单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 541 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-06 |
Distinct molecular patterns in R6/2 HD mouse brain: Insights from spatiotemporal transcriptomics
2025-Aug-06, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.05.014
PMID:40482637
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了亨廷顿病R6/2小鼠大脑中区域特异性、时间依赖性和细胞类型特异性的分子调控通路 | 首次将10x Genomics Visium空间转录组学与匹配的单核RNA测序整合应用于亨廷顿病小鼠模型，揭示了时空动态的基因表达变化和细胞特异性调控通路 | 研究仅限于R6/2小鼠模型，结果可能不完全适用于人类亨廷顿病；样本时间点有限，可能遗漏某些关键发育阶段的动态变化 | 探索亨廷顿病发病机制中的分子调控网络和时空动态变化 | R6/2亨廷顿病小鼠模型的大脑组织（出生后第0天、4周和12周） | 空间转录组学 | 亨廷顿病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | R6/2小鼠大脑在三个时间点（P0、4周、12周）的分析 | 10x Genomics | 空间转录组学，单核RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台整合单核RNA测序 |
| 342 | 2025-10-06 |
Identification and characterization of early human photoreceptor states and cell-state-specific retinoblastoma-related features
2025-Aug-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.101918
PMID:40767624
|
研究论文 | 通过全长单细胞RNA测序识别人类光感受器发育状态及视网膜母细胞瘤相关特征 | 首次使用全长scRNA-seq解析光感受器发育轨迹，发现早期视锥前体细胞特异性表达特征与视网膜母细胞瘤发生相关 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步功能验证 | 解析人类视锥和视杆细胞发育差异及其与视网膜母细胞瘤发生的关系 | 人类光感受器细胞（视锥和视杆细胞） | 单细胞基因组学 | 视网膜母细胞瘤 | 全长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | 全长单细胞RNA测序 |
| 343 | 2025-10-06 |
WGCNA and single-cell analysis reveal ferroptosis-related gene signatures for hepatocellular carcinoma prognosis and therapy
2025-Aug-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03335-z
PMID:40767898
|
研究论文 | 通过WGCNA和单细胞分析揭示铁死亡相关基因在肝细胞癌预后和治疗中的表达特征 | 首次结合WGCNA和单细胞RNA测序技术系统分析铁死亡相关基因在肝细胞癌中的表达异质性及其临床意义 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 研究铁死亡相关基因在肝细胞癌中的表达特征及其与临床预后的关系 | 肝细胞癌患者基因表达数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | WGCNA, 单细胞RNA测序, 生存分析, 功能富集分析 | 基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 344 | 2025-10-06 |
Aging affects reprogramming of pulmonary capillary endothelial cells after lung injury in male mice
2025-Aug-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62431-4
PMID:40769983
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学比较年轻与老年雄性小鼠肺损伤后的肺毛细血管内皮细胞转录组变化 | 首次利用纵向单细胞RNA测序和空间转录组学揭示衰老对肺毛细血管内皮细胞在肺损伤后重编程过程的影响 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未涉及雌性个体；样本量相对有限 | 探究衰老如何影响肺损伤后组织再生过程及纤维化疾病发展机制 | 年轻与老年雄性小鼠的肺组织及特发性肺纤维化患者样本 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年雄性小鼠在三个时间点的肺组织样本及患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 345 | 2025-10-06 |
The role of cellular heterogeneity in thyroid cancer: a multi-modal analysis approach with Mendelian randomization
2025-Aug-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03348-8
PMID:40770155
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序方法，探讨炎症蛋白基因与甲状腺癌风险的因果关系，并表征肿瘤微环境中的细胞异质性 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序的多模态分析方法，系统研究甲状腺癌中炎症蛋白基因的因果作用和细胞异质性 | 未明确说明样本量大小，研究结果需要在更大规模的研究中进一步验证 | 研究炎症蛋白基因与甲状腺癌风险的因果关系，并表征甲状腺癌微环境中的细胞组成和分化轨迹 | 甲状腺癌样本和与炎症蛋白表达相关的遗传变异 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序 | 多种MR方法（MR Egger、加权中位数、逆方差加权等） | 遗传变异数据，单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 346 | 2025-10-06 |
SGLT2 inhibitors and cardiac fibrosis: A comprehensive review
2025-Aug-05, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2025.103149
PMID:40769233
|
综述 | 本文全面综述了SGLT2抑制剂在心脏纤维化中的作用机制和临床证据 | 系统整合了SGLT2抑制剂在糖尿病和非糖尿病背景下抗心脏纤维化的多效性作用机制 | 主要心血管结局试验中缺乏纤维化特异性终点，且缺乏人体组织学验证 | 探讨SGLT2抑制剂作为心脏纤维化调节剂在不同心血管疾病状态中的作用 | 心脏纤维化病理过程及相关心血管疾病 | NA | 心血管疾病 | 心脏磁共振、血清胶原生物标志物检测、空间转录组学、高分辨率成像 | NA | 实验数据、临床数据、影像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 347 | 2025-10-06 |
The spatial landscape of glial pathology and T cell response in Parkinson's disease substantia nigra
2025-Aug-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62478-3
PMID:40759663
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组技术揭示了帕金森病黑质区T细胞和胶质细胞的病理空间景观 | 首次在帕金森病脑组织中发现CD8+T细胞克隆扩增及其与CD44+星形胶质细胞的空间相关性 | 研究基于死后脑组织样本，无法观察疾病动态过程 | 探究帕金森病中适应性免疫反应在脑内的特征和机制 | 帕金森病患者死后黑质脑组织 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 帕金森病患者死后脑组织样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, T细胞受体测序 | NA | NA |
| 348 | 2025-10-06 |
OmniCellAgent: Towards AI Co-Scientists for Scientific Discovery in Precision Medicine
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.31.667797
PMID:40766492
|
研究论文 | 开发了一个名为OmniCellAgent的智能AI代理，用于促进精准医学领域的自主科学发现 | 首个专门设计的代理AI模型，能够系统整合大规模单细胞RNA测序数据、组学数据分析工具、累积的生物医学知识和文献检索 | NA | 促进精准医学领域的自主科学发现，帮助非计算专家用户进行单细胞RNA测序数据驱动的生物医学研究 | 患者及家属、临床医生和湿实验室研究人员等非计算专家用户 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型, AI代理 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 349 | 2025-10-06 |
Elucidating prognostic significance of purine metabolism in colorectal cancer through integrating data from transcriptomic, immunohistochemical, and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Aug, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70010
PMID:40017120
|
研究论文 | 通过整合转录组、免疫组化和单细胞RNA测序数据阐明嘌呤代谢在结直肠癌中的预后意义 | 首次通过免疫组化验证嘌呤代谢作为结直肠癌预后标志物，并整合多种技术方法进行综合分析 | 嘌呤代谢反应具有可逆性，可能影响结果的稳定性 | 评估嘌呤代谢在结直肠癌中的临床相关性 | 结直肠癌患者组织样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组分析,免疫组化,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,单细胞测序数据 | 结直肠癌患者亚群（包括TP53野生型、TP53突变型和微卫星稳定型） | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 350 | 2025-10-06 |
Human CD4+ T cells regulate peripheral immune responses in rheumatoid arthritis via insulin-like growth factor-like family member 2
2025-Aug, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adr3838
PMID:40749037
|
研究论文 | 本研究揭示了人类CD4+ T细胞通过IGFL2调节类风湿关节炎外周免疫反应的机制 | 首次发现灵长类特有的炎症因子IGFL2在人类T外周辅助细胞中的特异性表达及其在RA发病机制中的调节作用 | 研究主要关注类风湿关节炎，结果在其他自身免疫疾病中的普适性需要进一步验证 | 阐明人类CD4+ T细胞在自身免疫疾病中的免疫调节机制 | 类风湿关节炎患者的CD4+ T细胞和单核细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据 | 血清阳性类风湿关节炎患者的滑膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 351 | 2025-10-06 |
Unravelling Osteoporosis: Key Genes and Potential Therapies
2025-Aug, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70759
PMID:40764749
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析鉴定骨质疏松症的关键基因及潜在治疗靶点 | 首次通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和免疫浸润分析系统鉴定FMO4、PSMA4和VEGFA作为骨质疏松症的关键基因，并发现60种潜在治疗化合物 | 基于欧洲人群的GWAS数据可能限制结果在其他人群的普适性，机制验证需要进一步实验研究 | 识别骨质疏松症的致病基因和开发新型治疗策略 | 骨质疏松症相关基因和信号通路 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | GWAS, 孟德尔随机化, scRNA-seq, 转录组分析, 免疫浸润分析, 基因集富集分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | FinnGen联盟GWAS数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-06 |
Integrating Single-Cell Transcriptomics and Machine Learning to Define an ac4C Gene Signature in Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.70140
PMID:40767620
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和机器学习方法，定义了肺腺癌中的ac4C基因特征 | 首次将单细胞转录组学与多种机器学习算法结合，开发了ac4C相关基因特征模型用于肺腺癌预后预测 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证 | 探索ac4C修饰在肺腺癌中的作用并开发预后预测模型 | 肺腺癌患者和相关的转录组数据 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | 多种机器学习算法 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列的公共数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 353 | 2025-10-06 |
S100A8/A9 Promotes Fibrosis in Iatrogenic Laryngotracheal Stenosis
2025-Aug-08, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.70008
PMID:40776636
|
研究论文 | 本研究探讨了S100A8/A9在医源性喉气管狭窄纤维化过程中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现S100A8/A9在iLTS中表达升高，并在小鼠模型中证实其促进纤维化的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明S100A8/A9在医源性喉气管狭窄发病机制中的作用 | 人类iLTS标本和iLTS诱导的小鼠模型 | 单细胞生物学 | 喉气管狭窄 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，基因表达分析 | NA | 基因表达数据，组织图像数据 | 人类iLTS标本和对照气管组织，iLTS诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 354 | 2025-10-06 |
Targeting SPATS2 in lung adenocarcinoma: implications for prognosis and immune-based therapy
2025-Aug-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03179-7
PMID:40779087
|
研究论文 | 本研究探讨SPATS2在肺腺癌中的表达模式及其与预后和免疫治疗的关系 | 首次系统评估SPATS2在肺腺癌中的多功能作用，包括其与基因组变异、免疫浸润和线粒体功能的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于体外细胞模型，需要更多体内实验验证 | 阐明SPATS2在肺腺癌发生发展中的作用机制及其临床意义 | 肺腺癌患者组织样本和A549细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, siRNA干扰, 线粒体功能检测 | 生物信息学分析模型, 细胞模型 | 转录组数据, 基因组数据, 单细胞测序数据, 实验数据 | 来自TCGA、GTEx、GEO和TISCH数据库的多组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 355 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals the therapeutic effect of nitazoxanide in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Aug-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03372-8
PMID:40779144
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了硝唑尼特在头颈部鳞状细胞癌中的治疗作用机制 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学相结合研究硝唑尼特在HNSCC中的作用，并发现其通过调控NKX2-3、PINK1、BIRC5和CDKN2A基因影响自噬过程 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内实验和临床数据支持 | 探索硝唑尼特在头颈部鳞状细胞癌中的治疗潜力及其作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC) | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,差异表达分析,功能富集分析,风险预后模型,WGCNA,突变分析,L1000FWD分析 | 风险预后模型,列线图模型 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 356 | 2025-10-06 |
Endothelial-like cancer-associated fibroblasts facilitate pancreatic cancer metastasis via vasculogenic mimicry and paracrine signalling
2025-Aug-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333638
PMID:40122596
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种新型内皮样癌症相关成纤维细胞亚型，并揭示其通过血管生成拟态和旁分泌信号促进胰腺癌转移的机制 | 首次发现FAPα+CD144+内皮样CAFs亚型，阐明其通过CD144-β-catenin-STAT3信号轴发挥双重促癌作用，并开发了靶向该亚型的siRNA递送纳米系统 | NA | 鉴定胰腺导管腺癌中具有血管生成拟态功能的新型促癌CAF亚型及其作用机制 | 胰腺导管腺癌患者样本、细胞系、类器官、原位肿瘤模型和KPC转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化,细胞因子阵列,RNA测序,IP质谱,ChIP,荧光素酶分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,多重免疫组化图像,分子生物学实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals the sphingolipid metabolism pathway plays an important role in leaf senescence in tobacco
2025-Aug-06, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-025-07051-2
PMID:40764913
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了烟草叶片衰老过程中鞘脂代谢通路的重要作用 | 首次在衰老烟草叶片中构建单细胞转录组图谱，发现鞘脂代谢通路基因在衰老过程中显著上调 | 研究仅基于转录组数据，需要进一步实验验证SPT等基因在叶片衰老中的具体调控机制 | 阐明烟草叶片衰老过程的分子机制 | 烟草叶片组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,100个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 358 | 2025-10-06 |
β-Sitosterol improves murine ulcerative colitis by inhibiting the expression of ribosomal proteins and the attempted polarization of type 1 macrophages
2025-Aug-05, International journal of colorectal disease
IF:2.5Q1
DOI:10.1007/s00384-025-04974-y
PMID:40762728
|
研究论文 | 本研究证实β-谷甾醇通过抑制核糖体信号通路关键基因表达和MΦ1巨噬细胞极化，改善小鼠溃疡性结肠炎症状 | 首次揭示β-谷甾醇通过调控核糖体蛋白表达抑制MΦ1巨噬细胞极化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体验证 | 探究β-谷甾醇对溃疡性结肠炎的治疗作用及分子机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型和RAW264.7巨噬细胞系 | 单细胞生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, KEGG分析, 流式细胞术, ELISA, Western blotting, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞因子数据 | 溃疡性结肠炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 359 | 2025-10-06 |
Clock pathway inhibitor overcomes tumor immune-exclusion via regulation of fibrocyte differentiation
2025-Aug-05, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01066-6
PMID:40764393
|
研究论文 | 本研究通过时钟通路抑制剂调控纤维细胞分化，克服肿瘤免疫排斥并增强免疫检查点抑制剂疗效 | 首次发现时钟通路调控纤维细胞向αSMA癌症相关成纤维细胞分化，并证明时钟抑制剂可将免疫排斥型肿瘤转化为免疫活跃型肿瘤 | 研究主要基于肺腺癌模型，在其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 探索克服肿瘤免疫排斥的新策略，提高免疫检查点抑制剂治疗效果 | 肺腺癌组织、肿瘤微环境中的纤维细胞和癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 360 | 2025-10-06 |
RNA m6A Methylation Regulates CDH6 to Promote Epithelial-to-Mesenchymal Transition in Cholangiocytes of Biliary Atresia
2025-Aug-05, Journal of pediatric surgery
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.jpedsurg.2025.162492
PMID:40774478
|
研究论文 | 本研究探讨了m6A甲基化通过调控CDH6表达促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的机制 | 首次揭示METTL3介导的m6A低甲基化通过YTHDF2稳定CDH6转录本促进胆管细胞EMT的新机制 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探索m6A修饰在胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化中的作用机制 | 胆道闭锁患者的胆管细胞 | 单细胞测序分析 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序, RNA测序, RNA免疫沉淀, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据, 图像数据 | 公开单细胞数据集HRA003163及体外培养的胆管细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |