单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-07-14	Emerging Techniques of Translational Research in Immuno-Oncology: A Focus on Non-Small Cell Lung Cancer 2025-Jul-04, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17132244 PMID:40647543	综述	本文综述了免疫肿瘤学在非小细胞肺癌（NSCLC）中的新兴转化研究技术，重点介绍了诊断和治疗精度的提升	介绍了人工智能、液体活检、单细胞RNA测序和病理组学等新兴技术在NSCLC诊断和治疗中的应用	综述性质的文章，未涉及具体实验数据或样本量的详细分析	优化NSCLC的个性化治疗策略，提升诊断和治疗精度	非小细胞肺癌（NSCLC）及其肿瘤微环境（TME）	数字病理学	肺癌	人工智能、液体活检、单细胞RNA测序、病理组学	Machine Learning、Deep Learning	NA	NA
62	2025-07-14	Emerging Therapeutic Strategies Targeting GPX4-Mediated Ferroptosis in Head and Neck Cancer 2025-Jul-04, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26136452 PMID:40650229	综述	本文综述了靶向GPX4介导的铁死亡在头颈癌治疗中的新兴策略	探讨了GPX4的多方面调控机制及其在克服头颈癌治疗耐药性中的核心作用，并总结了预测铁死亡敏感性的新兴生物标志物	药物递送、毒性和耐药机制等挑战仍未解决	研究靶向GPX4介导的铁死亡作为克服头颈癌治疗耐药性的新策略	头颈癌（HNC）	肿瘤学	头颈癌	单细胞转录组学和空间转录组学	NA	NA	NA
63	2025-07-14	Bacterial ADP-heptose triggers stem cell regeneration in the intestinal epithelium following injury 2025-Jul-04, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2025.06.009 PMID:40651470	研究论文	研究揭示了细菌代谢物ADP-heptose通过ALPK1-TIFA信号通路在肠道上皮干细胞再生中的作用	首次发现ADP-heptose通过ALPK1-TIFA信号通路调控肠道干细胞再生，揭示了细菌代谢物在肠道损伤修复中的新机制	研究主要在小鼠模型中进行，人类肠道中的类似机制尚未验证	探究ALPK1-TIFA信号通路在肠道上皮干细胞再生中的作用机制	肠道上皮干细胞(ISCs)和再生干细胞(revSCs)	细胞生物学	肠道损伤	单细胞转录组学、谱系追踪实验	小鼠模型	基因表达数据	NA
64	2025-07-14	Single-cell RNA sequencing reveals the role of heat shock protein 90AA1 in Müller cell proliferation via the Necroptosis/MAPK pathway in diabetic retinopathy 2025-Jul-03, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2025.110508 PMID:40617280	研究论文	本研究探讨了热休克蛋白90AA1（HSP90AA1）在糖尿病视网膜病变（DR）中Müller细胞（MCs）增殖中的作用	通过单细胞RNA测序揭示了HSP90AA1通过坏死性凋亡/MAPK通路在糖尿病视网膜病变中Müller细胞增殖的新机制	样本量较小（4名糖尿病患者和2名非糖尿病患者）	研究糖尿病视网膜病变的细胞和分子机制	Müller细胞（MCs）	数字病理学	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	4名糖尿病患者和2名非糖尿病患者的视网膜样本
65	2025-07-14	TriCLFF: a multi-modal feature fusion framework using contrastive learning for spatial domain identification 2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbaf316 PMID:40639417	研究论文	提出了一种基于对比学习的多模态特征融合框架TriCLFF，用于有效整合空间关联、基因表达水平和组织学特征，以精确识别空间域	TriCLFF框架通过先进的特征融合机制，在空间域识别任务中表现出更高的准确性和鲁棒性，并能识别更细粒度的结构和未知基因表达模式	未明确提及具体局限性	开发一个多模态特征融合框架，以精确识别空间转录组学中的空间域	空间转录组学数据（包括空间关联、基因表达水平和组织学特征）	空间转录组学	乳腺癌	对比学习	TriCLFF	多模态数据（空间关联、基因表达、组织学特征）	四个数据集（小鼠大脑前部、小鼠嗅球、人类背外侧前额叶皮层和人类乳腺癌）
66	2025-07-14	Stratification of Hepatocellular Carcinoma Using N6-Methyladenosine 2025-Jul-02, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17132220 PMID:40647517	研究论文	本研究通过m6A相关基因构建了一个风险模型，用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗效果	首次利用m6A相关基因构建风险评分模型，并验证其在预测HCC患者预后和免疫治疗反应中的价值	研究样本量有限，且需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的可靠性	评估m6A相关基因在预测肝细胞癌患者总体生存和免疫治疗效果中的潜力	肝细胞癌(HCC)患者	生物信息学	肝细胞癌	转录组测序，单细胞RNA测序	LASSO Cox回归模型	基因表达数据	485例HCC患者(TCGA-LIHC和GSE76427数据集)
67	2025-07-14	Current Landscape of Preclinical Models for Pediatric Gliomas: Clinical Implications and Future Directions 2025-Jul-02, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17132221 PMID:40647519	综述	本文综述了儿童高级别胶质瘤（特别是弥漫性中线胶质瘤）的临床前模型研究进展及其临床意义	总结了最新的体外、离体和体内模型，包括患者来源的脑类器官、基因工程小鼠模型和特定区域中线类器官，以及利用CRISPR-Cas9等技术精确研究肿瘤起始、进展和治疗抵抗	未提及具体模型的局限性或现有技术的不足	推进儿童高级别胶质瘤的有效治疗研究	儿童高级别胶质瘤，特别是弥漫性中线胶质瘤	数字病理学	胶质瘤	CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序, 空间转录组学	GEMMs, 脑类器官	NA	NA
68	2025-07-14	Heterogeneous pericoerulear neurons tune arousal and exploratory behaviours 2025-Jul, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08952-w PMID:40335695	研究论文	本文研究了蓝斑核（LC）及其周围神经元在调节觉醒和探索行为中的作用	发现了LC树突场中转录、空间和功能多样化的GABA能神经元群体，这些神经元通过调节LC的放电模式来控制全局觉醒水平和相关行为	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚待验证	探索LC及其周围神经元如何调节觉醒和回避状态	小鼠的蓝斑核（LC）及其周围神经元	神经科学	神经精神疾病	病毒追踪、单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	基因表达数据、神经活动数据	NA
69	2025-07-14	A visual-omics foundation model to bridge histopathology with spatial transcriptomics 2025-Jul, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-025-02707-1 PMID:40442373	研究论文	本文提出了一种名为OmiCLIP的视觉-组学基础模型，旨在整合组织病理学与空间转录组学数据	开发了OmiCLIP模型，首次实现了组织病理学图像与转录组学数据的整合，并构建了Loki平台提供多种功能	未提及具体局限性	开发能够整合组织病理学图像与转录组学数据的计算方法	组织病理学图像和转录组学数据	数字病理学	NA	空间转录组学、单细胞RNA测序	OmiCLIP（视觉-组学基础模型）	图像、转录组数据	220万对组织图像和转录组数据，覆盖32个器官
70	2025-07-14	High-resolution transcriptome atlas of bladder cancer highlights the functional myeloid subsets in modulating immune microenvironment 2025-Jul, EBioMedicine IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105801 PMID:40561775	研究论文	该研究通过高分辨率转录组图谱揭示了膀胱癌中髓系细胞亚群的功能及其在调节免疫微环境中的作用	揭示了TREM2+巨噬细胞和CMA1+肥大细胞在膀胱癌组织中的代谢改变，并发现Trem2敲除可显著重编程肿瘤微环境并上调树突状细胞上的PD-L1表达	样本量较小（仅11例患者），且部分发现仍需进一步体内外实验验证	探究膀胱癌中髓系细胞亚群的免疫功能及其调控机制	膀胱癌患者的肿瘤组织和正常膀胱组织中的髓系免疫细胞	数字病理学	膀胱癌	单细胞转录组分析、密度梯度离心、体外培养和小鼠肿瘤模型	NA	转录组数据	11例膀胱癌患者的配对肿瘤和正常组织
71	2025-07-14	Combination antiretroviral therapy and MCL-1 inhibition mitigate HTLV-1 infection in vivo 2025-Jul-01, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2025.06.023 PMID:40645177	研究论文	本研究探讨了针对人类T细胞淋巴病毒1型C亚型（HTLV-1c）感染的预防和治疗药物	发现HTLV-1c疾病比HTLV-1a更具侵袭性，并验证了联合抗逆转录病毒治疗与MCL-1抑制在体内显著减少HTLV-1c传播和疾病进展的效果	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	开发针对HTLV-1c感染的有效治疗策略	人类T细胞淋巴病毒1型C亚型（HTLV-1c）	病毒学	病毒感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞内流式细胞术	人源化小鼠模型	基因表达数据、流式细胞数据	人源化小鼠模型
72	2025-07-13	Treg activation during allograft tolerance induction requires mitochondrial-induced TGFβ1 in type 1 conventional dendritic cells 2025-Jul-10, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI178960 PMID:40644411	研究论文	研究探讨了1型常规树突状细胞（cDC1）在实体器官同种异体移植耐受诱导中的作用及其分子机制	首次揭示了cDC1在移植耐受中的关键作用及其通过线粒体代谢诱导TGF-β1表达以促进抗原特异性调节性T细胞生成的分子机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探索延长同种异体移植物存活的策略	1型常规树突状细胞（cDC1）和CD4+CD25+FoxP3+ T细胞	免疫学	器官移植	单细胞RNA测序和代谢分析	小鼠模型	基因表达数据和代谢数据	NA
73	2025-07-13	Single-Cell Analysis of Alternative Splicing and Gene Regulatory Network Reveals Remarkable Expression and Regulation Dynamics During Human Early Embryonic Development 2025-Jul, FASEB bioAdvances IF:2.5Q3 DOI:10.1096/fba.2025-00075 PMID:40641848	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，系统研究了人类早期胚胎发育中的基因表达动态，包括可变剪接、异构体转换和基因调控网络	整合基因表达水平、可变剪接、异构体转换和基因调控网络，全面揭示人类早期胚胎发育中的基因动态特征	研究仅覆盖了E3到E7阶段的胚胎发育，未涉及更早期或更晚期的发育阶段	探究人类早期胚胎发育过程中的基因表达动态变化	人类早期胚胎（E3到E7阶段）	基因组学	NA	scRNA-seq	NA	RNA-seq数据	未明确提及具体样本数量，但涉及E3到E7阶段的胚胎
74	2025-07-13	Prognostic Value of TBC1D1 and Its Relationship With the Tumor Microenvironment in Pancreatic Cancer: A Study Based on Single-Cell Sequencing 2025-Jul, FASEB bioAdvances IF:2.5Q3 DOI:10.1096/fba.2025-00092 PMID:40641846	研究论文	本研究评估了TBC1D1在胰腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境的相关性	首次揭示了TBC1D1在胰腺癌中的独立预后作用及其通过调节肿瘤微环境促进癌症进展的机制	样本量相对较小（168例患者），且缺乏功能实验验证TBC1D1的具体作用机制	评估TBC1D1在胰腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境的关系	胰腺癌患者（168例）及其肿瘤组织	数字病理学	胰腺癌	免疫组织化学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据、单细胞测序数据	168例胰腺癌患者
75	2025-07-12	Lymphoma B cells remodel bone marrow stromal cells into extracellular matrix-producing cancer-associated fibroblasts 2025-Jul-22, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024015616 PMID:40305664	research paper	该研究揭示了淋巴瘤B细胞如何重塑骨髓基质细胞成为产生细胞外基质的癌症相关成纤维细胞	首次通过单细胞RNA测序鉴定了小鼠瘦素受体阳性骨髓基质细胞与恶性B细胞之间的双向交互作用，并揭示了其向人类ECM/TGFβ肌纤维母细胞样癌症相关成纤维细胞表型转化的机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本的验证仍需进一步研究	探究B细胞淋巴瘤中骨髓基质微环境重塑的动力学机制	滤泡性淋巴瘤患者的骨髓样本和淋巴瘤B细胞小鼠移植模型	肿瘤微环境研究	淋巴瘤	单细胞RNA测序	小鼠异种移植模型	基因表达数据	滤泡性淋巴瘤患者骨髓样本和小鼠模型
76	2025-07-12	Single-cell RNA-seq provides insight into the underdeveloped immune system of germ-free mice 2025-Jul-18, Zoological research IF:4.0Q1 DOI:10.24272/j.issn.2095-8137.2024.467 PMID:40640979	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究无菌小鼠免疫系统发育不全的机制	首次使用单细胞RNA测序技术全面分析无菌小鼠骨髓和外周血的免疫细胞，揭示了微生物缺失与免疫缺陷之间的分子机制	研究仅局限于小鼠模型，未在人类或其他动物模型中验证	阐明微生物群缺失导致免疫系统发育不全的分子机制	无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓和外周血细胞	免疫学	免疫缺陷	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓和外周血样本
77	2025-07-12	ATF3 Deficiency Exacerbates Ageing-Induced Atherosclerosis and Clinical Intervention Strategy 2025-Jul-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202502249 PMID:40641410	研究论文	本研究探讨了ATF3在血管平滑肌细胞衰老和动脉粥样硬化中的作用，并提出了潜在的临床干预策略	发现ATF3通过新型ATF3-ATG7扩增环路调控自噬，保护血管平滑肌细胞免受衰老影响，并重新利用特唑嗪(TZ)稳定ATF3作为治疗策略	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床应用的转化效果仍需进一步验证	识别血管平滑肌细胞衰老的调控因子并开发针对衰老相关动脉粥样硬化的临床干预措施	血管平滑肌细胞(VSMCs)和动脉粥样硬化	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞RNA测序、CUT&Tag-seq、RNA/蛋白质相互作用分析、m6A表观转录组分析、高通量虚拟筛选	SMC特异性ATF3敲除小鼠模型	单细胞RNA测序数据、蛋白质相互作用数据、表观转录组数据	人类动脉粥样硬化颈动脉样本和小鼠模型
78	2025-07-12	Androgen Receptor Governs Tip Cell Formation in Cerebrovascular Malformations 2025-Jul-11, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326471 PMID:40641462	research paper	该研究通过单细胞转录组分析揭示了雄激素受体（AR）在脑血管畸形中调控尖端细胞形成的新机制	发现了雄激素非依赖性的AR介导的内皮细胞出芽模式，为血管生成疾病的干预提供了新靶点	研究样本量相对较小（13例脑血管畸形样本和13例对照样本），且主要基于小鼠模型	探究脑血管畸形中异常血管稳态的调控机制	人类脑血管畸形样本（脑海绵状血管畸形和脑动静脉畸形）和基因修饰小鼠模型	血管生物学	脑血管畸形	单细胞转录组分析，基因敲除小鼠模型，药物干预实验	内皮特异性Pdcd10敲除小鼠和KrasG12D突变小鼠	单细胞RNA测序数据	26例（13例脑血管畸形样本和13例对照脑样本）
79	2025-07-12	Profiling the spatial architecture of multiple myeloma in human bone marrow trephine biopsy specimens with spatial transcriptomics 2025-Jul-11, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2025028896 PMID:40643106	研究论文	利用空间转录组学技术解析多发性骨髓瘤在人类骨髓活检标本中的空间结构	首次使用亚细胞空间转录组学技术对多发性骨髓瘤骨髓微环境中的基因表达进行高分辨率分析，揭示了恶性浆细胞亚群的空间分布及其与微环境的异质性关系	样本量相对较小（21例），且仅分析了新诊断的多发性骨髓瘤和癌前病变病例	探究多发性骨髓瘤骨髓微环境的细胞和分子特征	人类骨髓活检标本（包括健康、癌前病变和活动性骨髓瘤样本）	数字病理学	多发性骨髓瘤	空间转录组学	NA	空间基因表达数据	21例骨髓活检标本（7例癌前病变，10例新诊断多发性骨髓瘤，4例健康对照）
80	2025-07-12	Targeting the HNRNPA2B1/HDGF/PTN Axis to Overcome Radioresistance in Non-Small Cell Lung Cancer 2025-Jul-11, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1 DOI:10.1089/ars.2024.0808 PMID:40643435	研究论文	本研究探讨了非小细胞肺癌(NSCLC)中放射抗性的分子机制，重点关注HNRNPA2B1/HDGF/PTN信号通路及其在自噬依赖性铁死亡调控中的作用	揭示了HNRNPA2B1/HDGF/PTN通路通过影响自噬依赖性铁死亡促进放射抗性的新机制	研究主要基于细胞系和小鼠模型，尚未在临床患者中进行验证	探索克服非小细胞肺癌放射抗性的潜在治疗靶点	非小细胞肺癌细胞系和小鼠肿瘤模型	癌症生物学	肺癌	单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、生化染色、RT-qPCR、Western blot、MeRIP-qPCR	NA	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	放射抗性和放射敏感性肺癌细胞系及小鼠肿瘤模型