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当前共找到 845 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Statistical significance of clustering for count data
2025-Jul-03, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf120
PMID:40971569
|
研究论文 | 提出了一种用于评估计数数据聚类显著性的新方法SigClust-DEV | 开发了专门针对计数数据的聚类显著性评估方法，解决了传统SigClust方法在离散数据上统计效能不足的问题 | 未明确说明方法在极端稀疏计数数据或超大规模数据集上的性能表现 | 开发适用于计数数据的聚类显著性评估方法 | 计数数据，包括单细胞RNA测序数据和电子健康记录 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | SigClust-DEV | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-05 |
Identification and validation of mitochondrial ferroptosis and immune microenvironment-related hub biomarkers in liver cirrhosis by integrated bioinformatics analysis
2025 Jul-Sep, Science progress
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/00368504251380638
PMID:40966021
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定并验证了与肝硬化中线粒体铁死亡和免疫微环境相关的关键生物标志物 | 首次将线粒体铁死亡与免疫微环境结合，通过多组学数据分析鉴定肝硬化关键生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，需要进一步实验验证 | 鉴定肝硬化诊断和治疗的可靠生物标志物 | 肝硬化患者转录组数据 | 生物信息学 | 肝硬化 | 转录组测序,单细胞测序,免疫组化,分子对接 | LASSO回归,随机森林,WGCNA,机器学习 | 基因表达数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-10-05 |
Overexpression of high affinity Type I adenosine receptors promotes the growth of uterine leiomyomas
2025-Jul-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf025
PMID:40489662
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研究论文 | 本研究探讨I型腺苷受体(ADORA1)过表达在子宫肌瘤生长中的作用机制 | 首次发现ADORA1受体在子宫肌瘤中的过表达现象，并阐明其通过调控AKT1信号通路促进肿瘤生长的机制 | 研究样本来源未明确说明具体数量，机制研究主要基于体外实验 | 探究细胞外腺苷水平改变促进子宫肌瘤生长的分子机制 | 子宫肌瘤组织标本和原代培养细胞 | 分子病理学 | 子宫肌瘤 | RT-qPCR, western blot, 免疫组织化学, 单细胞转录组学, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-05 |
Comparing Xenium 5K and Visium HD data from identical tissue slide at a pathological perspective
2025-Jul-26, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03479-4
PMID:40713820
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研究论文 | 从病理学角度比较Xenium 5K和Visium HD在相同组织切片上的空间转录组数据 | 首次使用相同组织切片生成的公开肺数据集对两种高分辨率空间转录组技术进行真实技术比较，并结合详尽的病理学注释 | 研究基于公开数据集，可能受限于特定组织类型；主要关注肺组织，在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 比较Visium HD和Xenium-5K两种空间转录组技术的性能差异，为不同研究场景选择合适技术提供病理学依据 | 肺组织空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组技术 | 聚类算法 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium 5K, Visium HD | Visium HD（2µm分辨率，转录组范围覆盖），Xenium-5K（亚微米分辨率，靶向成像检测技术） |
| 65 | 2025-10-05 |
MuST: multiple-modality structure transformation for single-cell spatial transcriptomics
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf405
PMID:40874816
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研究论文 | 提出一种名为MuST的多模态结构转换方法，用于解决单细胞空间转录组学中的模态偏差问题 | 通过拓扑发现策略和拓扑融合损失函数学习内在局部结构，协调不同模态间的不一致性 | NA | 减轻空间转录组数据中模态偏差的不利影响，满足各种下游分析任务需求 | 单细胞空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 多模态数据（转录组、空间、形态学） | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-05 |
Integrating spatial transcriptomics and snRNA-seq data enhances differential gene expression analysis results of AD-related phenotypes
2025-Jul-10, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100447
PMID:40329537
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，增强阿尔茨海默病相关表型的差异基因表达分析能力 | 首次将空间转录组学与单核RNA测序数据整合，实现了皮层层次和细胞类型特异性的差异基因表达分析 | 空间转录组学数据样本量较小，分析仅限于背外侧前额叶皮层组织 | 增强阿尔茨海默病相关表型的空间信息差异基因表达分析能力 | 436个死后大脑的背外侧前额叶皮层组织中的约150万个细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 线性混合模型 | 基因表达数据 | 436个死后大脑的背外侧前额叶皮层组织 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-10-05 |
Foxp3+ Regulatory T Cells Restrain Th1 Response Shielding the Brain from Lethal Inflammatory Damage during Cryptococcal Meningoencephalitis
2025-Jul-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7142999/v1
PMID:40766255
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研究论文 | 本研究揭示了Foxp3+调节性T细胞在隐球菌性脑膜脑炎中通过抑制Th1反应保护大脑免受炎症损伤的机制 | 首次系统阐明Treg细胞在CNS感染中的神经保护作用，发现CCR8/CCL1轴是Treg向大脑募集的关键机制，并验证Treg增强疗法对生存率的改善效果 | Areg缺失未显示生存效应，其具体调控机制仍需进一步研究 | 探究调节性T细胞在隐球菌性脑膜脑炎中的免疫调节作用及神经保护机制 | 人类CM患者和小鼠CM模型中的调节性T细胞 | 免疫学 | 中枢神经系统感染 | scRNA-seq, 流式细胞术, NanoString分析 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 人类患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-05 |
Dermatopathological Challenges in Objectively Characterizing Immunotherapy Response in Mycosis Fungoides
2025-Jul-29, Dermatopathology (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/dermatopathology12030022
PMID:40843796
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综述 | 探讨蕈样肉芽肿免疫治疗反应客观评估的挑战与新兴解决方案 | 提出将黑色素瘤研究方法应用于蕈样肉芽肿的免疫治疗评估，并倡导采用多光谱成像和空间转录组学等新技术 | 缺乏统一的病理生物标志物，难以区分治疗过程中的反应性淋巴细胞与恶性淋巴细胞 | 改进蕈样肉芽肿免疫治疗反应的客观评估方法 | 蕈样肉芽肿（皮肤T细胞淋巴瘤）患者 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 多光谱成像，空间转录组学，高通量T细胞受体基因重排分析 | NA | 组织病理图像，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2025-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.24.665575
PMID:40777386
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研究论文 | 本研究通过空间转录组技术揭示了多氯联苯暴露对成年小鼠大脑功能和认知的分子影响 | 首次结合空间转录组学分析PCB暴露对多个脑区基因表达的影响，并发现其对血脑屏障完整性的破坏机制 | 研究仅使用成年雄性C57BL/6J小鼠，结果可能不适用于其他性别或年龄的动物 | 评估PCB暴露对大脑功能和认知的影响机制 | 成年雄性C57BL/6J小鼠 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多只成年雄性C57BL/6J小鼠（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-05 |
Impact of Cattle Breed in scRNA-Seq Reference on Muscle Fiber Type Deconvolution from Bulk RNA-Seq: A Comparison of Software Tools
2025-Jul-25, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech14030056
PMID:40843779
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研究论文 | 比较不同软件工具在使用不同牛品种scRNA-seq参考数据对肌肉纤维类型反卷积分析的影响 | 首次证明参考scRNA-seq数据中使用的牛品种会显著影响反卷积结果 | 仅研究晚期妊娠荷斯坦奶牛，未涵盖其他品种或生理状态 | 评估不同牛品种scRNA-seq参考数据对肌肉纤维类型反卷积分析的影响 | 晚期妊娠荷斯坦多产奶牛的肌肉组织 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | CIBERSORTx, Cellanneal, DeconvR-NNLS, DeconvR-RLM | RNA测序数据 | 使用Brahman和Wagyu牛品种的scRNA-seq参考数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2025-10-05 |
Integrated single-nuclei and spatial transcriptomic profiling of human sacrococcygeal teratomas reveals heterogeneity in cellular composition and X-chromosome inactivation
2025-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.21.665156
PMID:40777431
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研究论文 | 通过整合单核RNA测序和空间转录组技术分析人类骶尾部畸胎瘤，揭示细胞组成异质性和X染色体失活状态 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学分析SCTs，发现X染色体双等位基因表达与细胞身份特征的关联 | 样本量较小（仅8个肿瘤样本），未检测到预期的多能细胞群体 | 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层和性别偏好的分子机制 | 人类骶尾部畸胎瘤组织样本（6个产后和2个产前样本） | 单细胞组学 | 畸胎瘤 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间基因表达数据 | 8个骶尾部畸胎瘤样本（1例男性，7例女性） | NA | 单核RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-05 |
Mapping mesenchymal diversity in the developing human intestine and organoids
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.22.665939
PMID:40777494
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研究论文 | 构建人类小肠发育过程中间充质细胞多样性的空间图谱并用于评估肠道类器官 | 首次创建了覆盖人类肠道细胞类型多样性的定制Xenium空间转录组基因panel，揭示了发育过程中成纤维细胞群体的动态空间重塑 | 研究主要聚焦于发育中的间充质群体，其他细胞类型分析相对有限 | 解析人类肠道发育过程中间充质细胞的空间组织与多样性 | 发育中的人类小肠组织及多能干细胞衍生的肠道类器官 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间定位数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | Xenium | 定制Xenium空间转录组基因panel |
| 73 | 2025-10-05 |
Activation of IL-17+ ILC subsets in IL-18R-deficient mice during fungal allergen exposure
2025-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.17.665289
PMID:40777291
|
研究论文 | 本研究探讨IL-18受体缺陷小鼠在真菌过敏原暴露下ILC亚群中IL-17的激活机制 | 首次揭示IL-18信号通过抑制ILC2s产生IL-17A来调控肺部嗜酸性粒细胞增多 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究IL-18/IL-18R信号通路在肺部ILC2应答中的作用机制 | IL-18受体敲除小鼠和野生型对照小鼠的肺组织免疫细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序，细胞因子检测 | NA | 基因表达数据，细胞因子数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-05 |
ETS1 Orchestrates a Hybrid EMT Program Driving in vivo Metastasis and Immune Evasion
2025-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.17.665404
PMID:40777467
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了转录因子ETS1在上呼吸道鳞状细胞癌中协调混合上皮间质转化程序，驱动体内转移和免疫逃逸的双重作用 | 首次发现ETS1作为混合上皮间质转化程序的主调控因子，同时驱动肿瘤转移和免疫抑制，并鉴定出HSP90抑制剂作为针对ETS1高表达肿瘤的靶向治疗策略 | 研究主要聚焦于上呼吸道鳞状细胞癌，其他癌症类型的普适性需要进一步验证 | 探索上呼吸道鳞状细胞癌中转录异质性程序如何驱动肿瘤转移和免疫逃逸 | 上呼吸道鳞状细胞癌细胞和患者肿瘤组织 | 癌症生物学 | 上呼吸道鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个患者队列的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-05 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662625
PMID:40672304
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研究论文 | 提出了一种名为GatorST的空间转录组数据分析框架，通过图建模和对比元学习整合空间信息与转录组数据 | 结合图建模与对比元学习，同时捕获局部和全局空间上下文，采用伪标签弱监督和分集训练策略增强泛化能力 | 未明确说明框架的计算复杂度以及对不同空间分辨率的适应性 | 开发空间转录组数据分析框架以改善下游任务性能 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络,对比学习,元学习 | 空间基因表达数据 | 14个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-05 |
Motor learning drives region-specific transcriptomic remodeling in the motor cortex and dorsal striatum
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664268
PMID:40791319
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研究论文 | 本研究通过结合活动依赖性遗传标记和单细胞RNA测序，揭示了运动学习过程中运动皮层和背侧纹状体细胞类型特异性转录组重塑 | 首次构建了行为参与细胞的无偏倚、细胞类型分辨的转录组图谱，发现了Htr3a中间神经元在运动学习中的特异性招募 | 研究主要关注前肢够取任务，可能不适用于其他类型的运动学习 | 阐明运动学习相关的分子机制和突触回路重塑 | 小鼠运动皮层和背侧纹状体的神经元和胶质细胞 | 神经科学 | NA | 活动依赖性遗传标记(TRAP), 单细胞RNA测序, 双光子钙成像 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-10-05 |
Single-cell profiling of EZH2-mediated immune signaling perturbations in NSCLC
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.12.663845
PMID:40791397
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析EZH2抑制对非小细胞肺癌免疫信号的影响 | 首次在单细胞水平揭示EZH2抑制通过非甲基转移酶功能调节T细胞分化的新机制 | 研究主要基于计算分析，需要实验验证 | 探索EZH2抑制对肺癌肿瘤微环境免疫信号的影响 | 非小细胞肺癌肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2025-10-05 |
Cell type-specific master metabolic regulators of Alzheimer's disease
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664443
PMID:40791427
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研究论文 | 本研究开发了scFUMES算法，系统识别阿尔茨海默病中细胞类型特异性的主要代谢调控因子 | 开发了整合多组学数据的scFUMES算法，首次系统揭示AD中细胞类型特异性代谢调控网络 | 研究仅限于两个AD易感脑区，需要更广泛区域验证 | 识别阿尔茨海默病中细胞类型特异性的主要代谢调控因子 | 人类大脑组织中的神经元和小胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,相互作用组学,基因组学,转录组学,代谢组学 | scFUMES算法 | 多组学数据 | 来自人类大脑生物样本库的样本 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学整合分析 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-05 |
Gastruloid patterning reflects division of labor among biased stem cell clones
2025-Jul-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.12.664536
PMID:40791385
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和空间转录组学揭示了胚胎发育中细胞异质性通过干细胞克隆分工促进轴向模式形成的机制 | 发现预先存在的细胞异质性通过克隆分工促进发育精确性，而非传统认为需要最小化异质性 | 研究基于胃胚样体模型，可能不完全反映体内真实发育过程 | 探究细胞异质性在胚胎发育模式形成中的作用机制 | 胃胚样体模型中的干细胞克隆 | 发育生物学 | NA | 荧光谱系追踪, 空间转录组学, RNA-seq, ATAC-seq | NA | 空间基因表达数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 空间转录组学, RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 80 | 2025-10-05 |
Cellular basis for cortical network aging in primates
2025-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.08.663725
PMID:40672262
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研究论文 | 本研究通过整合皮层相似性网络与全脑空间转录组学，揭示了灵长类动物大脑皮层网络老化的细胞基础 | 首次将皮层相似性网络与全脑空间转录组学整合，在跨物种水平上揭示了大脑网络老化的细胞机制 | 样本数量相对有限（N=64），且研究主要聚焦于猕猴模型 | 探索灵长类动物大脑皮层网络老化的细胞基础 | 猕猴寿命队列（1-26岁，N=64） | 空间转录组学 | 老年疾病 | 空间转录组学，成像-转录组整合分析 | NA | 转录组数据，网络数据 | 64只猕猴（年龄1-26岁） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |