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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis of intrahepatic cholangiocarcinoma reveals SPP1 facilitates disease progression via interaction with CD4+ T cells
2025-Aug, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2025.15135
PMID:40535101
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌肿瘤微环境,揭示SPP1通过调控CD4+ T细胞分化促进疾病进展 | 首次在单细胞水平揭示SPP1-CD44轴介导肿瘤细胞与免疫细胞相互作用,影响CD4+ T细胞分化 | 未明确SPP1-CD44相互作用的具体分子机制及临床转化潜力 | 探究肝内胆管癌肿瘤微环境中CD4+ T细胞的作用机制 | 肝内胆管癌患者肿瘤组织中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 单细胞组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 522 | 2025-10-06 |
Progress in single-cell sequencing of retinal vein occlusion or ischemic hypoxic retinopathy
2025-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110436
PMID:40414336
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变研究中的最新进展 | 整合了单核RNA测序、空间转录组学和多组学方法,增强对视网膜反应的空间和时间图谱绘制 | 样本保存、视网膜细胞类型注释和跨物种翻译等挑战尚未完全解决 | 探讨单细胞测序技术在视网膜血管疾病研究中的应用进展 | 视网膜静脉阻塞和缺血性缺氧性视网膜病变 | 数字病理学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 523 | 2025-10-06 |
Endothelial Nrf2 deficiency promotes atherosclerotic lesion formation by shaping a proinflammatory niche
2025-Aug-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123725
PMID:40404122
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型证明内皮细胞Nrf2缺失通过诱导炎症特性和改变血管细胞通讯促进动脉粥样硬化形成 | 首次在单细胞水平揭示内皮Nrf2缺失通过改变内皮细胞转录组和细胞间通讯促进动脉粥样硬化的机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究内皮细胞特异性Nrf2缺失在动脉粥样硬化形成中的作用机制 | Nrf2Cdh5tKO基因敲除小鼠和对照Nrf2flox/flox小鼠 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 基因工程小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and metabolomics reveal the potential role of ASRGL1 in metabolic reprogramming and invasion of nasopharyngeal carcinoma cells
2025-08, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106788
PMID:40320045
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和代谢组学分析揭示了ASRGL1在鼻咽癌细胞代谢重编程和侵袭中的潜在作用 | 首次在鼻咽癌中系统研究ASRGL1的表达特征和功能,发现其通过影响氨基酸代谢促进肿瘤侵袭 | 研究主要基于公共数据集和细胞系实验,缺乏体内实验验证 | 探究ASRGL1在鼻咽癌进展中的具体作用和机制 | 鼻咽癌细胞系C666-1和公共单细胞测序数据集 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, GC-MS, siRNA干扰, 细胞功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 细胞实验数据 | 公共数据集GSE150430和C666-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 525 | 2025-10-06 |
mitoXplorer 3.0, A Web Tool for Exploring Mitochondrial Dynamics in Single-cell RNA-seq Data
2025-Aug-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169004
PMID:40133780
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研究论文 | 介绍用于探索单细胞RNA测序数据中线粒体动力学的网络工具mitoXplorer 3.0 | 开发了适配单细胞测序数据分析的新功能,包括scXplorer格式化脚本和专门分析线粒体基因细胞间变异性的交互界面 | NA | 开发用于单细胞RNA测序数据中线粒体动力学分析的网络工具 | 单细胞RNA测序数据中的线粒体基因表达 | 生物信息学 | 脊髓小脑性共济失调1型 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 526 | 2025-10-06 |
TCREMP: A Bioinformatic Pipeline for Efficient Embedding of T-cell Receptor Sequences from Immune Repertoire and Single-cell Sequencing Data
2025-Aug-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169205
PMID:40368275
|
研究论文 | 开发了一个名为TCREMP的生物信息学流程,用于从免疫组库和单细胞测序数据中高效嵌入T细胞受体序列 | 通过原型相似性对TCR氨基酸序列进行数字化嵌入,为比较分析提供参考点并帮助解码抗原特异性预测 | NA | 开发高效的T细胞受体序列嵌入方法,用于适应性免疫研究 | T细胞受体序列、抗原特异性T细胞群体 | 生物信息学 | 免疫相关疾病 | 单细胞测序、MHC多聚体分选测序 | 嵌入模型 | 序列数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 527 | 2025-10-06 |
Immune-endothelial cell crosstalk in hepatic endothelial injury of liver fibrotic mice
2025-Aug-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.177730
PMID:40374060
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肝纤维化中免疫细胞与内皮细胞之间的相互作用机制 | 首次在肝纤维化模型中系统分析免疫-内皮细胞互作,发现Ptprc-Mrc1和Sell-Podxl信号通路在细胞通讯中的关键作用 | 研究仅使用CCl4诱导的小鼠肝纤维化模型,样本量相对有限 | 探索肝纤维化中肝内皮细胞损伤机制及细胞间通讯的调控通路 | C57BL/6雄性小鼠肝纤维化模型中的非实质细胞 | 单细胞组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序,扫描电镜,PCR,Masson染色,免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 24,534个细胞分为10个主要细胞亚群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 528 | 2025-10-06 |
Transcriptional profile and quantitative proteomics revealed NGF-p75NTR-associated synaptic plasticity and heterogeneity for diabetic encephalopathy and the potential role of CoQ10 for diabetic induced cognitive deficits in mice
2025-Aug, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167823
PMID:40185338
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞测序探讨了CoQ10对糖尿病诱导认知缺陷中突触可塑性的调控作用及异质性 | 首次系统研究DICD相关及CoQ10治疗的蛋白质组变化及其异质性改变,发现NGF-p75NTR信号通路在突触可塑性调控中的重要作用 | 研究仅基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;样本量相对有限 | 探索CoQ10在糖尿病诱导认知缺陷中的细胞和分子特征及潜在作用 | 糖尿病诱导认知缺陷小鼠模型 | 生物医学 | 糖尿病脑病 | TMT定量蛋白质组学,单细胞RNA测序,Western blotting | NA | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据,蛋白质印迹数据 | 多组小鼠比较(对照组、DICD组、CoQ10治疗组) | NA | 单细胞RNA-seq,定量蛋白质组学 | NA | NA |
| 529 | 2025-10-06 |
CTLA4 modulates B cell receptor signals to inhibit HBsAb secretion in chronic hepatitis B patients
2025-Aug, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167848
PMID:40279930
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研究论文 | 本研究揭示了CTLA4通过调节B细胞受体信号通路抑制慢性乙型肝炎患者HBsAb分泌的新机制 | 首次发现CTLA4在HBsAg特异性B细胞中高表达,并通过与SHP-1结合抑制Jak-STAT和B细胞受体信号通路 | 研究样本主要来自患者外周血和肝脏组织,需要更大规模验证 | 探索慢性乙型肝炎患者B细胞功能缺陷的机制及治疗靶点 | 慢性乙型肝炎患者的B细胞和HBV小鼠模型 | 免疫学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 慢性乙型肝炎患者的外周和肝脏B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 530 | 2025-10-06 |
DSG2 attenuates gemcitabine efficacy through PTX3 in lung adenocarcinoma
2025-Aug, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167881
PMID:40316058
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研究论文 | 本研究揭示了DSG2通过PTX3介导的机制增强肺腺癌对吉西他滨的耐药性 | 首次发现DSG2通过调控PTX3/NFκB/STAT3信号轴介导肺腺癌对吉西他滨的耐药机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步的体内实验验证 | 探讨DSG2在肺腺癌吉西他滨耐药中的作用机制 | 肺腺癌细胞和组织 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,KEGG分析,GSEA分析,体外实验 | NA | 基因组数据,转录组数据,实验数据 | TCGA数据库和多个组学数据库分析 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 531 | 2025-10-06 |
Fenofibrate inhibits activation of cGAS-STING pathway by alleviating mitochondrial damage to attenuate inflammatory response in diabetic dry eye
2025-Aug-01, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究探讨了cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼症中的作用,并发现非诺贝特通过减轻线粒体损伤抑制该通路激活从而缓解炎症反应 | 首次揭示cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼症发病机制中的关键作用,并发现非诺贝特通过保护线粒体功能抑制该通路的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未进行临床试验验证 | 探究cGAS-STING信号通路在糖尿病干眼症中的作用及非诺贝特的治疗机制 | 糖尿病干眼症小鼠模型和永生化人角膜上皮细胞 | 生物医学研究 | 糖尿病干眼症 | 单细胞RNA测序 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 532 | 2025-10-06 |
Activated Schwann cells promote tumor growth in colon cancer
2025-Aug-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217791
PMID:40349909
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研究论文 | 本研究揭示了活化雪旺细胞通过c-Jun依赖性机制促进结肠癌生长的关键作用 | 首次发现肿瘤相关非髓鞘形成雪旺细胞在结肠癌中显著增加,并阐明其通过c-Jun激活和IL-6分泌促进肿瘤生长的机制 | 未明确雪旺细胞与其他肿瘤微环境成分相互作用的详细分子通路 | 探究雪旺细胞在结肠癌进展中的具体作用机制 | 结肠癌组织样本、雪旺细胞、肿瘤细胞、癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤微环境研究 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、共培养实验、基因敲除 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 结肠癌组织样本与正常组织对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 533 | 2025-10-06 |
Decipher the single-cell level responses to chemotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma by a cross-time context graph model
2025-Aug-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217751
PMID:40294840
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研究论文 | 通过开发跨时间上下文图模型解析胰腺导管腺癌对化疗的单细胞水平响应机制 | 提出scConGraph可扩展双层图模型,能够有效整合跨时间上下文信息重构动态肿瘤细胞响应 | 基于静态单细胞RNA测序快照推断动态过程可能存在局限性 | 研究胰腺导管腺癌对吉西他滨化疗的耐药机制 | 胰腺导管腺癌患者来源异种移植模型 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 单细胞基因表达数据 | PDX模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2025-10-06 |
Paricalcitol plus hydroxychloroquine enhances gemcitabine activity and induces mesenchymal to epithelial transition in pancreatic ductal adenocarcinoma: A single cell RNA-seq analysis
2025-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217809
PMID:40409452
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了帕立骨化醇联合羟氯喹增强吉西他滨活性并诱导胰腺导管腺癌间质-上皮转化的分子机制 | 首次在单细胞分辨率水平系统解析GPH联合治疗方案通过下调纤维连接蛋白和胶原信号通路抑制EMT过程的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究联合药物治疗对胰腺导管腺癌EMT过程的影响机制 | KPC-Luc原位小鼠胰腺导管腺癌模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 高维加权基因共表达网络分析, 细胞间通讯分析 | NA | 单细胞转录组数据 | KPC-Luc小鼠肿瘤模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 535 | 2025-10-06 |
Landscape of spatial disruption of homeostasis in the middle temporal gyrus of epileptic patients
2025-Aug-01, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.149688
PMID:40350141
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析癫痫患者颞中回的细胞和空间稳态破坏 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示癫痫患者颞中回的细胞空间重组和稳态破坏机制 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 阐明癫痫相关的细胞和空间稳态破坏机制 | 癫痫患者和对照组的颞中回脑组织 | 空间转录组学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 空间转换张量算法 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 536 | 2025-10-06 |
NR2F2 and its contribution to lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma
2025-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111814
PMID:40262715
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研究论文 | 本研究探讨了NR2F2在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的作用及其与肿瘤干细胞特性的关联 | 首次在单细胞水平将口腔鳞癌干细胞分为五个亚群,并鉴定NR2F2为干细胞性最高亚群的关键基因,揭示了其在淋巴结转移中的新机制 | NA | 研究癌症干细胞在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的作用,重点关注NR2F2的表达和生物学意义 | 口腔鳞状细胞癌患者样本、癌细胞系、淋巴结组织 | 单细胞测序分析 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光、Western blot、功能实验、体内实验、批量RNA测序、药物敏感性分析 | CytoTRACE算法、irGSEA、GSVA、GO分析、KEGG分析 | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 537 | 2025-10-06 |
Atlas of temporal molecular pathological alterations after traumatic brain injury based on RNA-Seq
2025-Aug, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115270
PMID:40268159
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研究论文 | 基于RNA测序构建创伤性脑损伤后时间分子病理变化图谱 | 首次通过10个时间点的密集转录组分析系统揭示TBI进展中的动态分子病理变化,并聚焦焦亡在神经炎症中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 系统解析创伤性脑损伤后分子病理变化的时间动态特征 | C57/BL6小鼠脑组织 | 生物信息学 | 创伤性脑损伤 | RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | WGCNA, Mfuzz | 基因表达数据 | 10个时间点(0h,1h,2h,3h,4h,6h,12h,1d,3d,7d)的小鼠脑组织样本 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 538 | 2025-10-06 |
Immunogenic cuproptosis in cancer immunotherapy via an in situ cuproptosis-inducing system
2025-Aug, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究通过构建铜死亡诱导系统,探索铜死亡在结直肠癌免疫治疗中的免疫原性作用机制 | 首次系统评估12种细胞死亡模式的免疫原性,发现铜死亡与免疫原性细胞死亡和免疫应答的强相关性,并开发了原位铜死亡诱导系统 | 研究主要聚焦于结直肠癌,在其他癌种中的适用性需要进一步验证 | 探索铜死亡在癌症免疫治疗中的作用机制并开发新型治疗策略 | 结直肠癌细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,体外和体内实验 | NA | 基因表达数据,实验数据 | 内部队列和独立队列的多组样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 539 | 2025-10-07 |
The mechanism by which MALAT1/CREG1 regulates premature rupture of fetal membrane through autophagy mediated differentiation of amniotic fibroblasts
2025-Aug, Non-coding RNA research
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.ncrna.2025.04.004
PMID:40297152
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研究论文 | 本研究探讨了MALAT1/CREG1通过自噬介导羊膜成纤维细胞分化调控胎膜早破的机制 | 首次发现MALAT1与CREG1相互作用调控自噬过程,介导羊膜成纤维细胞向肌成纤维细胞分化 | NA | 探索通过干预成纤维细胞修复羊膜的科学问题,为临床治疗胎膜早破提供证据 | 胎膜组织和原代羊膜成纤维细胞 | 生物医学研究 | 胎膜早破 | 单细胞测序,天狼星红染色,荧光染色,拉曼光谱,Western blot,PCR,RNA Pulldown,RIP,分子对接 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 540 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic reveals network topology changes of cancer at the individual level
2025-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析癌症和溃疡性结肠炎中细胞类型特异性网络的拓扑结构变化 | 首次在个体水平利用单细胞RNA测序数据构建细胞类型特异性网络,分析不同病理状态下网络拓扑特征的变化 | 仅使用四个公开数据集,样本量有限;分析方法依赖于特定的软件包 | 探究不同病理状态下细胞类型特异性网络拓扑特征的变化规律 | 癌症和溃疡性结肠炎患者的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络、共表达网络 | 单细胞转录组数据 | 四个公开scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |