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当前共找到 555 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-08 |
A novel multislice framework for precision 3D spatial domain reconstruction and disease pathology analysis
2025-08-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280281.124
PMID:40659497
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研究论文 | 提出一种名为STMSC的多切片联合分析框架，用于精确的三维空间域重建和疾病病理学分析 | 创新性地引入预校正机制和图注意力自编码器，整合H&E成像数据，实现精确的三维空间域识别，并捕获肿瘤发展的阶段内和阶段间异质性 | NA | 开发一种多切片联合分析框架，以实现精确的三维空间域重建并深入分析疾病病理 | 空间转录组数据、H&E组织图像及连续组织切片和病理数据集 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | 图注意力自编码器 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-05-02 |
Simulating paired and longitudinal single-cell RNA sequencing data with rescueSim
2025-Aug-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf442
PMID:40811017
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研究论文 | 介绍一种模拟配对和纵向单细胞RNA测序数据的新方法rescueSim | 首次在gamma-Poisson框架中引入样本间和受试者间变异性，实现对配对/纵向scRNA-seq数据的模拟 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够模拟配对/纵向scRNA-seq数据的方法，支持研究规划和功效分析 | 单细胞RNA测序数据中的时间依赖性转录组变化 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq模拟 | gamma-Poisson框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-05-01 |
RORγt eTACs mediate oral tolerance and Treg induction
2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250573
PMID:40298935
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研究论文 | 本研究揭示RORγt eTACs在口服耐受和调节性T细胞诱导中的关键作用 | 首次鉴定RORγt eTACs（也称为Janus或Thetis细胞）为口服耐受的关键中介细胞，并揭示其通过MHCII和整合素β8 (Itgb8)诱导食物特异性调节性T细胞的新机制 | 未提及具体限制 | 阐明口服免疫耐受的细胞和分子机制 | 小鼠模型中的RORγt谱系抗原呈递细胞（包括ILC3s、RORγt谱系树突状细胞和RORγt eTACs） | 免疫学 | NA | 单细胞测序、谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-05-01 |
The spatial landscape of glial pathology and T cell response in Parkinson's disease substantia nigra
2025-Aug-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62478-3
PMID:40759663
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研究论文 | 通过单核RNA测序、空间转录组学和T细胞受体测序，分析帕金森病黑质中的胶质细胞病理与T细胞反应的空间特征 | 首次揭示帕金森病黑质中CD8+ T细胞克隆扩增及其与CD44+星形胶质细胞的空间相关性，并发现CD44可能作为神经炎症的潜在治疗靶点 | 基于死后组织样本，可能无法完全反映疾病动态过程；功能验证仅限于体外培养的星形胶质细胞 | 阐明帕金森病中适应性免疫反应在大脑内的特征及其与胶质细胞病理的关系 | 帕金森病患者死后黑质组织中的T细胞和胶质细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序，空间转录组学，T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据，TCR序列数据 | 死后帕金森病患者黑质组织样本（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单核RNA测序，10x Visium空间转录组学，Illumina NovaSeq测序平台 |
| 105 | 2026-05-01 |
Cancer-associated fibroblasts and metabolic reprogramming predict pathologic response to neoadjuvant PD-1 blockade in resected non-small cell lung cancer
2025-Aug, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01067-4
PMID:40358847
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现，癌症相关成纤维细胞和代谢重编程可预测非小细胞肺癌新辅助PD-1阻断治疗后的病理反应 | 首次揭示了癌症相关成纤维细胞与T细胞之间的互作机制以及蛋氨酸循环代谢在预测免疫治疗应答中的潜在作用 | 未提及具体局限性 | 探索非小细胞肺癌新辅助免疫治疗耐药机制，寻找预测病理反应的生物标志物 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞亚群、T细胞亚群及其代谢特征 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 两个已发表的scRNA-seq数据集和5个免疫检查点抑制剂转录组队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-05-01 |
Integrative multi-omics reveal NSUN2 facilitates glycolysis and histone lactylation-driven immune evasion in renal carcinoma
2025-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00336-4
PMID:40413354
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研究论文 | 综合多组学分析揭示NSUN2通过促进糖酵解和组蛋白乳酸化驱动肾癌免疫逃逸 | 首次发现NSUN2通过m5C依赖方式促进线粒体糖酵解和组蛋白乳酸化，进而通过MYC/POM121/CD274轴导致PD-L1介导的免疫逃逸，揭示了糖酵解与免疫逃逸之间新的调控机制 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限、缺乏更大规模临床验证、机制细节有待深入研究 | 研究线粒体代谢基因在肾透明细胞癌中的预后和治疗潜力，并探索NSUN2在糖酵解和免疫逃逸中的作用 | 肾透明细胞癌患者临床队列、肿瘤细胞系、动物模型 | 机器学习 | 肾癌 | RNA测序、单细胞测序 | 机器学习算法（包括10种算法构建的预测模型） | RNA测序数据、单细胞测序数据 | 多个ccRCC临床队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-05-01 |
Mapping the role of cytokine signaling at single-cell and structural resolution in uveal melanoma
2025-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00337-3
PMID:40490526
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研究论文 | 该论文通过单细胞RNA测序和结构生物学方法，研究葡萄膜黑色素瘤中细胞因子信号的作用 | 结合单细胞RNA测序与AlphaFold 2结构预测技术，发现ISG20作为关键预后标志物和治疗靶点 | 样本量有限，仅涉及8个原发性和3个转移性样本 | 揭示葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的复杂性，探索新的治疗策略 | 葡萄膜黑色素瘤的原发性和转移性肿瘤组织 | 机器学习, 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Cox回归, LASSO | 基因表达数据 | 11个肿瘤样本（8个原发性，3个转移性） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-05-01 |
Tracing Early Migratory Neurons in the Developing Nose Using Contactin-2 (Cntn2) CreERT2
2025-08, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70021
PMID:40580015
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研究论文 | 本研究利用Contactin-2 (Cntn2) CreERT2小鼠系追踪发育中鼻部的早期迁移神经元 | 首次通过生成诱导型Cntn2CreERT2小鼠系，实现对发育嗅觉系统中特定神经元群体的时间可控嵌合操作 | 未提供具体局限性信息 | 开发一种有效工具用于追踪和功能调控源自嗅觉区域的早期迁移神经元 | 发育中小鼠鼻部的早期迁移神经元，包括GnRH-1神经元、先锋/终末神经神经元和嗅鞘细胞 | 神经生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-05-01 |
Peripheral immune imbalance in pediatric fulminant myocarditis revealed by single-cell sequencing and plasma proteomics
2025-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00343-5
PMID:40629105
|
研究论文 | 利用单细胞测序和血浆蛋白质组学揭示儿童暴发性心肌炎外周免疫失衡 | 首次通过单细胞RNA测序和血浆蛋白质组学系统性分析了儿童暴发性心肌炎急性期和恢复期的外周免疫特征，发现多种独特细胞类型（如调节性B细胞、MAIT细胞、适应性NK细胞和CD8Tpex细胞）以及趋化因子受体CXCR4和S100A家族基因的显著上调 | 未提供明确的局限性信息 | 阐明儿童暴发性心肌炎中外周免疫亚群和分子变化，为诊断和治疗策略提供见解 | 儿童暴发性心肌炎患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学、TCR和BCR分析、配体-受体分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 儿童患者样本，包括急性期和恢复期（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2026-04-29 |
Patterns of Mitochondrial ATP Predict Tissue Folding
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.31.673364
PMID:40909554
|
研究论文 | 该研究发现线粒体ATP的模式化分布能够预测组织折叠，揭示了胚胎发育中生物能量学的空间维度 | 首次发现化学能量（ATP）在形态发生过程中呈现空间模式，并且线粒体在细胞顶端富集是多种动物保守的机制，可利用这种亚细胞模式通过计算预测组织折叠 | 未明确说明研究的局限 | 研究胚胎发育期间线粒体ATP模式和空间分布与组织折叠之间的关系 | 果蝇、小鼠、鸡胚胎的上皮细胞 | 生物信息学 | NA | 时序成像、空间转录组学、氧耗率测量 | 计算模型 | 图像、转录组数据 | 涉及果蝇、小鼠和鸡胚胎等多种模式生物 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 111 | 2026-04-29 |
Macrophages drive a fibrogenic gene program of periductal fibroblasts in pediatric primary sclerosing cholangitis
2025-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.14.670195
PMID:40894696
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研究论文 | 本研究通过多组学方法，整合MERSCOPE空间转录组学、bulk RNA-seq和SomaScan蛋白质组学，揭示巨噬细胞与肝星状细胞在原发性硬化性胆管炎中驱动导管周围纤维化的细胞串扰机制 | 首次采用多组学整合分析（空间转录组、批量RNA-seq和蛋白质组）系统描绘PSC中导管周围纤维化区域的细胞-细胞相互作用，并鉴定出巨噬细胞中17个纤维化驱动基因和肝星状细胞中6个效应基因 | NA | 阐明儿童原发性硬化性胆管炎中导管周围纤维化的细胞串扰和分子机制 | 儿童原发性硬化性胆管炎患者肝组织和血浆样本 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学、bulk RNA-seq、SomaScan蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | MERSCOPE | MERSCOPE空间转录组平台 |
| 112 | 2026-04-29 |
Identification of immune signatures associated with both SARS-CoV-2 infection and lung transplantation
2025-Aug-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102262
PMID:40749682
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研究论文 | 通过分析新冠感染合并肺移植患者的免疫特征，发现其RBD特异性抗体显著降低，并利用单细胞RNA测序和多重细胞因子分析揭示了特定的细胞扩增和细胞因子变化 | 首次在COVID-19相关肺损伤合并肺移植患者中全面描述免疫特征，包括RBD抗体水平、单细胞转录组和细胞因子谱的综合分析 | 样本量有限且仅关注循环血液中的免疫细胞，未涉及肺部局部免疫环境 | 探究新冠感染合并肺移植患者的免疫学特征及其与疾病进展的关系 | COVID-19相关肺损伤接受肺移植的患者、非移植新冠患者、血清阴性对照 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序、多重细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据、细胞因子表达数据 | 多项组群对比研究，具体样本量未详细说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于白细胞单细胞RNA测序 |
| 113 | 2026-04-29 |
Senolytic treatment with fisetin reverses age-related endothelial dysfunction partially mediated by SASP factor CXCL12
2025-Aug-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.670216
PMID:40894771
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研究论文 | 使用单细胞转录组学评估非瑟酮（fisetin）抗衰老治疗对老年小鼠主动脉内皮细胞衰老和内皮功能障碍的影响，并发现SASP因子CXCL12是部分介导年龄相关性内皮功能障碍的关键因子 | 首次通过单细胞转录组学系统鉴定老年小鼠主动脉内皮细胞中SASP因子的表达变化，并验证非瑟酮可逆转CXCL12等SASP因子的表达，从而改善内皮功能 | 该研究主要基于小鼠模型，体外实验使用人内皮细胞，但尚需在人体中验证非瑟酮的抗衰老效果及其对CXCL12的调控作用 | 探究内皮细胞衰老相关信号通路、内皮来源SASP因子及其对年龄相关性内皮功能障碍的影响，并评估非瑟酮的干预效果 | 年轻（6月龄）和老年（27月龄）小鼠主动脉内皮细胞，以及培养的人内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共4组小鼠：年轻组和老年组（各含非瑟酮处理组和对照组），每组6只（原文未明确提及具体数量，但通常每组3-5只），另用体外分离的小鼠动脉和人内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2026-04-29 |
Dynamical systems theory as an organizing principle for single-cell biology
2025-Aug-01, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00565-3
PMID:40750599
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评论 | 本文提出将动力系统理论作为解释单细胞生物学的组织原则，旨在为单细胞转录组数据提供可解释的因果定量分析框架 | 将动力系统理论首次系统性地应用于单细胞生物学领域，为理解基因表达异质性和细胞轨迹提供因果定量视角 | 未具体阐述该理论在复杂生物系统中的实际验证和实施细节 | 建立单细胞基因表达数据的统一理论框架，融合动力系统理论以增强数据解释能力和医疗应用潜力 | 单细胞转录组数据中的基因表达异质性和细胞发育轨迹 | 机器学习 | NA | NA | 动力系统模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-04-28 |
Ongoing genome doubling shapes evolvability and immunity in ovarian cancer
2025-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09240-3
PMID:40670783
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research paper | 探讨全基因组加倍在高级别浆液性卵巢癌中作为持续突变过程对肿瘤演化性和免疫逃逸的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示全基因组加倍是卵巢癌中的持续性突变过程，并开发了基于突变的WGD计时方法doubleTime来解析其驱动肿瘤演化的具体模式 | 未提及具体局限性，但样本来源仅限于高级别浆液性卵巢癌患者，可能限制对其他癌症类型的推广性 | 研究全基因组加倍在肿瘤体细胞演化及免疫逃逸中的作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤样本 | machine learning | ovarian cancer | 单细胞全基因组测序、单细胞RNA测序、高分辨率免疫荧光显微镜 | NA | 基因组数据、转录组数据、图像数据 | 来自41名患者的70个高级别浆液性卵巢癌样本（30,260个肿瘤基因组） | NA | 单细胞全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2026-04-27 |
Morphodynamics of human early brain organoid development
2025-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09151-3
PMID:40533563
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研究论文 | 本研究建立了长期活体光片显微镜技术，用于追踪人脑类器官发育过程中的形态动力学，并结合多通道标记和计算解复用方法，揭示了细胞形态、组织状态转变及基质力学感应在大脑区域化中的作用 | 首次实现对未引导人脑类器官长达数周的活体光片显微成像，开发了双通道、多镶嵌和多蛋白标记策略结合计算解复用方法，同时量化多种亚细胞特征，并发现基质诱导的力学感应与WNT和Hippo信号通路相关 | 研究依赖于体外类器官模型，可能无法完全重现体内大脑发育的复杂性；实验条件（如基质存在与否）可能影响结果的可推广性 | 研究人脑早期发育中的形态动力学，特别是基质力学感应在大脑区域化中的作用 | 人类诱导多能干细胞衍生的未引导脑类器官 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 活体光片显微镜、单细胞转录组测序 | 计算解复用模型 | 图像, 转录组数据 | 多个未引导脑类器官样本，具体数量未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序, 显微镜成像 | NA | 活体光片显微镜系统，具体配置未指定 |
| 117 | 2026-04-25 |
Cholinergic neuronal activity promotes diffuse midline glioma growth through muscarinic signaling
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.031
PMID:40541184
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研究论文 | 发现中脑胆碱能神经元通过毒蕈碱受体信号促进弥漫性中线胶质瘤生长 | 首次揭示胆碱能神经元活动以环路依赖方式调节弥漫性中线胶质瘤增殖，不同于已知的谷氨酸能神经元作用 | 未提供明确局限性信息 | 探究中脑胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞及健康少突胶质前体细胞 | 神经科学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原发性弥漫性中线胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2026-04-25 |
Single-cell sequencing and spatial transcriptomics reveal FAS+ T cell and autophagy-related signatures predicting chemoimmunotherapy response in diffuse large B-cell lymphoma patients
2025-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2849-2
PMID:40374987
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研究论文 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示FAS+ T细胞和自噬相关标志物预测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者化疗免疫反应 | 首次整合单细胞测序和空间转录组学数据，构建基于自噬相关基因的预后模型，并发现FAS阳性T细胞在肿瘤微环境中的免疫激活作用与良好预后相关 | 研究样本量有限（单细胞测序仅4例DLBCL，空间转录组学10例），且缺乏独立的前瞻性验证队列 | 探索自噬相关基因在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的预后预测价值及免疫微环境特征 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和健康对照者 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞测序， 空间转录组学， 抗体芯片 | NA | 转录组数据， 单细胞测序数据， 空间转录组数据， 蛋白质组数据 | 1409例DLBCL患者（转录组），531例健康对照，4例DLBCL（单细胞测序），10例DLBCL（空间转录组），110例DLBCL（本地队列蛋白质组） | NA | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-04-25 |
Embryonic mast cells arise from the Cpa3-expressing precursors but not granulocyte-monocyte progenitors
2025-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2891-1
PMID:40419842
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序和遗传命运图谱模型，揭示胚胎肥大细胞起源于表达Cpa3的前体细胞而非粒细胞-单核细胞祖细胞 | 首次通过单细胞RNA测序和多种遗传命运图谱模型，明确鉴定出胚胎肥大细胞起源于Cpa3阳性前体细胞，而非Ms4a3或Elane阳性粒细胞-单核细胞祖细胞，并发现跨物种保守的发育程序 | 研究主要关注胚胎期皮肤肥大细胞的起源，对其他组织中肥大细胞的发育路径未充分探索；体内移植实验的样本量未明确说明 | 探究胚胎肥大细胞的起源和发育过程，明确其在胚胎造血中的前体细胞类型 | 小鼠胚胎（卵黄囊、胎肝、外周组织）及人类早期卵黄囊和胎肝样本 | 单细胞生物学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序、体外分化、体内移植实验、遗传命运图谱 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞RNA测序平台 |
| 120 | 2026-04-25 |
CCR5-mediated dynamic maintenance of resident memory T cells in the respiratory tract
2025-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2920-y
PMID:40459692
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研究论文 | 通过条形码谱系追踪和单细胞转录组分析，揭示了呼吸道中组织驻留记忆T细胞通过CCR5介导的肺到淋巴结逆向迁移维持的机制 | 首次发现肺引流淋巴结中存在与肺驻留记忆T细胞共享条形码和转录谱的CD69+CD103+病毒特异性CD8+ T细胞，并阐明CCR5-CCL5轴驱动肺到淋巴结的逆向迁移以维持T细胞驻留记忆 | 未知 | 探讨呼吸道中组织驻留记忆T细胞的维持机制及其与淋巴器官中记忆T细胞的关系 | 小鼠肺引流淋巴结和肺组织中的CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | 流感病毒感染 | 单细胞转录组分析、条形码谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 流感感染小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |