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当前共找到 797 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-06 |
Duchenne Muscular Dystrophy Patient iPSCs-Derived Skeletal Muscle Organoids Exhibit a Developmental Delay in Myogenic Progenitor Maturation
2025-Jul-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14131033
PMID:40643552
|
研究论文 | 本研究利用杜氏肌营养不良症患者iPSCs衍生的3D骨骼肌类器官系统，揭示了肌源性祖细胞成熟发育延迟的现象 | 首次使用3D骨骼肌类器官系统模拟DMD疾病，发现肌源性祖细胞存在发育成熟延迟的创新发现 | 研究仅使用三个DMD患者iPSC系和两个非等基因健康对照，样本量有限 | 研究杜氏肌营养不良症中骨骼肌再生能力受损的机制 | 杜氏肌营养不良症患者iPSCs衍生的骨骼肌类器官 | 干细胞与类器官研究 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序，3D类器官培养 | 3D骨骼肌类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 三个DMD患者iPSC系和两个非等基因健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 542 | 2025-10-06 |
TriCLFF: a multi-modal feature fusion framework using contrastive learning for spatial domain identification
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf316
PMID:40639417
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研究论文 | 提出基于对比学习的多模态特征融合框架TriCLFF，用于空间转录组数据中的空间域识别 | 开发了基于对比学习的多模态特征融合框架，能有效整合空间关联、基因表达水平和组织学特征 | NA | 开发空间转录组数据分析方法，实现精确的空间域识别 | 小鼠大脑前部、小鼠嗅球、人背外侧前额叶皮层和人乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 对比学习 | 空间多模态数据 | 四个数据集 | 10x Genomics, BGI | 空间转录组学 | 10x Visium, Stereo-seq | 10x Visium空间转录组平台，Stereo-seq空间转录组技术 |
| 543 | 2025-10-06 |
High-resolution transcriptome atlas of bladder cancer highlights the functional myeloid subsets in modulating immune microenvironment
2025-Jul, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105801
PMID:40561775
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了膀胱癌中髓系细胞的功能亚群及其在调节肿瘤微环境中的作用 | 首次系统描绘了膀胱癌中TREM2+巨噬细胞和CMA1+肥大细胞等髓系细胞亚群的功能状态，并发现TREM2和APP作为免疫调节分子的新功能 | 样本量相对较小（11例患者），需要在更大队列中验证研究结果 | 深入探索膀胱癌肿瘤微环境中髓系细胞的功能特征和免疫调节机制 | 膀胱癌患者的肿瘤组织和正常膀胱组织，以及体外培养细胞和小鼠肿瘤模型 | 单细胞生物学 | 膀胱癌 | 单细胞转录组测序，密度梯度离心，体外培养，小鼠肿瘤模型，去卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例膀胱癌患者的配对肿瘤和正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 544 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Alternative Splicing and Gene Regulatory Network Reveals Remarkable Expression and Regulation Dynamics During Human Early Embryonic Development
2025-Jul, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2025-00075
PMID:40641848
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研究论文 | 通过整合基因表达水平、选择性剪接、异构体转换和基因调控网络，系统研究人类早期胚胎发育中的基因表达动态 | 首次在单细胞水平系统整合基因表达、选择性剪接和调控网络分析人类早期胚胎发育动态 | 仅关注E3到E7阶段的胚胎发育，未涵盖更广泛的发育时期 | 揭示人类早期胚胎发育过程中基因表达的动态特征 | 人类早期胚胎（E3-E7阶段） | 单细胞组学 | 发育生物学 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | E3到E7阶段人类胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 545 | 2025-10-06 |
Prognostic Value of TBC1D1 and Its Relationship With the Tumor Microenvironment in Pancreatic Cancer: A Study Based on Single-Cell Sequencing
2025-Jul, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2025-00092
PMID:40641846
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研究论文 | 本研究评估TBC1D1在胰腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境的关系 | 首次通过单细胞测序技术系统分析TBC1D1在胰腺癌不同细胞群体中的表达分布及其与肿瘤微环境的关联 | 样本量相对有限（168例患者），需要更大规模研究验证结果 | 评估TBC1D1在胰腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胰腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | 168例胰腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 546 | 2025-10-06 |
Human neuron subtype programming via single-cell transcriptome-coupled patterning screens
2025-Jul-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adn6121
PMID:40638726
|
研究论文 | 通过单细胞转录组耦合模式筛选实现人类神经元亚型编程 | 结合形态发生素信号调控与转录因子过表达，首次系统筛选480种信号调节组合，通过单细胞转录组分析揭示神经元多样性 | 研究基于体外干细胞分化模型，与体内真实发育环境存在差异 | 探索人类神经元亚型编程的多样性及其调控机制 | 人多能干细胞分化的神经元 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 700,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 547 | 2025-10-06 |
Advancements in single-cell techniques for examining the HIV reservoir: pathways to a cure
2025-Jul-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00655-25
PMID:40488537
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在HIV病毒储存库研究中的进展及其对治愈策略的推动作用 | 系统总结了单细胞测序、染色质可及性分析和多组学技术在研究HIV病毒储存库异质性和持久性机制中的应用 | NA | 探讨单细胞技术在揭示HIV病毒储存库特征和开发治愈策略中的应用 | HIV病毒储存库细胞，主要是静息CD4 T细胞和巨噬细胞等长寿细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞测序，染色质可及性分析，多组学技术 | NA | 基因组，转录组，表观基因组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学 | NA | NA |
| 548 | 2025-10-06 |
Identification of a novel ferroptosis-induced immunogenic cell death related signature based on a machine learning framework in colorectal cancer
2025-Jul-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03147-1
PMID:40632358
|
研究论文 | 基于机器学习框架开发了铁死亡诱导的免疫原性细胞死亡相关特征，用于预测结直肠癌预后和肿瘤免疫环境 | 首次结合铁死亡和免疫原性细胞死亡开发特征模型，采用101种机器学习算法和WGCNA分析识别关键基因 | 外部验证数据集的AUC值相对较低(0.61和0.58)，需要更多临床验证 | 探索铁死亡与免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的联合调控作用 | 结直肠癌患者样本 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序，机器学习算法，WGCNA分析，DESeq2差异分析 | RSF随机生存森林算法 | 转录组数据 | 多个数据集，包含正常和肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 549 | 2025-10-06 |
Leveraging machine learning models to evaluate immune infiltration in the ovarian cancer microenvironment: a single-cell analysis approach
2025-Jul-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03018-9
PMID:40632369
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研究论文 | 本研究利用机器学习模型和单细胞RNA测序数据评估卵巢癌微环境中的免疫浸润状态 | 首次在单细胞水平构建机器学习模型预测卵巢癌免疫浸润状态，相比传统免疫评分方法具有更高准确性 | 研究基于公共数据库数据，缺乏前瞻性临床验证 | 建立客观的卵巢癌免疫浸润评估模型，为个体化免疫治疗提供依据 | 卵巢癌肿瘤微环境中的免疫细胞 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | RandomForest, SVM | 基因表达数据 | 多个公共数据库中的卵巢癌样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 550 | 2025-10-06 |
Therapeutic targeting of FOSL1 and RELA-dependent transcriptional mechanisms to suppress pancreatic cancer metastasis
2025-Jul-09, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07810-x
PMID:40634284
|
研究论文 | 本研究揭示了炎症信号通路与致癌信号通路通过FOSL1和RELA转录因子协同促进胰腺癌转移的新机制 | 首次发现TNFα和EGF信号通过激活NF-κB和AP-1转录因子协同调控胰腺癌转移，并证明糖皮质激素受体激动剂可抑制此过程 | 对炎症和致癌信号在胰腺癌转移表观遗传调控中的联合作用机制理解仍不充分 | 探索胰腺癌转移的分子机制并开发治疗策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，体外和体内模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 551 | 2025-10-06 |
Triggering AHR resolves TGF-β1 induced fibroblast activation and promotes AT1 cell regeneration in alveolar organoids
2025-Jul-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08446-5
PMID:40634525
|
研究论文 | 本研究通过高通量筛选发现化合物DB-11-BE87可通过激活AHR通路抑制TGF-β1诱导的成纤维细胞活化，促进肺泡类器官中AT1细胞再生 | 首次建立TGF-β1依赖性AT1球体形成障碍的3D类器官模型，并通过高通量筛选发现AHR激活可对抗病理性的TGF-β1信号 | 研究基于体外类器官模型，尚未进行体内验证 | 探索促进病理条件下肺泡上皮再生的方法 | 肺泡类器官、AT2细胞、AT1细胞、成纤维细胞 | 再生医学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序、高通量筛选、3D类器官培养 | 3D类器官模型 | 基因表达数据 | 约16,800种化合物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 552 | 2025-10-06 |
Liver-specific expression of ANGPTL8 promotes Alzheimer's disease progression through activating microglial pyroptosis
2025-Jul-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03487-3
PMID:40634935
|
研究论文 | 本研究揭示肝脏特异性表达的ANGPTL8通过激活小胶质细胞焦亡加速阿尔茨海默病进展的分子机制 | 首次发现ANGPTL8能够穿越血脑屏障与PirB/LILRB2受体结合，通过激活NLRP3炎症小体诱导小胶质细胞焦亡 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究ANGPTL8在阿尔茨海默病进展中的具体作用机制 | ANGPTL8基因敲除小鼠和5×FAD阿尔茨海默病模型小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 透射电子显微镜, 腺相关病毒转染 | 动物模型 | 基因表达数据, 行为学数据, 组织染色图像 | 多组小鼠队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 553 | 2025-10-06 |
Telomeric repeat-containing RNA increases in aged human cells
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf597
PMID:40637232
|
研究论文 | 本研究通过全长TERRA测序揭示了端粒RNA的转录特征及其与人类衰老和疾病的关联 | 首次在T2T-CHM13参考基因组中注释TERRA转录区域，开发TERRA-QUANT量化工具，发现TERRA在衰老和阿尔茨海默病早期阶段上调 | TERRA完整序列解析仍存在技术挑战，样本类型和数量有限 | 研究端粒重复序列RNA在人类衰老和疾病中的作用机制 | 人类血液细胞、脑组织、成纤维细胞、白细胞、神经元和胚胎干细胞 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | TERRA捕获RNA测序, Oxford Nanopore直接RNA测序, 单细胞RNA测序, 逆转录定量PCR | NA | RNA测序数据 | 多种人类组织样本（血液、脑、成纤维细胞等） | Oxford Nanopore | 直接RNA测序, 单细胞RNA测序 | Oxford Nanopore直接RNA测序平台 | Oxford Nanopore直接RNA测序技术 |
| 554 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Clarifies Pathological Heterogeneity in Tenosynovial Giant Cell Tumor and Identifies Biomarkers for Predicting Disease Recurrence
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415835
PMID:40126353
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析弥漫型和局限型腱鞘巨细胞瘤的病理异质性，并鉴定预测疾病复发的生物标志物 | 首次在单细胞水平揭示D-TGCT中独特的肿瘤细胞亚群通过COL6A3-(ITGAV+ITGB8)相互作用调控成纤维细胞分化，并发现ROR1和PRKD1作为预测复发的生物标志物 | NA | 阐明腱鞘巨细胞瘤的病理异质性机制并寻找预测疾病复发的生物标志物 | 人类弥漫型和局限型腱鞘巨细胞瘤病变组织 | 单细胞组学 | 腱鞘巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2025-10-06 |
CeiTEA: Adaptive Hierarchy of Single Cells with Topological Entropy
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503539
PMID:40245302
|
研究论文 | 提出基于拓扑熵的自适应层次聚类算法CeiTEA，用于分析单细胞RNA测序数据中的细胞层次结构 | 通过最小化拓扑熵构建多叉划分树，结合自下而上的层次构建和自上而下的局部多样化策略 | NA | 解决现有聚类方法难以捕捉细胞类型复杂层次结构的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型 | 生物信息学 | 肿瘤异质性 | 单细胞RNA测序 | 自适应层次聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | 模拟和真实世界scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 556 | 2025-10-06 |
CellNEST reveals cell-cell relay networks using attention mechanisms on spatial transcriptomics
2025-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02721-3
PMID:40481363
|
研究论文 | 开发了基于注意力机制的空间转录组学工具CellNEST，用于检测细胞间中继网络通信 | 提出新型中继网络通信检测方法，能够识别配体-受体-配体-受体级联通信模式 | 未在摘要中明确说明 | 解码细胞间通信模式，解决现有方法假阳性率高、无法检测单个细胞间信号的问题 | 人类淋巴结、肺腺癌、结直肠癌和胰腺癌组织 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 注意力机制神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 557 | 2025-10-06 |
Understanding disease-associated metabolic changes in human colonic epithelial cells using the iColonEpithelium metabolic reconstruction
2025-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013253
PMID:40609069
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研究论文 | 本研究构建了首个结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，用于解析炎症性肠病相关的代谢变化 | 创建了首个结肠上皮细胞特异性代谢模型，包含独特的转运反应区室用于模拟与肠道微生物组的代谢相互作用 | 仅提供初步概念验证，需要进一步实验验证和模型完善 | 理解人类结肠上皮细胞在疾病状态下的代谢变化 | 人类结肠上皮细胞 | 代谢组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，基因组尺度代谢建模 | 基因组尺度代谢模型 | 基因表达数据 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 558 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Uncovers La Ribonucleoprotein 6 (LARP6) as a Dual Regulator of Proliferation and Immune Infiltration in Triple-Negative Breast Cancer
2025-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70709
PMID:40635123
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现LARP6在三阴性乳腺癌中作为增殖和免疫浸润的双重调节因子 | 首次发现LARP6在三阴性乳腺癌中特异性高表达，并揭示其在细胞增殖和肿瘤免疫微环境中的双重调控作用 | 研究基于已发表的数据库，需要进一步实验验证LARP6的具体作用机制 | 识别三阴性乳腺癌特异性标志物并探索其生物学功能 | 乳腺癌细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 生存分析, TriCycle分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过260,000个细胞，来自ER阳性、HER2阳性和三阴性乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 559 | 2025-10-06 |
ATF3 Deficiency Exacerbates Ageing-Induced Atherosclerosis and Clinical Intervention Strategy
2025-Jul-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502249
PMID:40641410
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研究论文 | 本研究揭示了ATF3在血管平滑肌细胞衰老和动脉粥样硬化中的保护作用及其分子机制 | 发现ATF3-ATG7正反馈放大环路调控自噬，并首次提出特唑嗪可通过稳定ATF3 mRNA延缓血管衰老 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 识别血管平滑肌细胞衰老调控因子并开发衰老相关动脉粥样硬化的临床干预策略 | 人动脉粥样硬化颈动脉、血管平滑肌细胞、SMC特异性ATF3敲除小鼠 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, CUT&Tag-seq, m6A表观转录组分析, 高通量虚拟筛选 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 表观遗传学分析 | NA | NA |
| 560 | 2025-10-06 |
Androgen Receptor Governs Tip Cell Formation in Cerebrovascular Malformations
2025-Jul-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326471
PMID:40641462
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了雄激素受体在脑血管畸形尖端细胞形成中的关键作用 | 发现了不依赖雄激素的AR介导的内皮细胞出芽新模式，并验证了AR降解剂ARD-2585的治疗潜力 | 样本量相对有限（13例患者样本），且主要基于小鼠模型验证 | 探究脑血管畸形中异常血管生成的调控机制 | 人类脑血管畸形样本（脑海绵状畸形和脑动静脉畸形）及相应小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 脑血管畸形 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，体外功能实验，动物模型验证 | NA | 单细胞转录组数据 | 13例人类脑血管畸形样本（10例脑海绵状畸形，3例脑动静脉畸形）和13例对照脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |