单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2025-09-03	Gene print-based cell subtypes annotation of human disease across heterogeneous datasets with gPRINT 2025-Aug-07, Protein & cell IF:13.6Q1 DOI:10.1093/procel/pwaf001 PMID:40083145	研究论文	开发gPRINT算法用于跨异构单细胞数据集统一注释疾病特异性细胞亚型	受语音识别启发，将基因位置和表达信息转化为独特“基因指纹”模式，并集成神经网络减少背景噪声影响	NA	实现跨数据集的疾病特异性细胞亚型自动统一注释	人类疾病细胞亚型，特别是纤维化相关疾病和肌腱病中的成纤维细胞亚型	生物信息学	纤维化疾病	单细胞测序	神经网络	单细胞基因表达数据	跨不同供体、测序平台和疾病亚型的多个数据集
202	2025-09-03	Human Dermal Microvascular Arterial and Venous Blood Endothelial Cells and Their Use in Bioengineered Dermo-Epidermal Skin Substitutes 2025-Aug, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202401588 PMID:39871784	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析人皮肤微血管内皮细胞标记物，并成功在三维水凝胶中生物工程化动脉和静脉毛细血管	首次在生物工程组织中同时构建动脉、静脉丛及淋巴毛细血管网络，并证明其与宿主血管快速吻合	NA	开发生物工程血管网络用于再生医学应用	人胎儿和青少年皮肤中的微血管内皮细胞	再生医学	NA	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	转录组数据、蛋白质表达数据	人胎儿和青少年皮肤样本
203	2025-09-03	Integrated Analysis of PSMB8 Expression and Its Potential Roles in Hepatocellular Carcinoma 2025-Aug, Digestive diseases and sciences IF:2.5Q2 DOI:10.1007/s10620-025-09040-9 PMID:40261568	研究论文	通过多组学分析探讨PSMB8在肝细胞癌中的表达、预后价值及其与免疫调节的关联	首次系统评估PSMB8在HCC中的多组学特征，并发现其与免疫检查点分子（PD-L1/CD274、CD27）的显著正相关	研究主要依赖公共数据库和回顾性数据，需进一步实验验证机制	阐明PSMB8在肝细胞癌中的功能作用和临床意义	肝细胞癌（HCC）组织和相关免疫细胞	生物信息学与癌症研究	肝细胞癌	多组学分析、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质表达数据	TCGA和GSE76427数据集中的HCC样本，以及组织微阵列验证
204	2025-09-03	The Genomics of Aging at the Single-Cell Scale 2025-Aug, Annual review of genomics and human genetics IF:7.7Q1 DOI:10.1146/annurev-genom-120523-024422 PMID:40279573	综述	总结单细胞测序技术在研究哺乳动物衰老过程中细胞类型特异性变化的应用与发现	系统整合跨器官单细胞衰老研究，揭示性别差异和抗衰老干预对细胞群体动态的影响	基于现有研究进行综述，未提出原始实验数据或验证性分析	阐明衰老对哺乳动物多器官细胞群体变化的系统性影响	哺乳动物器官的细胞类型特异性群体	基因组学	老年疾病	单细胞测序技术	NA	基因组数据	NA
205	2025-09-03	Identification of Multi-Landscape and Cell Interactions in the Tumor Microenvironment Through High-Coverage Single-Cell Sequencing 2025-Aug, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202500241 PMID:40320868	研究论文	开发了一种创新的Chigene单细胞RNA测序技术，用于在单细胞水平同时分析基因表达、突变和RNA剪接景观	结合oligo-dT引物和随机桥接共标记(RBCL)测序的微流控芯片设计，实现近乎100% RNA覆盖率和多维度遗传信息分析	NA	开发高性能单细胞测序技术以探索肿瘤微环境中的多景观和细胞相互作用	临床样本中的单细胞，特别是尿路上皮癌细胞	单细胞测序技术	尿路上皮癌	scRNA-seq, 随机桥接共标记(RBCL)测序, 靶向基因突变捕获	NA	单细胞RNA测序数据	Chigene V1和V2两个版本平台，在临床样本中验证
206	2025-09-03	Integrative multi-omics reveal NSUN2 facilitates glycolysis and histone lactylation-driven immune evasion in renal carcinoma 2025-Aug, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-025-00336-4 PMID:40413354	研究论文	本研究通过整合多组学数据揭示NSUN2通过促进糖酵解和组蛋白乳酸化驱动肾癌免疫逃逸的机制	首次发现NSUN2通过m5C依赖性方式调控糖酵解和组蛋白乳酸化，并揭示其通过MYC/POM121/CD274轴介导PD-L1表达的免疫逃逸新机制	NA	探究线粒体代谢基因在肾透明细胞癌中的预后价值和治疗靶点潜力	肾透明细胞癌(ccRCC)临床队列和实验模型	生物信息学	肾癌	批量RNA测序、单细胞测序、机器学习算法	集成10种机器学习算法的117个预测模型	多组学数据	多个ccRCC临床队列（具体样本数未明确说明）
207	2025-09-03	Epithelial cell dynamics: Key drivers of type 2 inflammation in eosinophilic chronic rhinosinusitis 2025-Aug, Auris, nasus, larynx DOI:10.1016/j.anl.2025.05.009 PMID:40424830	综述	本文探讨了上皮细胞在嗜酸性慢性鼻窦炎（ECRS）中作为2型炎症关键驱动因素的作用机制	强调了上皮细胞（而非传统认为的免疫细胞）在ECRS发病机制中的核心作用，并指出靶向IL-4/IL-13和IL-5信号通路的新型生物制剂潜力	ECRS发病机制存在患者群体异质性，导致通用疗法开发困难，需分层医疗策略	研究上皮细胞在慢性鼻窦炎2型炎症中的调控机制及治疗靶点	嗜酸性慢性鼻窦炎（ECRS）患者的上皮细胞和免疫细胞	免疫病理学	慢性鼻窦炎	单细胞转录组学、空间转录组学	NA	分子生物学数据	NA
208	2025-09-03	Single-Cell Analysis Reveals that Vitamin C Inhibits Bone Metastasis of Renal Cancer via Cell Cycle Arrest and Microenvironment Remodeling 2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202501011 PMID:40433925	研究论文	本研究通过单细胞分析揭示了维生素C通过诱导细胞周期阻滞和重塑微环境抑制肾癌骨转移的机制	首次使用单细胞RNA测序技术解析维生素C在骨转移微环境中的抗肿瘤作用，并发现与CXCR2拮抗剂的协同效应	研究基于小鼠模型，临床适用性需进一步验证	探究维生素C抑制肾癌骨转移的分子机制和治疗潜力	肾癌细胞、骨转移微环境、癌症干细胞样细胞	癌症生物学	肾癌骨转移	单细胞RNA测序、3D肿瘤球培养、体内外模型	小鼠骨转移模型	基因表达数据	未明确样本数量，使用纤维蛋白凝胶诱导的3D肿瘤球衍生肾癌细胞
209	2025-09-03	PROS1-MERTK Axis Drives Tumor Microenvironment Crosstalk and Progression in Papillary Thyroid Microcarcinoma 2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413474 PMID:40433916	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了PROS1-MERTK信号轴在甲状腺微小乳头状癌进展中的关键作用	首次发现PROS1-MERTK信号相互作用在PTMC进展中的核心作用，并鉴定NFYB和FOXP2作为PROS1转录激活因子	样本量相对有限（19个手术组织标本来自15例患者）	识别与甲状腺微小乳头状癌进展相关的生物标志物，实现精确风险分层和治疗规划	甲状腺微小乳头状癌（PTMC）患者的手术组织标本	肿瘤微环境研究	甲状腺癌	单细胞RNA测序，空间转录组学，体内外实验验证	NA	RNA测序数据，空间转录组数据	19个手术组织标本（来自15例患者，包括4个癌旁组织、4个非进展性PTMC、5个进展性PTMC和6个进展性PTC）
210	2025-09-03	Comprehensive Characterization of Bihormonal Cells and Endocrine Cell Lineages in Mammalian Pancreatic Islets 2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202416326 PMID:40439685	研究论文	本研究全面表征了哺乳动物胰腺胰岛中的双激素细胞和内分泌细胞谱系，揭示了其稀有性和非过渡性本质	通过多技术整合（基因工程小鼠、成像流式细胞术、单细胞RNA测序和双重组酶谱系追踪）系统验证双激素细胞的稀有性，重新定义内分泌细胞分类并发现物种特异性差异	主要基于小鼠模型，人类样本分析相对有限，可能无法完全代表人类胰岛生物学的复杂性	阐明双激素细胞在胰腺胰岛中的作用、 prevalence 及其在β细胞恢复中的潜力	哺乳动物（小鼠和人类）胰腺胰岛中的内分泌细胞，特别是双激素细胞	细胞生物学	糖尿病	基因工程小鼠模型、成像流式细胞术、单细胞RNA测序、双重组酶谱系追踪、基因共表达网络分析	NA	单细胞转录组数据、荧光成像数据	基因工程小鼠品系和人类胰岛样本（具体数量未在摘要中说明）
211	2025-09-03	HLA-DR⁺ Tumor Cells Show an Association with a Distinct Immune Microenvironment and CD8⁺ T-Cell Exhaustion in HBV-Associated Hepatocellular Carcinoma 2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202502979 PMID:40464412	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和多尺度蛋白验证，揭示了HLA-DR⁺肿瘤细胞在HBV相关肝细胞癌中的独特作用及其与免疫微环境和T细胞耗竭的关联	首次在HBV相关肝癌中鉴定出HLA-DR⁺肿瘤细胞群体，并揭示其与免疫抑制微环境、CD8⁺ T细胞耗竭的特定关联机制	研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证机制因果关系	探究HBV相关肝细胞癌中肿瘤微环境的免疫学特征和机制差异	HBV相关肝细胞癌患者肿瘤样本和免疫细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	scRNA-seq, 多重免疫荧光, 组织微阵列	NA	单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据	160个样本（来自124名患者）的单细胞数据和198个HCC标本的蛋白验证数据
212	2025-09-03	Real-Time Evolutionary Landscape of the Bronchial Epithelium and Corresponding Dynamic Immune Cell Alterations in Lung Squamous Cell Carcinogenesis 2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413256 PMID:40470646	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示肺鳞状细胞癌发生过程中支气管上皮细胞的进化轨迹及免疫微环境动态变化	首次在烟草致癌物诱导的大鼠模型中系统描绘从正常上皮到浸润性癌的全过程单细胞进化图谱，并发现CNV在癌前病变阶段已广泛出现	研究基于大鼠模型，与人类疾病存在物种差异；单细胞测序技术本身存在检测灵敏度限制	解析肺鳞癌发生过程中肿瘤细胞与微环境的协同进化机制	大鼠支气管上皮细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞	单细胞组学	肺癌	单细胞转录组测序	NA	单细胞RNA测序数据	涵盖正常、增生、化生、异型增生、原位癌到浸润性癌的多阶段样本
213	2025-09-03	Mapping the role of cytokine signaling at single-cell and structural resolution in uveal melanoma 2025-Aug, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-025-00337-3 PMID:40490526	研究论文	本研究结合单细胞RNA测序和结构生物学方法，揭示葡萄膜黑色素瘤中细胞因子信号相关基因的预后和治疗意义	首次在单细胞和结构分辨率水平整合分析葡萄膜黑色素瘤的细胞因子信号网络，并发现ISG20作为关键预后标志物和治疗靶点	样本量较小（8个原发和3个转移样本），需要更大队列验证	解析葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境复杂性并识别新的治疗策略	葡萄膜黑色素瘤患者组织样本（原发和转移灶）	计算生物学	葡萄膜黑色素瘤	scRNA-seq, bulk RNA-seq, AlphaFold 2, 分子对接分析	Cox回归, LASSO风险模型	单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据	8个原发眼组织样本和3个肝转移样本
214	2025-09-03	DNA damage repair (DDR) related prognostic risk model in multiple myeloma based on single-cell and bulk sequencing 2025-Aug, DNA repair IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.dnarep.2025.103857 PMID:40527059	研究论文	基于单细胞和批量测序构建多发性骨髓瘤DNA损伤修复相关预后风险模型	整合单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据，首次构建多发性骨髓瘤DDR相关预后模型并鉴定关键基因	NA	开发多发性骨髓瘤的预后风险分层模型并探索治疗靶点	多发性骨髓瘤患者	生物信息学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序, 批量RNA-seq, WGCNA, 差异表达分析	预后风险模型	基因组测序数据	训练队列和验证队列患者样本
215	2025-09-03	Morphodynamics of human early brain organoid development 2025-Aug, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-09151-3 PMID:40533563	研究论文	本研究通过活体光片显微镜和计算分析技术，系统追踪了人脑类器官发育过程中的形态动力学和细胞行为	开发了新型双通道多蛋白标记策略与计算解复用方法，首次实现长期同步量化脑类器官发育中多个亚细胞特征的动态变化	研究主要基于无引导脑类器官模型，可能与体内真实大脑发育存在差异	探究人脑早期发育的形态动力学机制及细胞自组织过程	人诱导多能干细胞衍生的脑类器官	发育生物学	NA	光片显微镜、单细胞转录组测序、计算解复用	NA	图像、转录组数据	未明确样本数量的人脑类器官
216	2025-09-03	[Research advances in perineural invasion of pancreatic cancer] 2025-Aug-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery] DOI:10.3760/cma.j.cn112139-20241208-00561 PMID:40556405	综述	本文系统回顾了胰腺癌神经浸润领域的最新研究进展，涵盖其解剖基础、调控网络、实验模型及手术策略创新	整合单细胞空间转录组学的手术导航策略及分子靶向探针联合神经丛精准切除技术	多学科技术临床转化融合仍面临挑战	总结胰腺癌神经浸润机制并探索治疗策略优化	胰腺癌及其神经浸润现象	数字病理	胰腺癌	单细胞空间转录组学、分子靶向探针	NA	NA	NA
217	2025-09-02	Immunoregulatory Endothelial Cells Interact With T Cells After Myocardial Infarction 2025-Aug-29, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326145 PMID:40735785	研究论文	本研究揭示了心肌梗死后心脏内皮细胞的一种新型免疫调节功能，通过单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定出一种免疫调节内皮细胞表型	首次发现并表征了心肌梗死后出现的CD45+CD11b+Cdh5+免疫调节内皮细胞表型(IMEC)，并阐明其通过IFN-γ信号通路诱导T细胞活化的机制	研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性和临床转化价值需要进一步验证	探究心肌梗死后内皮细胞的免疫调节功能及其分子机制	小鼠心肌梗死模型中的内皮细胞和T细胞	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序, 空间转录组学, 骨髓移植, 谱系追踪实验	NA	基因表达数据, 空间定位数据	小鼠模型（具体数量未明确说明）
218	2025-09-02	Bacterial Infections Shape Cardiac Macrophages' Response to Ischemia 2025-Aug-29, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325147 PMID:40735767	研究论文	研究细菌感染如何通过改变心脏巨噬细胞特性加剧后续心肌缺血损伤	首次发现细菌感染后心脏巨噬细胞形成两个新亚群，并揭示其通过代谢活性和趋化特性放大缺血后炎症的机制	NA	探究细菌感染对心脏髓系细胞的长期影响及其在后续心肌缺血中的作用	心脏免疫细胞、外周白细胞、骨髓和脾脏中的造血干细胞与祖细胞	免疫学	心血管疾病	流式细胞术、单细胞RNA测序、纳米颗粒介导的RNA干扰	NA	单细胞转录组数据、流式细胞数据	NA
219	2025-09-01	Exosomal gene signature in esophageal carcinoma: Insights from single-cell and bulk RNA sequencing 2025-Aug-14, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102490 PMID:40816225	研究论文	本研究结合单细胞和bulk RNA测序数据，开发并验证了一个与食管癌外泌体相关的九基因风险特征模型	首次整合单细胞和bulk RNA测序数据构建外泌体相关基因特征，并实验验证HAPLN3的肿瘤抑制功能	需要在外泌体特异性免疫治疗队列中进行进一步验证	开发食管鳞状细胞癌的预后生物标志物并探索其免疫治疗指导潜力	食管鳞状细胞癌(ESCA)患者	生物信息学	食管癌	RNA-seq, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归	九基因风险模型	RNA测序数据	TCGA-ESCA、GSE53625、GSE196756等多个队列数据
220	2025-09-01	Enhanced hematopoietic stem cell self-renewal and engraftment through human lung exosomal communication 2025-Aug-11, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.020 PMID:40798884	研究论文	研究发现人肺来源的外泌体通过细胞间通讯增强造血干细胞的自我更新和移植能力	首次揭示肺细胞通过外泌体通讯调控造血干细胞稳态，突破传统骨髓微环境单一调控的认知	研究主要基于实验条件，临床转化潜力尚需进一步验证	探究肺源外泌体对造血干细胞功能的调控机制	人造血干细胞和肺小气道上皮细胞	细胞生物学	血液疾病（镰状细胞病、骨髓衰竭）	单细胞外泌体追踪、单细胞RNA测序、外泌体miRNA分析、蛋白质组学、体内移植实验	NA	单细胞测序数据、miRNA数据、蛋白质数据	NA（未明确样本数量，但涉及原代细胞实验和移植研究）