单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 799 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2025-10-06 |
Skeletal site-specific variations in myeloid cells: insights from single-cell RNA sequencing of the mandible and femur
2025-Jul, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf074
PMID:40486046
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较小鼠下颌骨和股骨骨髓中CD11b+髓系细胞的转录组差异 | 首次从单细胞水平揭示下颌骨来源的髓系细胞具有独特的炎症基因特征，并发现KLF4基因在下颌骨细胞分化中的特异性作用 | 研究仅使用2月龄C57BL/6小鼠，样本来源和年龄范围有限 | 探究不同骨骼部位（下颌骨与股骨）髓系细胞的转录组差异 | 2月龄C57BL/6小鼠下颌骨和股骨骨髓中的CD11b+髓系细胞 | 单细胞组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | C57BL/6小鼠下颌骨和股骨骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 742 | 2025-10-06 |
PRRX1 is a key regulator in the phenotypic transition between human normal dermal and keloid fibroblasts
2025-Jul, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.05.002
PMID:40517126
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研究论文 | 本研究通过比较人类胎儿皮肤、出生后皮肤和瘢痕疙瘩组织，探索了PRRX1在调控正常皮肤和瘢痕疙瘩成纤维细胞表型转换中的关键作用 | 首次发现PRRX1阳性成纤维细胞比例从胎儿皮肤到出生后皮肤再到瘢痕疙瘩逐渐增加，并验证了PRRX1在调控瘢痕形成中的关键作用 | 研究样本类型和数量有限，需要进一步扩大验证 | 探索影响伤口愈合结果的关键因素，寻找促进无瘢痕愈合的潜在治疗靶点 | 人类胎儿皮肤、出生后皮肤和瘢痕疙瘩组织 | 空间转录组学 | 皮肤瘢痕 | 空间转录组学、组织学成像、三维人类瘢痕疙瘩模型 | NA | 空间转录组数据、组织图像 | 人类胎儿皮肤、出生后皮肤和瘢痕疙瘩组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 743 | 2025-10-06 |
Identification of two molecularly and prognostically distinct subtypes in acral melanoma using network prediction method
2025-Jul, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.20335
PMID:39282977
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和网络预测方法识别了肢端黑色素瘤的两种分子和预后显著不同的亚型 | 首次使用网络预测方法识别肢端黑色素瘤的两种分子亚型，并发现具有高区分度的生物标志物组合 | 研究结果需要在不同队列中进行进一步验证 | 阐明肢端黑色素瘤的分子景观及其亚型与临床特征的相关性 | 肢端黑色素瘤患者样本 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析,网络预测算法 | 网络预测方法 | 单细胞RNA测序数据,临床样本数据 | 临床验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 744 | 2025-10-06 |
The human infertility single-cell testis atlas (HISTA): an interactive molecular scRNA-Seq reference of the human testis
2025-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13637
PMID:38577799
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研究论文 | 开发了一个名为HISTA的交互式单细胞RNA测序参考图谱，用于研究人类睾丸的基因表达 | 整合了来自多个供体、发育年龄和生育状态的单细胞RNA测序数据，创建了首个交互式人类睾丸分子图谱工具 | 数据集仅包含12个供者样本，样本量相对有限 | 构建人类睾丸单细胞转录组参考图谱，帮助科学家理解和研究人类精子发生过程 | 人类睾丸组织样本，包括健康成人对照、青少年和多种不孕症病例 | 生物信息学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | 12个供者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 745 | 2025-10-06 |
Applications of spatial transcriptomics in studying spermatogenesis
2025-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70043
PMID:40202007
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综述 | 探讨空间转录组学技术在研究生精过程中的应用价值 | 系统阐述空间转录组学如何突破单细胞测序技术丢失空间信息的局限，在组织原位解析基因表达空间模式 | 作为综述文章未涉及具体实验数据验证 | 阐明空间转录组学在研究生精细胞发育调控机制中的应用前景 | 哺乳动物睾丸组织 | 空间转录组学 | 男性不育症 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 746 | 2025-10-06 |
Superloaded Multiplexed scRNA-seq Data Preserves Primary Immune Cell Heterogeneity but Necessitates Stringent Doublet Removal
2025-Jul, Immunological investigations
IF:2.9Q3
DOI:10.1080/08820139.2025.2457039
PMID:39882751
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研究论文 | 比较超载和标准载入对单细胞RNA测序数据质量的影响，特别关注T细胞受体分析 | 首次系统评估超载对多路复用单细胞基因表达和T细胞受体数据的影响，并提出基于TCR配置的双联体去除方法 | 研究仅针对人类胸腺和血液样本，结果可能不适用于其他组织类型 | 评估超载对单细胞RNA测序数据质量的影响并优化双联体去除方法 | 人类胸腺和血液样本中的免疫细胞 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, T细胞受体序列数据 | 人类胸腺和血液样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 747 | 2025-10-06 |
The Role of Omics Techniques in Diabetic Wound Healing: Recent Insights into the Application of Single-Cell RNA Sequencing, Bulk RNA Sequencing, Spatial Transcriptomics, and Proteomics
2025-Jul, Advances in therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1007/s12325-025-03212-9
PMID:40381157
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综述 | 概述组学技术在糖尿病伤口愈合研究中的最新应用进展 | 系统整合单细胞RNA测序、空间转录组学等多种前沿组学技术在糖尿病足溃疡研究中的应用 | NA | 探讨组学技术对糖尿病足溃疡分子机制和治疗策略的研究进展 | 糖尿病足溃疡的临床前动物模型和人类临床研究 | NA | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 748 | 2025-10-06 |
Mucosal Macrophages Govern Intestinal Regeneration in Response to Injury
2025-Jul, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.01.252
PMID:40086603
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研究论文 | 本研究揭示了黏膜巨噬细胞在辐射损伤后通过分泌神经调节蛋白1和骨桥蛋白诱导肠道上皮细胞胎儿样重编程和增殖，从而驱动肠道再生的关键机制 | 首次发现巨噬细胞通过特定分泌因子直接调控肠道干细胞区室的再生程序，并证实该机制在人类细胞中具有保守性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限；巨噬细胞亚型的具体功能分化需要进一步解析 | 探究辐射性肠炎中肠道再生程序的激活机制 | 小鼠模型和人类肠道类器官 | 细胞生物学 | 辐射性肠炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 细胞谱系追踪, 细胞轨迹分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠模型和人类肠道类器官共培养体系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 749 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of proximal tubular cells with different DNA content reveals functional heterogeneity in the acute kidney injury to chronic kidney disease transition
2025-Jul, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.03.025
PMID:40268163
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同DNA含量的近端肾小管上皮细胞在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的功能异质性 | 首次揭示不同DNA含量（特别是多倍体细胞）的近端肾小管上皮细胞在AKI向CKD转变中的功能异质性及其促纤维化作用机制 | 研究仅关注缺血再灌注损伤模型，未验证其他AKI模型中的普适性 | 探究不同DNA含量的近端肾小管上皮细胞在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的功能异质性 | 急性肾损伤后不同DNA含量的近端肾小管上皮细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | AKI后第3天和第14天分离的近端肾小管上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 750 | 2025-10-06 |
A survey of the methodological process of modeling, inference, and evaluation of gene regulatory networks using scRNA-Seq data
2025-Jul, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105464
PMID:40409400
|
综述 | 本文系统探讨了使用单细胞RNA测序数据构建基因调控网络的方法学流程，包括建模、推断和评估环节 | 全面梳理了scRNA-Seq技术在基因调控网络推断中面临的方法学挑战，并通过比较计算实验提出更稳健的方法学流程建议 | 作为综述性文章，未提出新的推断算法，主要聚焦于方法学问题的系统分析 | 分析单细胞RNA测序数据在基因调控网络推断中的方法学挑战并提出改进建议 | 基因调控网络的建模、推断和评估方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 751 | 2025-10-06 |
TMEM55A-mediated PI5P signalling regulates alpha cell actin depolymerisation and glucagon secretion
2025-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06411-9
PMID:40140059
|
研究论文 | 本研究揭示了TMEM55A通过调控PI5P信号和F-肌动蛋白网络调节胰岛α细胞胞吐和胰高血糖素分泌的新机制 | 首次发现TMEM55A介导的PI5P信号通路通过调节F-肌动蛋白解聚和GTPase/RhoA失活来控制胰高血糖素分泌 | 研究主要关注TMEM55A-PI5P信号轴，其他潜在调控机制尚未完全探索 | 验证TMEM55A及其信号分子在α细胞功能和胰高血糖素分泌中的作用 | 人和小鼠胰岛α细胞、αTC1-9细胞系 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 膜片钳电生理学、单细胞RNA测序、体外磷酸酶测定、活细胞成像、GTPase活性下拉测定、共聚焦显微镜 | NA | 电生理记录、RNA测序数据、显微镜图像、分泌测定数据 | 人和小鼠胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 752 | 2025-10-06 |
RFX3 is essential for the generation of functional human pancreatic islets from stem cells
2025-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06424-4
PMID:40263183
|
研究论文 | 本研究揭示了RFX3在调控人类胰岛细胞分化和抑制肠嗜铬细胞定向中的关键作用 | 首次探索RFX3在人类胰岛发育中的功能，发现其调控胰岛内分泌细胞分化和抑制肠嗜铬细胞定向的新机制 | 研究主要基于干细胞衍生的胰岛类器官模型，未在体内系统中验证 | 研究RFX3在人类胰岛发育中的功能 | 人类诱导多能干细胞衍生的胰岛类器官 | 发育生物学 | 糖尿病 | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 基因敲除和过表达模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 753 | 2025-10-06 |
Abundance of a metabolically active subpopulation in dedifferentiated adipocytes inversely correlates with body mass index
2025-Jul, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102161
PMID:40348015
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在人脂肪细胞中发现了一个代谢活跃的亚群，该亚群丰度与体重指数呈负相关 | 首次在去分化脂肪细胞中鉴定出具有独特基因特征和代谢活性的CD36+/CD146+亚群，并发现其丰度与BMI的负相关性 | 样本量相对有限（11名供者），且机制研究仍需深入 | 探究人脂肪组织中不同亚群的细胞组成和功能特性 | 人脂肪组织来源的去分化脂肪细胞 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序，流式细胞分选，批量RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 11名人类供者的脂肪细胞，以及1759名供者的皮下脂肪组织基因表达数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 754 | 2025-10-06 |
The co-location of MARCO+ tumor-associated macrophages and CTSE+ tumor cells determined the poor prognosis in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Jul-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001138
PMID:39471066
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞数据分析，揭示了肝内胆管癌中MARCO+肿瘤相关巨噬细胞与CTSE+肿瘤细胞共定位导致不良预后的机制 | 首次在肝内胆管癌中识别出两种肿瘤内免疫浸润模式，并发现MARCO+ TAMs与CTSE+肿瘤细胞的空间共定位关系及其对预后的影响 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证发现 | 探究肝内胆管癌肿瘤微环境中免疫细胞表型及其空间分布对预后的影响 | 肝内胆管癌患者组织样本 | 空间转录组学 | 肝内胆管癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 6个空间转录组样本(29,632个点), 35个单细胞样本(21,158个细胞), 20个ICC样本用于验证 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 755 | 2025-06-22 |
Deciphering Macrophage-Fibroblast Cross Talk in Obesity-Induced Adipose Tissue Fibrosis: Insights From Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0337
PMID:40540667
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 756 | 2025-10-06 |
Predictive significance of MPT-driven necrosis-related genes signature in gastric cancer and their impact on the tumor microenvironment
2025-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03832-7
PMID:39690336
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研究论文 | 本研究探讨了MPT驱动坏死相关基因特征在胃癌中的预测意义及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次构建了基于MPT驱动坏死相关基因的胃癌预后风险模型，并揭示了该特征与肿瘤免疫微环境及免疫治疗反应的关系 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 研究MPT驱动坏死相关基因在胃癌预后预测和肿瘤免疫微环境中的作用 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | Cox回归，LASSO回归，风险评分模型 | RNA测序数据，突变数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌样本 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 757 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing and machine learning reveal the role of dioxin-interacting genes in HCC prognosis and immune microenvironment
2025-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118484
PMID:40483782
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研究论文 | 通过单细胞测序和机器学习揭示二噁英相互作用基因在肝细胞癌预后和免疫微环境中的作用 | 首次结合单细胞和批量转录组分析识别二噁英相互作用差异表达基因，并建立预后模型 | 未提及样本量限制或验证队列的详细信息 | 探究二噁英在肝细胞癌发展中的分子机制及预后评估 | 肝细胞癌患者样本和体外细胞实验 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 批量转录组分析, 机器学习, 分子对接, 体外实验 | 预后风险模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 758 | 2025-10-06 |
Mechanism of Dihydroartemisinin in activating macrophages to enhance host resistance to malaria
2025-Jul-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156913
PMID:40450979
|
研究论文 | 本研究揭示了双氢青蒿素通过激活NLRP12促进巨噬细胞向M1表型极化的分子机制 | 首次发现双氢青蒿素通过上调NLRP12表达促进巨噬细胞M1极化，并鉴定出Lcn2高表达M1巨噬细胞新亚群 | 研究主要基于小鼠巨噬细胞系和动物模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明双氢青蒿素激活巨噬细胞增强宿主抗疟疾抵抗力的分子机制 | 小鼠巨噬细胞系RAW 264.7和小鼠原代巨噬细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学, 基因敲低 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 小鼠巨噬细胞系和原代巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学 | NA | NA |
| 759 | 2025-10-06 |
From cells to clinic: Single-cell transcriptomics shaping the future of orthopedics
2025-Jul, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.05.001
PMID:40510239
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综述 | 探讨单细胞RNA测序技术在骨科研究中的应用及其对临床实践的影响 | 系统阐述单细胞转录组学如何为骨科疾病研究提供新视角，推动精准医疗发展 | NA | 评估单细胞RNA测序技术对骨科研究和临床实践的推动作用 | 骨关节炎、类风湿关节炎、椎间盘退变、骨肉瘤等骨科疾病 | 单细胞组学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 760 | 2025-10-06 |
New insights into cancer immune checkpoints landscape from single-cell RNA sequencing
2025-07, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189298
PMID:40088992
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综述 | 通过单细胞RNA测序技术解析癌症免疫检查点景观及其在免疫治疗中的作用机制 | 利用单细胞RNA测序技术高分辨率揭示免疫检查点之间的功能互作关系，识别新兴免疫检查点靶点 | NA | 探讨免疫检查点阻断治疗的响应与抵抗机制 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |