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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-04-27 |
Morphodynamics of human early brain organoid development
2025-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09151-3
PMID:40533563
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研究论文 | 本研究建立了长期活体光片显微镜技术,用于追踪人脑类器官发育过程中的形态动力学,并结合多通道标记和计算解复用方法,揭示了细胞形态、组织状态转变及基质力学感应在大脑区域化中的作用 | 首次实现对未引导人脑类器官长达数周的活体光片显微成像,开发了双通道、多镶嵌和多蛋白标记策略结合计算解复用方法,同时量化多种亚细胞特征,并发现基质诱导的力学感应与WNT和Hippo信号通路相关 | 研究依赖于体外类器官模型,可能无法完全重现体内大脑发育的复杂性;实验条件(如基质存在与否)可能影响结果的可推广性 | 研究人脑早期发育中的形态动力学,特别是基质力学感应在大脑区域化中的作用 | 人类诱导多能干细胞衍生的未引导脑类器官 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 活体光片显微镜、单细胞转录组测序 | 计算解复用模型 | 图像, 转录组数据 | 多个未引导脑类器官样本,具体数量未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序, 显微镜成像 | NA | 活体光片显微镜系统,具体配置未指定 |
| 62 | 2026-04-25 |
Cholinergic neuronal activity promotes diffuse midline glioma growth through muscarinic signaling
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.031
PMID:40541184
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研究论文 | 发现中脑胆碱能神经元通过毒蕈碱受体信号促进弥漫性中线胶质瘤生长 | 首次揭示胆碱能神经元活动以环路依赖方式调节弥漫性中线胶质瘤增殖,不同于已知的谷氨酸能神经元作用 | 未提供明确局限性信息 | 探究中脑胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞及健康少突胶质前体细胞 | 神经科学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原发性弥漫性中线胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-04-25 |
Single-cell sequencing and spatial transcriptomics reveal FAS+ T cell and autophagy-related signatures predicting chemoimmunotherapy response in diffuse large B-cell lymphoma patients
2025-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2849-2
PMID:40374987
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研究论文 | 通过单细胞测序和空间转录组学揭示FAS+ T细胞和自噬相关标志物预测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者化疗免疫反应 | 首次整合单细胞测序和空间转录组学数据,构建基于自噬相关基因的预后模型,并发现FAS阳性T细胞在肿瘤微环境中的免疫激活作用与良好预后相关 | 研究样本量有限(单细胞测序仅4例DLBCL,空间转录组学10例),且缺乏独立的前瞻性验证队列 | 探索自噬相关基因在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的预后预测价值及免疫微环境特征 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和健康对照者 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学, 抗体芯片 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 1409例DLBCL患者(转录组),531例健康对照,4例DLBCL(单细胞测序),10例DLBCL(空间转录组),110例DLBCL(本地队列蛋白质组) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2026-04-25 |
Embryonic mast cells arise from the Cpa3-expressing precursors but not granulocyte-monocyte progenitors
2025-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2891-1
PMID:40419842
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和遗传命运图谱模型,揭示胚胎肥大细胞起源于表达Cpa3的前体细胞而非粒细胞-单核细胞祖细胞 | 首次通过单细胞RNA测序和多种遗传命运图谱模型,明确鉴定出胚胎肥大细胞起源于Cpa3阳性前体细胞,而非Ms4a3或Elane阳性粒细胞-单核细胞祖细胞,并发现跨物种保守的发育程序 | 研究主要关注胚胎期皮肤肥大细胞的起源,对其他组织中肥大细胞的发育路径未充分探索;体内移植实验的样本量未明确说明 | 探究胚胎肥大细胞的起源和发育过程,明确其在胚胎造血中的前体细胞类型 | 小鼠胚胎(卵黄囊、胎肝、外周组织)及人类早期卵黄囊和胎肝样本 | 单细胞生物学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序、体外分化、体内移植实验、遗传命运图谱 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞RNA测序平台 |
| 65 | 2026-04-25 |
CCR5-mediated dynamic maintenance of resident memory T cells in the respiratory tract
2025-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2920-y
PMID:40459692
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研究论文 | 通过条形码谱系追踪和单细胞转录组分析,揭示了呼吸道中组织驻留记忆T细胞通过CCR5介导的肺到淋巴结逆向迁移维持的机制 | 首次发现肺引流淋巴结中存在与肺驻留记忆T细胞共享条形码和转录谱的CD69+CD103+病毒特异性CD8+ T细胞,并阐明CCR5-CCL5轴驱动肺到淋巴结的逆向迁移以维持T细胞驻留记忆 | 未知 | 探讨呼吸道中组织驻留记忆T细胞的维持机制及其与淋巴器官中记忆T细胞的关系 | 小鼠肺引流淋巴结和肺组织中的CD8+ T细胞亚群 | 免疫学 | 流感病毒感染 | 单细胞转录组分析、条形码谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 流感感染小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 66 | 2026-04-24 |
The kinase ERK plays a conserved dominant role in the heterogeneity of epithelial-mesenchymal transition in pancreatic cancer cells
2025-Aug-12, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.ads7002
PMID:40794842
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研究论文 | 本研究结合迭代间接免疫荧光成像和互信息分析,揭示了ERK激酶在胰腺癌细胞上皮-间充质转化异质性中的主导作用 | 通过单细胞水平的信号蛋白测量,发现ERK活性变异驱动EMT异质性,且MEK抑制时JNK可代偿,群体水平模型无法捕捉这些关系 | 未提及具体局限性 | 在信号蛋白水平理解胰腺癌细胞EMT异质性的分子机制 | 胰腺癌细胞及肿瘤 | 计算机视觉 | 胰腺癌 | 迭代间接免疫荧光成像 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2026-04-24 |
Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area specification
2025-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09010-1
PMID:40369074
|
研究论文 | 使用MERFISH技术与深度学习核分割方法,对人类胎儿皮层的单细胞空间发育进行详细解析,涵盖18百万个单细胞和8个皮层区域在7个发育时间点的数据 | 首次揭示了人类胎儿皮层六层结构在细胞构筑层出现前3个月就已通过兴奋性神经元亚型分层确立,并发现视觉皮层V1与V2区域间存在明显的二元边界,挑战了中期妊娠皮层区域化仅具有梯度过渡的传统观点 | 未明确提及,但可能受限于样本来源(胎儿组织)和MERFISH技术的检测通量,以及深度学习方法对细胞核分割的依赖 | 通过空间转录组学解析人类皮层发育过程中层和区域分子特化的机制 | 人类胎儿皮层组织 | 数字病理学 | NA | MERFISH, 单细胞RNA测序 | 深度学习(用于核分割) | 图像, 转录组数据 | 超过1800万个单细胞,涵盖8个皮层区域,7个发育时间点(未注明具体胎儿样本数) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | MERFISH | 多重错误容忍荧光原位杂交技术结合深度学习核分割 |
| 68 | 2026-04-23 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671333
PMID:40894744
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研究论文 | 本研究系统性地评估了整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)数据以改善批量RNA测序(bulk RNA-seq)反卷积性能的策略 | 首次系统性地比较了多种整合scRNA-seq和snRNA-seq数据的方法,并提出了针对不同场景的明确指导原则,包括基因过滤和条件变分自编码器(scVI)的应用 | 研究仅在四种组织类型中进行了验证,对于更广泛或更特殊的组织类型,方法的普适性有待进一步验证 | 提高批量RNA测序反卷积的准确性,特别是在缺乏完整scRNA-seq参考数据的情况下 | 批量RNA测序数据的细胞类型组成反卷积 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单核RNA测序(snRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) | 条件变分自编码器(scVI),非条件变分自编码器,主成分分析 | RNA测序数据 | 四种不同的组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-04-23 |
Dual states of murine Bmi1-expressing intestinal stem cells drive epithelial development utilizing non-canonical Wnt signaling
2025-Aug-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.014
PMID:40262610
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道发育早期Bmi1表达干细胞的功能及其通过非经典Wnt信号调控增殖状态的动态过程 | 首次在Lgr5表达干细胞出现之前鉴定出Bmi1细胞作为功能性干细胞,并发现其通过非经典Wnt信号调控增殖状态向慢周期状态的转变 | 研究主要基于小鼠模型,人类肠道发育中的类似机制仍需验证 | 探究肠道上皮发育过程中干细胞亚群的动态调控机制 | 小鼠肠道发育早期的Bmi1表达干细胞 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-04-21 |
PTEN restrains SHH medulloblastma growth through cell autonomous and nonautonomous mechanisms
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.31.667996
PMID:40766638
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研究论文 | 本研究探讨PTEN基因在SHH亚型髓母细胞瘤中通过细胞自主和非自主机制抑制肿瘤生长的作用 | 揭示了PTEN缺失通过促进细胞增殖、增强祖细胞状态以及减少巨噬细胞浸润和细胞毒性,加速SHH髓母细胞瘤生长的双重机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者中的直接验证尚需进一步研究 | 探究PTEN基因在SHH髓母细胞瘤生长中的调控机制及其对疾病预后的影响 | SHH亚型髓母细胞瘤小鼠模型及小脑颗粒细胞前体细胞 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-04-19 |
Healing of lytic lesions and restoration of bone health in multiple myeloma through sclerostin inhibition
2025-Aug-22, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00699-4
PMID:40847323
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研究论文 | 本研究探讨了通过抑制硬化素(Scl-ab)来促进多发性骨髓瘤(MM)患者溶骨性病变愈合和恢复骨骼健康的潜力 | 首次在临床前模型和患者样本中系统评估了Scl-ab对MM骨骼疾病的修复作用,并证实其与抗癌药物联用时的协同抗肿瘤效果 | 研究包含回顾性临床分析,需要前瞻性临床试验进一步验证;动物模型结果向人类转化的有效性需更多验证 | 探究硬化素抑制剂(Scl-ab)能否促进MM骨骼修复、增强抗癌疗效并改善患者骨骼健康 | 多发性骨髓瘤小鼠模型、患者来源样本(包括缓解期患者) | NA | 多发性骨髓瘤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、临床回顾性数据 | 临床前动物模型及患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-04-17 |
ChemPerturb-seq screen identifies a small molecule cocktail enhancing human beta cell survival after subcutaneous transplantation
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.002
PMID:40562034
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研究论文 | 本研究开发了一种结合化学筛选与单细胞RNA测序的ChemPerturb-seq平台,用于系统分析小分子处理后人源β细胞的分子变化,并发现了一种能增强皮下移植后β细胞存活的小分子混合物 | 创新性地将化学筛选与单细胞RNA测序结合,开发了ChemPerturb-seq平台,实现了高通量分析小分子对细胞分子层面的影响,并发现了性别特异性的小分子混合物效果 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未在人体临床试验中证实效果;且发现的小分子混合物对雌性小鼠有效,但对雄性小鼠效果有限,存在性别差异 | 旨在通过化学筛选和单细胞分析,发现能增强人源β细胞在皮下移植后存活和功能的小分子混合物 | 人源β细胞和原代胰岛 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | AI驱动的网站分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,涉及人源β细胞和原代胰岛的体外及小鼠体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-04-15 |
RESCUE: recovery of idiosyncratic expression patterns in spatial transcriptomics
2025-Aug-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.11.669542
PMID:40832184
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RESCUE的计算方法,用于恢复空间转录组学数据中被现有分析方法遗漏的独特表达模式 | RESCUE能够捕获脆弱或代表性不足的细胞类型、亚细胞结构(如神经突)和细胞外表达等现有方法可能忽略的重要表达模式 | NA | 开发一种计算方法来改善空间转录组学数据分析的完整性和准确性 | 空间转录组学数据,特别是来自蜜蜂大脑的MERFISH数据及其他ST数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,MERFISH | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学,MERFISH | NA | NA |
| 74 | 2026-04-12 |
Development of Drug-resistant Cell Lines for Experimental Procedures
2025-08-12, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68957
PMID:40889269
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研究论文 | 本文介绍了用于实验程序的耐药细胞系的开发方法及其在癌症治疗研究中的应用 | 系统描述了通过逐步增加药物浓度诱导耐药细胞系的方法,并强调这些模型可用于多种高通量分析和体内外实验 | 未提及具体癌症类型或药物种类,方法描述较为通用,缺乏特定实验数据支持 | 开发耐药细胞系以研究癌症治疗中的耐药机制并寻找克服治疗失败的策略 | 癌症细胞系(具体类型未指定) | NA | 癌症(未指定具体类型) | 细胞活力测定、非线性回归分析、微阵列、单细胞测序 | NA | 实验数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-04-12 |
Using R, Seurat, and CellChat to Analyze a Single-Cell Transcriptomics Dataset of Mouse Skin Wound Healing
2025-08-01, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67266
PMID:40824857
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方法学论文 | 本文提供了一个使用R、Seurat和CellChat分析小鼠皮肤伤口愈合单细胞转录组数据集的逐步可视化工作流程 | 为缺乏生物信息学背景的伤口愈合科学家提供了一个图形化编码环境下的详细、可视化单细胞分析协议,旨在降低技术门槛 | 主要是一个方法学指南,依赖于已发表的数据集,未提出新的生物学发现或算法 | 旨在使更多伤口愈合科学家能够在自己的实验室中直接使用生物信息学工具,以促进对其自身单细胞数据集的深入分析以及对已发表数据集的更广泛再分析 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的细胞 | 生物信息学 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-04-04 |
Cigarette Tar Enhanced ECs Pyroptosis via CAMKII/Drp1/mtDNA: Novel Insight Into the Mechanism of Plaque Erosion
2025-Aug, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2025.03.015
PMID:40866045
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研究论文 | 本研究揭示了吸烟通过诱导内皮细胞焦亡促进斑块侵蚀的新机制 | 首次发现香烟焦油通过CAMKII/Drp1/mtDNA通路增强内皮细胞焦亡,为斑块侵蚀机制提供新见解 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究吸烟导致斑块侵蚀的分子机制 | 载脂蛋白E基因敲除小鼠、人冠状动脉内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-04-01 |
Spatial transcriptomics: a bibliometric analysis with large language model on English literatures
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf553
PMID:41139313
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文献计量分析 | 本文利用大语言模型对空间转录组学领域的英文文献进行了文献计量分析 | 首次结合大语言模型对空间转录组学领域进行文献计量分析,使分析结果更全面和具体 | 分析仅基于Web of Science数据库的1197篇文献,可能未涵盖所有相关研究 | 分析空间转录组学领域的研究趋势、期刊分布和关键词,以识别关键研究领域 | 2015年至2024年间Web of Science数据库中的1197篇空间转录组学相关出版物 | 生物信息学 | 癌症 | 文献计量分析,大语言模型 | 大语言模型 | 文本 | 1197篇出版物 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 78 | 2026-04-01 |
Quantum Annealing for Enhanced Feature Selection in Single-Cell RNA Sequencing Data Analysis
2025-Aug-15, ArXiv
PMID:40832053
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研究论文 | 本研究提出了一种基于量子退火的QUBO方法,用于单细胞RNA测序数据中的特征选择,以识别与细胞分化及抗癌药物耐药性相关的关键基因 | 首次将量子退火赋能的二次无约束二进制优化(QUBO)应用于单细胞RNA测序数据的特征选择,能够揭示传统方法可能遗漏的复杂基因表达模式 | 未提及具体的数据集规模、量子硬件实现细节或与传统方法的定量比较结果 | 开发增强单细胞RNA测序数据分析与解释的特征选择方法 | 人类细胞分化系统和抗癌药物耐药性研究中的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 量子退火赋能的QUBO(二次无约束二进制优化) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-03-31 |
Single-cell analysis of ovarian myeloid cells identifies age-associated changes in macrophages and signaling dynamics†
2025-Aug-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf122
PMID:40459236
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和流式细胞术分析年轻与年老小鼠卵巢中的髓系细胞,揭示了与年龄相关的巨噬细胞亚群变化及信号通路动态 | 首次在年老小鼠卵巢中鉴定出独特的Cx3cr1lowCd81hi巨噬细胞亚群,并发现ANNEXIN和TGFβ信号通路的显著改变,为卵巢衰老相关的炎症和纤维化提供了新机制 | 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本,且样本量相对较小 | 探究卵巢衰老过程中髓系细胞的功能特征和信号动态变化 | 年轻(3个月)和年老(14-17个月)小鼠卵巢中的CD45+ CD11b+髓系细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | RNA序列数据, 流式细胞数据 | 年轻和年老小鼠卵巢样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-03-31 |
The Advance of Single-Cell RNA Sequencing Applications in Ocular Physiology and Disease Research
2025-08-04, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15081120
PMID:40867565
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在眼生理学和疾病研究中的应用进展 | 系统总结了scRNA-seq如何通过单细胞水平的高分辨率分析,揭示眼部细胞异质性、识别疾病特异性基因谱,并推动新型生物标志物和治疗靶点的发现 | 作为一篇综述文章,未提出新的实验数据或方法,主要基于现有文献进行归纳总结 | 回顾和总结scRNA-seq技术在眼生理学和病理学研究中的应用进展与潜力 | 眼部组织,包括与近视、眼表和角膜疾病、青光眼、葡萄膜炎、视网膜疾病及眼部肿瘤相关的各类细胞 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |