单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 539 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
301 2025-10-06
Cross-Analysis of Single-Cell Transcriptomic Datasets Reveals Conserved Neurogenic Gene Signatures and New Insights Into Neural Stem Cell Aging
2025-Aug, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 通过跨分析单细胞转录组数据集揭示神经干细胞保守的神经源性基因特征及其在衰老过程中的变化 识别了神经干细胞中保守的基因表达谱,提出了新的标记物作为标准化参考,并利用伪时间推断分析揭示神经干细胞的时间动态 依赖公开可用的单细胞RNA测序数据集,可能存在数据质量和注释不一致的问题 解决神经干细胞分子分类和功能研究中的挑战,优化其分类框架 海马体成人神经干细胞 单细胞转录组学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 伪时间推断分析 单细胞转录组数据 多个公开单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
302 2025-10-06
Identification and Construction of a R-loop Mediated Diagnostic Model and Associated Immune Microenvironment of COPD through Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 通过机器学习和单细胞转录组学构建R-loop介导的COPD诊断模型并分析其免疫微环境特征 首次系统研究R-loop调节因子在COPD中的作用,利用12种机器学习算法识别关键R-loop调节因子,建立基于14个R-loop调节因子的风险评分模型并发现两种不同COPD亚型 研究样本量未明确说明,部分发现仅在动物模型中验证 探索R-loop调节因子在慢性阻塞性肺疾病(COPD)发病机制中的作用并构建诊断模型 COPD患者肺组织、小鼠肺组织 机器学习, 单细胞转录组学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, RT-PCR 机器学习算法(12种算法150种组合) 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
303 2025-10-06
PD-L1 Promotes Immunological Tolerance and Enhances Visual Protection of hESC-RPE Grafts in Retinal Degeneration
2025-Aug, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究探讨PD-L1过表达在改善人胚胎干细胞来源视网膜色素上皮细胞移植治疗年龄相关性黄斑变性中的免疫保护作用 提出无需删除MHC基因仅通过PD-L1过表达即可增强hESC-RPE移植物存活和视觉保护的新策略 研究主要聚焦于PD-L1的免疫调节作用,未全面评估其他免疫检查点的潜在影响 探索PD-L1过表达对hESC-RPE移植免疫耐受和视觉功能保护的作用机制 人胚胎干细胞来源视网膜色素上皮细胞和视网膜退行性病变模型 细胞治疗 年龄相关性黄斑变性 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
304 2025-10-06
Exploration of heterogeneity and recurrence signatures in hepatocellular carcinoma
2025-Aug, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过整合分析肝细胞癌的单细胞RNA测序数据,揭示了复发肿瘤的异质性特征并构建了复发预后模型 首次系统揭示肝细胞癌复发过程中的细胞异质性变化,识别MIF-(CD74+CXCR4)信号通路的关键作用,并开发了基于机器学习的新型复发风险评分模型 研究样本量有限,需要更大规模队列验证模型的普适性 探索肝细胞癌复发异质性特征并开发预后预测模型 肝细胞癌患者样本和小鼠移植模型 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 机器学习, RT-qPCR, 免疫组化 机器学习模型 基因表达数据, 单细胞数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq NA NA
305 2025-10-06
Time, the final frontier
2025-Aug, Molecular oncology IF:5.0Q1
评论 本文主张将时间动态维度整合到癌症研究中,强调从传统终点实验向数据驱动的连续方法转变 提出将时间动态分析作为癌症研究的新前沿,强调开发活体成像技术、时间组学方法和计算工具来探索肿瘤演化过程 NA 推动癌症研究从静态分析向动态时间维度整合的范式转变 肿瘤生态系统及其时间演化过程 数字病理学 癌症 活体成像技术、时间组学方法、计算分析 NA 时间序列数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
306 2025-10-06
Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area specification
2025-Aug, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过空间转录组技术揭示人类胎儿大脑皮层分层和区域特化的分子机制 首次结合MERFISH技术和深度学习核分割,在空间单细胞分辨率下系统绘制人类胎儿皮层发育图谱,发现皮层区域特化的两种不同模式 研究仅聚焦胎儿发育阶段,未涵盖出生后皮层发育过程 解析人类大脑皮层分层和区域特化的空间分子机制 人类胎儿大脑皮层组织 空间转录组学 NA MERFISH, 单核RNA测序, 深度学习核分割 深度学习 空间转录组数据, 图像数据 超过1800万个单细胞,涵盖7个发育时间点和8个皮层区域 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH)
307 2025-10-06
Taurine from tumour niche drives glycolysis to promote leukaemogenesis
2025-Aug, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术发现肿瘤微环境中的牛磺酸通过驱动糖酵解促进白血病发生 首次系统描绘白血病进展过程中基质信号的动态变化,鉴定牛磺酸-TAUT轴作为侵袭性髓系白血病的关键依赖性通路 研究主要聚焦于髓系白血病,对其他类型白血病的适用性需进一步验证 探索肿瘤微环境对白血病干细胞的支持机制 白血病干细胞、骨髓基质细胞、小鼠模型和患者来源的急性髓系白血病细胞 单细胞生物学 白血病 单细胞RNA测序、CRISPR筛选、多组学分析 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、基因表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
308 2025-10-06
Exploiting the endothelial-immune axis to improve radiotherapy efficacy
2025-Aug-01, The British journal of radiology
综述 探讨放射治疗中内皮细胞与免疫系统的相互作用机制及其对治疗效果的影响 提出通过靶向内皮-免疫轴来增强放射治疗疗效的新策略 NA 改善放射治疗的疗效并减少副作用 血管内皮细胞与免疫细胞在放射治疗中的相互作用 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
309 2025-10-06
ChemPerturb-seq screen identifies a small molecule cocktail enhancing human beta cell survival after subcutaneous transplantation
2025-Aug-07, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 开发了化学扰动测序技术,通过单细胞RNA测序筛选出能增强人β细胞皮下移植后存活的小分子组合 将化学筛选与单细胞RNA测序相结合,创建ChemPerturb-seq平台,实现系统性分析小分子处理后人β细胞的分子变化 发现的小分子组合仅对雌性小鼠有效,对雄性小鼠无效 筛选能增强人β细胞移植后存活和功能的小分子组合 人β细胞和原代胰岛 单细胞组学 糖尿病 单细胞RNA测序 人工智能 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
310 2025-10-06
Impact of Curcumin on the IL-17A-Mediated p53-Fibrinolytic System: Mouse Proteomics and Integrated Human Fibrosis scRNAseq Insights
2025-Aug, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究探讨姜黄素通过调节IL-17A介导的p53-纤溶系统对急性肺损伤向特发性肺纤维化发展的影响机制 首次整合小鼠蛋白质组学与人类肺纤维化单细胞RNA测序数据,揭示IL-17A在p53-纤溶系统中的新作用及姜黄素的调节机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证相对有限 阐明IL-17A在急性肺损伤向肺纤维化进展中的作用机制及姜黄素的治疗潜力 C57BL/6小鼠和人类IPF肺组织标本 生物信息学 肺纤维化 蛋白质组学,单细胞RNA测序,分子对接 Schroedinger分子对接模型 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 20例IPF患者和10例对照肺组织标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
311 2025-10-06
Multiple Machine Learning Identifies Key Gene PHLDA1 Suppressing NAFLD Progression
2025-Aug, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过多种机器学习方法鉴定出PHLDA1基因在抑制非酒精性脂肪肝疾病进展中的关键作用 首次通过整合多种机器学习策略和单细胞RNA测序数据,系统鉴定PHLDA1作为NAFLD的新型生物标志物,并验证其在细胞和小鼠模型中的功能 研究主要基于公共数据库数据,临床样本验证有限,机制研究仍需深入 识别非酒精性脂肪肝疾病的新型生物标志物和治疗靶点 非酒精性脂肪肝疾病相关基因表达数据、细胞模型和小鼠模型 机器学习 非酒精性脂肪肝疾病 差异表达分析,WGCNA,机器学习,ROC分析,单细胞RNA测序,基因集富集分析 多种机器学习策略 基因表达数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 三个NAFLD数据集中的23个重叠差异表达基因 NA 单细胞RNA测序 NA NA
312 2025-10-06
Comprehensive Analysis of Sialylation-Related Gene Profiles and Their Impact on the Immune Microenvironment in Periodontitis
2025-Aug, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 通过综合分析唾液酸化相关基因谱及其对牙周炎免疫微环境的影响 首次系统鉴定牙周炎中唾液酸化相关核心基因并构建诊断模型,结合单细胞测序揭示唾液酸化对单核细胞发育和细胞通讯的影响 研究基于公共数据集,需要实验验证;样本量有限 识别与牙周炎相关的唾液酸化相关基因并探索其对牙周免疫微环境的影响 牙周炎患者 生物信息学 牙周炎 单细胞测序,差异表达分析,机器学习,加权基因共表达网络分析,伪时间序列分析,细胞通讯分析 机器学习诊断模型 基因表达数据,单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
313 2025-10-06
Single-Cell RNA-seq Reveals Increased and Activated Post-Capillary Venule Endothelial Cells in Erythrodermic Psoriasis
2025-Aug, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了红皮病型银屑病中毛细血管后微静脉内皮细胞显著增加和激活的现象 首次在单细胞水平发现红皮病型银屑病中毛细血管后微静脉内皮细胞的异常增加和激活状态 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 探究红皮病型银屑病中血管内皮细胞的病理变化 人类和小鼠的红皮病型银屑病皮肤组织样本 单细胞组学 银屑病 单细胞RNA测序,免疫荧光,流式细胞术 轨迹分析 单细胞转录组数据,图像数据,流式数据 人类患者活检样本和小鼠模型样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
314 2025-10-06
A Functional Variant rs2122031 in ATG7 Is Associated with the Risk of Radiation Pneumonitis
2025-Aug, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究探讨了自噬相关基因ATG7的功能性变异rs2122031与放射性肺炎风险的关联 首次发现ATG7基因的功能性变异与放射性肺炎风险相关,并通过多组学方法验证了其分子机制 样本量相对有限(301例患者),仅分析了5个自噬相关基因的13个SNP 研究自噬相关基因遗传变异与放射性肺炎风险的关联 接受放疗的301例患者、成纤维细胞和条件性基因敲除小鼠 医学遗传学 放射性肺炎 MassArray基因分型、Sanger测序、qRT-PCR、免疫组化、单细胞RNA测序 Cox风险比例模型 基因型数据、临床影像数据、基因表达数据 301例患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
315 2025-10-06
Multi-omics insights of immune cells in the risk and prognosis of idiopathic membranous nephropathy
2025-Aug-10, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过多组学数据分析揭示了CD39调节性T细胞在特发性膜性肾病风险与预后中的关键作用 首次通过孟德尔随机化分析确定CD39 Tregs与IMN的因果关系,并构建了107个复合机器学习模型识别MN 研究样本量有限,需要更大规模验证 探究免疫细胞在特发性膜性肾病风险与预后中的作用机制 731种免疫细胞表型与特发性膜性肾病患者 生物信息学 肾脏疾病 多组学分析, 孟德尔随机化, 多重免疫荧光染色, 单细胞转录组分析, 流式细胞术 机器学习模型 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
316 2025-10-06
Mitochondrial metabolic reprogramming in colorectal cancer: mechanisms of resistance and future clinical interventions
2025-Aug-09, Cell death discovery IF:6.1Q1
综述 探讨结直肠癌中线粒体代谢重编程在治疗抵抗中的作用机制及潜在临床干预策略 系统阐述线粒体代谢重编程作为结直肠癌治疗抵抗的核心适应机制,并评估空间转录组学等新技术在个性化治疗中的转化价值 NA 分析线粒体代谢重编程导致结直肠癌治疗抵抗的机制并探索临床干预方向 结直肠癌细胞及其线粒体代谢机制 NA 结直肠癌 空间转录组学, 蛋白质组学, 患者来源类器官 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
317 2025-10-06
CAR-engineered cytolytic Tregs reverse pulmonary fibrosis and remodel the fibrotic niche with limited CRS
2025-Aug-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究开发了靶向FAP1的CAR工程化细胞毒性调节T细胞,用于治疗特发性肺纤维化 结合CAR-T细胞的靶向杀伤优势和Treg细胞的免疫抑制功能,首次开发CAR-cTregs治疗肺纤维化 研究基于博来霉素诱导的肺纤维化模型,尚未在人体临床试验中验证 开发治疗特发性肺纤维化的新型细胞免疫疗法 FAP1+肺泡成纤维细胞和CAR工程化细胞毒性调节T细胞 细胞免疫治疗 特发性肺纤维化 单细胞转录组测序,CAR-T细胞工程 NA 基因表达数据,病理学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
318 2025-10-06
Regulation of cortical neurogenesis by MED13L via transcriptional priming and its implications for MED13L syndrome
2025-Aug-08, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过基因敲除小鼠模型揭示了MED13L通过转录启动调控大脑皮层神经发生的分子机制 首次发现MED13L通过结合中介体复合物启动关键发育基因的转录激活,阐明了MED13L综合征的发育机制 研究基于小鼠模型,在人类中的直接适用性需要进一步验证 探究MED13L综合征的发育和分子机制 MED13L基因敲除小鼠模型 神经发育生物学 神经发育障碍 单细胞转录组学,免疫荧光,多组学分析 基因敲除动物模型 基因表达数据,蛋白质定位数据 MED13L敲除胚胎和成年小鼠 NA 单细胞RNA-seq,多组学分析 NA NA
319 2025-10-06
A human NK cell progenitor that originates in the thymus and generates KIR+NKG2A- NK cells
2025-Aug-08, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究发现了人类胸腺来源的NK细胞前体细胞,能够生成KIR+NKG2A- NK细胞 首次鉴定出胸腺来源的cILC1前体细胞(thyILC1),揭示了胸腺依赖性NK细胞分化途径 NA 探索KIR+NKG2A- NK细胞的发育起源和分化途径 人类天然杀伤细胞(NK细胞)和先天淋巴样细胞(ILC) 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 包括健康供体和22q11.2缺失综合征患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
320 2025-10-06
Mendelian randomization analysis of inflammatory biomarkers and hepatocellular carcinoma risk: genetic causality and single-cell transcriptomics
2025-Aug-07, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过孟德尔随机化分析和单细胞转录组学验证炎症生物标志物与肝细胞癌风险的因果关系 首次结合孟德尔随机化分析和单细胞转录组学方法系统评估炎症生物标志物与肝细胞癌的因果关系 样本量有限(仅4个HCC样本),需要更大规模研究验证 探究炎症生物标志物与肝细胞癌风险的因果关系 肝细胞癌患者和炎症生物标志物 生物信息学 肝细胞癌 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 MR Egger,加权中位数,逆方差加权,加权模式,简单模式 遗传数据,单细胞转录组数据 4个肝细胞癌样本(BT1306,BT1307,scrSOL004,scrSOL006) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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