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当前共找到 820 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-28 |
CROPseq-multi: a universal solution for multiplexed perturbation in high-content pooled CRISPR screens
2025-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.17.585235
PMID:38558968
|
研究论文 | 开发了一种名为CROPseq-multi的多重CRISPR筛选系统，用于在高质量集合筛选中实现通用多重扰动 | 开发了具有多功能读出兼容性的CROPseq-inspired慢病毒系统，支持单个和组合扰动，在条形码识别和扰动性能方面表现优异 | NA | 开发兼容多种筛选方法的多重CRISPR扰动系统 | CRISPR筛选系统和遗传扰动技术 | 基因编辑技术 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞RNA测序，光学集合筛选 | NA | 基因表达数据，条形码序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，光学集合筛选 | NA | NA |
| 62 | 2025-07-17 |
Unveiling new therapeutic targets for esophageal cancer treatment through single-cell transcriptomics: pH-responsive nanobubbles enhance the efficacy of 125I radiotherapy
2025-Jul-15, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03552-2
PMID:40665303
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2025-10-23 |
MerQuaCo: a computational tool for quality control in image-based spatial transcriptomics
2025-Jul-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.04.626766
PMID:39677693
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研究论文 | 开发用于图像空间转录组学数据质量控制的自动化计算工具MerQuaCo | 首个能够自动检测和量化空间转录组学数据缺陷的计算工具，无需人工输入 | 研究基于641个小鼠脑切片数据，主要针对Vizgen MERSCOPE平台 | 开发空间转录组学数据质量控制的自动化方法 | 641个新鲜冷冻成年小鼠脑切片 | 空间转录组学 | NA | 图像空间转录组学 | NA | 空间转录组图像数据 | 641个小鼠脑切片 | Vizgen | 空间转录组学 | MERSCOPE | Vizgen MERSCOPE平台 |
| 64 | 2025-10-22 |
Single cell RNA-sequencing reveals no evidence for meiotic sex chromosome inactivation in the threespine stickleback fish
2025-Jul-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.26.625488
PMID:39651240
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示三刺棘鱼在精子发生过程中不存在减数分裂性染色体失活现象 | 首次在三刺棘鱼中发现性染色体在减数分裂期间保持基因表达活性，未形成浓缩的性染色体小体，这与哺乳动物等物种的MSCI模式截然不同 | 研究仅针对三刺棘鱼一个物种，需要更多鱼类物种的验证来确认MSCI在硬骨鱼类中的保守性 | 探究三刺棘鱼在精子发生过程中是否存在减数分裂性染色体失活现象 | 三刺棘鱼的性染色体(X和Y染色体)及其在精子发生过程中的基因表达模式 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-10-21 |
Role of Dual Specificity Phosphatase 1 (DUSP1) in influencing inflammatory pathways in macrophages modulated by Borrelia burgdorferi lipoproteins
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.20.624562
PMID:39605372
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研究论文 | 本研究探讨双特异性磷酸酶1（DUSP1）在伯氏疏螺旋体脂蛋白调控巨噬细胞炎症通路中的作用机制 | 首次应用单细胞RNA测序和多组学方法系统解析脂蛋白诱导的巨噬细胞异质性反应，并发现DUSP1在早期炎症调控中的关键作用 | 研究仅使用小鼠骨髓来源巨噬细胞，未在人体细胞或动物模型中进行验证 | 阐明DUSP1在莱姆病病原体脂蛋白诱导的宿主免疫反应中的调控机制 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞（BMDMs） | 免疫学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-16 |
Joint representation and visualization of derailed cell states with Decipher
2025-Jul-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03682-8
PMID:40702544
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研究论文 | 提出一种名为Decipher的深度生成模型，用于整合单细胞基因组学数据并可视化正常与异常细胞状态间的转变 | 开发首个能联合建模和可视化正常与扰动单细胞RNA-seq数据中基因表达和细胞状态的深度生成模型 | NA | 开发计算工具以整合跨条件的单细胞基因组学数据并表征正常到异常细胞状态的转变 | 单细胞RNA测序数据中的细胞状态 | 机器学习 | 胰腺炎、急性髓系白血病、胃癌 | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-10-05 |
Snail1 as a key prognostic biomarker of cancer-associated fibroblasts in breast tumors
2025-07, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189316
PMID:40222423
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综述 | 本文总结了Snail1作为癌症相关成纤维细胞关键预后生物标志物在乳腺肿瘤中的作用 | 揭示了Snail1相关基因特征在CAFs中的预后潜力，并强调了表达Snail1的成纤维细胞的纤维化和免疫抑制作用 | 基于现有研究的综述性分析，缺乏原始实验数据验证 | 探讨CAF生物标志物在癌症预后中的价值，特别关注Snail1的作用 | 乳腺癌患者样本和小鼠模型中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2025-10-05 |
CXCL13 as a Prognostic Biomarker and Modulator of the Tumor Microenvironment in Colorectal Cancer
2025 Jul-Aug, Journal of digestive diseases
IF:2.3Q3
DOI:10.1111/1751-2980.70001
PMID:40804009
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研究论文 | 本研究探讨CXCL13作为预后生物标志物在结直肠癌肿瘤微环境中的作用 | 首次系统评估CXCL13在结直肠癌中的预后价值及其与CD8+T细胞的相互作用机制 | 研究基于多个独立队列但需要进一步实验验证CXCL13调控CD8+T细胞功能的具体机制 | 探究CXCL13对结直肠癌患者预后和肿瘤免疫微环境的影响 | 结直肠癌患者和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学,多重免疫组织化学,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,组织切片图像,单细胞测序数据 | 四个独立队列(包括TCGA队列和Renji医院队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-05 |
Increased inflammation as well as decreased endoplasmic reticulum stress and translation differentiate pancreatic islets from donors with pre-symptomatic stage 1 type 1 diabetes and non-diabetic donors
2025-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06417-3
PMID:40457096
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析比较了1型糖尿病前期患者与非糖尿病供体的胰岛蛋白表达差异 | 首次在人类胰岛中揭示1型糖尿病前期阶段的蛋白质组变化，发现免疫反应增强与内质网应激和蛋白质翻译减弱并存的新现象 | 样本量较小（n=3 vs n=3），供体间变异大，统计功效有限 | 识别1型糖尿病前期胰岛β细胞功能障碍的分子通路 | 来自器官捐献者的胰岛组织 | 蛋白质组学 | 1型糖尿病 | 激光显微切割，质谱蛋白质组学，无标记定量 | NA | 蛋白质组数据 | 3名多自身抗体阳性1型糖尿病前期患者与3名匹配的非糖尿病对照 | NA | 质谱蛋白质组学，单细胞RNA-seq | NA | 液相色谱-质谱联用技术 |
| 70 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling of bone metastasis ecosystems from multiple cancer types reveals convergent and divergent mechanisms of bone colonization
2025-Jul-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100888
PMID:40412393
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析多种癌症类型骨转移生态系统的异质性 | 首次在多种癌症类型的骨转移中识别出三种不同的生态系统原型，并发现骨转移原型与组织来源相关性较弱 | 样本量相对有限(42例骨转移样本)，需要更大规模研究验证 | 研究不同癌症类型骨转移生态系统的异质性和趋同机制 | 8种癌症类型的42例骨转移样本 | 单细胞组学 | 骨转移癌 | 单细胞RNA测序,免疫组化,生物信息学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织切片图像,批量RNA测序数据 | 42例骨转移样本(单细胞测序),158例骨转移样本(验证分析) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录omics | NA | NA |
| 71 | 2025-10-05 |
An Intrinsic-hoc Framework for Heterogeneous Cellular Senescence Elucidation Using Deep Graph Representation Learning and Experimental Validation
2025-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662364
PMID:40631080
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研究论文 | 提出一种基于深度图表示学习的框架DeepSAS，用于从单细胞RNA-seq数据中解析衰老细胞的异质性 | 开发了首个结合深度图表示学习和实验验证的本征框架，能够稳健地识别衰老细胞类型及其相关基因 | NA | 解析衰老细胞的异质性及其相关基因，增进对衰老和年龄相关疾病的理解 | 健康眼部细胞图谱和特发性肺纤维化数据集中的衰老细胞 | 机器学习 | 年龄相关疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 深度图表示学习 | 单细胞RNA-seq数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组学验证平台 |
| 72 | 2025-10-05 |
cp_measure: API-first feature extraction for image-based profiling workflows
2025-Jul-01, ArXiv
PMID:41019218
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研究论文 | 开发了一个名为cp_measure的Python库，用于从生物图像中提取特征以支持基于图像的细胞分析工作流 | 将CellProfiler的核心测量功能提取为模块化、API优先的工具，实现程序化特征提取 | NA | 开发适用于机器学习工作流的自动化、可重复图像分析工具 | 生物图像中的细胞和其他实体 | 计算机视觉 | NA | 图像分析，特征提取 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学，3D成像 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-05 |
From injury to recovery: Spatiotemporal dynamics of the visual pathway during spontaneous structural and functional regeneration after optic nerve transection in zebrafish
2025-07-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究系统揭示了斑马鱼视神经横断后视觉通路自发再生过程中的时空动态变化 | 首次在成年斑马鱼中系统描绘了从视网膜到视神经再到大脑的完整视觉通路再生时空动态，并建立了结构与功能恢复的关联 | 研究仅限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 阐明斑马鱼视觉系统自发再生的时空协调机制 | 成年斑马鱼的视觉通路（视网膜、视神经、大脑） | 神经科学 | 视神经损伤 | 苏木精-伊红染色,免疫组织化学,透射电子显微镜,单细胞RNA测序,视动反应行为评估 | NA | 组织切片图像,基因表达数据,行为数据 | 成年斑马鱼在5周时间内的系列观察 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq provides insight into the underdeveloped immune system of germ-free mice
2025-Jul-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无菌小鼠免疫系统发育不全的分子机制 | 首次使用液滴单细胞RNA测序系统比较无菌小鼠与特定病原体自由小鼠的免疫细胞差异，发现微生物缺失导致中性粒细胞凋亡增加和干扰素反应受损的新机制 | 研究主要聚焦于骨髓和外周血细胞，未涉及其他免疫器官；机制验证仍需进一步功能实验 | 探究微生物群缺失导致免疫系统发育不全的分子机制 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓及外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 免疫缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓及外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴单细胞RNA测序平台 |
| 75 | 2025-10-05 |
Phenotypic, transcriptomic, and genomic analyses reveal the spatiotemporal patterns and associated genes of coarse hair density in goats
2025-07-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了大足黑山羊粗毛密度的时空变化模式及其相关基因 | 创新应用高分辨率微型相机成像技术，结合转录组、基因组和单细胞RNA测序等多组学数据解析粗毛密度调控机制 | 研究主要聚焦于单一山羊品种，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究山羊粗毛密度的遗传调控机制和时空变化规律 | 大足黑山羊 | 基因组学 | NA | RNA-seq, 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹, 免疫组织化学染色 | NA | 图像, 转录组, 基因组 | 905张皮肤图像, 33个皮肤转录组, 272个全基因组序列, 182个下载转录组 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-05 |
CXCL12 Drives Reversible Fibroimmune Remodeling in Androgenetic Alopecia Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jul-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26146568
PMID:40724819
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CXCL12在雄激素性脱发中驱动可逆性纤维免疫重塑的作用机制 | 首次在雄激素性脱发模型中系统阐明CXCL12通过自分泌和旁分泌信号通路协调调控成纤维细胞和免疫细胞的核心作用 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明CXCL12在雄激素性脱发纤维免疫病理过程中的分子机制 | 睾酮诱导的雄激素性脱发小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2025-10-05 |
MORPH Predicts the Single-Cell Outcome of Genetic Perturbations Across Conditions and Data Modalities
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661992
PMID:40631143
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研究论文 | 提出MORPH框架用于预测单细胞水平上遗传扰动的响应结果 | 结合差异变分自编码器和注意力机制，能够预测未见过的扰动、扰动组合及新细胞环境中的扰动响应 | NA | 开发能够跨条件和数据模态预测遗传扰动单细胞结果的计算模型 | 单细胞对遗传扰动的响应 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学，成像技术 | 变分自编码器，注意力机制 | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2025-10-05 |
α7 nicotinic acetylcholine receptors regulate radial glia fate in the developing human cortex
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61167-5
PMID:40593693
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研究论文 | 本研究阐明了烟碱型乙酰胆碱受体在人类皮质发育过程中对放射状胶质细胞命运的调控机制 | 首次发现人类特异性CHRFAM7A亚基在放射状胶质细胞末端富集，并揭示YAP1作为nAChR信号通路下游关键效应分子 | 研究主要基于体外培养模型，需要进一步在体验证 | 探究产前尼古丁暴露影响人类皮质发育的细胞分子机制 | 人类皮质发育过程中的放射状胶质细胞和神经前体细胞 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序，器官型切片培养，分散细胞培养，基因敲降 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-05 |
A multi-omics approach reveals dysregulated TNF-related signaling pathways in circulating NK and T cell subsets of young children with autism
2025-Jul-30, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00349-z
PMID:40739030
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研究论文 | 通过多组学方法揭示自闭症幼儿外周血NK和T细胞亚群中TNF相关信号通路的失调 | 首次在阿拉伯幼儿自闭症队列中整合转录组、蛋白质组和单细胞RNA-seq数据，发现JAK3、CUL2和CARD11基因与症状严重度负相关，并鉴定出TRAIL、RANKL和TWEAK信号通路在特定免疫细胞中的失调 | 研究样本仅限于2-4岁阿拉伯儿童，结果可能受种族和年龄因素影响 | 探索自闭症谱系障碍中外周免疫失调的分子机制 | 自闭症幼儿（2-4岁）和匹配对照的外周血单个核细胞（PBMCs）及血浆样本 | 多组学分析 | 自闭症谱系障碍 | 转录组分析, 蛋白质组分析, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | 年轻阿拉伯自闭症儿童队列（2-4岁）及匹配对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析, 蛋白质组分析 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-05 |
Immune dysfunction during S. aureus biofilm-associated implant infections: opportunities for novel therapeutic strategies
2025-Jul-25, NPJ biofilms and microbiomes
IF:7.8Q1
DOI:10.1038/s41522-025-00782-y
PMID:40715142
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综述 | 探讨金黄色葡萄球菌生物膜感染引起的免疫功能障碍机制及新型治疗策略 | 结合最新细菌单细胞测序研究，揭示生物膜通过改变细菌代谢和毒素产生诱导免疫功能障碍的新机制 | NA | 分析金黄色葡萄球菌生物膜感染中免疫功能障碍的机制并探索治疗策略 | 金黄色葡萄球菌生物膜及宿主免疫系统 | 微生物免疫学 | 细菌感染性疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |