单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 845 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
Reg2ST: recognizing potential patterns from gene expression for spatial transcriptomics prediction
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf425
PMID:40825238
|
研究论文 | 开发了一种名为Reg2ST的深度学习模型，用于从基因表达中识别潜在模式并进行空间转录组学预测 | 提出了一种新颖的方法来捕获spots之间的关系，而不是使用K-最近邻方法；采用对比学习最小化空间转录组学和病理图像之间的距离 | NA | 解决现有空间转录组学预测方法存在的问题，提高预测性能 | 人类乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌,皮肤鳞状细胞癌 | 空间转录组学,深度学习 | 对比学习 | 基因表达数据,病理图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-05 |
Advances in Collateral Neuroimaging for Acute Ischemic Stroke: Redefining Time and Tissue Windows in the Reperfusion Era
2025 Jul-Aug, Journal of neuroimaging : official journal of the American Society of Neuroimaging
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jon.70079
PMID:40820581
|
综述 | 本文系统综述了急性缺血性卒中侧支循环神经影像学评估技术的最新进展及其在精准医疗中的应用 | 提出基于侧支循环状态重新定义缺血半暗带时间窗，整合多模态影像与分子影像技术实现精准评估 | 存在技术异质性、验证数据有限且缺乏标准化评估体系 | 探讨神经影像学技术在卒中侧支循环评估中的临床应用价值 | 急性缺血性卒中患者 | 医学影像 | 脑血管疾病 | CT血管成像、灌注成像、磁共振成像、PET成像、空间转录组学 | NA | 医学影像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-05 |
Diabetes-Kidney-Heart Continuum and Its Implication on Therapeutic Management
2025-Jul, Cureus
DOI:10.7759/cureus.88561
PMID:40861717
|
综述 | 本文系统阐述了2型糖尿病-肾脏-心脏连续体的病理机制、分期管理策略及新型诊疗方法 | 首次整合糖尿病-肾脏-心脏连续体的多阶段管理框架，并系统评估新型生物标志物与单细胞技术的临床应用价值 | 作为叙述性综述缺乏原始数据支持，未对纳入研究进行系统性质量评价 | 探讨糖尿病相关心肾并发症的连续发展机制及优化治疗策略 | 2型糖尿病患者的血管并发症（心血管疾病与慢性肾脏病） | 医学研究 | 糖尿病并发症 | 单细胞转录组测序，生物标志物检测 | NA | 临床研究数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-05 |
Barcoded monoclonal embryoids are a potential solution to confounding bottlenecks in mosaic organoid screens
2025-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655669
PMID:40475436
|
研究论文 | 本研究开发了条形码单克隆胚胎体技术，解决了嵌合体类器官筛选中因细胞瓶颈导致的统计效力不足和结果混淆问题 | 开发了可扩展的单克隆胚胎体协议，通过遗传条形码技术解决了嵌合体类器官筛选中细胞瓶颈导致的统计效力限制 | 研究仍处于概念验证阶段，需要在更广泛的遗传扰动和表型分析中进一步验证 | 解决嵌合体类器官遗传筛选中因细胞瓶颈导致的统计效力不足和结果不可重复性问题 | 小鼠胚胎干细胞和胚胎体 | 发育生物学 | NA | CRISPR筛选，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophages-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664370
PMID:40791434
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析臭氧暴露小鼠模型中肺泡巨噬细胞的转录组变化 | 首次在单细胞分辨率下揭示不同浓度臭氧暴露对肺泡巨噬细胞转录组的浓度依赖性影响 | 研究仅使用C57BL/6J雄性成年小鼠，样本多样性有限 | 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的分子响应机制 | C57BL/6J雄性成年小鼠的肺泡巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6J雄性成年小鼠，分为过滤空气组、1 ppm臭氧组和1.5 ppm臭氧组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-05 |
A hybrid 1DCNN-GRU deep learning framework for classifying caprine granulosa cell fertility potential using single-cell transcriptomics
2025-Jul, Veterinary world
IF:1.7Q2
DOI:10.14202/vetworld.2025.1922-1935
PMID:40926859
|
研究论文 | 开发混合1DCNN-GRU深度学习模型，利用单细胞转录组数据对山羊颗粒细胞生育潜力进行分类 | 首次将深度学习应用于山羊颗粒细胞的生育潜力分类，结合1DCNN和GRU的混合架构 | 需要在更大数据集和跨物种中进行进一步验证 | 开发基于单细胞转录组数据的颗粒细胞生育潜力分类方法 | 山羊颗粒细胞 | 机器学习 | 生殖疾病 | 单细胞RNA测序 | 1DCNN-GRU混合模型 | 基因表达数据 | 公开可用的单胎和多胎山羊scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-05 |
CREB drives acinar cells to ductal reprogramming and promotes pancreatic cancer progression in preclinical models of alcoholic pancreatitis
2025-Jul-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.05.574376
PMID:38903082
|
研究论文 | 本研究揭示了CREB在酒精性胰腺炎中驱动腺泡细胞向导管重编程并促进胰腺癌进展的机制 | 首次阐明CREB与致癌Kras在慢性炎症环境下协同促进胰腺癌进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究CREB在酒精性胰腺炎促进胰腺癌进展中的作用机制 | 遗传修饰小鼠模型（Ptf1aCreERTM/+;LSL-KrasG12D/+）和腺泡细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 磷酸激酶阵列, 定量PCR, 谱系追踪 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像, 蛋白质印迹数据 | 多种遗传背景的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of dup15q syndrome reveals developmental and postnatal molecular changes in autism
2025-Jul-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61184-4
PMID:40615364
|
研究论文 | 通过单细胞分析研究dup15q综合征在自闭症中的发育和出生后分子变化 | 首次结合皮质类器官和死后脑样本的单细胞测序，揭示dup15q综合征在胎儿期和青少年-成人期的细胞类型特异性分子变化 | 研究样本数量未明确说明，且依赖死后脑组织可能存在保存质量问题 | 研究dup15q综合征在自闭症发病机制中的分子基础 | dup15q患者来源的iPSCs皮质类器官和死后脑样本 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,基因共表达网络分析 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-05 |
scPlantLLM: A Foundation Model for Exploring Single-cell Expression Atlases in Plants
2025-Jul-11, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf024
PMID:40094454
|
研究论文 | 开发了一个名为scPlantLLM的Transformer基础模型，用于探索植物单细胞表达图谱 | 首个专门针对植物单细胞数据的Transformer基础模型，采用序列预训练策略，在零样本学习场景下达到0.91的准确率 | 目前主要应用于拟南芥数据集，在其他植物系统中的泛化能力有待验证 | 解决植物单细胞RNA测序数据中的批次整合、细胞类型注释和基因调控网络推断等挑战 | 植物单细胞表达数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞基因表达数据 | 数百万个植物单细胞数据点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-10-05 |
Obesity hinders the efficacy of adipose-derived stem cells for knee osteoarthritis by reducing the proportion of DPP4+ stem cells
2025-Jul-24, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szaf004
PMID:40913785
|
研究论文 | 本研究探讨肥胖如何通过减少DPP4+干细胞比例影响脂肪来源干细胞对膝骨关节炎的治疗效果 | 首次揭示肥胖通过改变脂肪来源干细胞亚群比例（特别是DPP4+细胞减少）影响其治疗效果的机制 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类患者中验证 | 探究肥胖对脂肪来源干细胞治疗骨关节炎疗效的影响机制 | 野生型和ob/ob肥胖小鼠的脂肪来源干细胞 | 干细胞治疗 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选, 组织学分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 行为数据, 组织学图像 | 野生型和肥胖小鼠的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-05 |
Synovial tissue atlas in juvenile idiopathic arthritis reveals pathogenic niches associated with disease severity
2025-Jul-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adt6050
PMID:40601776
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术构建了幼年特发性关节炎滑膜组织图谱，揭示了与疾病严重程度相关的致病微环境 | 首次在初治JIA患儿中建立滑膜组织细胞图谱，识别了与关节炎严重程度相关的空间组织微环境和特定细胞群体 | 样本来自疾病早期初治患者，可能无法代表所有JIA亚型或疾病阶段 | 解析幼年特发性关节炎滑膜组织的细胞组成和空间结构，指导靶向治疗 | 幼年特发性关节炎患儿的滑膜组织活检样本、滑液和外周血 | 数字病理学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫荧光图像 | 初治JIA患儿的滑膜组织活检样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-05 |
Clonal hematopoiesis is clonally unrelated to multiple myeloma and is associated with specific microenvironmental changes
2025-Jul-31, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026236
PMID:40112284
|
研究论文 | 本研究探讨了克隆造血与多发性骨髓瘤的克隆无关性及其对肿瘤微环境的特定影响 | 首次证明CHIP与MM克隆起源无关，并通过单细胞RNA测序揭示了CHIP阳性微环境的特异性改变 | 样本量有限（16例单细胞RNA测序），血红蛋白差异趋势未达统计学显著性 | 研究克隆造血在多发性骨髓瘤肿瘤微环境中的作用机制 | 106例多发性骨髓瘤患者（其中16例进行单细胞RNA测序） | 单细胞基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 106例患者（16例进行单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis unveils immune dysregulation and EBV-driven lymphoproliferative disorder in pediatric liver transplant recipients
2025-Jul, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2025.111309
PMID:40263002
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小儿肝移植受者中EB病毒驱动的淋巴增殖性疾病的免疫失调机制 | 首次在单细胞水平系统描绘PTLD患者的免疫微环境特征，揭示EBV感染特异性靶向记忆B细胞和浆细胞的机制 | 样本量有限，未涉及组织样本分析，未能验证功能性恢复策略 | 阐明小儿肝移植后EBV相关淋巴增殖性疾病的免疫病理机制 | 小儿肝移植受者外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 淋巴增殖性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四组人群：EBV阳性PTLD患者、EBV阳性非PTLD移植受者、EBV阴性移植受者、健康儿童 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Changes in Patient-Derived Glioma and U87 Glioblastoma Cell Cultures Infected with the Oncolytic Virus VV-GMCSF-Lact
2025-07-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26146983
PMID:40725231
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析溶瘤病毒VV-GMCSF-Lact感染人胶质瘤细胞后的转录组变化 | 首次在单细胞水平比较患者来源胶质瘤细胞、非恶性脑细胞和U87胶质母细胞瘤细胞对溶瘤病毒的转录反应 | 研究仅针对特定溶瘤病毒株VV-GMCSF-Lact，未与其他病毒疗法比较 | 探究溶瘤病毒治疗胶质瘤的细胞特异性反应机制 | 患者来源胶质瘤细胞、非恶性脑细胞、U87胶质母细胞瘤细胞系 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者来源胶质瘤细胞培养物和U87细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-09-06 |
Progress in the Application of Single-Cell Sequencing in Neoadjuvant Therapy for Esophageal Cancer
2025-Jul, Cureus
DOI:10.7759/cureus.89163
PMID:40895953
|
综述 | 本文探讨单细胞测序技术在食管癌新辅助治疗中的应用进展及其对肿瘤微环境和治疗策略的启示 | 提供了评估新辅助治疗有效性的新视角，并通过单细胞水平分析揭示个体细胞差异 | 未明确提及具体研究限制，但属于技术应用综述而非实证研究 | 推动食管癌新辅助治疗策略的优化和个性化治疗发展 | 食管癌肿瘤微环境及接受新辅助治疗的患者群体 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序（sc-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
[Buyang Huanwu Decoction targets PPARG/SPP1/CD44 signaling pathway: mechanisms of lipid dysregulation and treatment in idiopathic pulmonary fibrosis]
2025-Jul, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 本研究揭示补阳还五汤通过调控PPARG/SPP1/CD44信号通路改善特发性肺纤维化脂质代谢紊乱的机制 | 首次发现PPARG/SPP1/CD44通路在IPF脂质代谢中的核心调控作用，并阐明补阳还五汤通过该新机制发挥抗纤维化作用 | 研究主要基于动物模型，尚未进行临床验证 | 探究特发性肺纤维化中脂质代谢紊乱的调控机制及中药治疗作用 | 博来霉素诱导的特发性肺纤维化大鼠模型 | 生物医学研究 | 特发性肺纤维化 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 网络药理学, 分子对接, Western blot | 动物疾病模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 大鼠随机分为6组（对照组、模型组、吡非尼酮组及补阳还五汤低中高剂量组） | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
A human-specific enhancer fine-tunes radial glia potency and corticogenesis
2025-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09002-1
PMID:40369080
|
研究论文 | 本研究揭示了人类特异性增强子HARE5通过调控神经祖细胞增殖和神经发生能力来精细调节大脑皮层发育和连接 | 首次证明人类特异性增强子HARE5通过放大经典WNT信号通路调控神经祖细胞行为，促进大脑皮层扩张 | 研究主要依赖基因编辑动物模型和类器官，与真实人类大脑发育存在差异 | 探索人类加速区域HARs在物种特异性大脑皮层发育中的功能作用 | 基因编辑小鼠模型、灵长类模型、人类和黑猩猩神经祖细胞、皮层类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、基因组编辑、活体成像、谱系分析 | NA | 基因表达数据、成像数据、电生理数据 | 多种基因编辑动物模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
Setdb1 ablation in macrophages attenuates fibrosis in heart allografts
2025-Jul, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424534122
PMID:40553495
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了Setdb1通过调控巨噬细胞重编程在心脏移植物纤维化和肿瘤组织免疫排斥中的作用机制 | 首次发现Setdb1介导的组蛋白甲基化调控巨噬细胞重编程在纤维化形成中的关键作用，并揭示CCR2-Creb/Setdb1-FN1信号轴机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究巨噬细胞中Setdb1在纤维化形成中的作用机制及其治疗潜力 | 人类和小鼠心脏移植物、肿瘤组织中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠心脏移植物样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
NFATC3 enhances osteosarcoma progression by increasing PD-L1 and CXCL2 levels
2025-Jul-29, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02850-x
PMID:40728758
|
研究论文 | 本研究探讨了NFATC3基因通过增加PD-L1和CXCL2表达促进骨肉瘤进展的机制 | 首次揭示NFATC3通过调控PD-L1配体和炎症因子表达促进骨肉瘤进展，并发现其在肿瘤微环境T细胞和巨噬细胞中的高表达 | 研究主要基于细胞系实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究NFATC3基因在骨肉瘤中的表达及其对肿瘤进展的影响机制 | 骨肉瘤细胞系(143B、SJSA、HOS、MG63、MNNG)和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | qRT-PCR、单细胞测序、肿瘤细胞与巨噬细胞共培养系统 | 细胞系模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 5种骨肉瘤细胞系和多个骨肉瘤测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
Bi-allelic variants in POPDC2 cause an autosomal recessive syndrome presenting with cardiac conduction defects and hypertrophic cardiomyopathy
2025-Jul-03, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.04.016
PMID:40409267
|
研究论文 | 本研究证实POPDC2基因的双等位基因变异会导致常染色体隐性遗传的心脏综合征，表现为心脏传导缺陷和肥厚型心肌病 | 首次发现POPDC2基因变异与人类心脏传导疾病和肥厚型心肌病之间的因果关系，并阐明其通过cAMP结合能力受损影响TREK-1钾通道功能的机制 | 研究样本量较小（仅四个家系），肌肉活检未显示明显的肌病特征 | 探究POPDC2基因变异与心脏传导系统疾病和心肌病的关联机制 | 四个携带POPDC2双等位基因变异的家系患者及人类心脏组织 | 遗传学 | 心脏传导疾病和肥厚型心肌病 | 同源建模，体外电生理研究，单细胞RNA测序，群体遗传数据分析 | NA | 基因组数据，电生理数据，RNA测序数据 | 四个家系，超过100万人的群体遗传数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |