单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
441	2025-06-22	TMEM55A-mediated PI5P signalling regulates alpha cell actin depolymerisation and glucagon secretion 2025-Jul, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06411-9 PMID:40140059	研究论文	本文揭示了TMEM55A通过调控细胞内PI5P和F-actin网络来调节α细胞胞吐作用和胰高血糖素分泌的新途径	发现TMEM55A通过PI5P信号通路调控α细胞肌动蛋白解聚和胰高血糖素分泌的新机制	研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证	验证TMEM55A及其潜在信号分子在α细胞功能和胰高血糖素分泌中的作用	人和小鼠的胰岛α细胞	细胞生物学	糖尿病	膜片钳电生理学、单细胞RNA测序、共聚焦显微镜	NA	电生理数据、RNA测序数据、显微镜图像	人类和小鼠胰岛α细胞
442	2025-06-22	RFX3 is essential for the generation of functional human pancreatic islets from stem cells 2025-Jul, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06424-4 PMID:40263183	研究论文	本研究探讨了调控因子X3（RFX3）在人类胰岛发育中的功能，使用诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的胰岛类器官进行研究	首次揭示了RFX3在人类胰岛细胞分化中的关键作用及其对肠嗜铬细胞（ECs）分化的抑制作用	研究主要基于体外类器官模型，未涉及体内验证	探究RFX3在人类胰岛发育中的功能及其机制	人类诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的胰岛类器官	干细胞生物学	糖尿病	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、批量RNA测序	基因敲除（KO）和过表达模型	基因表达数据	未明确说明样本数量，使用了iPSC衍生的胰岛类器官
443	2025-06-22	Abundance of a metabolically active subpopulation in dedifferentiated adipocytes inversely correlates with body mass index 2025-Jul, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2025.102161 PMID:40348015	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术鉴定了人类脂肪细胞中一个具有高代谢活性的亚群，并发现其丰度与体重指数呈负相关	首次在人类去分化脂肪细胞中发现具有肌肉细胞基因特征的高代谢活性亚群，并揭示其与体重指数的负相关性	研究样本量相对有限（11名供体），且机制研究有待深入	探究脂肪组织中不同亚群的细胞组成和功能特性与代谢疾病的关系	人类去分化脂肪细胞（DFAT）和皮下脂肪组织	代谢组学	肥胖症	单细胞RNA测序（10x Genomics）、流式细胞分选（FACS）、批量RNA测序	NA	基因表达数据	11名人类供体的脂肪细胞样本+1759名供体的皮下脂肪组织基因表达数据
444	2025-06-22	The co-location of MARCO+ tumor-associated macrophages and CTSE+ tumor cells determined the poor prognosis in intrahepatic cholangiocarcinoma 2025-Jul-01, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001138 PMID:39471066	研究论文	本研究通过空间转录组和单细胞转录组数据，详细分析了肝内胆管癌（ICC）中的免疫浸润模式，并发现MARCO+肿瘤相关巨噬细胞与CTSE+肿瘤细胞的共定位与患者不良预后相关	首次在ICC中鉴定了两种肿瘤内免疫浸润模式（巨噬细胞+和浆细胞+），并揭示了MARCO+ TAMs与CTSE+肿瘤细胞的共定位如何促进免疫抵抗性微环境的形成	样本量相对较小（6个空间转录组样本和35个单细胞样本），且仅在20个ICC样本中通过多重免疫荧光验证了共定位结果	探究肝内胆管癌中免疫细胞的具体表型及其在肿瘤微环境中的空间分布	肝内胆管癌（ICC）患者	数字病理	肝内胆管癌	空间转录组学、单细胞转录组学、多重免疫荧光	NA	转录组数据、图像数据	6个空间转录组样本（29,632个点）、35个单细胞样本（21,158个细胞）、20个ICC验证样本
445	2025-06-20	Predictive significance of MPT-driven necrosis-related genes signature in gastric cancer and their impact on the tumor microenvironment 2025-Jul, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03832-7 PMID:39690336	research paper	该研究探讨了MPT驱动的坏死相关基因（MPTDNRGs）在胃癌中的预测意义及其对肿瘤免疫微环境的影响	首次揭示了MPTDNRGs在胃癌中的突变率和表达差异，并构建了一个预后风险模型，能够有效预测患者生存期和免疫治疗反应	研究主要基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证	研究MPT驱动的坏死相关基因在胃癌中的预测价值及其对肿瘤免疫微环境的影响	胃癌患者及其肿瘤组织样本	digital pathology	gastric cancer	RNA-seq, scRNA-seq	LASSO regression	RNA sequencing data	来自TCGA和GEO数据库的胃癌患者样本
446	2025-06-20	Circulating monocytes upregulate CD52 and sustain innate immune function in cirrhosis unless acute decompensation emerges 2025-Jul, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2024.12.031 PMID:39818234	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了肝硬化患者循环单核细胞的异质性及其功能变化，特别是CD52在单核细胞中的表达及其对免疫功能的影响	首次发现CD52在肝硬化患者单核细胞中的表达变化，并揭示了其在维持先天免疫功能中的作用及在急性失代偿期的功能丧失机制	研究主要基于体外实验，临床样本量有限，且未探讨CD52稳定化的具体治疗方法	解析肝硬化不同阶段循环单核细胞的异质性及功能变化，探索CD52在免疫抑制中的作用	健康人群及肝硬化患者的循环单核细胞	免疫学	肝硬化	单细胞RNA测序、流式细胞术、体外功能实验	NA	RNA测序数据、流式细胞数据	健康人群及肝硬化患者（补偿期和非急性失代偿期）的单核细胞样本
447	2025-06-19	Integrating scRNA-seq to explore offspring neurodevelopmental toxicity induced by Cyfluthrin exposure during pregnancy: A fate decision for NSCs 2025-Jul-15, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138205 PMID:40209410	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索了孕期暴露于氟氯氰菊酯对子代神经发育的毒性机制	首次构建了孕期暴露于氟氯氰菊酯的子代大脑海马单细胞图谱，揭示了神经干细胞命运改变是导致发育毒性的主要原因	研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探究孕期氟氯氰菊酯暴露对子代神经发育的毒性作用机制	孕期暴露于氟氯氰菊酯的大鼠及其子代	神经毒理学	神经发育障碍	scRNA-seq	NA	基因表达数据	不同年龄段的子代大鼠
448	2025-06-17	Single-cell sequencing and machine learning reveal the role of dioxin-interacting genes in HCC prognosis and immune microenvironment 2025-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118484 PMID:40483782	研究论文	通过单细胞测序和机器学习揭示了二恶英相互作用基因在肝细胞癌预后和免疫微环境中的作用	结合单细胞和批量转录组分析及机器学习，识别了与免疫逃逸、代谢重编程和细胞周期调控相关的二恶英相互作用差异表达基因（DI-DEGs），并构建了预后模型	分子机制仍需进一步研究，实验验证仅限于体外	探究二恶英在肝细胞癌（HCC）发展中的分子机制及其对预后和免疫微环境的影响	肝细胞癌（HCC）患者和二恶英相互作用基因	数字病理学	肝癌	单细胞测序、批量转录组分析、机器学习、分子对接	机器学习模型	转录组数据	未明确提及具体样本数量
449	2025-06-16	Mechanism of Dihydroartemisinin in activating macrophages to enhance host resistance to malaria 2025-Jul-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156913 PMID:40450979	research paper	本研究探讨了双氢青蒿素（DHA）在治疗疟疾过程中促进巨噬细胞向M1表型极化的分子机制	首次揭示了DHA通过上调NLRP12表达促进巨噬细胞M1极化的分子机制，并发现NLRP12缺失会抑制炎症相关细胞因子的分泌	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证	阐明DHA激活巨噬细胞增强宿主抗疟疾抵抗力的分子机制	巨噬细胞（小鼠RAW 264.7细胞系和小鼠原代巨噬细胞）	免疫学	疟疾	流式细胞术、单细胞RNA测序、无标记定量蛋白质组学分析	小鼠疟疾模型	基因表达数据、蛋白质组数据	小鼠巨噬细胞系和原代巨噬细胞
450	2025-06-15	Biomarkers Related to Interferon-γ Pathway in Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury and the Potential Molecular Mechanisms 2025-Jul, Cardiovascular toxicology IF:3.4Q2 DOI:10.1007/s12012-025-09999-x PMID:40346414	研究论文	研究干扰素-γ通路在心肌缺血再灌注损伤（MIRI）中的分子机制及其潜在生物标志物	通过挖掘转录组和单细胞测序数据，鉴定了与干扰素-γ通路相关的两个关键基因Myd88和Trp53作为MIRI的生物标志物，并揭示了其在细胞通讯和伪时间分析中的作用	研究依赖于公开数据集，未进行实验验证	阐明干扰素-γ通路在心肌缺血再灌注损伤中的分子机制	心肌缺血再灌注损伤（MIRI）	生物信息学	心血管疾病	转录组测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	三个数据集（GSE160516、GSE83472、GSE227088）和182个干扰素-γ通路相关基因
451	2025-06-15	From cells to clinic: Single-cell transcriptomics shaping the future of orthopedics 2025-Jul, Journal of orthopaedic translation IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.jot.2025.05.001 PMID:40510239	review	探讨单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）在骨科研究和临床实践中的潜在影响	scRNA-seq技术能够精细表征细胞亚群的变化及其在疾病进展中的作用，为骨科疾病研究提供新视角	NA	评估scRNA-seq技术在骨科研究和临床实践中的应用前景	骨关节炎、类风湿性关节炎、椎间盘退变和骨肉瘤等骨科疾病	digital pathology	geriatric disease	scRNA-seq	NA	RNA-seq数据	NA
452	2025-06-14	New insights into cancer immune checkpoints landscape from single-cell RNA sequencing 2025-07, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189298 PMID:40088992	review	本文通过单细胞RNA测序技术深入探讨了癌症免疫检查点的异质性及其在免疫检查点阻断疗法中的作用	利用单细胞RNA测序技术高分辨率地描绘了免疫检查点之间以前未被认识的功能性相互作用，并识别了新的免疫检查点作为癌症免疫治疗的潜在靶点	未提及具体样本量或实验设计的局限性	探讨免疫检查点阻断疗法中肿瘤微环境的异质性及其对治疗效果的影响	肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞	肿瘤免疫学	癌症	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NA
453	2025-06-14	Snail1 as a key prognostic biomarker of cancer-associated fibroblasts in breast tumors 2025-07, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189316 PMID:40222423	综述	本文总结了乳腺癌患者样本和小鼠模型中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的最新研究发现，重点关注通过单细胞RNA测序鉴定的CAF亚型及其对癌症预后的预测价值	揭示了Snail1在CAFs中的表达与恶性肿瘤的关联，并发现了一个新的与Snail1相关的基因特征，具有乳腺癌和其他实体瘤的预后潜力	主要基于现有研究的总结，缺乏新的实验数据验证	探讨CAFs在肿瘤进展中的作用及其作为预后生物标志物的潜力	乳腺癌患者样本和小鼠模型中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
454	2025-06-14	Patient phenotyping for molecular profiling of neck and low back pain - Study protocol 2025 Jul-Dec, Neurobiology of pain (Cambridge, Mass.) DOI:10.1016/j.ynpai.2025.100186 PMID:40501484	研究论文	本文概述了用于分子剖析颈部和腰部疼痛的患者表型研究的方案	应用批量、单细胞和空间转录组学技术研究颈部和腰部疼痛的分子神经生物学和神经免疫学机制	研究依赖于手术获取的组织样本，可能限制了样本的多样性和数量	通过分子剖析揭示颈部和腰部疼痛的机制，以发现治疗靶点	颈部和腰部疼痛患者的手术组织样本及器官捐赠者的对照组织	分子神经生物学	颈部和腰部疼痛	批量、单细胞和空间转录组学	NA	组织样本	颈部和腰部疼痛患者的手术组织样本及器官捐赠者的对照组织
455	2025-06-13	Microglial colonization routes and their impacts on cellular diversity 2025-Jul, Neuroscience research IF:2.4Q3 DOI:10.1016/j.neures.2025.04.004 PMID:40288616	review	本文探讨小胶质细胞在脑发育过程中的多样性形成机制，重点关注其不同的定植路线	综述了小胶质细胞多样性的两种可能形成机制，特别强调了不同定植路线的影响	主要关注理论假设，缺乏实验验证数据	探索小胶质细胞多样性形成的机制	小胶质细胞	神经科学	NA	单细胞转录组学	NA	NA	NA
456	2025-06-13	Insights into Keratinocyte and Immunologic Landscape in Cutaneous Graft-Versus-Host Disease through Single-Cell Transcriptomics 2025-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health DOI:10.1016/j.xjidi.2025.100373 PMID:40492027	研究论文	通过单细胞转录组学揭示皮肤移植物抗宿主病（GVHD）中角质形成细胞和免疫细胞的复杂反应	首次使用单细胞RNA测序技术比较慢性GVHD与健康对照样本的转录组，揭示了角质形成细胞和免疫细胞的非免疫和免疫学变化	研究样本量未明确说明，可能限制结果的普遍性	探讨皮肤GVHD的发病机制，特别是角质形成细胞和其他皮肤结构细胞的作用	慢性GVHD患者的表皮和真皮样本与健康对照样本	单细胞转录组学	皮肤移植物抗宿主病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
457	2025-06-12	Skeletal site-specific variations in myeloid cells: insights from single-cell RNA sequencing of the mandible and femur 2025-Jul, JBMR plus IF:3.4Q2 DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf074 PMID:40486046	research paper	通过单细胞RNA测序研究下颌骨和股骨骨髓中CD11b+髓系细胞的差异，揭示下颌骨来源细胞具有独特的炎症基因特征	首次通过单细胞RNA测序揭示下颌骨与股骨骨髓中CD11b+髓系细胞的转录组差异，并发现KLF4基因在下颌骨来源细胞分化中的特异性作用	研究仅使用2月龄C57BL/6小鼠样本，未涉及其他年龄段或品系	探究不同骨骼部位（下颌骨与股骨）髓系细胞群的生物学差异	2月龄C57BL/6小鼠下颌骨和股骨骨髓中的CD11b+髓系细胞	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq），转座酶可及染色质测序（ATAC-seq），定量逆转录PCR（qRT-PCR）	NA	单细胞转录组数据，表观遗传数据	2月龄C57BL/6小鼠的下颌骨和股骨骨髓样本
458	2025-06-11	Targeting SPP1+ macrophages via the SPP1-CD44 axis reveals a key mechanism of immune suppression and tumor progression in ovarian cancer 2025-Jul-28, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114906 PMID:40446696	研究论文	该研究通过整合分析卵巢癌单细胞测序数据，揭示了SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴促进T细胞耗竭和免疫抑制的机制	首次发现SPP1+巨噬细胞亚群通过SPP1-CD44轴驱动卵巢癌中的免疫抑制和T细胞耗竭，并验证了nilotinib作为潜在SPP1抑制剂的治疗潜力	研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，需要进一步的体内实验验证	探索卵巢癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)促进免疫抑制和肿瘤进展的分子机制	高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)中的肿瘤相关巨噬细胞和T细胞	肿瘤免疫学	卵巢癌	单细胞测序、分子对接、分子动力学模拟	NA	单细胞测序数据	六个HGSOC单细胞测序数据集
459	2025-06-11	Mefunidone treats pulmonary fibrosis by targeting SDH to regulate fibro-promoting macrophages 2025-Jul-28, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114971 PMID:40449267	研究论文	本研究揭示了Mefunidone通过靶向SDH并调节促纤维化巨噬细胞转化来治疗肺纤维化的新机制	首次发现Mefunidone通过结合并抑制SDH活性来抑制琥珀酸生成，进而调控促纤维化巨噬细胞表型转化	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	阐明Mefunidone治疗肺纤维化的分子靶点和潜在机制	博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型和促纤维化巨噬细胞	基础医学研究	肺纤维化	单细胞测序技术	动物模型	实验数据	博来霉素诱导的肺纤维化小鼠
460	2025-06-11	Multi-omics identifies OSM-OSMR as a key receptor-ligand in the tumor environment of endometrial adenocarcinoma 2025-Jul-28, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114933 PMID:40450916	研究论文	本研究通过多组学方法识别了OSM-OSMR作为子宫内膜腺癌肿瘤微环境中的关键受体-配体，并构建了一个预后模型	首次发现OSM信号在子宫内膜癌组织中的细胞通讯中显著升高，并基于OSM基因集将子宫内膜腺癌分为四种亚型，构建了七基因特征的预后模型	研究主要基于公开数据集和细胞系实验，缺乏大规模临床样本验证	探索子宫内膜腺癌肿瘤微环境中细胞间的配体-受体关系并构建预后模型	子宫内膜腺癌组织和细胞系	肿瘤微环境研究	子宫内膜腺癌	单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量RNA测序	随机生存森林模型	RNA测序数据和临床数据	来自GEO和TCGA的公开数据集及Ishikawa细胞系