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当前共找到 541 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-12-13 |
The Genomics of Aging at the Single-Cell Scale
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在研究衰老相关细胞变化中的应用，总结了衰老对哺乳动物器官中细胞类型特异性种群的影响 | 通过整合近期单细胞研究，系统性地总结了衰老对哺乳动物全身细胞类型特异性种群的影响，填补了系统性理解衰老相关细胞变化的知识空白 | NA | 阐明衰老对哺乳动物器官中细胞类型特异性种群变化的影响，为衰老及相关疾病提供潜在治疗靶点 | 哺乳动物器官中的细胞类型特异性种群 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2025-12-12 |
Cancer-associated fibroblast-derived fibulin-5 promotes radioresistance in non-small-cell lung cancer
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116018
PMID:40711881
|
研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过分泌Fibulin-5促进非小细胞肺癌放疗抵抗的机制 | 首次发现CAFs来源的Fibulin-5通过整合素αVβ5受体激活Src-STAT3通路，下调ACSL4，抑制辐射诱导的铁死亡，从而介导放疗抵抗 | NA | 鉴定预测放疗疗效的CAFs表达分子并阐明非小细胞肺癌的放疗抵抗机制 | 非小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-12-11 |
Recent developments in omics studies and artificial intelligence in depression and suicide
2025-Aug-11, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03497-y
PMID:40790016
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综述 | 本文系统综述了与抑郁症和自杀相关的转录组学、非编码RNA和人工智能领域的最新进展 | 整合了高通量测序技术、多组学数据与人工智能方法，探讨了空间转录组学等新研究途径，并提出了未来研究方向 | NA | 寻找抑郁症和自杀的新分子通路、有效生物标志物和药物靶点，以提供有效的诊断、预后和治疗方案 | 重度抑郁症患者、自杀相关样本（血液样本、人尸检脑组织）以及各种动物模型 | 自然语言处理, 机器学习 | 抑郁症 | 高通量测序技术, 全基因组分析 | NA | 组学数据（转录组、表观基因组、蛋白质组） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2025-12-10 |
Deciphering Precursor Cell Dynamics in Esophageal Preneoplasia via Genetic Barcoding and Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.637920
PMID:40060545
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研究论文 | 本研究通过结合遗传条形码技术与单细胞RNA测序，追踪食管癌前病变细胞的谱系，揭示了高可塑性祖细胞样群体及其在肿瘤早期发生中的作用 | 首次将遗传条形码与单细胞RNA测序结合用于食管癌前病变细胞谱系追踪，并开发了新的评分系统来映射高可塑性细胞 | NA | 阐明食管癌前病变细胞的起源、轨迹及其在早期肿瘤发生中的动态 | 食管癌前病变细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 遗传条形码，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2025-12-09 |
Metabolic reprogramming of arachidonic acid in clear cell renal carcinoma promotes an immunosuppressive microenvironment by activating MDK signaling pathway
2025-Aug-13, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01807-8
PMID:40802073
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，探讨了透明细胞肾细胞癌中代谢重编程与免疫耗竭的关系，并揭示了花生四烯酸代谢异常通过激活MDK信号通路促进免疫抑制微环境的机制 | 首次结合单细胞和批量RNA测序技术，构建了ccRCC的代谢亚型，并发现花生四烯酸代谢异常通过MDK信号通路驱动免疫抑制，为免疫治疗提供了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于测序数据和体外实验，缺乏大规模临床队列验证，且免疫治疗模型的体内效果需进一步确认 | 探究透明细胞肾细胞癌中代谢重编程与免疫耗竭的关联机制 | 透明细胞肾细胞癌患者样本及肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组化, Western blotting, ELISA, 细胞共培养 | Scissor算法, 细胞间通讯分析 | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 未明确样本数量，但涉及ccRCC患者分组及细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-12-06 |
Identification of prognostic genes related to T cell proliferation in papillary thyroid cancer based on single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing data
2025-Aug-02, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01826-5
PMID:40753315
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别与T细胞增殖相关的预后基因，以评估其在甲状腺乳头状癌中的预后价值和分子机制 | 结合单细胞和批量RNA测序数据，识别出KLRB1、TSHZ2和TRABD2A作为新的预后基因，并构建风险模型，为PTC的预后和治疗策略提供新见解 | 研究基于公共数据库数据，可能受样本异质性限制，且未进行实验验证 | 评估T细胞增殖相关基因在甲状腺乳头状癌中的预后价值和潜在分子机制 | 甲状腺乳头状癌患者 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Cox回归, 机器学习算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-12-05 |
Direct oHSV Infection Induces DC Maturation and a Tumor Therapeutic Response
2025-Aug-19, Viruses
DOI:10.3390/v17081134
PMID:40872847
|
研究论文 | 本文探讨了溶瘤性单纯疱疹病毒直接感染树突状细胞如何促进其成熟并增强抗肿瘤免疫反应 | 揭示了oHSV直接感染DC而非仅通过肿瘤细胞感染来激活抗肿瘤免疫的新机制，为癌症免疫治疗提供了新视角 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体中进行验证，且oHSV感染DC为流产性感染，其长期效果和安全性需进一步评估 | 探究溶瘤性单纯疱疹病毒通过直接感染树突状细胞增强抗肿瘤免疫治疗的机制 | 溶瘤性单纯疱疹病毒、树突状细胞、CT-2A胶质瘤细胞、T细胞 | 免疫治疗 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-12-05 |
Identification of Novel Lactylation-Related Biomarkers for COPD Diagnosis Through Machine Learning and Experimental Validation
2025-Aug-18, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13082006
PMID:40868258
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研究论文 | 本研究通过机器学习筛选和实验验证，鉴定出CBR1和PRDX1作为与乳酸化相关的慢性阻塞性肺疾病诊断生物标志物 | 首次将乳酸化修饰与COPD诊断生物标志物发现相结合，并采用多算法集成筛选与单细胞转录组学分析进行验证 | 研究主要基于公共数据集和体外CSE诱导模型，需要在更大临床队列和体内模型中进一步验证 | 鉴定COPD中临床相关的乳酸化相关生物标志物并探究其在疾病发病机制中的潜在作用 | 慢性阻塞性肺疾病患者基因表达数据、香烟烟雾提取物诱导的COPD细胞模型 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 转录组学分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、免疫荧光 | LASSO回归、支持向量机递归特征消除、加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 来自GSE21359和GSE76925数据集的COPD患者样本，以及GSE173896单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-12-04 |
APOBEC3B Promotes SARS-CoV-2 Through Activation of PKR/eIF2⍺ and AMPD2 Dysregulation
2025-Aug-28, Viruses
DOI:10.3390/v17091176
PMID:41012606
|
研究论文 | 本研究揭示了APOBEC3B通过激活PKR/eIF2α通路和调控AMPD2表达，在SARS-CoV-2感染中发挥促病毒作用 | 首次发现A3B在重症COVID-19患者中过表达，并通过整合应激反应和嘌呤代谢调控网络促进SARS-CoV-2感染 | 研究主要基于细胞模型和测序数据，缺乏体内实验验证；不同细胞系中A3B的作用机制存在差异 | 阐明APOBEC3B在SARS-CoV-2感染中的分子机制及其与COVID-19严重程度的关联 | 支气管肺泡灌洗液细胞、Caco-2细胞、A549-ACE2细胞、重症与轻症COVID-19患者样本 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、基因敲降、机器学习预测 | Transformer（Geneformer） | RNA测序数据、临床样本数据 | 未明确样本数量，包括重症与轻症COVID-19患者的BALF细胞及多种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-12-04 |
Enhanced M2 Polarization of Retinal Microglia in Streptozotocin-Induced Diabetic Mice upon Autoimmune Stimulation
2025-Aug-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13092049
PMID:41007615
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病环境对实验性自身免疫性葡萄膜视网膜炎（EAU）发展的影响以及眼内小胶质细胞的激活状态 | 首次在链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型中，结合单细胞RNA测序技术，揭示了糖尿病环境下小胶质细胞向抗炎M2表型极化的转变及其对EAU的抑制作用 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且糖尿病模型的特定诱导方式可能影响结果的普适性 | 探究糖尿病环境如何影响自身免疫性疾病EAU的发病机制及小胶质细胞的激活状态 | 野生型小鼠和链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫组织化学、眼底镜检查、光学相干断层扫描（OCT） | NA | 基因表达数据、图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及野生型和糖尿病小鼠组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-12-03 |
Coxiella burnetii strains elicit distinct inflammatory responses in human macrophages
2025-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.10.669536
PMID:40832301
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了不同毒力Coxiella burnetii菌株感染人肺泡巨噬细胞后诱导的差异性炎症反应 | 首次在单细胞分辨率下比较不同毒力Coxiella burnetii菌株感染人巨噬细胞后的转录组差异，揭示了菌株特异性和细胞异质性对免疫应答的影响 | 研究仅使用人肺泡巨噬细胞，未涉及其他免疫细胞类型；体外感染模型可能无法完全模拟体内感染环境 | 阐明Coxiella burnetii不同菌株与宿主巨噬细胞相互作用的分子机制，为Q热治疗提供新见解 | 人肺泡巨噬细胞感染不同毒力Coxiella burnetii菌株（NMI、G、NMII、Dugway） | 感染免疫学 | Q热 | RNA测序，单细胞RNA测序，细胞因子检测 | NA | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2025-11-28 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671333
PMID:40894744
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研究论文 | 本研究系统评估了整合单细胞和单核RNA测序数据以改进批量RNA-seq反卷积的方法 | 首次系统比较多种整合策略，发现过滤跨模态差异表达基因和使用条件变分自编码器可显著提升反卷积精度 | 研究仅基于四种组织类型，对于更广泛组织类型的适用性需要进一步验证 | 提高批量RNA测序反卷积的准确性 | 单细胞RNA测序和单核RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量RNA测序 | 变分自编码器, 主成分分析 | 基因表达数据 | 四种不同组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-11-27 |
Gene editing and multi-omics approaches to study early embryogenesis in cattle
2025-Aug-29, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD25167
PMID:41292010
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综述 | 本文综述了多组学分析和基因编辑技术在牛早期胚胎发育研究中的应用与进展 | 整合单细胞多组学技术与多种功能工具（CRISPR/Cas9、RNA编辑、碱基编辑等）研究牛早期胚胎发育机制 | NA | 通过多组学与功能工具研究牛早期胚胎发育机制，提高牛生育能力 | 牛早期胚胎（第一周发育阶段） | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 代谢组学, 蛋白质组学, CRISPR/Cas9, RNA编辑, 碱基编辑, Trim-Away | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 代谢组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 54 | 2025-11-26 |
Integrated multi-omics analysis identifies lipid metabolism biomarkers in ONFH and reveals therapeutic potential of retinoic acid
2025-Aug-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-13703-y
PMID:40841396
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研究论文 | 通过多组学分析识别股骨头坏死中脂质代谢生物标志物并揭示视黄酸的治疗潜力 | 首次整合多组学分析与机器学习技术识别ONFH脂质代谢生物标志物，并通过单细胞测序验证生物标志物与免疫细胞的关联 | 未明确说明样本量大小及数据来源的具体细节 | 识别股骨头坏死的潜在生物标志物并为疾病治疗提供参考 | 股骨头坏死相关基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 股骨头坏死 | 多组学分析、机器学习、分子对接、单细胞测序 | 列线图模型、ROC曲线分析 | 基因组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-11-24 |
SCAN-ACT: adoptive T cell therapy target discovery through single-cell transcriptomics
2025-Aug-14, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01514-9
PMID:40814001
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研究论文 | 开发了一个名为SCAN-ACT的计算流程，通过单细胞转录组学和多组学数据发现和优先排序用于过继性T细胞疗法的靶点 | 首次开发了整合单细胞RNA测序和多组学数据的计算流程，能够同时提名CAR-T和TCR-T细胞治疗的靶点，包括单特异性靶点、双特异性靶点对和肽-MHC靶点 | NA | 加速实体瘤过继性T细胞疗法的靶点发现 | 软组织肉瘤和胶质母细胞瘤 | 生物信息学 | 软组织肉瘤,胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | 计算分析流程 | 单细胞转录组数据,多组学数据 | 986,749个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学 | NA | NA |
| 56 | 2025-11-19 |
The current landscape and emerging challenges of benchmarking single-cell methods
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf380
PMID:41045508
|
综述 | 本文系统评估了单细胞测序计算方法基准测试的研究现状与新兴挑战 | 提供了最全面的单细胞基准测试研究量化总结，涵盖282篇论文的系统分析 | 基于文献综述，缺乏原始实验数据验证 | 评估单细胞计算方法基准测试领域现状并识别关键挑战 | 单细胞测序计算方法基准测试研究 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 282篇研究论文（130篇纯基准测试论文+152篇方法开发论文） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-11-17 |
Epiblast-derived CX3CR1+ progenitors generate cardiovascular cells during cardiogenesis
2025-Aug, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00488-z
PMID:40551012
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪揭示了胚胎CX3CR1+细胞作为多能性上胚层来源祖细胞群，在心脏发育过程中生成心肌细胞、内皮细胞和巨噬细胞 | 首次发现CX3CR1+细胞起源于E6.5上胚层细胞，并证实其通过新生分化和细胞融合双重机制生成心血管细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚需验证 | 阐明CX3CR1+细胞在心脏发育过程中的起源和命运 | 小鼠胚胎和成年心脏中的CX3CR1+细胞及其谱系细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序、胚胎干细胞分化 | NA | 基因表达数据、细胞谱系数据 | 小鼠胚胎发育不同阶段（E6.5-E9.5）及成年心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-11-14 |
CD38+ Endothelial Remodeling Defines Spatially Diverse Vasculopathy Programs in Rapidly Advancing Oral Inflammation
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.29.667333
PMID:40766487
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学揭示了快速进展性口腔炎症中CD38+内皮细胞重塑的空间特异性血管病变模式 | 首次发现CD38+内皮细胞在快速进展性口腔炎症中的空间特异性重塑模式，并开发了三重空间分析方法 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 揭示快速进展性口腔炎症的细胞机制和空间结构特征 | 种植体周围炎和重度牙周炎患者的口腔组织样本 | 单细胞生物学 | 口腔炎症疾病 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 激光捕获显微切割, 微生物组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间蛋白质组数据, 微生物组数据 | 总计59个样本，包括36个scRNA-seq样本(121,395个细胞)，15个空间蛋白质组学样本(337,260个细胞)，8个黏膜活检样本(225,137个细胞) | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 59 | 2025-11-10 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal Keratinocytes as Key Players in Vulvar Lichen Sclerosus Pathogenesis
2025-Aug-29, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.022
PMID:40886965
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学技术揭示角化细胞在外阴硬化性苔藓发病机制中的核心作用 | 首次整合空间和单细胞转录组学技术系统揭示外阴硬化性苔藓中角化细胞的双重角色及多细胞类型的统一分子变化 | 未明确说明样本量大小和研究人群特征 | 阐明外阴硬化性苔藓的分子发病机制 | 外阴硬化性苔藓病变组织、非病变组织和健康外阴皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2025-11-06 |
STEAM: Spatial Transcriptomics Evaluation Algorithm and Metric for clustering performance
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf570
PMID:41171708
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研究论文 | 提出一种用于评估空间转录组学数据聚类性能的计算框架STEAM | 开发了首个专门针对空间转录组学数据的聚类评估算法和指标，通过机器学习分类预测方法评估聚类结果的一致性和可靠性 | NA | 解决空间转录组学数据缺乏真实标签导致的聚类验证难题 | 空间转录组学数据聚类结果 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | 机器学习分类和预测方法 | 空间转录组数据，空间蛋白质组数据 | 多个公共数据集，涵盖多细胞到单细胞分辨率、正常和病变组织 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |