单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
461	2025-06-11	Phillyrin for sepsis-related acute lung injury: A potential strategy suppressing GSK-3β 2025-Jul, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2025.04.017 PMID:40359720	研究论文	本研究探讨了连翘苷（PHN）通过抑制GSK-3β信号通路缓解脓毒症相关急性肺损伤（ALI/ARDS）的潜在机制	首次发现PHN能与GSK-3β形成稳定复合物，并证实其通过抑制GSK-3β促进M2巨噬细胞极化和减少中性粒细胞募集来缓解ALI/ARDS	研究主要基于LPS诱导的炎症模型，临床转化效果需进一步验证	阐明PHN缓解脓毒症相关ALI/ARDS的分子机制	连翘苷（PHN）、GSK-3β信号通路、ALI/ARDS动物模型	分子药理学	急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征	分子对接、动力学模拟、孟德尔随机化分析、单细胞测序	LPS诱导的小鼠和斑马鱼炎症模型	基因表达数据、蛋白质活性数据、细胞表型数据	从公共数据库筛选8331个ALI/ARDS相关靶基因，并进行了体内外实验验证
462	2025-06-10	Single-cell transcriptional profiling reveals cellular senescence and inflammatory persistence as key features of type 1 diabetes partial remission 2025-Jul, Diabetes, obesity & metabolism DOI:10.1111/dom.16384 PMID:40183401	研究论文	通过单细胞RNA测序研究1型糖尿病部分缓解期的免疫机制	揭示了1型糖尿病部分缓解期未被认识的免疫失调特征，包括单细胞亚群的分子特征和动态变化	研究仅基于外周血单个核细胞，未涉及其他免疫细胞或组织	探究1型糖尿病部分缓解期的免疫机制	健康对照者、新诊断的1型糖尿病患者和处于部分缓解期的患者	单细胞转录组学	1型糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	健康对照者、新诊断T1D患者和PR阶段患者的PBMCs样本
463	2025-06-10	A survey of the methodological process of modeling, inference, and evaluation of gene regulatory networks using scRNA-Seq data 2025-Jul, Bio Systems DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105464 PMID:40409400	综述	本文综述了利用scRNA-Seq数据建模、推断和评估基因调控网络的方法学过程	揭示了scRNA-Seq技术在基因调控网络推断中的技术和方法学挑战，并提出了更稳健的方法学过程建议	缺乏关于真实网络的知识以及评估指标的非标准化，导致算法性能比较困难	探讨scRNA-Seq数据在基因调控网络推断中的方法学挑战和改进方向	基因调控网络（GRNs）	生物信息学	NA	scRNA-Seq	NA	基因表达数据	NA
464	2025-06-09	Delivery of Itgb1-siRNA by triptolide-modified and anti-Flt1 peptide-guided ionizable cationic LNPs for targeted therapy of corneal neovascularization 2025-Jul-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1 DOI:10.1016/j.jconrel.2025.113811 PMID:40324532	研究论文	本研究开发了一种新型的离子化阳离子脂质纳米颗粒（icLNPs），用于递送Itgb1-siRNA，以靶向治疗角膜新生血管（CoNV）	通过结合抗Flt1肽引导和雷公藤甲素修饰，提高了icLNPs的靶向性和抗炎性能，有效抑制血管内皮细胞增殖和迁移	研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	开发一种新型的非侵入性治疗方法，用于治疗角膜新生血管	角膜新生血管（CoNV）及其相关血管内皮细胞和周细胞	生物医学工程	眼科疾病	单细胞测序、siRNA递送技术	NA	NA	小鼠模型
465	2025-06-09	Intercellular communication after myocardial infarction: Macrophage as the centerpiece 2025-Jul, Ageing research reviews IF:12.5Q1 DOI:10.1016/j.arr.2025.102757 PMID:40320153	综述	本文综述了心肌梗死后巨噬细胞作为核心的细胞间通讯及其在损伤修复中的作用	总结了巨噬细胞亚群动态变化及以巨噬细胞为中心的细胞间通讯，提出了新的靶向治疗策略和免疫代谢调控潜力	NA	探讨心肌梗死后巨噬细胞在损伤修复中的核心作用及其治疗潜力	心肌梗死后巨噬细胞及其与其他心脏细胞的相互作用	心血管疾病	心肌梗死	单细胞测序	NA	基因表达谱	NA
466	2025-06-09	Single-cell transcriptomic analyses provide insights into the tumor microenvironment heterogeneity and invasion phenotype in retinoblastoma 2025-Jul, Pathology, research and practice DOI:10.1016/j.prp.2025.156009 PMID:40378583	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了视网膜母细胞瘤（RB）肿瘤微环境（TME）的异质性及其与侵袭表型的关系	首次系统描绘了RB中TME的细胞亚群特征及细胞间通讯网络，并发现特定TME亚群（如MG1巨噬细胞和AC1星形胶质样细胞）与RB眼外侵袭的相关性	研究样本量有限，且机制研究主要基于生物信息学分析，需进一步实验验证	探究视网膜母细胞瘤肿瘤微环境异质性及其在肿瘤侵袭中的作用机制	视网膜母细胞瘤组织样本及其肿瘤微环境细胞	数字病理	视网膜母细胞瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CellChat细胞通讯分析、Monocle拟时序分析、CIBERSORT免疫细胞浸润分析	NA	单细胞转录组数据、微阵列数据	未明确说明样本数量（包含侵袭性和非侵袭性RB样本）
467	2025-06-09	Crosstalk between kidney and bones: New perspective for modulating osteoporosis 2025-Jul, Ageing research reviews IF:12.5Q1 DOI:10.1016/j.arr.2025.102776 PMID:40389172	review	探讨肾脏与骨骼之间的相互作用及其在骨质疏松症中的调节作用	从分子生物学到临床视角综合分析肾脏与骨骼的相互作用，并提出新的体外模型和潜在治疗策略	NA	研究肾脏与骨骼之间的相互作用及其在骨质疏松症中的调节作用	肾脏、骨骼及其相互作用	NA	骨质疏松症	细胞共培养、器官芯片、单细胞测序、空间转录组学	NA	NA	NA
468	2025-06-09	stDGAC: A novel identifying spatial domains method via graph attention contrastive network for spatial transcriptomics data 2025-Jul, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110280 PMID:40403639	研究论文	提出了一种名为stDGAC的新方法，通过结合使用去噪自编码器和图注意力对比网络，更准确地识别空间转录组数据中的空间域	stDGAC方法首次联合使用去噪自编码器和图注意力对比网络，有效利用高维且噪声较多的空间转录组数据，提高了空间域识别的准确性	未提及具体的样本量或数据来源限制	开发一种更准确识别空间转录组数据中空间域的方法	空间转录组数据	生物信息学	NA	空间转录组测序	去噪自编码器（denoising autoencoder）和图注意力对比网络（graph attention contrastive network）	空间转录组数据	NA
469	2025-06-09	Integrating multi-omics data with artificial intelligence to decipher the role of tumor-infiltrating lymphocytes in tumor immunotherapy 2025-Jul, Pathology, research and practice DOI:10.1016/j.prp.2025.156035 PMID:40435910	综述	本文综述了人工智能在评估肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）中的应用进展，包括自动化定量、亚群识别和空间分布模式分析	整合多组学数据与人工智能技术，探索TILs在肿瘤免疫治疗中的作用，并探讨AI与其他新兴技术（如单细胞测序、多重免疫荧光等）的结合	未提及具体AI模型的性能比较或临床验证结果	阐明TILs在各种癌症中的预后价值及其对免疫治疗和新辅助治疗反应的预测能力	肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）	数字病理学	癌症	单细胞测序、多重免疫荧光、空间转录组学	CNN	图像	NA
470	2025-06-07	Single-cell RNA sequencing identifies cellular heterogeneity in endothelial and epithelial cells associated with nitrogen dioxide-induced acute lung injury 2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118385 PMID:40403690	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究了二氧化氮诱导的急性肺损伤中内皮细胞和上皮细胞的异质性变化	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了二氧化氮诱导的急性肺损伤中内皮细胞和上皮细胞的异质性变化，并发现了新的上皮细胞亚群Ly6a肺泡细胞	研究仅关注了内皮细胞和上皮细胞的变化，未涉及其他可能参与急性肺损伤的细胞类型	探究二氧化氮诱导的急性肺损伤的分子机制	内皮细胞和上皮细胞	数字病理学	急性肺损伤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量
471	2025-06-07	Characterizing microglial heterogeneity in autophagy impairment of Paraquat-induced Parkinson's disease-like neurodegeneration 2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118364 PMID:40403688	研究论文	本研究通过建立百草枯诱导的帕金森病样神经退行性变模型，利用单细胞RNA测序技术揭示了小胶质细胞在自噬障碍中的异质性及其在病理过程中的核心作用	首次在百草枯暴露背景下生成自噬的单细胞RNA测序图谱，发现小胶质细胞亚型在自噬调节中的异质性，并鉴定出一个自噬特异性小胶质细胞亚型	研究主要基于动物模型和体外细胞实验，结果向人类帕金森病的直接转化需要进一步验证	探究百草枯诱导的帕金森病样神经退行性变中自噬障碍的细胞异质性	百草枯诱导的帕金森病样神经退行性变模型中的小胶质细胞	神经退行性疾病研究	帕金森病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	百草枯诱导的PD样神经退行性变模型	转录组数据	未明确说明样本数量，使用动物模型和BV2细胞系
472	2025-06-07	Subacute dibutyl phthalate exposure impairs hepatic T cells and facilitates hepatitis B progression in mouse liver 2025-Jul-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118398 PMID:40440982	research paper	该研究探讨了亚急性邻苯二甲酸二丁酯（DBP）暴露如何通过损害肝脏T细胞功能促进乙型肝炎病毒（HBV）的进展	首次揭示了DBP通过驱动T细胞耗竭加剧HBV进展的机制，并提出了针对免疫耗竭的治疗策略	研究主要基于小鼠模型，人类流行病学数据的相关性分析尚未完全验证因果关系	探究亚急性DBP暴露对HBV进展的影响及其免疫调节机制	HBV感染患者和小鼠模型	免疫学	乙型肝炎	单细胞RNA测序、流式细胞术、共培养实验	小鼠模型	RNA测序数据、流式细胞数据、流行病学数据	HBV感染患者肝脏组织和小鼠模型
473	2025-06-06	Emergence of regulatory and matrix-producing stromal cells during adipogenic induction in human ceiling culture-derived preadipocytes 2025-Jul-22, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152012 PMID:40409116	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和表观遗传学分析，探讨了人类天花板培养来源的前脂肪细胞在脂肪生成诱导早期的转录组变化	首次在单细胞水平上揭示了人类原代培养的天花板培养来源前脂肪细胞的脂肪生成反应，并发现了ATOH8转录因子在脂肪生成中的新角色	研究仅关注早期转录组变化，未涉及长期分化结果	探究天花板培养来源前脂肪细胞在脂肪生成诱导下的细胞异质性	人类天花板培养来源的前脂肪细胞和脂肪来源干细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 表观遗传学分析	NA	RNA测序数据, 表观遗传数据	未明确说明样本数量的人类前脂肪细胞和脂肪来源干细胞
474	2025-06-06	CD105 blockade restores osimertinib sensitivity in drug-resistant EGFR-mutant non-small cell lung cancer 2025-Jul, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2025.101237 PMID:40090182	研究论文	本研究探讨了CD105在非小细胞肺癌中对EGFR靶向治疗耐药性的作用，并发现阻断CD105可以恢复对奥希替尼的敏感性	首次揭示了CD105在EGFR突变型非小细胞肺癌耐药性中的关键作用，并验证了CD105中和抗体carotuximab能够恢复耐药肿瘤对奥希替尼的敏感性	研究样本量相对较小（66例肿瘤样本），且主要基于细胞系和小鼠模型，需要进一步临床验证	探究CD105在EGFR突变型非小细胞肺癌耐药性中的作用机制并寻找克服耐药性的策略	非小细胞肺癌（NSCLC）患者肿瘤样本和EGFR突变型细胞系	肿瘤学	非小细胞肺癌	成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、ATAC测序、SCENITH分析	NA	基因表达数据、蛋白质组数据、代谢组数据	66例NSCLC肿瘤样本（其中44例有EGFR突变）和2种奥希替尼耐药EGFR突变细胞系
475	2025-06-06	Decoding Long-Distance Communication Under Mineral Stress: Advances in Vascular Signalling and Molecular Tools for Plant Resilience 2025-Jul, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.15475 PMID:40091594	综述	本文探讨了植物在矿物质缺乏条件下通过长距离信号传导机制维持矿物质稳态和优化生长的复杂机制	强调了维管组织在感知和传递矿物质缺乏信号中的关键作用，并介绍了利用TRAP-Seq、异种嫁接和单细胞RNA测序等分子工具揭示的长距离信号传导新方面	NA	探索植物在矿物质缺乏条件下的长距离信号传导机制及其在作物抗逆性和矿物质利用效率中的应用	植物	植物生物学	NA	TRAP-Seq、异种嫁接、单细胞RNA测序	NA	分子生物学数据	NA
476	2025-06-06	Single-cell RNA sequencing indicates AP-1 as a potential therapeutic target for autoimmune uveitis 2025-Jul, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2025.116945 PMID:40228638	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了AP-1在自身免疫性葡萄膜炎（EAU）发病机制中的关键作用，并探索了AP-1抑制作为潜在治疗策略的效果	首次通过单细胞RNA测序技术鉴定AP-1为EAU发病机制中的关键分子，并发现AP-1通过GM-CSF/IL-23反馈环路支持Th17细胞的致病性	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	探索自身免疫性葡萄膜炎（EAU）的发病机制并寻找潜在治疗靶点	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠的脾脏和颈部引流淋巴结（CDLNs）	生物医学研究	自身免疫性葡萄膜炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠模型	RNA测序数据	正常和EAU小鼠的脾脏和颈部引流淋巴结（CDLNs）样本
477	2025-06-05	RETRACTED: Deciphering the prognostic landscape of osteosarcoma: Integrating the roles of hippo pathway genes, programmed cell death, and the tumor immune microenvironment 2025-Jul, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24280 PMID:38622820	研究论文	本研究通过分析Hippo信号通路与肿瘤免疫微环境(TME)的相互作用，探讨了骨肉瘤的分子基础及其预后标志物	鉴定了131个与Hippo通路相关的基因，并从中筛选出8个关键基因(DLG5、WNT11等)与患者预后显著相关，揭示了免疫逃避模式与不良预后的关联	研究基于公共数据集(TARGET-OS和GTEx)，可能需要更多独立样本验证	探索骨肉瘤的分子机制及预后标志物	骨肉瘤患者样本及其转录组数据	数字病理学	骨肉瘤	转录组数据分析、单细胞测序	Cox回归分析、Kaplan-Meier生存分析	转录组数据	TARGET-OS数据集和GTEx对照样本
478	2025-06-05	RETRACTED: Single-cell transcriptome sequencing analysis reveals intra-tumor heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma 2025-Jul, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24243 PMID:38572681	研究论文	通过单细胞转录组测序分析揭示食管鳞状细胞癌的肿瘤内异质性	利用单细胞转录组测序技术深入探索食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境机制，并成功构建预后风险模型和筛选关键基因UPF3A	样本量相对较小，仅包括60个肿瘤样本和4个癌旁样本	研究食管鳞状细胞癌的致癌机制和潜在关键分子事件	食管鳞状细胞癌患者	数字病理学	食管鳞状细胞癌	单细胞转录组测序	LASSO分析	单细胞RNA测序数据	60个肿瘤样本和4个癌旁样本
479	2025-06-05	RETRACTED: Prediction of potential targets and toxicological insights of Astragalus in liver cancer based on network pharmacology: Integrating systems biology, drug interaction networks, and toxicological perspectives 2025-Jul, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24189 PMID:38476113	研究论文	本研究利用网络药理学探讨黄芪作为原发性肝癌新型治疗选择的潜力，揭示其分子和细胞机制	整合系统生物学、药物相互作用网络和毒理学视角，首次在单细胞分辨率下分析黄芪对肝癌的基因表达影响	研究结果需要进一步的体内实验验证	探索黄芪作为原发性肝癌治疗药物的潜在靶点和作用机制	黄芪及其活性成分对原发性肝癌细胞的影响	网络药理学	肝癌	scRNA-seq, UMAP, tSNE, 基因本体分析, KEGG通路分析, 基因集变异分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 分子对接	NA	基因表达数据, 单细胞RNA测序数据	处理组与对照组各20个基因表达变化, 15个独特的细胞簇, 9个MT1相关细胞亚群, 5个通过SingleR包指定的细胞亚群
480	2025-06-05	Understanding psoriatic disease at single-cell resolution: an update 2025-Jul-01, Current opinion in rheumatology IF:5.2Q1 DOI:10.1097/BOR.0000000000001085 PMID:40160177	综述	本文综述了单细胞技术在银屑病研究中的最新进展，包括单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学，揭示了银屑病的细胞多样性及其在疾病进展中的关键作用	利用单细胞技术和空间转录组学揭示了银屑病中免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞亚型的作用，以及代谢失调在慢性炎症中的关键性	NA	探讨单细胞技术在银屑病研究中的应用及其对精准治疗的潜在影响	银屑病中的免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学	NA	转录组数据	NA