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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-10-06 |
Single-Cell Omics Analysis Reveals Immunological Dysregulation in COVID-19 and HIV: Identifying a Shared Abnormality of B Cell Activation via the Unfolded Protein Response and Diagnostic Biomarkers Using Machine Learning Algorithms
2025-Aug, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70538
PMID:40757697
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示COVID-19和HIV患者B细胞中未折叠蛋白反应通路的异常激活,并开发机器学习诊断模型 | 首次在单细胞水平发现COVID-19和HIV共享的B细胞未折叠蛋白反应通路异常激活机制 | 分子机制仍需进一步深入研究 | 探究COVID-19和HIV共存时疾病加重的分子机制 | COVID-19和HIV感染患者的外周血细胞 | 单细胞组学 | COVID-19, HIV | 单细胞转录组测序 | 机器学习诊断模型 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2025-08-04 |
Rotation-invariance is essential for accurate detection of spatially variable genes in spatial transcriptomics
2025-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62574-4
PMID:40753081
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 443 | 2025-10-06 |
Comprehensive Single-Cell RNA Atlas of Human Laryngeal Normal, Preneoplastic, and Tumorigenic States
2025-Aug-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3679
PMID:40407728
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析喉部正常、癌前和肿瘤状态的细胞微环境差异 | 构建了首个声带息肉和声带白斑的单细胞图谱,并扩展了喉鳞状细胞癌的癌细胞图谱,揭示了VCL作为良恶性过渡病变的混合微环境特征 | 样本量相对有限(36例患者),需要更大规模研究验证发现 | 阐明声带白斑向喉鳞状细胞癌进展的分子机制 | 36例声带息肉、声带白斑和喉鳞状细胞癌患者的手术组织标本 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 36例患者,包含318,907个细胞和12,679个空间转录组位点 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 444 | 2025-10-06 |
Mapping the peripheral immune landscape of Parkinson's disease patients with single-cell sequencing
2025-Aug-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf066
PMID:40417848
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研究论文 | 通过单细胞测序绘制帕金森病患者外周免疫图谱 | 首次使用单细胞RNA和T细胞受体测序全面分析帕金森病患者外周免疫细胞转录组变化,识别出疾病特异性免疫特征和潜在生物标志物 | 样本量相对有限(10名健康对照和14名帕金森病患者),仅关注外周免疫系统 | 探索帕金森病患者外周免疫细胞的转录组变化,寻找疾病特征和潜在血液生物标志物 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞测序分析 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | 生物信息学聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 78,876个细胞(来自10名健康对照和14名帕金森病患者) | NA | 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 445 | 2025-10-06 |
Early transcriptional states of spermatogonia and marker expressions in the prepubertal human testis following chemotherapy-induced depletion
2025-Aug-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf103
PMID:40482072
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究化疗诱导的精原细胞耗竭后青春期前人类睾丸中精原细胞的分化状态和标志物表达 | 首次在青春期前儿童癌症患者中证实睾丸仅含有未分化精原细胞,并发现表达UTF1和PIWIL4标志物的精原细胞亚型对化疗诱导的耗竭更具抵抗力 | 研究人群在年龄和治疗暴露方面存在异质性,无法单独评估特定癌症治疗的影响,组织可用性有限降低了统计功效,不同精原细胞标志物表达的相关性仅为指示性趋势 | 研究正常条件下和化疗诱导精原细胞耗竭后青春期前睾丸中精原细胞的分化状态 | 青春期前人类睾丸组织和儿童癌症患者的睾丸组织样本 | 单细胞生物学 | 儿童癌症 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 6个健康男孩睾丸样本(0-17岁),14个生物库对照样本(中位年龄4.9岁),31个儿童癌症患者睾丸样本(中位年龄6.8岁) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 446 | 2025-10-06 |
Proteomic profiling of nasal fluids and serum for type 2 nasal polyps diagnosis
2025-Aug, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2025.04.007
PMID:40280274
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析和机器学习框架开发了基于鼻液和血清蛋白质表达的无创诊断模型,用于2型慢性鼻窦炎伴鼻息肉的诊断 | 首次结合蛋白质组学与机器学习方法,基于鼻液和血清样本开发了2型鼻息肉的无创诊断模型,并识别出关键生物标志物 | 样本量相对有限(82例患者),需要更大规模的研究验证模型的普适性 | 系统评估鼻液和血清中蛋白质表达对2型慢性鼻窦炎伴鼻息肉的预测价值 | 82例慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者 | 机器学习 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 邻近延伸分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序、逆转录定量聚合酶链反应 | 机器学习(LASSO回归) | 蛋白质表达数据、RNA测序数据 | 82例患者 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | NA |
| 447 | 2025-10-06 |
CCR2+ monocytes promote memory CD8+ T-cell differentiation via membrane-bound TGF-β
2025-Aug, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01299-2
PMID:40461701
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了CCR2+单核细胞通过膜结合TGF-β促进记忆CD8+ T细胞分化的新机制 | 首次发现单核细胞通过细胞间接触和膜结合TGF-β依赖的方式促进记忆CD8 T细胞分化,揭示了CD8 T细胞命运决定的空间机制 | 研究主要聚焦于急性感染模型中的脾脏环境,其他组织或慢性感染中的机制尚不明确 | 探究急性感染期间效应和记忆CD8 T细胞命运决定的空间决定因素 | CD8 T细胞、单核细胞、树突状细胞 | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 448 | 2025-10-06 |
From roots to nodules: regulation of organogenesis in nitrogen-fixing symbiosis
2025-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102755
PMID:40582138
|
综述 | 本文综述了固氮植物根瘤器官发生的分子调控机制及其与侧根发育的进化关系 | 通过比较根瘤与侧根发育的调控网络,揭示器官特异性进化的分子基础,并整合单细胞转录组等新兴技术 | 主要聚焦于豆科植物蝶形花亚科,可能不适用于其他固氮植物类群 | 探索固氮共生中根瘤器官发生的调控机制及其进化起源 | 固氮植物根瘤器官发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、先进成像技术、系统基因组学 | NA | 基因表达数据、成像数据、进化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 449 | 2025-10-06 |
The Critical Role of APOE+ Macrophages in the Immune Microenvironment and Prognosis of Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70731
PMID:40736341
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了APOE+巨噬细胞在肺腺癌免疫微环境中的关键作用,并开发了相关的风险预测模型 | 首次系统阐明APOE+巨噬细胞通过MIF信号通路塑造免疫抑制微环境的机制,并开发了具有最高预后准确度的风险模型 | NA | 阐明APOE+巨噬细胞在肺腺癌免疫微环境中的免疫调节功能及临床意义 | 肺腺癌肿瘤微环境中的APOE+巨噬细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞转录组测序, 多重免疫荧光分析, 机器学习 | RSF, Ridge | 单细胞转录组数据, 突变谱数据, 免疫组化数据 | 7个公共队列和3个前瞻性免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 450 | 2025-10-06 |
Lymph-node-derived stem-like but not tumor-tissue-resident CD8+ T cells fuel anticancer immunity
2025-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02219-2
PMID:40730900
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传小鼠模型系统解析了肿瘤和引流淋巴结中CD8+ T细胞的异质性与功能 | 发现淋巴结来源的干细胞样CD8+ T细胞而非肿瘤组织驻留细胞驱动抗肿瘤免疫,并揭示TGFβ在限制干细胞样T细胞丰度中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类癌症中的发现需要进一步验证 | 阐明不同类型CD8+ T细胞在肿瘤控制和免疫检查点阻断治疗中的相对贡献 | 肿瘤和肿瘤引流淋巴结中的细胞毒性T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2025-08-03 |
Correction: Cross-tissue gene expression interactions from bulk, single cell and spatial transcriptomics with crossWGCNA
2025-Aug-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11923-0
PMID:40750841
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2025-10-06 |
Dual-expression (primitive enterocyte phenotype and neuroendocrine differentiation) gastric adenocarcinoma: the unique high-aggressive subtype
2025-Aug-01, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04191-6
PMID:40751090
|
研究论文 | 本研究识别并表征了胃腺癌中同时表达原始肠上皮细胞表型和神经内分泌分化的独特高侵袭性亚型 | 首次系统描述了胃腺癌中双重表达亚型的临床病理特征,发现其具有独特的侵袭行为和分子特征 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 阐明双重表达胃腺癌亚型的临床病理特征和分子特性 | 胃腺癌患者组织样本和胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组织化学,单细胞RNA测序,体外实验 | NA | 组织样本,细胞系,测序数据 | 186例GAPEP患者(77例DEGA,109例nDEGA) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 453 | 2025-10-06 |
Tumor Necrosis Factor Receptor Superfamily Member 12A Enhances Retinal Ganglion Cell Survival and Promotes Axon Regeneration
2025-Aug-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500988RR
PMID:40747811
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现Tnfrsf12a/Fn14能增强视网膜神经节细胞存活并促进轴突再生 | 首次发现Tnfrsf12a/Fn14在αRGCs/ipRGCs中富集于轴突再生相关生物过程,并证实其双重神经保护和再生功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在更高等哺乳动物验证 | 探索增强视网膜神经节细胞存活和轴突再生的转录通路 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序,AAV病毒载体,免疫染色,电生理记录 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据,电生理数据 | 小鼠视神经损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 454 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling uncovers cellular complexity and microenvironment in gastric tumorigenesis associated with Helicobacter pylori
2025-Aug, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.10.012
PMID:39414226
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示幽门螺杆菌相关胃肿瘤发生过程中的细胞异质性和微环境特征 | 首次构建了涵盖胃炎、肠上皮化生和胃癌的胃肿瘤发生单细胞图谱,揭示了不同细胞谱系的癌症相关表达特征和细胞间通讯网络 | 样本量相对有限(18例标本),需要在更大队列中验证发现 | 解析幽门螺杆菌驱动的胃肿瘤发生过程中的细胞异质性和分子机制 | 人类胃组织标本(胃炎、胃肠上皮化生和胃癌) | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,免疫组化,qRT-PCR,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学数据,公共数据库数据 | 18例胃组织标本(胃炎、胃肠上皮化生和胃癌),另有人类胃组织验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 455 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Critical Role of SEC16B in Lung Metastasis of Osteosarcoma
2025-Aug, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00161
PMID:40735296
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示SEC16B在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出与骨肉瘤肺转移密切相关的C1肿瘤细胞亚群,并发现SEC16B基因的下调在肺转移中起关键作用 | 样本量相对有限(6个原发肿瘤样本,2个肺转移样本,4个正常骨组织样本) | 探究骨肉瘤肺转移的分子机制并识别关键调控基因 | 骨肉瘤患者组织样本(原发肿瘤、肺转移灶)和正常骨组织 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Transwell实验 | hdWGCNA, CytoTRACE, Scissor, CellphoneDB, CSOmap | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 12个单细胞RNA测序样本(6原发+2转移+4正常)+ 8个批量RNA测序样本(4原发+4转移) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 456 | 2025-10-06 |
Combined angiogenic and hypertrophic gene therapy enhances skeletal muscle growth
2025-Aug-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00966.2024
PMID:40622896
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研究论文 | 本研究通过联合使用肌生成抑制素原肽和血管内皮生长因子B基因疗法,探索促进骨骼肌生理性生长和改善肌肉功能的新策略 | 首次将血管生成和肌肉肥大的基因疗法相结合,克服了单一促肌肉生长疗法导致的毛细血管稀疏等副作用 | 研究主要在健康和小鼠糖尿病模型中进行,尚未在更多疾病模型或大型动物中验证 | 开发能够同时促进肌肉生长和血管生成的联合基因疗法,以克服当前肌肉肥大治疗的局限性 | 健康小鼠和糖尿病小鼠的骨骼肌组织 | 基因治疗 | 肌肉萎缩 | 单细胞RNA测序,腺相关病毒载体基因递送 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 健康小鼠和糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 457 | 2025-10-06 |
Human myelocyte and metamyelocyte-stage neutrophils suppress tumor immunity and promote cancer progression
2025-Aug, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-025-01145-0
PMID:40664963
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研究论文 | 本研究揭示了人类骨髓细胞和晚幼粒细胞阶段中性粒细胞在肿瘤免疫抑制和促进癌症进展中的关键作用 | 首次将人类中性粒细胞分为三个发育阶段,发现MC&MM阶段中性粒细胞具有强免疫抑制特性,并建立了支持人类肿瘤浸润中性粒细胞重建的NCG-Gfi1 HIS小鼠模型 | 研究主要基于小鼠模型,在人类患者中的直接验证仍需进一步研究 | 探索肿瘤浸润中性粒细胞不同发育阶段的免疫调节功能及其在癌症进展中的作用 | 人类和小鼠的中性粒细胞,涵盖17种癌症类型的患者样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NCG-Gfi1人类免疫系统小鼠模型 | 基因表达数据 | 涵盖17种癌症类型的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 458 | 2025-10-06 |
Transcription factors TCF4 and KLF4 respectively control the development of the DC2A and DC2B lineages
2025-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02208-5
PMID:40702338
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序等技术揭示了转录因子TCF4和KLF4分别调控DC2A和DC2B谱系发育的分子机制 | 首次明确Klf4表达可区分cDC与pDC谱系,并鉴定出两个前体DC2亚群及其特异性发育调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类DC细胞发育机制仍需进一步验证 | 阐明常规树突状细胞(cDC)的谱系发育和分类框架 | 小鼠常规树突状细胞(cDC)和浆细胞样树突状细胞(pDC) | 免疫学 | NA | 单细胞测序, 转录因子命运示踪模型, 条件性基因敲除模型, 过继转移 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2025-10-06 |
B- and T cell receptor sequencing elucidates characteristics of lymphocyte depletion by ocrelizumab
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113068
PMID:40727939
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研究论文 | 本研究通过分析B细胞和T细胞受体序列,阐明了奥瑞珠单抗治疗对多发性硬化症患者淋巴细胞耗竭的特征 | 首次在奥瑞珠单抗治疗背景下全面分析B细胞和T细胞受体库变化,并发现脑脊液中组织驻留记忆细胞的治疗抵抗现象 | 样本量有限,未来需要更大规模研究验证已识别表型与多发性硬化病理的关系 | 阐明奥瑞珠单抗治疗对多发性硬化症患者适应性免疫系统的影响 | 多发性硬化症患者和健康捐赠者的血液、脑脊液样本 | 免疫学 | 多发性硬化症 | B细胞受体测序,T细胞受体测序,单细胞转录组测序 | NA | 基因组测序数据,转录组数据 | 35名多发性硬化症患者(奥瑞珠单抗治疗),11名健康捐赠者,14名多发性硬化症患者(那他珠单抗治疗),29名捐赠者的脑脊液和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 460 | 2025-07-30 |
From iPSCs to myotubes: Identifying potential biomarkers for human FSHD by single-cell transcriptomics
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70423
PMID:40726336
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |