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当前共找到 806 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-10-06 |
stGRL: spatial domain identification, denoising, and imputation algorithm for spatial transcriptome data based on multi-task graph contrastive representation learning
2025-Jul-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02290-z
PMID:40597202
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研究论文 | 提出一种基于多任务图对比表示学习的空间转录组数据分析算法stGRL，用于空间域识别、去噪和插补 | 开发了首个结合编码器-解码器架构与零膨胀负二项分布的多任务图神经网络模型，集成图对比表示学习增强节点嵌入一致性 | 未明确说明算法计算复杂度及对大规模数据集的处理效率 | 解决空间转录组数据高丢失率和噪声问题，提升下游分析性能 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌,卵巢癌 | 空间转录组测序 | 图神经网络,编码器-解码器,对比学习 | 空间转录组数据 | 多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 702 | 2025-10-06 |
A rare IDH-Mutant glioma case: insights from single-cell transcriptomic analysis of tumor recurrences
2025-Jul-01, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-03913-z
PMID:40597255
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病例报告 | 通过单细胞转录组分析研究一例罕见IDH突变胶质瘤多灶性复发的细胞异质性和谱系关系 | 首次对IDH突变胶质瘤多灶性复发进行单细胞测序分析，揭示不同病灶间的细胞组成差异和隐藏谱系关系 | 单一样本病例研究，结果可能不具有普遍代表性 | 探究IDH突变胶质瘤多灶性复发的分子机制 | 36岁男性IDH突变少突胶质细胞瘤患者的多灶性复发肿瘤组织 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者的2个复发肿瘤病灶 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 703 | 2025-10-06 |
Gremlin1 repression-mediated mitochondrial network hyperfunction contributes to TCE-induced zebrafish cardiac defects
2025-Jul-01, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02314-9
PMID:40597303
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研究论文 | 本研究揭示三氯乙烯通过抑制Gremlin1基因导致线粒体网络功能亢进，从而引起斑马鱼心脏发育缺陷的机制 | 首次发现Gremlin1基因在心脏发育中的关键作用，并阐明环境污染物通过调控该基因导致心脏缺陷的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型，在人类中的直接相关性需要进一步验证 | 探究三氯乙烯诱导先天性心脏病的分子机制 | 斑马鱼胚胎和人类多能干细胞来源的心肌细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, CRISPR/dCas9基因编辑 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎和hPSC-CMs细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 704 | 2025-10-06 |
Multiple cell types guided by neurocytes orchestrate horn bud initiation in dairy goats
2025-Jul-01, Genetics, selection, evolution : GSE
DOI:10.1186/s12711-025-00981-3
PMID:40597626
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了奶山羊早期角芽发育过程中细胞异质性和命运轨迹 | 首次揭示了神经细胞引导下多种细胞类型协同调控山羊角芽起始的发育机制 | 研究仅聚焦于胚胎期角芽发育，未涉及出生后角形成过程 | 阐明奶山羊角芽起始的细胞和分子机制 | 奶山羊胚胎期角芽组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, HE染色, 免疫组织化学 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据, 组织图像 | 奶山羊胚胎期角芽组织（E50, E60, E70阶段） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 705 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome of mouse hippocampus identifies neural precursor-like cells, and reveals IL15Rα knock out-mediated neuron remodeling
2025-Jul-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11785-6
PMID:40597645
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了IL15Rα敲除对小鼠海马体细胞功能的影响，并鉴定出一种具有前体样属性的新型神经细胞 | 发现前体样神经元这一新型细胞类型，提出'极化评分'方法评估细胞聚集程度，揭示IL15Rα敲除通过影响神经元可塑性调节兴奋-抑制平衡 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；单细胞测序技术本身存在技术偏差 | 研究IL15Rα敲除对成年小鼠海马体细胞功能的影响 | 野生型和IL15Rα敲除小鼠的海马体组织 | 单细胞转录组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 64,399个单细胞转录组（来自WT和KO小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 706 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals the role of SALL4 in cervical cancer development
2025-Jul-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14469-2
PMID:40597906
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨SALL4在宫颈癌发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次结合单细胞测序技术和体内外实验系统揭示SALL4在宫颈癌进展中的关键调控作用 | 研究主要基于HeLa细胞系，临床样本验证不足 | 探究SALL4在宫颈癌发展中的作用及其治疗靶点潜力 | 宫颈癌细胞系HeLa | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞测序，转录组分析，免疫荧光，体内外实验 | NA | 单细胞测序数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 707 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and time-series metabolite profiling reveal the spatiotemporal regulation of flavonoid biosynthesis genes and phytohormone homeostasis by PAP1 in Arabidopsis
2025-Jul-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02297-6
PMID:40598113
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和时序代谢物分析，揭示了PAP1在拟南芥中调控类黄酮生物合成基因和植物激素稳态的时空调控机制 | 首次结合单细胞转录组和时序代谢组学，在细胞类型特异性水平解析PAP1对类黄酮生物合成途径的时空调控网络 | 研究仅针对拟南芥模型植物，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 阐明PAP1转录因子在植物类黄酮生物合成和植物激素稳态中的细胞特异性调控机制 | 拟南芥野生型和pap1-D突变体叶片 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 代谢物分析 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | 拟南芥野生型和pap1-D突变体叶片样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 708 | 2025-10-06 |
Mechanical force-induced oncostatin M secretion by Jun-positive neutrophils promotes craniofacial bone regeneration for midface hypoplasia treatment
2025-Jul-01, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04458-4
PMID:40598376
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研究论文 | 本研究揭示了机械力通过Jun阳性中性粒细胞分泌制瘤素M促进颅面骨再生的新机制 | 首次发现Jun阳性中性粒细胞亚群在机械力诱导的骨再生中的关键作用，并阐明其通过分泌制瘤素M促进缝线来源干细胞成骨分化的机制 | 研究基于小鼠模型，临床转化需要进一步验证；未探讨其他细胞类型在骨再生中的潜在作用 | 探究经缝牵引成骨技术促进颅面骨再生的分子机制 | C57BL/6小鼠颧颌缝区域的中性粒细胞和缝线来源干细胞 | 骨再生生物学 | 颅面畸形 | 单细胞RNA测序，细胞通讯分析，体外拉伸实验 | 小鼠TSDO模型，HL-60细胞分化模型 | 基因表达数据，细胞信号通路数据 | 4周龄C57BL/6小鼠和中性粒细胞缺失小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 709 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics and multi-omics reveal relapse and resistance mechanisms of EndMT-derived CAFs mediated by TNC and FLNC in glioblastoma
2025-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06743-5
PMID:40598496
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和多组学分析揭示了胶质母细胞瘤中由TNC和FLNC介导的内皮-间质转化来源的癌症相关成纤维细胞的复发和耐药机制 | 首次发现TNC和FLNC通过介导内皮-间质转化促进CAFs形成，并证实天然产物安石榴苷可通过靶向TNC和FLNC逆转胶质母细胞瘤耐药性 | 研究样本量有限，机制研究主要基于体外共培养模型，需要更多临床样本验证 | 探索胶质母细胞瘤复发和耐药机制，特别是CAFs的来源和作用 | 胶质母细胞瘤组织样本、替莫唑胺敏感和耐药细胞、人脑血管内皮细胞 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组测序,RNA-seq,无标记定量蛋白质组学,免疫组化染色 | NA | 空间转录组数据,RNA测序数据,蛋白质组数据,图像数据 | 包含原发性和复发性胶质瘤的组织芯片样本，体外共培养模型 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 710 | 2025-10-06 |
Construction of a prostate adenocarcinoma molecular classification: integrating spatial transcriptomics with retrospective cohort validation
2025-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06661-6
PMID:40598508
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研究论文 | 本研究通过空间转录组分析构建了前列腺腺癌的分子分类系统，并在回顾性队列中验证其预后预测价值 | 整合空间转录组学与回顾性队列验证，首次基于恶性细胞分化相关预后基因构建前列腺腺癌分子分类系统 | 研究基于回顾性队列，需要前瞻性研究进一步验证 | 建立前列腺腺癌的精确分子分类系统以改善患者预后分层 | 前列腺腺癌患者组织样本和临床数据 | 数字病理 | 前列腺癌 | 空间转录组分析,免疫组化染色,单变量Cox回归,Kaplan-Meier分析 | ConsensusClusterPlus算法,Monocle 2分析 | 空间转录组数据,基因组数据,免疫组数据,临床随访数据 | TCGA-PRAD队列和回顾性队列患者样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 711 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic atlas of human lens epithelium: identification and functional insights into lens stem/progenitor cells
2025-Jul-01, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04436-w
PMID:40598599
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序构建了人类晶状体上皮细胞的转录组图谱，识别了晶状体干细胞/祖细胞并提供了功能见解 | 首次在人类晶状体上皮中识别出瞬时扩增细胞(TACs)和晶状体祖细胞样细胞(LPLCs)，确定了TOP2A作为TAC的生物标志物，揭示了PTN信号在晶状体稳态中的关键作用 | 样本量相对较小(8对样本)，仅包含人类供体样本，需要进一步的功能验证实验 | 识别和表征人类晶状体上皮中的干细胞/祖细胞亚群，理解晶状体细胞分化轨迹和衰老相关变化 | 人类供体晶状体上皮样本、人类晶状体、晶状体类器官、兔再生晶状体、小鼠晶状体和细胞系 | 单细胞生物学 | 白内障 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、轨迹推断、细胞间通讯分析、转录组测序、免疫荧光 | UMAP、CytoTRACE | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 8对人类供体晶状体上皮样本(4个非老年<65岁，4个老年>65岁) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 712 | 2025-10-06 |
Identification of Crucial Genes Associated With MYCN-Driven Neuroblastoma Based on Single-Cell Analysis and Machine Learning
2025-Jul, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71008
PMID:40600620
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析和机器学习方法识别与MYCN驱动神经母细胞瘤相关的关键基因 | 结合单细胞转录组分析和随机生存森林机器学习方法识别预后相关基因，并揭示其在免疫微环境调控中的作用 | 样本量有限，需要更大规模验证；机制研究仍需深入 | 阐明MYCN扩增神经母细胞瘤的分子机制并识别关键预后基因 | 神经母细胞瘤患者样本和细胞系 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR | 随机生存森林(RSF)，列线图分析 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | GSE218450数据集中的神经母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 713 | 2025-10-06 |
IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes
2025-Jul-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027689
PMID:40163892
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了IFN-γ通过激活炎症性单核细胞促进特发性多中心Castleman病进展的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘iMCD免疫图谱，发现CCL单核细胞通过IFN-II信号通路与NK/NKT细胞互动的关键机制 | 样本量相对有限（15例患者和4例健康对照），需要更大规模研究验证 | 探索iMCD疾病免疫发病机制并寻找新的治疗靶点 | 特发性多中心Castleman病患者的外周血单个核细胞、淋巴结和骨髓样本 | 单细胞组学 | 特发性多中心Castleman病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例iMCD患者和4例健康对照的外周血单个核细胞，以及淋巴结和骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 714 | 2025-10-06 |
Pathogenic mechanism of extracranial arteriovenous malformations: insights from clinical, pathological, and genetic analyses
2025-Jul-02, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04158-7
PMID:40603544
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研究论文 | 通过临床、病理和遗传分析揭示颅外动静脉畸形的致病机制 | 首次报道AVMs中显著的基因型-表型相关性，发现MAP2K1突变型AVMs中异常小血管网络的特异性基因表达谱 | 回顾性研究设计，样本量较小（30例患者） | 阐明颅外动静脉畸形的发病机制与基因突变的关系 | 30例颅外动静脉畸形患者 | 数字病理学 | 血管畸形 | 空间转录组学，免疫组织化学，基因突变分析 | NA | 基因表达数据，病理图像，临床数据 | 30例颅外AVM患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 715 | 2025-10-06 |
FLI1 and GATA1 govern TLN1 transcription: new insights into FLI1-related platelet disorders
2025-Jul-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.286372
PMID:39744817
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研究论文 | 本研究揭示了FLI1基因变异通过影响与GATA1的协同转录活性导致talin-1缺陷和血小板功能障碍的新机制 | 首次发现FLI1与GATA1共同调控TLN1转录，并鉴定两个新型FLI1变异体(p.G307R和p.R340C) | 研究样本量有限，机制研究主要依赖体外实验 | 阐明FLI1变异对人类巨核细胞和血小板功能影响的分子机制 | FLI1基因变异患者、巨核细胞、血小板和细胞系 | 分子生物学 | 血小板疾病 | 单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀测序,荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,测序数据 | FLI1变异患者样本和细胞系 | NA | single-cell RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 716 | 2025-10-06 |
Enhancing genetic transformation efficiency in cucurbit crops through AtGRF5 overexpression: Mechanistic insights and applications
2025-Jul, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13912
PMID:40213927
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研究论文 | 通过过表达AtGRF5基因显著提高葫芦科作物的遗传转化效率，并阐明其分子机制 | 发现AtGRF5通过促进愈伤组织增殖和增加致密细胞来增强遗传转化效率，开发了ABA诱导型AtGRF5表达系统以减轻多效性影响 | NA | 提高葫芦科作物的遗传转化和基因编辑效率 | 葫芦科作物（黄瓜等） | 植物生物技术 | NA | 单细胞RNA测序, DAP-seq, 时间序列转录组学 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 717 | 2025-10-06 |
Distinct transcriptional changes in hematopoietic progenitor subsets on LPS-induced emergency granulopoiesis
2025-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104792
PMID:40316244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了LPS诱导的应急粒细胞生成过程中不同造血祖细胞亚群的转录变化 | 首次在单细胞水平揭示非谱系定型多能祖细胞在炎症刺激下向髓系和红系祖细胞重编程的动态过程 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究不同多能祖细胞亚群在LPS诱导的应急粒细胞生成中的作用 | 野生型小鼠的多能祖细胞(MPPs) | 单细胞生物学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 移植实验, 假时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组和LPS处理组小鼠的MPPs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 718 | 2025-10-06 |
Differentiable graph clustering with structural grouping for single-cell RNA-seq data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf347
PMID:40511990
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的可微分图聚类方法，通过结构分组整合图聚类信息 | 设计了可微分聚类机制将离散的K路归一化割转化为可微分学习目标，通过谱松弛实现图聚类信息的整合 | 未在抽象中明确说明研究局限性 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 自编码器, 图注意力自编码器 | 单细胞RNA测序数据 | 14个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 719 | 2025-10-06 |
T-cell differentiation stage block bias confers hypermethylation and mediastinal preference in T-cell lymphoblastic lymphoma
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70380
PMID:40579780
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了T淋巴母细胞淋巴瘤中T细胞分化阻滞模式的特征及其对肿瘤微环境和甲基化状态的影响 | 首次从T细胞分化阻滞角度系统阐明T-LBL与T-ALL的差异，发现DN/DP阶段阻滞模式驱动免疫抑制微环境和纵隔偏好，并揭示E2F2-UHRF1介导的抑癌基因高甲基化新机制 | 样本来源相对有限，需要更大规模队列验证研究结果 | 探究T淋巴母细胞淋巴瘤与T细胞急性淋巴细胞白血病之间的生物学差异和分子机制 | T淋巴母细胞淋巴瘤患者样本和T细胞急性淋巴细胞白血病数据 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 流式细胞术, 表达芯片 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 体细胞突变数据 | NCH-TALL-LBL队列样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 720 | 2025-10-06 |
Innovative Single-Cell Sequencing Techniques for B-Cell Analysis and Their Implications for Rational HIV-1 Vaccine Design
2025-Jul-01, Current HIV research
IF:0.8Q4
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在B细胞分析中的最新进展及其对HIV-1疫苗设计的启示 | 通过单细胞技术实现B细胞免疫库、基因表达和表型的多维度分析，为疫苗设计提供新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在传染病和疫苗接种背景下B细胞反应分析的应用 | B细胞及其在免疫反应中的动态变化 | 单细胞分析 | HIV-1感染 | 单细胞测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |