单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-05-30	Landscape of spatial disruption of homeostasis in the middle temporal gyrus of epileptic patients 2025-Aug-01, Brain research IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.brainres.2025.149688 PMID:40350141	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）技术，探讨癫痫患者中颞回（MTG）的细胞和空间稳态破坏	结合单细胞和空间转录组数据，揭示了癫痫患者中颞回的细胞层特异性基因表达模式和空间动态变化，并识别了与空间稳态破坏相关的关键基因	NA	阐明癫痫患者中颞回的细胞和空间稳态破坏机制	癫痫患者的中颞回（MTG）组织	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST）	空间转移张量（STT）算法	基因表达数据、空间转录组数据	NA
42	2025-05-25	NR2F2 and its contribution to lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma 2025-Aug, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111814 PMID:40262715	研究论文	探讨NR2F2在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的作用及其与肿瘤干细胞特性的关系	首次将NR2F2与口腔鳞状细胞癌的淋巴结转移联系起来，并揭示其在肿瘤干细胞亚群中的关键作用	研究主要基于细胞和动物模型，临床样本验证仍需进一步扩大	研究NR2F2在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的分子机制	口腔鳞状细胞癌患者样本、肿瘤细胞系和动物模型	肿瘤生物学	口腔鳞状细胞癌	单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、Western blot、功能实验、体内实验	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据、影像数据	未明确说明患者样本数量，包含细胞系和动物模型
43	2025-05-25	Atlas of temporal molecular pathological alterations after traumatic brain injury based on RNA-Seq 2025-Aug, Experimental neurology IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115270 PMID:40268159	研究论文	该研究通过RNA测序技术，系统描绘了创伤性脑损伤（TBI）后不同时间点的分子病理变化图谱	首次利用RNA-seq和WGCNA方法，全面揭示了TBI进展过程中时间依赖性的分子病理变化，并重点分析了细胞焦亡在神经炎症过程中的关键作用	研究仅使用了C57/BL6小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步研究	揭示创伤性脑损伤后时间依赖性的分子病理变化机制	C57/BL6小鼠脑组织	生物信息学	创伤性脑损伤	RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光	WGCNA, Mfuzz	RNA测序数据	C57/BL6小鼠在10个时间点（0h至7d）的脑组织样本
44	2025-05-15	The role of lactate metabolism in retinoblastoma tumorigenesis and ferroptosis resistance 2025-Aug, Tissue & cell IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.tice.2025.102893 PMID:40188688	研究论文	本研究探讨了乳酸代谢在视网膜母细胞瘤肿瘤发生和抗铁死亡中的作用	首次揭示了乳酸代谢通过上调MCT1促进视网膜母细胞瘤细胞存活和抗铁死亡的新机制	研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证不足	阐明乳酸代谢相关基因表达谱对视网膜母细胞瘤发生和抗铁死亡的影响	视网膜母细胞瘤细胞系和患者组织样本	肿瘤代谢	视网膜母细胞瘤	单细胞RNA测序	小鼠异种移植模型	转录组数据	患者视网膜组织和视网膜母细胞瘤组织的单细胞RNA测序数据
45	2025-05-12	Revealing NAPSA's role in ccRCC: Insights from single-cell RNA sequencing 2025-Aug-05, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2025.149478 PMID:40194687	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示了NAPSA在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的表达特征及其潜在作用	首次在单细胞水平上研究了NAPSA在ccRCC中的表达模式及其与肿瘤微环境的相互作用	样本量较小(7个肿瘤样本和2个正常样本)，且需要进一步实验验证NAPSA的具体作用机制	探索NAPSA在ccRCC中的分子特征及其临床意义	透明细胞肾细胞癌(ccRCC)组织和细胞系	数字病理学	肾癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	7个肿瘤样本和2个正常样本
46	2025-05-12	Lamb1-mediated Wnt/β-catenin signaling pathway drives endothelial angiogenesis for fracture healing 2025-Aug-05, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2025.149481 PMID:40221061	research paper	该研究探讨了Lamb1通过Wnt/β-catenin信号通路促进内皮细胞血管生成以加速骨折愈合的机制	揭示了Lamb1在骨折愈合过程中通过激活Wnt信号通路上调VEGFA表达，进而促进内皮细胞生长、迁移和血管生成的新机制	研究主要基于体外实验和公共数据集分析，缺乏体内动物模型的验证	探究内皮细胞在骨折愈合中的作用及其分子机制	内皮细胞（ECs）和骨折愈合过程	分子生物学与细胞生物学	骨折	scRNA-seq, qRT-PCR, 细胞免疫荧光染色, transwell实验	NA	单细胞RNA测序数据, 体外实验数据	公共数据集中的单细胞数据，具体样本数量未明确说明
47	2025-05-12	RNA methylation: A new perspective in osteoarthritis research 2025-Aug-05, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2025.149518 PMID:40254081	综述	本文系统总结了RNA修饰在骨关节炎(OA)中的主要类型及其调控作用，并探讨了未来研究方向	聚焦RNA甲基化在OA中的动态调控功能，提出利用单细胞测序解析RNA修饰动态变化的新方向	未涉及具体实验验证数据，主要基于现有文献进行理论分析	探索RNA修饰在骨关节炎发病机制中的作用及其诊疗潜力	软骨细胞自噬、炎症反应及关键信号通路	表观遗传学	骨关节炎	单细胞测序	NA	文献数据	NA
48	2025-05-12	Immunogenic cuproptosis in cancer immunotherapy via an in situ cuproptosis-inducing system 2025-Aug, Biomaterials IF:12.8Q1 DOI:10.1016/j.biomaterials.2025.123201 PMID:40020502	research paper	该研究探讨了铜死亡在结直肠癌免疫治疗中的免疫原性及其与免疫治疗的联合应用	首次评估了铜死亡在结直肠癌中的免疫原性，并开发了一种原位铜死亡诱导系统以增强免疫治疗效果	研究主要集中于结直肠癌，其他癌症类型的适用性尚待验证	探索铜死亡在癌症免疫治疗中的潜在应用	结直肠癌(CRC)细胞及肿瘤微环境(TME)	癌症免疫治疗	结直肠癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 体外和体内实验	NA	基因表达数据, 实验数据	内部队列和其他独立队列的样本
49	2025-05-02	RORγt eTACs mediate oral tolerance and Treg induction 2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20250573 PMID:40298935	research paper	该研究揭示了RORγt eTACs在口服耐受和Treg诱导中的关键作用	首次证实RORγt eTACs是口服耐受诱导的必要细胞群体，并发现其独特的Itgb8表达特征	研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚需验证	阐明口服耐受的细胞机制和关键调控细胞	RORγt谱系抗原呈递细胞（包括ILC3s、树突状细胞和R-eTACs）	免疫学	自身免疫疾病	谱系追踪、单细胞测序	小鼠基因敲除模型	基因表达数据、细胞表型数据	未明确说明具体样本数量，使用基因工程小鼠模型
50	2025-05-01	The mechanism by which MALAT1/CREG1 regulates premature rupture of fetal membrane through autophagy mediated differentiation of amniotic fibroblasts 2025-Aug, Non-coding RNA research IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.ncrna.2025.04.004 PMID:40297152	研究论文	探讨MALAT1/CREG1通过自噬介导的羊膜成纤维细胞分化调节胎膜早破的机制	首次揭示MALAT1通过与CREG1相互作用调节自噬相关分子表达，进而影响羊膜成纤维细胞分化的机制	研究主要基于体外实验和部分临床组织验证，缺乏大规模临床试验验证	探索通过干预成纤维细胞解决羊膜修复相关的科学问题，为临床治疗胎膜早破提供依据	胎膜组织和原代羊膜成纤维细胞	分子生物学	产科疾病	单细胞测序、Sirius染色、荧光染色、拉曼光谱、WB、PCR、RNA Pulldown、RIP、分子对接	NA	分子生物学数据	未明确说明样本数量，涉及临床组织和原代细胞
51	2025-04-22	Single-cell transcriptomic reveals network topology changes of cancer at the individual level 2025-Aug, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2025.108401 PMID:40037020	研究论文	本研究通过单细胞转录组学揭示了癌症在个体水平上的网络拓扑结构变化	首次在个体水平上分析细胞类型特异性网络的拓扑特征在不同病理状态下的变化	研究依赖于公开的scRNA-seq数据集，样本量有限	探索不同病理状态下细胞类型特异性网络的拓扑特征变化	癌症和溃疡性结肠炎患者的单细胞RNA测序数据	生物信息学	癌症	scRNA-seq	PPI网络和共表达网络	单细胞RNA测序数据	四个公开的scRNA-seq数据集
52	2025-04-22	Multiple omics-based machine learning reveals specific macrophage sub-clusters in renal ischemia-reperfusion injury and constructs predictive models for transplant outcomes 2025-Aug, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2025.108421 PMID:40086342	研究论文	本研究通过多组学机器学习方法揭示了肾缺血再灌注损伤中特定的巨噬细胞亚群，并构建了移植结果的预测模型	创新性地将基因表达矩阵转化为独特的图形像素模块，并应用先进的计算机视觉处理算法构建DGF预测模型，同时使用10种机器学习算法的111种组合开发移植存活的预测特征	研究主要基于GEO数据库的scRNA-Seq数据，可能受到数据来源的限制	分析巨噬细胞在IRI中的发育和分化特征，识别IRI的特定分子亚型，并建立DGF和移植存活的稳健预测策略	肾缺血再灌注损伤(IRI)中的巨噬细胞亚群	数字病理学	肾脏疾病	scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, qRT-PCR, WB, IHC	深度学习算法, 随机生存森林算法	基因表达数据, 图像数据	GEO数据库的scRNA-Seq数据和小鼠IRI模型