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当前共找到 820 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-06 |
Inference of gene coexpression networks from single-cell transcriptome data based on variance decomposition analysis
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf309
PMID:40618350
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研究论文 | 提出基于方差分解分析的单细胞转录组基因共表达网络推断方法GCNVDA | 通过引入基因水平方差和残差误差的随机效应项，有效解决单细胞数据噪声和稀疏性问题 | 未明确说明方法计算复杂度和对大规模数据的适用性 | 从单细胞转录组数据推断基因共表达网络以探索基因调控机制 | 基因共表达网络和功能模块 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 方差分解分析模型 | 单细胞转录组数据 | 三个真实世界单细胞数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 622 | 2025-10-06 |
Molecular mechanism and biological pathway of high-expressed RAD51 in regulating cell adhesion and potentially affecting oral squamous cell carcinoma
2025-Jul-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03085-y
PMID:40613957
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研究论文 | 本研究探讨RAD51高表达通过调控细胞粘附机制促进口腔鳞状细胞癌发展的分子机制 | 首次在多平台（RNA-seq、微阵列、IHC、scRNA-seq）上全面验证RAD51在OSCC中的表达模式及其在细胞粘附中的功能作用 | 研究样本量相对有限，需要进一步的功能验证实验 | 探索RAD51在口腔鳞状细胞癌中调控细胞粘附的分子机制和生物学通路 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 | 癌症生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq, 微阵列, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | 1006个OSCC样本（bulk RNA）, 162个OSCC组织（IHC）, 9693个恶性上皮细胞（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 623 | 2025-10-06 |
Divide-and-conquer strategy with engineered ossification center organoids for rapid bone healing through developmental cell recruitment
2025-Jul-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61619-y
PMID:40615395
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研究论文 | 本研究通过工程化构建骨化中心类器官，采用分而治之策略促进大尺寸骨缺损的快速愈合 | 开发了具有内核心骨形态发生/神经营养球和外壳促血管生成相的双层骨化中心类器官结构，首次通过原位类器官融合与成熟招募发育性Krt8骨骼干细胞 | 研究未详细探讨类器官在体内的长期安全性与稳定性 | 开发新型骨组织工程策略以解决大尺寸骨缺损修复中血管化延迟和再生缓慢的难题 | 骨缺损动物模型及工程化骨化中心类器官 | 组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序，3D打印，机器学习 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2025-10-06 |
DOLPHIN advances single-cell transcriptomics beyond gene level by leveraging exon and junction reads
2025-Jul-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61580-w
PMID:40615408
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研究论文 | 提出一种名为DOLPHIN的深度学习方法，通过整合外显子水平和连接点读取数据来改进单细胞转录组分析 | 首次将外显子水平和连接点读取数据整合到单细胞转录组分析中，使用图结构表示基因并通过变分图自编码器处理 | NA | 改进单细胞转录组分析的质量和分辨率 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分图自编码器 | 外显子水平数据、连接点读取数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2025-10-06 |
Multi-omics and experimental validation reveal mechanism of compound mylabris capsules in treating diffuse large B-cell lymphoma
2025-Jul-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-09767-5
PMID:40615583
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证揭示了复方斑蝥胶囊治疗弥漫性大B细胞淋巴瘤的作用机制 | 首次系统整合生物信息学分析、单细胞RNA测序和实验验证，阐明复方斑蝥胶囊主要成分豆甾醇通过调控CDK1和CDK2靶点抑制DLBCL的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究复方斑蝥胶囊治疗弥漫性大B细胞淋巴瘤的作用机制 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞及相关基因靶点 | 生物信息学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,体外实验 | 网络分析,PPI网络 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | GEO和TCGA数据库中的DLBCL数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 626 | 2025-10-06 |
Uncovering key markers and therapeutic targets for renal fibrosis in diabetic kidney disease through bulk and single-cell RNA sequencing
2025-Jul-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06554-8
PMID:40615901
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研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序识别糖尿病肾病中肾纤维化的关键标志物和治疗靶点 | 结合WGCNA、机器学习、单细胞RNA测序和分子对接技术，首次系统鉴定PROM1和THY1作为糖尿病肾病肾纤维化的关键诊断标志物 | 研究主要基于公共数据集和动物模型，需要在更大临床队列中验证 | 识别糖尿病肾病中肾纤维化的关键基因标志物和潜在治疗靶点 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据、STZ诱导的糖尿病肾病小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | WGCNA, ssGSEA, 机器学习, 单细胞RNA测序, 分子对接 | FibrosisScore模型, 机器学习模型 | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 两个糖尿病肾病数据集, STZ小鼠模型, Nephroseq V5数据库临床数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 627 | 2025-10-06 |
Integrative analysis reveals the multilateral inflammatory mechanisms of CD14 monocytes in gout
2025-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.01.046
PMID:40023733
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示CD14单核细胞在痛风中的多边炎症机制 | 首次在单细胞水平系统表征痛风患者CD14单核细胞的分子和细胞特征，发现S100Ahigh单核细胞亚群通过缺氧和脂肪酸代谢途径驱动炎症反应 | 样本量较小（8例患者和6例对照），需更大规模研究验证 | 阐明CD14单核细胞在痛风炎症反应启动中的具体作用机制 | 痛风患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例痛风患者和6例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 628 | 2025-10-06 |
Microglia heterogeneity, modeling and cell-state annotation in development and neurodegeneration
2025-Jul, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01931-4
PMID:40195564
|
综述 | 本文综述了小胶质细胞在发育和神经退行性疾病中的异质性、建模与细胞状态注释方法 | 提供了基于基因表达的小胶质细胞状态注释工具，整合了发育、神经退行性疾病、性别和中枢神经系统区域等多维度异质性分析 | NA | 深入理解小胶质细胞在健康和疾病状态下的转录异质性及其功能动态 | 小鼠和人类的小胶质细胞 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2025-10-06 |
Fibroblast Activation Protein (FAP)+ cancer-associated fibroblasts induce macrophage M2-like polarization via the Fibronectin 1-Integrin α5β1 axis in breast cancer
2025-Jul, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03359-3
PMID:40263422
|
研究论文 | 本研究揭示了表达成纤维细胞活化蛋白的癌症相关成纤维细胞通过纤连蛋白1-整合素α5β1轴诱导巨噬细胞M2样极化，促进乳腺癌免疫抑制的机制 | 首次发现FAP CAFs通过分泌FN1激活巨噬细胞整合素α5β1-FAK-AKT-STAT3信号通路，驱动M2样极化，并证实靶向该轴可重塑肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于小鼠模型和临床标本，尚未在更广泛的人群中验证治疗策略的临床效果 | 探究FAP CAFs在乳腺癌免疫微环境中的调控机制及潜在治疗靶点 | 乳腺癌微环境中的FAP阳性癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，体内外实验，临床标本分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，临床数据，实验数据 | 临床标本和小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 630 | 2025-10-06 |
A dynamic and multimodal framework to define microglial states
2025-Jul, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01978-3
PMID:40394327
|
研究论文 | 提出微胶质细胞状态连续体模型，挑战传统离散分类范式 | 首次提出微胶质细胞存在于连续体而非离散亚群的理论框架 | 主要基于计算方法分析，缺乏实验验证 | 建立微胶质细胞状态分类的稳健理论框架 | 中枢神经系统微胶质细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 连续体模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 631 | 2025-10-06 |
Spatial multiomics decipher fibroblast-macrophage dynamics in systemic sclerosis
2025-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.04.025
PMID:40410053
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研究论文 | 通过空间多组学技术解析系统性硬化症中成纤维细胞-巨噬细胞动态相互作用 | 首次构建系统性硬化症皮肤纤维化微环境的空间图谱，揭示ACKR3在肌成纤维细胞前体中的选择性表达及其调控巨噬细胞募集的机制 | 样本量相对有限（14例皮肤活检），需要更大规模研究验证发现 | 探索系统性硬化症皮肤组织中细胞空间组织和协调机制，为精准医疗提供新见解 | 系统性硬化症患者皮肤组织、SSc小鼠模型、伤口愈合驯鹿模型 | 空间转录组学 | 系统性硬化症 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 14例皮肤活检（10例弥漫性皮肤SSc患者，4例健康对照） | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 632 | 2025-10-06 |
CD4+ tissue-resident memory Th17 cells are a major source of IL-17A in Spondyloarthritis synovial tissue
2025-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.04.018
PMID:40413112
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间RNA分析，确定了CD4+组织驻留记忆Th17细胞是脊柱关节炎滑膜组织中IL-17A的主要来源 | 首次在脊柱关节炎滑膜组织中鉴定CD4+CXCR6+ TRM17细胞为主要的IL-17A产生细胞，并发现BRD1表观遗传调控因子在TRM17细胞生成中的关键作用 | 样本量相对较小（单细胞RNA测序n=11，空间RNA分析n=4），需要在更大队列中验证 | 确定脊柱关节炎滑膜组织中IL-17A的细胞来源及其调控机制 | 脊柱关节炎患者的滑膜组织和血液记忆CD4+ T细胞 | 单细胞生物学 | 脊柱关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间RNA分析, CellPhoneDB细胞通讯分析, siRNA, CRISPR | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 单细胞RNA测序：11例（5例轴性脊柱关节炎，6例银屑病关节炎）；空间RNA分析：4例银屑病关节炎 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 633 | 2025-10-06 |
Disruption of Morrbid alleviates autoinflammatory osteomyelitis in Pstpip2-deficient mice
2025-Jul-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052176
PMID:40503910
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了Morrbid基因在慢性复发性多灶性骨髓炎(CRMO)发病机制中的作用 | 首次发现Morrbid基因缺失可缓解Pstpip2缺陷小鼠的自发性炎症性骨髓炎症状 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究Morrbid基因在慢性复发性多灶性骨髓炎发病机制中的作用 | Pstpip2缺陷小鼠模型及Morrbid/Pstpip2双缺陷小鼠 | 单细胞组学 | 骨髓炎 | 单细胞转录组测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 634 | 2025-10-06 |
Inhibitor of DNA-Binding 3 Is a Novel Regulator of Limbal Epithelial Cell Migration Via the EphA2/Akt Signaling Pathway
2025-Jul-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.9.2
PMID:40590805
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研究论文 | 本研究揭示了ID3通过EphA2/Akt信号通路调控角膜缘上皮细胞迁移的新机制 | 首次发现ID3通过EphA2/Akt信号轴调控角膜上皮细胞迁移，揭示了ID3在角膜伤口愈合中的抑制作用 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步体内验证 | 探索角膜伤口愈合过程中细胞迁移的调控机制 | 角膜缘上皮细胞、hTCEpi细胞系 | 细胞生物学 | 角膜损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA转染, 划痕实验 | NA | 基因表达数据, 细胞迁移数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 635 | 2025-10-06 |
Modulation of mitochondrial dysfunction: Mechanisms and strategies for the use of natural products to treat stroke
2025-Jul-05, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00016
PMID:40618255
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综述 | 本文综述了天然产物通过调节线粒体功能障碍治疗脑卒中的机制与策略 | 系统总结了天然产物通过多靶点调控线粒体功能障碍（包括生物合成、动力学平衡、自噬、凋亡机制、氧化应激调节和线粒体转运）发挥神经保护作用的新机制 | 成分复杂性导致标准化困难、跨区域临床数据不足、缺乏长期安全性评估 | 探讨天然产物通过调节线粒体功能障碍治疗脑卒中的机制和策略 | 天然产物（如虫草素、红花黄色素A、人参皂苷Rb3等）及其对线粒体功能的调节作用 | NA | 脑卒中 | 单细胞测序、类器官模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 636 | 2025-10-06 |
Brain macrophages and pial fibroblasts promote inflammation in a hypomyelination model
2025-Jul-04, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02063-3
PMID:40615895
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研究论文 | 本研究探讨了脑巨噬细胞和软脑膜成纤维细胞在低髓鞘化模型中促进炎症的机制 | 首次揭示软脑膜成纤维细胞被招募至低髓鞘化皮层并与脑巨噬细胞建立稳定相互作用，驱动慢性炎症 | 研究基于特定基因敲除小鼠模型，在人类疾病中的直接适用性需进一步验证 | 阐明难治性神经系统疾病中慢性进行性神经功能缺损的机制 | Pdgfra条件性敲除的 neonatal 小鼠大脑皮层 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序，组织学分析 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 基因修饰 neonatal 小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 637 | 2025-10-06 |
Interleukin-32-expressing CD4+ T cells are a potentially pathogenic subset in systemic sclerosis with interstitial lung disease
2025-Jul-04, Respiratory investigation
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.resinv.2025.06.008
PMID:40617174
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，发现表达IL-32的CD4+ T细胞是系统性硬化症伴间质性肺病中的潜在致病亚群 | 首次在SSc-ILD中鉴定出IL32高表达的CD4+ T细胞亚群，并揭示其在疾病发病机制中的关键作用 | 需要进一步研究来探索IL-32的治疗潜力及其具体作用机制 | 表征SSc-ILD中CD4+ T细胞亚群的异常细胞因子产生 | 系统性硬化症伴间质性肺病患者的CD4+ T细胞 | 生物信息学 | 系统性硬化症伴间质性肺病 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13例SSc和11例健康对照肺活检样本, 18例SSc-ILD和16例健康对照外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 638 | 2025-10-06 |
Human airway submucosal gland organoids to study respiratory inflammation and infection
2025-Jul-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.05.013
PMID:40513559
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研究论文 | 本研究利用长期培养的器官芯片模型研究人类气道黏膜下腺体在呼吸道炎症和感染中的独特生理特性 | 首次分别建立表面气道上皮和黏膜下腺体器官芯片模型，发现CD13/ANPEP特异性标记SMG分泌细胞及其对冠状病毒的易感性 | 研究仅限于体外器官芯片模型，需进一步体内验证 | 研究呼吸道炎症和感染的病理生理机制 | 人类气道表面气道上皮和黏膜下腺体 | 单细胞生物学 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序 | 器官芯片 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 639 | 2025-10-06 |
Ensemblex: an accuracy-weighted ensemble genetic demultiplexing framework for population-scale scRNAseq sample pooling
2025-Jul-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03643-1
PMID:40611203
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研究论文 | 提出Ensemblex框架，通过集成四种算法实现高精度单细胞RNA测序样本解复用 | 开发了基于准确度加权的集成遗传解复用框架，显著提升高度多重化实验中的样本识别精度 | NA | 解决单细胞RNA测序中样本多重化后的供体识别问题 | 计算和实验混合的单细胞RNA测序样本 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 640 | 2025-10-06 |
An orally bioavailable BRD4 inhibitor disrupts expansion of a pathogenic epithelial-mesenchymal niche in bleomycin-induced fibrosis
2025-Jul-02, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03306-6
PMID:40604997
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研究论文 | 本研究开发了一种口服可用的BRD4抑制剂，用于治疗博来霉素诱导的肺纤维化 | 首次设计并验证了口服可用的BRD4抑制剂ZL0969在肺纤维化模型中的治疗效果 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 研究BRD4信号在肺纤维化发病机制中的作用 | C57BL6小鼠和人类IPF样本 | 分子生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类IPF样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |