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当前共找到 827 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-12 |
Variational inference of single cell time series
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610389
PMID:39257806
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNOW的深度学习算法，用于解卷积单细胞时间序列数据，以分离时间依赖和独立成分 | 提出SNOW算法，能够构建有生物学意义的潜在空间、去除批次效应并生成真实的单细胞时间序列 | NA | 解决单细胞RNA测序时间序列数据分析中的挑战，如时间与细胞类型贡献的解卷积、区分真实动态与批次效应 | 单细胞RNA测序时间序列数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-02-11 |
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.673801
PMID:41000836
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研究论文 | 本研究探讨了脂氧素B4（LXB4）在眼压升高期间如何调节TRPV4通道激活的Müller胶质细胞反应性，并揭示了Müller胶质细胞自身是视网膜中LXB4的重要来源 | 首次证实Müller胶质细胞是视网膜中抗炎和神经保护性脂质介质LXB4的内源性来源，并揭示了TRPV4机械应力激活同时触发胶质增生和保护性脂质信号传导的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床样本中得到验证 | 探究LXB4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞激活和炎症，以及Müller胶质细胞自身是否参与视网膜脂氧素通路 | 小鼠Müller胶质细胞（原代和永生化细胞系）、小鼠视网膜组织 | 神经科学 | 青光眼 | RNA bulk-sequencing, qPCR, LC-MS/MS脂质组学, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 免疫染色, 免疫印迹 | NA | 转录组数据, 脂质组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-02-08 |
Single-Cell transcriptomic profiles of peripheral blood immune cells reveal early monocyte and platelet activation in the transition from high-risk states to clinical sepsis
2025-Sep-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17078-y
PMID:40998960
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了外周血免疫细胞在脓毒症高风险状态向临床脓毒症转变过程中，单核细胞和血小板早期激活的转录组重编程特征 | 首次在单细胞水平上系统描绘了脓毒症进展过程中单核细胞和血小板的动态转录组变化，并发现了一个在多种高风险人群中一致、早期且持续上调的核心基因特征（S100A8, S100A9, IFITM2, IFITM3） | 研究样本量相对有限，且主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证 | 阐明从脓毒症高风险状态向临床脓毒症转变过程中的免疫细胞转录组变化特征 | 健康对照、脓毒症高风险个体、临床脓毒症患者的外周血免疫细胞，以及独立队列中的极早产脓毒症婴儿和老年糖尿病患者 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照、高风险个体、临床脓毒症患者，以及独立队列的极早产婴儿和老年糖尿病患者（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-02-07 |
Hypertension-Induced Neurovascular and Cognitive Dysfunction at Single-Cell Resolution
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.14.648770
PMID:41000655
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在高血压小鼠模型中揭示了高血压诱导神经血管和认知功能障碍的早期分子机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示了高血压诱导的早期内皮细胞、中间神经元和少突胶质细胞脆弱性，为神经血管功能障碍和认知障碍提供了分子基础 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；样本时间点有限，未涵盖更长期的动态变化 | 探究高血压如何通过影响脑细胞导致神经血管和认知功能障碍的分子机制 | 高血压小鼠模型（由血管紧张素II诱导）中的新皮质细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 高血压小鼠模型在不同时间点（3天和42天）的新皮质样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-02-07 |
Recent Advances in Deciphering Normal and Diseased Aortic Valve Biology Using Transcriptomic Technologies
2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70835
PMID:40903834
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综述 | 本文综述了转录组学技术在揭示正常与病变主动脉瓣生物学机制方面的最新进展 | 强调了利用单细胞测序等转录组学技术解析主动脉瓣细胞可塑性、异质性及细胞间相互作用的新视角，并首次系统性地提出将健康基线特征作为疾病解读的参照标准 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，依赖已有研究的整合分析 | 通过整合转录组学发现，识别关键分子靶点以推动钙化性主动脉瓣疾病的有效疗法开发 | 主动脉瓣的正常与病变生物学机制，重点关注瓣膜内皮细胞与单核细胞的相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序（RNAseq），单细胞测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-02-03 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
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研究论文 | 本文报道了乳腺癌中肿瘤细胞通过去分化程序表达白细胞表面受体蛋白，称为“免疫拟态”，并探讨其与肿瘤进展和治疗抵抗的关系 | 首次提出乳腺癌细胞通过“免疫拟态”表达白细胞表面受体蛋白，并证明这赋予肿瘤细胞增殖优势，促进早期肿瘤生长 | 需要更多乳腺癌队列验证其预后价值，并评估与远端转移、生存期和治疗反应的相关性 | 研究乳腺癌细胞去分化程序中的免疫拟态现象及其对肿瘤进展的影响 | 人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织病理学标本、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺癌症模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据、图像、细胞系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-02-03 |
Single-cell and clonal analysis of AL amyloidosis plasma cells and their bone marrow microenvironment
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024719
PMID:40493887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和克隆分析，揭示了AL淀粉样变性患者浆细胞及其骨髓微环境的转录特征和功能改变 | 首次在治疗初治的AL淀粉样变性患者中，结合单细胞RNA测序和定量蛋白质组学，系统描绘了克隆性浆细胞及其骨髓微环境的转录景观，并识别出与蛋白质稳态相关的关键基因表达变化 | 研究样本量有限，且为横断面研究，未能追踪疾病进展或治疗后的动态变化 | 阐明AL淀粉样变性中克隆性浆细胞的功能特性及其与骨髓微环境的相互作用 | 新诊断、未经治疗的AL淀粉样变性患者和健康对照者的骨髓样本 | 单细胞组学 | AL淀粉样变性 | 5' 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 新诊断、未经治疗的AL淀粉样变性患者和健康对照者（具体人数未在摘要中明确给出） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5' 单细胞RNA测序 |
| 8 | 2026-02-02 |
Primary cilia in growth plates orchestrate long bone development
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2025.04.014
PMID:41613437
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研究论文 | 本研究揭示了初级纤毛在生长板中通过调控关键信号通路和干细胞命运，对长骨发育起关键作用 | 首次系统性地报告了初级纤毛存在于生长板的所有区域，并阐明了其通过介导Wnt等信号通路、调控骨骼干细胞不对称分裂来协调长骨发育的具体机制 | 研究主要基于条件性基因敲除小鼠模型，在人类骨骼疾病中的直接相关性仍需进一步验证 | 探究初级纤毛在长骨发育和修复中的作用机制 | 生长板软骨细胞、成骨细胞及骨骼干细胞 | 发育生物学 | 骨骼发育障碍 | 空间转录组学、条件性基因敲除、延时成像 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 空间转录组数据、显微成像数据 | 条件性敲除小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-01-28 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2025-Sep-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96713
PMID:40982369
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习工具DEGAS，通过单细胞RNA-seq数据识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 应用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据，首次识别出与2型糖尿病和肥胖相关的独特β细胞亚群，并验证了CDKN1C和DLK1基因的表达差异 | 研究仅基于现有单细胞RNA-seq数据，未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集以揭示复杂的多细胞相互作用 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群，以更好地理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗的相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据 | 来自健康和非糖尿病捐赠者的人类胰腺切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-01-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651101
PMID:40475445
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研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序协议，以提升胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 通过优化5'文库制备协议和靶向耗竭胰岛素转录本，提高了单细胞长读长测序的读长和转录本检测效率 | 单细胞长读长测序存在技术挑战，如读长不足和错误率较高 | 优化单细胞长读长测序协议，以增强胰腺胰岛中异构体的检测 | 胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-01-28 |
Investigating Gene Expression Noise Reduction by MicroRNAs and MiRISC Reinforcement by Self-Feedback Regulation of mRNA Degradation
2025-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637731
PMID:39990448
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研究论文 | 本研究通过数学建模和单细胞RNA-seq数据分析，探讨了microRNA通过负自反馈调控mRNA降解来降低基因表达噪声的机制 | 首次同时分析mRNA降解动力学和表达噪声，并证明通过mRNA降解的自反馈调控可以降低噪声 | NA | 研究microRNA介导的基因表达噪声减少机制 | microRNA诱导的沉默复合体（miRISC）及其靶向的mRNAs | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学建模 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-01-28 |
Integrated immune profiling of chordomas reveals spatially organized niches and functional heterogeneity
2025-Sep-11, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf213
PMID:41586579
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、T细胞受体分析和多重免疫荧光技术，揭示了脊索瘤的免疫细胞异质性、空间组织及功能状态 | 首次在脊索瘤中整合空间、转录组和TCR数据，揭示系统性抗肿瘤反应、肿瘤特异性TCR基序及纤维隔膜作为免疫相互作用枢纽 | 样本量相对较小（35个脊索瘤样本），作为超罕见癌症类型，结果可能需要更大队列验证 | 深入理解脊索瘤的免疫景观，为开发个性化免疫疗法提供基础 | 脊索瘤样本及其配对外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析，多重免疫荧光 | 加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据，空间分布数据，TCR序列数据 | 35个脊索瘤样本和6个配对肿瘤-PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-01-25 |
Spatially resolved transcriptomics of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf016
PMID:39847441
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术分析良性和恶性外周神经鞘瘤，揭示其空间和生物学异质性 | 首次将空间转录组学应用于外周神经鞘瘤，构建了空间细胞分化图谱，并整合了组织学特征和单细胞数据 | 作为一项试点研究，样本量有限，未来需要更大规模验证 | 确定外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性，以改善其分类和诊断 | 福尔马林固定石蜡包埋的患病外周神经组织样本 | 数字病理学 | 外周神经鞘瘤 | 空间转录组学 | 空间聚类和加权相关网络分析 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-01-24 |
Next-generation translational genomics for developing future crops
2025-Sep-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01704-z
PMID:40987990
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综述 | 本文综述了现代转化基因组学在作物育种中的全面进展，强调从传统方法向整合基因组、转录组和表型数据的下一代策略的转变 | 从单一基因组转向泛基因组以更好地捕获种内多样性，并从批量转录组分析转向单细胞转录组学，实现对基因调控和功能基因组学的细胞特异性洞察 | NA | 探索现代转化基因组学在作物育种中的应用，以加速作物改良并应对农业挑战 | 作物育种和未来作物开发 | 机器学习 | NA | 基因组学、转录组学、表型组学、单细胞转录组学 | 灵活模型（基于AI和机器学习） | 基因组、转录组、表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-01-24 |
Human brain cell types shape host-rabies virus transcriptional interactions revealing a preexisting pro-viral astrocyte subpopulation
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116159
PMID:40864551
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人脑细胞共培养中狂犬病毒与宿主细胞的转录相互作用，揭示了病毒基因表达受宿主细胞类型影响，并发现了一个预先存在的促病毒星形胶质细胞亚群 | 首次在单细胞水平上揭示了狂犬病毒如何通过抑制先天免疫来塑造人脑不同细胞类型的转录调控，并意外发现了一个独立于感染的促病毒星形胶质细胞亚群 | 研究基于体外共培养模型，可能无法完全模拟体内复杂的大脑环境；样本规模有限，促病毒星形胶质细胞亚群在人类大脑中的稀有性需要进一步验证 | 探究病毒-宿主细胞相互作用和先天免疫拮抗如何影响神经嗜性病毒在不同脑细胞类型中的感染动态 | 人脑细胞共培养体系中的狂犬病毒及其突变体 | 单细胞转录组学 | 狂犬病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-01-24 |
Integrative analysis identifies FERMT3 as a key regulator of metabolic reprogramming in keloid scarring and metabolic syndrome
2025-Sep-10, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01705-y
PMID:40928556
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研究论文 | 本研究通过整合分析瘢痕疙瘩和代谢综合征的公共微阵列数据集，识别出共享的转录组特征，并发现FERMT3作为调控代谢重编程和炎症表型的关键潜在调节因子 | 首次通过整合分析识别瘢痕疙瘩和代谢综合征之间的共享转录组特征，并利用单细胞RNA测序数据将关键基因FERMT3定位到特定细胞类型，通过体外实验验证其在代谢和炎症表型中的调控作用 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，缺乏体内或临床验证，且样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 识别瘢痕疙瘩和代谢综合征之间的共享致病机制和潜在治疗靶点 | 瘢痕疙瘩和代谢综合征患者的组织样本，以及巨噬细胞和成纤维细胞体外模型 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩和代谢综合征 | 微阵列分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、LASSO回归、机器学习、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外细胞实验 | LASSO回归、机器学习模型 | 微阵列数据、单细胞RNA测序数据 | 来自公共数据集的瘢痕疙瘩、代谢综合征及健康对照组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-01-24 |
Single-cell atlas of human liver and blood immune cells across fatty liver disease stages reveals distinct signatures linked to liver dysfunction and fibrogenesis
2025-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02255-y
PMID:40883571
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序图谱，揭示了人类脂肪肝疾病不同阶段中肝脏和血液免疫细胞的独特特征，并关联到肝功能障碍和纤维生成 | 提供了首个涵盖全谱MASLD/MASH阶段的配对外周血和肝脏细针穿刺样本的单细胞RNA测序图谱，识别了与疾病进展相关的阶段特异性免疫细胞特征 | 研究基于人类样本，但样本获取可能受限，且未详细讨论治疗干预的直接影响 | 探究MASLD/MASH中免疫细胞的阶段特异性作用，以识别新的治疗靶点 | 人类肝脏和血液免疫细胞，覆盖MASLD/MASH全谱阶段 | 数字病理学 | 脂肪肝疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 全谱MASLD/MASH人类队列的配对外周血和肝脏细针穿刺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-01-20 |
Regional Transcriptomic Architecture of Glioblastoma Reveals NUCB2 as a Key Orchestrator of Tumour Aggression and Immune Dysfunction
2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70814
PMID:40913484
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析，揭示了胶质母细胞瘤中NUCB2作为肿瘤侵袭和免疫功能障碍的关键调控因子 | 首次将NUCB2鉴定为胶质母细胞瘤中协调肿瘤细胞增殖和免疫调节功能的多功能调控因子，并揭示了其在肿瘤中心区域神经祖细胞样肿瘤细胞中的特异性上调 | 研究基于公共数据集，缺乏实验验证NUCB2在体内模型中的具体作用机制 | 阐明胶质母细胞瘤空间分子程序驱动肿瘤进展的机制 | 胶质母细胞瘤中心和外周区域的细胞群体 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个公共数据集中的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-01-16 |
Exploring therapeutic targets for hepatocellular carcinoma through druggable genes
2025-Sep-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000044627
PMID:41029168
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化等方法探索肝细胞癌的潜在治疗靶点 | 整合多种分析方法（包括两样本孟德尔随机化、基于汇总数据的MR、贝叶斯共定位和蛋白质-蛋白质相互作用网络）来优先排序药物靶点，并结合单细胞RNA测序验证细胞类型特异性表达模式 | NA | 识别与肝细胞癌风险相关的潜在治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化（MR）、基于汇总数据的MR、贝叶斯共定位、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-01-15 |
Cyclic Heptapeptide FZ1 Acts as an Integrin αvβ3 Agonist to Facilitate Diabetic Skin Wound Healing by Enhancing Angiogenesis
2025-Sep-25, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c01734
PMID:40910702
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研究论文 | 本研究揭示了环状七肽FZ1通过作为整合素αvβ3激动剂，激活FAK-AKT/ERK1/2信号通路并诱导VEGFC表达，从而促进糖尿病皮肤伤口血管生成和愈合 | 首次发现并鉴定出FZ1是首个靶向整合素αvβ3并具有促进糖尿病伤口愈合作用的肽类激动剂 | NA | 开发有效的治疗剂并深入理解糖尿病伤口愈合的调控机制 | 糖尿病皮肤伤口愈合 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, RNA干扰, 表面等离子体共振, 分子对接 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |