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当前共找到 845 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-06 |
Targeting FGFR4 abrogates HNF1A-driven metastasis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Jul-29, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02408-5
PMID:40731412
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研究论文 | 本研究揭示了HNF1A通过上调FGFR4驱动胰腺导管腺癌转移的机制，并证明FGFR4抑制剂可有效阻断该转移过程 | 首次发现HNF1A通过调控FGFR4促进PDAC转移，并验证了FGFR4抑制剂在阻断转移中的治疗潜力 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究HNF1A在胰腺导管腺癌转移中的作用机制并寻找靶向治疗策略 | 胰腺导管腺癌细胞系、患者来源的PDAC细胞、小鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 组织芯片分析, UMAP空间分析, RNA干扰, 药物抑制实验 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 免疫组化数据 | ATCC细胞系、患者来源细胞及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-06 |
Evaluating Integrative Strategies for Incorporating Phenotypic Features in Spatial Transcriptomics
2025-Jul-29, ArXiv
PMID:40766882
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研究论文 | 本研究评估了在空间转录组学中整合表型特征的策略，特别关注在现实实验约束条件下的多模态数据整合方法 | 使用最小调参的变分自编码器从细胞图像中提取信息丰富的低维表示，并与转录计数进行整合，展示了在受限条件下学习表示优于手工特征的优势 | 研究基于公开的小鼠回肠MERFISH数据集，数据集规模有限且存在类别不平衡问题，使用基于边界框的分割方法 | 评估在空间转录组学中整合表型特征和成像模态的最佳策略 | 小鼠回肠组织细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，成像分析 | 变分自编码器(VAE)，岭回归模型 | 空间转录组数据，细胞图像数据（核染色，膜染色） | 公开可用的MERFISH小鼠回肠数据集 | NA | 空间转录组学，MERFISH | NA | NA |
| 143 | 2025-10-06 |
Single-cell antigen receptor sequencing in pigs with influenza
2025-Jul-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08507-9
PMID:40715353
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研究论文 | 本研究开发了猪特异性T细胞和B细胞受体富集引物，利用单细胞测序技术分析流感感染猪的免疫受体库 | 开发了与10x Genomics VDJ测序协议兼容的猪特异性TCR和BCR富集引物，首次在猪模型中实现高通量单细胞免疫受体测序 | 研究样本量有限，仅针对特定基因型猪和流感感染模型 | 研究自然杀伤T细胞对肺T细胞和B细胞受体库的影响，追踪流感感染后克隆扩增 | CD1D表达和CD1D缺陷猪的肺细胞及肺液T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | NA | 单细胞测序数据 | CD1D表达和CD1D缺陷猪的肺细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | 10x Chromium | 10x Genomics VDJ测序协议 |
| 144 | 2025-10-06 |
Identification and Mechanistic Studies of Key Genes in Thalamic Hemorrhage Pain by Multi-omics
2025-Jul-25, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/JIN38130
PMID:40767016
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研究论文 | 通过多组学方法识别丘脑出血疼痛的关键基因并研究其机制 | 首次采用整合多组学方法（转录组学、蛋白质组学、代谢组学、核糖体分析和单细胞RNA测序）系统研究丘脑出血疼痛的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 阐明丘脑出血疼痛发病机制中的关键基因 | 丘脑出血疼痛小鼠模型 | 多组学分析 | 丘脑出血疼痛 | 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 核糖体分析, 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 多组学数据 | THP组和对照组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-06 |
KMT2D Regulates Tooth Enamel Development
2025-Jul, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251320922
PMID:40103013
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研究论文 | 本研究通过构建KMT2D条件性敲除小鼠模型，揭示了KMT2D在牙釉质发育中的关键调控作用 | 首次系统阐明KMT2D通过直接激活成釉细胞分化关键基因调控牙釉质发育的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究KMT2D基因在牙釉质发育过程中的具体功能机制 | KMT2D条件性敲除小鼠模型及其牙釉质组织 | 发育生物学 | 牙釉质发育不全 | 条件性基因敲除, micro-CT, 扫描电镜, RNA测序, CUT&RUN测序, 单细胞RNA测序 | 条件性敲除小鼠模型 | 影像数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | KMT2D条件性敲除小鼠及对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 表观遗传测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-06 |
A lipid metabolism-related gene signature predicts prognosis after tamoxifen treatment in ER + breast cancer and reflects tumor microenvironment heterogeneity through single-cell analysis
2025-Jul-31, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02194-5
PMID:40745642
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于脂质代谢相关基因的特征模型，用于预测ER阳性乳腺癌患者他莫昔芬治疗后的预后 | 整合脂质代谢基因表达和机器学习数据构建预后模型，并通过单细胞分析揭示肿瘤微环境异质性 | 研究样本量相对有限，需要更多独立队列验证 | 开发ER阳性乳腺癌患者他莫昔芬治疗后预后预测模型 | ER阳性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序，机器学习 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | TCGA-ER+BRCA数据集183例，验证数据集GSE17705(298例)、GSE22219(134例)、GSE42568(70例)、GSE58644(147例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2025-10-06 |
Dual lineage origins contribute to neocortical astrocyte diversity
2025-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61829-4
PMID:40738880
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和谱系追踪技术揭示了小鼠新皮质中星形胶质细胞的五种亚型及其双重谱系起源机制 | 首次发现新皮质星形胶质细胞存在两种不同的发育谱系，并鉴定出Olig2作为关键调控因子控制特定谱系的分化 | 研究仅聚焦于小鼠新皮质区域，尚未验证其他脑区或物种的普适性 | 探究星形胶质细胞多样性形成的发育机制 | 小鼠新皮质中的星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪技术 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 148 | 2025-10-06 |
SETDB1 ensures the continuity of embryonic to adult neural stem cells through metabolic alterations in the dentate gyrus
2025-Jul-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424315122
PMID:40699919
|
研究论文 | 本研究揭示了SETDB1通过调控代谢状态确保胚胎神经祖细胞向成年神经干细胞连续转化的机制 | 首次发现SETDB1通过调控线粒体复合物组分COX6B2和氧化磷酸化过程，控制成年神经干细胞命运决定 | 研究主要聚焦于齿状回发育过程，其他脑区是否适用类似机制尚需验证 | 探索胚胎神经祖细胞向成年神经干细胞转化的分子机制 | 小鼠齿状回神经干细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-06 |
Time-coexpress: temporal trajectory modeling of dynamic gene co-expression patterns using single-cell transcriptomics data
2025-Jul-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06218-w
PMID:40731381
|
研究论文 | 提出基于copula的TIME-CoExpress框架，用于建模单细胞转录组数据中基因共表达随细胞时间轨迹的非线性动态变化 | 首次将copula模型与数据驱动平滑函数结合，能够捕捉基因共表达的非线性动态变化，同时建模零膨胀率和平均表达水平的动态变化 | 方法性能仅在模拟分析和单个scRNAseq数据集上验证，需要更多真实数据验证其普适性 | 开发能够识别单细胞转录组数据中基因共表达动态变化的计算方法 | 基因共表达模式、零膨胀率、平均表达水平沿细胞时间轨迹的动态变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | copula模型、数据驱动平滑函数 | 单细胞转录组数据 | 垂体胚胎发育过程中的scRNAseq数据集，比较[公式：见正文]和野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2025-10-06 |
"Small extracellular vesicles: messengers at the service of breast cancer agenda in the primary and distant microenvironments"
2025-Jul-21, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03471-y
PMID:40691627
|
综述 | 本文综述了小细胞外囊泡在乳腺癌原发和远处微环境中的关键作用及其临床转化潜力 | 系统整合小细胞外囊泡在乳腺癌微环境通讯中的多功能角色，并探讨人工智能与多组学技术结合的解决方案 | 存在小细胞外囊泡异质性问题和追踪技术限制，临床转化仍面临靶向效率、体内稳定性等挑战 | 阐明小细胞外囊泡在乳腺癌进展和治疗抵抗中的分子机制及临床应用前景 | 乳腺癌相关的小细胞外囊泡及其携带的生物分子（蛋白质、脂质、非编码RNA等） | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 超速离心、免疫亲和、微流控系统、单细胞转录组学、多组学分析 | NA | 分子生物学数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、多组学分析 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-06 |
Image-based inference of tumor cell trajectories enables large-scale cancer progression analysis
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9466
PMID:40680117
|
研究论文 | 开发基于人工智能的模型，利用H&E染色全切片图像推断肿瘤细胞轨迹并进行大规模癌症进展分析 | 首次利用常规病理切片中的细胞形态特征和组织学空间组织来推断肿瘤细胞分化状态和动态轨迹 | 方法依赖于图像质量，且在三组独立肺腺癌队列中验证但需进一步扩大验证范围 | 开发成本效益高的方法来分析肿瘤进展动态和肿瘤微环境细胞群体多样性 | 肺腺癌患者的H&E染色全切片图像和肿瘤细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 人工智能模型，空间转录组学分析，批量转录组学分析 | AI模型 | 图像 | 三个独立肺腺癌队列 | NA | 空间转录组学，批量转录组学 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-06 |
Artifacts in spatial transcriptomics data: their detection, importance, prevalence, and prevention
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf306
PMID:40748322
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研究论文 | 开发了一种名为BLADE的空间转录组学数据伪影检测方法 | 首次提出跨平台的自动化统计方法，能够检测和去除三种类型的空间转录组数据伪影 | 仅验证了Visium和CosMx平台，在其他平台上的适用性尚未验证 | 开发空间转录组数据质量控制方法 | 空间转录组数据中的伪影 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 统计方法 | 空间转录组数据 | 37个10x Visium样本（人类和小鼠的肝脏和脂肪组织） | 10x Genomics,Nanostring | 空间转录组学 | 10x Visium,CosMx | 10x Visium空间转录组平台，CosMx空间分子成像平台 |
| 153 | 2025-10-06 |
PoweREST: Statistical power estimation for spatial transcriptomics experiments to detect differentially expressed genes between two conditions
2025-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013293
PMID:40729405
|
研究论文 | 开发了用于空间转录组学实验统计功效估计的工具PoweREST，支持10X Genomics Visium数据的差异表达基因检测功效计算 | 首个专门针对空间转录组学实验的统计功效估计工具，支持实验前和初步数据收集后的功效分析 | 目前仅支持10X Genomics Visium平台数据，未涵盖其他空间转录组学技术 | 解决空间转录组学实验中差异表达基因检测的统计功效计算问题 | 空间转录组学数据中的差异表达基因 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计功效分析模型 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium空间转录组学平台 |
| 154 | 2025-10-06 |
Preliminary Study on GZMA- and GSDMB-Associated Pyroptosis and CD8+ T Cell-Mediated Immune Evasion in Skin Cutaneous Melanoma
2025-Jul-31, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
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研究论文 | 本研究探讨皮肤黑色素瘤中GZMA和GSDMB相关焦亡及CD8+ T细胞介导的免疫逃逸机制 | 首次在单细胞水平揭示CD8+ T细胞通过GZMA蛋白与黑色素瘤细胞相互作用促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 未检测到显著焦亡相关差异表达基因，焦亡通路在肿瘤组未被激活 | 基于焦亡特征揭示皮肤黑色素瘤的发病机制 | 皮肤黑色素瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验 | 差异表达分析, 基因集富集分析, 细胞通讯分析 | 基因表达数据, 临床信息 | TCGA和GEO数据库中的SKCM患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2025-10-06 |
Traditional medicine Kuanxiong Aerosol alleviates atherosclerotic plaque inflammation by mitigating CX3CR1+ macrophage apoptosis via the cGAS-STING pathway
2025-Jul-30, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157120
PMID:40753933
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研究论文 | 本研究探讨宽胸气雾剂通过cGAS-STING通路减轻CX3CR1+巨噬细胞凋亡，从而缓解动脉粥样硬化斑块炎症的作用机制 | 首次揭示宽胸气雾剂对巨噬细胞亚群的调控作用及其抗凋亡功能 | NA | 探索宽胸气雾剂治疗动脉粥样硬化的潜力及其作用机制 | ApoE-/-小鼠模型 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,超高效液相色谱-高分辨质谱,生物信息学分析,分子对接 | NA | 基因表达数据,质谱数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 156 | 2025-10-06 |
Analyses of Nogo-Family Genes in Mouse and Human Microglia Omics Datasets Identify LINGO1 as a Candidate Drug Target in Alzheimer's Disease
2025-Jul-30, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
|
研究论文 | 通过分析小鼠和人类小胶质细胞组学数据，探索Nogo家族基因表达模式并鉴定LINGO1作为阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 首次发现LINGO1在人类AD小胶质细胞中高度富集，并系统分析了Nogo信号系统在小胶质细胞中的表达特征 | 研究主要基于公开数据集，需要进一步实验验证功能机制 | 探索Nogo家族基因在小胶质细胞中的表达模式及其在阿尔茨海默病中的作用 | 小鼠和人类小胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序，RNA-seq，RiboTag翻译谱分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 整合21个人类脑细胞单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | CZ CellxGene Discover | 用于整合分析21个单细胞测序数据集的工具平台 |
| 157 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics: Technical Advances, Applications and Challenges in Cancer Drug Discovery
2025-Jul-30, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
|
综述 | 本文全面概述单细胞RNA测序技术在癌症药物发现中的技术进展、应用与挑战 | 重点强调单细胞转录组学在解析肿瘤异质性和识别药物靶点方面的创新应用 | 讨论了单细胞RNA测序技术当前面临的技术挑战 | 促进读者对单细胞测序的理解，启发肿瘤药物开发新思路 | 癌症药物发现过程 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-06 |
Renin Cells Drive Kidney Neurovascular Development and Arterial Remodeling when Renin Activity is Deficient
2025-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.08.663706
PMID:40672316
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研究论文 | 本研究通过新型超亮肾素细胞特异性报告小鼠模型，揭示了肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的关键作用 | 开发了超亮肾素细胞特异性tdTomato报告小鼠模型，首次实现了对稀有肾素细胞（仅占肾脏细胞0.01%）与神经纤维相互作用的3D可视化 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的功能机制 | 肾素细胞、肾脏神经纤维、动脉血管 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 高分辨率3D成像 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2025-10-06 |
Metabolic Analysis of Tumor Cells Within Ameloblastoma at the Single-Cell Level
2025-Jul, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15239
PMID:39737843
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析成釉细胞瘤肿瘤细胞的代谢异质性 | 首次在单细胞水平揭示成釉细胞瘤肿瘤细胞的代谢异质性，发现线粒体编程和糖酵解的变异是肿瘤细胞代谢特征的主要贡献者 | 仅分析了3例患者样本，样本量较小；研究主要基于计算分析框架 | 表征成釉细胞瘤在单细胞分辨率下的代谢异质性 | 成釉细胞瘤肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 成釉细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据 | 3例AB供体的17,284个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-06 |
CCL19+ Fibroblasts Promote Tertiary Lymphoid Structure in Oral Lichen Planus: A Retrospective Study
2025-Jul, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15266
PMID:39962879
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色揭示了口腔扁平苔藓中CCL19+成纤维细胞通过促进三级淋巴结构形成加剧疾病严重性的机制 | 首次在口腔扁平苔藓中发现CCL19+成纤维细胞在三级淋巴结构形成中的关键作用，并阐明其通过淋巴毒素激活促进T细胞趋化的机制 | 回顾性研究设计，样本量有限 | 阐明口腔扁平苔藓中适应性免疫的启动机制，特别关注诱导性三级淋巴结构和基质-免疫微环境的作用 | 口腔扁平苔藓患者 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 口腔扁平苔藓患者回顾性临床数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |