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当前共找到 845 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2025-10-06 |
Construction of a prostate adenocarcinoma molecular classification: integrating spatial transcriptomics with retrospective cohort validation
2025-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06661-6
PMID:40598508
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研究论文 | 本研究通过空间转录组分析构建了前列腺腺癌的分子分类系统，并在回顾性队列中验证其预后预测价值 | 整合空间转录组学与回顾性队列验证，首次基于恶性细胞分化相关预后基因构建前列腺腺癌分子分类系统 | 研究基于回顾性队列，需要前瞻性研究进一步验证 | 建立前列腺腺癌的精确分子分类系统以改善患者预后分层 | 前列腺腺癌患者组织样本和临床数据 | 数字病理 | 前列腺癌 | 空间转录组分析,免疫组化染色,单变量Cox回归,Kaplan-Meier分析 | ConsensusClusterPlus算法,Monocle 2分析 | 空间转录组数据,基因组数据,免疫组数据,临床随访数据 | TCGA-PRAD队列和回顾性队列患者样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 742 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic atlas of human lens epithelium: identification and functional insights into lens stem/progenitor cells
2025-Jul-01, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04436-w
PMID:40598599
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序构建了人类晶状体上皮细胞的转录组图谱，识别了晶状体干细胞/祖细胞并提供了功能见解 | 首次在人类晶状体上皮中识别出瞬时扩增细胞(TACs)和晶状体祖细胞样细胞(LPLCs)，确定了TOP2A作为TAC的生物标志物，揭示了PTN信号在晶状体稳态中的关键作用 | 样本量相对较小(8对样本)，仅包含人类供体样本，需要进一步的功能验证实验 | 识别和表征人类晶状体上皮中的干细胞/祖细胞亚群，理解晶状体细胞分化轨迹和衰老相关变化 | 人类供体晶状体上皮样本、人类晶状体、晶状体类器官、兔再生晶状体、小鼠晶状体和细胞系 | 单细胞生物学 | 白内障 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、轨迹推断、细胞间通讯分析、转录组测序、免疫荧光 | UMAP、CytoTRACE | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 8对人类供体晶状体上皮样本(4个非老年<65岁，4个老年>65岁) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 743 | 2025-10-06 |
Identification of Crucial Genes Associated With MYCN-Driven Neuroblastoma Based on Single-Cell Analysis and Machine Learning
2025-Jul, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71008
PMID:40600620
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析和机器学习方法识别与MYCN驱动神经母细胞瘤相关的关键基因 | 结合单细胞转录组分析和随机生存森林机器学习方法识别预后相关基因，并揭示其在免疫微环境调控中的作用 | 样本量有限，需要更大规模验证；机制研究仍需深入 | 阐明MYCN扩增神经母细胞瘤的分子机制并识别关键预后基因 | 神经母细胞瘤患者样本和细胞系 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR | 随机生存森林(RSF)，列线图分析 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | GSE218450数据集中的神经母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 744 | 2025-10-06 |
ShinySC: an R/Shiny-based desktop application for seamless analysis of scRNA-Seq data
2025-Jul-01, Biomedical journal
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.bj.2025.100885
PMID:40609640
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研究论文 | 开发了一个基于R/Shiny的桌面应用程序，用于简化单细胞RNA测序数据分析 | 整合了多种自动细胞类型注释方法（基于参考、基于标记和基于GPT），支持多种数据格式和并行比较功能 | 在标准64GB内存台式机上最多支持20万个细胞的分析，分析时长依赖具体任务和注释方法 | 为无编程经验的临床医生和研究人员提供易用的单细胞RNA测序分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 最多支持20万个细胞的数据集 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, BD Rhapsody | 支持10x Genomics、BD Rhapsody、Seurat、Scanpy和CellView等多种数据格式 |
| 745 | 2025-10-06 |
Palmitoylation Dynamics in Systemic Lupus Erythematosus: Multi-Omics Insights and Potential Therapeutic Implications
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70346
PMID:40613570
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研究论文 | 通过多组学分析揭示棕榈酰化在系统性红斑狼疮中的动态变化及其治疗潜力 | 首次整合多组学数据识别SLE中棕榈酰化相关基因，并通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析揭示免疫细胞动态及因果关系 | 需要进一步研究验证发现并探索临床意义 | 探究棕榈酰化在系统性红斑狼疮发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 系统性红斑狼疮患者基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 多组学分析,单细胞RNA测序,孟德尔随机化,加权基因共表达网络分析,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | GSE61635数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 746 | 2025-10-06 |
IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes
2025-Jul-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027689
PMID:40163892
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了IFN-γ通过激活炎症性单核细胞促进特发性多中心Castleman病进展的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘iMCD免疫图谱，发现CCL单核细胞通过IFN-II信号通路与NK/NKT细胞互动的关键机制 | 样本量相对有限（15例患者和4例健康对照），需要更大规模研究验证 | 探索iMCD疾病免疫发病机制并寻找新的治疗靶点 | 特发性多中心Castleman病患者的外周血单个核细胞、淋巴结和骨髓样本 | 单细胞组学 | 特发性多中心Castleman病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例iMCD患者和4例健康对照的外周血单个核细胞，以及淋巴结和骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 747 | 2025-10-06 |
A Comparative Analysis Dissecting the Immune Landscape of Vitiligo and Melanoma from a single-cell Perspective: Two Sides of the Same Coin?
2025-Jul-03, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02332-2
PMID:40608219
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较分析白癜风和黑色素瘤的免疫微环境差异 | 首次从单细胞角度系统比较白癜风和黑色素瘤的免疫微环境，揭示两者在免疫激活与免疫逃逸机制上的根本差异 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 解析白癜风和黑色素瘤免疫微环境的异同点 | 健康对照者、白癜风患者和黑色素瘤患者的皮肤组织样本 | 单细胞组学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照、白癜风和黑色素瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 748 | 2025-10-06 |
Pathogenic mechanism of extracranial arteriovenous malformations: insights from clinical, pathological, and genetic analyses
2025-Jul-02, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04158-7
PMID:40603544
|
研究论文 | 通过临床、病理和遗传分析揭示颅外动静脉畸形的致病机制 | 首次报道AVMs中显著的基因型-表型相关性，发现MAP2K1突变型AVMs中异常小血管网络的特异性基因表达谱 | 回顾性研究设计，样本量较小（30例患者） | 阐明颅外动静脉畸形的发病机制与基因突变的关系 | 30例颅外动静脉畸形患者 | 数字病理学 | 血管畸形 | 空间转录组学，免疫组织化学，基因突变分析 | NA | 基因表达数据，病理图像，临床数据 | 30例颅外AVM患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 749 | 2025-10-06 |
FLI1 and GATA1 govern TLN1 transcription: new insights into FLI1-related platelet disorders
2025-Jul-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.286372
PMID:39744817
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研究论文 | 本研究揭示了FLI1基因变异通过影响与GATA1的协同转录活性导致talin-1缺陷和血小板功能障碍的新机制 | 首次发现FLI1与GATA1共同调控TLN1转录，并鉴定两个新型FLI1变异体(p.G307R和p.R340C) | 研究样本量有限，机制研究主要依赖体外实验 | 阐明FLI1变异对人类巨核细胞和血小板功能影响的分子机制 | FLI1基因变异患者、巨核细胞、血小板和细胞系 | 分子生物学 | 血小板疾病 | 单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀测序,荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,测序数据 | FLI1变异患者样本和细胞系 | NA | single-cell RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 750 | 2025-10-06 |
Enhancing genetic transformation efficiency in cucurbit crops through AtGRF5 overexpression: Mechanistic insights and applications
2025-Jul, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13912
PMID:40213927
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研究论文 | 通过过表达AtGRF5基因显著提高葫芦科作物的遗传转化效率，并阐明其分子机制 | 发现AtGRF5通过促进愈伤组织增殖和增加致密细胞来增强遗传转化效率，开发了ABA诱导型AtGRF5表达系统以减轻多效性影响 | NA | 提高葫芦科作物的遗传转化和基因编辑效率 | 葫芦科作物（黄瓜等） | 植物生物技术 | NA | 单细胞RNA测序, DAP-seq, 时间序列转录组学 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 751 | 2025-10-06 |
Distinct transcriptional changes in hematopoietic progenitor subsets on LPS-induced emergency granulopoiesis
2025-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104792
PMID:40316244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了LPS诱导的应急粒细胞生成过程中不同造血祖细胞亚群的转录变化 | 首次在单细胞水平揭示非谱系定型多能祖细胞在炎症刺激下向髓系和红系祖细胞重编程的动态过程 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究不同多能祖细胞亚群在LPS诱导的应急粒细胞生成中的作用 | 野生型小鼠的多能祖细胞(MPPs) | 单细胞生物学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 移植实验, 假时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组和LPS处理组小鼠的MPPs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 752 | 2025-10-06 |
Differentiable graph clustering with structural grouping for single-cell RNA-seq data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf347
PMID:40511990
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的可微分图聚类方法，通过结构分组整合图聚类信息 | 设计了可微分聚类机制将离散的K路归一化割转化为可微分学习目标，通过谱松弛实现图聚类信息的整合 | 未在抽象中明确说明研究局限性 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 自编码器, 图注意力自编码器 | 单细胞RNA测序数据 | 14个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 753 | 2025-10-06 |
Putting AML Differentiation States on the BoneMarrowMap
2025-Jul-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0083
PMID:40294281
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为'BoneMarrowMap'的新型计算工具，可将白血病单细胞RNA测序数据映射到造血分化状态 | 开发了能够将白血病单细胞RNA测序数据集映射到造血分化状态的新型计算工具，并发现了12种与预后和治疗相关的复发性急性髓系白血病分化模式 | NA | 开发计算工具以分析白血病单细胞RNA测序数据并识别分化模式 | 急性髓系白血病患者的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大规模单细胞RNA测序数据重新分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 754 | 2025-10-06 |
T-cell differentiation stage block bias confers hypermethylation and mediastinal preference in T-cell lymphoblastic lymphoma
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70380
PMID:40579780
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了T淋巴母细胞淋巴瘤中T细胞分化阻滞模式的特征及其对肿瘤微环境和甲基化状态的影响 | 首次从T细胞分化阻滞角度系统阐明T-LBL与T-ALL的差异，发现DN/DP阶段阻滞模式驱动免疫抑制微环境和纵隔偏好，并揭示E2F2-UHRF1介导的抑癌基因高甲基化新机制 | 样本来源相对有限，需要更大规模队列验证研究结果 | 探究T淋巴母细胞淋巴瘤与T细胞急性淋巴细胞白血病之间的生物学差异和分子机制 | T淋巴母细胞淋巴瘤患者样本和T细胞急性淋巴细胞白血病数据 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 流式细胞术, 表达芯片 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 体细胞突变数据 | NCH-TALL-LBL队列样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 755 | 2025-10-06 |
Innovative Single-Cell Sequencing Techniques for B-Cell Analysis and Their Implications for Rational HIV-1 Vaccine Design
2025-Jul-01, Current HIV research
IF:0.8Q4
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在B细胞分析中的最新进展及其对HIV-1疫苗设计的启示 | 通过单细胞技术实现B细胞免疫库、基因表达和表型的多维度分析，为疫苗设计提供新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在传染病和疫苗接种背景下B细胞反应分析的应用 | B细胞及其在免疫反应中的动态变化 | 单细胞分析 | HIV-1感染 | 单细胞测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 756 | 2025-10-06 |
Exploring the interconnection between PANoptosis and chronic inflammatory diseases: identifying key targets and therapeutic strategies for periodontitis and ulcerative colitis
2025-Jul-02, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04320-7
PMID:40600991
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探索了PANoptosis在牙周炎和溃疡性结肠炎这两种慢性炎症疾病中的关键作用 | 首次将PANoptosis概念与牙周炎和溃疡性结肠炎联系起来，识别了BAG3、LYN和APOE作为核心治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学预测和动物模型验证，需要在人类临床样本中进一步验证 | 识别牙周炎和溃疡性结肠炎的共同分子机制，探索PANoptosis相关基因的相互作用，预测潜在治疗靶点和药物 | 牙周炎和溃疡性结肠炎的基因表达数据、DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性炎症疾病 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、GO和KEGG富集分析、LASSO和SVM-RFE算法、单细胞RNA测序、分子对接模拟 | LASSO、SVM-RFE | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | GSE16134（牙周炎数据集）和GSE87466（溃疡性结肠炎数据集） | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 757 | 2025-10-06 |
Gene expression and hormonal signaling in osteoporosis: from molecular mechanisms to clinical breakthroughs
2025-Jul, Journal of biomaterials science. Polymer edition
DOI:10.1080/09205063.2024.2445376
PMID:39729311
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综述 | 本文综述骨质疏松症的分子机制与临床突破，重点关注基因表达和激素信号调控 | 整合单细胞RNA测序、长链非编码RNA等最新技术，提出基于遗传和激素变异的个体化治疗策略 | 未涉及具体实验验证，主要基于现有文献的综合分析 | 探讨骨质疏松症的分子机制并推动临床治疗突破 | 骨质疏松症的基因表达调控和激素信号通路 | 医学研究 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 758 | 2025-10-06 |
Comparison of Droplet- and Microwell-based Methods to Analyze Cryopreserved Human BAL Cells by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0467MA
PMID:40392631
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研究论文 | 比较基于液滴和微孔板的两种单细胞RNA测序方法在分析冷冻保存人支气管肺泡灌洗液细胞中的表现 | 首次系统比较两种scRNA-seq平台在冷冻保存人BALF细胞分析中的性能差异，特别发现微孔板方法能独特识别脆性嗜酸性粒细胞 | 仅使用4个BALF样本，样本量较小；仅比较两种技术平台 | 评估不同单细胞RNA测序方法在分析冷冻保存人支气管肺泡灌洗液细胞中的适用性 | 人支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞测序 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4个BALF样本 | NA | 单细胞RNA测序 | 液滴平台,微孔板平台 | 基于液滴的单细胞RNA测序方法,基于微孔板捕获的单细胞RNA测序方法 |
| 759 | 2025-10-06 |
Integrating AI/ML and multi-omics approaches to investigate the role of TNFRSF10A/TRAILR1 and its potential targets in pancreatic cancer
2025-Jul, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110432
PMID:40424767
|
研究论文 | 通过整合AI/ML和多组学方法研究TNFRSF10A/TRAILR1在胰腺癌中的作用及其潜在靶点 | 首次将空间转录组学、ceRNA网络分析与基于Transformer的深度学习模型SELFormer结合，用于胰腺癌药物靶点发现 | 研究主要基于计算预测和体外模拟，需要实验验证 | 发现胰腺导管腺癌的新治疗靶点和药物 | 胰腺导管腺癌(PDAC)微环境中的癌细胞 | 机器学习 | 胰腺癌 | 多组学分析、深度学习、分子动力学模拟、虚拟筛选 | Transformer、SELFormer、QSAR模型 | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、化学结构数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学、bulk基因组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 760 | 2025-10-06 |
Analysis of Hyperexpanded T Cell Clones in SARS-CoV-2 Vaccine-Associated Liver Injury by Spatial Proteomics and Transcriptomics
2025-Jul, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70172
PMID:40522253
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研究论文 | 通过空间蛋白质组学和转录组学分析SARS-CoV-2疫苗相关肝损伤中的超扩增T细胞克隆 | 首次结合多重免疫荧光-RNA原位杂交和单细胞空间转录组学技术，在单细胞水平定位和表征SVALI中的超扩增T细胞克隆 | 仅分析单个患者的肝脏样本，样本量有限 | 表征严重SARS-CoV-2疫苗相关肝损伤患者的免疫浸润特征 | SVALI患者的肝脏移植样本 | 数字病理学 | 肝损伤 | T细胞受体测序, 多重免疫荧光, RNA原位杂交, 单细胞空间转录组学 | NA | 空间蛋白质组数据, 空间转录组数据, 序列数据 | 1例严重SVALI患者的肝脏移植样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞分析 | Xenium | Xenium原位平台用于单细胞空间转录组学分析 |