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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling uncovers cellular complexity and microenvironment in gastric tumorigenesis associated with Helicobacter pylori
2025-Aug, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.10.012
PMID:39414226
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示幽门螺杆菌相关胃肿瘤发生过程中的细胞异质性和微环境特征 | 首次构建了涵盖胃炎、肠上皮化生和胃癌的胃肿瘤发生单细胞图谱,揭示了不同细胞谱系的癌症相关表达特征和细胞间通讯网络 | 样本量相对有限(18例标本),需要在更大队列中验证发现 | 解析幽门螺杆菌驱动的胃肿瘤发生过程中的细胞异质性和分子机制 | 人类胃组织标本(胃炎、胃肠上皮化生和胃癌) | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,免疫组化,qRT-PCR,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学数据,公共数据库数据 | 18例胃组织标本(胃炎、胃肠上皮化生和胃癌),另有人类胃组织验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 462 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Critical Role of SEC16B in Lung Metastasis of Osteosarcoma
2025-Aug, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00161
PMID:40735296
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示SEC16B在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出与骨肉瘤肺转移密切相关的C1肿瘤细胞亚群,并发现SEC16B基因的下调在肺转移中起关键作用 | 样本量相对有限(6个原发肿瘤样本,2个肺转移样本,4个正常骨组织样本) | 探究骨肉瘤肺转移的分子机制并识别关键调控基因 | 骨肉瘤患者组织样本(原发肿瘤、肺转移灶)和正常骨组织 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Transwell实验 | hdWGCNA, CytoTRACE, Scissor, CellphoneDB, CSOmap | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 12个单细胞RNA测序样本(6原发+2转移+4正常)+ 8个批量RNA测序样本(4原发+4转移) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 463 | 2025-10-06 |
Human myelocyte and metamyelocyte-stage neutrophils suppress tumor immunity and promote cancer progression
2025-Aug, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-025-01145-0
PMID:40664963
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研究论文 | 本研究揭示了人类骨髓细胞和晚幼粒细胞阶段中性粒细胞在肿瘤免疫抑制和促进癌症进展中的关键作用 | 首次将人类中性粒细胞分为三个发育阶段,发现MC&MM阶段中性粒细胞具有强免疫抑制特性,并建立了支持人类肿瘤浸润中性粒细胞重建的NCG-Gfi1 HIS小鼠模型 | 研究主要基于小鼠模型,在人类患者中的直接验证仍需进一步研究 | 探索肿瘤浸润中性粒细胞不同发育阶段的免疫调节功能及其在癌症进展中的作用 | 人类和小鼠的中性粒细胞,涵盖17种癌症类型的患者样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NCG-Gfi1人类免疫系统小鼠模型 | 基因表达数据 | 涵盖17种癌症类型的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 464 | 2025-10-06 |
Transcription factors TCF4 and KLF4 respectively control the development of the DC2A and DC2B lineages
2025-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02208-5
PMID:40702338
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序等技术揭示了转录因子TCF4和KLF4分别调控DC2A和DC2B谱系发育的分子机制 | 首次明确Klf4表达可区分cDC与pDC谱系,并鉴定出两个前体DC2亚群及其特异性发育调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类DC细胞发育机制仍需进一步验证 | 阐明常规树突状细胞(cDC)的谱系发育和分类框架 | 小鼠常规树突状细胞(cDC)和浆细胞样树突状细胞(pDC) | 免疫学 | NA | 单细胞测序, 转录因子命运示踪模型, 条件性基因敲除模型, 过继转移 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 465 | 2025-10-06 |
B- and T cell receptor sequencing elucidates characteristics of lymphocyte depletion by ocrelizumab
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113068
PMID:40727939
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研究论文 | 本研究通过分析B细胞和T细胞受体序列,阐明了奥瑞珠单抗治疗对多发性硬化症患者淋巴细胞耗竭的特征 | 首次在奥瑞珠单抗治疗背景下全面分析B细胞和T细胞受体库变化,并发现脑脊液中组织驻留记忆细胞的治疗抵抗现象 | 样本量有限,未来需要更大规模研究验证已识别表型与多发性硬化病理的关系 | 阐明奥瑞珠单抗治疗对多发性硬化症患者适应性免疫系统的影响 | 多发性硬化症患者和健康捐赠者的血液、脑脊液样本 | 免疫学 | 多发性硬化症 | B细胞受体测序,T细胞受体测序,单细胞转录组测序 | NA | 基因组测序数据,转录组数据 | 35名多发性硬化症患者(奥瑞珠单抗治疗),11名健康捐赠者,14名多发性硬化症患者(那他珠单抗治疗),29名捐赠者的脑脊液和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 466 | 2025-07-30 |
From iPSCs to myotubes: Identifying potential biomarkers for human FSHD by single-cell transcriptomics
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70423
PMID:40726336
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2025-10-06 |
Unravelling the Role of PIEZO1 in Adipogenesis of Fibrogenic/Adipogenic Progenitors for Muscle Fat Infiltration After Rotator Cuff Tear
2025-Aug, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.70004
PMID:40726363
|
研究论文 | 本研究探讨了机械敏感性离子通道PIEZO1在肩袖撕裂后肌纤维脂肪浸润中的作用机制 | 首次揭示PIEZO1通过ERK/KLF4信号通路调控FAPs成脂分化的新机制,并发现低强度脉冲超声可通过激活PIEZO1减轻脂肪浸润 | 研究样本量有限,机制研究主要基于动物模型,临床转化需要进一步验证 | 探索肩袖撕裂后机械环境变化如何影响肌肉脂肪浸润及其潜在治疗策略 | 人和小鼠的纤维生成/成脂祖细胞(FAPs) | 分子生物学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 小分子处理, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人和小鼠的FAPs细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 468 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional landscape of peripheral myeloid cells in autoimmune diseases
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113026
PMID:40703454
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析自身免疫疾病中外周髓系细胞的转录景观 | 首次在14种自身免疫疾病中对351,905个髓系细胞进行大规模单细胞转录组分析,识别出13个具有独特免疫特征的髓系细胞亚群 | 研究主要关注外周髓系细胞,未涉及组织驻留髓系细胞或其他免疫细胞类型 | 揭示自身免疫疾病中髓系细胞的异质性和功能状态 | 375个单细胞RNA测序样本中的351,905个外周髓系细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,伪时间分析,全基因组关联研究 | NA | 单细胞转录组数据,遗传数据 | 351,905个髓系细胞,来自375个样本,覆盖14种自身免疫疾病 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 469 | 2025-10-06 |
METAB-HTX: prospective, longitudinal cohort study evaluating cardiac and systemic metabolism after heart transplantation
2025-Aug, ESC heart failure
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/ehf2.15330
PMID:40375600
|
研究论文 | 一项评估心脏移植后心脏和全身代谢变化的前瞻性纵向队列研究 | 首次系统性地对心脏移植患者进行长期代谢表型分析,结合多组学技术和先进影像学方法评估代谢恶化与心脏功能的关系 | 单中心研究,样本量相对有限(400例),观察性研究设计无法确定因果关系 | 探索心脏移植后代谢恶化与心脏功能受损和生存率的关系 | 心脏移植术后患者 | 医学研究 | 心血管疾病 | 第三代和第四代测序(短读长和长读长测序)、单细胞测序、心脏磁共振成像和波谱分析、回声心动图 | NA | 临床数据、影像数据、基因组数据、转录组数据 | 400例心脏移植术后患者,随访5年 | NA | 单细胞测序、转录组测序 | NA | NA |
| 470 | 2025-10-06 |
Adverse effects of progestin-primed ovarian stimulation: combination of clinical study and single-cell analysis
2025-Aug, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2025.104833
PMID:40467355
|
研究论文 | 通过临床研究和单细胞分析评估孕激素预处理卵巢刺激对生殖结局的不良影响 | 结合临床队列研究和单细胞RNA测序技术探究PPOS方案对生殖结局的影响机制 | 回顾性研究设计,样本量相对有限 | 比较PPOS与GnRH拮抗剂方案在辅助生殖中的效果差异 | 接受IVF治疗的不孕症患者及其卵泡壁颗粒细胞 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序, 逆概率处理加权 | NA | 临床数据, 基因表达数据 | 907例患者(临床研究), 16例患者(单细胞分析) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 471 | 2025-10-06 |
Idiopathic Subglottic Stenosis and the Epithelial Interface of Host and Environment
2025-Aug-01, Journal of the American College of Surgeons
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/XCS.0000000000001340
PMID:39902917
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究特发性声门下狭窄的发病机制,揭示上皮细胞异常与微生物群移位在纤维化过程中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术对iSGS患者队列进行无偏倚分析,发现上皮祖细胞缺失和微生物群移位的病理机制 | 疾病罕见性和患者地理分布广泛可能限制样本规模,动物模型结果向人类转化的有效性需进一步验证 | 阐明特发性声门下狭窄的发病机制和病理过程 | 国际iSGS患者队列的病变黏膜组织和动物模型 | 单细胞基因组学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 国际iSGS患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 472 | 2025-10-06 |
Advances in single-cell omics: Transformative applications in basic and clinical research
2025-Aug, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2025.102548
PMID:40517461
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术的最新进展及其在基础和临床研究中的变革性应用 | 强调单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学整合技术在解析复杂组织和识别独特细胞群体方面的突破性能力 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法的具体局限性 | 探讨单细胞组学技术在生物学研究和临床应用中的重要作用 | 复杂组织、细胞群体、细胞功能状态 | 生物信息学 | 癌症、神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合、计算模型 | 计算模型 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 473 | 2025-10-06 |
Insights into chondrocyte populations in cartilaginous tissues at the single-cell level
2025-Aug, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-025-01275-0
PMID:40640375
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综述 | 通过单细胞多组学技术揭示软骨组织中软骨细胞群体的异质性及其在疾病中的作用 | 利用单细胞转录组学实现对软骨细胞亚型更精细的功能注释分类 | 需要将先进单细胞技术与计算建模相结合以解析软骨细胞群体的动态相互作用 | 研究软骨细胞亚型在软骨形成、维持和疾病进展中的作用 | 软骨组织中的软骨细胞群体 | 单细胞生物学 | 骨关节炎、椎间盘疾病 | 单细胞多组学、单细胞转录组学 | 计算建模 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学、单细胞转录组学 | NA | NA |
| 474 | 2025-10-06 |
Bioinspired 3D hydrogel scaffold to mimic tumor microenvironment for investigating into the anoikis resistance mechanisms in colorectal cancer
2025-Aug, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102061
PMID:40697318
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研究论文 | 开发了一种仿生复合水凝胶支架模拟肿瘤微环境,用于研究结直肠癌中的失巢凋亡抵抗机制 | 创建了由4-arm-PEGDA、明胶甲基丙烯酰和透明质酸甲基丙烯酰组成的仿生复合水凝胶,能形成紧凑的3D细胞球体模拟肿瘤微环境 | NA | 研究结直肠癌中失巢凋亡抵抗机制 | 结直肠癌细胞系Caco-2 | 生物医学工程 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,放射组学分析 | 3D水凝胶支架模型 | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 475 | 2025-10-06 |
NFATc1 Fosters Allergic Contact Dermatitis Responses by Enhancing the Induction of IL-17-Producing CD8 Cells
2025-Aug, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.11.014
PMID:39733935
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研究论文 | 本研究揭示NFATc1通过促进CD8+T细胞向Tc17细胞分化来增强过敏性接触性皮炎反应 | 首次发现NFATc1通过调控CD8+T细胞分化命运,促进Tc17细胞生成并加重过敏性接触性皮炎 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究NFATc1在过敏性接触性皮炎发病机制中的作用 | 小鼠CD8+T细胞和过敏性接触性皮炎模型 | 免疫学 | 过敏性接触性皮炎 | 单细胞RNA测序,细胞极化实验,过继转移实验 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 野生型和Nfatc1条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 476 | 2025-10-06 |
Long-Term High-Fat Diet Affected Bone Marrow Microenvironment During Aging at Single-Cell Resolution
2025-Aug, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70276
PMID:40692664
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示长期高脂饮食对衰老过程中骨髓微环境的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明长期高脂饮食通过骨髓微环境加速衰老的机制,发现骨髓巨噬细胞中Chil3和Fabp4上调及Ptn-Sdc3、Cxcl12-Cxcr4轴等新型信号通路 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究长期高脂饮食如何通过影响骨髓微环境加速衰老过程 | 长期高脂饮食喂养的衰老小鼠模型及其骨髓细胞 | 单细胞组学 | 骨质疏松 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | LHA小鼠模型的骨髓细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 477 | 2025-10-06 |
Induction of host genes by nested genes during C. elegans development
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113021
PMID:40686608
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研究论文 | 本研究通过分析秀丽隐杆线虫发育过程中反向嵌套基因对宿主基因的转录调控作用 | 首次系统性地揭示了反向嵌套基因构型中嵌套基因能够诱导宿主基因在特定细胞类型中产生短转录本 | 研究主要聚焦于蛋白质编码基因,未涉及其他类型基因的嵌套调控 | 探索基因组拓扑结构中反向嵌套基因对宿主基因表达的调控机制 | 秀丽隐杆线虫胚胎发育过程中的基因表达调控 | 发育生物学 | NA | CRISPR基因组工程, 单分子荧光原位杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 数百个蛋白质编码基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 478 | 2025-10-06 |
Unraveling asthma through single-cell RNA sequencing in understanding disease mechanisms
2025-Aug, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
DOI:10.1080/02770903.2025.2472358
PMID:40014380
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术的基本原理及其在哮喘研究中的应用,旨在增强对哮喘病理生理学的理解 | 系统总结了scRNA-seq在揭示哮喘免疫细胞异质性和功能状态方面的创新应用,为靶向治疗提供理论基础 | 数据整合方法需要进一步完善,当前研究结果的临床适用性有限,缺乏纵向和临床数据 | 阐明scRNA-seq的基本原理并总结其在哮喘研究中的应用,指导未来研究方向 | 哮喘相关细胞类型特别是免疫细胞和气道重塑细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 479 | 2025-10-06 |
A robust diagnostic model for high-risk MASH: integrating clinical parameters and circulating biomarkers through a multi-omics approach
2025-Aug, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-025-10792-9
PMID:40205303
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研究论文 | 通过多组学方法整合临床参数和循环生物标志物,开发用于高风险MASH的稳健诊断模型 | 首次将蛋白质组学、转录组学和单细胞测序数据整合,识别出TREM2、IL18BP和LGALS3BP作为Kupffer细胞中的关键生物标志物,并构建了ABD-LTyG预测模型 | 样本量相对有限(发现队列144人,验证队列171人),需要在更大规模人群中进一步验证 | 开发用于高风险代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)的诊断模型 | MASLD患者,特别是高风险MASH患者(NAS≥4+F≥2) | 生物医学信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 蛋白质组学分析,转录组分析,单细胞RNA测序,免疫荧光双标记,LASSO回归 | ABD-LTyG预测模型(包含AST、BMI、TB、维生素D、TyG、LGALS3BP和TREM2) | 蛋白质组数据,转录组数据,单细胞测序数据,临床参数,血液样本 | 发现队列144人,验证队列171人 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 转录组学 | NA | NA |
| 480 | 2025-10-06 |
Bone marrow tumor microenvironment profiling predicts distinct immunosuppressive phenotypes and immunotherapy potential in AML patients
2025-Aug, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118287
PMID:40555045
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研究论文 | 通过骨髓肿瘤微环境分析预测AML患者不同的免疫抑制表型和免疫治疗潜力 | 开发了新的巨核细胞/红细胞和髓单核细胞/单核细胞多基因标志物,改进了AML微环境分类,克服了传统的热-冷肿瘤分类方法 | 研究主要基于生物信息学分析和体外共培养实验,需要进一步的体内验证 | 解析急性髓系白血病的免疫景观并预测免疫治疗反应 | 成人和儿童AML患者队列及AML细胞系 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,共培养实验,生物信息学分析 | xCell算法,TIDE算法,Celligner匹配 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 成人和儿童AML患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |