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当前共找到 801 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-05 |
cp_measure: API-first feature extraction for image-based profiling workflows
2025-Jul-01, ArXiv
PMID:41019218
|
研究论文 | 开发了一个名为cp_measure的Python库，用于从生物图像中提取特征以支持基于图像的细胞分析工作流 | 将CellProfiler的核心测量功能提取为模块化、API优先的工具，实现程序化特征提取 | NA | 开发适用于机器学习工作流的自动化、可重复图像分析工具 | 生物图像中的细胞和其他实体 | 计算机视觉 | NA | 图像分析，特征提取 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学，3D成像 | NA | NA |
| 122 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq provides insight into the underdeveloped immune system of germ-free mice
2025-Jul-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无菌小鼠免疫系统发育不全的分子机制 | 首次使用液滴单细胞RNA测序系统比较无菌小鼠与特定病原体自由小鼠的免疫细胞差异，发现微生物缺失导致中性粒细胞凋亡增加和干扰素反应受损的新机制 | 研究主要聚焦于骨髓和外周血细胞，未涉及其他免疫器官；机制验证仍需进一步功能实验 | 探究微生物群缺失导致免疫系统发育不全的分子机制 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓及外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 免疫缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓及外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴单细胞RNA测序平台 |
| 123 | 2025-10-05 |
Phenotypic, transcriptomic, and genomic analyses reveal the spatiotemporal patterns and associated genes of coarse hair density in goats
2025-07-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了大足黑山羊粗毛密度的时空变化模式及其相关基因 | 创新应用高分辨率微型相机成像技术，结合转录组、基因组和单细胞RNA测序等多组学数据解析粗毛密度调控机制 | 研究主要聚焦于单一山羊品种，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究山羊粗毛密度的遗传调控机制和时空变化规律 | 大足黑山羊 | 基因组学 | NA | RNA-seq, 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹, 免疫组织化学染色 | NA | 图像, 转录组, 基因组 | 905张皮肤图像, 33个皮肤转录组, 272个全基因组序列, 182个下载转录组 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-05 |
CXCL12 Drives Reversible Fibroimmune Remodeling in Androgenetic Alopecia Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jul-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26146568
PMID:40724819
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CXCL12在雄激素性脱发中驱动可逆性纤维免疫重塑的作用机制 | 首次在雄激素性脱发模型中系统阐明CXCL12通过自分泌和旁分泌信号通路协调调控成纤维细胞和免疫细胞的核心作用 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明CXCL12在雄激素性脱发纤维免疫病理过程中的分子机制 | 睾酮诱导的雄激素性脱发小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-05 |
MORPH Predicts the Single-Cell Outcome of Genetic Perturbations Across Conditions and Data Modalities
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661992
PMID:40631143
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研究论文 | 提出MORPH框架用于预测单细胞水平上遗传扰动的响应结果 | 结合差异变分自编码器和注意力机制，能够预测未见过的扰动、扰动组合及新细胞环境中的扰动响应 | NA | 开发能够跨条件和数据模态预测遗传扰动单细胞结果的计算模型 | 单细胞对遗传扰动的响应 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学，成像技术 | 变分自编码器，注意力机制 | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2025-10-05 |
α7 nicotinic acetylcholine receptors regulate radial glia fate in the developing human cortex
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61167-5
PMID:40593693
|
研究论文 | 本研究阐明了烟碱型乙酰胆碱受体在人类皮质发育过程中对放射状胶质细胞命运的调控机制 | 首次发现人类特异性CHRFAM7A亚基在放射状胶质细胞末端富集，并揭示YAP1作为nAChR信号通路下游关键效应分子 | 研究主要基于体外培养模型，需要进一步在体验证 | 探究产前尼古丁暴露影响人类皮质发育的细胞分子机制 | 人类皮质发育过程中的放射状胶质细胞和神经前体细胞 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序，器官型切片培养，分散细胞培养，基因敲降 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-10-05 |
Immune dysfunction during S. aureus biofilm-associated implant infections: opportunities for novel therapeutic strategies
2025-Jul-25, NPJ biofilms and microbiomes
IF:7.8Q1
DOI:10.1038/s41522-025-00782-y
PMID:40715142
|
综述 | 探讨金黄色葡萄球菌生物膜感染引起的免疫功能障碍机制及新型治疗策略 | 结合最新细菌单细胞测序研究，揭示生物膜通过改变细菌代谢和毒素产生诱导免疫功能障碍的新机制 | NA | 分析金黄色葡萄球菌生物膜感染中免疫功能障碍的机制并探索治疗策略 | 金黄色葡萄球菌生物膜及宿主免疫系统 | 微生物免疫学 | 细菌感染性疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2025-10-05 |
Meta-Analysis of Gene Expression in Bulk-Processed Post-Mortem Spinal Cord from ALS Patients and Normal Controls
2025-Jul-16, NeuroSci
IF:1.6Q4
DOI:10.3390/neurosci6030065
PMID:40700130
|
荟萃分析 | 对ALS患者和正常对照者尸检脊髓组织的基因表达数据集进行荟萃分析 | 通过荟萃分析减弱了个体研究中的差异表达偏倚，识别出213个差异表达基因并揭示了白质是mRNA丰度变化最显著的脊髓区域 | 基于批量处理的尸检组织数据，可能无法完全解析细胞类型特异性表达模式 | 分析ALS患者脊髓组织的基因表达变化特征 | ALS患者和正常对照者的尸检脊髓组织样本 | 生物信息学 | 肌萎缩侧索硬化 | 基因表达分析，空间转录组学 | 荟萃分析 | 基因表达数据 | 569个样本（454个ALS，115个对照），来自348个个体（262个ALS，86个对照） | NA | 批量RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 129 | 2025-10-05 |
Spatially aware adjusted Rand index for evaluating spatial transcriptomics clustering
2025-Jul-03, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf127
PMID:41001748
|
研究论文 | 提出了一种考虑空间信息的评估指标spARI，用于评估空间转录组学聚类方法 | 首次将空间距离信息整合到Rand指数中，提出了空间感知的调整Rand指数(spARI) | 未提及具体的技术实现限制或计算复杂度分析 | 开发更准确评估空间转录组学聚类方法性能的指标 | 空间转录组学数据聚类结果 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-05 |
Deletion of gasdermin D promotes granulocytic myeloid-derived suppressor cell differentiation by decreased release of mitochondrial DNA to promote tumor escape
2025-Jul-25, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04104-1
PMID:40711527
|
研究论文 | 本研究揭示了gasdermin D缺失通过抑制线粒体DNA释放促进粒细胞样髓源抑制细胞分化从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次发现GSDMD缺失通过维持线粒体完整性、减少mtDNA释放，进而抑制cGAS/STING/TBK1/IRF8/7信号轴激活，促进G-MDSCs分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和部分临床样本，需要更多临床验证；GSDMD重组慢病毒治疗的临床应用潜力需进一步评估 | 探究GSDMD在髓源抑制细胞分化及肿瘤免疫逃逸中的作用机制 | 结直肠癌组织、外周血G-MDSCs、GSDMD缺陷小鼠模型 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 慢病毒转染 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 结直肠癌患者组织及外周血样本, 基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2025-10-05 |
TREM2-Mediated Myeloid Cells Protect Against Pathological Choroidal Neovascularization
2025-Jul-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501793R
PMID:40716081
|
研究论文 | 本研究揭示了TREM2通过调节髓系细胞功能在病理性脉络膜新生血管形成中的保护作用 | 首次系统阐明TREM2在脉络膜新生血管中的保护机制，发现其与SOCS3通过独立但重叠的抗血管生成程序发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性仍需进一步验证 | 探究TREM2在脉络膜新生血管形成中的分子机制和功能作用 | 激光诱导的脉络膜新生血管小鼠模型 | 眼科疾病研究 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序，免疫染色，转录组分析，基因功能研究 | 基因缺陷小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据，病理图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-10-05 |
A spatiotemporal atlas of orchiectomy-induced androgen deprivation-mediated modulation of cellular composition and gene expression in the mouse prostate
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664414
PMID:40791419
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞分析，构建了小鼠前列腺在阉割诱导雄激素剥夺后的细胞组成和基因表达时空图谱 | 发现了一种新的成纤维细胞亚型（OIF），并揭示了前列腺不同叶在雄激素剥夺后的特异性时空基因表达变化和细胞间通讯动态 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 解析雄激素剥夺治疗对前列腺细胞组成和基因表达的影响 | 小鼠前列腺组织 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠前列腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 133 | 2025-10-05 |
Uncovering Functional Gene Regulatory Networks in Bulk and Single-Cell Data through Robust Transcription Factor Activity Estimation and Model-Guided Experimental Validation
2025-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.09.658650
PMID:40661601
|
研究论文 | 提出MERLIN+P+TFA方法，通过先验知识引导的稀疏正则化稳健估计转录因子活性和基因调控网络 | 使用先验知识引导的稀疏正则化方法，在存在先验知识噪声的情况下仍能准确估计转录因子活性和下游基因调控网络 | 需要生成特定背景的金标准来提高网络推断的准确性 | 重建基因组规模的基因调控网络 | 酵母和哺乳动物系统的模拟和真实表达数据，包括小鼠胚胎干细胞 | 系统生物学 | NA | 基因调控网络推断，转录因子活性估计 | MERLIN+P+TFA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2025-10-05 |
Statistical significance of clustering for count data
2025-Jul-03, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf120
PMID:40971569
|
研究论文 | 提出了一种用于评估计数数据聚类显著性的新方法SigClust-DEV | 开发了专门针对计数数据的聚类显著性评估方法，解决了传统SigClust方法在离散数据上统计效能不足的问题 | 未明确说明方法在极端稀疏计数数据或超大规模数据集上的性能表现 | 开发适用于计数数据的聚类显著性评估方法 | 计数数据，包括单细胞RNA测序数据和电子健康记录 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | SigClust-DEV | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-05 |
Identification and validation of mitochondrial ferroptosis and immune microenvironment-related hub biomarkers in liver cirrhosis by integrated bioinformatics analysis
2025 Jul-Sep, Science progress
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/00368504251380638
PMID:40966021
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定并验证了与肝硬化中线粒体铁死亡和免疫微环境相关的关键生物标志物 | 首次将线粒体铁死亡与免疫微环境结合，通过多组学数据分析鉴定肝硬化关键生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，需要进一步实验验证 | 鉴定肝硬化诊断和治疗的可靠生物标志物 | 肝硬化患者转录组数据 | 生物信息学 | 肝硬化 | 转录组测序,单细胞测序,免疫组化,分子对接 | LASSO回归,随机森林,WGCNA,机器学习 | 基因表达数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2025-10-05 |
Overexpression of high affinity Type I adenosine receptors promotes the growth of uterine leiomyomas
2025-Jul-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf025
PMID:40489662
|
研究论文 | 本研究探讨I型腺苷受体(ADORA1)过表达在子宫肌瘤生长中的作用机制 | 首次发现ADORA1受体在子宫肌瘤中的过表达现象，并阐明其通过调控AKT1信号通路促进肿瘤生长的机制 | 研究样本来源未明确说明具体数量，机制研究主要基于体外实验 | 探究细胞外腺苷水平改变促进子宫肌瘤生长的分子机制 | 子宫肌瘤组织标本和原代培养细胞 | 分子病理学 | 子宫肌瘤 | RT-qPCR, western blot, 免疫组织化学, 单细胞转录组学, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2025-10-05 |
Comparing Xenium 5K and Visium HD data from identical tissue slide at a pathological perspective
2025-Jul-26, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03479-4
PMID:40713820
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研究论文 | 从病理学角度比较Xenium 5K和Visium HD在相同组织切片上的空间转录组数据 | 首次使用相同组织切片生成的公开肺数据集对两种高分辨率空间转录组技术进行真实技术比较，并结合详尽的病理学注释 | 研究基于公开数据集，可能受限于特定组织类型；主要关注肺组织，在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 比较Visium HD和Xenium-5K两种空间转录组技术的性能差异，为不同研究场景选择合适技术提供病理学依据 | 肺组织空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组技术 | 聚类算法 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium 5K, Visium HD | Visium HD（2µm分辨率，转录组范围覆盖），Xenium-5K（亚微米分辨率，靶向成像检测技术） |
| 138 | 2025-10-05 |
MuST: multiple-modality structure transformation for single-cell spatial transcriptomics
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf405
PMID:40874816
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研究论文 | 提出一种名为MuST的多模态结构转换方法，用于解决单细胞空间转录组学中的模态偏差问题 | 通过拓扑发现策略和拓扑融合损失函数学习内在局部结构，协调不同模态间的不一致性 | NA | 减轻空间转录组数据中模态偏差的不利影响，满足各种下游分析任务需求 | 单细胞空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 多模态数据（转录组、空间、形态学） | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-05 |
Integrating spatial transcriptomics and snRNA-seq data enhances differential gene expression analysis results of AD-related phenotypes
2025-Jul-10, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100447
PMID:40329537
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，增强阿尔茨海默病相关表型的差异基因表达分析能力 | 首次将空间转录组学与单核RNA测序数据整合，实现了皮层层次和细胞类型特异性的差异基因表达分析 | 空间转录组学数据样本量较小，分析仅限于背外侧前额叶皮层组织 | 增强阿尔茨海默病相关表型的空间信息差异基因表达分析能力 | 436个死后大脑的背外侧前额叶皮层组织中的约150万个细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 线性混合模型 | 基因表达数据 | 436个死后大脑的背外侧前额叶皮层组织 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-05 |
Foxp3+ Regulatory T Cells Restrain Th1 Response Shielding the Brain from Lethal Inflammatory Damage during Cryptococcal Meningoencephalitis
2025-Jul-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7142999/v1
PMID:40766255
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研究论文 | 本研究揭示了Foxp3+调节性T细胞在隐球菌性脑膜脑炎中通过抑制Th1反应保护大脑免受炎症损伤的机制 | 首次系统阐明Treg细胞在CNS感染中的神经保护作用，发现CCR8/CCL1轴是Treg向大脑募集的关键机制，并验证Treg增强疗法对生存率的改善效果 | Areg缺失未显示生存效应，其具体调控机制仍需进一步研究 | 探究调节性T细胞在隐球菌性脑膜脑炎中的免疫调节作用及神经保护机制 | 人类CM患者和小鼠CM模型中的调节性T细胞 | 免疫学 | 中枢神经系统感染 | scRNA-seq, 流式细胞术, NanoString分析 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 人类患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |