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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-06 |
Immune signaling mediates stromal changes to support epithelial reprogramming in celiac duodenum
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116039
PMID:40694474
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了乳糜泻十二指肠中免疫信号介导的基质变化如何支持上皮重编程 | 构建了迄今为止最全面的乳糜泻单细胞RNA测序数据集,揭示了T细胞-髓系细胞-基质细胞-上皮细胞通讯网络在疾病中的作用机制 | 样本量相对有限(21例活动性乳糜泻和11例对照),且为观察性研究 | 探究乳糜泻发病机制中细胞间通讯和上皮重编程的分子基础 | 乳糜泻患者和健康对照的十二指肠组织样本 | 单细胞转录组学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 203,555个细胞,来自21例活动性乳糜泻和11例对照十二指肠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 262 | 2025-10-06 |
Gut commensal microbiota drive tailored macrophage responses
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116157
PMID:40828655
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类巨噬细胞对不同肠道共生菌的响应模式 | 首次在单细胞水平系统评估人类巨噬细胞对15种主要共生菌的异质性响应,发现特定菌种驱动不同免疫反应 | 研究基于体外单核细胞来源的巨噬细胞模型,可能与体内组织驻留巨噬细胞存在差异 | 探究肠道共生菌如何调控巨噬细胞的免疫反应特性 | 人类单核细胞来源的巨噬细胞和15种主要肠道共生菌 | 免疫学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 74,476个巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多重单细胞RNA测序 |
| 263 | 2025-10-06 |
Improving reproducibility of differentially expressed genes in single-cell transcriptomic studies of neurodegenerative diseases through meta-analysis
2025-Aug-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62579-z
PMID:40796563
|
研究论文 | 开发了一种基于相对差异表达排序可重复性的非参数元分析方法,用于提高单细胞转录组研究中差异表达基因的可重复性 | 提出了SumRank元分析方法,基于跨数据集相对差异表达排序的可重复性来识别差异表达基因,相比传统方法具有更好的预测能力 | 未明确说明样本量限制,且方法在不同疾病类型中的效果存在差异 | 提高单细胞转录组研究中差异表达基因的可重复性 | 帕金森病、亨廷顿病、阿尔茨海默病、精神分裂症和COVID-19的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 非参数元分析方法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 264 | 2025-10-06 |
Impact of intercellular adhesion molecule 1-positive dental pulp stem cells in deep caries progression
2025-08, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14248
PMID:40343788
|
研究论文 | 本研究探讨了ICAM1阳性牙髓干细胞在深龋进展中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示了深龋组织中ICAM1+ DPSCs的增多及其与单核巨噬细胞的相互作用 | 研究主要基于体外实验,需要进一步在体验证 | 研究ICAM1+ DPSCs在深龋免疫微环境中的作用以开发治疗策略 | 人源和小鼠模型的牙髓组织及THP-1细胞系 | 单细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞测序, 免疫荧光, 流式细胞术, RT-qPCR, Western Blot, ELISA, SCENIC, RNA-seq | NA | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人源和小鼠深龋及健康牙髓组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2025-10-06 |
Astrocytic AEG-1 drives neuroinflammation and enhances seizure susceptibility
2025-08, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106957
PMID:40383165
|
研究论文 | 本研究探讨星形胶质细胞中AEG-1基因在神经炎症和癫痫易感性中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示AEG-1表达星形胶质细胞亚群与炎症反应的关联,并证实AEG-1通过NF-κB信号通路介导神经炎症和癫痫易感性 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠模型和体外培养模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究星形胶质细胞AEG-1在神经炎症和癫痫易感性中的分子机制 | 小鼠模型和体外星形胶质细胞培养模型 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 266 | 2025-10-06 |
Multi-omics characterization of oncosis in spinal cord injury
2025-08, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106982
PMID:40467009
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法首次系统描绘了脊髓损伤后oncosis相关基因的时空表达图谱 | 首次在脊髓损伤中系统研究oncosis的作用,揭示了6个关键基因的时空表达模式和细胞特异性 | 研究主要基于动物模型,需要进一步验证在人类脊髓损伤中的适用性 | 阐明oncosis在脊髓损伤中的作用机制并寻找潜在治疗靶点 | 脊髓损伤大鼠模型和LPS处理的PC12细胞系 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR, 免疫荧光, 透射电镜 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 多个时间点的脊髓损伤大鼠样本和细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 267 | 2025-10-06 |
Emerging molecular Therapeutic targets in breast Cancer: Pathologic identification and clinical implications
2025-Aug, Human pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.humpath.2025.105881
PMID:40759284
|
综述 | 本文总结了乳腺癌当前和新兴的分子生物标志物及其在精准肿瘤学中的应用 | 系统梳理了包括液体活检、空间转录组学和高通量技术在内的新兴生物标志物发现方法及其临床转化潜力 | 生物标志物的标准化、可重复性和临床验证仍面临挑战 | 总结乳腺癌分子治疗靶点的病理学识别和临床意义 | 乳腺癌分子生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 下一代测序, 液体活检, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 基因组数据, 分子标志物数据, 肿瘤微环境数据 | NA | NA | 空间转录组学, 液体活检 | NA | NA |
| 268 | 2025-10-06 |
BCLAF1 restrains stress responses in hematopoietic stem cells to support expansion and repopulation
2025-Aug-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014916
PMID:40435510
|
研究论文 | 本研究揭示了转录调节因子BCLAF1通过限制造血干细胞应激反应来维持其发育和移植后重建功能的新机制 | 首次发现BCLAF1在造血干细胞中通过限制应激反应基因表达来维持干细胞功能的新作用机制 | BCLAF1与染色质结合的具体分子机制尚不明确,需要进一步研究 | 探究BCLAF1在造血干细胞发育和移植后重建功能中的调控作用 | 小鼠胎儿和成年造血干细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,染色质结合分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,染色质结合数据 | 小鼠造血干细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2025-10-06 |
Zn-Based Multi-Active Framework Nanoparticles TSA-CAN-Zn Inhibit Skin Glycation via Dual Blockade of HMGB1/RAGE and AGEs/RAGE Pathways
2025-Aug, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500664
PMID:40370206
|
研究论文 | 本研究开发了锌基多活性框架纳米颗粒TSA-CAN-Zn,通过双重阻断HMGB1/RAGE和AGEs/RAGE通路抑制皮肤糖化损伤 | 首次设计可同时抑制HMGB1/RAGE和AGEs/RAGE两条通路的纳米颗粒,并通过单细胞RNA测序揭示其对皮肤不同细胞类型的影响机制 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发治疗糖化诱导皮肤损伤的新型纳米疗法 | HaCaT细胞和小鼠皮肤糖化模型 | 纳米医学 | 皮肤糖化损伤 | 分子对接,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 270 | 2025-10-06 |
Visualization of the Spiral Ganglion Neuron in Vivo Using a Novel 177Lu Nuclear Molecule Label
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504464
PMID:40387257
|
研究论文 | 开发了一种新型放射性核素标记的抗体药物,实现了耳蜗螺旋神经节神经元的活体成像 | 首次利用放射性核素标记的抗VGLUT1抗体实现耳蜗螺旋神经节神经元的活体成像 | 目前仅在动物模型水平验证,尚未应用于临床 | 开发评估耳蜗神经完整性的新方法,为人工耳蜗植入术前评估提供依据 | 小鼠和猪模型的螺旋神经节神经元 | 分子影像学 | 听力损失 | 核素成像,单细胞测序分析 | NA | 影像数据,分子探针数据 | SGN损伤的小鼠和猪模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 271 | 2025-10-06 |
Activation of HTR2B Suppresses Osteosarcoma Progression through the STAT1-NLRP3 Inflammasome Pathway and Promotes OASL1+ Macrophage Production to Enhance Antitumor Immunity
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415276
PMID:40387572
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研究论文 | 本研究探讨了HTR2B通过STAT1-NLRP3炎症小体通路抑制骨肉瘤进展并促进OASL1+巨噬细胞产生以增强抗肿瘤免疫的双重作用机制 | 首次揭示HTR2B在骨肉瘤中的抑癌作用及其通过STAT1-NLRP3炎症小体通路和免疫调节的双重作用机制 | NA | 探索HTR2B在骨肉瘤进展中的潜在作用及其治疗靶点价值 | 骨肉瘤细胞系、骨肉瘤组织样本、CD45+免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | TARGET和GEO数据库数据及医院骨肉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 272 | 2025-10-06 |
Presbycusis: Pathology, Signal Pathways, and Therapeutic Strategy
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410413
PMID:40349177
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综述 | 本文聚焦于老年性耳聋中血管纹的关键作用,探讨其病理机制、信号通路及治疗策略 | 重点强调血管纹在老年性耳聋中的作用,并引入单细胞转录组学技术解析其机制 | NA | 阐明老年性耳聋的病理机制并探索治疗策略 | 老年性耳聋(Presbycusis/ARHL)的病理机制 | NA | 老年性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-06 |
SOX2 regulates foregut squamous epithelial homeostasis and is lost during Barrett's esophagus development
2025-Aug-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190374
PMID:40587339
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研究论文 | 本研究揭示了SOX2转录因子在食管鳞状上皮稳态维持中的关键作用及其在巴雷特食管发展过程中的丢失机制 | 建立了人类BE类器官生物库,通过单细胞转录组学揭示了SOX2和CDX2在BE分化中的平衡调控机制,并利用条件性基因敲除小鼠模型证实SOX2缺失可诱导鳞状上皮向柱状上皮的化生转变 | 研究主要基于动物模型和类器官,需要进一步在人体中验证SOX2丢失与BE发展的直接因果关系 | 探究巴雷特食管化生过程的分子决定因素 | 食管鳞状上皮细胞、巴雷特食管类器官、Krt5CreER/+ Sox2Δ/Δ ROSA26tdTomato/+基因敲除小鼠 | 分子生物学 | 食管腺癌 | 单细胞转录组学、CUT&RUN分析、类器官培养、基因敲除技术 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 人类BE类器官生物库、基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-10-06 |
Immune-responsive gene 1: The mitochondrial key to Th17 cell pathogenicity in CNS autoimmunity
2025-Aug-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2427052122
PMID:40758870
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研究论文 | 本研究揭示了免疫应答基因1在调控致病性Th17细胞中的关键作用及其在中枢神经系统自身免疫病中的保护机制 | 首次发现免疫应答基因1通过NLRP3/IL-1β轴调控巨噬细胞MHC Class II表达,影响致病性Th17细胞极化 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证不足 | 探究免疫应答基因1在中枢神经系统自身免疫病中对致病性Th17细胞的调控机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型、原代脑胶质细胞、免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 骨髓嵌合体实验, 过继转移实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 275 | 2025-10-06 |
A recurrent de novo damaging variant in EMP2 causes progressive symmetric erythrokeratoderma
2025-Aug-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509896122
PMID:40758889
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研究论文 | 发现EMP2基因的复发性新生错义变异导致进行性对称性红斑角皮病 | 首次将EMP2基因变异与进行性对称性红斑角皮病相关联,并揭示其通过EGFR信号通路发挥功能获得性机制 | NA | 研究孟德尔皮肤疾病的遗传病因和发病机制 | 进行性对称性红斑角皮病患者及其组织样本 | 遗传学 | 皮肤疾病 | 单细胞空间转录组学, 蛋白质印迹法 | NA | 遗传数据, 转录组数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 276 | 2025-10-06 |
Combined Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis to Reveal the Potential Influences of Intestinal Inflammatory Disease on Multiple Sclerosis
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02195-z
PMID:39680254
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研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞转录组分析,揭示肠道炎症疾病对多发性硬化的潜在影响机制 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,系统分析IBD和MS的共同炎症相关基因,并利用机器学习筛选诊断标志物 | 研究主要基于公共数据库和动物模型数据,需要进一步临床验证 | 探索多发性硬化与炎症性肠病之间的共同病理生理机制 | 多发性硬化患者、实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型、炎症性肠病患者 | 生物信息学 | 多发性硬化, 炎症性肠病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 飞行时间质谱流式细胞术, 机器学习 | 机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞数据, 质谱流式数据 | 多个公共数据集(GSE126124等)和PRJCA003980单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 277 | 2025-10-06 |
Potential function exploration of lncRNAs in idiopathic pulmonary fibrosis: insights from whole transcriptome sequencing data analysis
2025-Aug-08, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100732
PMID:40782499
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研究论文 | 通过全转录组测序数据分析探索长链非编码RNA在特发性肺纤维化中的潜在功能 | 首次系统识别IPF中差异表达lncRNAs并构建共表达网络,发现与炎症反应通路相关的关键lncRNAs | 样本量较小(12例患者和5例对照),需更大规模研究验证 | 探索lncRNAs在特发性肺纤维化发病机制中的功能作用 | 特发性肺纤维化患者和健康对照的RNA测序数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA | 共表达网络分析 | RNA测序数据 | 12例IPF患者和5例对照 | NA | 全转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-10-06 |
Microglia Single-Cell RNA-Seq Enables Robust and Applicable Markers of Biological Aging
2025-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70095
PMID:40371813
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据开发基于小胶质细胞的生物年龄标记物 | 首次在单细胞水平开发基于小胶质细胞的生物年龄时钟,采用无监督频率汇总方法平衡准确性、可解释性和计算效率 | 研究依赖于现有单细胞数据集,需要进一步实验验证 | 开发稳健且适用的生物年龄标记物 | 人类和小鼠的小胶质细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 无监督频率汇总方法 | 单细胞转录组数据,批量RNA测序数据 | 三个不同的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 279 | 2025-10-06 |
Aging Compromises Terminal Differentiation Program of Cytotoxic Effector Lineage and Promotes Exhaustion in CD8+ T Cells Responding to Coronavirus Infection
2025-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70109
PMID:40396260
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研究论文 | 本研究通过小鼠冠状病毒感染模型揭示衰老如何通过调控关键转录因子损害CD8+T细胞的终末分化程序并促进T细胞耗竭 | 首次发现衰老会损害(而非促进)病毒特异性CD8+T细胞的终末分化程序,并鉴定出ZEB2和KLF2转录因子在此过程中的关键调控作用 | 研究基于小鼠冠状病毒感染模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老对冠状病毒感染中病毒特异性T细胞分化程序的影响机制 | 年轻和年老小鼠的CD8+T细胞、CD4+T细胞及髓系细胞 | 免疫学 | 冠状病毒感染 | bulk转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄组的小鼠T细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing on PBMCs from patients with HA and HB with inhibitors reveals different immune responses to FVIII and FIX
2025-Aug-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025015799
PMID:40402102
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研究论文 | 通过单细胞测序分析血友病A和血友病B伴抑制剂患者外周血单个核细胞的免疫应答差异 | 首次在单细胞水平比较血友病A和血友病B伴抑制剂患者对FVIII和FIX的不同免疫应答机制 | 样本量较小(各5例患者),需更大样本验证 | 探索血友病A和血友病B患者对FVIII和FIX的不同免疫应答机制 | 血友病A和血友病B伴抑制剂患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 血友病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例HA患者和5例HB患者,共75,051个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |