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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-10-06 |
Early developmental origins of cortical disorders modeled in human neural stem cells
2025-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61316-w
PMID:40634286
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研究论文 | 本研究通过人类神经干细胞模型探索皮层障碍的早期发育起源 | 首次在人类神经干细胞中系统分析皮层和神经精神疾病风险基因的表达动态,揭示疾病特异性关键阶段和跨疾病信号汇聚机制 | 研究主要基于体外模型,与体内真实发育环境存在差异 | 探索人类端脑早期发育阶段在皮层障碍病因学中的作用 | 人类神经干细胞和皮层发育过程 | 发育神经生物学 | 皮层障碍,自闭症 | 单细胞转录组测序,基因表达分析 | 人类神经干细胞体外分化模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2025-10-06 |
TCF7 functions as a prognostic biomarker in bladder cancer by strengthening EMT and stemness associated with TGF-β/SMAD3 signaling
2025-Jul, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05241-y
PMID:40025258
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研究论文 | 本研究探讨TCF7通过调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路,从而促进膀胱癌EMT和干细胞特性的机制 | 首次揭示TCF7通过转录调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路驱动膀胱癌EMT和干细胞特性的新机制 | TCF7在膀胱癌中的具体转录调控机制仍需进一步阐明 | 探究TCF7在膀胱癌进展中的作用及调控机制 | 膀胱癌 | 肿瘤生物学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 503 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing generates an atlas of normal tibia cartilage under mechanical loading conditions
2025-Jul, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05234-x
PMID:40072674
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析机械负荷对胫骨软骨细胞的影响 | 首次在单细胞水平构建正常胫骨软骨在机械负荷条件下的图谱,并鉴定负荷相关枢纽基因 | 样本量有限(6名供体),仅分析胫骨特定区域 | 探究机械负荷对软骨细胞生物学过程的影响机制 | 人胫骨软骨组织样本 | 单细胞组学 | 骨关节疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 11个软骨组织样本(来自6名供体),132,685个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 504 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals that human milk feeding shapes neonatal immune cell interleukin signaling pathways in a nonrandomized clinical trial
2025-Jul, The American journal of clinical nutrition
DOI:10.1016/j.ajcnut.2025.04.024
PMID:40294751
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析比较母乳喂养和配方奶喂养婴儿的免疫细胞基因表达差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示母乳喂养对新生儿免疫细胞白介素信号通路的调节作用 | 非随机临床试验设计,样本量较小(n=9) | 表征母乳喂养与配方奶喂养婴儿循环免疫细胞亚群的基因表达差异 | 健康婴儿(3-3.5个月大)的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9名婴儿(6名母乳喂养,3名配方奶喂养) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 505 | 2025-10-06 |
Epitenon-derived progenitors drive fibrosis and regeneration after flexor tendon injury in a spatially-dependent manner
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60704-6
PMID:40593535
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术,揭示了腱外膜来源的祖细胞在肌腱损伤后纤维化和再生过程中的关键作用 | 首次明确鉴定腱外膜作为肌腱损伤后纤维化和再生的重要祖细胞来源,并证明其空间依赖性功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究肌腱损伤修复过程中的细胞来源和机制 | 小鼠肌腱损伤模型和人类肌腱周围瘢痕组织 | 单细胞生物学 | 肌腱损伤 | 遗传谱系追踪,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 506 | 2025-10-06 |
SLC3A2 as a key anoikis-related gene for prognosis and tumor microenvironment remodeling in melanoma
2025-Jul-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03125-7
PMID:40643718
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析,鉴定SLC3A2作为黑色素瘤预后和肿瘤微环境重塑的关键失巢凋亡相关基因 | 首次系统评估101种机器学习算法组合构建黑色素瘤预后模型,并通过单细胞分析揭示失巢凋亡在肿瘤微环境重塑中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 识别黑色素瘤中失巢凋亡相关的预后标志物并探索其与肿瘤微环境的关系 | 黑色素瘤患者和细胞系 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 机器学习, shRNA敲低, 集落形成实验, Transwell迁移实验 | 随机生存森林, 梯度提升机, Cox回归 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据 | 多个黑色素瘤队列(TCGA, GSE19234, GSE22153, GSE65904)和单细胞数据集GSE215120 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 507 | 2025-10-06 |
Zwilch kinetochore protein affects the prognosis of cancer patients by participating in cell proliferation, enhancing cell communication, and reshaping the tumor microenvironment
2025-Jul-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02981-7
PMID:40643756
|
研究论文 | 本研究探讨Zwilch动粒蛋白通过参与细胞增殖、增强细胞通讯和重塑肿瘤微环境影响癌症患者预后的机制 | 首次系统揭示ZWILCH在多种癌症中的普遍高表达特征及其通过细胞通讯和肿瘤微环境重塑影响预后的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探究ZWILCH在肿瘤发生发展中的作用机制及其临床意义 | 多种癌症类型及其肿瘤微环境 | 生物信息学 | 多种癌症 | 全转录组分析,空间转录组分析,单细胞转录组分析,GSEA,GSVA,KEGG富集分析,Aucell,全基因组CRISPR筛选 | 单变量Cox回归分析 | 转录组数据,功能蛋白数据 | 多种癌症患者样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2025-10-06 |
Exploring the role of PANoptosis related genes in the prognosis of oral squamous cell carcinoma subtypes based on multi-omics analysis
2025-Jul-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03154-2
PMID:40643861
|
研究论文 | 基于PANoptosis相关基因通过多组学分析探索口腔鳞状细胞癌亚型的预后作用 | 首次基于PANoptosis相关基因对OSCC进行分子分型,并构建包含8个基因的预后模型 | 研究主要基于TCGA数据库,需要外部验证队列确认结果的普适性 | 探索PANoptosis相关基因在口腔鳞状细胞癌预后中的作用 | 口腔鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | Cox回归模型, 聚类算法 | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | TCGA数据库中的OSCC患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 509 | 2025-10-06 |
Construction of a macrophage-related prognostic signature and assessment of immune checkpoint inhibitor efficacy of HCC
2025-Jul-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06937-3
PMID:40645977
|
研究论文 | 本研究构建了肝细胞癌中巨噬细胞相关的预后基因特征,并评估了其预测免疫检查点抑制剂疗效的能力 | 首次基于单细胞RNA测序构建了八基因巨噬细胞相关预后特征,并深入揭示了PLAUR通过PI3K/AKT/mTOR通路促进免疫抑制极化和肿瘤进展的机制 | 研究样本量有限,需要更多独立队列验证基因特征的临床适用性 | 开发肝细胞癌预后生物标志物和免疫检查点抑制剂疗效预测工具 | 肝细胞癌患者、巨噬细胞亚型、PLAUR基因功能 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 功能实验 | 预后模型, 细胞通讯分析 | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | TCGA-LIHC队列和配对肝癌与正常肝组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 510 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of Mendelian randomization and scRNA-seq identify key prognostic genes and relevant functional roles in colorectal cancer
2025-Jul-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10354-x
PMID:40646181
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞测序识别结直肠癌关键预后基因MMRN1和SLC6A19及其功能机制 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞测序技术系统鉴定结直肠癌预后关键基因 | NA | 识别结直肠癌关键预后基因并探索其分子机制 | 结直肠癌相关基因和细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, qRT-PCR | 单变量Cox分析, 列线图模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 511 | 2025-10-06 |
Comparison of local effects and systemic T-cell responses in patients with breast cancer treated by radiofrequency ablation versus microwave ablation
2025-Jul-11, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03896-7
PMID:40646574
|
研究论文 | 比较射频消融与微波消融治疗乳腺癌的局部效果和系统性T细胞免疫反应 | 首次报道实体瘤热消融后外周T细胞溶解功能差异,通过单细胞RNA测序揭示微波消融激活树突状细胞脂肪酸代谢的机制 | 需要未来临床试验验证研究结果 | 比较两种热消融疗法在乳腺癌治疗中的局部效果和免疫反应差异 | 60名乳腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 流式细胞术, ELISA, qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据, 血液样本, 基因表达数据 | 60例乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 512 | 2025-10-06 |
Multimodal evaluation of cerebrospinal fluid from breast cancer leptomeningeal metastases using circulating tumor cell detection, single-cell sequencing, and proteomics
2025-Jul-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06671-4
PMID:40640833
|
研究论文 | 通过多模态方法评估乳腺癌软脑膜转移患者的脑脊液,包括循环肿瘤细胞检测、单细胞测序和蛋白质组学分析 | 首次结合循环肿瘤细胞检测、单细胞RNA测序和细胞因子分析对乳腺癌软脑膜转移患者的脑脊液进行综合分子分析 | 研究仅基于单例患者样本,样本量有限 | 开发用于监测乳腺癌中枢神经系统转移治疗反应的微创方法 | HER2阳性乳腺癌软脑膜转移患者的脑脊液样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 细胞因子分析, 循环肿瘤细胞检测 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 细胞计数数据 | 1例患者的系列脑脊液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 513 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing dataset of hearts from wild type and Cyp26b1 knockout mouse embryos
2025-Jul-09, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05497-5
PMID:40634327
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析野生型和Cyp26b1基因敲除小鼠胚胎心脏的转录组变化 | 首次在四个发育时间点对Cyp26b1敲除小鼠心脏进行单细胞转录组分析,揭示其在心肌细胞中的特异性转录变化 | 研究仅关注胚胎期E10.5-E13.5发育阶段,未涉及更晚期发育或成年表型 | 探究Cyp26b1基因在心脏发育中的作用及其与左心室致密化不全的潜在关联 | 野生型和Cyp26b1基因敲除小鼠胚胎的心脏组织 | 单细胞组学 | 心肌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 134,499个高质量细胞(57,923个野生型,62,488个敲除型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 514 | 2025-10-06 |
Novel Cell-to-Cell Communications Between Macrophages and Fibroblasts Regulate Obesity-Induced Adipose Tissue Fibrosis
2025-Jul-01, Diabetes..
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0762
PMID:40063503
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术揭示了肥胖诱导的脂肪组织纤维化中巨噬细胞与成纤维细胞之间的新型细胞通讯机制 | 发现了表达Mincle的巨噬细胞亚群通过分泌Osm调控成纤维细胞胶原基因表达的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究肥胖诱导的脂肪组织纤维化过程中的细胞间通讯机制 | 饮食诱导肥胖小鼠的脂肪组织及人类肥胖脂肪组织 | 单细胞生物学 | 肥胖相关代谢疾病 | 单细胞转录组分析,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 饮食诱导肥胖小鼠模型及人类肥胖脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 515 | 2025-10-06 |
NRF2 modulates WNT signaling pathway to enhance photodynamic therapy resistance in oral leukoplakia
2025-Jul, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00256-w
PMID:40494896
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现NRF2通过激活WNT信号通路增强口腔白斑的光动力疗法耐药性 | 首次在单细胞水平揭示NRF2通过调控WNT信号通路介导口腔白斑光动力疗法耐药的新机制 | 样本量相对有限,需要更大规模临床试验验证NRF2抑制剂的治疗效果 | 探究口腔白斑光动力疗法耐药的关键调控通路 | 口腔白斑患者样本和4NQO诱导的小鼠口腔白斑模型 | 单细胞组学 | 口腔白斑 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例单细胞测序样本(3例敏感,3例耐药),117例验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 516 | 2025-10-06 |
Quantification of transcript isoforms at the single-cell level using SCALPEL
2025-Jul-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61118-0
PMID:40640129
|
研究论文 | 开发了一种名为SCALPEL的单细胞RNA测序工具,用于在单细胞水平定量分析转录本亚型 | 基于Nextflow的工具能够从标准3' scRNA-seq数据中定量表征转录本亚型,相比现有方法具有更高的灵敏度和特异性 | NA | 改进单细胞水平转录本亚型的定量分析,探索转录后基因调控机制 | 转录本亚型、细胞群体、3' UTR长度变化、miRNA特征 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、长短读长测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、合成数据、真实数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 标准3'单细胞RNA测序 |
| 517 | 2025-10-06 |
Exploration and validation of the prognostic value of mitophagy and mitochondrial dynamics-related genes in cervical cancer
2025-Jul-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-09310-6
PMID:40640353
|
研究论文 | 本研究探索并验证了线粒体自噬和线粒体动力学相关基因在宫颈癌中的预后价值 | 首次结合孟德尔随机化和101种机器学习模型识别宫颈癌中线粒体自噬和线粒体动力学的预后基因,并构建了高精度的风险模型 | 研究机制仍需进一步实验验证,风险模型AUC值仅超过0.6,准确度有提升空间 | 评估线粒体自噬和线粒体动力学在宫颈癌中的预后意义 | 宫颈癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 孟德尔随机化,单细胞RNA测序,基因集富集分析 | 多种机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 518 | 2025-10-06 |
Single cell RNA sequencing analysis of mice hindlimb muscles identifies transcriptional heterogeneity in aging and physical frailty
2025-Jul-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10421-3
PMID:40640360
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠后肢肌肉,揭示衰老和身体衰弱过程中的转录异质性 | 首次在单细胞水平系统比较相对健康衰老、年龄相关衰弱和年龄无关衰弱三种状态的转录调控网络和细胞通讯差异 | 研究仅针对小鼠模型,结果需要进一步在人类样本中验证 | 阐明衰老和身体衰弱的分子机制 | 小鼠后肢肌肉组织 | 单细胞转录组学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序,SMART测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老小鼠,分为非衰弱年轻/年老组和衰弱年老组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2025-10-06 |
Unveiling the therapeutic potential of senescence-related IQGAP2 in pancreatic Cancer through post-GWAS genomic and scRNA-seq analyses
2025-Jul-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03078-x
PMID:40640432
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析揭示衰老相关基因IQGAP2在胰腺癌中的治疗潜力 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序方法系统研究衰老相关基因在胰腺癌中的作用,发现IQGAP2在胰腺癌中的因果作用和治疗靶点潜力 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证IQGAP2的功能机制 | 探索衰老相关基因在胰腺癌发生发展中的作用及其治疗潜力 | 胰腺癌细胞和衰老相关基因 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 功能富集分析 | SMR分析, HEIDI检验, 共定位分析 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 520 | 2025-10-06 |
MTMR14 depletion aggravates intrapulmonary inflammation and emphysema in experimental COPD through activating macrophage M1 polarization
2025-Jul-10, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03293-8
PMID:40640787
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研究论文 | 本研究探讨MTMR14在COPD巨噬细胞极化中的作用机制 | 首次揭示MTMR14通过PI3K/Akt和NF-κB通路负调控巨噬细胞M1极化,并发现TRIM21通过泛素-蛋白酶体系统下调MTMR14 | 未提供临床样本量具体数据,动物模型结果向临床转化的有效性需进一步验证 | 研究MTMR14在慢性阻塞性肺疾病巨噬细胞中的功能和机制 | 巨噬细胞、肺泡上皮细胞、小鼠模型、临床标本 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 生物信息学分析、单细胞测序、免疫共沉淀、环己酰亚胺追踪实验 | 基因敲除小鼠模型、细胞敲低/过表达模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、功能实验数据 | 临床标本、动物模型和细胞模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |