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当前共找到 541 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 利用单细胞转录组学（TempO-LINC平台）分析约40000个HepaRG细胞在七种毒物诱导下的应激反应路径，揭示细胞状态动态转变 | 首次采用单细胞转录组技术系统解码化学物质诱导的多种应激反应路径（UPR、OSR、HSR、DDR），并通过广义Jaccard度量聚类识别出五种细胞表型状态组，展示细胞亚群在毒物处理下的动态转变 | 未提及具体局限性 | 利用单细胞转录组学解码细胞对毒物的应激状态，为毒性评估提供动态分子机制见解 | HepaRG细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学（TempO-LINC平台） | NA | 基因表达数据 | 约40000个HepaRG细胞 | 10x Genomics（若TempO-LINC基于类似技术）或BioSpyder（TempO-LINC开发商） | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC单细胞转录组分析平台 |
| 2 | 2026-05-16 |
Enhanced Translational Activity Is Linked to Lymphatic Endothelial Cell Activation in Cutaneous Leishmaniasis
2025-Aug, Lymphatic research and biology
IF:1.6Q4
DOI:10.1089/lrb.2024.0080
PMID:40279249
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、流式细胞术和嘌呤霉素掺入法，表征了小鼠皮肤利什曼病中淋巴管内皮细胞的转录和翻译反应，发现其翻译活性增强与免疫激活相关 | 首次在皮肤利什曼病模型中综合表征淋巴管内皮细胞的转录和翻译活性，揭示其翻译活性在病变中显著高于其他细胞类型，并验证其作为抗原递呈细胞的功能 | NA | 研究皮肤利什曼病小鼠模型中淋巴管内皮细胞的转录和翻译反应，探究其在病变中的激活状态和免疫调节作用 | 小鼠皮肤利什曼病模型中的淋巴管内皮细胞 | 数字病理学 | 传染病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 嘌呤霉素掺入法 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-16 |
Targeting the HNRNPA2B1/HDGF/PTN Axis to Overcome Radioresistance in Non-Small Cell Lung Cancer
2025-08, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2024.0808
PMID:40643435
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研究论文 | 探究HNRNPA2B1/HDGF/PTN信号通路在非小细胞肺癌放疗抵抗中的作用机制，重点分析其通过调控自噬依赖性铁死亡影响肿瘤细胞存活 | 首次揭示HNRNPA2B1/HDGF/PTN通路通过调控自噬依赖性铁死亡促进非小细胞肺癌放疗抵抗的新机制 | 主要基于体外细胞系和动物模型，缺乏临床样本验证；具体分子间相互作用细节尚需进一步阐明 | 阐明HNRNPA2B1/HDGF/PTN信号通路在非小细胞肺癌放疗抵抗中的分子机制，寻找克服放疗抵抗的新治疗靶点 | 非小细胞肺癌放疗抵抗细胞系和小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 流式细胞术, 生化染色, 逆转录定量聚合酶链反应, 蛋白质印迹, 甲基化RNA免疫沉淀定量PCR | NA | 单细胞基因表达数据, 图像, 生物化学数据 | 放疗抵抗肺癌细胞系和小鼠肿瘤模型（具体样本量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-16 |
Resolvin D1-mediated cellular crosstalk protects against MASH
2025-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101454
PMID:40671835
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研究论文 | 本研究探讨了Resolvin D1介导的细胞间对话对代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的保护作用及机制 | 首次揭示了RvD1通过缓解内质网应激减少肝细胞死亡和DAMP产生，进而抑制Kupffer细胞、T细胞和肝星状细胞激活的新型细胞间对话机制 | 文章未明确提及局限性 | 确定RvD1介导的细胞间对话在MASH中的作用和机制 | 小鼠和人类的肝脏细胞，包括肝细胞、Kupffer细胞、T细胞和肝星状细胞 | NA | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 共培养实验 | NA | 转录组数据 | 小鼠n=5-6, 人类n=9-10 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-15 |
TSC2/mTORC1 integrates deoxynivalenol signals recognized by membrane receptors IR and EGFR to restrict intestinal stem cell function
2025-08-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138769
PMID:40466374
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术，发现TSC2/mTORC1通路整合膜受体IR和EGFR识别的脱氧雪腐镰刀菌烯醇信号，限制肠道干细胞功能 | 首次阐明脱氧雪腐镰刀菌烯醇通过膜受体IR和EGFR调控TSC2/mTORC1活性，进而影响肠道干细胞功能的分子机制 | 尚未提及具体的局限性 | 探究膜受体如何整合细胞外脱氧雪腐镰刀菌烯醇信号以损害肠道干细胞的定向命运决定 | 猪肠道干细胞、猪肠道类器官、IPEC-J2细胞系 | 机器学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序、等温滴定量热法 | NA | 基因表达数据 | 使用猪肠道类器官和IPEC-J2细胞系的体外实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-05-15 |
Bacterial ADP-heptose triggers stem cell regeneration in the intestinal epithelium following injury
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.009
PMID:40651470
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研究论文 | 该论文揭示了细菌代谢产物ADP-庚糖通过ALPK1-TIFA信号通路触发肠道上皮损伤后干细胞再生的机制 | 首次发现ALPK1-TIFA信号在肠道干细胞中调控损伤后静止干细胞向恢复性干细胞的转换，并鉴定潘氏细胞为ADP-庚糖诱导恢复性干细胞的起源细胞 | 未提及具体限制 | 阐明ADP-庚糖通过ALPK1-TIFA信号在肠道上皮损伤后干细胞再生中的作用机制 | 肠道干细胞、潘氏细胞 | 数字病理学 | 肠道损伤 | 单细胞转录组学、谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（Tifa突变小鼠）以及辐射或硫酸葡聚糖钠诱导的损伤模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 7 | 2026-05-12 |
Nuclear Profilin-1 for DNA Damage Repair Is Involved in Phagocytic Impairment of Senescent Microglia
2025-08, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70028
PMID:40317528
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研究论文 | 本研究发现核内profilin-1参与DNA损伤修复，并涉及衰老小胶质细胞吞噬功能障碍 | 首次揭示profilin-1从细胞质向细胞核的转位在DNA双链断裂修复中的作用，并阐明其与衰老小胶质细胞吞噬功能损伤的关联 | 细胞松弛素D处理未能促进PFN1返回细胞质，且研究主要基于体外实验，需进一步体内验证 | 探究profilin-1在小胶质细胞DNA损伤修复中的作用及其对衰老相关吞噬功能的影响 | 小胶质细胞（体外培养及离体衰老小胶质细胞） | 自然语言处理 | 老年性疾病（脑衰老相关） | 单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像（单细胞RNA测序数据） | 体外细胞实验及公开的小鼠脑单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-05-10 |
A STAT3/integrin axis accelerates pancreatic cancer initiation and progression
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116010
PMID:40701148
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研究论文 | 本文发现STAT3/整合素轴通过调控ITGB3表达加速胰腺癌的起始与进展，并揭示其表观遗传调控机制 | 首次发现STAT3通过结合ITGB3增强子区域调控其表达，建立18基因预后特征，为胰腺癌分层治疗提供新靶点 | 未在临床样本中验证18基因特征的实际应用，缺乏体内动物模型对机制的直接验证 | 阐明STAT3通路在胰腺导管腺癌进展中的下游调控机制及临床意义 | 缺氧或制瘤素M处理的胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | ChIP-seq, 单细胞转录组学 | NA | 测序数据 | 未指定样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台进行单细胞转录组分析 |
| 9 | 2026-05-10 |
A Spatially Coordinated Keratinocyte-Fibroblast Circuit Recruits MMP9+ Myeloid Cells to Drive IFN-I-Driven Inflammation in Photosensitive Autoimmunity
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.19.670635
PMID:40894544
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学等方法，揭示紫外线B通过角化细胞-成纤维细胞-髓系细胞环路驱动光敏感性自身免疫的机制 | 首次发现MMP9+ CD14+髓系细胞是光敏感性的关键效应细胞，并描述了角化细胞-成纤维细胞-髓系细胞多细胞炎症级联环路 | 研究主要基于人类体外模型和临床样本，可能未完全复制体内微环境的复杂性 | 阐明紫外线B暴露如何触发皮肤特异性自身免疫的分子机制 | 皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者皮肤组织及健康对照皮肤 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮, 皮肌炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 (seqFISH+), 紫外线B激发, 体外模型 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 涉及皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者皮损及非皮损皮肤样本，健康对照皮肤样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | seqFISH+ | NA |
| 10 | 2026-05-09 |
Selective Depletion of CCR8+Treg Cells Enhances the Antitumor Immunity of Cytotoxic T Cells in Lung Cancer by Dendritic Cells
2025-08, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2025.02.029
PMID:40056978
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研究论文 | 该研究探讨了在非小细胞肺癌中通过选择性清除CCR8+调节性T细胞增强细胞毒性T细胞的抗肿瘤免疫作用 | 首次揭示抗CCR8疗法与PD1抑制剂联用通过破坏CCR8+Treg-CCL5+树突状细胞相互作用重塑肿瘤微环境，并明确JAK-STAT通路激活诱导IL-12分泌增强CD8+ T细胞杀伤活性的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本量有限且仅观察了晚期非小细胞肺癌患者联合治疗潜力，尚未开展大规模随机临床试验验证安全性与有效性 | 评估抗CCR8单药及联合PD1抑制剂在非小细胞肺癌中的治疗效果及分子机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型及晚期患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、流式细胞术、多色免疫荧光、Luminex检测 | NA | 基因表达数据、免疫表型数据 | 四种非小细胞肺癌小鼠模型及部分晚期非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-05-08 |
stImage: a versatile framework for optimizing spatial transcriptomic analysis through customizable deep histology and location informed integration
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf429
PMID:40905789
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研究论文 | stImage是一个开源R包，通过生成深度学习组织学特征并提供54种整合策略，优化空间转录组学分析 | 首次在统一框架中完全协同基因表达、组织学特征和精确空间坐标，并利用诊断图指导用户选择最佳整合策略 | 现有方法在不同数据集和条件下的性能表现不一致，stImage仍需进一步验证其在更多样数据集中的普适性 | 开发一个全面且灵活的空间转录组学分析框架，提升生物学洞察和组织结构理解 | 多个空间转录组学数据集中的组织样本 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据、组织学图像、空间坐标 | 多个数据集中的组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-05-08 |
Batch correction methods used in single-cell RNA sequencing analyses are often poorly calibrated
2025-08-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279886.124
PMID:40623818
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研究论文 | 本文比较了八种用于单细胞RNA测序数据批次校正的方法，并发现许多方法存在校准不良的问题，引入了可测量的伪影 | 提出了一种新的衡量方法，从细粒度（细胞间距离）和粗粒度（细胞簇间效应）两个层面评估批次校正对数据的改变程度 | 未提及具体局限性，但测试仅基于特定数据集和设置，可能无法完全代表所有实际情况 | 评估和比较单细胞RNA测序数据批次校正方法的校准性能 | 八种常见的批次校正方法（MNN， SCVI， LIGER， Combat， ComBat-seq， BBKNN， Seurat， Harmony） | 机器学习 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序实验的合并数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-05-08 |
A novel multislice framework for precision 3D spatial domain reconstruction and disease pathology analysis
2025-08-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280281.124
PMID:40659497
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研究论文 | 提出一种名为STMSC的多切片联合分析框架，用于精确的三维空间域重建和疾病病理学分析 | 创新性地引入预校正机制和图注意力自编码器，整合H&E成像数据，实现精确的三维空间域识别，并捕获肿瘤发展的阶段内和阶段间异质性 | NA | 开发一种多切片联合分析框架，以实现精确的三维空间域重建并深入分析疾病病理 | 空间转录组数据、H&E组织图像及连续组织切片和病理数据集 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | 图注意力自编码器 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-05-02 |
Targeting Liver Epsins Ameliorates Dyslipidemia in Atherosclerosis through Inhibition of Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 9-Mediated Low-density Lipoprotein Receptor Degradation
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609742
PMID:39253478
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研究论文 | 通过抑制PCSK9介导的低密度脂蛋白受体降解，靶向肝脏Epsins可改善动脉粥样硬化中的血脂异常 | 首次揭示肝脏Epsins通过其泛素相互作用基序（UIM）与LDLR结合，促进PCSK9介导的LDLR降解，从而加剧动脉粥样硬化，并提出了靶向Epsins的纳米颗粒siRNA疗法 | 主要基于小鼠模型，未在人体中验证疗效；长期安全性和副作用需进一步研究 | 探究肝脏Epsins是否及如何通过调节PCSK9介导的LDLR内吞和降解，影响LDL-C清除和动脉粥样硬化进程 | 肝脏特异性Epsin敲除的动脉粥样硬化小鼠模型（ApoE-/-和PCSK9-AAV8诱导） | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型：ApoE-/-和PCSK9-AAV8诱导的肝脏特异性Epsin敲除小鼠，西方饮食喂养 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 15 | 2026-05-02 |
Simulating paired and longitudinal single-cell RNA sequencing data with rescueSim
2025-Aug-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf442
PMID:40811017
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研究论文 | 介绍一种模拟配对和纵向单细胞RNA测序数据的新方法rescueSim | 首次在gamma-Poisson框架中引入样本间和受试者间变异性，实现对配对/纵向scRNA-seq数据的模拟 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够模拟配对/纵向scRNA-seq数据的方法，支持研究规划和功效分析 | 单细胞RNA测序数据中的时间依赖性转录组变化 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq模拟 | gamma-Poisson框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-05-01 |
RORγt eTACs mediate oral tolerance and Treg induction
2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250573
PMID:40298935
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研究论文 | 本研究揭示RORγt eTACs在口服耐受和调节性T细胞诱导中的关键作用 | 首次鉴定RORγt eTACs（也称为Janus或Thetis细胞）为口服耐受的关键中介细胞，并揭示其通过MHCII和整合素β8 (Itgb8)诱导食物特异性调节性T细胞的新机制 | 未提及具体限制 | 阐明口服免疫耐受的细胞和分子机制 | 小鼠模型中的RORγt谱系抗原呈递细胞（包括ILC3s、RORγt谱系树突状细胞和RORγt eTACs） | 免疫学 | NA | 单细胞测序、谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-01 |
The spatial landscape of glial pathology and T cell response in Parkinson's disease substantia nigra
2025-Aug-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62478-3
PMID:40759663
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研究论文 | 通过单核RNA测序、空间转录组学和T细胞受体测序，分析帕金森病黑质中的胶质细胞病理与T细胞反应的空间特征 | 首次揭示帕金森病黑质中CD8+ T细胞克隆扩增及其与CD44+星形胶质细胞的空间相关性，并发现CD44可能作为神经炎症的潜在治疗靶点 | 基于死后组织样本，可能无法完全反映疾病动态过程；功能验证仅限于体外培养的星形胶质细胞 | 阐明帕金森病中适应性免疫反应在大脑内的特征及其与胶质细胞病理的关系 | 帕金森病患者死后黑质组织中的T细胞和胶质细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序，空间转录组学，T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据，TCR序列数据 | 死后帕金森病患者黑质组织样本（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单核RNA测序，10x Visium空间转录组学，Illumina NovaSeq测序平台 |
| 18 | 2026-05-01 |
Cancer-associated fibroblasts and metabolic reprogramming predict pathologic response to neoadjuvant PD-1 blockade in resected non-small cell lung cancer
2025-Aug, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01067-4
PMID:40358847
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现，癌症相关成纤维细胞和代谢重编程可预测非小细胞肺癌新辅助PD-1阻断治疗后的病理反应 | 首次揭示了癌症相关成纤维细胞与T细胞之间的互作机制以及蛋氨酸循环代谢在预测免疫治疗应答中的潜在作用 | 未提及具体局限性 | 探索非小细胞肺癌新辅助免疫治疗耐药机制，寻找预测病理反应的生物标志物 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞亚群、T细胞亚群及其代谢特征 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 两个已发表的scRNA-seq数据集和5个免疫检查点抑制剂转录组队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-01 |
Integrative multi-omics reveal NSUN2 facilitates glycolysis and histone lactylation-driven immune evasion in renal carcinoma
2025-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00336-4
PMID:40413354
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研究论文 | 综合多组学分析揭示NSUN2通过促进糖酵解和组蛋白乳酸化驱动肾癌免疫逃逸 | 首次发现NSUN2通过m5C依赖方式促进线粒体糖酵解和组蛋白乳酸化，进而通过MYC/POM121/CD274轴导致PD-L1介导的免疫逃逸，揭示了糖酵解与免疫逃逸之间新的调控机制 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限、缺乏更大规模临床验证、机制细节有待深入研究 | 研究线粒体代谢基因在肾透明细胞癌中的预后和治疗潜力，并探索NSUN2在糖酵解和免疫逃逸中的作用 | 肾透明细胞癌患者临床队列、肿瘤细胞系、动物模型 | 机器学习 | 肾癌 | RNA测序、单细胞测序 | 机器学习算法（包括10种算法构建的预测模型） | RNA测序数据、单细胞测序数据 | 多个ccRCC临床队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-05-01 |
Mapping the role of cytokine signaling at single-cell and structural resolution in uveal melanoma
2025-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00337-3
PMID:40490526
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研究论文 | 该论文通过单细胞RNA测序和结构生物学方法，研究葡萄膜黑色素瘤中细胞因子信号的作用 | 结合单细胞RNA测序与AlphaFold 2结构预测技术，发现ISG20作为关键预后标志物和治疗靶点 | 样本量有限，仅涉及8个原发性和3个转移性样本 | 揭示葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的复杂性，探索新的治疗策略 | 葡萄膜黑色素瘤的原发性和转移性肿瘤组织 | 机器学习, 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Cox回归, LASSO | 基因表达数据 | 11个肿瘤样本（8个原发性，3个转移性） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |