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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-06 |
Construction and validation of a lipid metabolism-related genes prognostic signature for skin cutaneous melanoma
2025-Aug-15, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152115
PMID:40460484
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研究论文 | 构建并验证了皮肤黑色素瘤中脂质代谢相关基因的预后特征模型 | 首次基于脂质代谢相关基因建立皮肤黑色素瘤预后特征模型,并通过单细胞RNA测序和体内外实验验证关键基因CCNA2的功能 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步临床验证 | 研究脂质代谢相关基因在皮肤黑色素瘤中的预后价值和功能作用 | 皮肤黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | mRNA测序,单细胞RNA测序,NMF聚类分析,WGCNA,LASSO回归,Cox回归 | 预后风险模型,列线图 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的多个队列(包括GSE65904,GSE54467,GSE72056) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 522 | 2025-10-06 |
Identify critical genes of breast cancer and corresponding leading natural product compounds of potential therapeutic targets
2025-Aug, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-024-11035-z
PMID:39656376
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研究论文 | 通过多组学分析识别乳腺癌关键基因及潜在天然产物治疗靶点 | 整合WGCNA、差异基因表达、ChIP-seq、scRNA-seq和空间转录组学数据,首次系统筛选靶向角鲨烯环氧酶的天然产物化合物 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 识别乳腺癌关键基因和潜在天然产物治疗靶点 | 乳腺癌基因和天然产物化合物 | 生物信息学 | 乳腺癌 | WGCNA, 差异基因表达分析, ChIP-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 虚拟筛选 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, ChIP-seq | NA | NA |
| 523 | 2025-10-06 |
RNA binding proteins PCBP1 and PCBP2 regulate pancreatic β cell translation
2025-Aug, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102175
PMID:40451383
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研究论文 | 本研究探讨RNA结合蛋白PCBP1和PCBP2在胰腺β细胞翻译调控中的协同作用 | 首次揭示PCBP1和PCBP2通过共同调控翻译起始因子和核糖体mRNAs网络来维持β细胞全局翻译的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类β细胞中的具体机制仍需进一步验证 | 探究PCBP1和PCBP2在β细胞稳态和翻译调控中的功能关系 | 胰腺β细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot, RNA免疫沉淀, CRISPR-Cas9, shRNA, 嘌呤霉素标记 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | β细胞特异性Pcbp1和Pcbp1/2双敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 524 | 2025-10-06 |
METRNL represses beta-to-alpha cell trans-differentiation to maintain beta cell function under diabetic metabolic stress in mice
2025-Aug, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06459-7
PMID:40495021
|
研究论文 | 本研究揭示METRNL蛋白在糖尿病代谢应激下通过抑制β细胞向α细胞转分化来维持β细胞功能 | 首次发现METRNL在胰岛β细胞中的特异性表达及其通过调控KLF6和c-Jun通路防止β细胞转分化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类胰岛细胞中验证 | 探究METRNL在维持胰岛β细胞功能和身份认同中的作用机制 | 小鼠胰岛β细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,葡萄糖刺激胰岛素分泌实验,基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,生理指标数据 | 未明确样本数量,使用正常饮食和高脂饮食喂养的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 525 | 2025-10-06 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Intratumoral Heterogeneity in Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24531
PMID:40346999
|
撤稿声明 | 因同行评审过程存在问题而撤回已发表的单细胞转录组分析研究论文 | NA | NA | NA | NA | NA | 肺腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 526 | 2025-10-06 |
Exploring the untapped potential of single-cell and spatial omics in plant biology
2025-Aug, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70220
PMID:40398874
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综述 | 探讨单细胞和空间组学技术在植物生物学中的潜力和应用 | 系统总结植物生物学中单细胞和空间组学技术的创新应用,并指出多组学、谱系追踪等新兴技术的未开发潜力 | 存在植物特异性技术障碍(如细胞壁复杂性、抗体资源有限)和资源可用性限制 | 推动单细胞和空间组学技术在植物研究中的应用与发展 | 植物生物学研究,重点关注模型植物物种 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组分析、染色质可及性分析、空间转录组学、多组学、谱系追踪、分子记录 | NA | 转录组数据、染色质可及性数据、空间分布数据 | 多个模型植物物种 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 527 | 2025-10-06 |
Scalable inference of transcriptional variability with BASiCS
2025-Aug-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2025.112157
PMID:40479909
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研究论文 | 本文扩展了BASiCS单细胞RNA测序数据分析方法,提出了一种可扩展的贝叶斯推断方案 | 在BASiCS模型中引入了分治推断方案,实现了大规模单细胞RNA测序数据的可扩展贝叶斯推断 | 未明确说明具体数据集规模上限和计算资源需求 | 开发可扩展的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯层次模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 528 | 2025-10-06 |
Hydroxychloroquine cures autoimmune myocarditis by inhibiting the innate immune system via the C-X-C motif chemokine ligand 16 and C-X-C motif receptor 6 axis between macrophages and T cells
2025-Aug, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70028
PMID:40222951
|
研究论文 | 本研究评估羟氯喹通过抑制CXCL16/CXCR6轴治疗自身免疫性心肌炎的疗效 | 首次揭示羟氯喹通过下调YY1转录因子抑制CXCL16表达,从而减少巨噬细胞对Th17和NKT细胞的趋化作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 评估羟氯喹治疗心肌炎的效果及作用机制 | 实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型 | 免疫学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,蛋白质印迹,超声心动图 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 529 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Functional Exhaustion of T Cells in Oral Lichen Planus
2025-Aug, Molecular oral microbiology
IF:2.8Q3
DOI:10.1111/omi.12495
PMID:40366262
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示口腔扁平苔藓中T细胞功能耗竭的机制 | 首次在单细胞水平系统揭示OLP中T细胞组成异质性及CD8+耗竭T细胞的终末分化特征 | 样本量较小(3例患者+3例对照),动物模型与人类疾病存在物种差异 | 解析口腔扁平苔藓免疫微环境中T细胞的组成和功能状态 | 口腔黏膜组织(人类患者和健康个体)、小鼠慢性炎症模型 | 单细胞组学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、免疫荧光染色、HE染色 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、组织病理图像 | 3例OLP患者+3例健康个体的人类组织,小鼠慢性炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 530 | 2025-10-06 |
Development and Validation of a Flow-Dependent Endothelialized 3D Model of Intracranial Atherosclerotic Disease
2025-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01310-4
PMID:39537986
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研究论文 | 开发并验证了一种基于患者特异性成像的流动依赖性内皮化3D颅内动脉粥样硬化疾病模型 | 首次创建了基于患者特异性神经影像的可内皮化并承受流动力的可重复ICAD模型,结合单细胞RNA测序分析流动依赖性内皮基因表达 | 依赖于神经影像数据的质量,模型复杂度可能限制高通量应用 | 开发用于研究颅内动脉粥样硬化疾病机制和治疗方法的实验模型 | 大脑中动脉的3D模型和人类内皮细胞 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,计算流体动力学,共聚焦显微镜 | 3D生物模型 | 图像,基因表达数据 | 使用SAMMPRIS临床试验的影像数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 531 | 2025-10-06 |
CCN1 Is a Therapeutic Target for Reperfused Ischemic Brain Injury
2025-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01279-0
PMID:39028413
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研究论文 | 本研究揭示CCN1是再灌注缺血性脑损伤的治疗靶点,通过干预脑膜淋巴系统调控系统性炎症 | 首次发现脑膜淋巴破坏通过降低CCN1表达减轻脑缺血再灌注损伤,并证实CCN1是脑-CLN轴炎症调控的关键介质 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;CCN1作用机制尚未完全阐明 | 探究脑膜淋巴系统在缺血再灌注阶段调控系统性炎症的作用及机制 | 小鼠缺血再灌注脑损伤模型、脑膜淋巴管内皮细胞、脑浸润免疫细胞 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序、脑室内注射、空间记忆功能测试 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、行为学数据、组织病理数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 532 | 2025-10-06 |
Sex-specific neurotoxicity induced by long-term bisphenol A exposure: Single-cell sequencing reveals dual mechanisms involving hippocampal gliosis and neuronal apoptosis
2025-Aug-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2025.179810
PMID:40505511
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示长期双酚A暴露通过海马胶质增生和神经元凋亡双重机制诱导性别特异性神经毒性 | 首次结合行为学分析和单细胞测序技术系统阐明BPA性别特异性神经毒性的细胞分子机制 | 仅使用小鼠模型,未涉及人类样本验证 | 探究长期BPA暴露对成年小鼠行为记忆和神经系统的性别特异性影响 | 成年小鼠(分雌雄性别) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、行为学数据、形态学数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 533 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic atlas reveals the underlying mechanism of indole-3-acetic acid in protecting against acute cholestatic liver injury
2025-Aug, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156942
PMID:40513326
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组图谱揭示了吲哚-3-乙酸在急性胆汁淤积性肝损伤中的保护机制 | 首次整合转录组学、代谢组学和单细胞RNA测序技术,系统阐明3-IAA通过调节免疫细胞亚群发挥肝保护作用的新机制 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体中验证 | 探究吲哚-3-乙酸对急性胆汁淤积性肝损伤的治疗潜力及其作用机制 | 胆管结扎诱导的急性胆汁淤积性肝损伤大鼠模型 | 单细胞组学 | 肝病 | 单细胞RNA测序, 转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2025-10-06 |
Investigating the potential risk of cadmium exposure on Osteoporosis: An integrated multi-omics approach
2025-Aug, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118502
PMID:40517505
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研究论文 | 通过多组学方法研究镉暴露对骨质疏松症的潜在风险 | 整合了流行病学数据、生物信息学、机器学习、单细胞RNA测序和分子对接等多种方法,首次系统揭示镉暴露通过HMOX1基因影响骨质疏松的机制 | 研究主要基于横断面分析,无法确定因果关系;需要进一步实验验证 | 探索镉暴露在骨质疏松症发病机制中的作用 | 骨质疏松症患者及相关基因表达 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 机器学习, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习模型 | 多组学数据, 流行病学数据 | NHANES数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2025-10-06 |
FCGR2A contributes to M2 macrophages polarization in HCC through IL-4/JAK/STAT6 axis
2025-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102429
PMID:40482466
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研究论文 | 本研究揭示了FCGR2A通过IL-4/JAK/STAT6轴促进肝细胞癌中M2巨噬细胞极化的机制 | 首次发现FCGR2A在肝癌M2巨噬细胞中高表达并通过IL-4/JAK/STAT6轴驱动M2极化 | 具体调控机制细节仍需进一步研究 | 探究FCGR2A在肝细胞癌肿瘤微环境中对巨噬细胞极化的调控作用 | 肝细胞癌组织、巨噬细胞、NK细胞、T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、体内实验、转染实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 536 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis of intrahepatic cholangiocarcinoma reveals SPP1 facilitates disease progression via interaction with CD4+ T cells
2025-Aug, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2025.15135
PMID:40535101
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌肿瘤微环境,揭示SPP1通过调控CD4+ T细胞分化促进疾病进展 | 首次在单细胞水平揭示SPP1-CD44轴介导肿瘤细胞与免疫细胞相互作用,影响CD4+ T细胞分化 | 未明确SPP1-CD44相互作用的具体分子机制及临床转化潜力 | 探究肝内胆管癌肿瘤微环境中CD4+ T细胞的作用机制 | 肝内胆管癌患者肿瘤组织中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 单细胞组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 537 | 2025-10-06 |
Progress in single-cell sequencing of retinal vein occlusion or ischemic hypoxic retinopathy
2025-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110436
PMID:40414336
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变研究中的最新进展 | 整合了单核RNA测序、空间转录组学和多组学方法,增强对视网膜反应的空间和时间图谱绘制 | 样本保存、视网膜细胞类型注释和跨物种翻译等挑战尚未完全解决 | 探讨单细胞测序技术在视网膜血管疾病研究中的应用进展 | 视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变 | 数字病理学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 538 | 2025-10-06 |
Endothelial Nrf2 deficiency promotes atherosclerotic lesion formation by shaping a proinflammatory niche
2025-Aug-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123725
PMID:40404122
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型证明内皮细胞Nrf2缺失通过诱导炎症特性和改变血管细胞通讯促进动脉粥样硬化形成 | 首次在单细胞水平揭示内皮Nrf2缺失通过改变内皮细胞转录组和细胞间通讯促进动脉粥样硬化的机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究内皮细胞特异性Nrf2缺失在动脉粥样硬化形成中的作用机制 | Nrf2Cdh5tKO基因敲除小鼠和对照Nrf2flox/flox小鼠 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 基因工程小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 539 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and metabolomics reveal the potential role of ASRGL1 in metabolic reprogramming and invasion of nasopharyngeal carcinoma cells
2025-08, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106788
PMID:40320045
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和代谢组学分析揭示了ASRGL1在鼻咽癌细胞代谢重编程和侵袭中的潜在作用 | 首次在鼻咽癌中系统研究ASRGL1的表达特征和功能,发现其通过影响氨基酸代谢促进肿瘤侵袭 | 研究主要基于公共数据集和细胞系实验,缺乏体内实验验证 | 探究ASRGL1在鼻咽癌进展中的具体作用和机制 | 鼻咽癌细胞系C666-1和公共单细胞测序数据集 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, GC-MS, siRNA干扰, 细胞功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 细胞实验数据 | 公共数据集GSE150430和C666-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 540 | 2025-10-06 |
mitoXplorer 3.0, A Web Tool for Exploring Mitochondrial Dynamics in Single-cell RNA-seq Data
2025-Aug-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169004
PMID:40133780
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研究论文 | 介绍用于探索单细胞RNA测序数据中线粒体动力学的网络工具mitoXplorer 3.0 | 开发了适配单细胞测序数据分析的新功能,包括scXplorer格式化脚本和专门分析线粒体基因细胞间变异性的交互界面 | NA | 开发用于单细胞RNA测序数据中线粒体动力学分析的网络工具 | 单细胞RNA测序数据中的线粒体基因表达 | 生物信息学 | 脊髓小脑性共济失调1型 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |