHD发病时鉴定出两个具有耗竭样表型的CD8 T细胞亚群,并揭示了它们从炎症前耗竭状态向终末耗竭状态的转变轨迹 样本量有限,Treg功能受损的确切机制尚未完全阐明 探究慢性移植物抗宿主病的免疫发病机制 口腔黏膜活检组织中的免疫细胞和基质细胞 免疫学 慢性移植物抗宿主病 单细胞RNA测序,伪时间分析 NA 单细胞转录组数据 在cGVHD发病时和移植后6个月收集的口腔黏膜活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
196 2025-10-06
Astrocytic glutamate regulation is shaped by adversity and glucocorticoid signalling
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞核和空间转录组学揭示了人类皮质星形胶质细胞的多样性及其在精神疾病和逆境暴露中的分子变化 首次在人类中系统揭示星形胶质细胞分子多样性及其在精神疾病中谷氨酸相关突触功能的特异性改变,并证实糖皮质激素信号直接调控谷氨酸信号 样本数量有限,未完全阐明性别差异的机制 探究逆境暴露和糖皮质激素信号如何通过星形胶质细胞影响精神疾病风险 人类皮质星形胶质细胞、精神疾病患者、人 pluripotent stem cell 来源的星形胶质细胞模型 空间转录组学 精神疾病 单细胞核转录组学, 空间转录组学, 组织学定量 2D和3D细胞模型 转录组数据, 空间定位数据 约145,000个星形胶质细胞, 超过20,000个组织学定量星形胶质细胞 NA 单细胞核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
197 2025-10-05
Intestinal epithelial Ceacam1 deficiency prevents steroid-refractory acute gut graft-versus-host disease
2025-Sep-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过多组学分析发现肠道上皮细胞CEACAM1缺失可预防类固醇难治性急性肠道移植物抗宿主病 首次揭示肠道上皮细胞CEACAM1在SR-Gut-aGVHD中的关键作用机制,并证明其缺失可通过调节T细胞亚群、肠道菌群和单核吞噬细胞来预防疾病 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 探究肠道上皮细胞CEACAM1在类固醇难治性急性肠道移植物抗宿主病发病机制中的作用 小鼠模型和人类样本中的肠道上皮细胞、免疫细胞及肠道菌群 免疫学 移植物抗宿主病 成像质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,ATAC测序,高维流式细胞术 NA 图像,单细胞转录组数据,表观基因组数据,流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,多组学分析 NA NA
198 2025-10-05
Single-Cell Profiling of Pediatric High-Grade Gliomas Reveals OPC-Like Subpopulations Driving Tumorigenic Lineage Transitions
2025-Sep, Pediatric discovery
研究论文 通过单细胞RNA测序分析儿童高级别胶质瘤,揭示少突胶质前体细胞样亚群在肿瘤发生和谱系转化中的关键作用 首次在弥漫性中线胶质瘤中发现表达EGFR的OPC样细胞作为潜在肿瘤起源,并鉴定PDGFRA作为DMG特异性分子标志物 研究排除了婴儿型半球胶质瘤,样本来源和数量可能存在限制 探究儿童高级别胶质瘤的肿瘤微环境特征和肿瘤细胞谱系转化机制 儿童高级别胶质瘤肿瘤细胞 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序, 下一代测序, 多重免疫荧光 Monocle2, CytoTRACE2, SCENT, scMetabolism 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
199 2025-10-05
Delving Into the Dialogue between Epigenetic Modifications and Immunometabolism in Cancer
2025-Sep, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
综述 探讨肿瘤免疫代谢与表观遗传修饰之间的相互作用及其在肿瘤微环境中的调控机制 系统阐述代谢产物作为表观遗传调节因子调控免疫细胞功能的新机制 肿瘤微环境的细胞复杂性、动态相互作用和时空异质性对研究构成重大挑战 解析肿瘤免疫代谢与表观遗传修饰的对话机制,探索新兴技术在该领域的应用前景 肿瘤微环境中的免疫细胞及其表观遗传调控 肿瘤免疫学 癌症 单细胞测序,空间组学,人工智能 NA 多组学数据 NA NA 单细胞测序,空间组学 NA NA
200 2025-10-05
Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals a Distinct Monocyte MIF/ANXA1 Signature Associated With Poor Responsiveness to ICS
2025-Sep, Allergy, asthma & immunology research
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了与哮喘患者吸入糖皮质激素治疗反应不良相关的单核细胞MIF/ANXA1特征 首次在单细胞水平识别出ICS治疗反应不良哮喘患者的特异性单核细胞分子特征,发现MIF-ANXA1信号通路失调是关键免疫特征 样本量较小(仅16例),需要更大规模研究验证 探究哮喘患者对吸入糖皮质激素治疗反应差异的细胞和分子机制 哮喘患者和健康对照者的外周血单个核细胞 单细胞组学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 16例样本(6例健康对照,6例ICS反应者,4例ICS反应不良者) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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