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当前共找到 541 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-06 |
Defining the Ovarian Cancer Precancerous Landscape through Modeling Fallopian Tube Epithelium Reprogramming Driven by Extracellular Vesicles
2025-Aug-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0064
PMID:40689422
|
研究论文 | 本研究通过微流体组织培养平台结合空间转录组和蛋白质组分析，探索卵巢癌来源的小细胞外囊泡对输卵管上皮细胞重编程的影响 | 开发了首个结合空间转录组和蛋白质组读数的微流体组织培养平台，能够同时捕获组织对sEV暴露的短期转录组变化和长期蛋白质组响应 | 研究使用体外培养系统，可能无法完全模拟体内环境；样本规模相对有限 | 阐明卵巢癌前病变的分子机制，特别关注细胞外囊泡驱动的输卵管上皮重编程 | 人输卵管上皮细胞和卵巢癌来源的小细胞外囊泡 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 微流体组织培养 | 微流体组织培养模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 微流体组织培养平台结合空间转录组和蛋白质组读数 |
| 402 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell Analysis Reveals Iron Overload-Induced Senescence and Metabolic Reprogramming in Ovarian Endometriosis-Associated Infertility
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417528
PMID:40693455
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研究论文 | 通过整合单细胞分析揭示铁过载诱导卵巢子宫内膜异位症相关不孕中的细胞衰老和代谢重编程 | 首次结合单细胞图谱和空间转录组学揭示铁过载在卵巢子宫内膜异位症不孕中的细胞衰老机制 | 研究样本量有限，主要基于小鼠模型和部分人类卵巢样本 | 研究铁过载对卵巢子宫内膜异位症相关不孕患者卵泡功能的影响机制 | 卵巢子宫内膜异位症不孕患者的排卵前卵泡液、铁过载小鼠卵巢、衰老人类卵巢 | 数字病理学 | 卵巢子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 卵巢子宫内膜异位症不孕患者卵泡液样本、铁过载小鼠卵巢、衰老人类卵巢样本 | 华大基因 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Stereo-seq | 华大基因Stereo-seq空间转录组技术 |
| 403 | 2025-10-06 |
SCENE: Signature Collection for Endometrial Cancer Prognosis
2025-Aug, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70762
PMID:40754672
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研究论文 | 开发了一个名为SCENE的数据库，用于收集子宫内膜癌转录组特征并与患者预后相关联 | 创建了首个专门针对子宫内膜癌的转录组特征与预后关联数据库，整合了多种RNA类型的特征数据 | 基于文献回顾而非原始实验数据，可能受限于已发表研究的质量和覆盖面 | 改善子宫内膜癌的预后预测准确性 | 子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组分析(scRNA-seq), 文献挖掘 | 数据库系统 | 文本数据, 转录组数据 | 约200项研究，包含700个mRNA特征、60个miRNA特征和150个lncRNA特征 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 404 | 2025-10-06 |
Nanoparticle-Delivered siRNA Targeting NSUN4 Relieves Systemic Lupus Erythematosus through Declining Mitophagy-Mediated CD8+T Cell Exhaustion
2025-Aug, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70311
PMID:40761479
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序发现系统性红斑狼疮中CD7+CD74+ CD8+T细胞亚群扩增，并揭示NSUN4通过调控线粒体自噬促进CD8+T细胞耗竭的机制 | 首次发现CD7+CD74+ CD8+T细胞亚群在SLE中的扩增现象，阐明NSUN4通过m5C修饰调控CD74表达和线粒体自噬的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，在人体中的治疗效果需要进一步验证 | 探索系统性红斑狼疮中CD8+T细胞耗竭的分子机制并开发治疗策略 | 系统性红斑狼疮患者和SLE小鼠模型 | 表观转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序,m5C表观转录组测序,siRNA纳米颗粒递送 | NA | 转录组数据,表观遗传数据 | SLE患者和对照人群的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,表观转录组测序 | NA | NA |
| 405 | 2025-10-06 |
Anatomical Region-Specific Transcriptomic Signatures and the Role of Epithelial Cells in Pterygium Inflammation: A Multi-Omics Analysis
2025-Aug-01, Translational vision science & technology
IF:2.6Q2
DOI:10.1167/tvst.14.8.13
PMID:40772680
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研究论文 | 通过多组学分析揭示翼状胬肉不同解剖区域的转录组特征及上皮细胞在炎症中的作用 | 首次区分翼状胬肉主体区和附属区的分子特征，发现上皮细胞在ANPTL、IL1和KLK信号网络中的关键作用 | 样本量较小（6例批量RNA-seq，2例单细胞RNA-seq） | 理解翼状胬肉不同解剖区域的细胞和分子模式差异，重点关注炎症和线粒体能量代谢 | 翼状胬肉患者组织样本 | 生物信息学 | 翼状胬肉 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | 转录组数据 | 6例批量RNA-seq样本，2例单细胞RNA-seq样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 406 | 2025-10-06 |
Cellular senescence in renal ischemia-reperfusion injury
2025-Aug-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003698
PMID:40625295
|
综述 | 本文综述了细胞衰老在肾脏缺血再灌注损伤中的作用机制及靶向治疗策略 | 系统阐述细胞衰老在IRI-AKI向慢性肾损伤转变中的关键作用，并探讨新兴的衰老靶向治疗策略 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证相关机制 | 探讨细胞衰老在肾脏缺血再灌注损伤中的病理机制及治疗靶点 | 肾脏缺血再灌注损伤模型及相关的细胞衰老过程 | 病理生理学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序、人工智能药物筛选 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 407 | 2025-10-06 |
Decoding the immune microenvironment of secondary chronic myelomonocytic leukemia due to diffuse large B-cell lymphoma with CD19 CAR-T failure by single-cell RNA-sequencing
2025-Aug-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003690
PMID:40625291
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析CD19 CAR-T治疗失败后继发慢性粒单核细胞白血病的免疫微环境特征 | 首次报道CAR-T治疗后继发CMML这一新型继发肿瘤类型，并揭示其免疫微环境特征 | 仅基于单个病例研究，样本量有限 | 阐明CAR-T治疗后继发肿瘤的免疫微环境特征及其发病机制 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者CAR-T治疗后继发的慢性粒单核细胞白血病 | 单细胞测序分析 | 慢性粒单核细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | Cell Ranger, CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 1例患者（治疗前后骨髓样本） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 408 | 2025-10-06 |
High-resolution spatial transcriptomics in fixed tissue using a cost-effective PCL-seq workflow
2025-Aug-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279906.124
PMID:40764053
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PCL-seq的新型空间转录组学技术，能够在固定组织中实现高分辨率空间基因表达分析 | 开发了基于光控DNA标记策略的空间索引方法，首次实现与FFPE组织兼容且具备亚细胞分辨率的空间转录组分析 | NA | 开发一种成本效益高且通用的空间转录组学工作流程 | 小鼠胚胎冷冻组织和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，光切割测序 | NA | 基因表达矩阵，空间转录组数据 | 小鼠胚胎组织（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | PCL-seq工作流程 | 光切割和连接测序，使用光可切割寡核苷酸和连接适配器，光照直径=100 µm，检测约170,000个独特分子标识符和8600个基因 |
| 409 | 2025-10-06 |
Macrophage activation determines muscle wasting in pancreatic cancer
2025-Aug, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03434-9
PMID:40442475
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现巨噬细胞通过CHI3L1-HDAC3信号通路介导胰腺癌肌肉萎缩 | 首次通过单细胞RNA测序确定巨噬细胞是胰腺癌早期肌肉萎缩的关键介质，并揭示CHI3L1-HDAC3信号通路机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肿瘤微环境中非癌细胞在癌症恶病质发生发展中的作用机制 | KPC转基因小鼠模型、PBMC细胞、小鼠源性同种移植肿瘤、C2C12成肌细胞 | 单细胞测序分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | KPC GEMM小鼠模型 | 单细胞基因表达数据 | PBMC 29,615个细胞，MDST 23,151个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 410 | 2025-10-06 |
Developing risk stratification strategies and biomarkers for recurrent hepatocellular carcinoma
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70410
PMID:40741894
|
综述 | 本文探讨肝细胞癌术后复发风险分层策略和生物标志物的最新进展 | 整合基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、液体活检和人工智能驱动的组织学与影像组学分析等多组学方法 | 传统临床和病理学预测指标在准确识别高风险患者方面存在不足 | 开发肝细胞癌复发风险分层策略和生物标志物 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、液体活检、AI驱动的组织学和影像组学分析 | 人工智能 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、组织学图像、医学影像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 411 | 2025-10-06 |
Dynamical systems theory as an organizing principle for single-cell biology
2025-Aug-01, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00565-3
PMID:40750599
|
观点论文 | 提出将动力系统理论作为单细胞生物学的组织原则，为理解单细胞基因表达数据提供理论框架 | 首次将动力系统理论系统性地应用于单细胞生物学领域，为单细胞数据提供可解释、因果性和定量化的分析视角 | NA | 建立单细胞生物学领域的统一理论框架 | 单细胞基因表达数据 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学 | 动力系统理论 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial atlas of smoking-induced changes in human gingival tissues
2025-Aug-01, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-025-00385-5
PMID:40750693
|
研究论文 | 利用单细胞空间转录组技术构建吸烟引起的人类牙龈组织变化的空间图谱 | 首次在单细胞分辨率下揭示吸烟通过破坏上皮屏障完整性、改变成纤维细胞功能及调控内皮细胞-巨噬细胞相互作用加剧牙周炎的机制 | 样本量相对有限（12名个体），需要更大规模研究验证发现 | 探究吸烟导致牙周炎的具体分子机制 | 人类牙龈组织 | 空间转录组学 | 牙周炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 12名个体（包括牙周炎患者、吸烟相关牙周炎患者和健康对照） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD单细胞空间转录组 |
| 413 | 2025-10-06 |
Aberrant pace of cortical neuron development in brain organoids from patients with 22q11.2 deletion syndrome-associated schizophrenia
2025-Aug-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62187-x
PMID:40750773
|
研究论文 | 本研究通过22q11.2缺失综合征相关精神分裂症患者的脑类器官，揭示了皮质神经元发育异常的细胞类型特异性机制 | 首次在22q11.2DS患者来源的脑类器官中发现皮质神经元成熟延迟的细胞特异性发育异常，并揭示DGCR8单倍体不足通过调控成熟速度基因导致这一表型 | 研究基于体外脑类器官模型，可能无法完全模拟体内大脑发育的复杂性 | 探究22q11.2缺失如何改变早期人类大脑发育过程 | 22q11.2缺失综合征伴精神分裂症患者来源的脑皮质类器官 | 神经发育生物学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序, microRNA分析, 蛋白质相互作用网络分析, 钙成像 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据, microRNA表达数据, 蛋白质相互作用数据, 功能实验数据 | 22q11.2DS患者来源的脑类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 414 | 2025-10-06 |
The Key to Spinal Cord Recovery: Harnessing p21 Inhibition to Boost Neural Stem/Progenitor Cell Proliferation
2025-Aug-05, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c05512
PMID:40712080
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研究论文 | 本研究开发了一种基于阳离子脂质体的p21 siRNA递送系统，通过抑制p21表达增强脊髓损伤后内源性神经干/祖细胞的增殖能力 | 首次利用阳离子脂质体递送p21 siRNA来特异性增强脊髓损伤后神经干/祖细胞的增殖能力，并发现其通过调控细胞周期通路发挥作用 | 研究仅在T9脊髓损伤大鼠模型中进行验证，尚未在更大型动物或临床环境中测试 | 探索通过调控细胞周期来促进脊髓损伤后神经再生和功能恢复的新治疗策略 | 神经干/祖细胞和T9脊髓损伤大鼠模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序，RNA干扰，转录组分析 | NA | 基因表达数据，功能行为数据 | T9脊髓损伤大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 415 | 2025-10-06 |
Prg4+ fibroadipogenic progenitors in muscle are crucial for bone fracture repair
2025-Aug-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2417806122
PMID:40729389
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研究论文 | 本研究揭示了肌肉中Prg4+纤维脂肪生成祖细胞在骨折修复中的关键作用 | 首次发现Prg4+ FAPs能从肌肉迁移至骨折部位并分化为软骨细胞、成骨细胞和骨细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肌肉细胞在骨骨折修复中的具体作用机制 | 小鼠骨骼肌中的Prg4+纤维脂肪生成祖细胞 | 骨骼生物学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | 小鼠骨折模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2025-10-06 |
Single-Cell Multi-Omics Identifies Specialized Cytotoxic and Migratory CD8+ Effector T Cells in Acute Myocarditis
2025-Aug-05, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术识别了急性心肌炎中具有高细胞毒性和迁移潜能的CD57+CD8+效应T细胞亚群 | 首次在急性心肌炎中鉴定出具有特殊细胞毒性和迁移能力的CD57+CD8+效应T细胞亚群，并揭示了其上游IL-18信号通路 | 样本量相对有限（40例患者），且动物模型为小鼠模型，与人类疾病存在物种差异 | 探究急性心肌炎的免疫发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 急性心肌炎患者（40例，其中轻度24例，暴发性16例）和柯萨奇病毒B3诱导的暴发性心肌炎小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 飞行时间质谱流式细胞术, Olink蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 40例急性心肌炎患者（24例轻度，16例暴发性）和柯萨奇病毒B3诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 飞行时间质谱流式细胞术, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 417 | 2025-10-06 |
KAFSTExp: Kernel Adaptive Filtering with Nystrom Approximation for Predicting Spatial Gene Expression from Histology Image
2025-Aug-04, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3595101
PMID:40758493
|
研究论文 | 提出一种基于核自适应滤波和Nystrom近似的框架KAFSTExp，用于从组织学图像预测空间基因表达 | 首次将核自适应滤波与Nystrom近似结合用于空间转录组学预测，利用UNI病理基础模型编码图像特征，显著提升预测精度并降低计算成本 | 在有限的空间转录组数据集上验证，模型泛化能力仍需更多外部验证 | 开发从组织病理学图像预测空间基因表达的高效计算方法 | 空间转录组数据和对应的组织病理学图像 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学，核方法，Nystrom近似 | 核自适应滤波，核最小均方算法，UNI基础模型 | 图像，基因表达数据 | 多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 418 | 2025-10-06 |
Allele-specific expression analysis: pipelines, applications, challenges, and unmet needs
2025-Aug-03, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110890
PMID:40759060
|
综述 | 本文系统评估了26种等位基因特异性表达分析流程的现状、应用与挑战 | 首次对26种前沿等位基因特异性表达分析流程进行系统性分类评估，提出未来发展方向 | 现有分析流程缺乏端到端解决方案、多组学整合能力不足、单细胞测序技术支持有限 | 评估等位基因特异性表达分析流程的能力与应用前景 | 26种等位基因特异性表达分析流程 | 生物信息学 | NA | 等位基因特异性表达分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞测序,多组学整合 | NA | NA |
| 419 | 2025-10-06 |
Spatial mutual nearest neighbors for spatial transcriptomics data
2025-Aug-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf403
PMID:40713795
|
研究论文 | 提出了一种名为spatialMNN的新算法，用于整合多个空间转录组样本并识别空间域 | 将传统的互近邻算法扩展到空间转录组学领域，通过整合2D空间信息改进了批次校正方法 | NA | 开发能够整合空间信息的转录组数据批次校正和空间域识别算法 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | kNN, MNN, Louvain算法 | 空间转录组数据 | 包含31个10x Genomics Visium样本的大规模数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium平台 |
| 420 | 2025-10-06 |
Upregulation of YY1/EZH2 and MLH1 as Therapeutic Targets for Adult T-Cell Leukemia/Lymphoma
2025-Aug, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70095
PMID:40355804
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现YY1/EZH2表观遗传调控轴在成人T细胞白血病/淋巴瘤中的关键作用，并揭示MLH1作为潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平识别ATLL中YY1/EZH2表观遗传调控轴，并发现其通过调控MLH1影响疾病侵袭性 | ATLL的遗传背景多样性使得作用机制难以完全阐明，样本量有限 | 探索成人T细胞白血病/淋巴瘤的共同治疗靶点 | 成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)原代细胞和细胞系 | 单细胞测序分析 | 白血病/淋巴瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 计算机启动子分析, 慢病毒敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 原代ATLL细胞和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |