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当前共找到 541 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-05 |
Autophagy-related biomarkers in non-obstructive azoospermia: insights from transcriptomics and single-cell sequencing
2025-Aug, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03559-6
PMID:40587077
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞测序技术筛选非梗阻性无精子症中的自噬相关生物标志物 | 首次结合差异表达分析、WGCNA和机器学习算法筛选NOA的自噬相关生物标志物，并在单细胞水平验证其表达模式 | 研究主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 探索自噬相关基因在非梗阻性无精子症中的作用并筛选诊断生物标志物 | 非梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本 | 生物信息学 | 男性不育症 | 转录组测序, 单细胞测序, RT-qPCR, 机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个公共数据集（包括GSE9210和GSE145467） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 162 | 2025-09-14 |
Comparative spatial transcriptomics of pancreatic cancer with ductal and acinar origins in mouse models
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70416
PMID:40717219
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2025-10-05 |
spammR: an R package designed for analysis and integration of spatial multi-omic measurements
2025-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672472
PMID:40909542
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研究论文 | 开发了一个用于空间多组学数据分析和整合的R软件包 | 专门针对质谱衍生的空间组学数据集设计，能够处理小样本量、空间稀疏性、大量缺失值且无需先验知识的完全数据驱动分析 | 主要针对质谱平台数据，对其他空间组学技术的适用性可能有限 | 开发空间多组学测量数据的分析和整合工具 | 空间多组学测量数据，特别是质谱衍生的空间组学数据 | 生物信息学 | NA | 质谱分析，空间多组学技术 | NA | 空间多组学数据，质谱数据 | 小样本量数据集 | NA | 空间多组学，质谱分析 | NA | NA |
| 164 | 2025-10-05 |
Expanding canonical cortical cell type markers in the era of single-cell transcriptomics
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672469
PMID:40909566
|
研究论文 | 本研究通过分析近50万个单细胞核转录组数据，扩展了大脑皮层细胞类型的经典标记物，并开发了评估标记物表达保真度的统计框架 | 开发了评估细胞标记物表达保真度的统计框架，首次系统量化了标记物在目标细胞类型中的表达保真度和背景表达，并识别出具有改进保真度的新标记物 | 研究主要基于已有研究的单细胞数据，可能受到原始数据质量和注释准确性的限制 | 扩展和优化大脑皮层细胞类型的标记物，提高单细胞转录组数据中细胞类型注释的准确性 | 人类大脑皮层细胞类型 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 统计框架 | 单细胞转录组数据 | 近500,000个高质量单细胞核转录组图谱，来自19项研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 165 | 2025-10-05 |
Immune dysregulation in the prostates of C57BL/6Aire-/- mice mirrors that seen in human benign prostatic hyperplasia
2025-Aug-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669857
PMID:40832162
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研究论文 | 本研究通过建立C57BL/6 Aire-/-小鼠慢性前列腺炎症模型，揭示了其免疫失调特征与人类良性前列腺增生相似 | 首次在C57BL/6背景小鼠中建立转录因子缺陷型非消退性慢性炎症模型，并证明其免疫特征与人类BPH高度相似 | 研究仅使用小鼠模型，需要进一步验证在人类中的适用性；样本采集时间点有限（仅21天和35天） | 研究前列腺慢性炎症在良性前列腺增生发病机制中的作用 | C57BL/6 Aire-/-小鼠前列腺组织和人类良性前列腺增生组织 | 单细胞生物学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织学分析 | 动物疾病模型 | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | C57BL/6小鼠前列腺组织（21天和35天时间点），人类BPH scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 166 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptome and RNA Sequencing Reveal Immune-Related Markers of Preeclampsia
2025-Aug, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-01843-5
PMID:40216654
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研究论文 | 通过单细胞转录组和RNA测序技术研究子痫前期胎盘免疫微环境中的关键靶基因 | 首次结合单细胞测序和RNA测序技术系统分析子痫前期胎盘免疫微环境，发现巨噬细胞在疾病中的关键作用及其调控基因 | 研究样本量未明确说明，仅基于两个转录组数据集进行验证 | 探索子痫前期胎盘免疫微环境中的关键调控基因 | 子痫前期和非子痫前期胎盘样本 | 单细胞生物学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | Scenic包, 伪时序分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据, bulk RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-05 |
A Spatially Coordinated Keratinocyte-Fibroblast Circuit Recruits MMP9+ Myeloid Cells to Drive IFN-I-Driven Inflammation in Photosensitive Autoimmunity
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.19.670635
PMID:40894544
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学等技术，揭示了光敏性自身免疫疾病中角质形成细胞-成纤维细胞-髓系细胞的炎症级联反应机制 | 首次发现MMP9+ CD14+髓系细胞在光敏性自身免疫中的核心作用，并阐明其通过角质形成细胞-成纤维细胞轴被招募至真皮-表皮连接处的空间协调机制 | 研究主要基于体外模型和有限临床样本，需要更大规模的临床验证 | 阐明紫外线B暴露引发皮肤特异性自身免疫的分子机制 | 皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者的皮肤组织及体外细胞模型 | 数字病理学 | 自身免疫性皮肤病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学(seqFISH+), 体外建模 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确样本数量，包括患者皮肤组织和体外细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | seqFISH+空间转录组技术 |
| 168 | 2025-10-05 |
High-Resolution Spatial Transcriptomics Unveils Spatially Resolved Gene Modules and Fatty Acid Metabolism Dysregulation in Human Skin Aging
2025-Aug-23, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.011
PMID:40850650
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研究论文 | 通过高分辨率空间转录组技术揭示人类皮肤衰老过程中空间分辨的基因模块和脂肪酸代谢失调 | 首次利用高分辨率空间转录组技术构建人类眼睑皮肤衰老图谱，发现表皮脂肪酸合成减少是皮肤衰老的新特征 | 研究主要聚焦于眼睑皮肤，其他皮肤区域的变化可能有所不同 | 解析人类皮肤衰老的分子机制和空间特征 | 人类眼睑皮肤组织、原代人角质形成细胞、重建全层皮肤模型(T-Skin) | 空间转录组学 | 皮肤衰老 | 空间增强分辨率组学测序、多重FISH | NA | 空间转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-05 |
Integrated spatial and functional metabolic profiling identified the thick ascending limb as a mitochondrial vulnerability hub in acute kidney injury
2025-Aug-22, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.07.021
PMID:40850621
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研究论文 | 本研究通过整合空间和功能代谢分析，发现肾小管粗升支是急性肾损伤中的线粒体脆弱性枢纽 | 首次通过整合空间转录组学、单细胞转录组学和同位素示踪成像技术，系统揭示了肾小管粗升支在急性肾损伤中的特殊代谢脆弱性 | 研究主要基于动物模型和有限的临床样本，需要在更大规模的人群研究中进一步验证 | 探索急性肾损伤的代谢机制和肾脏能量代谢的空间分布特征 | 小鼠模型和人类肾移植患者的肾脏组织 | 空间生物学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 免疫荧光, 同位素示踪成像 | NA | 转录组数据, 图像数据, 代谢数据 | 小鼠模型和人类肾移植患者样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2025-10-05 |
FAHD1-mediated pyruvate metabolism in hepatocellular carcinoma: Multi-omics and causal genetic evidence
2025-Aug-14, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100494
PMID:40814172
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了FAHD1在肝细胞癌中调控丙酮酸代谢的因果机制及其在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 首次整合单细胞转录组学、空间定位和遗传因果推断方法，识别出丙酮酸高活性上皮亚群及其与肿瘤核心区域的代谢分区特征，发现FAHD1作为丙酮酸代谢的因果驱动因子 | 研究主要基于观察性数据和体外模型验证，需要进一步的体内实验和临床试验确认FAHD1靶向治疗的临床价值 | 探索肝细胞癌中丙酮酸代谢的因果调控机制及其在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的上皮细胞亚群、癌症相关成纤维细胞及其相互作用 | 多组学整合分析 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组、孟德尔随机化分析、分子对接 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 171 | 2025-10-05 |
Inhibition of astrocyte signaling leads to sex-specific changes in microglia phenotypes in a diet-based model of cerebral small vessel disease
2025-Aug-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03523-2
PMID:40783543
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研究论文 | 本研究通过饮食诱导的高同型半胱氨酸血症小鼠模型，探讨星形胶质细胞信号对微胶质细胞表型的性别特异性影响 | 首次揭示星形胶质细胞通过CN/NFAT信号通路对微胶质细胞表型调控存在性别二态性 | 样本量较小，需要更多生物学重复和更严格的统计分析来验证结果 | 研究星形胶质细胞信号在高同型半胱氨酸血症诱导的脑小血管病中对微胶质细胞表型的调控作用 | 7-8周龄雄性和雌性C57BL/6J小鼠 | 神经科学 | 脑小血管病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,Western blot | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 未明确具体数量的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2025-10-05 |
Loeys-Dietz syndrome subtypes exhibit distinct clinical behavior and aortic cellular transcriptomic profiles
2025-Aug, JTCVS open
DOI:10.1016/j.xjon.2025.06.013
PMID:40923070
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研究论文 | 本研究整合Loeys-Dietz综合征患者主动脉根部置换术后的纵向临床结果与主动脉平滑肌细胞转录组分析，探讨不同亚型特异性主动脉脆弱性的机制 | 首次通过单细胞RNA测序比较TGFBR1/2和SMAD3变异患者的主动脉平滑肌细胞表型，揭示亚型特异性基因调控模式 | 单机构研究，样本量有限（特别是单细胞RNA测序仅8例样本），随访时间中位6.16年 | 研究Loeys-Dietz综合征不同亚型的临床行为差异及其分子机制 | Loeys-Dietz综合征患者（62例，包括TGFBR1/2和SMAD3变异亚型） | 单细胞转录组学 | Loeys-Dietz综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和单细胞RNA测序数据 | 62例患者（其中59例基因确认），单细胞RNA测序分析8例（3例TGFBR1/2，5例SMAD3） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 173 | 2025-10-05 |
Segmentation Matters: Recognizing the Cell Segmentation Challenge in Spatial Transcriptomics
2025-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.25.672145
PMID:40909538
|
研究论文 | 系统评估空间转录组学中细胞分割方法的性能并提出改进策略 | 首次系统评估多种自动分割方法在人类感觉神经节神经元中的表现，并提出结合人工质量检查的改进方案 | 研究主要关注人类感觉神经节神经元，结果可能不适用于其他细胞类型或组织 | 解决空间转录组学中细胞分割准确性的挑战 | 人类感觉神经节神经元和非神经元细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，探针杂交技术 | 神经网络 | 空间转录组图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 174 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing of mouse cornea during wound healing after infrared laser irradiation
2025-Aug-29, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110615
PMID:40886962
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析红外激光损伤后小鼠角膜伤口愈合过程中的细胞动态变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术绘制小鼠角膜伤口愈合过程中的细胞图谱，揭示了三个新分化的上皮亚群和免疫细胞动态变化 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型，样本量相对有限 | 研究角膜伤口愈合过程中的细胞类型变化和动态相互作用 | C57BL/6J小鼠的角膜组织 | 单细胞组学 | 角膜损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12,956个细胞，来自10个健康角膜 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-10-05 |
Intercellular signaling reinforces single-cell level phenotypic transitions and facilitates robust re-equilibrium of heterogeneous cancer cell populations
2025-Aug-28, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02405-7
PMID:40877935
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据和计算模型，研究细胞间信号传导如何增强癌细胞表型可塑性并维持肿瘤异质性 | 开发多尺度推断方法整合单细胞转录组数据与数学模型，揭示细胞间通讯在表型可塑性和肿瘤异质性维持中的新机制 | 主要基于计算推断和模型模拟，需要实验验证来确认预测的生物学机制 | 探究细胞间信号传导在癌细胞表型可塑性和肿瘤异质性维持中的作用机制 | 小细胞肺癌和其他多种癌症类型的癌细胞 | 计算生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 计算建模 | 常微分方程模型, 网络推断模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-05 |
LXR-β regulates microglial efferocytosis and neuroinflammation in CPSP via STAT6 activation
2025-Aug-21, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.106089
PMID:40848997
|
研究论文 | 本研究探讨LXR-β通过激活STAT6调控小胶质细胞胞葬作用缓解脑卒中后中枢性疼痛的机制 | 首次揭示LXR-β通过p-STAT6信号通路调控小胶质细胞胞葬作用缓解神经炎症的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未进行临床验证 | 探究LXR-β调控小胶质细胞胞葬作用缓解中枢性卒中后疼痛的分子机制 | 脑出血患者单细胞测序数据、CPSP大鼠模型、BV2小胶质细胞系 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞测序, 行为学测试, 分子生物学检测 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 行为数据, 分子标记数据 | 大鼠模型和细胞系，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2025-10-05 |
Pediatric Atopic Dermatitis Exhibits Distinctive Patterns in JAK/STAT Pathway Activation and CD6-ALCAM Signaling
2025-Aug, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e26
PMID:40917795
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析比较了儿童和成人特应性皮炎的免疫特征差异 | 首次发现儿童特应性皮炎缺乏成人患者中观察到的JAK/STAT通路上调，并独特激活CD6-ALCAM通路 | 样本量较小（9例儿童和12例成人患者） | 识别儿童特应性皮炎的独特免疫特征并比较儿童与成人患者的差异 | 特应性皮炎患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9例儿童患者（6-16岁）和12例成人患者（20-60岁），以及年龄和性别匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-10-05 |
Patterns of Mitochondrial ATP Predict Tissue Folding
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.31.673364
PMID:40909554
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体ATP的空间分布模式可预测胚胎发育过程中的组织折叠 | 首次发现线粒体在顶端收缩过程中局部富集于上皮细胞顶端，且这种亚细胞模式可计算预测组织折叠 | 未详细探讨线粒体空间分布调控的具体分子机制 | 探究胚胎形态发生过程中化学能量的空间分布模式及其与组织折叠的关系 | 果蝇、鸡和小鼠胚胎的上皮组织 | 发育生物学 | NA | 时间序列成像、空间转录组学、耗氧率测量 | 计算预测模型 | 图像、基因表达、代谢数据 | 多物种胚胎样本（果蝇、鸡、小鼠） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-06 |
A simple liquid 3D cell culture paradigm models oxidative mitochondrial metabolism of epithelial breast cancer cells with relevance for lung metastases
2025-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.24.671623
PMID:40909564
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研究论文 | 本研究比较了两种3D细胞培养模型在模拟乳腺癌细胞代谢特性和肺转移能力方面的差异 | 开发了一种新型的液体3D细胞培养模型（EmC），能够更好地模拟乳腺癌细胞的氧化磷酸化代谢和肺转移特性 | 研究仅针对三种乳腺癌细胞系（SUM149、IBC-3、MDA-MB-468），需要更多细胞系验证 | 比较不同3D细胞培养模型对乳腺癌细胞代谢特性和转移能力的影响 | 乳腺癌细胞系（SUM149、IBC-3、MDA-MB-468） | 细胞生物学 | 乳腺癌 | 蛋白质组学、单细胞转录组学、代谢流分析、电子显微镜 | 3D细胞培养模型 | 图像、蛋白质组数据、转录组数据、代谢数据 | 三种乳腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2025-10-05 |
Rethinking large-scale phylogenomics with EukPhylo v.1.0, a flexible toolkit to enable phylogeny-informed data curation and analyses of diverse eukaryotic lineages
2025-Aug-27, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01770-25
PMID:40862604
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研究论文 | 介绍EukPhylo v.1.0工具包，用于真核生物系统发育基因组学数据管理和分析 | 开发了模块化、用户友好的流程，通过系统发育信息指导的污染去除和同源基因家族估计来改进真核生物系统发育分析 | 未明确说明工具在处理特定类型污染或极端数据情况下的局限性 | 解决真核生物系统发育基因组学分析中的数据污染和可重复性问题 | 真核生物、细菌和古菌的多样化谱系 | 生物信息学 | NA | 系统发育基因组学分析、单细胞测序、同源基因家族分析 | NA | 基因组序列数据、基因家族数据 | 1,000个多样化物种，包含约15,000个古老基因家族 | NA | 系统发育分析、基因家族估计、多序列比对 | EukPhylo v.1.0工具包 | 包含Hook数据库（约15,000个古老基因家族）和独立实用程序套件的模块化流程 |