单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 820 篇文献，本页显示第 801 - 820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in the study of human retinal organoids
2025-Jul, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110417
PMID:40320034
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在人类视网膜类器官研究中的应用与进展 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学、CRISPR筛选等技术，深化对视网膜生物学的理解 | NA | 研究视网膜发育、细胞互作及疾病机制 | 人类视网膜类器官 | 单细胞组学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 802 | 2025-10-06 |
Calceolarioside B targets MMP12 in the tumor microenvironment to inhibit M2 macrophage polarization and suppress hepatocellular carcinoma progression
2025-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156805
PMID:40347889
|
研究论文 | 本研究揭示中药成分Calceolarioside B通过靶向MMP12抑制肿瘤相关巨噬细胞的M2极化，从而抑制肝细胞癌进展 | 首次发现Calceolarioside B是MMP12的新型抑制剂，并阐明其通过调节肿瘤微环境中巨噬细胞极化抑制肝癌的机制 | 主要基于小鼠模型和体外实验，尚未进行临床试验验证 | 探究Calceolarioside B对肝细胞癌肿瘤微环境中巨噬细胞的影响及其作用机制 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，细胞热位移分析，小分子下拉实验，表面等离子共振 | 小鼠肝内移植肝癌模型，巨噬细胞-肝癌细胞共培养系统 | 基因表达数据，蛋白质相互作用数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 803 | 2025-10-06 |
Ophiopogonin C protects against acute lung injury by fatal sepsis through pyroptosis macrophage
2025-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156698
PMID:40397999
|
研究论文 | 本研究揭示了麦冬皂苷C通过抑制巨噬细胞焦亡减轻致命性脓毒症引起的急性肺损伤的保护机制 | 首次发现麦冬皂苷C通过靶向DDX3X与NLRP3的相互作用抑制巨噬细胞焦亡，为脓毒症治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未进行临床试验验证 | 探究麦冬皂苷C对致命性脓毒症诱导的急性肺损伤的保护作用机制 | 小鼠模型、脓毒症患者单细胞数据、人外周血单个核细胞 | 分子生物学 | 脓毒症、急性肺损伤 | 单细胞RNA测序、分子对接模型、盲肠结扎穿孔模型 | 分子对接模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠模型（不同剂量组）、脓毒症患者单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 804 | 2025-10-06 |
Unraveling the immune activation mechanisms of DAMPs in coronary artery disease through transcriptomic and single-cell analyses
2025-Jul, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2025.156952
PMID:40306092
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研究论文 | 通过转录组学和单细胞分析揭示DAMPs在冠状动脉疾病中触发免疫激活的机制 | 首次结合转录组学和单细胞分析系统研究DAMPs在CAD中的免疫激活机制，发现P2RY14和IFIH1基因的显著表达差异 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证；样本来源和数量有限 | 探究损伤相关分子模式在冠状动脉疾病中触发免疫激活的分子机制 | 冠状动脉疾病患者的转录组和单细胞数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 差异表达分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自GSE202625、GSE242046和GSE159677数据集的样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 805 | 2025-10-06 |
Unveiling the spatiotemporal strategies of plants in response to biotic and abiotic stresses:A comprehensive review
2025-Jul, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109967
PMID:40315636
|
综述 | 本文全面评述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在研究植物响应生物与非生物胁迫的细胞层面策略中的应用 | 首次系统性地探讨了单细胞和空间转录组技术在植物环境胁迫研究中的整合应用，填补了该领域综述的空白 | 植物组织解离的技术挑战限制了单细胞技术在植物研究中的广泛应用 | 深入分析单细胞和空间转录组技术的发展、优势与局限，探索其在植物胁迫响应研究中的应用前景 | 植物细胞类型及其在胁迫条件下的响应机制 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学(ST) | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 806 | 2025-10-06 |
Spatial multi-omics analysis of metabolic heterogeneity in zebrafish exposed to microcystin-LR and its disinfection byproducts
2025-Jul-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2025.123599
PMID:40209558
|
研究论文 | 本研究采用空间多组学技术分析斑马鱼暴露于微囊藻毒素-LR及其消毒副产物后的代谢异质性 | 首次将空间多组学技术应用于环境污染物研究，整合代谢组学、空间代谢组学和空间转录组学，揭示污染物在器官层面的空间分布特征 | 研究仅针对斑马鱼模型，结果向其他物种的推广需要进一步验证 | 探究微囊藻毒素-LR及其消毒副产物对斑马鱼的生物效应和空间代谢异质性 | 斑马鱼 | 空间多组学 | 环境毒理学 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 807 | 2025-10-06 |
TransAnno-Net: A Deep Learning Framework for Accurate Cell Type Annotation of Mouse Lung Tissue Using Self-supervised Pretraining
2025-Jul, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108809
PMID:40315689
|
研究论文 | 提出一种基于自监督预训练和Transformer架构的深度学习框架，用于小鼠肺组织单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 采用自监督预训练策略，利用大量未标记数据预训练模型，仅需少量标记数据进行微调，显著降低标注成本并提高模型效率和可迁移性 | 主要针对小鼠肺组织数据，在其他组织或物种中的适用性需要进一步验证 | 开发高效准确的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 小鼠肺组织单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | 约100,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 808 | 2025-10-06 |
COL1A1-positive endothelial cells promote gastric cancer progression via the ANGPTL4-SDC4 axis driven by endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Jul-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217731
PMID:40254092
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现COL1A1阳性内皮细胞通过内皮-间质转化驱动的ANGPTL4-SDC4轴促进胃癌进展 | 首次在胃癌中鉴定出COL1A1阳性内皮细胞亚群，揭示其通过EndoMT过程促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仍需进一步扩展 | 探究内皮-间质转化在胃癌进展中的具体作用和机制 | 胃癌患者样本中的内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 细胞功能实验 | ssGSEA, Monocle2, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 97个胃癌样本（来自6个单细胞RNA测序队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 809 | 2025-10-06 |
Spatial lipidomics reveals sphingolipid metabolism as anti-fibrotic target in the liver
2025-Jul, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2025.156237
PMID:40127860
|
研究论文 | 本研究通过空间脂质组学等多组学技术揭示了鞘脂代谢在肝脏纤维化中的作用机制 | 首次结合空间脂质组学、转录组学和成像质谱流式技术，系统揭示了鞘脂代谢在肝纤维化中的细胞类型特异性机制 | 研究样本量有限，且动物模型与人类疾病存在差异 | 探索脂肪肝疾病中脂毒性机制和纤维化发生的分子基础 | SLD患者肝组织和3种小鼠模型，以及肝星状细胞和人类精准肝切片 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 空间脂质组学, bulk/spatial转录组学, 成像质谱流式, 单细胞RNA测序 | NA | 脂质组数据, 转录组数据, 图像数据 | SLD患者和3种小鼠模型的肝组织样本 | NA | 空间脂质组学, 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 | NA | NA |
| 810 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis reveals BAF complexes as immune-related biomarkers and validation in triple-negative breast cancer
2025-Jul-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123607
PMID:40194763
|
研究论文 | 通过泛癌分析揭示BAF复合物作为免疫相关生物标志物并在三阴性乳腺癌中进行验证 | 首次构建BAF复合物预后模型并发现ACTL6A在三阴性乳腺癌中作为免疫相关生物标志物和治疗靶点的双重作用 | NA | 解码特定BAF复合物在癌症病理、免疫和靶向治疗中的潜力 | 多种人类癌症，重点关注三阴性乳腺癌 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 预后模型，列线图 | 基因表达数据 | 来自TCGA、GEO和IMvigor210数据库的多组数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 811 | 2025-10-06 |
Fibroblast to macrophage-like cell transition in renal inflammatory injury through the MR/CSF1 pathway induced by aldosterone
2025-Jul-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123627
PMID:40216224
|
研究论文 | 本研究验证了醛固酮通过MR/CSF1通路诱导肾间质成纤维细胞向巨噬细胞样细胞转化的新机制 | 首次发现成纤维细胞可通过MR/CSF1信号通路转化为巨噬细胞样细胞，揭示了肾脏炎症损伤中巨噬细胞的新来源 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，临床样本验证相对有限 | 探究肾脏炎症损伤中巨噬细胞的新来源及其形成机制 | Wistar大鼠、大鼠肾间质成纤维细胞(RKF)、慢性肾脏病患者肾活检样本 | 病理生理学 | 慢性肾脏病 | 流式细胞术、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、图像数据 | Wistar大鼠分组研究、体外培养的肾间质成纤维细胞、慢性肾脏病患者肾活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 812 | 2025-10-07 |
Systems biology of Haemonchus contortus - Advancing biotechnology for parasitic nematode control
2025 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108567
PMID:40127743
|
综述 | 本文综述了捻转血矛线虫分子生物学研究的关键进展及其在寄生虫控制中的生物技术应用 | 整合基因组学、转录组学和蛋白质组学技术解析关键分子通路，并应用机器学习和人工智能工具增强基因功能注释能力 | NA | 推动寄生虫线虫控制的生物技术发展 | 捻转血矛线虫及其与宿主的相互作用 | 生物信息学 | 寄生虫感染 | 基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞测序, 空间转录组学 | 机器学习算法, 人工智能驱动的蛋白质结构预测 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 813 | 2025-10-07 |
Mitigation of ischemia/reperfusion injury via selenium nanoparticles: Suppression of STAT1 to inhibit cardiomyocyte oxidative stress and inflammation
2025-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究通过静脉注射模板法合成的球形硒纳米颗粒，探索其在心肌缺血/再灌注损伤中的保护作用及机制 | 首次发现球形硒纳米颗粒通过抑制STAT1信号通路，打破STAT1-ROS循环，从而减轻心肌细胞氧化应激和炎症反应 | NA | 开发新型纳米材料治疗心肌缺血/再灌注损伤 | 心肌细胞、巨噬细胞 | 纳米医学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 测序数据、功能指标 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 814 | 2025-10-07 |
scCorrect: Cross-modality label transfer from scRNA-seq to scATAC-seq using domain adaptation
2025-Jul, Analytical biochemistry
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.ab.2025.115847
PMID:40154828
|
研究论文 | 提出一种跨模态标签转移方法scCorrect，通过域适应技术将scRNA-seq的细胞类型注释转移到scATAC-seq数据 | 开发了包含两个阶段的新型神经网络框架，第一阶段对齐数据集生成初始注释，第二阶段通过校正网络修正错误注释 | 未提及具体的数据集规模限制或计算资源需求 | 解决scATAC-seq数据中细胞类型注释的挑战，提高注释准确性 | 单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 神经网络, 域适应 | 单细胞测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 815 | 2025-10-07 |
Macrophage polarization-mediated PKM2/mTORC1/YME1L signaling pathway activation in fibrosis associated with Cardiorenal syndrome
2025-Jul, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111664
PMID:39961408
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞极化通过PKM2/mTORC1/YME1L信号通路促进心肾综合征相关肾纤维化的机制 | 首次发现HIF-1α诱导的M1巨噬细胞极化通过PKM2/mTORC1/YME1L信号轴驱动肾纤维化 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究心肾综合征中肾纤维化的分子机制 | 心肾综合征相关的肾纤维化过程 | 单细胞生物学 | 心肾综合征 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, 慢病毒载体, 免疫浸润分析, 伪时间分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织学图像 | CRS小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 816 | 2025-10-07 |
Identification of potential biomarkers in cardiovascular calcification based on bioinformatics combined with single-cell RNA-seq and multiple machine learning analysis
2025-Jul, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111705
PMID:40024421
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研究论文 | 本研究通过生物信息学结合单细胞RNA测序和多种机器学习方法，识别心血管钙化的潜在生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序与多种机器学习方法识别心血管钙化相关生物标志物，并通过孟德尔随机化分析验证其与冠状动脉钙化的因果关系 | 研究主要基于公共数据库分析，需要更多实验验证 | 探索血管钙化的分子和遗传机制，识别诊断性生物标志物 | 巨噬细胞中的钙化标志物相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 孟德尔随机化分析, ELISA, 免疫组化 | 多种机器学习方法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个数据集(GSE104140, GSE235995, GSE159677), ApoE-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 817 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals B cell dynamics and osteoclast activation in Talaromycosis-related bone destruction
2025-Jul, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111708
PMID:40032159
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示马尔尼菲篮状菌感染引起的B细胞动态变化和破骨细胞活化在骨破坏中的作用机制 | 首次在马尔尼菲篮状菌感染模型中应用单细胞RNA测序技术分析B细胞组成变化，并揭示其通过氧化磷酸化过程影响骨破坏的新机制 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；机制研究主要集中于MAPK通路，可能存在其他未探索的调控途径 | 探索马尔尼菲篮状菌感染引起的骨破坏变化及其潜在分子机制 | 小鼠胫骨骨髓细胞，特别是B细胞和破骨细胞 | 单细胞组学 | 真菌感染相关骨病 | 单细胞RNA测序，Micro CT，流式细胞术，qRT-PCR，Western blot，免疫荧光，酶联免疫吸附试验 | NA | 单细胞RNA测序数据，影像数据，蛋白质数据 | 小鼠胫骨骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 818 | 2025-10-07 |
Therapeutic potential of Da Cheng Qi Decoction and its ingredients in regulating ferroptosis via the NOX2-GPX4 signaling pathway to alleviate and predict severe acute pancreatitis
2025-Jul, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111733
PMID:40081545
|
研究论文 | 本研究探讨大承气汤及其成分通过NOX2-GPX4信号通路调控铁死亡对重症急性胰腺炎的治疗潜力 | 首次揭示大承气汤通过NOX2/GPX4通路抑制铁死亡的治疗机制，并建立基于铁死亡相关基因的预测模型 | 样本量相对有限，需要更大规模临床验证 | 阐明大承气汤对重症急性胰腺炎的保护作用机制并建立风险预测模型 | 重症急性胰腺炎患者、胰腺腺泡细胞、小鼠模型 | 生物医学研究 | 急性胰腺炎 | 微阵列分析、机器学习、单细胞RNA测序、HPLC分析 | LASSO回归、机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 32名健康对照和87名急性胰腺炎患者 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列分析 | NA | NA |
| 819 | 2025-10-07 |
OTUB1 promotes glioma progression by stabilizing TRAF4
2025-Jul, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111704
PMID:40090557
|
研究论文 | 本研究揭示了OTUB1通过稳定TRAF4促进胶质瘤进展的分子机制 | 首次发现OTUB1通过抑制TRAF4泛素化来稳定TRAF4，从而促进胶质瘤细胞增殖和侵袭 | 样本量相对有限（12例患者），需要更大规模研究验证 | 探讨OTUB1在胶质瘤中的功能作用及其对TRAF4稳定性的影响，寻找潜在治疗靶点 | 胶质瘤组织、LN229和U87MG胶质瘤细胞系、裸鼠异种移植模型 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | 单细胞测序、Western blot、qPCR、免疫共沉淀、泛素化检测 | NA | 单细胞测序数据、蛋白质印迹数据、基因表达数据 | 12例胶质瘤患者的20,145个胶质瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 820 | 2025-10-07 |
Fibroblast-derived versican exacerbates periodontitis progression by regulating macrophage migration and inflammatory cytokine secretion
2025-Jul, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111755
PMID:40112905
|
研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞来源的versican通过调控巨噬细胞迁移和炎症因子分泌加剧牙周炎进展的机制 | 首次明确versican在牙周炎中主要由成纤维细胞产生，并系统阐明其通过激活MAPK通路促进巨噬细胞M1极化的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床验证不足；机制研究尚未涉及其他潜在信号通路 | 探究versican在牙周炎发病过程中的分子机制和病理作用 | 牙周炎相关细胞（成纤维细胞、巨噬细胞）及动物模型 | 分子生物学 | 牙周炎 | RNA测序，单细胞RNA测序，qRT-PCR，免疫组织化学，免疫荧光 | 细胞共培养模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据，细胞功能数据 | 未明确具体样本数量 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |