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当前共找到 820 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
Gene-regulatory programs that specify age-related differences during thymocyte development
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115903
PMID:40570375
|
研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育的转录和染色质可及性图谱，揭示了年龄相关差异的基因调控程序 | 首次系统揭示胸腺细胞发育中年龄相关的基因调控程序差异，并发现Zbtb20这一保守转录调控因子在年龄依赖性T细胞发育差异中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，人类中的相关性需要进一步验证 | 阐明T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控机制 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑, 染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 新生和成年小鼠胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-05 |
Meta-Analysis of Gene Expression in Bulk-Processed Post-Mortem Spinal Cord from ALS Patients and Normal Controls
2025-Jul-16, NeuroSci
IF:1.6Q4
DOI:10.3390/neurosci6030065
PMID:40700130
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荟萃分析 | 对ALS患者和正常对照者尸检脊髓组织的基因表达数据集进行荟萃分析 | 通过荟萃分析减弱了个体研究中的差异表达偏倚，识别出213个差异表达基因并揭示了白质是mRNA丰度变化最显著的脊髓区域 | 基于批量处理的尸检组织数据，可能无法完全解析细胞类型特异性表达模式 | 分析ALS患者脊髓组织的基因表达变化特征 | ALS患者和正常对照者的尸检脊髓组织样本 | 生物信息学 | 肌萎缩侧索硬化 | 基因表达分析，空间转录组学 | 荟萃分析 | 基因表达数据 | 569个样本（454个ALS，115个对照），来自348个个体（262个ALS，86个对照） | NA | 批量RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-05 |
Spatially aware adjusted Rand index for evaluating spatial transcriptomics clustering
2025-Jul-03, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf127
PMID:41001748
|
研究论文 | 提出了一种考虑空间信息的评估指标spARI，用于评估空间转录组学聚类方法 | 首次将空间距离信息整合到Rand指数中，提出了空间感知的调整Rand指数(spARI) | 未提及具体的技术实现限制或计算复杂度分析 | 开发更准确评估空间转录组学聚类方法性能的指标 | 空间转录组学数据聚类结果 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-05 |
Deletion of gasdermin D promotes granulocytic myeloid-derived suppressor cell differentiation by decreased release of mitochondrial DNA to promote tumor escape
2025-Jul-25, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04104-1
PMID:40711527
|
研究论文 | 本研究揭示了gasdermin D缺失通过抑制线粒体DNA释放促进粒细胞样髓源抑制细胞分化从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次发现GSDMD缺失通过维持线粒体完整性、减少mtDNA释放，进而抑制cGAS/STING/TBK1/IRF8/7信号轴激活，促进G-MDSCs分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和部分临床样本，需要更多临床验证；GSDMD重组慢病毒治疗的临床应用潜力需进一步评估 | 探究GSDMD在髓源抑制细胞分化及肿瘤免疫逃逸中的作用机制 | 结直肠癌组织、外周血G-MDSCs、GSDMD缺陷小鼠模型 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 慢病毒转染 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 结直肠癌患者组织及外周血样本, 基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-05 |
TREM2-Mediated Myeloid Cells Protect Against Pathological Choroidal Neovascularization
2025-Jul-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501793R
PMID:40716081
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研究论文 | 本研究揭示了TREM2通过调节髓系细胞功能在病理性脉络膜新生血管形成中的保护作用 | 首次系统阐明TREM2在脉络膜新生血管中的保护机制，发现其与SOCS3通过独立但重叠的抗血管生成程序发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性仍需进一步验证 | 探究TREM2在脉络膜新生血管形成中的分子机制和功能作用 | 激光诱导的脉络膜新生血管小鼠模型 | 眼科疾病研究 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序，免疫染色，转录组分析，基因功能研究 | 基因缺陷小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据，病理图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-Binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2025-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321173
PMID:40401371
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次发现FABP4/5通过调控内皮细胞糖酵解和动脉编程参与肺动脉高压的发病机制 | 研究主要基于动物模型，人类样本验证仍需进一步扩大 | 探究内皮细胞FABP4/5在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉内皮细胞、肺动脉高压患者样本、PH大鼠模型、基因敲除小鼠 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序, 蛋白质组分析 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 人类PAH患者样本、PH大鼠模型、Egln1Tie2Cre和Egln1Tie2Cre/Fabp4/5-/-小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-05 |
A spatiotemporal atlas of orchiectomy-induced androgen deprivation-mediated modulation of cellular composition and gene expression in the mouse prostate
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664414
PMID:40791419
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞分析，构建了小鼠前列腺在阉割诱导雄激素剥夺后的细胞组成和基因表达时空图谱 | 发现了一种新的成纤维细胞亚型（OIF），并揭示了前列腺不同叶在雄激素剥夺后的特异性时空基因表达变化和细胞间通讯动态 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 解析雄激素剥夺治疗对前列腺细胞组成和基因表达的影响 | 小鼠前列腺组织 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠前列腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-05 |
Uncovering Functional Gene Regulatory Networks in Bulk and Single-Cell Data through Robust Transcription Factor Activity Estimation and Model-Guided Experimental Validation
2025-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.09.658650
PMID:40661601
|
研究论文 | 提出MERLIN+P+TFA方法，通过先验知识引导的稀疏正则化稳健估计转录因子活性和基因调控网络 | 使用先验知识引导的稀疏正则化方法，在存在先验知识噪声的情况下仍能准确估计转录因子活性和下游基因调控网络 | 需要生成特定背景的金标准来提高网络推断的准确性 | 重建基因组规模的基因调控网络 | 酵母和哺乳动物系统的模拟和真实表达数据，包括小鼠胚胎干细胞 | 系统生物学 | NA | 基因调控网络推断，转录因子活性估计 | MERLIN+P+TFA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-10-05 |
Statistical significance of clustering for count data
2025-Jul-03, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf120
PMID:40971569
|
研究论文 | 提出了一种用于评估计数数据聚类显著性的新方法SigClust-DEV | 开发了专门针对计数数据的聚类显著性评估方法，解决了传统SigClust方法在离散数据上统计效能不足的问题 | 未明确说明方法在极端稀疏计数数据或超大规模数据集上的性能表现 | 开发适用于计数数据的聚类显著性评估方法 | 计数数据，包括单细胞RNA测序数据和电子健康记录 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | SigClust-DEV | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-05 |
Identification and validation of mitochondrial ferroptosis and immune microenvironment-related hub biomarkers in liver cirrhosis by integrated bioinformatics analysis
2025 Jul-Sep, Science progress
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/00368504251380638
PMID:40966021
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定并验证了与肝硬化中线粒体铁死亡和免疫微环境相关的关键生物标志物 | 首次将线粒体铁死亡与免疫微环境结合，通过多组学数据分析鉴定肝硬化关键生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，需要进一步实验验证 | 鉴定肝硬化诊断和治疗的可靠生物标志物 | 肝硬化患者转录组数据 | 生物信息学 | 肝硬化 | 转录组测序,单细胞测序,免疫组化,分子对接 | LASSO回归,随机森林,WGCNA,机器学习 | 基因表达数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-10-05 |
Overexpression of high affinity Type I adenosine receptors promotes the growth of uterine leiomyomas
2025-Jul-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf025
PMID:40489662
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研究论文 | 本研究探讨I型腺苷受体(ADORA1)过表达在子宫肌瘤生长中的作用机制 | 首次发现ADORA1受体在子宫肌瘤中的过表达现象，并阐明其通过调控AKT1信号通路促进肿瘤生长的机制 | 研究样本来源未明确说明具体数量，机制研究主要基于体外实验 | 探究细胞外腺苷水平改变促进子宫肌瘤生长的分子机制 | 子宫肌瘤组织标本和原代培养细胞 | 分子病理学 | 子宫肌瘤 | RT-qPCR, western blot, 免疫组织化学, 单细胞转录组学, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-05 |
Comparing Xenium 5K and Visium HD data from identical tissue slide at a pathological perspective
2025-Jul-26, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03479-4
PMID:40713820
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研究论文 | 从病理学角度比较Xenium 5K和Visium HD在相同组织切片上的空间转录组数据 | 首次使用相同组织切片生成的公开肺数据集对两种高分辨率空间转录组技术进行真实技术比较，并结合详尽的病理学注释 | 研究基于公开数据集，可能受限于特定组织类型；主要关注肺组织，在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 比较Visium HD和Xenium-5K两种空间转录组技术的性能差异，为不同研究场景选择合适技术提供病理学依据 | 肺组织空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组技术 | 聚类算法 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium 5K, Visium HD | Visium HD（2µm分辨率，转录组范围覆盖），Xenium-5K（亚微米分辨率，靶向成像检测技术） |
| 93 | 2025-10-05 |
MuST: multiple-modality structure transformation for single-cell spatial transcriptomics
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf405
PMID:40874816
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研究论文 | 提出一种名为MuST的多模态结构转换方法，用于解决单细胞空间转录组学中的模态偏差问题 | 通过拓扑发现策略和拓扑融合损失函数学习内在局部结构，协调不同模态间的不一致性 | NA | 减轻空间转录组数据中模态偏差的不利影响，满足各种下游分析任务需求 | 单细胞空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 多模态数据（转录组、空间、形态学） | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-05 |
Integrating spatial transcriptomics and snRNA-seq data enhances differential gene expression analysis results of AD-related phenotypes
2025-Jul-10, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100447
PMID:40329537
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，增强阿尔茨海默病相关表型的差异基因表达分析能力 | 首次将空间转录组学与单核RNA测序数据整合，实现了皮层层次和细胞类型特异性的差异基因表达分析 | 空间转录组学数据样本量较小，分析仅限于背外侧前额叶皮层组织 | 增强阿尔茨海默病相关表型的空间信息差异基因表达分析能力 | 436个死后大脑的背外侧前额叶皮层组织中的约150万个细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 线性混合模型 | 基因表达数据 | 436个死后大脑的背外侧前额叶皮层组织 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-05 |
Foxp3+ Regulatory T Cells Restrain Th1 Response Shielding the Brain from Lethal Inflammatory Damage during Cryptococcal Meningoencephalitis
2025-Jul-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7142999/v1
PMID:40766255
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研究论文 | 本研究揭示了Foxp3+调节性T细胞在隐球菌性脑膜脑炎中通过抑制Th1反应保护大脑免受炎症损伤的机制 | 首次系统阐明Treg细胞在CNS感染中的神经保护作用，发现CCR8/CCL1轴是Treg向大脑募集的关键机制，并验证Treg增强疗法对生存率的改善效果 | Areg缺失未显示生存效应，其具体调控机制仍需进一步研究 | 探究调节性T细胞在隐球菌性脑膜脑炎中的免疫调节作用及神经保护机制 | 人类CM患者和小鼠CM模型中的调节性T细胞 | 免疫学 | 中枢神经系统感染 | scRNA-seq, 流式细胞术, NanoString分析 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 人类患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-05 |
Dermatopathological Challenges in Objectively Characterizing Immunotherapy Response in Mycosis Fungoides
2025-Jul-29, Dermatopathology (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/dermatopathology12030022
PMID:40843796
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综述 | 探讨蕈样肉芽肿免疫治疗反应客观评估的挑战与新兴解决方案 | 提出将黑色素瘤研究方法应用于蕈样肉芽肿的免疫治疗评估，并倡导采用多光谱成像和空间转录组学等新技术 | 缺乏统一的病理生物标志物，难以区分治疗过程中的反应性淋巴细胞与恶性淋巴细胞 | 改进蕈样肉芽肿免疫治疗反应的客观评估方法 | 蕈样肉芽肿（皮肤T细胞淋巴瘤）患者 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 多光谱成像，空间转录组学，高通量T细胞受体基因重排分析 | NA | 组织病理图像，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2025-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.24.665575
PMID:40777386
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研究论文 | 本研究通过空间转录组技术揭示了多氯联苯暴露对成年小鼠大脑功能和认知的分子影响 | 首次结合空间转录组学分析PCB暴露对多个脑区基因表达的影响，并发现其对血脑屏障完整性的破坏机制 | 研究仅使用成年雄性C57BL/6J小鼠，结果可能不适用于其他性别或年龄的动物 | 评估PCB暴露对大脑功能和认知的影响机制 | 成年雄性C57BL/6J小鼠 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多只成年雄性C57BL/6J小鼠（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-05 |
Impact of Cattle Breed in scRNA-Seq Reference on Muscle Fiber Type Deconvolution from Bulk RNA-Seq: A Comparison of Software Tools
2025-Jul-25, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech14030056
PMID:40843779
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研究论文 | 比较不同软件工具在使用不同牛品种scRNA-seq参考数据对肌肉纤维类型反卷积分析的影响 | 首次证明参考scRNA-seq数据中使用的牛品种会显著影响反卷积结果 | 仅研究晚期妊娠荷斯坦奶牛，未涵盖其他品种或生理状态 | 评估不同牛品种scRNA-seq参考数据对肌肉纤维类型反卷积分析的影响 | 晚期妊娠荷斯坦多产奶牛的肌肉组织 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | CIBERSORTx, Cellanneal, DeconvR-NNLS, DeconvR-RLM | RNA测序数据 | 使用Brahman和Wagyu牛品种的scRNA-seq参考数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2025-10-05 |
Mapping mesenchymal diversity in the developing human intestine and organoids
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.22.665939
PMID:40777494
|
研究论文 | 构建人类小肠发育过程中间充质细胞多样性的空间图谱并用于评估肠道类器官 | 首次创建了覆盖人类肠道细胞类型多样性的定制Xenium空间转录组基因panel，揭示了发育过程中成纤维细胞群体的动态空间重塑 | 研究主要聚焦于发育中的间充质群体，其他细胞类型分析相对有限 | 解析人类肠道发育过程中间充质细胞的空间组织与多样性 | 发育中的人类小肠组织及多能干细胞衍生的肠道类器官 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间定位数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | Xenium | 定制Xenium空间转录组基因panel |
| 100 | 2025-10-05 |
Activation of IL-17+ ILC subsets in IL-18R-deficient mice during fungal allergen exposure
2025-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.17.665289
PMID:40777291
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研究论文 | 本研究探讨IL-18受体缺陷小鼠在真菌过敏原暴露下ILC亚群中IL-17的激活机制 | 首次揭示IL-18信号通过抑制ILC2s产生IL-17A来调控肺部嗜酸性粒细胞增多 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究IL-18/IL-18R信号通路在肺部ILC2应答中的作用机制 | IL-18受体敲除小鼠和野生型对照小鼠的肺组织免疫细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序，细胞因子检测 | NA | 基因表达数据，细胞因子数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |