单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
881	2025-06-07	Single-cell RNA sequencing identifies cellular heterogeneity in endothelial and epithelial cells associated with nitrogen dioxide-induced acute lung injury 2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118385 PMID:40403690	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究了二氧化氮诱导的急性肺损伤中内皮细胞和上皮细胞的异质性变化	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了二氧化氮诱导的急性肺损伤中内皮细胞和上皮细胞的异质性变化，并发现了新的上皮细胞亚群Ly6a肺泡细胞	研究仅关注了内皮细胞和上皮细胞的变化，未涉及其他可能参与急性肺损伤的细胞类型	探究二氧化氮诱导的急性肺损伤的分子机制	内皮细胞和上皮细胞	数字病理学	急性肺损伤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量
882	2025-06-07	Characterizing microglial heterogeneity in autophagy impairment of Paraquat-induced Parkinson's disease-like neurodegeneration 2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118364 PMID:40403688	研究论文	本研究通过建立百草枯诱导的帕金森病样神经退行性变模型，利用单细胞RNA测序技术揭示了小胶质细胞在自噬障碍中的异质性及其在病理过程中的核心作用	首次在百草枯暴露背景下生成自噬的单细胞RNA测序图谱，发现小胶质细胞亚型在自噬调节中的异质性，并鉴定出一个自噬特异性小胶质细胞亚型	研究主要基于动物模型和体外细胞实验，结果向人类帕金森病的直接转化需要进一步验证	探究百草枯诱导的帕金森病样神经退行性变中自噬障碍的细胞异质性	百草枯诱导的帕金森病样神经退行性变模型中的小胶质细胞	神经退行性疾病研究	帕金森病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	百草枯诱导的PD样神经退行性变模型	转录组数据	未明确说明样本数量，使用动物模型和BV2细胞系
883	2025-06-07	Subacute dibutyl phthalate exposure impairs hepatic T cells and facilitates hepatitis B progression in mouse liver 2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118398 PMID:40440982	research paper	该研究探讨了亚急性邻苯二甲酸二丁酯（DBP）暴露如何通过损害肝脏T细胞功能促进乙型肝炎病毒（HBV）的进展	首次揭示了DBP通过驱动T细胞耗竭加剧HBV进展的机制，并提出了针对免疫耗竭的治疗策略	研究主要基于小鼠模型，人类流行病学数据的相关性分析尚未完全验证因果关系	探究亚急性DBP暴露对HBV进展的影响及其免疫调节机制	HBV感染患者和小鼠模型	免疫学	乙型肝炎	单细胞RNA测序、流式细胞术、共培养实验	小鼠模型	RNA测序数据、流式细胞数据、流行病学数据	HBV感染患者肝脏组织和小鼠模型
884	2025-06-06	Emergence of regulatory and matrix-producing stromal cells during adipogenic induction in human ceiling culture-derived preadipocytes 2025-Jul-22, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152012 PMID:40409116	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和表观遗传学分析，探讨了人类天花板培养来源的前脂肪细胞在脂肪生成诱导早期的转录组变化	首次在单细胞水平上揭示了人类原代培养的天花板培养来源前脂肪细胞的脂肪生成反应，并发现了ATOH8转录因子在脂肪生成中的新角色	研究仅关注早期转录组变化，未涉及长期分化结果	探究天花板培养来源前脂肪细胞在脂肪生成诱导下的细胞异质性	人类天花板培养来源的前脂肪细胞和脂肪来源干细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 表观遗传学分析	NA	RNA测序数据, 表观遗传数据	未明确说明样本数量的人类前脂肪细胞和脂肪来源干细胞
885	2025-06-06	CD105 blockade restores osimertinib sensitivity in drug-resistant EGFR-mutant non-small cell lung cancer 2025-Jul, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2025.101237 PMID:40090182	研究论文	本研究探讨了CD105在非小细胞肺癌中对EGFR靶向治疗耐药性的作用，并发现阻断CD105可以恢复对奥希替尼的敏感性	首次揭示了CD105在EGFR突变型非小细胞肺癌耐药性中的关键作用，并验证了CD105中和抗体carotuximab能够恢复耐药肿瘤对奥希替尼的敏感性	研究样本量相对较小（66例肿瘤样本），且主要基于细胞系和小鼠模型，需要进一步临床验证	探究CD105在EGFR突变型非小细胞肺癌耐药性中的作用机制并寻找克服耐药性的策略	非小细胞肺癌（NSCLC）患者肿瘤样本和EGFR突变型细胞系	肿瘤学	非小细胞肺癌	成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、ATAC测序、SCENITH分析	NA	基因表达数据、蛋白质组数据、代谢组数据	66例NSCLC肿瘤样本（其中44例有EGFR突变）和2种奥希替尼耐药EGFR突变细胞系
886	2025-06-06	Decoding Long-Distance Communication Under Mineral Stress: Advances in Vascular Signalling and Molecular Tools for Plant Resilience 2025-Jul, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.15475 PMID:40091594	综述	本文探讨了植物在矿物质缺乏条件下通过长距离信号传导机制维持矿物质稳态和优化生长的复杂机制	强调了维管组织在感知和传递矿物质缺乏信号中的关键作用，并介绍了利用TRAP-Seq、异种嫁接和单细胞RNA测序等分子工具揭示的长距离信号传导新方面	NA	探索植物在矿物质缺乏条件下的长距离信号传导机制及其在作物抗逆性和矿物质利用效率中的应用	植物	植物生物学	NA	TRAP-Seq、异种嫁接、单细胞RNA测序	NA	分子生物学数据	NA
887	2025-06-06	Single-cell RNA sequencing indicates AP-1 as a potential therapeutic target for autoimmune uveitis 2025-Jul, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2025.116945 PMID:40228638	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了AP-1在自身免疫性葡萄膜炎（EAU）发病机制中的关键作用，并探索了AP-1抑制作为潜在治疗策略的效果	首次通过单细胞RNA测序技术鉴定AP-1为EAU发病机制中的关键分子，并发现AP-1通过GM-CSF/IL-23反馈环路支持Th17细胞的致病性	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	探索自身免疫性葡萄膜炎（EAU）的发病机制并寻找潜在治疗靶点	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠的脾脏和颈部引流淋巴结（CDLNs）	生物医学研究	自身免疫性葡萄膜炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠模型	RNA测序数据	正常和EAU小鼠的脾脏和颈部引流淋巴结（CDLNs）样本
888	2025-06-05	RETRACTED: Deciphering the prognostic landscape of osteosarcoma: Integrating the roles of hippo pathway genes, programmed cell death, and the tumor immune microenvironment 2025-Jul, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24280 PMID:38622820	研究论文	本研究通过分析Hippo信号通路与肿瘤免疫微环境(TME)的相互作用，探讨了骨肉瘤的分子基础及其预后标志物	鉴定了131个与Hippo通路相关的基因，并从中筛选出8个关键基因(DLG5、WNT11等)与患者预后显著相关，揭示了免疫逃避模式与不良预后的关联	研究基于公共数据集(TARGET-OS和GTEx)，可能需要更多独立样本验证	探索骨肉瘤的分子机制及预后标志物	骨肉瘤患者样本及其转录组数据	数字病理学	骨肉瘤	转录组数据分析、单细胞测序	Cox回归分析、Kaplan-Meier生存分析	转录组数据	TARGET-OS数据集和GTEx对照样本
889	2025-06-05	RETRACTED: Single-cell transcriptome sequencing analysis reveals intra-tumor heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma 2025-Jul, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24243 PMID:38572681	研究论文	通过单细胞转录组测序分析揭示食管鳞状细胞癌的肿瘤内异质性	利用单细胞转录组测序技术深入探索食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境机制，并成功构建预后风险模型和筛选关键基因UPF3A	样本量相对较小，仅包括60个肿瘤样本和4个癌旁样本	研究食管鳞状细胞癌的致癌机制和潜在关键分子事件	食管鳞状细胞癌患者	数字病理学	食管鳞状细胞癌	单细胞转录组测序	LASSO分析	单细胞RNA测序数据	60个肿瘤样本和4个癌旁样本
890	2025-06-05	RETRACTED: Prediction of potential targets and toxicological insights of Astragalus in liver cancer based on network pharmacology: Integrating systems biology, drug interaction networks, and toxicological perspectives 2025-Jul, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24189 PMID:38476113	研究论文	本研究利用网络药理学探讨黄芪作为原发性肝癌新型治疗选择的潜力，揭示其分子和细胞机制	整合系统生物学、药物相互作用网络和毒理学视角，首次在单细胞分辨率下分析黄芪对肝癌的基因表达影响	研究结果需要进一步的体内实验验证	探索黄芪作为原发性肝癌治疗药物的潜在靶点和作用机制	黄芪及其活性成分对原发性肝癌细胞的影响	网络药理学	肝癌	scRNA-seq, UMAP, tSNE, 基因本体分析, KEGG通路分析, 基因集变异分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 分子对接	NA	基因表达数据, 单细胞RNA测序数据	处理组与对照组各20个基因表达变化, 15个独特的细胞簇, 9个MT1相关细胞亚群, 5个通过SingleR包指定的细胞亚群
891	2025-06-05	Understanding psoriatic disease at single-cell resolution: an update 2025-Jul-01, Current opinion in rheumatology IF:5.2Q1 DOI:10.1097/BOR.0000000000001085 PMID:40160177	综述	本文综述了单细胞技术在银屑病研究中的最新进展，包括单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学，揭示了银屑病的细胞多样性及其在疾病进展中的关键作用	利用单细胞技术和空间转录组学揭示了银屑病中免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞亚型的作用，以及代谢失调在慢性炎症中的关键性	NA	探讨单细胞技术在银屑病研究中的应用及其对精准治疗的潜在影响	银屑病中的免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学	NA	转录组数据	NA
892	2025-06-05	RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Sequencing Analysis Reveals Intra-Tumor Heterogeneity in Esophageal Squamous Cell Carcinoma 2025-Jul, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24542 PMID:40358431	撤稿声明	该文章因提交和同行评审过程存在问题，且作者未回应验证肿瘤样本和细胞系来源的要求而被撤稿	NA	提交和同行评审过程被破坏，且作者未验证样本来源	NA	NA	NA	食管鳞状细胞癌	单细胞转录组测序	NA	NA	NA
893	2025-06-04	Cell Fate Determination of the Potato Shoot Apex and Stolon Tips Revealed by Single-Cell Transcriptome Analysis 2025-Jul, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.15459 PMID:40095217	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示了马铃薯茎尖和匍匐茎尖的细胞命运决定机制	首次对马铃薯茎尖和匍匐茎尖进行单细胞RNA测序，揭示了23个不同的细胞簇及其转录差异，特别是激素相关基因的表达模式	NA	探究马铃薯茎尖和匍匐茎尖细胞在转录水平上的差异	马铃薯茎尖和匍匐茎尖的细胞	植物生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	NA
894	2025-06-04	The integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals the tumor microenvironment and spatial organization of testicular diffuse large B-cell lymphomas 2025-Jul, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101475 PMID:40453362	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了睾丸弥漫性大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境空间组织结构	首次揭示了睾丸弥漫性大B细胞淋巴瘤中耗竭CD8 T细胞和B细胞的空间分布特征，并发现抑制E2F和CREB可作为潜在治疗靶点	研究样本仅来自一名患者，可能限制结果的普遍适用性	解析睾丸弥漫性大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境空间组织结构并探索潜在治疗靶点	睾丸弥漫性大B细胞淋巴瘤(PT-DLBCL)患者的肿瘤组织	数字病理学	淋巴瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学, 染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)	NA	单细胞转录组数据, 空间转录组数据	来自1名PT-DLBCL患者的19,559个单细胞
895	2025-06-03	Decoding the corneal immune microenvironment in healthy and diabetic mice during corneal wound healing 2025-Jul, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2025.02.010 PMID:40023495	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术解析了健康和糖尿病小鼠角膜在稳态和伤口愈合过程中免疫细胞的转录变化	首次建立了健康和糖尿病小鼠角膜伤口愈合过程中免疫细胞的全面单细胞RNA测序转录组图谱	研究仅针对小鼠模型，尚未在人类样本中验证	探究糖尿病角膜病变(DK)中免疫微环境的变化机制	健康和糖尿病小鼠的角膜免疫细胞	生物医学	糖尿病角膜病变	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	转录组数据	健康和糖尿病小鼠的角膜样本
896	2025-06-03	Investigating the molecular mechanisms and clinical potential of APO+ endothelial cells associated with PANoptosis in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma using single-cell sequencing data 2025-Jul, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102402 PMID:40318262	研究论文	该研究利用单细胞RNA测序数据探索了肝细胞癌肿瘤微环境中与PANoptosis相关的APO+内皮细胞的分子机制及临床潜力	首次系统性地研究了PANoptosis在肝细胞癌肿瘤微环境中的细胞分布和功能，并揭示了APO+内皮细胞在改善预后和免疫治疗效果中的潜在机制	样本量相对较小（16例患者），且研究结果需要进一步的实验验证	探究PANoptosis在肝细胞癌肿瘤微环境中的具体功能和分子机制	肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	AUCell算法、CytoTRACE、scMetabolism	单细胞RNA测序数据	16例肝细胞癌患者的单细胞RNA测序样本
897	2025-05-30	Immune checkpoint inhibitor-associated pneumonitis: focus on diagnosis and underlying mechanisms 2025-Jul-01, Current opinion in pulmonary medicine IF:2.8Q2 DOI:10.1097/MCP.0000000000001175 PMID:40265506	review	本文综述了免疫检查点抑制剂（ICI）相关肺炎的诊断、风险因素和治疗策略，特别关注其潜在的病理生理机制	通过单细胞RNA测序和生物标志物（如自身抗体）的鉴定，增强了对ICI相关肺炎的理解，揭示了细胞介导和体液机制在病理生理中的作用	尽管皮质类固醇是治疗的一线药物，但类固醇难治性肺炎仍然常见且死亡率高	提供ICI相关肺炎的最新研究进展，以指导靶向治疗和未来研究方向	免疫检查点抑制剂（ICI）相关肺炎	NA	lung cancer	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
898	2025-05-27	Costunolide: Targeting endothelial cell PANoptosis to mitigate lung injury in acute pancreatitis mice 2025-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156767 PMID:40318531	research paper	本研究探讨了costunolide（COS）通过抑制内皮细胞PANoptosis来减轻急性胰腺炎（AP）小鼠肺损伤的治疗效果和机制	首次发现COS可作为新型ALDH2激活剂，通过抑制ZBP1介导的内皮细胞PANoptosis来治疗AP相关急性肺损伤（ALI），为AP相关ALI治疗提供了全新靶点	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未进行人体临床试验	探究COS对AP相关ALI的治疗效果及其分子机制	急性胰腺炎小鼠模型和人脐静脉内皮细胞	生物医学	急性胰腺炎和急性肺损伤	转录组测序、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接、分子动力学模拟、Western blot、ELISA	小鼠急性胰腺炎模型和体外内皮细胞损伤模型	基因表达数据、蛋白质数据	未明确说明具体样本数量，但涉及健康小鼠、AP模型小鼠和人脐静脉内皮细胞
899	2025-05-27	Single-cell RNA sequencing in the study of human retinal organoids 2025-Jul, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2025.110417 PMID:40320034	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类视网膜类器官研究中的应用及其在视网膜发育和疾病研究中的重要作用	scRNA-seq技术能够识别不同的细胞群体、揭示发育轨迹和视网膜疾病的分子特征，为视网膜神经发生、细胞多样性及退行性疾病的病理生理学提供了新见解	NA	探讨scRNA-seq在视网膜类器官研究中的应用及其对理解视网膜发育和疾病的贡献	人类视网膜类器官（ROs）	生物医学研究	视网膜退行性疾病	scRNA-seq, 空间转录组学, CRISPR筛选	NA	单细胞RNA测序数据	NA
900	2025-05-27	Calceolarioside B targets MMP12 in the tumor microenvironment to inhibit M2 macrophage polarization and suppress hepatocellular carcinoma progression 2025-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156805 PMID:40347889	研究论文	本研究探讨了Calceolarioside B通过靶向肿瘤微环境中的MMP12抑制M2巨噬细胞极化，从而抑制肝细胞癌进展的机制	首次发现Calceolarioside B作为MMP12的新型抑制剂，能够调节肿瘤微环境中的TAMs，为肝细胞癌治疗提供了新的靶向策略	研究主要基于小鼠模型和体外共培养系统，尚未在人体临床试验中验证	探究Calceolarioside B对肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的影响及其潜在靶点和调控机制	肝细胞癌（HCC）及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）	肿瘤免疫学	肝细胞癌	细胞热转移实验、小分子下拉实验、表面等离子体共振、单细胞RNA测序、TCGA数据分析	小鼠肝内移植HCC模型、巨噬细胞-HCC细胞共培养系统	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	NA