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当前共找到 799 篇文献,本页显示第 41 - 60 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-09-01
CD206+ macrophages facilitate wound healing through interactions with Gpnmbhi fibroblasts
2025-07, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究利用小鼠模型和单细胞转录组学,揭示了CD206+巨噬细胞通过与Gpnmb高表达成纤维细胞相互作用促进伤口愈合的机制。 首次通过选择性耗竭CD206+巨噬细胞的小鼠模型结合单细胞转录组学,阐明CD206+巨噬细胞通过PDGF-A信号通路与Gpnmb高表达成纤维细胞通讯,促进其增殖和细胞外基质沉积,从而加速伤口愈合。 研究主要基于小鼠模型,人类伤口愈合中的相关机制尚需验证;此外,未深入探讨其他潜在信号通路或细胞类型在其中的作用。 探究CD206+巨噬细胞在伤口愈合过程中的具体作用机制,特别是其与成纤维细胞的相互作用。 CD206+巨噬细胞和Gpnmb高表达成纤维细胞在小鼠伤口愈合中的相互作用。 单细胞转录组学 伤口愈合障碍 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
42 2026-08-31
T Cells Enhance Tissue Complexity and Function to Study Fibrosis in 3D Skin-Like Tissue Models
2025-07, Tissue engineering. Part C, Methods
研究论文 开发了包含T细胞的三维皮肤样组织模型,通过单细胞RNA测序等技术研究T细胞在纤维化中的作用 首次构建了包含自体或异体T细胞的三维皮肤样组织模型,结合scRNA-seq鉴定出五种T细胞亚群,弥补了单层培养与动物模型之间的差距 未明确提及局限性,可能包括模型复杂度有限及体内验证不足 研究T细胞在组织纤维化发病机制中的作用,建立更预测性的三维模型用于临床前药物筛选和纤维化疾病的机制研究 皮肤样组织中的T细胞、成纤维细胞、巨噬细胞和角质形成细胞,以及来自硬皮病患者的细胞 数字病理学 硬皮病 单细胞RNA测序 三维组织模型 单细胞基因表达数据及组织图像 来自硬皮病患者的细胞构建的组织模型,具体样本数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
43 2026-08-29
MatriCom, a single-cell RNA-sequencing data mining tool to infer cell-extracellular matrix interactions
2025-07-01, Journal of cell science IF:3.3Q3
研究论文 介绍MatriCom,一个基于单细胞RNA测序数据挖掘工具,用于推断细胞与细胞外基质(ECM)之间的相互作用。 开发了独特的MatriComDB数据库,包含超过25,000个经过整理的涉及基质组分的相互作用,并考虑ECM蛋白相互作用的特定规则。 未在摘要中明确提及限制。 提供一种从单细胞RNA测序数据推断ECM组分之间及不同细胞群体与ECM之间通讯的方法。 人类肾脏组织及46个健康成人组织的scRNA-Seq数据集。 生物信息学 不适用 单细胞RNA测序 不适用 基因表达数据 1个人类肾脏和46个健康成人组织的scRNA-Seq数据集 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
44 2026-08-27
A Novel 14-Gene Panel Associated With Efferocytosis for Predicting Pancreatic Cancer Prognosis Through Bulk and Single-Cell Databases
2025-07-30, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过综合批量转录组和单细胞RNA测序数据,识别出一个与胞葬作用相关的14基因预后特征,简称“14基因面板”,用于预测胰腺导管腺癌的预后。 首次将胞葬作用相关基因整合到14基因预后面板中,并利用深度学习和随机生存森林算法识别关键基因,结合单细胞和实验验证方法,提供了新的预后标志物和潜在治疗靶点。 未提供明确的局限性,但未来研究需探索调控这些相互作用以开发新的治疗机会。 评估胞葬作用对胰腺导管腺癌进展的影响,并基于此构建预后模型。 胰腺导管腺癌中的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞。 机器学习 胰腺癌 批量RNA-seq和单细胞RNA-seq Cox回归、LASSO回归、随机生存森林 基因表达数据、单细胞数据、图像数据(免疫组化和多重免疫荧光) 样本量未明确,但涉及TCGA和GEO数据库的数据 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
45 2026-08-26
Macrophage polarization-mediated PKM2/mTORC1/YME1L signaling pathway activation in fibrosis associated with Cardiorenal syndrome
2025-07, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了巨噬细胞极化介导的PKM2/mTORC1/YME1L信号通路在心肾综合征相关肾纤维化中的作用 首次阐明HIF-1α诱导的M1巨噬细胞极化通过PKM2/mTORC1/YME1L轴驱动肾纤维化的机制,并验证了靶向HIF-1α的治疗潜力 未提及具体局限性 探究巨噬细胞极化及其下游信号在心肾综合征诱导的肾纤维化中的作用机制,并评估潜在治疗靶点 心肾综合征小鼠模型及相关的巨噬细胞和肾上皮细胞 机器学习 心肾综合征 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因编辑、慢病毒载体、免疫浸润分析、Meta分析、拟时间分析 NA 单细胞转录组数据、组织学图像 未提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
46 2026-08-25
SPaSE: Spatially resolved pathology scores using optimal transport on spatial transcriptomics data
2025-07-16, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 介绍了一种基于最优传输的空间转录组数据分析算法SPaSE,用于计算疾病组织每个点的病理评分,并在小鼠心肌梗死、脑外伤和杜氏肌营养不良模型及人类心肌梗死数据上验证了其有效性 首次将最优传输理论应用于空间转录组数据的病理评分,实现了无监督的疾病区域识别和严重程度量化,且模型可跨物种转移 对模拟数据和部分真实数据的验证有限,评分可能受组织样本质量影响,且未提供与传统方法的全面比较 开发一种空间转录组数据分析方法,以量化疾病组织中的病理影响并识别相关分子特征 小鼠心肌梗死、脑外伤和杜氏肌营养不良模型及人类心肌梗死样本的空间转录组数据 空间转录组学 心肌梗死、脑外伤、杜氏肌营养不良 空间转录组测序 最优传输算法 基因表达数据(空间转录组) 包含多个小鼠模型和人类样本,具体数量未在摘要中给出 NA 空间转录组学 NA NA
47 2026-08-25
Resolving the design principles that control post-natal vascular growth and scaling
2025-07-16, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 本研究通过多尺度实验和计算方法,揭示了出生后主动脉生长的设计原理,包括两波与血流对齐的增殖、细胞代谢变化及细胞挤压在维持血管大小中的关键作用 首次揭示主动脉生长遵循与脊柱成比例的独特原则,并通过单细胞RNA测序和数学模型结合,阐明了内皮细胞挤压在调节血管大小中的新机制 研究主要基于小鼠模型,可能不直接适用于人类;未深入探讨其他血管或器官的生长差异 解析出生后血管生长和比例控制的生物学原理,特别是主动脉生长的细胞动力学和分子机制 小鼠主动脉及其内皮细胞,以及软骨发育不全小鼠模型 生物信息学, 计算生物学, 单细胞测序 心血管疾病, 软骨发育不全 单细胞RNA测序, 数学建模 计算模型 单细胞基因表达数据, 实验测量数据 未提供具体样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
48 2026-08-23
DGAT: A Dual-Graph Attention Network for Inferring Spatial Protein Landscapes from Transcriptomics
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出了一种名为DGAT的双图注意力网络,用于从转录组数据推断空间蛋白质表达谱 首次通过构建整合转录组、蛋白质组和空间信息的异构图,并利用图注意力网络从仅含转录组的空间数据中推断蛋白质表达 未在摘要中明确提及局限性 弥合空间转录组学缺乏蛋白质测量的关键空白,实现从转录组数据中获得蛋白质层面的见解,增强癌症、免疫学和精准医学中的功能解读 扁桃体、乳腺癌、胶质母细胞瘤和恶性间皮瘤的空间转录组数据集及相应的空间CITE-seq数据集 机器学习和空间组学 乳腺癌、胶质母细胞瘤、恶性间皮瘤 空间CITE-seq 图注意力网络 空间转录组数据、蛋白质表达数据、空间信息 多个公共和内部数据集 未明确提及 空间转录组学、空间CITE-seq 未明确提及 未明确提及
49 2026-08-23
Boosting data interpretation with GIBOOST to enhance visualization of complex high-dimensional data
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出GIBOOST框架,通过贝叶斯方法和优化自编码器整合多个降维方法,提升高维单细胞数据可视化和解释能力 首次利用贝叶斯框架和GI优化自编码器系统整合多个降维方法的输出,自动选择最优组合,显著提高聚类敏感性和生物学相关性 主要依赖降维方法输出,可能对极大数据集计算开销较大,且需要已知生物学过程进行验证 开发一种AI驱动框架,增强复杂高维单细胞数据的可视化和可解释性,保留全局与局部结构 单细胞RNA-seq数据集,包括上皮-间质转化、CiPSC重编程、精子发生和胎盘发育等动态生物学过程 机器学习 NA 单细胞RNA测序 自编码器、贝叶斯模型 基因表达数据 包含约400,000个细胞,28种细胞类型,来自七个胎盘区域的数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
50 2026-08-22
Deficiency of NPR-C triggers high salt-induced thoracic aortic dissection by impairing mitochondrial homeostasis
2025-07-08, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了NPR-C缺失在高盐诱导的胸主动脉夹层中的作用机制,发现其通过调节线粒体稳态发挥保护作用 首次揭示NPR-C在胸主动脉夹层中的保护作用,并阐明其通过ERK1/2-PPARγ-HADHB通路调控线粒体脂肪酸氧化的新机制 未明确说明研究的局限性 探究NPR-C在胸主动脉夹层发病机制中的作用及其分子机制 人类急性胸主动脉夹层患者主动脉组织、BAPN处理小鼠、NPR-C特异性敲除小鼠(VSMC和内皮细胞)、血管平滑肌细胞 数字病理学 胸主动脉夹层 转录组测序、单细胞测序、RNA-seq NA 基因表达数据、单细胞数据、组织病理图像 人类患者样本和多种小鼠模型,具体数量未明确 NA NA NA NA
51 2026-08-21
Single-cell transcriptomic analysis identifies systemic immunosuppressive myeloid cells and local monocytes/macrophages as key regulators in polytrauma-induced immune dysregulation
2025-Jul-07, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析,识别多发性创伤诱导的免疫失调中系统性免疫抑制性髓系细胞和局部单核细胞/巨噬细胞的关键作用 同时分析全身(外周血)和局部(损伤部位软组织和骨髓)的免疫细胞,识别出创伤相关的免疫抑制性髓系细胞群和CD1d及Spp1单核细胞/巨噬细胞亚群,以及Anxa1-Fpr2和Spp1-Cd44信号轴 研究基于大鼠模型,其与人类情况的差异可能影响临床转化;且仅分析了特定时间点,未涉及动态变化 理解多发性创伤导致的免疫失调及其相关骨愈合障碍的细胞和分子机制 大鼠多发性创伤模型中的血液、骨髓和局部缺损软组织免疫细胞 单细胞转录组学 多发性创伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞基因表达数据 大鼠多发性创伤模型,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2026-08-21
Large-scale dependency and drug screens to characterize the therapeutic vulnerabilities of multiple myeloma with 1q
2025-07-03, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过大规模依赖性筛选和药物筛选,系统表征了伴有1q染色体异常的复发骨髓瘤的治疗脆弱性,并发现对MCL1和PI3K抑制剂敏感性增强 首次通过大规模依赖性筛选和药物筛选,结合单细胞RNA测序和同基因克隆模型,系统揭示了1q+骨髓瘤对MCL1和PI3K抑制剂的增强敏感性及协同作用机制 研究主要基于体外细胞系和患者样本,缺乏体内验证;1q+亚克隆的比较可能受样本异质性影响 系统表征伴有1q染色体异常的复发骨髓瘤的治疗脆弱性,以开发针对性治疗策略 伴有1q染色体异常的多发性骨髓瘤细胞系和患者样本 数字病理学 多发性骨髓瘤 大规模依赖性筛选、药物筛选、单细胞RNA测序 NA 基因依赖性数据、药物反应数据、单细胞转录组数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
53 2026-08-21
IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes
2025-07-03, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示IFN-γ通过激活炎症性单核细胞促进特发性多中心Castleman病(iMCD)的进展 首次在iMCD中阐明IFN-II信号通路在驱动外周炎症风暴中的关键作用,并发现血清IFN-γ水平与疾病严重程度及治疗耐药性正相关,为预后评估和治疗靶点提供新见解 样本量相对较小,且未包含功能验证实验,需进一步验证IFN-γ通路抑制剂的临床潜力 深入理解iMCD患者的免疫景观,以建立早期预后分层并发现新的治疗靶点 15名iMCD患者和4名健康对照的外周血单核细胞(PBMCs),以及部分淋巴结和骨髓样本 单细胞转录组学 特发性多中心Castleman病 单细胞RNA测序,CellChat分析 NA 单细胞转录组数据 15名iMCD患者和4名健康对照的PBMCs,以及淋巴结和骨髓样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
54 2026-08-21
Single-cell transcriptional profiling reveals cellular senescence and inflammatory persistence as key features of type 1 diabetes partial remission
2025-07, Diabetes, obesity & metabolism
研究论文 利用单细胞RNA测序技术,研究1型糖尿病部分缓解期外周血单核细胞的转录特征,揭示细胞衰老和炎症持续是部分缓解期关键特征 首次通过单细胞转录组分析揭示1型糖尿病部分缓解期中单核细胞衰老和炎症持续存在的新特征,识别出IL1B+单核细胞扩增和HDAC9+群体减少等新的免疫失调标志 摘要未提及研究局限性 探究1型糖尿病部分缓解期外周血单核细胞的免疫机制,寻找潜在治疗靶点 健康对照、新诊断T1D患者和部分缓解期患者的单核细胞 单细胞转录组学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未具体说明样本数量,涉及健康对照、新诊断T1D和部分缓解期患者的外周血单核细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
55 2026-08-21
A visual-omics foundation model to bridge histopathology with spatial transcriptomics
2025-Jul, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 开发了OmiCLIP视觉组学基础模型,将组织学图像与空间转录组数据整合,并构建了Loki平台提供多种功能 首次将H&E图像与转录组数据通过视觉-组学基础模型进行整合,采用将转录组数据转换为句子形式的方法,并构建了大规模配对数据集 未提及 弥合组织病理学与空间转录组学之间的鸿沟,实现图像与转录组数据的联合分析 来自32个器官的220万对组织图像和转录组数据 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 基础模型(如OmiCLIP) 图像, 文本(基因符号序列) 220万对组织图像和转录组数据,覆盖32个器官 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 使用10x Visium数据生成组织斑块
56 2026-08-21
Mobilizing antigen-presenting mast cells in anti-PD-1-refractory triple-negative breast cancer: a phase 2 trial
2025-Jul, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 该研究通过单细胞转录组分析揭示了肥大细胞异质性对抗PD-1治疗三阴性乳腺癌疗效的影响,并启动了一项针对抗PD-1难治性转移性三阴性乳腺癌的2期临床试验,结果显示色甘酸钠联合抗PD-1治疗的客观缓解率达到50%。 首次发现抗原呈递肥大细胞(apMCs)在三阴性乳腺癌中对抗PD-1治疗反应的关键作用,并利用色甘酸钠这一常用抗过敏药物增强apMC介导的T细胞免疫,从而克服抗PD-1耐药,提供了逆转转化的精准免疫肿瘤学框架。 主要局限包括2期临床试验样本量较小,且仅针对女性患者,以及尚未进行头对头比较或更长时间随访。 探索三阴性乳腺癌抗PD-1耐药的机制并评估新策略的临床疗效和安全性。 三阴性乳腺癌患者,包括44名初治患者和484名验证队列,以及2期临床试验中的抗PD-1难治性转移性三阴性乳腺癌女性患者。 基因组学, 肿瘤学 三阴性乳腺癌 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据、临床数据 44名初治患者和484名验证患者,以及2期临床试验中抗PD-1难治性转移性三阴性乳腺癌女性患者(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
57 2026-08-20
Interpretable machine learning-guided single-cell mapping deciphers multi-lineage pancreatic dysregulation in type 2 diabetes
2025-07-24, Cardiovascular diabetology IF:8.5Q1
研究论文 本研究利用可解释机器学习指导的单细胞测序分析,揭示了2型糖尿病中胰腺多谱系的失调机制 开发了两种新型工具PanSubPred(两阶段特征选择/XGBoost分类器)和PSC-Stat(XGBoost/Gini优化),实现了多谱系细胞注释和星状细胞活化分析,发现了64个细胞类型特异性标记物(其中38个为新发现)和15基因糖尿病导管细胞特征 未提及明确的局限性 利用机器学习框架解码胰腺细胞异质性,系统绘制糖尿病中的胰腺细胞改变图谱 2型糖尿病患者的胰腺细胞,包括β细胞、腺泡细胞、导管细胞和星状细胞等 机器学习 2型糖尿病 单细胞RNA测序 XGBoost分类器 单细胞转录组数据 未在摘要中明确说明具体样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
58 2026-08-19
NRF2 modulates WNT signaling pathway to enhance photodynamic therapy resistance in oral leukoplakia
2025-07, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和验证队列,发现NRF2通过激活WNT信号通路增强口腔白斑的光动力治疗耐药性,并证实NRF2抑制可提高PDT疗效。 首次揭示NRF2通过促进CTNNB1转录激活WNT信号通路,调控活性氧反应和角化过程,从而介导口腔白斑的PDT耐药性,并确立p-NRF2作为预测治疗反应的生物标志物。 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、机制验证主要依赖小鼠模型等。 识别驱动口腔白斑PDT耐药性的关键调控通路,并评估NRF2作为预测和干预靶点的潜力。 口腔白斑组织样本(3例PDT敏感、3例PDT耐药)、两个独立验证队列(n=117)、4NQO诱导的OLK小鼠模型。 数字病理学 口腔白斑 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、临床病理数据、小鼠模型组织学数据 单细胞测序6例,验证队列117例,小鼠模型未明确数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
59 2026-08-18
T-cell differentiation stage block bias confers hypermethylation and mediastinal preference in T-cell lymphoblastic lymphoma
2025-07, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过多组学数据对比T细胞淋巴母细胞淋巴瘤(T-LBL)与T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL),揭示T-LBL恶性T细胞主要在DN和DP阶段阻滞,导致免疫抑制微环境及纵隔偏好,并通过E2F2上调UHRF1引起肿瘤抑制基因高甲基化,去甲基化治疗可有效抑制肿瘤增殖 首次从分化阻滞阶段偏倚的角度阐明T-LBL与T-ALL的差异,发现DN/DP阶段阻滞与纵隔偏好及免疫抑制微环境的关联,并揭示E2F2-UHRF1轴驱动的高甲基化机制及去甲基化治疗潜力 尚未提及具体局限性 探讨T-LBL与T-ALL在分化阻滞阶段上的差异及其对临床表现、微环境和治疗反应的影响 T-LBL和T-ALL患者样本,包括来自NCH-TALL-LBL队列的流式细胞术数据和体细胞突变数据,以及T-LBL样本的单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据 数字病理学 T细胞淋巴母细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、表达阵列、流式细胞术 NA 基因表达数据、突变数据、单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序 NA NA
60 2026-08-18
IGF2BP2 binding to CPSF6 facilitates m6A-mediated alternative polyadenylation of PUM2 and promotes malignant progression in ovarian cancer
2025-07, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了卵巢癌中m6A修饰通过IGF2BP2与CPSF6的相互作用调控PUM2的替代性多聚腺苷酸化,从而促进肿瘤恶性进展的机制 首次阐明m6A通过IGF2BP2与CPSF6的交叉对话调控前体mRNA的APA加工,并鉴定PUM2为关键靶基因,其短3'UTR转录本更稳定并促进卵巢癌恶性进展 未提及 探究卵巢癌中m6A依赖的APA调控机制及其在肿瘤进展中的作用 卵巢癌细胞及临床样本 基因组学 卵巢癌 RNA甲基化测序、单细胞测序、RNA pull-down、免疫沉淀、质谱、Western blot、蛋白质纯化、GST pull-down、PAS-seq、eCLIP-seq、RIP-seq、meRIP-seq、RT-qPCR、3'RACE、RNA稳定性分析、双荧光素酶报告基因 NA 测序数据、蛋白质互作数据、基因表达数据 NA NA NA NA NA
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