单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202507-202507] [清除筛选条件]
当前共找到 801 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-03-01
Integrated single-nuclei and spatial transcriptomic profiling of human sacrococcygeal teratomas reveals heterogeneity in cellular composition and X-chromosome inactivation
2025-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了人类骶尾部畸胎瘤的细胞组成异质性和X染色体失活状态 首次结合单核RNA-seq和空间转录组学分析SCTs,发现X染色体双等位基因表达与细胞身份和性别偏见的关联 样本量较小(仅8个肿瘤),且未检测到假定的多能细胞群 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层和性别偏见机制 人类骶尾部畸胎瘤组织样本 数字病理学 骶尾部畸胎瘤 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间数据 8个SCTs样本(6个产后,2个产前) NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
62 2026-02-26
Genetic deficiency of EXOSC10 ribonuclease disrupts spermatogenesis and male fertility in mice
2025-07, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究探讨了EXOSC10核糖核酸酶在小鼠雄性生殖细胞减数分裂中的关键作用,揭示其缺失导致精子发生障碍和雄性不育 首次在雄性生殖细胞中系统研究EXOSC10的功能,通过条件性敲除模型结合单细胞RNA测序技术,阐明其在减数分裂转录组调控中的新机制 研究仅限于小鼠模型,人类中的功能保守性尚未验证;单细胞测序样本量相对有限 探究EXOSC10核糖核酸酶在雄性生殖细胞减数分裂调控中的作用机制 小鼠雄性生殖细胞(特别是减数分裂前生殖细胞和精母细胞) 生殖生物学 男性不育症 条件性基因敲除、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及条件性敲除小鼠的生殖细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2026-02-11
Targeting IGF1-Induced Cellular Senescence to Rejuvenate Hair Follicle Aging
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究探讨了IGF-1信号通路通过诱导毛囊干细胞衰老来调控毛囊老化的机制,并提出了针对性的干预策略 首次在转基因小鼠模型中揭示了表皮过度表达IGF-1会直接导致毛囊干细胞衰老和毛囊早衰,并验证了通过调控下游通路或清除衰老细胞来逆转这一过程的可行性 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤中的机制验证尚需进一步临床研究 探究IGF-1信号通路在器官老化特别是毛囊衰老中的作用机制 小鼠皮肤组织、人类皮肤样本、转基因小鼠模型 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
64 2026-02-11
Pyrroloquinoline Quinone Reprograms the Single-Cell Landscape of Immune Aging in Hematopoietic Immune System
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了衰老对小鼠造血免疫系统的影响,并证明了抗氧化剂吡咯喹啉醌(PQQ)能够通过减轻氧化应激、逆转免疫衰老表型、恢复免疫稳态来改善免疫衰老 首次在单细胞分辨率下系统描绘了PQQ对衰老造血免疫系统的重编程作用,并鉴定了ASPP1、Yy1和CD62L等关键分子靶点,同时结合机器学习程序验证了PQQ的衰老细胞清除(senolytic)和衰老表型调节(senomorphic)效应 研究基于小鼠模型,其在人体中的效果和机制仍需进一步验证;单细胞测序仅聚焦于脾脏和骨髓细胞,未涵盖其他免疫器官或组织 探究衰老对造血免疫系统的影响,并评估抗氧化剂PQQ在改善免疫衰老、恢复免疫稳态方面的潜力 小鼠的脾脏和骨髓细胞 单细胞组学 免疫衰老 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习程序 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
65 2026-02-11
Deciphering Immunosenescence From Child to Frailty: Transcriptional Changes, Inflammation Dynamics, and Adaptive Immune Alterations
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过整合分析从儿童到衰弱老年人的PBMCs的bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,揭示了免疫衰老的转录组变化、炎症动态和适应性免疫改变 首次结合bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,全面描绘了从儿童到衰弱老年人PBMCs的免疫衰老动态变化,并识别了衰弱老年人特有的免疫细胞表型异常 研究仅基于PBMCs样本,可能无法完全反映组织特异性免疫变化;样本年龄跨度虽广,但未详细说明各年龄组样本量 探究年龄相关的免疫系统变化,特别是免疫衰老在健康衰老和衰弱状态中的机制 外周血单个核细胞(PBMCs) 生物信息学 老年疾病 RNA-seq NA 转录组数据 从儿童到衰弱老年人的PBMCs样本(具体数量未说明) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
66 2026-02-05
SPP1 + macrophages facilitate pancreatic cancer progression via ITGB6-mediated interactions: evidence from integrated multi-omics analysis and experimental validation
2025-Jul-28, Immunologic research IF:3.3Q3
研究论文 本研究通过整合多组学分析和实验验证,揭示了SPP1+巨噬细胞通过ITGB6介导的相互作用促进胰腺癌进展的机制 建立了基于基底膜相关基因的新型胰腺癌亚型分类和预后标志物,并首次在单细胞水平上描绘了肿瘤相关巨噬细胞的图谱,阐明了SPP1+巨噬细胞通过ITGB6介导的相互作用驱动肿瘤进展的新机制 研究主要基于公共数据库数据,实验验证可能受样本量限制,且机制研究集中在ITGB6,其他潜在分子通路有待进一步探索 探究基底膜和肿瘤相关巨噬细胞在胰腺癌进展中的作用机制,并开发预后预测模型 胰腺癌组织和细胞 生物信息学 胰腺癌 单细胞RNA测序,多组学分析,机器学习算法 LASSO,生存SVM RNA-seq数据,单细胞RNA-seq数据 来自公共数据库的胰腺癌队列数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
67 2026-02-05
The impact of neddylation on prognosis in the immune microenvironment of neuroblastoma: a single-cell transcriptomic analysis
2025-Jul-17, Immunologic research IF:3.3Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了neddylation在神经母细胞瘤免疫微环境中的预后影响,并建立了一个neddylation相关的预后特征 首次在神经母细胞瘤中结合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析,构建neddylation相关预后特征,并揭示其与免疫微环境及治疗响应的关联 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证来确认预后特征的普遍适用性 评估neddylation在神经母细胞瘤预后中的作用,并开发一个相关的预后特征以指导个性化治疗 神经母细胞瘤患者 数字病理学 神经母细胞瘤 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 单样本基因集富集分析 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 171,992个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
68 2026-01-30
Intestinal Bacteroides drives glioma progression by regulating CD8+ T cell tumor infiltration
2025-Jul-30, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究揭示了肠道微生物Bacteroides通过调节CD8+ T细胞肿瘤浸润驱动神经纤维瘤病1型相关低级别胶质瘤进展的机制 首次建立了肠道微生物Bacteroides与NF1-LGG病理生物学之间的机制性联系,并揭示了TGFβ介导的免疫调节通路 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 探究肠道微生物对神经纤维瘤病1型相关视路胶质瘤进展的影响机制 Nf1突变小鼠模型(Nf1OPG小鼠)的视路胶质瘤 肿瘤免疫学 神经胶质瘤 16S基因分型,单细胞RNA测序 NA 基因测序数据 使用Nf1OPG小鼠模型进行研究 NA 单细胞RNA测序 NA NA
69 2026-01-26
Clonal hematopoiesis is clonally unrelated to multiple myeloma and is associated with specific microenvironmental changes
2025-Jul-31, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究探讨了克隆造血与多发性骨髓瘤的共存关系及其对肿瘤微环境的影响 首次证明克隆造血与多发性骨髓瘤在诊断时频繁共存,且两者克隆起源无关,并通过单细胞RNA测序揭示了克隆造血阳性患者肿瘤微环境的显著变化 样本量相对较小(106例患者),且克隆造血与较低血红蛋白中位数的关联趋势不显著 研究克隆造血在多发性骨髓瘤肿瘤微环境中的修饰作用及其临床意义 多发性骨髓瘤患者 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 106例多发性骨髓瘤患者,其中16例进行了单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
70 2026-01-25
SETDB1 ensures the continuity of embryonic to adult neural stem cells through metabolic alterations in the dentate gyrus
2025-Jul-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了SETDB1通过调控代谢状态,确保胚胎神经祖细胞向成年神经干细胞(aNSCs)的连续性,防止其分化为星形胶质细胞 发现SETDB1通过靶向线粒体复合物成分COX6B2调控氧化磷酸化,从而控制aNSCs命运,防止星形胶质细胞分化 NA 探究胚胎神经祖细胞如何过渡为成年神经干细胞,同时避免星形胶质细胞命运,以维持aNSCs池 齿状回发育过程中的胚胎神经祖细胞和成年神经干细胞 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
71 2026-01-24
Integration of scRNA-seq and bulk tissue RNA-seq data to identify cancer-associated fibroblast-related gene RGMA as a potential treatment target for esophageal cancer
2025-Jul-11, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量组织RNA测序数据,识别出癌症相关成纤维细胞相关基因RGMA,并探讨其作为食管癌潜在治疗靶点的作用 首次结合scRNA-seq和WGCNA分析识别CAF相关基因RGMA,并验证其在食管癌中的抑癌功能及调控机制 研究主要基于公共数据集和细胞系实验,缺乏大规模临床样本验证,且体内实验模型有限 识别食管癌中癌症相关成纤维细胞的关键基因,探索其作为治疗靶点的潜力 食管癌组织、细胞系(ECA109)、癌症相关成纤维细胞(CAFs)和正常成纤维细胞(NFs) 生物信息学 食管癌 scRNA-seq, 批量RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, western blot, 体外和体内实验 NA 基因表达数据 TCGA-ESCA队列数据集和GSE196756 scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
72 2026-01-24
Palmitoylation Dynamics in Systemic Lupus Erythematosus: Multi-Omics Insights and Potential Therapeutic Implications
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了棕榈酰化在系统性红斑狼疮中的动态作用及其潜在治疗靶点 结合多组学数据、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,首次系统性鉴定了与SLE相关的棕榈酰化相关基因及因果代谢物 研究结果基于公共数据集GSE61635,需要进一步实验验证;样本来源和临床异质性可能影响结论的普适性 探究棕榈酰化在系统性红斑狼疮发病机制中的作用并识别潜在生物标志物和治疗靶点 系统性红斑狼疮患者与健康对照的基因表达数据及免疫细胞 生物信息学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型, 孟德尔随机化 机器学习模型 基因表达数据 基于公共数据集GSE61635,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
73 2026-01-24
Noncanonical Differentiation of Memory B Cells Drives Latent Tuberculosis Infection Reactivation Upon Tumor Necrosis Factor-Alpha Inhibitor Therapy: An Integrative Transcriptomic Study
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学分析,揭示了记忆B细胞在结核病进展和肿瘤坏死因子抑制剂治疗中的非经典分化轨迹及其代谢重编程作用 首次识别ROR1+记忆B细胞在结核病进展中的非经典分化轨迹,并发现其代谢重编程可能破坏免疫平衡,导致潜伏结核感染再激活 研究基于六个转录组数据集,样本量有限,且为回顾性分析,需进一步实验验证 探究肿瘤坏死因子抑制剂治疗中潜伏结核感染再激活的致病机制 记忆B细胞在结核病进展和肿瘤坏死因子抑制剂治疗中的转录变化 生物信息学 结核病 转录组分析、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 六个转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
74 2026-01-21
Spatia: Multimodal Model for Prediction and Generation of Spatial Cell Phenotypes
2025-Jul-07, ArXiv
PMID:40671942
研究论文 本文介绍了一种名为Spatia的多模态模型,用于预测和生成空间细胞表型,通过融合细胞形态、基因表达和空间上下文信息来学习统一表示 Spatia首次提出了一种多尺度生成和预测模型,能够整合图像衍生的形态标记和转录组向量标记,并通过跨注意力机制和Transformer模块在单细胞、生态位和组织水平上捕获空间依赖性,同时利用生成扩散解码器合成高分辨率细胞图像 NA 学习统一的、空间感知的表示,以整合细胞形态、基因表达和空间上下文,从而理解组织功能 细胞形态、基因表达和空间组织 数字病理学 NA 空间转录组学 Transformer, 生成扩散模型 图像, 基因表达数据 涉及49名捐赠者、17种组织类型和12种疾病状态,包括1700万个细胞-基因对、100万个生态位-基因对和1万个组织-基因对 NA 空间转录组学 NA NA
75 2026-01-20
Ex vivo model of functioning human lymph node reveals role for innate lymphocytes and stroma in response to vaccine adjuvant
2025-Jul-22, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文介绍了一种使用人淋巴结切片作为功能性模型系统,研究疫苗佐剂早期炎症反应的方法 开发了精确切割的人淋巴结切片作为保持组织结构完整的全器官模型系统,结合单细胞转录组学和多重成像技术,揭示了先天淋巴细胞和基质细胞在疫苗佐剂反应中的新作用 模型系统可能无法完全模拟体内复杂免疫环境,且研究聚焦于早期炎症反应,长期效应未涉及 研究人类免疫系统对疫苗佐剂的早期炎症反应机制 人淋巴结切片中的免疫细胞和基质细胞 免疫学 NA 单细胞转录组学,多重成像 NA 转录组数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
76 2026-01-18
Spatial Transcriptomics Advances the Use of Canine Patients in Cancer Research: Analysis of Osteosarcoma-Bearing Pet Dogs Enrolled in a Clinical Trial
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究首次将GeoMx犬类癌症图谱应用于骨肉瘤临床试验中犬类患者的预后相关样本,通过空间转录组学分析揭示了与疾病无进展间隔相关的基因和通路 首次在犬类骨肉瘤临床试验样本中应用GeoMx犬类癌症图谱进行空间转录组学分析,验证了犬类模型在人类癌症研究中的价值 样本量较小(n=16),仅基于疾病无进展间隔进行分组,可能未涵盖所有临床变量 利用犬类骨肉瘤模型研究人类骨肉瘤的分子机制和预后标志物 犬类骨肉瘤患者的原发性肿瘤组织样本 数字病理学 骨肉瘤 空间转录组学 NA 空间转录组数据 16个犬类骨肉瘤样本(高DFI组8个,低DFI组8个) NA 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler GeoMx犬类癌症图谱,用于福尔马林固定石蜡包埋组织的空间转录组分析
77 2026-01-17
Foxn3 is required to suppress aberrant ciliogenesis in nonphotoreceptor retinal neurons
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨了转录因子Foxn3在抑制视网膜非感光神经元中异常纤毛发生中的作用 首次揭示了Foxn3作为关键转录抑制因子,通过直接结合并抑制纤毛基因及其反式激活因子的启动子,来防止非感光神经元形成类似感光细胞的纤毛结构 研究主要基于小鼠模型,其在人类视网膜中的具体作用机制尚需进一步验证 探究视网膜细胞类型间纤毛结构差异的建立与维持机制 视网膜特异性条件性敲除(Foxn3CKO)小鼠的视网膜神经元,特别是双极细胞和无长突细胞 发育生物学 纤毛病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质分析、转录测定 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、电生理数据、染色质结合数据 Foxn3CKO小鼠及其对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
78 2026-01-17
Genomic and Single-Cell Analyses Characterize Patient-Derived Tumor Organoids to Enable Personalized Therapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源的肿瘤类器官,结合基因组和单细胞分析,揭示了肿瘤异质性、顺铂耐药机制,并识别了潜在治疗靶点 利用患者来源的肿瘤类器官模型,结合bulk和单细胞RNA测序,首次在类器官中表征了分子亚型和瘤内转录异质性,并发现了一种与顺铂耐药和不良预后相关的混合上皮-间质转化样程序,识别了amphiregulin作为关键调节因子 研究样本量相对较小(31例患者),且主要基于体外类器官模型,其体内生理环境模拟和长期临床验证仍需进一步研究 改善头颈部鳞状细胞癌的生物学理解并开发个性化疗法 头颈部鳞状细胞癌患者及其来源的肿瘤类器官 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 患者来源的肿瘤类器官模型 基因组数据, 转录组数据, 组织病理学数据 31例头颈部鳞状细胞癌患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
79 2026-01-15
CD36 promotes iron accumulation and dysfunction in CD8+ T cells via the p38-CEBPB-TfR1 axis in early-stage hepatocellular carcinoma
2025-07, Clinical and molecular hepatology IF:14.0Q1
研究论文 本研究揭示了CD36通过p38-CEBPB-TfR1轴促进早期肝细胞癌中CD8+ T细胞铁积累和功能障碍的新机制 首次发现CD36通过介导oxLDL-p38-CEBPB轴上调TfR1,导致CD8+ T细胞铁积累和功能障碍 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 探究早期肝细胞癌肿瘤微环境中CD8+ T细胞功能障碍的机制 早期肝细胞癌肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA RNA测序数据,流式细胞数据 小鼠肝细胞癌模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
80 2026-01-10
EDNRB2 regulates fate, migration, and maturation of hair cell precursors in regenerating avian auditory epithelium explants
2025-Jul-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生过程中对前体细胞命运、迁移和成熟的关键调控作用 首次发现EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生过程中特异性高表达,并系统阐明了其信号通路在毛细胞前体细胞命运决定、迁移和成熟中的调控机制 研究基于鸟类模型,其发现向哺乳动物(如人类)耳蜗的转化应用仍需进一步验证 揭示EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生中的具体作用机制 鸟类听觉上皮(基底乳头)的毛细胞前体细胞 发育生物学与再生医学 听力损失 单细胞RNA测序,RNA测序,组织学评估 NA 基因表达数据,组织学图像 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
回到顶部