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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of immune landscape in triple-negative breast cancer during neoadjuvant chemotherapy
2025-Jul-07, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00549-3
PMID:40624003
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析三阴性乳腺癌新辅助化疗过程中的免疫景观变化 | 首次在S100АMHC单核细胞群中发现髓源性抑制细胞特征并建立MDSC评分系统 | 样本量有限,需要在更大队列中验证发现 | 探究三阴性乳腺癌新辅助化疗疗效与免疫系统功能状态的关系 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 响应者和非响应者TNBC患者,以及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2025-10-06 |
Integrated bioinformatics analysis identifies CHAD association with osteoporosis and in vitro chondrogenic effects of Wogonin
2025-Jul-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05861-w
PMID:40624035
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定CHAD与骨质疏松症的关联,并验证汉黄芩素在体外对软骨形成的促进作用 | 首次采用多组学生物信息学方法识别CHAD作为骨质疏松症的潜在关键基因,并结合中药化合物进行实验验证 | 仅进行了体外初步实验验证,缺乏动物模型和临床数据支持 | 探索骨质疏松症的新型治疗靶点和中药替代疗法 | 骨质疏松症相关差异表达基因和中药化合物 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 整合生物信息学分析,分子对接,单细胞RNA测序,qRT-PCR | 分子对接模型 | 基因表达数据,化合物结构数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 583 | 2025-10-06 |
Neurogenomic and behavioral principles shape freezing dynamics and synergistic performance in Drosophila melanogaster
2025-Jul-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61313-z
PMID:40624091
|
研究论文 | 本研究通过大规模行为实验和基因组分析揭示了果蝇集体防御行为的神经基因组机制 | 首次发现果蝇群体中遗传多样性通过视觉神经元发育相关基因(Ptp99A和kirre)调控冻结行为,提出基因组水平高阶关联研究新方法 | 研究主要聚焦果蝇模型,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究集体防御行为的神经和遗传基础 | 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster) | 神经科学, 行为遗传学 | NA | GWAS, 单细胞转录组测序, 功能验证实验, 动物-计算机交互实验, 基于代理的模拟 | NA | 行为数据, 基因组数据, 转录组数据 | 大规模果蝇群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 584 | 2025-10-06 |
Novel single-cell preservation and RNA sequencing technology unlocks field studies for Plasmodium natural infections
2025-Jul-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08765-x
PMID:40624152
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研究论文 | 开发并验证了适用于疟原虫自然感染现场研究的单细胞RNA保存和测序技术 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于疟原虫自然感染现场研究,解决了在资源有限环境中开展单细胞研究的挑战 | 目前仅在恶性疟原虫中验证,尚未在其他疟原虫物种中广泛应用 | 开发适用于现场研究的疟原虫单细胞RNA保存和测序方法 | 恶性疟原虫单细胞 | 单细胞测序 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个样本,包含22,345个恶性疟原虫单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 585 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of polytranscriptomics reveals TNFSF ligand genes in pancreatic cancer prognosis and immune regulation
2025-Jul-07, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00733-4
PMID:40624624
|
研究论文 | 通过整合分析胰腺癌中的TNFSF配体基因表达模式,揭示其在预后和免疫调控中的作用 | 首次基于TNFSF配体表达谱对胰腺癌进行分子分型,并发现TNFSF4在B细胞中的特异性表达与免疫治疗反应相关 | 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证TNFSF4的具体作用机制 | 研究TNF配体超家族成员在胰腺癌中的表达模式和预后意义 | 胰腺癌患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,qRT-PCR,非负矩阵分解聚类,ssGSEA,KEGG通路分析 | NMF聚类模型,生存分析模型 | 基因表达数据,临床生存数据 | GSE212966单细胞数据集和TCGA-PAAD批量RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 586 | 2025-10-06 |
Microgravity modulates keratinocyte, fibroblast, and endothelial cell communication during wound healing
2025-Jul-06, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123842
PMID:40628314
|
综述 | 探讨微重力环境下皮肤伤口愈合过程中角质形成细胞、成纤维细胞和内皮细胞间的相互作用机制 | 首次系统阐述微重力通过调节角质形成细胞迁移、成纤维细胞增殖和内皮细胞形态基因表达影响伤口愈合的新视角 | 主要基于模拟微重力研究,缺乏真实太空环境的验证数据 | 阐明微重力对皮肤伤口愈合细胞通讯的调控机制 | 角质形成细胞、成纤维细胞、内皮细胞 | 空间生物学 | 皮肤创伤 | 单细胞转录组学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 587 | 2025-10-06 |
The reprogramming impact of SMAC-mimetic on glioblastoma stem cells and the immune tumor microenvironment evolution
2025-Jul-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03452-1
PMID:40616096
|
研究论文 | 本研究评估SMAC模拟物Xevinapant对胶质母细胞瘤干细胞和肿瘤微环境的双重调控作用 | 首次在单细胞水平系统揭示SMAC模拟物同时靶向胶质瘤干细胞并重编程免疫抑制微环境的双重机制 | 研究主要基于临床前模型,需进一步临床验证 | 开发同时靶向胶质瘤干细胞和重编程肿瘤微环境的新型胶质母细胞瘤治疗策略 | 人源和小鼠源胶质母细胞瘤干细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,活力测定,原位移植模型 | NA | 基因表达数据,生存数据 | 人源和小鼠源胶质母细胞瘤干细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 588 | 2025-10-06 |
Spotiflow: accurate and efficient spot detection for fluorescence microscopy with deep stereographic flow regression
2025-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02662-x
PMID:40481364
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习的高精度斑点检测方法Spotiflow,用于荧光显微镜图像分析 | 将斑点检测建模为多尺度热图和立体流回归问题,支持2D和3D图像,具有跨成像条件的泛化能力 | NA | 开发高效准确的斑点检测方法以提升空间转录组学分析效果 | 荧光显微镜图像中的斑点状结构 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | 立体流回归模型 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 589 | 2025-10-06 |
dbscATAC: a resource of single-cell super-enhancers/enhancers and gene markers derived from scATAC-seq data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf364
PMID:40581357
|
研究论文 | 开发了一个专门用于注释单细胞ATAC-seq数据中超级增强子、基因标记和增强子-基因相互作用的数据库资源 | 首次构建了基于scATAC-seq数据的综合性单细胞数据库,整合了改进的机器学习算法识别超级增强子和增强子-基因相互作用 | NA | 解决scATAC-seq数据中超级增强子/典型增强子和基因标记探索不足的问题,提供细胞类型特异性顺式调控元件注释资源 | 来自13个物种的1028种组织/细胞类型中的1,668,076个单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq, 机器学习 | 改进的机器学习算法 | 表观基因组数据 | 1,668,076个单细胞,涵盖1028种组织/细胞类型和13个物种 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 590 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblast-derived extracellular vesicles loaded with GLUT1 inhibitor synergize anti-PD-L1 to suppress tumor growth via degrading matrix stiffness and remodeling tumor microenvironment
2025-Jul-01, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.113998
PMID:40609836
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于癌症相关成纤维细胞来源的细胞外囊泡递送GLUT1抑制剂的新型联合免疫疗法,通过降解基质硬度和重塑肿瘤微环境来抑制肿瘤生长 | 首次利用CAFs来源的细胞外囊泡作为GLUT1抑制剂BAY-876的靶向递送载体,并证明其与抗PD-L1治疗的协同作用 | 研究主要基于小鼠肺肿瘤模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发通过靶向肿瘤微环境代谢来增强免疫治疗效果的新策略 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)、肺肿瘤细胞系、小鼠肺肿瘤模型 | 肿瘤免疫治疗 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、治疗反应数据 | 公共数据集中的单细胞RNA测序数据和小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 591 | 2025-10-06 |
The foraging gene coordinates brain and heart networks to modulate socially cued interval timing in Drosophila
2025-Jul, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011752
PMID:40627675
|
研究论文 | 本研究揭示了果蝇foraging基因通过协调大脑和心脏网络调控社交线索间隔时间行为的机制 | 首次发现foraging基因通过非神经组织(心脏)的钙动态和肽能信号调控间隔时间行为,揭示了基因在神经与非神经组织间的协同作用 | 研究主要聚焦于果蝇模型,机制在高等生物的普适性仍需验证 | 探究foraging基因在间隔时间行为调控中的多效性作用机制 | 黑腹果蝇及其foraging基因的等位基因变异体(rover和sitter) | 神经遗传学 | NA | 单细胞RNA测序,基因敲低,CaLexA钙信号检测 | NA | 基因表达数据,钙成像数据,行为数据 | 果蝇不同基因型群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 592 | 2025-10-06 |
Cellular heterogeneity and patterning strategies as revealed by upper respiratory epithelium single cell atlas
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112845
PMID:40612507
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序结合空间验证构建了小鼠上呼吸道上皮细胞图谱 | 首次结合单细胞RNA测序与空间验证揭示上呼吸道上皮细胞的18种类型及其三维空间分布模式 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 解析上呼吸道上皮细胞的异质性和空间分布模式 | 小鼠上呼吸道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组验证 | NA | 单细胞转录组数据,空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 593 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Highlights a Contribution of Human Amniotic Mesenchymal Stem Cells-Derived Exosomes to Androgenetic Alopecia
2025-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500853R
PMID:40622121
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示人羊膜间充质干细胞外泌体通过Wnt/β-catenin信号通路促进雄激素性脱发模型小鼠毛发生长的分子机制 | 首次在单细胞水平解析hAMSC-exo促进毛发生长的细胞图谱和分子机制,发现其通过增强毛囊细胞与真皮乳头细胞间的通讯并改善线粒体功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证;机制研究主要聚焦Wnt/β-catenin通路,可能存在其他未探索的调控途径 | 探索人羊膜间充质干细胞外泌体对雄激素性脱发的治疗作用及分子机制 | 雄激素性脱发模型小鼠的背部皮肤组织 | 单细胞组学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 594 | 2025-10-06 |
Impact of IKCa Channels on CD34+ Cells in Arteriole Remodeling in Angiotensin II-Induced Hypertension Model Mice
2025-Jul-09, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究探讨了IKCa通道在Ang II诱导的高血压模型中CD34+细胞介导的动脉内皮修复作用 | 首次揭示非骨髓来源的CD34+细胞通过IKCa通道调控ERK/P38信号通路参与高血压血管修复的新机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 阐明高血压条件下内皮修复的细胞分子机制 | CD34+细胞在Ang II诱导的高血压小鼠动脉重塑中的作用 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,transwell迁移实验,膜片钳技术,骨髓移植 | NA | 基因表达数据,图像数据,电生理数据 | Ang II处理的高血压模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 595 | 2025-10-06 |
Proneural-Mesenchymal hybrid glioblastoma cells are resistant to therapy and dependent on nuclear import
2025-Jul-08, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf160
PMID:40627673
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中同时表达前神经和间充质标记的混合细胞亚群对常规疗法具有耐药性 | 首次发现并表征了胶质母细胞瘤中前神经-间充质混合细胞亚群,揭示了其通过核质转运机制介导治疗抵抗的新机制 | 研究主要基于患者来源的细胞系和动物模型,临床转化价值仍需进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤细胞可塑性及其治疗抵抗的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞,特别是前神经-间充质混合细胞亚群 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ChIP测序, 核蛋白质组学, 高分辨率成像, 正交小鼠模型 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 多个患者来源的细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ChIP测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 596 | 2025-10-06 |
Peripheral immune imbalance in pediatric fulminant myocarditis revealed by single-cell sequencing and plasma proteomics
2025-Jul-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00343-5
PMID:40629105
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研究论文 | 通过单细胞测序和血浆蛋白质组学揭示儿童暴发性心肌炎的外周免疫失衡特征 | 首次系统描绘儿童暴发性心肌炎急性期和恢复期的外周免疫细胞图谱,发现多种独特细胞类型及CXCR4、S100A家族基因的广泛高表达 | 样本量有限,未明确验证IL-10和TGFB1在治疗中的具体作用机制 | 解析暴发性心肌炎的外周免疫病理机制 | 儿童暴发性心肌炎患者外周血单个核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序, TCR/BCR分析, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, TCR/BCR序列数据, 蛋白质组数据 | 儿童暴发性心肌炎患者急性期和恢复期样本 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 597 | 2025-10-06 |
Opposite regulation of intestinal and intrahepatic CD8+ T cells controls alcohol-associated liver disease progression
2025-Jul-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334412
PMID:40199574
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研究论文 | 本研究揭示了肠道和肝内CD8+ T细胞的相反调控在酒精性肝病进展中的关键作用 | 首次发现肠道和肝内CD8+ T细胞在酒精性肝病中呈现相反的变化趋势,并证明BCL2在调控这些细胞存活中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩大 | 探究肠道和肝内CD8+ T淋巴细胞在酒精性肝病中的调控机制及其贡献 | 酒精性肝病患者和野生型、CD8特异性Bcl2转基因及Cd8基因敲除小鼠 | 免疫学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 酒精性肝病患者和多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 598 | 2025-10-06 |
Regulation of revival stem cell differentiation by CREPT/RPRD1B during intestinal regeneration
2025-Jul-07, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01434-6
PMID:40624542
|
研究论文 | 本研究揭示了CREPT/RPRD1B在肠道再生过程中调控复苏干细胞分化的机制 | 首次发现CREPT/RPRD1B蛋白在肠道再生过程中对复苏干细胞分化的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需进一步验证 | 探究肠道再生过程中复苏干细胞分化的调控机制 | 小鼠肠道复苏干细胞 | 干细胞生物学 | 肠道损伤修复 | 单细胞转录组分析,谱系追踪,基因敲除 | Villin-Cre介导的CREPT敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 599 | 2025-10-06 |
Glioma promotes macrophage immunosuppressive phenotype through ANXA1 in a methionine metabolism-dependent manner
2025-Jul-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03112-y
PMID:40618309
|
研究论文 | 本研究探讨了胶质瘤中甲硫氨酸代谢与肿瘤免疫抑制微环境的关系,发现胶质瘤通过ANXA1以甲硫氨酸代谢依赖的方式促进巨噬细胞免疫抑制表型 | 首次揭示胶质瘤细胞通过甲硫氨酸代谢上调ANXA1表达,促进巨噬细胞M2极化和免疫抑制微环境形成 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,需要更多体内实验验证 | 探究甲硫氨酸代谢在胶质瘤免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 胶质瘤患者队列、胶质瘤细胞、巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 胶质瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 600 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome atlas reveals mitophagy dynamics in acute chemical injury model and the role of MSCs transplantation
2025-Jul-06, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04491-3
PMID:40619426
|
研究论文 | 通过单细胞转录组图谱揭示急性肝损伤模型中线粒体自噬动态及间充质干细胞移植的作用 | 首次构建了急性肝衰竭的单细胞转录组图谱,揭示了不同细胞类型中线粒体自噬的差异状态及MSCs治疗的调节机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的转化价值需要进一步验证 | 探索MSCs治疗急性肝衰竭过程中肝细胞和巨噬细胞中线粒体自噬的不同状态 | 健康小鼠、急性肝衰竭小鼠和人脐带间充质干细胞移植小鼠的肝组织 | 单细胞组学 | 急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组小鼠肝组织样本(健康组、ALF组、hUC-MSC移植组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |