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当前共找到 544 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-06 |
Integrative multiomics analysis reveals the subtypes and key mechanisms of platinum resistance in gastric cancer: identification of KLF9 as a promising therapeutic target
2025-Aug-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06725-7
PMID:40775648
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示了胃癌铂类耐药亚型及关键机制，鉴定KLF9作为潜在治疗靶点 | 首次使用相似性网络融合算法结合多组学数据对胃癌铂类耐药进行分子分型，并在单细胞和空间转录组层面验证耐药基因空间分布 | 研究样本量有限，需要更大规模临床验证 | 阐明胃癌铂类耐药机制并寻找有效治疗靶点 | 胃腺癌患者及AGS胃癌细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 多组学分析，单细胞RNA测序，空间转录组学，机器学习 | 相似性网络融合算法，机器学习预测模型 | 基因表达数据，甲基化数据，体细胞突变数据，单细胞数据，空间转录组数据 | 胃腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 362 | 2025-10-06 |
IgG autoantibodies in bullous pemphigoid induce a pathogenic MyD88-dependent pro-inflammatory response in keratinocytes
2025-Aug-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62495-2
PMID:40769980
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研究论文 | 本研究揭示了天疱疮患者IgG自身抗体通过MyD88依赖性途径诱导角质形成细胞产生促炎症反应的新机制 | 首次系统阐明自身抗体直接作用于角质形成细胞并通过MyD88信号通路引发促炎症和蛋白水解反应的分子机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，需要进一步验证在人体内的实际病理作用 | 探究天疱疮中自身抗体对角质形成细胞的直接作用及其在疾病病理中的贡献 | 原代角质形成细胞、天疱疮患者皮肤样本、临床前小鼠模型 | 皮肤病学 | 天疱疮 | 多重免疫分析、RNA-seq、空间转录组学、单细胞RNA-seq | Krt14特异性Myd88敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 363 | 2025-10-06 |
Fibro-NPC: a pathogenic subtype identified at single-cell resolution with secreted SFRP4 as a biomarker in intervertebral disc degeneration
2025-Aug-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06798-4
PMID:40770348
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研究论文 | 通过单细胞测序鉴定椎间盘退变中的致病性纤维化髓核细胞亚型Fibro-NPC，并发现分泌蛋白SFRP4可作为诊断和治疗靶点 | 首次在单细胞水平识别出椎间盘退变中的致病性FibroPC亚型，并确定SFRP4作为关键致病蛋白和生物标志物 | 样本量较小（仅5个退变椎间盘），需要更大规模研究验证 | 探究椎间盘退变的分子机制并寻找诊断治疗靶点 | 退变椎间盘组织中的髓核细胞 | 单细胞生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序,质谱分析,机器学习 | CellChat算法,WGCNA,机器学习 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 5个退变椎间盘的髓核组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 364 | 2025-10-06 |
Mitochondrial subtypes in renal ischemia reperfusion injury guide delayed graft function and Long-Term graft prediction
2025-Aug-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14595-8
PMID:40770395
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研究论文 | 本研究通过分析线粒体相关基因识别了肾缺血再灌注损伤的两种亚型，并建立了延迟移植功能和长期移植存活的预测模型 | 首次基于线粒体相关基因对肾缺血再灌注损伤进行亚型分类，并开发了针对延迟移植功能和长期移植存活的预测模型 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 建立基于线粒体相关基因的肾移植术后并发症预测模型 | 肾移植患者的缺血再灌注损伤样本 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2025-10-06 |
Meta_B cells: a computationally identified candidate immunosuppressive driver of gastric cancer metastasis revealed by single-cell analysis and machine learning
2025-Aug-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03356-8
PMID:40770460
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研究论文 | 通过单细胞分析和机器学习识别出一种名为meta_B细胞的候选免疫抑制性B细胞亚群，该亚群与胃癌转移相关 | 计算识别出一种新的转移富集B细胞亚群meta_B细胞，并揭示其通过BTLA-TNFRSF14通路发挥免疫抑制作用的潜在机制 | 研究主要基于计算分析和公共数据库数据，需要实验验证meta_B细胞的功能机制 | 探索胃癌转移过程中肿瘤微环境的免疫细胞动态变化 | 胃癌患者的单细胞RNA-seq数据和TCGA-STAD队列的批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 机器学习 | hdWGCNA, LASSO-Cox回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库(GSE163558)和TCGA-STAD队列的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2025-10-06 |
Identification of cell-type-specific, transcriptionally active transposable elements using long-read RNA-sequencing data-based comprehensive annotation
2025-Aug-06, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00048-1
PMID:40770674
|
研究论文 | 利用长读长RNA测序数据构建转座元件衍生转录本的综合注释，并识别细胞类型特异性的活跃转座元件 | 首次基于大规模人类长读长RNA测序数据构建转录组水平的转座元件注释，相比现有注释工具具有更好的检测准确性 | 研究主要依赖公共数据集，可能受限于数据质量和覆盖度 | 开发转座元件衍生转录本的检测和注释方法，研究其在细胞类型特异性表达中的功能 | 人类21个器官和71种细胞系的长读长RNA测序数据，以及GTEx单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 长读长RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 2596个长读长RNA测序数据集，覆盖21个器官和71种细胞系 | NA | 长读长RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 367 | 2025-10-06 |
Thor: a platform for cell-level investigation of spatial transcriptomics and histology
2025-Aug-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62593-1
PMID:40764306
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研究论文 | 介绍Thor平台，用于空间转录组学和组织学图像的细胞水平综合分析 | 开发抗收缩马尔可夫扩散方法从spot水平数据推断单细胞空间转录组，整合基因表达和细胞形态分析 | NA | 开发集成空间转录组学和组织学图像分析的平台 | 心脏衰竭再生特征、乳腺癌标志物、小鼠嗅球精细分层、纤维化心脏组织 | 空间生物学 | 心脏病,乳腺癌 | 空间转录组学 | 抗收缩马尔可夫扩散方法 | 空间转录组数据,组织学图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | ISH, MERFISH, Xenium, Stereo-seq, Visium HD |
| 368 | 2025-10-06 |
Role of T cell exhaustion and tissue-resident memory T cells in the expression and prognosis of colorectal cancer
2025-Aug-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14409-x
PMID:40764738
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析结直肠癌患者T细胞亚型的动态变化及其预后价值 | 首次系统揭示衰竭T细胞和预衰竭组织驻留记忆T细胞在结直肠癌不同临床阶段的功能演变规律 | 样本量有限，需要更大规模队列验证 | 探究T细胞衰竭和组织驻留记忆T细胞在结直肠癌中的表达特征和预后意义 | 结直肠癌患者肿瘤微环境中的T细胞亚群 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞测序, 流式细胞术, 功能富集分析 | NA | 单细胞测序数据, 流式细胞数据, 临床预后数据 | 结直肠癌患者队列（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2025-10-06 |
Epithelial characteristics of ovarian clear cell carcinoma at single-cell resolution
2025-Aug-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08617-4
PMID:40764744
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示卵巢透明细胞癌上皮细胞特征及其调控机制 | 首次在单细胞分辨率下建立OCCC转录图谱，识别恶性上皮细胞亚群并发现173个候选因子 | 样本类型有限，仅包含正常卵巢、卵巢子宫内膜异位症和OCCC组织 | 探究卵巢透明细胞癌恶性上皮细胞的识别、起源和分子特征 | 正常卵巢、卵巢子宫内膜异位症、原发性和复发性卵巢透明细胞癌组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 370 | 2025-10-06 |
Adverse prognosis gene expression patterns in metastatic castration-resistant prostate cancer
2025-Aug, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70001
PMID:39985777
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研究论文 | 本研究通过分析1012个mCRPC组织样本，识别了与不良预后相关的基因表达通路 | 首次在大型mCRPC队列中系统分析预后基因表达通路，并揭示了AR信号丢失、高增殖和糖酵解表型作为独立不良预后因素 | 仅272名患者可获得生存数据，样本量相对有限 | 探索转移性去势抵抗性前列腺癌的预后基因表达模式 | 769名患者的1012个mCRPC组织样本 | 癌症基因组学 | 前列腺癌 | 基因集变异分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 1012个组织样本来自769名患者，其中272名有生存数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 371 | 2025-10-06 |
Temporal control of progenitor competence shapes maturation in GABAergic neuron development in mice
2025-Aug, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01999-y
PMID:40629142
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了小鼠GABA能神经元发育中前体细胞时间性调控对神经元成熟的机制 | 发现神经发生的时间进程特异性调控成熟能力而非分化能力，并鉴定NFIB转录因子及其靶基因构成的调控模块 | 研究仅限于小鼠胚胎模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究前体细胞能力如何影响GABA能神经元的成熟和分化 | 小鼠胚胎端脑GABA能投射神经元和中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学, 染色质可及性分析, 谱系追踪, 出生日期标记, 移植实验, 扰动测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 372 | 2025-10-06 |
A molecular cell atlas of mouse lemur, an emerging model primate
2025-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09113-9
PMID:40739356
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术构建了小鼠狐猴的转录组图谱Tabula Microcebus | 首次创建了小鼠狐猴的分子细胞图谱，定义了750多种分子细胞类型，并揭示了灵长类细胞和基因表达的进化特征 | 仅使用4个供体的样本，样本量相对有限 | 建立新兴灵长类模型生物的细胞和分子基础 | 小鼠狐猴（Microcebus） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类、整合和注释算法 | 单细胞转录组数据 | 4个供体的27个器官，共226,000个细胞 | NA | 液滴式单细胞RNA测序,平板式单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 373 | 2025-10-06 |
Mouse lemur cell atlas informs primate genes, physiology and disease
2025-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09114-8
PMID:40739355
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研究论文 | 利用小鼠狐猴单细胞图谱研究灵长类基因、生理和疾病特征 | 首次构建小鼠狐猴单细胞图谱，发现数千个新基因和数万个灵长类特异性剪接位点，建立反向遗传分析实验框架 | 作为新兴模式生物，小鼠狐猴的遗传学、细胞和分子生物学研究仍处于初步阶段 | 建立小鼠狐猴分子和遗传分析基础，确定未来研究的灵长类基因、异构体、生理和疾病优先方向 | 小鼠狐猴（Microcebus spp）27个器官的单细胞数据 | 单细胞基因组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 27个器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2025-10-06 |
Multi-omics profiling identifies TNFRSF18 as a novel marker of exhausted CD8⁺ T cells and reveals tumour-immune dynamics in colorectal cancer
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70425
PMID:40770837
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研究论文 | 通过多组学分析揭示结直肠癌中CD8⁺ T细胞耗竭动态及肿瘤免疫逃逸机制 | 首次发现TNFRSF18作为CD8⁺ T细胞耗竭的新标志物，并揭示核糖体干性在肿瘤免疫逃逸中的作用 | 样本量较小（仅6例患者），需要在更大队列中验证 | 探究结直肠癌中CD8⁺ T细胞耗竭的动态演变及其对临床预后的影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序,单细胞T细胞受体/B细胞受体测序,空间转录组学,免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,免疫组化数据 | 6例结直肠癌患者的20个组织样本（涵盖不同TNM分期） | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞VDJ测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 375 | 2025-10-06 |
CXCL16 Producing Tumor Clones Are Shaping Immunosuppressive Microenvironment in Squamous Cell Carcinoma via CXCR6 Regulatory T Cell
2025-Aug, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71060
PMID:40776410
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了皮肤鳞状细胞癌中产生CXCL16的肿瘤克隆通过CXCR6调节性T细胞塑造免疫抑制微环境的机制 | 首次发现SCC特异性COL6A1+/ITGA5+癌细胞产生CXCL16，并通过CXCL16/CXCR6轴招募Tregs形成免疫抑制微环境 | 样本量较小（仅10个肿瘤样本），需要更大规模研究验证发现 | 探究皮肤鳞状细胞癌肿瘤演化的详细机制和免疫微环境形成 | 皮肤基底细胞癌、原位鳞状细胞癌和侵袭性鳞状细胞癌的肿瘤样本 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体克隆分析, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 10个皮肤肿瘤样本（5个BCC, 3个SCCIS, 2个SCC），共117,663个细胞 | NanoString | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx DSP空间转录组分析平台 |
| 376 | 2025-10-06 |
CYBB as a potential therapeutic target through influencing ferroptosis and macrophage in ovarian cancer
2025-Aug-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02891-8
PMID:40782134
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和体外实验验证了CYBB基因在卵巢癌中通过调控铁死亡和巨噬细胞极化影响肿瘤进展的关键作用 | 首次揭示CYBB基因在卵巢癌中铁死亡与肿瘤相关巨噬细胞之间的调控关系，并证明其通过影响巨噬细胞极化参与肿瘤微环境调控 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索铁死亡与肿瘤相关巨噬细胞在卵巢癌进展中的相互作用机制，寻找潜在治疗靶点 | 卵巢癌相关基因、铁死亡相关基因、巨噬细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、体外细胞实验、共培养模型 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 4410个免疫相关卵巢基因和483个铁死亡相关基因 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 377 | 2025-10-06 |
Single cell approaches define the murine leptomeninges:cortical brain interface as a distinct cellular neighborhood comprised of neural and nonneural cell types
2025-Aug-08, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0046-25.2025
PMID:40780964
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了小鼠大脑皮层与软脑膜界面由神经和非神经细胞类型组成的独特细胞微环境 | 首次系统性地定义了大脑界面屏障的细胞组成，发现了转录特征独特的PDGFRα阳性软脑膜细胞、边界星形胶质细胞和组织驻留巨噬细胞三种主要细胞类型 | 研究仅限于成年小鼠皮层界面，发育过程中的动态变化和人类中的适用性尚未验证 | 阐明大脑表面与脑膜界面屏障的细胞组成和相互作用机制 | 成年小鼠大脑皮层与软脑膜界面细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学, 形态谱系追踪, 免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 378 | 2025-10-06 |
LSGI: interpretable spatial gradient analysis for spatial transcriptomics data
2025-Aug-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03716-1
PMID:40781324
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研究论文 | 提出用于空间转录组数据的可解释空间梯度分析计算框架LSGI | 开发了首个系统识别空间转录组梯度(STG)的计算框架，能够识别具有显著梯度模式的肿瘤通路 | NA | 分析空间转录组数据中的梯度模式，揭示肿瘤空间异质性 | 肿瘤空间转录组数据集 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | LSGI计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 379 | 2025-10-06 |
Combining single-cell and bulk RNA sequencing to identify CAF-related signature for prognostic prediction and treatment response in patients with melanoma
2025-Aug-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14979-w
PMID:40781483
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研究论文 | 本研究结合单细胞和bulk RNA测序数据，构建了黑色素瘤中癌症相关成纤维细胞(CAF)相关特征用于预后预测和治疗反应评估 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据构建CAF相关特征，能够预测黑色素瘤患者对化疗和免疫治疗的疗效 | 研究样本量有限，需要在更大规模队列中进一步验证 | 构建CAF相关特征用于黑色素瘤患者的预后预测和治疗反应评估 | 黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, LASSO回归, 免疫组化, 免疫荧光, qPCR | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | TCGA数据集和GSE65904验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2025-10-06 |
Targeting immune microenvironment in cervical cancer: current research and advances
2025-Aug-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06896-3
PMID:40781691
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综述 | 本文全面探讨宫颈癌免疫微环境的组成特征、研究进展及免疫治疗策略 | 整合高分辨率空间图谱和单细胞测序技术揭示肿瘤免疫微环境异质性，系统评估不同疾病阶段和治疗方法的差异 | NA | 通过靶向肿瘤免疫微环境改善宫颈癌患者治疗效果 | 宫颈癌肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 空间图谱技术, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |