单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 845 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-10-06 |
Emerging Techniques of Translational Research in Immuno-Oncology: A Focus on Non-Small Cell Lung Cancer
2025-Jul-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132244
PMID:40647543
|
综述 | 本文重点介绍免疫肿瘤学中用于改善非小细胞肺癌诊疗精度的新兴转化研究技术 | 聚焦人工智能、液体活检等创新诊断工具在解码肿瘤微环境相互作用机制中的应用 | NA | 优化非小细胞肺癌个性化治疗策略 | 非小细胞肺癌患者 | 自然语言处理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 液体活检 | 机器学习, 深度学习 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2025-10-06 |
Emerging Therapeutic Strategies Targeting GPX4-Mediated Ferroptosis in Head and Neck Cancer
2025-Jul-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136452
PMID:40650229
|
综述 | 本文综述了靶向GPX4介导的铁死亡在头颈癌治疗中的新兴策略 | 系统阐述了GPX4在铁死亡中的核心调控机制及其在治疗耐药头颈癌中的靶向价值 | 药物递送、毒性和耐药机制等挑战仍需解决，目前主要基于临床前数据 | 探索靶向GPX4介导的铁死亡作为克服头颈癌治疗耐药的新策略 | 头颈癌及其治疗耐药亚型 | 肿瘤治疗学 | 头颈癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 503 | 2025-10-06 |
Stratification of Hepatocellular Carcinoma Using N6-Methyladenosine
2025-Jul-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132220
PMID:40647517
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于m6A相关基因的八基因风险模型，用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗效果 | 首次利用m6A相关基因构建肝细胞癌风险分层模型，并系统评估其与免疫治疗疗效的关联 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要更多前瞻性研究验证模型的临床应用价值 | 开发基于m6A相关基因的肝细胞癌预后和免疫治疗疗效预测模型 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，LASSO Cox回归，多元Cox回归，体外实验 | 风险评分模型 | 转录组数据，临床数据，单细胞转录组数据 | 485例HCC患者（TCGA-LIHC和GSE76427），外加ICGC外部验证队列 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 504 | 2025-10-06 |
Current Landscape of Preclinical Models for Pediatric Gliomas: Clinical Implications and Future Directions
2025-Jul-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132221
PMID:40647519
|
综述 | 本文综述了儿童胶质瘤临床前模型的现状，重点介绍了各类模型在模拟肿瘤生物学和肿瘤微环境方面的进展 | 整合了包括患者来源脑类器官、基因工程小鼠模型和区域特异性中线类器官在内的多种创新模型，并应用单细胞RNA测序和空间转录组学等多组学平台 | NA | 推进儿童高级别胶质瘤的有效治疗方法开发 | 儿童高级别胶质瘤（pHGGs），特别是弥漫性中线胶质瘤（DMGs） | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，CRISPR-Cas9，脂质体介导的转染，PiggyBac质粒系统 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 505 | 2025-10-06 |
Scalable and unsupervised discovery from raw sequencing reads using SPLASH2
2025-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02381-2
PMID:39313645
|
研究论文 | 介绍SPLASH2，一种基于高效k-mer计数方法的快速可扩展实现，用于在多种测序技术和生物背景的大规模数据集中检测调控序列变异 | 基于高效k-mer计数方法实现快速可扩展的序列变异检测，支持多种测序技术和生物背景 | NA | 开发可扩展的无监督序列变异检测方法 | 原始测序读数 | 生物信息学 | 癌症 | k-mer计数，单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 506 | 2025-10-06 |
Multiplexed, image-based pooled screens in primary cells and tissues with PerturbView
2025-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02391-0
PMID:39375449
|
研究论文 | 开发了一种名为PerturbView的光学池筛选技术，可在原代细胞和组织中进行多重图像表型筛选 | 利用体外转录在原位测序前扩增条形码，首次实现原代细胞和组织中的高多重表型筛选 | 未明确说明技术应用的样本规模限制或具体技术参数 | 开发适用于多种系统的光学池筛选技术 | 诱导多能干细胞衍生神经元、原代免疫细胞和动物模型肿瘤组织切片 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 原位测序、体外转录、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 光学池筛选、空间转录组学 | PerturbView | 基于体外转录条形码扩增的光学池筛选平台 |
| 507 | 2025-10-06 |
Unveiling the impact of ferroptosis on diabetes-associated cognitive decline through comprehensive single-cell RNA sequencing and experimental studies
2025-Jul, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70101
PMID:40254912
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验研究探讨铁死亡在糖尿病相关认知衰退中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示铁死亡相关基因在糖尿病认知衰退中的表达变化，并验证Tfr1基因敲除和铁死亡抑制对认知功能的保护作用 | 研究仅使用小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明铁死亡在糖尿病相关认知衰退发病机制中的作用 | 2型糖尿病小鼠的海马体组织，特别是少突胶质细胞和小胶质细胞 | 数字病理学 | 糖尿病相关认知衰退 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 行为学分析, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | T2DM和对照小鼠的海马体样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 508 | 2025-10-06 |
SpotSweeper: spatially aware quality control for spatial transcriptomics
2025-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02713-3
PMID:40481362
|
研究论文 | 开发了一种名为SpotSweeper的空间感知质量控制方法，用于空间转录组学数据 | 首次提出利用局部邻域信息校正空间混杂效应，能够同时识别局部异常值和区域伪影 | NA | 解决空间转录组学数据质量控制问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间基因表达平台 |
| 509 | 2025-10-06 |
Cancer-Associated Fibroblasts: Heterogeneity, Cancer Pathogenesis, and Therapeutic Targets
2025-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70292
PMID:40656546
|
综述 | 系统阐述癌症相关成纤维细胞(CAFs)的异质性、在肿瘤发生发展中的作用机制及靶向治疗策略 | 整合单细胞多组学和空间转录组学最新发现，提出基于CAF亚型特异性的精准基质治疗路线图 | CAF功能双重性使治疗策略面临临床转化困难 | 探索CAFs在肿瘤微环境中的调控机制及靶向治疗潜力 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其亚型 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 510 | 2025-10-06 |
KIL transcription factors facilitate embryo growth in maize by promoting endosperm elimination via lytic cell death
2025-Jul-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf162
PMID:40579219
|
研究论文 | 本研究揭示了KIL转录因子通过促进胚乳溶解性细胞死亡来调控玉米胚胎生长的机制 | 首次发现KIL1和KIL2两个NAC转录因子特异性调控胚乳邻近胚盾片区域的细胞死亡过程，并揭示了父本基因对胚乳细胞死亡的调控作用 | 研究主要聚焦于KIL转录因子的功能，对其他可能参与调控的因子和分子机制探索不够深入 | 探究玉米籽粒发育过程中胚乳细胞死亡的调控机制及其对胚胎生长的影响 | 玉米(Zea mays)籽粒发育过程中的胚乳组织和胚胎 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析，功能丧失突变体分析 | NA | 转录组数据，表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 511 | 2025-10-06 |
Exploring the sublayer formation process in layer V of the neocortex through two newly identified molecular markers
2025-Jul-01, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhaf174
PMID:40668607
|
研究论文 | 通过两个新分子标记探索新皮层第五层亚层形成过程 | 首次发现Pcp4和FoxO1作为定义新皮层第五层Va和Vb亚层的新型分子标记 | 研究主要关注晚期分化阶段，早期发育机制尚未完全阐明 | 揭示新皮层第五层神经元亚型多样化的分子机制 | 小鼠新皮层第五层兴奋性锥体神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, Dicer条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | Dicer条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 512 | 2025-10-06 |
Network-Guided Sparse Subspace Clustering on Single-Cell Data
2025-Jul-15, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666251359688
PMID:40662619
|
研究论文 | 开发了一种网络引导的稀疏子空间聚类方法NetworkSSC，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 在传统稀疏子空间聚类基础上整合了基因网络拉普拉斯矩阵的正则化项，能够捕捉基因间的功能关联 | 仅在九个单细胞RNA测序数据集上进行了比较分析，样本规模有限 | 解决单细胞数据高维特性导致的传统聚类方法效果不佳问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏子空间聚类 | 基因表达数据 | 九个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell Analysis Decodes Gene Expression and Chromatin Accessibility in the Developing Human Fetal Brain
2025-Jul-15, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05184-x
PMID:40663269
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和染色质可及性测序，系统解析人类胎儿大脑发育过程中的基因表达和染色质调控机制 | 首次构建人类胎儿大脑发育的单细胞多组学整合图谱，揭示神经细胞分化轨迹和动态调控机制 | 研究样本仅涵盖8-17周孕期的流产胎儿组织，样本来源有限 | 解析人类胎儿大脑发育过程中的细胞异质性、谱系关系和转录调控网络 | 8-17周孕期的人类胎儿脑组织 | 单细胞组学 | 神经发育疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 流产胎儿脑组织（孕8-17周） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 514 | 2025-10-06 |
Testis Molecular Pathways in CAIS Unveil Testosterone/Estradiol on Germ Cell Tumor Risk in Non-Obstructive Azoospermia
2025-Jul-14, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgaf404
PMID:40658795
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示非梗阻性无精子症中睾丸分子通路与生殖细胞肿瘤风险的关联 | 首次在CAIS患者睾丸体细胞中发现与精原细胞瘤微环境相关的转录特征，并证实睾酮/雌二醇比值对非遗传性NOA患者TGCC的预后价值 | 样本量有限，特别是CAIS病例仅有一例，需要更大规模研究验证 | 建立非遗传性和遗传性NOA睾丸体细胞中共享或特异的分子通路 | 睾丸体细胞、NOA患者、CAIS患者、Klinefelter综合征患者和睾丸生殖细胞癌患者 | 单细胞测序分析 | 男性不育症、睾丸生殖细胞癌 | 单细胞RNA测序、数据整合分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床数据 | 752名年龄匹配男性（120名生育者，155名不育者，116名NOA患者，18名KS患者，343名TGCC患者） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 515 | 2025-10-06 |
SCassist: An AI Based Workflow Assistant for Single-Cell Analysis
2025-Jul-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf402
PMID:40650988
|
研究论文 | 开发了一个基于大型语言模型的R包SCassist，用于指导单细胞RNA测序数据分析 | 首次将大型语言模型集成到单细胞RNA测序分析工作流中，提供参数推荐和结果解释 | NA | 简化单细胞RNA测序数据分析流程，降低技术门槛 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | LLM（大型语言模型） | 基因表达数据 | NA | Google, OpenAI, Meta | 单细胞RNA-seq | Gemini, GPT, Llama3 | 基于大型语言模型的单细胞分析辅助工具 |
| 516 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals immunotherapy-driven bone marrow niche remodeling in AML
2025-Jul-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw4871
PMID:40632867
|
研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组学揭示了免疫治疗驱动的急性髓系白血病骨髓微环境重塑 | 整合单细胞RNA测序与单细胞空间转录组学数据，开发基于深度学习的图像分析方法，实现精确的转录本定位和细胞间距离量化 | 存在测序深度限制，需要整合多种技术来弥补数据不足 | 研究免疫治疗对AML骨髓微环境中细胞相互作用的影响 | 接受pembrolizumab和地西他滨治疗的急性髓系白血病患者骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学, 深度学习图像分析 | CNN | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 517 | 2025-10-06 |
PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2
2025-Jul-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61759-1
PMID:40640184
|
研究论文 | 研究发现小分子抑制剂RMC-113通过抑制PIP4K2C和PIKfyve脂质激酶，逆转SARS-CoV-2诱导的自噬流障碍，从而抑制病毒复制 | 首次揭示PIP4K2C在SARS-CoV-2进入、RNA复制和组装/释放中的作用，并发现其与病毒非结构蛋白6结合调控自噬流 | 研究主要基于人类肺类器官模型，尚未进行体内验证 | 开发广谱抗病毒药物，研究SARS-CoV-2复制机制 | SARS-CoV-2和其他RNA病毒，人类肺类器官 | 病毒学 | COVID-19 | 脂质组学分析，蛋白质组学，单细胞转录组学，功能测定 | NA | 分子相互作用数据，基因表达数据，代谢物数据 | 人类肺类器官模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 518 | 2025-10-06 |
Mineralocorticoid receptor knockout alters hippocampal CA2 neurons to become like those in CA1
2025-Jul-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08378-0
PMID:40640339
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法发现盐皮质激素受体敲除会导致海马CA2神经元获得CA1样分子表型 | 首次揭示盐皮质激素受体在控制海马CA2神经元身份中的关键作用，证明其缺失会使CA2神经元转变为CA1样表型 | 研究主要关注发育阶段，对成年期的影响尚不明确 | 探究盐皮质激素受体敲除对海马CA2神经元命运的影响 | 小鼠海马CA2区域神经元 | 神经科学 | NA | 空间转录组学 | 条件性基因敲除模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 519 | 2025-10-06 |
Early developmental origins of cortical disorders modeled in human neural stem cells
2025-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61316-w
PMID:40634286
|
研究论文 | 本研究通过人类神经干细胞模型探索皮层障碍的早期发育起源 | 首次在人类神经干细胞中系统分析皮层和神经精神疾病风险基因的表达动态，揭示疾病特异性关键阶段和跨疾病信号汇聚机制 | 研究主要基于体外模型，与体内真实发育环境存在差异 | 探索人类端脑早期发育阶段在皮层障碍病因学中的作用 | 人类神经干细胞和皮层发育过程 | 发育神经生物学 | 皮层障碍，自闭症 | 单细胞转录组测序，基因表达分析 | 人类神经干细胞体外分化模型 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 520 | 2025-10-06 |
TCF7 functions as a prognostic biomarker in bladder cancer by strengthening EMT and stemness associated with TGF-β/SMAD3 signaling
2025-Jul, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05241-y
PMID:40025258
|
研究论文 | 本研究探讨TCF7通过调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路，从而促进膀胱癌EMT和干细胞特性的机制 | 首次揭示TCF7通过转录调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路驱动膀胱癌EMT和干细胞特性的新机制 | TCF7在膀胱癌中的具体转录调控机制仍需进一步阐明 | 探究TCF7在膀胱癌进展中的作用及调控机制 | 膀胱癌 | 肿瘤生物学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |