单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 541 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-05 |
An engineered glioblastoma model yields macrophage-secreted drivers of invasion
2025-Aug-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181903
PMID:40857405
|
研究论文 | 本研究通过工程化胶质母细胞瘤模型揭示肿瘤相关巨噬细胞分泌的侵袭驱动因子 | 结合工程化3D水凝胶肿瘤微环境模型与多组学分析，首次发现并验证TGFBI作为巨噬细胞分泌的可靶向促肿瘤因子 | 对肿瘤相关巨噬细胞功能的认知仍不完整，临床转化效果需进一步验证 | 研究肿瘤相关巨噬细胞与胶质母细胞瘤干细胞之间的相互作用机制 | 胶质母细胞瘤干细胞和M2极化巨噬细胞 | 肿瘤微环境研究 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,3D水凝胶模型 | 工程化3D水凝胶肿瘤微环境模型 | 转录组数据,蛋白质组数据 | 胶质母细胞瘤患者单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2025-10-05 |
Cholinergic Waves Have a Modest Influence on the Transcriptome of Retinal Ganglion Cells
2025-Aug-27, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0165-25.2025
PMID:40695599
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胆碱能波对小鼠视网膜神经节细胞转录组的影响 | 首次在单细胞水平揭示胆碱能波对视网膜神经节细胞转录组的类型特异性调控作用，而非普遍性影响 | 研究仅关注出生后第一周末的特定发育阶段，可能未覆盖其他关键发育时期的转录组变化 | 探究β2KO突变对单个功能型视网膜神经节细胞基因表达的影响 | 野生型和β2KO小鼠的视网膜神经节细胞 | 单细胞转录组学 | 视觉系统发育障碍 | 单细胞RNA测序,原位杂交,全细胞记录 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和β2KO小鼠视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-05 |
A Benchmark of Semi-Supervised scRNA-seq Integration Methods in Real-World Scenarios
2025-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.23.671952
PMID:40909636
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研究论文 | 系统评估五种半监督单细胞RNA测序整合方法在真实场景下的性能表现 | 首次在六种不同数据集上系统比较半监督与无监督单细胞RNA测序整合方法，并评估五种现实标注场景下的性能 | 仅评估了五种半监督方法，可能未涵盖所有相关方法；评估场景虽多样但仍有限 | 评估半监督单细胞RNA测序整合方法在现实标注场景下的实用价值 | 单细胞RNA测序数据整合方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | scANVI, scGEN, ssSTACAS, scDREAMER, ItClust, scCRAFT | 单细胞RNA测序数据 | 六个不同数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-10-05 |
A Low Sodium Diet Activates HSD2 Neurons in the Nucleus Tractus Solitarii to Promote Sodium Appetite Via the cAMP/MAPK Signaling Pathway
2025-Aug-26, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/JIN42286
PMID:40919635
|
研究论文 | 本研究揭示了低钠饮食通过激活NTS中HSD2神经元促进钠食欲的神经机制 | 首次阐明低钠饮食通过cAMP/MAPK信号通路激活HSD2神经元促进钠食欲的具体机制 | 研究仅使用小鼠模型，未在其它物种验证；未探讨长期低钠饮食的影响 | 探究低钠饮食条件下HSD2神经元在调节钠食欲中的神经生物学机制 | 小鼠模型中的HSD2神经元及其神经环路 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，药理学干预，顺行追踪，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，生理参数数据，行为数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2025-10-05 |
Stem cells within the HPA axis in tissue homeostasis and disease
2025-Aug-22, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf039
PMID:40590582
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综述 | 本文综述了HPA轴内干细胞在组织稳态和疾病中的作用，重点关注其起源、定位及功能 | 总结了单细胞RNA测序揭示的HPA轴干细胞群体异质性，并讨论了体外分化干细胞替代疗法的新策略 | 对HPA轴动态组织可塑性机制的理解仍有限，特别是在人类研究方面 | 探讨HPA轴中干细胞在组织稳态维持和疾病发生发展中的作用机制 | 下丘脑-垂体-肾上腺轴中的干细胞和祖细胞 | 发育生物学 | 代谢疾病、癌症、应激相关疾病 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、体外分化 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2025-10-05 |
Reviewing the Developing Significance of the Serine Protease PRSS23
2025-Aug-18, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL27294
PMID:40917042
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综述 | 本文系统回顾了丝氨酸蛋白酶PRSS23在不同生理病理过程中的功能研究进展 | 首次全面梳理PRSS23从基础生物学功能到疾病机制的研究历程，特别关注近年单细胞技术带来的新发现 | 作为综述文章，主要整合现有研究而非提供原始实验数据 | 总结PRSS23的生物学功能及其在疾病中的作用机制 | 丝氨酸蛋白酶PRSS23及其在不同组织和疾病中的表达与功能 | 分子生物学 | 乳腺癌, 胃癌, 局限性硬皮病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 药物筛选 | NA | 文献资料 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 187 | 2025-10-05 |
Astaxanthin promotes in vitro maturation of mouse oocytes by regulating mitochondrial functions and protein homeostasis†
2025-Aug-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf107
PMID:40324205
|
研究论文 | 本研究揭示虾青素通过调控线粒体功能和蛋白质稳态促进小鼠卵母细胞体外成熟 | 首次报道虾青素在卵母细胞体外成熟中的作用，并阐明其通过调控线粒体功能和蛋白质稳态的机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在其它物种验证 | 探究虾青素对小鼠卵母细胞体外成熟的影响及其作用机制 | 小鼠卵母细胞 | 生殖生物学 | NA | 单细胞转录组测序, 微量蛋白质组学, 透明带激光打孔, 体外受精 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2025-10-05 |
Developmental cues from epicardial cells simultaneously promote cardiomyocyte proliferation and electrochemical maturation
2025-Aug-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102572
PMID:40614731
|
研究论文 | 本研究通过共培养人诱导多能干细胞来源的心肌细胞与心外膜细胞，探索发育信号如何同时促进心肌细胞增殖和电化学成熟 | 发现心外膜细胞能同时促进心肌细胞增殖和电化学成熟，挑战了传统认为成熟会限制增殖的观点 | 3D工程心脏组织中心肌细胞增殖改善有限，研究主要基于体外模型 | 探究心外膜细胞对心肌细胞发育成熟的影响机制 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞和心外膜细胞 | 干细胞与组织工程 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序，2D/3D共培养技术 | 工程心脏组织模型 | 基因表达数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2025-10-05 |
A clonally expanded nodal T-cell population diagnosed as T-cell lymphoma after CAR-T therapy
2025-Aug-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62709-7
PMID:40796743
|
研究论文 | 报道一例CAR-T治疗后出现的克隆性扩增T细胞群体被诊断为T细胞淋巴瘤的病例 | 首次使用单细胞空间转录组学揭示CAR-T治疗后T细胞淋巴瘤的克隆特征和空间分布模式 | 仅基于单个病例报告，样本量有限 | 研究CAR-T治疗后继发性T细胞恶性肿瘤的分子特征 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者CAR-T治疗后出现的淋巴结病变 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 基因组测序, 单细胞空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞空间转录组学, 基因组测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-05 |
Singletrome enhances detection of long noncoding RNAs in single cell transcriptomes
2025-Aug-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-13528-9
PMID:40796606
|
研究论文 | 介绍Singletrome工具，用于增强单细胞转录组中长链非编码RNA的检测 | 开发了Singularity镜像工具，整合蛋白质编码和lncRNA基因注释，考虑基因的正反义重叠，生成增强注释 | NA | 改进单细胞RNA测序中长链非编码RNA的检测和分析 | 长链非编码RNA和蛋白质编码基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-05 |
Multi-omics single-cell data alignment and integration with enhanced contrastive learning and differential attention mechanism
2025-Aug-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf443
PMID:40795161
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研究论文 | 提出一种用于单细胞多组学数据对齐和整合的新方法scECDA | 采用增强对比学习和差异注意力机制，能自主学习各组学数据集的特征分布并减少噪声干扰 | NA | 提高单细胞多组学数据整合的准确性和细胞类型识别能力 | 单细胞多组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞多组学测序 | 自编码器,对比学习 | 单细胞多组学数据 | 八个配对单细胞多组学数据集 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10X Multiome, CITE-seq, TEA-seq | 多种单细胞多组学技术平台生成的数据 |
| 192 | 2025-10-05 |
A Single-Cell Atlas-Inspired Hitchhiking Therapeutic Strategy for Acute Pancreatitis by Restricting ROS in Neutrophils
2025-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202502200
PMID:40395143
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示急性胰腺炎中中性粒细胞亚群组成及极化过程，并开发了一种基于二氧化锰纳米反应器的靶向治疗策略 | 首次构建急性胰腺炎中性粒细胞单细胞图谱，并创新性地提出基于中性粒细胞搭便车递送的纳米治疗策略，实现原位合成抗氧化剂 | NA | 开发针对急性胰腺炎的靶向治疗策略，通过限制中性粒细胞中活性氧来减轻胰腺炎症 | 急性胰腺炎中的中性粒细胞 | 单细胞测序 | 急性胰腺炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-05 |
Decoding neuronal diversity: Mechanisms governing neural cell fate in Drosophila
2025-Aug, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.103061
PMID:40482397
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综述 | 本文综述了果蝇神经细胞命运决定机制的最新研究进展 | 整合单细胞转录组学和全脑连接组学新技术，系统阐述神经细胞命运决定的三大关键机制 | 主要聚焦果蝇模型，对哺乳动物神经发育的普适性有待验证 | 解析神经干细胞如何产生神经元多样性的分子机制 | 果蝇神经系统发育 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞转录组学、全脑连接组学、经典遗传学、标记技术 | NA | 基因表达数据、神经连接数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2025-10-05 |
Principles of synaptogenesis: Insights from Caenorhabditiselegans
2025-Aug, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.103056
PMID:40483740
|
综述 | 基于秀丽隐杆线虫模型阐述突触发生的原理、组织与精细化调控机制 | 整合基因编辑、显微成像、单细胞转录组与计算分析等前沿技术解析突触发育机制 | NA | 揭示突触组装、精细化与重塑的遗传基础与调控机制 | 秀丽隐杆线虫神经系统 | 神经科学 | NA | 基因编辑, 显微成像, 单细胞转录组分析, 计算分析 | NA | 基因表达数据, 显微图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-05 |
Molecular characterization and functional prioritization of CD46, IL6R, KLRC1, LEAP2 and SMOX as candidate targets in acute kidney injury
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146096
PMID:40683494
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研究论文 | 通过多组学整合框架鉴定并验证急性肾损伤的候选治疗靶点 | 建立遗传信息指导的多组学整合框架，系统筛选具有治疗潜力的候选靶点，并结合计算药物重定位和实验验证 | NA | 识别和验证急性肾损伤的潜在治疗靶点 | CD46、IL6R、KLRC1、LEAP2和SMOX基因及其编码蛋白 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 多组学整合分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、计算机药物重定位 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-05 |
Computational methods for alternative polyadenylation and splicing in post-transcriptional gene regulation
2025-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01496-z
PMID:40804481
|
综述 | 全面概述选择性多聚腺苷酸化和选择性剪接的计算分析方法及其在转录后基因调控中的作用 | 系统总结了单细胞RNA测序专用的APA和AS分析技术，提供了从群体到单细胞水平的基因调控新见解 | 作为综述文章，主要总结现有方法而非提出新算法，依赖已有文献的覆盖范围 | 探讨选择性多聚腺苷酸化和选择性剪接在转录后基因调控中的计算分析方法 | 基因转录本和调控机制 | 生物信息学 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-10-05 |
stImage: a versatile framework for optimizing spatial transcriptomic analysis through customizable deep histology and location informed integration
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf429
PMID:40905789
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研究论文 | 开发了一个名为stImage的开源R包，用于优化空间转录组分析 | 首次在统一框架中完全整合基因表达、组织学特征和精确空间坐标，并提供54种整合策略 | NA | 优化空间转录组分析，提高生物学见解 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据、组织学图像、空间坐标 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-05 |
Steatohepatitis alters lymphocytes cytotoxicity and localization, accelerating colorectal liver metastases
2025-Aug-28, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101222
PMID:40882404
|
研究论文 | 本研究探讨脂肪性肝炎如何通过改变淋巴细胞毒性和定位来加速结直肠癌肝转移 | 首次揭示MASH通过改变CD8+T细胞和NK细胞的定位与功能，而非单纯数量变化，来促进肝转移的新机制 | 研究基于小鼠模型，需要人类样本验证；未详细探讨其他免疫细胞亚群的作用 | 阐明MAFLD中代谢应激引起的肝脏免疫细胞变化及其对结直肠癌肝转移早期阶段的影响 | 小鼠模型中的肝脏免疫细胞和MC38癌细胞 | 免疫肿瘤学 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序，RT-PCR，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2025-10-05 |
Nitrogen-Driven Orchestration of Lateral Root Development: Molecular Mechanisms and Systemic Integration
2025-Aug-21, Biology
DOI:10.3390/biology14081099
PMID:40906392
|
综述 | 本文系统综述了氮素如何通过分子机制调控植物侧根发育过程及其系统整合 | 整合了单细胞转录组学和先进成像技术揭示的侧根对氮素响应的细胞异质性，强调了氮素作为主调节器通过分子枢纽同步营养感应与根形态发生的动态重编程机制 | 作为综述文章，主要整合现有研究而非提出新的实验证据 | 阐明氮素感知、信号传导及其与侧根发育途径整合的分子机制，旨在提高作物氮素利用效率 | 植物侧根发育过程，包括起始、原基形成、出现和伸长 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞转录组学，先进成像技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq to identify lactylation-related gene signatures in lung ischemia-reperfusion injury after lung transplantation
2025-Aug-19, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115361
PMID:40914702
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别肺移植后缺血再灌注损伤中与乳酸化相关的基因特征 | 首次将乳酸化相关基因特征与肺移植缺血再灌注损伤关联，并通过多组学整合和机器学习方法识别诊断生物标志物 | 研究主要基于公共数据集，实验验证仅限于小鼠模型 | 识别肺移植后缺血再灌注损伤中乳酸化相关的关键调控基因 | 肺移植患者的转录组数据和小鼠肺缺血再灌注损伤模型 | 生物信息学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 乳酸测定, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 免疫荧光, RT-qPCR | LASSO, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞数据 | GSE145989和GSE18995数据集，小鼠肺IRI模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |