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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-05 |
Excitatory Synaptic Transmission Is Differentially Modulated by Opioid Receptors along the Claustrocingulate Pathway
2025-Aug, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0219-25.2025
PMID:40670155
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研究论文 | 本研究探讨阿片受体对小鼠扣带回皮层中谷氨酸能信号传导的调节作用 | 首次揭示KOR、MOR和DOR阿片受体在claustrocingulate通路中对兴奋性突触传递的差异化调节机制 | 研究仅限于小鼠脑切片实验,未在活体动物中进行验证 | 探究阿片受体在claustrocingulate神经环路中对兴奋性突触传递的调节机制 | 小鼠前扣带回皮层和屏状核的神经环路 | 神经科学 | 疼痛感知与意识相关疾病 | 空间转录组学,脑切片电生理学,光遗传学,药理学方法 | NA | 电生理数据,转录组数据 | 雌雄小鼠脑切片样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-05 |
Lung Single-Cell Transcriptomics Reveal Diverging Pathobiology and Opportunities for Precision Targeting in Scleroderma-Associated Versus Idiopathic Pulmonary Arterial Hypertension
2025-Aug, Circulation. Genomic and precision medicine
DOI:10.1161/CIRCGEN.124.004936
PMID:40686216
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较硬皮病相关性与特发性肺动脉高压的肺组织基因表达差异 | 首次在单细胞水平揭示SSc-PAH与IPAH的分子病理差异,发现特异性细胞信号通路和潜在靶向治疗药物 | 样本量较小(每组4例),需要更大规模研究验证 | 探究不同亚型肺动脉高压的分子机制差异,为精准治疗提供依据 | 肺动脉高压患者的肺组织样本 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | Seurat分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 4例SSc-PAH、4例IPAH、4例对照供体肺组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium Flex | 10x Genomics Chromium Flex单细胞测序平台 |
| 183 | 2025-10-05 |
IL-17 Stimulates Sensory Neurons and Sensitises Colonic Afferents to Noxious Stimuli in a PI3K Dependent Manner in Male Mice
2025-Aug, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.70191
PMID:40827457
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研究论文 | 本研究揭示了IL-17通过PI3K信号通路直接激活感觉神经元并增强结肠传入神经对有害刺激的敏感性 | 首次通过生物信息学分析和实验验证相结合,发现IL-17通过PI3K依赖性机制直接激活DRG感觉神经元并增强结肠痛觉敏感性 | 研究主要在雄性小鼠中进行,性别差异的影响需要进一步验证 | 探索炎症性肠病中内脏疼痛的介质和机制 | 溃疡性结肠炎患者结肠活检样本、小鼠背根神经节神经元 | 生物医学研究 | 炎症性肠病/溃疡性结肠炎 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、钙成像、磁激活细胞分选 | NA | 基因表达数据、钙信号数据 | 溃疡性结肠炎患者结肠活检样本、小鼠背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-10-05 |
Spatial Domain-Based Approach to Analyze the Mechanism of Sparganii Rhizoma-Curcumae Rhizoma Pair in the Treatment of Colorectal Cancer
2025-Aug, Food science & nutrition
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/fsn3.70794
PMID:40842663
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和网络药理学,分析中药三棱-莪术药对在结直肠癌治疗中的空间域特异性作用机制 | 建立了整合空间转录组学、单细胞RNA测序和网络药理学的综合分析框架,首次从空间域角度解析中药药对在肿瘤微环境中的调控机制 | 研究主要基于计算分析和预测,需要进一步的实验验证来确认机制 | 研究三棱-莪术药对在结直肠癌原发灶和肝转移灶中的治疗机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的空间域和细胞间相互作用 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 网络药理学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing reveals the role of IL-33 + endothelial subsets in promoting early gastric cancer progression
2025-Aug, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70050
PMID:40860436
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示IL-33+内皮细胞亚群在促进早期胃癌进展中的作用 | 构建了包含184,426个高质量胃癌细胞的单细胞图谱,首次发现静脉-1内皮亚群通过IL-33促进血管生成和肿瘤生长的机制 | NA | 阐明早期胃癌的单细胞特征及肿瘤微环境组成,寻找预测标志物和治疗靶点 | 胃癌临床活检和手术样本中的细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 184,426个高质量胃癌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2025-10-05 |
Neuromodulatory Signaling in Chronic Pain Patients: A Narrative Review
2025-Aug-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14171320
PMID:40940732
|
综述 | 本叙述性综述综合分析了神经调节信号系统在慢性疼痛中的作用机制及治疗潜力 | 整合转录组分析、功能性神经影像和单细胞RNA测序等新技术发现患者特异性神经调节功能障碍模式,提出精准医疗干预点 | 叙述性综述缺乏系统性文献检索和定量分析,证据质量受原始研究限制 | 探讨神经调节信号通路在慢性疼痛病理生理机制中的作用及治疗靶点 | 慢性疼痛患者及相关的神经调节系统 | 神经科学 | 慢性疼痛 | 转录组分析,功能性神经影像,单细胞RNA测序 | NA | 临床观察数据,临床前研究数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-05 |
Artificial Intelligence in Ocular Transcriptomics: Applications of Unsupervised and Supervised Learning
2025-Aug-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14171315
PMID:40940727
|
综述 | 本文综述了2019-2025年间人工智能在眼科转录组学中的应用,重点介绍了无监督和监督学习方法在生物标志物发现、细胞类型分类及眼部疾病建模方面的进展 | 系统总结了AI在眼科转录组学中的最新应用,涵盖单细胞工作流程标准方法和深度学习框架在多组学整合中的潜力 | 存在可解释性和标准化方面的挑战 | 探讨人工智能在眼科转录组学数据分析中的应用 | 眼部组织转录组数据,包括视网膜、角膜、黄斑等 | 自然语言处理 | 年龄相关性黄斑变性 | 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | PCA, t-SNE, UMAP, WGCNA, LASSO, SVM, 随机森林, 变分自编码器, 神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2025-10-05 |
Current Role and Future Frontiers of Spatial Transcriptomics in Genitourinary Cancers
2025-Aug-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172774
PMID:40940870
|
综述 | 本文概述了空间转录组学技术在泌尿生殖系统癌症中的新兴作用和未来潜力 | 聚焦空间转录组学技术在泌尿生殖系统癌症中的独特应用,区别于传统转录组学仅关注基因表达水平 | NA | 探讨空间转录组学技术在泌尿生殖系统癌症研究中的当前作用和未来发展方向 | 泌尿生殖系统恶性肿瘤 | 空间转录组学 | 泌尿生殖系统癌症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 189 | 2025-10-05 |
A fibroblast-centric network drives cold fibrosis in the tumor microenvironment of lung squamous cell carcinoma
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.25.668405
PMID:40909739
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了肺鳞癌肿瘤微环境中由癌症相关成纤维细胞驱动的冷纤维化网络 | 首次将非癌性纤维化中的热/冷纤维化概念应用于肺鳞癌,发现了由CAF自分泌生长因子环路维持的冷纤维化结构 | 样本量相对较小(16例患者),仅针对初治患者进行研究 | 探究慢性炎症相关癌症中纤维化基质的组织原则 | 肺鳞癌患者的肿瘤和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 16例初治肺鳞癌患者的匹配肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2025-10-05 |
Genomic Insights into Tumorigenesis in Newly Diagnosed Multiple Myeloma
2025-Aug-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15172130
PMID:40941618
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析新诊断多发性骨髓瘤患者的遗传突变,揭示疾病进展的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序比较MGUS、SMM和新诊断MM各阶段的遗传突变特征,发现新的肿瘤发生相关基因 | 样本数量未明确说明,研究仅关注遗传突变而可能忽略其他分子机制 | 识别导致多发性骨髓瘤进展和肿瘤发生的遗传突变 | MGUS、SMM和新诊断多发性骨髓瘤患者样本 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 计算分析流程 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-05 |
Dynamic Intercellular Networks in the CNS: Mechanisms of Crosstalk from Homeostasis to Neurodegeneration
2025-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178155
PMID:40943076
|
综述 | 本文综述了中枢神经系统中动态细胞间通讯网络在健康稳态到神经退行性疾病过程中的作用机制 | 通过整合单细胞和空间转录组学最新发现,系统比较了不同疾病背景下细胞间通讯网络的动态变化 | 作为综述文章,主要基于现有文献分析,缺乏原始实验数据验证 | 探讨中枢神经系统中细胞间通讯网络在健康稳态和疾病状态下的作用机制 | 神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞等中枢神经系统细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 192 | 2025-10-05 |
Plasma Proteomics Reveals Dysregulated Pathways Across the Spectrum LMNA Cardiomyopathy
2025-Aug, Circulation. Genomic and precision medicine
DOI:10.1161/CIRCGEN.124.004924
PMID:40509996
|
研究论文 | 通过血浆蛋白质组学分析揭示LMNA心肌病发展过程中的失调通路 | 首次在LMNA心肌病中鉴定出EDA2R、MYL4等新型蛋白标志物,并发现26个蛋白在心肌细胞中呈现一致性差异表达 | 样本量相对有限(LMNA组41例,肌小节组18例),需要更大规模研究验证 | 探索LMNA基因致病变异相关的蛋白质和生物学通路 | 遗传性扩张型心肌病患者(LMNA和肌小节变异)及表型阴性家族成员 | 蛋白质组学 | 心血管疾病 | 血浆蛋白质组学分析,单细胞测序 | 主成分分析 | 蛋白质表达数据,基因表达数据 | 114例(41例LMNA DCM,18例肌小节DCM,55例表型阴性个体) | OLINK | 血浆蛋白质组学 | OLINK平台 | 测量约3000种血浆蛋白质 |
| 193 | 2025-10-05 |
Autophagy-related biomarkers in non-obstructive azoospermia: insights from transcriptomics and single-cell sequencing
2025-Aug, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03559-6
PMID:40587077
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞测序技术筛选非梗阻性无精子症中的自噬相关生物标志物 | 首次结合差异表达分析、WGCNA和机器学习算法筛选NOA的自噬相关生物标志物,并在单细胞水平验证其表达模式 | 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 探索自噬相关基因在非梗阻性无精子症中的作用并筛选诊断生物标志物 | 非梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本 | 生物信息学 | 男性不育症 | 转录组测序, 单细胞测序, RT-qPCR, 机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个公共数据集(包括GSE9210和GSE145467) | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-09-14 |
Comparative spatial transcriptomics of pancreatic cancer with ductal and acinar origins in mouse models
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70416
PMID:40717219
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2025-10-05 |
spammR: an R package designed for analysis and integration of spatial multi-omic measurements
2025-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672472
PMID:40909542
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研究论文 | 开发了一个用于空间多组学数据分析和整合的R软件包 | 专门针对质谱衍生的空间组学数据集设计,能够处理小样本量、空间稀疏性、大量缺失值且无需先验知识的完全数据驱动分析 | 主要针对质谱平台数据,对其他空间组学技术的适用性可能有限 | 开发空间多组学测量数据的分析和整合工具 | 空间多组学测量数据,特别是质谱衍生的空间组学数据 | 生物信息学 | NA | 质谱分析,空间多组学技术 | NA | 空间多组学数据,质谱数据 | 小样本量数据集 | NA | 空间多组学,质谱分析 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-05 |
Expanding canonical cortical cell type markers in the era of single-cell transcriptomics
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672469
PMID:40909566
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研究论文 | 本研究通过分析近50万个单细胞核转录组数据,扩展了大脑皮层细胞类型的经典标记物,并开发了评估标记物表达保真度的统计框架 | 开发了评估细胞标记物表达保真度的统计框架,首次系统量化了标记物在目标细胞类型中的表达保真度和背景表达,并识别出具有改进保真度的新标记物 | 研究主要基于已有研究的单细胞数据,可能受到原始数据质量和注释准确性的限制 | 扩展和优化大脑皮层细胞类型的标记物,提高单细胞转录组数据中细胞类型注释的准确性 | 人类大脑皮层细胞类型 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 统计框架 | 单细胞转录组数据 | 近500,000个高质量单细胞核转录组图谱,来自19项研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-10-05 |
Immune dysregulation in the prostates of C57BL/6Aire-/- mice mirrors that seen in human benign prostatic hyperplasia
2025-Aug-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669857
PMID:40832162
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研究论文 | 本研究通过建立C57BL/6 Aire-/-小鼠慢性前列腺炎症模型,揭示了其免疫失调特征与人类良性前列腺增生相似 | 首次在C57BL/6背景小鼠中建立转录因子缺陷型非消退性慢性炎症模型,并证明其免疫特征与人类BPH高度相似 | 研究仅使用小鼠模型,需要进一步验证在人类中的适用性;样本采集时间点有限(仅21天和35天) | 研究前列腺慢性炎症在良性前列腺增生发病机制中的作用 | C57BL/6 Aire-/-小鼠前列腺组织和人类良性前列腺增生组织 | 单细胞生物学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,组织学分析 | 动物疾病模型 | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | C57BL/6小鼠前列腺组织(21天和35天时间点),人类BPH scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-05 |
A Spatially Coordinated Keratinocyte-Fibroblast Circuit Recruits MMP9+ Myeloid Cells to Drive IFN-I-Driven Inflammation in Photosensitive Autoimmunity
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.19.670635
PMID:40894544
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学等技术,揭示了光敏性自身免疫疾病中角质形成细胞-成纤维细胞-髓系细胞的炎症级联反应机制 | 首次发现MMP9+ CD14+髓系细胞在光敏性自身免疫中的核心作用,并阐明其通过角质形成细胞-成纤维细胞轴被招募至真皮-表皮连接处的空间协调机制 | 研究主要基于体外模型和有限临床样本,需要更大规模的临床验证 | 阐明紫外线B暴露引发皮肤特异性自身免疫的分子机制 | 皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者的皮肤组织及体外细胞模型 | 数字病理学 | 自身免疫性皮肤病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学(seqFISH+), 体外建模 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确样本数量,包括患者皮肤组织和体外细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | seqFISH+空间转录组技术 |
| 199 | 2025-10-05 |
Integrated spatial and functional metabolic profiling identified the thick ascending limb as a mitochondrial vulnerability hub in acute kidney injury
2025-Aug-22, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.07.021
PMID:40850621
|
研究论文 | 本研究通过整合空间和功能代谢分析,发现肾小管粗升支是急性肾损伤中的线粒体脆弱性枢纽 | 首次通过整合空间转录组学、单细胞转录组学和同位素示踪成像技术,系统揭示了肾小管粗升支在急性肾损伤中的特殊代谢脆弱性 | 研究主要基于动物模型和有限的临床样本,需要在更大规模的人群研究中进一步验证 | 探索急性肾损伤的代谢机制和肾脏能量代谢的空间分布特征 | 小鼠模型和人类肾移植患者的肾脏组织 | 空间生物学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 免疫荧光, 同位素示踪成像 | NA | 转录组数据, 图像数据, 代谢数据 | 小鼠模型和人类肾移植患者样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2025-10-05 |
FAHD1-mediated pyruvate metabolism in hepatocellular carcinoma: Multi-omics and causal genetic evidence
2025-Aug-14, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100494
PMID:40814172
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了FAHD1在肝细胞癌中调控丙酮酸代谢的因果机制及其在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 首次整合单细胞转录组学、空间定位和遗传因果推断方法,识别出丙酮酸高活性上皮亚群及其与肿瘤核心区域的代谢分区特征,发现FAHD1作为丙酮酸代谢的因果驱动因子 | 研究主要基于观察性数据和体外模型验证,需要进一步的体内实验和临床试验确认FAHD1靶向治疗的临床价值 | 探索肝细胞癌中丙酮酸代谢的因果调控机制及其在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的上皮细胞亚群、癌症相关成纤维细胞及其相互作用 | 多组学整合分析 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组、孟德尔随机化分析、分子对接 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |