单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 541 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-06 |
Co-Expression of MHC-II and ANXA1: Mediators of PD-1/PD-L1 Therapy Resistance in Breast Cancer
2025-Aug, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70291
PMID:40744683
|
研究论文 | 本研究探讨MHC-II和ANXA1在乳腺癌中对PD-1/PD-L1治疗耐药性的潜在作用 | 发现ANXA1在PD-1/PD-L1治疗无应答者中表达增加，揭示了其作为免疫治疗耐药性介导因子的新机制 | ANXA1表达与总生存率缺乏直接相关性，需要进一步验证 | 研究MHC-II表达在乳腺癌免疫逃逸、肿瘤转移和免疫治疗疗效中的作用 | 三阴性乳腺癌患者和乳腺癌组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 差异表达分析, GO和KEGG通路富集分析, 孟德尔随机化分析 | Limma, clusterProfiler, Scanpy, CellTypist, UMAP, PCA, Leiden算法 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | UK Biobank和GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2025-10-06 |
Effects of Cholesterol Metabolism on Corneal Endothelial Dysfunction in Patients With Type 1 Diabetes
2025-Aug-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.11.9
PMID:40762538
|
研究论文 | 本研究从胆固醇代谢角度揭示糖尿病诱导角膜内皮功能障碍的机制 | 首次发现糖尿病通过抑制SREBF2/SQLE依赖的胆固醇生物合成途径导致角膜内皮功能障碍 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，在人体中的直接证据有限 | 探究胆固醇代谢在糖尿病角膜内皮功能障碍中的作用机制 | 1型糖尿病小鼠模型、高糖培养的B4G12细胞、人和小鼠角膜内皮样本 | 眼科疾病研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,RT-qPCR,Western blotting,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 糖尿病小鼠模型和高糖培养细胞模型 | NA | single-cell RNA-seq,RNA-seq | NA | NA |
| 423 | 2025-10-06 |
Single-cell eQTL Mapping Reveals Cell Subtype-specific Genetic Control and Mechanism in Malignant Transformation of Colorectal Cancer
2025-Aug-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1561
PMID:40029140
|
研究论文 | 通过单细胞eQTL图谱揭示结直肠癌恶性转化过程中细胞亚型特异性遗传调控机制 | 构建首个结直肠癌单细胞eQTL图谱，发现76%的sc-eQTL具有细胞类型特异性，且通过多基因风险评分显著改善结直肠癌风险预测 | NA | 解析结直肠癌恶性转化过程中的细胞亚型特异性遗传调控机制 | 142个多阶段结直肠癌样本 | 单细胞基因组学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,单细胞多组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,单细胞多组学数据 | 751,531个单细胞转录组,142个多阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 424 | 2025-10-06 |
Unraveling Liver Cirrhosis: Bridging Pathophysiology to Innovative Therapeutics
2025-Aug-03, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.70037
PMID:40754005
|
综述 | 本文综述了肝硬化的病理生理机制及创新治疗策略的最新研究进展 | 整合了单细胞转录组学、空间生物学和人工智能等前沿技术对肝硬化异质性的新认识，并探讨了微生物组调节、抗纤维化药物和再生医学等创新疗法 | 作为综述文章，未报告原始研究数据，主要基于现有文献进行整合分析 | 探讨肝硬化的病理生理机制并评估创新治疗策略 | 肝硬化及其相关病理过程 | 医学研究 | 肝硬化 | 单细胞转录组学、空间生物学、弹性成像、液体活检、人工智能建模 | 计算模型 | 文本综述 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 425 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing reveals BHLHE40 and NDRG1 as key regulatory molecules modulating the trophoblastic senescence in preeclampsia
2025-Aug, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.06.009
PMID:40517485
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现BHLHE40和NDRG1是调控先兆子痫中滋养细胞衰老的关键分子 | 首次通过整合单细胞RNA测序、ChIP检测和转录组数据分析，揭示BHLHE40和NDRG1在滋养细胞衰老中的关键调控作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，需要进一步在体功能验证 | 探索先兆子痫中滋养细胞衰老的分子机制和关键调控靶点 | 先兆子痫患者胎盘组织、LPS诱导的先兆子痫大鼠模型和体外培养的滋养细胞 | 单细胞测序分析 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序, ChIP检测, 转录组测序, WGCNA分析 | 列线图模型 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE173193, GSE24129, GSE75010)和实验验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 426 | 2025-10-06 |
Single-Cell Omics Analysis Reveals Immunological Dysregulation in COVID-19 and HIV: Identifying a Shared Abnormality of B Cell Activation via the Unfolded Protein Response and Diagnostic Biomarkers Using Machine Learning Algorithms
2025-Aug, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70538
PMID:40757697
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示COVID-19和HIV患者B细胞中未折叠蛋白反应通路的异常激活，并开发机器学习诊断模型 | 首次在单细胞水平发现COVID-19和HIV共享的B细胞未折叠蛋白反应通路异常激活机制 | 分子机制仍需进一步深入研究 | 探究COVID-19和HIV共存时疾病加重的分子机制 | COVID-19和HIV感染患者的外周血细胞 | 单细胞组学 | COVID-19, HIV | 单细胞转录组测序 | 机器学习诊断模型 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 427 | 2025-08-04 |
Rotation-invariance is essential for accurate detection of spatially variable genes in spatial transcriptomics
2025-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62574-4
PMID:40753081
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 428 | 2025-10-06 |
Comprehensive Single-Cell RNA Atlas of Human Laryngeal Normal, Preneoplastic, and Tumorigenic States
2025-Aug-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3679
PMID:40407728
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析喉部正常、癌前和肿瘤状态的细胞微环境差异 | 构建了首个声带息肉和声带白斑的单细胞图谱，并扩展了喉鳞状细胞癌的癌细胞图谱，揭示了VCL作为良恶性过渡病变的混合微环境特征 | 样本量相对有限（36例患者），需要更大规模研究验证发现 | 阐明声带白斑向喉鳞状细胞癌进展的分子机制 | 36例声带息肉、声带白斑和喉鳞状细胞癌患者的手术组织标本 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 36例患者，包含318,907个细胞和12,679个空间转录组位点 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-06 |
Mapping the peripheral immune landscape of Parkinson's disease patients with single-cell sequencing
2025-Aug-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf066
PMID:40417848
|
研究论文 | 通过单细胞测序绘制帕金森病患者外周免疫图谱 | 首次使用单细胞RNA和T细胞受体测序全面分析帕金森病患者外周免疫细胞转录组变化，识别出疾病特异性免疫特征和潜在生物标志物 | 样本量相对有限（10名健康对照和14名帕金森病患者），仅关注外周免疫系统 | 探索帕金森病患者外周免疫细胞的转录组变化，寻找疾病特征和潜在血液生物标志物 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞测序分析 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | 生物信息学聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 78,876个细胞（来自10名健康对照和14名帕金森病患者） | NA | 单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-10-06 |
Early transcriptional states of spermatogonia and marker expressions in the prepubertal human testis following chemotherapy-induced depletion
2025-Aug-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf103
PMID:40482072
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究化疗诱导的精原细胞耗竭后青春期前人类睾丸中精原细胞的分化状态和标志物表达 | 首次在青春期前儿童癌症患者中证实睾丸仅含有未分化精原细胞，并发现表达UTF1和PIWIL4标志物的精原细胞亚型对化疗诱导的耗竭更具抵抗力 | 研究人群在年龄和治疗暴露方面存在异质性，无法单独评估特定癌症治疗的影响，组织可用性有限降低了统计功效，不同精原细胞标志物表达的相关性仅为指示性趋势 | 研究正常条件下和化疗诱导精原细胞耗竭后青春期前睾丸中精原细胞的分化状态 | 青春期前人类睾丸组织和儿童癌症患者的睾丸组织样本 | 单细胞生物学 | 儿童癌症 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 6个健康男孩睾丸样本（0-17岁），14个生物库对照样本（中位年龄4.9岁），31个儿童癌症患者睾丸样本（中位年龄6.8岁） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-06 |
Batch correction methods used in single-cell RNA sequencing analyses are often poorly calibrated
2025-Aug-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279886.124
PMID:40623818
|
研究论文 | 比较八种单细胞RNA测序数据批次校正方法的性能表现 | 提出了一种新方法来评估批次校正方法在精细尺度上对数据的改变程度 | 仅评估了八种方法，可能未涵盖所有现有批次校正方法 | 评估单细胞RNA测序数据批次校正方法的校准效果 | 单细胞RNA测序数据批次校正方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-06 |
A novel multislice framework for precision 3D spatial domain reconstruction and disease pathology analysis
2025-Aug-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280281.124
PMID:40659497
|
研究论文 | 提出一种名为STMSC的多切片联合分析框架，用于精确三维空间域重建和疾病病理分析 | 开发了具有预校正机制的多切片联合分析框架，能够精确识别复杂空间域并重建三维组织结构 | NA | 通过空间转录组学技术深入解析组织成分和机制，推进疾病病理学研究 | 连续组织切片和病理数据集，重点关注癌症微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学，H&E成像 | 图注意力自编码器 | 空间转录组数据，H&E图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 433 | 2025-10-06 |
Proteomic profiling of nasal fluids and serum for type 2 nasal polyps diagnosis
2025-Aug, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2025.04.007
PMID:40280274
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析和机器学习框架开发了基于鼻液和血清蛋白质表达的无创诊断模型，用于2型慢性鼻窦炎伴鼻息肉的诊断 | 首次结合蛋白质组学与机器学习方法，基于鼻液和血清样本开发了2型鼻息肉的无创诊断模型，并识别出关键生物标志物 | 样本量相对有限（82例患者），需要更大规模的研究验证模型的普适性 | 系统评估鼻液和血清中蛋白质表达对2型慢性鼻窦炎伴鼻息肉的预测价值 | 82例慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者 | 机器学习 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 邻近延伸分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序、逆转录定量聚合酶链反应 | 机器学习（LASSO回归） | 蛋白质表达数据、RNA测序数据 | 82例患者 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | NA |
| 434 | 2025-10-06 |
CCR2+ monocytes promote memory CD8+ T-cell differentiation via membrane-bound TGF-β
2025-Aug, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01299-2
PMID:40461701
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了CCR2+单核细胞通过膜结合TGF-β促进记忆CD8+ T细胞分化的新机制 | 首次发现单核细胞通过细胞间接触和膜结合TGF-β依赖的方式促进记忆CD8 T细胞分化，揭示了CD8 T细胞命运决定的空间机制 | 研究主要聚焦于急性感染模型中的脾脏环境，其他组织或慢性感染中的机制尚不明确 | 探究急性感染期间效应和记忆CD8 T细胞命运决定的空间决定因素 | CD8 T细胞、单核细胞、树突状细胞 | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-06 |
Integrative exome sequencing and machine learning identify MICB and interferon pathway genes as contributors to SSc risk
2025-Aug, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.05.009
PMID:40514331
|
研究论文 | 通过整合外显子组测序和机器学习方法，识别出MICB和干扰素通路基因是系统性硬化症的风险因素 | 开发了进化行动-机器学习框架，整合多种基因组学数据识别新的蛋白质编码变异和致病通路 | 研究主要基于高加索人群，需要在其他人群中验证 | 识别系统性硬化症的新的遗传风险因素和致病机制 | 系统性硬化症患者和健康对照 | 机器学习 | 系统性硬化症 | 外显子组测序, 单细胞RNA测序, 表达数量性状位点分析 | 机器学习 | 基因组数据, 转录组数据 | 发现队列2,559例患者和893例对照，验证队列9,846例患者和18,333例对照 | NA | 外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2025-10-06 |
From roots to nodules: regulation of organogenesis in nitrogen-fixing symbiosis
2025-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102755
PMID:40582138
|
综述 | 本文综述了固氮植物根瘤器官发生的分子调控机制及其与侧根发育的进化关系 | 通过比较根瘤与侧根发育的调控网络，揭示器官特异性进化的分子基础，并整合单细胞转录组等新兴技术 | 主要聚焦于豆科植物蝶形花亚科，可能不适用于其他固氮植物类群 | 探索固氮共生中根瘤器官发生的调控机制及其进化起源 | 固氮植物根瘤器官发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、先进成像技术、系统基因组学 | NA | 基因表达数据、成像数据、进化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 437 | 2025-10-06 |
The Critical Role of APOE+ Macrophages in the Immune Microenvironment and Prognosis of Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70731
PMID:40736341
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了APOE+巨噬细胞在肺腺癌免疫微环境中的关键作用，并开发了相关的风险预测模型 | 首次系统阐明APOE+巨噬细胞通过MIF信号通路塑造免疫抑制微环境的机制，并开发了具有最高预后准确度的风险模型 | NA | 阐明APOE+巨噬细胞在肺腺癌免疫微环境中的免疫调节功能及临床意义 | 肺腺癌肿瘤微环境中的APOE+巨噬细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞转录组测序, 多重免疫荧光分析, 机器学习 | RSF, Ridge | 单细胞转录组数据, 突变谱数据, 免疫组化数据 | 7个公共队列和3个前瞻性免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 438 | 2025-10-06 |
Lymph-node-derived stem-like but not tumor-tissue-resident CD8+ T cells fuel anticancer immunity
2025-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02219-2
PMID:40730900
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传小鼠模型系统解析了肿瘤和引流淋巴结中CD8+ T细胞的异质性与功能 | 发现淋巴结来源的干细胞样CD8+ T细胞而非肿瘤组织驻留细胞驱动抗肿瘤免疫，并揭示TGFβ在限制干细胞样T细胞丰度中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类癌症中的发现需要进一步验证 | 阐明不同类型CD8+ T细胞在肿瘤控制和免疫检查点阻断治疗中的相对贡献 | 肿瘤和肿瘤引流淋巴结中的细胞毒性T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2025-10-06 |
Dysregulation of Rho-Associated Coiled-Coil Protein Kinase1 Depletes Neural Stem Cell Pool and Impairs Hippocampal Neurogenesis After Traumatic Brain Injury
2025-Aug-01, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70093
PMID:40749978
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了创伤性脑损伤后海马神经干细胞池耗竭的分子机制，发现ROCK1信号通路异常是导致神经发生受损的关键因素 | 首次发现ROCK1在创伤性脑损伤后神经干细胞池动态变化中的关键调控作用，并阐明ROCK1-AKT信号轴在成人海马神经发生中的单向调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床转化需要进一步验证 | 探究创伤性脑损伤后海马神经发生受损的分子机制 | 小鼠海马神经干细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除，药理学抑制 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 440 | 2025-10-06 |
Exploring the Genetic Landscape of Psoriatic Arthritis: A Narrative Review of Recent Genomic Studies
2025-Aug-01, The Journal of rheumatology
IF:3.6Q2
DOI:10.3899/jrheum.2025-0273
PMID:40750314
|
综述 | 本文综述了银屑病关节炎基因组学领域的最新研究进展 | 聚焦于可能具有临床意义的基因组变异，探讨单细胞测序和空间组学等新兴技术在银屑病关节炎研究中的应用 | 目前尚无用于银屑病关节炎管理的基因检测方法 | 推进银屑病关节炎的分层、预后和药物基因组学研究 | 银屑病关节炎患者 | 基因组学 | 银屑病关节炎 | NGS, 单细胞测序, 空间组学, 转录谱分析 | NA | 基因组数据 | 大规模基因组数据集 | NA | 单细胞测序, 空间组学 | NA | NA |