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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-10-06 |
stDGAC: A novel identifying spatial domains method via graph attention contrastive network for spatial transcriptomics data
2025-Jul, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110280
PMID:40403639
|
研究论文 | 提出了一种名为stDGAC的新型空间域识别方法,通过图注意力对比网络分析空间转录组数据 | 联合使用去噪自编码器和图注意力对比网络,能够聚合空间上下文邻域信息并获得更鲁棒的表征 | NA | 更准确地识别空间转录组数据中的空间域 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 去噪自编码器, 图注意力对比网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 782 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data with artificial intelligence to decipher the role of tumor-infiltrating lymphocytes in tumor immunotherapy
2025-Jul, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156035
PMID:40435910
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综述 | 本文综述了人工智能在肿瘤浸润淋巴细胞评估中的应用进展及其临床价值 | 整合多组学数据与人工智能技术,系统阐述AI在TILs自动识别、定量分析、亚群识别和空间分布模式研究中的创新应用 | NA | 阐明肿瘤浸润淋巴细胞在肿瘤免疫治疗中的作用及其预后价值 | 肿瘤浸润淋巴细胞 | 医学影像分析 | 肿瘤 | 单细胞测序,多重免疫荧光,空间转录组学,多模态方法 | CNN | 图像 | NA | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 783 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing identifies cellular heterogeneity in endothelial and epithelial cells associated with nitrogen dioxide-induced acute lung injury
2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118385
PMID:40403690
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究二氧化氮诱导急性肺损伤中内皮细胞和上皮细胞的异质性变化 | 首次在二氧化氮诱导的急性肺损伤中鉴定出LRG1和UCP2在内皮细胞中显著上调,并发现新型Ly6a肺泡上皮细胞亚群 | 研究仅关注内皮和上皮细胞,未涉及其他可能参与急性肺损伤的细胞类型 | 探究二氧化氮诱导急性肺损伤的细胞分子机制 | 小鼠肺组织中的内皮细胞和上皮细胞 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 784 | 2025-10-06 |
Characterizing microglial heterogeneity in autophagy impairment of Paraquat-induced Parkinson's disease-like neurodegeneration
2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118364
PMID:40403688
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研究论文 | 本研究通过建立帕金森病样神经退行性病变模型,利用单细胞RNA测序技术揭示了百草枯暴露下小胶质细胞在自噬调控中的异质性特征 | 首次在百草枯暴露背景下生成自噬相关单细胞RNA测序图谱,识别出自噬特异性小胶质细胞亚型及其在帕金森病样神经退行性病变中的核心作用机制 | 研究主要基于动物模型和细胞系实验,在人类样本中的验证尚需进一步研究 | 探究百草枯诱导的帕金森病样神经退行性病变中小胶质细胞在自噬调控中的异质性作用 | 百草枯诱导的帕金森病样神经退行性病变模型中的脑细胞,特别是小胶质细胞亚型 | 单细胞转录组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 785 | 2025-10-06 |
Subacute dibutyl phthalate exposure impairs hepatic T cells and facilitates hepatitis B progression in mouse liver
2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118398
PMID:40440982
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研究论文 | 本研究揭示亚急性邻苯二甲酸二丁酯暴露通过耗竭肝T细胞和诱导功能耗竭加剧乙型肝炎病毒进展 | 首次发现DBP是HBV感染者肝组织中的主要PAE污染物,并阐明亚急性DBP暴露通过驱动T细胞耗竭破坏肝脏免疫微环境的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据主要来自流行病学关联分析,缺乏直接机制验证 | 探究亚急性邻苯二甲酸酯暴露对肝脏免疫微环境和乙型肝炎病毒进展的影响 | HBV感染患者肝组织、小鼠模型、HBV携带小鼠 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 共培养实验, 流行病学分析 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 临床指标数据, 流行病学数据 | HBV感染患者肝组织、小鼠模型、流行病学人群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 786 | 2025-10-06 |
Emergence of regulatory and matrix-producing stromal cells during adipogenic induction in human ceiling culture-derived preadipocytes
2025-Jul-22, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152012
PMID:40409116
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和表观遗传分析研究人源天花板培养来源前脂肪细胞在脂肪生成诱导早期的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示ccdPAs对脂肪生成诱导的异质性反应,发现ATOH8转录因子在ccdPAs中的特异性高表达 | 研究仅关注早期转录组变化,未涉及长期分化过程 | 探究人源前脂肪细胞在脂肪生成诱导过程中的细胞异质性和分子机制 | 人源天花板培养来源前脂肪细胞(ccdPAs)和脂肪来源干细胞(ASCs) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 表观遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | 人源ccdPAs和ASCs细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 787 | 2025-10-06 |
CD105 blockade restores osimertinib sensitivity in drug-resistant EGFR-mutant non-small cell lung cancer
2025-Jul, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2025.101237
PMID:40090182
|
研究论文 | 本研究探讨CD105在EGFR突变非小细胞肺癌中对奥希替尼耐药的作用机制 | 首次发现CD105阻断可恢复耐药EGFR突变非小细胞肺癌对奥希替尼的敏感性,并揭示其通过调节慢循环细胞群和代谢状态的机制 | 研究样本量有限(66例肿瘤样本),且主要依赖细胞系和小鼠模型验证 | 研究CD105在EGFR靶向治疗耐药中的作用机制 | 非小细胞肺癌肿瘤样本和EGFR突变细胞系 | 癌症生物学 | 非小细胞肺癌 | 成像质谱流式技术,单细胞RNA测序,ATAC测序,SCENITH代谢分析,质谱分析 | 细胞系模型,小鼠模型 | 图像,基因表达数据,表观遗传数据,代谢数据 | 66例NSCLC肿瘤样本(其中44例EGFR突变)和2种奥希替尼耐药EGFR突变细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,ATAC测序,代谢分析 | NA | NA |
| 788 | 2025-10-06 |
Decoding Long-Distance Communication Under Mineral Stress: Advances in Vascular Signalling and Molecular Tools for Plant Resilience
2025-Jul, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15475
PMID:40091594
|
综述 | 本文探讨植物在矿物质胁迫下通过维管组织进行长距离信号传导的机制及其对植物抗逆性的影响 | 系统阐述维管组织作为信号传导枢纽的新功能,并介绍TRAP-Seq、单细胞RNA测序等新型分子工具在揭示长距离信号传导机制中的应用 | 作为综述文章,未提供原始实验数据验证相关假设 | 解析植物在矿物质缺乏条件下的长距离信号传导网络及其调控机制 | 植物维管组织(特别是伴胞)及信号分子(植物激素、小RNA、蛋白质、小肽、移动mRNA等) | 植物生物学 | 矿物质缺乏胁迫 | TRAP-Seq, 异源嫁接, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 789 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing indicates AP-1 as a potential therapeutic target for autoimmune uveitis
2025-Jul, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.116945
PMID:40228638
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型,发现AP-1是疾病关键分子并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序揭示AP-1在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的关键作用,并发现其通过GM-CSF/IL-23反馈环路支持Th17细胞致病性 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探索自身免疫性葡萄膜炎的发病机制并寻找新的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的脾脏和颈引流淋巴结细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常和EAU小鼠的脾脏及颈引流淋巴结 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 790 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Deciphering the prognostic landscape of osteosarcoma: Integrating the roles of hippo pathway genes, programmed cell death, and the tumor immune microenvironment
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24280
PMID:38622820
|
研究论文 | 本研究通过整合Hippo通路基因、程序性细胞死亡和肿瘤免疫微环境,揭示骨肉瘤的预后特征 | 首次系统整合Hippo通路基因与肿瘤免疫微环境在骨肉瘤预后中的作用,并通过单细胞测序揭示细胞异质性 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 探索骨肉瘤的分子基础并识别预后生物标志物 | 骨肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 转录组分析, 单细胞测序 | Cox回归分析, 层次聚类, Kaplan-Meier分析 | 转录组数据 | TARGET-OS数据集和GTEx对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 791 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Single-cell transcriptome sequencing analysis reveals intra-tumor heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24243
PMID:38572681
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析揭示食管鳞状细胞癌的肿瘤内异质性 | 首次在食管鳞癌中应用单细胞转录组测序技术系统解析肿瘤微环境细胞组成和空间特征,并鉴定出关键基因UPF3A | 样本量相对有限(60个肿瘤样本和4个癌旁样本),研究结果需要更大样本验证 | 深入探究食管鳞癌的发病机制和关键分子事件 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | COX回归模型, LASSO分析 | 单细胞转录组数据 | 60个肿瘤样本和4个癌旁样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 792 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Prediction of potential targets and toxicological insights of Astragalus in liver cancer based on network pharmacology: Integrating systems biology, drug interaction networks, and toxicological perspectives
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24189
PMID:38476113
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学方法探讨黄芪在原发性肝癌治疗中的潜在靶点及其分子机制 | 整合系统生物学、单细胞分析和分子对接技术,首次在单细胞分辨率揭示黄芪对MT1E基因的调控作用及其细胞亚群特异性 | 研究主要基于计算预测和体外实验,缺乏临床验证数据 | 探索黄芪治疗原发性肝癌的分子靶点和作用机制 | 黄芪活性成分及其在肝癌细胞中的分子靶点 | 网络药理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 基因本体分析, KEGG通路分析, 基因集变异分析, 蛋白质相互作用网络, 分子对接, qPCR | UMAP, tSNE, SingleR | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 793 | 2025-10-06 |
Understanding psoriatic disease at single-cell resolution: an update
2025-Jul-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001085
PMID:40160177
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在银屑病研究中的最新进展,重点探讨了免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞在疾病中的作用机制 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示银屑病细胞多样性,发现IL-17/IL-36和PRSS3-F2R通路在成纤维细胞-角质形成细胞相互作用中的关键作用,以及代谢失调在慢性炎症中的新机制 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于已有研究进行总结分析 | 探讨单细胞技术在银屑病研究中的应用及其对疾病机制理解的贡献 | 银屑病患者皮肤组织中的免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 794 | 2025-10-06 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Sequencing Analysis Reveals Intra-Tumor Heterogeneity in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24542
PMID:40358431
|
撤稿声明 | 本文宣布撤回一篇关于食管鳞状细胞癌肿瘤内异质性的单细胞转录组测序研究论文 | NA | 论文基于受损的投稿和同行评审流程被接受,且作者未能验证肿瘤样本和细胞系的来源 | NA | 食管鳞状细胞癌 | NA | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 795 | 2025-10-06 |
Cell Fate Determination of the Potato Shoot Apex and Stolon Tips Revealed by Single-Cell Transcriptome Analysis
2025-Jul, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15459
PMID:40095217
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示马铃薯茎尖和匍匐茎尖端的细胞命运决定机制 | 首次构建马铃薯茎尖和匍匐茎尖端的单细胞转录图谱,鉴定23个细胞簇并发现激素相关基因的差异表达模式 | 研究仅限于转录组层面,未进行功能验证实验 | 探究马铃薯茎尖和匍匐茎尖端的转录差异及其发育机制 | 马铃薯茎尖和匍匐茎尖端的细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 796 | 2025-10-06 |
The integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals the tumor microenvironment and spatial organization of testicular diffuse large B-cell lymphomas
2025-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101475
PMID:40453362
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了睾丸弥漫性大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境空间组织结构 | 首次系统揭示睾丸DLBCL的肿瘤微环境空间架构,发现耗竭CD8 T细胞围绕肿瘤B细胞、巨噬细胞环绕耗竭T细胞的空间分布模式 | 仅基于单个患者样本,样本量有限,需要更多病例验证 | 解析睾丸弥漫性大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境组成和空间组织结构 | 睾丸弥漫性大B细胞淋巴瘤患者组织样本 | 空间转录组学 | 睾丸弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 19,559个单细胞,来自1例PT-DLBCL患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 797 | 2025-10-06 |
Decoding the corneal immune microenvironment in healthy and diabetic mice during corneal wound healing
2025-Jul, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2025.02.010
PMID:40023495
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术解析了健康与糖尿病小鼠角膜伤口愈合过程中免疫微环境的转录组变化 | 首次建立健康与糖尿病小鼠角膜伤口愈合过程中免疫细胞的全面单细胞转录组图谱 | 研究仅限于小鼠模型,机制研究仍需进一步深入验证 | 探究糖尿病角膜病变中免疫微环境的变化机制 | 糖尿病和健康对照小鼠的角膜免疫细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病角膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 糖尿病和健康对照小鼠角膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 798 | 2025-10-06 |
Investigating the molecular mechanisms and clinical potential of APO+ endothelial cells associated with PANoptosis in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma using single-cell sequencing data
2025-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102402
PMID:40318262
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据探索肝细胞癌肿瘤微环境中与PANoptosis相关的APO+内皮细胞的分子机制和临床潜力 | 首次系统性地在肝细胞癌肿瘤微环境中识别并表征了具有高PANoptosis评分的APO+内皮细胞亚群,并揭示了其通过调控HLA分子表达影响T细胞功能的潜在机制 | 样本量相对较小(16例患者),且研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证 | 探究PANoptosis在肝细胞癌肿瘤微环境中的具体功能和分子机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞,特别是APO+内皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,CCK8检测 | AUCell算法,CytoTRACE,scMetabolism | 单细胞RNA测序数据 | 16例肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 799 | 2025-10-06 |
Immune checkpoint inhibitor-associated pneumonitis: focus on diagnosis and underlying mechanisms
2025-Jul-01, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000001175
PMID:40265506
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综述 | 本文综述免疫检查点抑制剂相关肺炎的诊断、风险因素、治疗策略及其病理生理机制 | 重点关注支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序等新技术在揭示疾病机制中的应用 | NA | 更新对免疫检查点抑制剂相关肺炎的认识,特别关注其病理生理机制 | 免疫检查点抑制剂相关肺炎 | NA | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 800 | 2025-10-06 |
Costunolide: Targeting endothelial cell PANoptosis to mitigate lung injury in acute pancreatitis mice
2025-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156767
PMID:40318531
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研究论文 | 本研究探讨了木香烃内酯通过靶向内皮细胞PANoptosis缓解急性胰腺炎小鼠肺损伤的作用机制 | 首次发现木香烃内酯可作为新型ALDH2激活剂,通过抑制ZBP1介导的内皮细胞PANoptosis来治疗AP相关急性肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床转化价值需进一步验证 | 探究木香烃内酯对急性胰腺炎相关肺损伤的治疗效果及作用机制 | 急性胰腺炎小鼠模型和人脐静脉内皮细胞 | 生物医学 | 急性胰腺炎、急性肺损伤 | 单细胞RNA测序、转录组测序、孟德尔随机化、分子对接、分子动力学模拟、western blot、ELISA | 小鼠疾病模型、细胞模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、转录组测序 | NA | NA |