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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2025-10-06 |
The immunological and prognostic landscape of TFAP4 in cancer: A single-cell RNA sequencing perspective
2025-Jul-11, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110551
PMID:40653182
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示TFAP4在肿瘤免疫微环境中的生物学功能和预后价值 | 首次从单细胞水平系统解析TFAP4在多种癌症类型中的免疫调控机制及其与治疗反应的关系 | 未明确说明具体涉及的癌症类型种类及样本数量 | 探究TFAP4在肿瘤免疫微环境中的生物学功能和临床意义 | 多种癌症类型的恶性上皮细胞和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 482 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals metabolic dysfunction prior to overt tauopathy in the PS19 mouse model
2025-Jul-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6941464/v1
PMID:40671812
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组分析揭示了PS19小鼠模型中在明显tau病变出现前的代谢功能障碍 | 首次在tau病变可检测病理出现前识别出CA3区域糖酵解通路基因的早期上调,揭示了区域特异性代谢失调的时间动态 | 研究仅限于PS19转基因小鼠模型,结果在人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究区域脆弱性与前缠结tau驱动的转录组变化之间的关系 | tau P301S转基因小鼠模型(PS19品系) | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | PS19小鼠模型在不同疾病阶段的海马体和皮质区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 483 | 2025-10-06 |
From scRNA-seq to therapeutic targets: Unveiling the impact of activated mast cells on intestinal dysfunction in acute pancreatitis
2025-Jul-07, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v31.i25.107865
PMID:40656612
|
评论 | 对一项关于急性胰腺炎中肥大细胞通过分泌CCL5导致肠道功能障碍的单细胞转录组研究的评论 | 强调了研究中整合单细胞转录组与功能分析的方法创新 | NA | 探讨急性胰腺炎相关肠道损伤的细胞和分子机制 | 急性胰腺炎早期小肠组织 | 单细胞转录组学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 484 | 2025-10-06 |
USP14-IMP2-CXCL2 axis in tumor-associated macrophages facilitates resistance to anti-PD-1 therapy in gastric cancer by recruiting myeloid-derived suppressor cells
2025-07, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03425-w
PMID:40269263
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞中USP14-IMP2-CXCL2轴通过招募髓源性抑制细胞导致胃癌抗PD-1治疗耐药的机制 | 首次发现USP14通过去泛素化稳定m6A阅读器IMP2,增强CXCL2表达和分泌,从而驱动抗PD-1治疗耐药的新机制 | 研究主要基于临床样本和动物实验,需要进一步验证在人类患者中的临床应用价值 | 探索胃癌抗PD-1治疗耐药的分子机制并寻找新的治疗策略 | 胃癌患者内镜活检样本、肿瘤相关巨噬细胞、髓源性抑制细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 无法手术胃癌患者的内镜活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 485 | 2025-10-06 |
Angiopoietin-TIE2 feedforward circuit promotes PIK3CA-driven venous malformations
2025-Jul, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00655-9
PMID:40410415
|
研究论文 | 本研究揭示了PIK3CA驱动的静脉畸形中血管生成素-TIE2正反馈环路促进疾病进展的机制 | 首次发现静脉特异性信号环路,揭示PI3Kα活性通过自分泌和旁分泌机制放大上游TIE2受体信号 | mTOR阻断对晚期静脉畸形效果有限,研究主要基于小鼠模型 | 探究PIK3CA相关静脉畸形的发病机制和潜在治疗靶点 | 静脉畸形小鼠模型和人类静脉畸形样本 | 病理学 | 静脉畸形 | 单细胞转录组学,谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 486 | 2025-10-06 |
Mechanisms and therapeutic potential of epithelial-immune crosstalk in airway inflammation
2025-Jul, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2514604
PMID:40452271
|
综述 | 本文综述了气道上皮细胞与免疫细胞在气道炎症中的相互作用机制及其治疗潜力 | 整合了单细胞测序技术的新发现与单克隆抗体靶向治疗的最新进展 | 气道炎症的复杂病理生理机制尚未完全阐明 | 探讨上皮-免疫细胞相互作用在气道炎症中的机制及治疗潜力 | 慢性气道炎症疾病(包括慢性鼻窦炎、过敏性鼻炎、哮喘、囊性纤维化和慢性阻塞性肺疾病) | NA | 气道炎症疾病 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 487 | 2025-10-06 |
Unveiling the Immune Landscape: Single-Cell Sequencing of Infectious Mononucleosis Patients
2025-Jul, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70491
PMID:40673701
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术分析儿童传染性单核细胞增多症的免疫动态特征 | 首次在单细胞水平揭示EBV感染B细胞亚群的趋向性差异,发现RPMS1致癌调节因子在维持病毒潜伏期的作用,以及NK细胞亚群对EBV的差异化应答机制 | 研究样本仅限于儿科IM患者,未包含其他年龄段或EBV相关疾病对照 | 解析EBV与宿主免疫系统的相互作用机制 | 传染性单核细胞增多症患者的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 传染性单核细胞增多症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 儿科IM患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 488 | 2025-10-06 |
Foxn3 is required to suppress aberrant ciliogenesis in nonphotoreceptor retinal neurons
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500871122
PMID:40663603
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研究论文 | 本研究探讨转录因子Foxn3在抑制非光感受器视网膜神经元异常纤毛发生中的作用 | 首次发现Foxn3作为关键转录抑制因子,通过直接结合并抑制纤毛基因及其转录激活因子的启动子,防止非光感受器神经元形成类似光感受器的纤毛结构 | 研究主要基于小鼠模型,在人类视网膜中的功能需要进一步验证 | 探究Foxn3在建立和维持视网膜细胞纤毛结构分化中的作用机制 | 视网膜特异性条件性敲除Foxn3小鼠的非光感受器神经元(双极细胞和无长突细胞) | 发育生物学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质分析, 转录分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 电生理数据, 染色质结合数据 | Foxn3条件性敲除小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 489 | 2025-10-06 |
Chemotaxis overrides the killing response in alloreactive CTLs, providing vascular immune privilege during cellular rejection
2025-Jul-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI155191
PMID:40435228
|
研究论文 | 本研究揭示了在细胞排斥期间趋化作用如何通过引导细胞毒性T淋巴细胞远离内皮细胞来维持血管免疫特权 | 挑战了传统细胞内在免疫特权的观点,提出了细胞外在机制,证明趋化梯度能覆盖T细胞受体诱导的细胞毒性 | 研究主要基于肾脏移植模型,在其他器官或病理条件下的普适性需要进一步验证 | 探究移植排斥过程中血管免疫特权的机制 | 移植内皮细胞、细胞毒性T淋巴细胞、上皮细胞 | 免疫学 | 移植排斥 | 转录组学分析、单细胞RNA测序、活体显微镜、共培养实验 | NA | 基因表达数据、显微镜图像、临床活检数据 | 小鼠肾脏移植模型和人类肾移植活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 490 | 2025-10-06 |
Endocrine Resistance Score Based on Three Key Genes Predicts Prognosis and Reveals Potential Therapeutic Targets for ER+HER2- Breast Cancer
2025-Jul-15, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70100
PMID:40664624
|
研究论文 | 本研究基于CLEC3A、PCDH10和ST3GAL1三个关键基因构建内分泌抵抗评分,用于预测ER+HER2-乳腺癌预后并揭示潜在治疗靶点 | 首次发现CLEC3A、PCDH10和ST3GAL1三个基因与内分泌抵抗相关,并构建了具有预后预测价值的评分系统 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 探索ER+HER2-乳腺癌内分泌抵抗的分子机制并开发预后预测工具 | ER+HER2-乳腺癌细胞系和患者组织样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,Cox回归分析 | nomogram模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 491 | 2025-10-06 |
scGPT: end-to-end protocol for fine-tuned retinal cell type annotation
2025-Jul-15, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01220-1
PMID:40665101
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研究论文 | 提供scGPT在单细胞RNA测序数据中用于细胞类型分类的端到端微调协议 | 开发了基于scGPT基础模型的完整微调流程,实现了99.5% F1-score的高精度细胞类型注释 | 需要用户具备中等生物信息学知识,对Python和Linux有基本了解 | 解决单细胞研究中高分辨率细胞类型注释的挑战 | 视网膜单细胞数据集 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, scGPT | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 492 | 2025-10-06 |
Light-Regulated Reprogramming in Moss: SHMT1 Mediates Blue Light Enhancement of Cell Regeneration
2025-Jul-15, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70044
PMID:40665554
|
研究论文 | 本研究首次揭示蓝光通过上调SHMT1基因促进植物细胞重编程的分子机制 | 首次建立了光照条件与细胞重编程之间的分子联系,发现蓝光通过上调SHMT1基因加速细胞再生过程 | NA | 探究蓝光促进植物细胞重编程的分子机制 | 小立碗藓原生质体 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 新鲜分离原生质体(CK)、蓝光处理24小时(B24h)、白光处理24小时(W24h)三组样品 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 493 | 2025-10-06 |
Keratin 6A Overexpression in the Lymphovascular Invasion-Associated Tumor Subgroup Promotes Progression of Triple-Negative Breast Cancer
2025-Jul-14, Cancer research and treatment
IF:4.1Q2
DOI:10.4143/crt.2025.423
PMID:40665712
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研究论文 | 本研究探讨角蛋白6A在淋巴血管侵袭相关的三阴性乳腺癌亚群中的过表达及其促进肿瘤进展的机制 | 首次通过单细胞测序识别LVI阳性TNBC中的主导上皮细胞亚群,并发现KRT6A通过Wnt/β-catenin信号通路促进EMT和转移的新机制 | 未明确说明样本量大小,机制研究可能仍需进一步验证 | 研究三阴性乳腺癌中淋巴血管侵袭相关的上皮调节因子及其功能作用 | 三阴性乳腺癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序,转录组分析,免疫组化染色,CCK8,伤口愈合实验,Transwell实验,动物实验 | NA | 单细胞测序数据,转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 494 | 2025-10-06 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing reveals intratumor heterogeneity phenotypes and immune infiltration in pancreatic cancer
2025-Jul-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03080-3
PMID:40652419
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,揭示了胰腺癌肿瘤内异质性表型及其与免疫浸润的关系 | 首次将bulk RNA测序与单细胞RNA测序相结合系统分析胰腺癌肿瘤内异质性,构建了11基因预后模型并发现Galectin信号通路的关键作用 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 探索胰腺癌肿瘤内异质性的预后价值和治疗指导意义 | 胰腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | Cox回归分析,多种机器学习技术 | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胰腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 495 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and multi-omics analysis of prognosis-related staging in papillary thyroid cancer
2025-Jul-12, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04101-4
PMID:40650680
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多组学分析建立甲状腺乳头状癌预后相关分子分型 | 首次基于肿瘤细胞分化状态构建甲状腺乳头状癌分子分型系统OSPTCC,并开发了7基因风险评分模型 | 样本量相对有限,单细胞数据仅来自11例患者,需要更大规模验证 | 改善甲状腺乳头状癌的风险分层和预后预测精度 | 甲状腺乳头状癌患者 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, 多组学分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 11例PTC患者(158,577个细胞)的单细胞数据,501例TCGA-THCA队列数据,48例独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 496 | 2025-10-06 |
Development and validation of a prognostic model for predicting survival and immunotherapy benefits in melanoma based on metabolism-relevant genes
2025-Jul-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03186-8
PMID:40652057
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研究论文 | 基于代谢相关基因开发并验证了预测黑色素瘤患者生存和免疫治疗获益的预后模型 | 首次基于代谢相关基因对黑色素瘤患者进行分子分型,并构建了包含五个特征基因的预后模型,同时结合单细胞RNA测序分析和体外实验验证 | 研究样本量有限,模型验证需要更大规模的前瞻性研究 | 开发预测黑色素瘤患者预后和免疫治疗反应的预后模型 | 皮肤 cutaneous 黑色素瘤(SKCM)患者 | 数字病理 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, western blot, 定量PCR, 免疫组化, siRNA干扰 | LASSO回归, COX回归, ResNet50, 弹性回归 | 基因表达数据, 病理图像, 单细胞测序数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 497 | 2025-10-06 |
Decoding sexual dimorphism of the sex-shared nervous system at single-neuron resolution
2025-Jul-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9106
PMID:40644535
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究性别共享神经系统中单个神经元水平的分子性别二态性 | 首次在单神经元分辨率揭示性别共享神经系统的广泛分子二态性,发现触觉感受器等先前未知的神经元类型存在性别差异表达 | 研究仅限于成年雄性和雌雄同体,未涵盖其他发育阶段或性别类型 | 解析遗传性别如何塑造神经系统在单个神经元水平的分子结构 | 成年雄性和雌雄同体的性别共享神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌雄同体的性别共享神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 498 | 2025-10-06 |
Malevolent alliance of MYBL2hi cancer stem cell and SPP1+ macrophage confers resistance to neoadjuvant immunotherapy in bladder cancer
2025-Jul-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011319
PMID:40639849
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示了膀胱癌新辅助免疫治疗耐药的新机制 | 发现MYBL2hi癌症干细胞与SPP1+巨噬细胞之间的恶性同盟是膀胱癌免疫治疗耐药的关键机制 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探索膀胱癌新辅助免疫治疗耐药的分子机制 | 膀胱癌患者的外周血单核细胞、肿瘤组织、癌旁组织和转移淋巴结 | 数字病理 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序, 多重免疫组化, 流式细胞术 | 小鼠原位膀胱癌模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 12例膀胱癌患者(2例未治疗,10例nICB治疗,含5例应答者和5例非应答者) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 499 | 2025-10-06 |
Systems analysis of clinical malaria reveals proteomic perturbation and innate-adaptive crosstalk linked to disease severity
2025-Jul-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.06.014
PMID:40664217
|
研究论文 | 通过整合血浆蛋白质组学和单细胞RNA测序数据,分析临床疟疾患者的系统生物学变化 | 首次将系统性蛋白质组变化与免疫细胞通讯和器官特异性反应联系起来,并识别出与疾病严重程度相关的11种蛋白质特征 | 研究对象为成人旅行者群体,样本代表性可能存在局限 | 理解疟疾的发病机制和宿主反应,改善临床管理和预防 | 成人旅行者中的急性恶性疟原虫疟疾患者 | 系统生物学 | 疟疾 | 蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 | NA | 血浆蛋白质数据,单细胞RNA测序数据 | 包含单细胞RNA测序数据的供体亚群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 500 | 2025-10-06 |
Leucine-rich repeat-containing protein 19 suppresses colorectal cancer by targeting cyclin-dependent kinase 6/E2F1 and remodeling the immune microenvironment
2025-Jul-07, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v31.i25.107893
PMID:40656610
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研究论文 | 本研究揭示了富含亮氨酸重复序列蛋白19通过靶向CDK6/E2F1轴和重塑免疫微环境抑制结直肠癌的机制 | 首次阐明LRRC19通过调控CDK6/E2F1轴诱导细胞周期阻滞,并发现其对肿瘤免疫微环境的重塑作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究LRRC19在结直肠癌中的肿瘤抑制功能及其分子机制 | 结直肠癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 定量PCR, 免疫组织化学, Western blotting, 流式细胞术, 双荧光素酶报告基因检测, 分子对接, 单细胞测序 | 异种移植模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | 来自GEO和TCGA数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |